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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-09-27 |
High infiltration of immune cells with lower immune activity mediated the heterogeneity of gastric adenocarcinoma and promoted metastasis
2024-Sep-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37092
PMID:39319155
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析胃腺癌的转移特征 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了低免疫活性的免疫细胞高浸润与胃腺癌异质性和转移的关系 | 研究仅限于体外实验验证,缺乏体内实验数据 | 探索胃腺癌的转移特征 | 胃腺癌的免疫细胞和基因表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7697个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-09-27 |
A Quantitative Computational Framework for Allopolyploid Single-Cell Data Integration and Core Gene Ranking in Development
2024-Sep-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msae178
PMID:39213378
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研究论文 | 开发了一种名为“伪基因组分化量化”(pgDQ)的定量计算框架,用于量化和追踪异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 提出了pgDQ方法,能够直接在细胞水平上量化和追踪亚基因组分化,并能与单细胞RNA测序数据得出的细胞分化轨迹进行比较 | 未提及 | 探讨异源多倍体发育过程中不同基因组融合对发育的影响 | 异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-09-26 |
Transcriptomic dysregulation and autistic-like behaviors in Kmt2c haploinsufficient mice rescued by an LSD1 inhibitor
2024-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02479-8
PMID:38528071
|
研究论文 | 研究探讨了Kmt2c基因半合子缺失小鼠的转录组失调和自闭症样行为,并发现LSD1抑制剂可以改善这些行为 | 首次揭示了Kmt2c基因半合子缺失导致的神经发育缺陷的分子机制,并证明了LSD1抑制剂在治疗这些缺陷中的有效性 | 研究主要集中在成年小鼠,未探讨LSD1抑制剂对幼年小鼠的影响 | 探讨Kmt2c基因半合子缺失如何导致神经发育缺陷及其治疗方法 | Kmt2c基因半合子缺失小鼠及其行为和转录组变化 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年和新生小鼠脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-09-26 |
A necroptosis-regulated model from single-cell analysis that predicts survival and identifies the Pivotal role of MAGEA6 in hepatocellular carcinoma
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37711
PMID:39315163
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞分析的坏死性凋亡调控模型,用于预测肝细胞癌患者的生存情况,并揭示了MAGEA6在肝细胞癌中的关键作用 | 本研究首次开发了一种基于坏死性凋亡相关基因的风险特征,用于预测肝细胞癌患者的预后,并通过实验验证了MAGEA6在肝癌中的作用 | 本研究的样本量较小,且仅基于TCGA和ICGC数据库进行验证,未来需要更大规模的临床验证 | 开发一种新的坏死性凋亡相关基因风险特征,用于预测肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌患者的预后预测和坏死性凋亡在肝癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 25个关键坏死性凋亡调控因子和168个坏死性凋亡相关基因,TCGA-LIHC数据集作为训练集,ICGC数据集用于验证 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-09-26 |
Meiotic chromatin-associated HSF5 is indispensable for pachynema progression and male fertility
2024-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae701
PMID:39162221
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种新的睾丸特异性蛋白HSF5,该蛋白通过染色质结合调控雄性减数分裂中的粗线期进展 | 首次发现HSF5在粗线期进展中的关键作用,并揭示了其与SMARCA5、SMARCA4和SMARCE1的生物学相互作用 | NA | 探讨HSF5在雄性减数分裂粗线期进展中的调控作用 | HSF5蛋白及其在减数分裂中的功能 | NA | NA | scRNA-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据 | Hsf5-/-个体 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-09-26 |
Patient-derived xenografts and single-cell sequencing identifies three subtypes of tumor-reactive lymphocytes in uveal melanoma metastases
2024-Sep-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91705
PMID:39312285
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和患者来源的异种移植模型,识别并验证了葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞的三个亚型 | 首次结合单细胞测序和功能分析,揭示了葡萄膜黑色素瘤肝转移中肿瘤反应性T细胞的多样性 | 研究仅限于葡萄膜黑色素瘤肝转移,结果可能不适用于其他类型的黑色素瘤或其他器官的转移 | 通过识别和功能验证肿瘤反应性T细胞,提高葡萄膜黑色素瘤肝转移的免疫治疗效果 | 葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自患者的生物样本和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-09-25 |
Investigation of the pharmacological mechanisms of Shenfu injection in acute pancreatitis through network pharmacology and experimental validation
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37491
PMID:39309824
