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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-09-30 |
nsDCC: dual-level contrastive clustering with nonuniform sampling for scRNA-seq data analysis
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae477
PMID:39327063
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研究论文 | 提出了一种名为nsDCC的双层对比聚类方法,结合非均匀采样技术用于单细胞RNA测序数据分析 | 引入双层对比聚类方法,结合实例级和聚类级对比,同时优化降维和聚类任务,并通过非均匀采样和注意力机制增强模型性能 | NA | 开发一种新的方法来优化单细胞RNA测序数据的降维和聚类任务 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 对比聚类模型 | RNA测序数据 | 涉及真实和模拟的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-09-30 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveal immune-related biomarkers in postmenopausal osteoporosis
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38022
PMID:39328516
|
研究论文 | 研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示了绝经后骨质疏松症中的免疫相关生物标志物 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据,识别出六个免疫相关差异表达基因(IR-DEGs),并构建了绝经后骨质疏松症的分子亚型和诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的数据,缺乏临床样本的验证 | 探讨绝经后骨质疏松症的免疫调节机制和早期诊断生物标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA测序 | 随机森林(RF)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)和LASSO回归模型 | RNA | 训练组使用GSE56815数据集,验证组使用GSE2208数据集,涉及单细胞RNA测序数据分析11个不同的细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-09-30 |
NOX2 mediates NLRP3/ROS facilitating nasal mucosal epithelial inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38029
PMID:39328569
|
研究论文 | 本研究探讨了NOX2在慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)中通过NLRP3/ROS途径促进鼻黏膜上皮炎症的机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示了NOX2在CRSwNP中通过ROS积累和NLRP3炎症小体激活的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据,缺乏体内实验验证 | 探讨氧化应激在慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)鼻黏膜上皮细胞中的机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)的鼻黏膜上皮细胞 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HRA000772数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-09-30 |
Non-thermal atmospheric pressure plasma induces selective cancer cell apoptosis by modulating redox homeostasis
2024-Sep-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01810-8
PMID:39327567
|
研究论文 | 研究非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 首次详细探讨了非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 研究仅限于HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞,未涵盖其他类型的癌细胞 | 探索非热等离子体诱导选择性细胞死亡的机制及其在癌症治疗中的应用 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | NA | NA | 非热等离子体处理、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-09-30 |
Beyond the bulk: overview and novel insights into the dynamics of muscle satellite cells during muscle regeneration
2024-Sep-26, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00354-1
PMID:39327631
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综述 | 本文综述了肌肉卫星细胞在肌肉再生过程中的动态变化,并介绍了单细胞技术在研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,揭示了肌肉再生过程中肌肉卫星细胞的动态异质性 | NA | 综述肌肉卫星细胞在肌肉再生中的作用,并探讨单细胞技术带来的新见解 | 肌肉卫星细胞及其在肌肉再生中的动态变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-09-30 |
Ketamine ameliorates post-traumatic social avoidance by erasing the traumatic memory encoded in VTA-innervated BLA engram cells
2024-Sep-25, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.06.026
PMID:39032491
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研究论文 | 研究探讨了氯胺酮通过消除中脑腹侧被盖区(VTA)投射到基底外侧杏仁核(BLA)的记忆细胞中的创伤记忆,减轻创伤后社交回避的作用 | 首次揭示了氯胺酮在记忆再巩固窗口期内通过减少BLA记忆细胞的活性和数量,有效缓解创伤后社交回避,并发现多巴胺D2受体在这一过程中的关键作用 | 研究仅在急性社会挫败应激(SDS)小鼠模型中进行,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨氯胺酮在创伤后应激障碍(PTSD)治疗中的作用机制 | 创伤后社交回避及相关的记忆细胞 | 神经科学 | 创伤后应激障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-09-30 |
Single-cell dissection of the human blood-brain barrier and glioma blood-tumor barrier
2024-Sep-25, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.07.026
PMID:39191260
|
研究论文 | 本文通过单细胞mRNA测序技术分析了人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序构建了人脑血脑屏障的分子图谱,并揭示了胶质母细胞瘤中血脑屏障的异常特征 | 研究样本仅限于13例手术切除的胶质瘤样本及其邻近的正常脑组织 | 探究人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征,并研究其在胶质母细胞瘤中的异常变化 | 人脑血脑屏障和胶质瘤血瘤屏障的细胞组成和分子特征 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13例手术切除的胶质瘤样本及其邻近的正常脑组织,共103,230个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-09-30 |
Microglia and macrophages alterations in the CNS during acute SIV infection: A single-cell analysis in rhesus macaques
2024-Sep, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012168
PMID:39283947
|
研究论文 | 研究了急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次在急性SIV感染的恒河猴中枢神经系统中进行了单细胞RNA测序,揭示了微胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞的不同亚群及其在感染期间的动态变化 | 样本量较小,仅包括三只感染SIV的恒河猴和三只未感染的对照组 | 探讨急性SIV感染期间中枢神经系统中微胶质细胞和巨噬细胞的动态变化及其与神经退行性疾病的潜在关联 | 急性SIV感染的恒河猴中枢神经系统中的微胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三只感染SIV的恒河猴和三只未感染的对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-09-28 |
Single-cell mapping of peripheral blood mononuclear cells reveals key transcriptomic changes favoring coronary artery lesion in IVIG-resistant Kawasaki disease
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37857
PMID:39323779
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了静脉免疫球蛋白(IVIG)抵抗型川崎病(KD)患者的外周血单核细胞(PBMCs)的转录组特征 | 首次全面描绘了IVIG抵抗型KD患者PBMCs的整体转录组图谱,揭示了CD8+效应T细胞分化受阻以及髓系细胞与T细胞之间的关键相互作用 | 样本量较小,仅包括12名参与者 | 探索IVIG抵抗型KD患者外周血单核细胞的转录组特征,揭示其与冠状动脉病变的关系 | IVIG抵抗型KD患者、IVIG反应型KD患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 12名参与者,包括5名IVIG抵抗型KD患者、4名IVIG反应型KD患者和3名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-09-28 |
Macrophage-Expressed Coagulation Factor VII Promotes Adverse Cardiac Remodeling
2024-Sep-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324114
PMID:39234697
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研究论文 | 研究了巨噬细胞表达的凝血因子VII在心肌梗死后不良心脏重塑中的作用 | 首次揭示了外周TF-FVIIa-PAR2信号复合体在缺血性心脏病中驱动炎症性巨噬细胞极化的作用,并提出了针对这一信号复合体的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,结果的临床转化和人类适用性尚需进一步验证 | 探讨凝血-炎症回路在心肌梗死后巨噬细胞重编程中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 | 心肌梗死后巨噬细胞的极化和心脏重塑 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质表达分析、共聚焦显微镜、纵向监测 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、显微镜图像 | 使用永久性左前降支结扎的小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-09-28 |
A Ctnnb1 enhancer transcriptionally regulates Wnt signaling dosage to balance homeostasis and tumorigenesis of intestinal epithelia
2024-Sep-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98238
PMID:39320349
|
研究论文 | 本文研究了Ctnnb1增强子对Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的作用 | 发现了ieCtnnb1增强子在肠道稳态和肿瘤发生中的关键作用,揭示了增强子依赖的Wnt信号调控机制 | NA | 研究Wnt信号通量调控在肠道上皮稳态和肿瘤发生中的机制 | Ctnnb1增强子及其在肠道上皮中的功能 | NA | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-09-27 |
Kidney fibrosis molecular mechanisms Spp1 influences fibroblast activity through transforming growth factor beta smad signaling
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109839
PMID:39323737
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据深入探讨了肾脏纤维化过程中纤维母细胞和肌纤维母细胞的关键作用,并揭示了Spp1基因通过TGF-β/Smad信号通路促进纤维母细胞向肌纤维母细胞分化的机制 | 首次揭示了Spp1基因在肾脏纤维化中的关键作用及其通过TGF-β/Smad信号通路促进纤维母细胞分化的机制 | NA | 探讨肾脏纤维化过程中的分子机制 | 肾脏纤维化过程中的纤维母细胞和肌纤维母细胞 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-09-28 |
Unraveling the impact of lysosomal dysfunction on myeloproliferative neoplasm
2024-Sep, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70238
PMID:39320136
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研究论文 | 研究溶酶体功能障碍对骨髓增殖性肿瘤的影响及其病理机制 | 首次探讨了溶酶体功能障碍在骨髓增殖性肿瘤中的作用,并揭示了其通过诱导异常炎症促进肿瘤发展的机制 | 样本量较小,尤其是单细胞RNA测序的样本数量有限 | 阐明溶酶体功能障碍在骨髓增殖性肿瘤发病机制中的作用 | 骨髓增殖性肿瘤患者和健康对照组 | NA | 血液肿瘤 | 全转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、转录组数据 | 190名骨髓增殖性肿瘤患者和461名健康对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-09-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals surface markers of primordial germ cells in chicken and zebra finch
2024-Sep-26, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-024-02186-7
PMID:39325237
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的表面标记物 | 发现了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物NEGR1、SLC34A2和ESYT3,这些标记物在后期发育阶段和生殖组织中持续表达 | 现有的分离方法在效率和适用性方面存在局限,特别是SSEA-1的特异性在后期发育阶段下降 | 揭示鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物,以解决