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学和实验验证探讨了参附注射液在急性胰腺炎治疗中的药理机制 | 首次通过网络药理学和实验验证揭示了参附注射液在急性胰腺炎治疗中的多成分、多靶点和多细胞特性 | NA | 探讨参附注射液在急性胰腺炎治疗中的潜在机制 | 参附注射液在急性胰腺炎中的作用机制 | NA | 急性胰腺炎 | 网络药理学、分子对接、单细胞转录组分析、HE染色、流式细胞术、Tunel染色、CCK-8检测、Western blot、ELISA | NA | 基因、蛋白质、细胞 | 体外实验涉及多种细胞类型,体内实验涉及急性胰腺炎大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the distinct features of colorectal cancer with or without Fusobacterium nucleatum infection in PD-L1 blockade therapy
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37511
PMID:39309908
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了在PD-L1阻断疗法下,有无Fusobacterium nucleatum感染的结直肠癌的特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Fusobacterium nucleatum感染对PD-L1阻断疗法在结直肠癌中作用的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证结果 | 探讨PD-L1阻断疗法在结直肠癌中的作用机制,特别是Fusobacterium nucleatum感染的影响 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的结直肠癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals intratumoral heterogeneity and multicellular community in primary hepatocellular carcinoma underlying microvascular invasion
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37233
PMID:39309949
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了原发性肝细胞癌中微血管侵犯的肿瘤内异质性和多细胞社区 | 首次对肝细胞癌中的微血管侵犯进行了详细的单细胞分析,揭示了免疫抑制生态系统和与微血管侵犯相关的上调信号 | 样本量较小,仅包括3个微血管侵犯阳性样本和14个阴性样本 | 研究肝细胞癌中微血管侵犯的肿瘤微环境,为免疫治疗提供潜在靶点 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及其配对的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3个微血管侵犯阳性样本和14个阴性样本,以及它们的配对非肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-09-25 |
Single-cell transcriptome and crosstalk analysis reveals immune alterations and key pathways in the bone marrow of knee OA patients
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110827
PMID:39310769
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,研究了膝骨关节炎患者骨髓抽吸物中的免疫变化和关键通路 | 本文首次深入研究了骨髓在膝骨关节炎中的免疫变化,不同于以往关注损伤部位或外周血的研究 | NA | 揭示膝骨关节炎患者骨髓中的免疫变化和关键通路 | 膝骨关节炎患者的骨髓抽吸物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自随机临床试验(MILES: NCT03818737)的骨髓抽吸物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-09-25 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of pancreatic neuroendocrine tumors under genomic instability and histological grading
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110836
PMID:39310774
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序分析了胰腺神经内分泌肿瘤在基因组不稳定性和组织学分级下的异质性 | 揭示了肿瘤细胞在不同组织学分级和基因组不稳定性模式下激活的核心通路存在显著差异,并发现多种细胞类型可能参与肝转移过程 | NA | 研究胰腺神经内分泌肿瘤在基因组不稳定性和组织学分级下的异质性 | 胰腺神经内分泌肿瘤细胞及其在不同分级和基因组不稳定性下的异质性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA-seq analysis of rat molars reveals cell identity and driver genes associated with dental mesenchymal cell differentiation
2024-Sep-11, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01996-w
PMID:39256700
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析大鼠磨牙,揭示了与牙髓间充质细胞分化相关的细胞身份和驱动基因 | 首次在大鼠磨牙的晚期钟形阶段使用单细胞RNA测序分析,揭示了牙髓间充质细胞的异质性和分化轨迹,并鉴定了新的细胞标记基因 | 研究仅限于大鼠磨牙的晚期钟形阶段,未涵盖其他物种或发育阶段 | 研究牙齿形态发生中的分子机制和信号通路,特别是牙髓间充质细胞的分化 | 大鼠下颌第一和第二磨牙的牙髓间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠下颌第一和第二磨牙的多个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-09-25 |
A single-cell transcriptomic dataset of pluripotent stem cell-derived astrocytes via NFIB/SOX9 overexpression
2024-Sep-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03823-x
PMID:39256463
|
研究论文 | 本文通过NFIB/SOX9过表达诱导多能干细胞分化为星形胶质细胞,并进行了单细胞转录组测序分析 | 建立了NFIB/SOX9诱导的星形胶质细胞分化路径的全面图谱,揭示了分化过程中的分子变化 | 对诱导星形胶质细胞的精确分化路径和分子特征的理解仍不完全 | 研究人类神经疾病并识别治疗靶点 | 多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 64,736个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-09-25 |
Characterization of prostate macrophage heterogeneity, foam cell markers, and CXCL17 upregulation in a mouse model of steroid hormone imbalance
2024-09-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71137-4
PMID:39251671
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研究论文 | 研究使用激素失衡小鼠模型,分析前列腺巨噬细胞异质性、泡沫细胞标志物及CXCL17上调 | 首次在激素失衡小鼠模型中详细描述了前列腺巨噬细胞的异质性,并确认了泡沫细胞在前列腺中的潜在病理作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证这些发现 | 进一步表征激素失衡模型中前列腺的细胞异质性,并识别招募的泡沫细胞的特定转录组特征 | 前列腺巨噬细胞、泡沫细胞及其标志物 | NA | 前列腺增生 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | C57BL/6J雄性小鼠,植入睾酮和雌二醇缓释颗粒或假手术,共两周 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-09-25 |
Differential expression of small bowel TGFβ1 and TGFβ3 characterizes intestinal strictures in patients with fibrostenotic Crohn's disease
2024-Sep, Histochemistry and cell biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00418-024-02290-0
PMID:38705911
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研究论文 | 研究了TGFβ1和TGFβ3在小肠狭窄患者中的表达差异,以了解其在克罗恩病肠道纤维化中的作用 | 首次通过原位杂交和单细胞转录组学研究了TGFβ1和TGFβ3在小肠狭窄中的表达差异,揭示了TGFβ3在肠道纤维化中的潜在作用 | 研究仅限于小肠狭窄的黏膜和黏膜下层,未涉及其他组织或细胞类型 | 探讨TGFβ1和TGFβ3在克罗恩病小肠狭窄形成中的作用,为治疗提供理论依据 | 克罗恩病患者的小肠狭窄组织 | NA | 克罗恩病 | 原位杂交、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 克罗恩病患者的小肠狭窄组织与正常小肠组织 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-09-25 |
Human organoids with an autologous tissue-resident immune compartment
2024-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07791-5
PMID:39143209
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研究论文 | 本文描述了一种新型的人类肠道免疫器官(IIOs),通过自组织形成包含自体组织驻留记忆T细胞的肠道器官,用于研究组织驻留免疫反应 | 首次在器官模型中引入自体组织驻留记忆T细胞,模拟了组织水平的免疫过程 | NA | 研究组织驻留免疫反应在肿瘤发生、感染和自身免疫疾病中的作用 | 人类肠道免疫器官(IIOs)及其在癌症治疗相关肠道炎症中的作用 | 生物医学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-09-25 |
Heme oxygenase 1-mediated ferroptosis in Kupffer cells initiates liver injury during heat stroke
2024-Sep, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.05.007
PMID:39309491
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研究论文 | 研究热射病期间库普弗细胞中的血红素氧合酶1介导的铁死亡如何引发肝脏损伤 | 首次揭示了库普弗细胞中的血红素氧合酶1在热射病期间介导铁死亡,并通过IL-1介导的炎症引发肝脏损伤 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨热射病期间库普弗细胞功能障碍与肝脏损伤的关系 | 库普弗细胞、血红素氧合酶1、铁死亡、热射病 | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-09-24 |
At the interface of tumor-associated macrophages and fibroblasts: immune-suppressive networks and emerging exploitable targets
2024-Sep-23, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1690
PMID:39311702
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综述 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和癌症相关成纤维细胞(CAFs)之间的相互作用及其在肿瘤微环境中的免疫抑制网络 | 利用单细胞RNA测序(sc-RNA seq)和空间转录组学技术,深入理解TAMs和CAFs之间的信号动态和空间分布 | NA | 研究TAMs和CAFs在实体肿瘤微环境中的相互作用,寻找新的治疗靶点 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(sc-RNA seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-09-24 |
RGS19: A novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma revealed through comprehensive bulk and single-cell sequencing analysis
2024-Sep-21, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.09.057
PMID:39307631
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-09-24 |
Gene regulatory mechanisms of T cell exhaustion in diffuse large B cell lymphoma based on single-cell transcriptome data
2024-Sep-19, Leukemia research
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.leukres.2024.107588
PMID:39307100
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组数据分析弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因调控机制 | 首次全面分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因表达特征,并发现了ID3基因在T细胞耗竭中的关键作用 | 研究依赖于公开的单细胞转录组数据,可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 深入理解弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的分子病理机制,寻找新的治疗靶点 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤中的T细胞耗竭及其相关基因表达特征 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 使用公开的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |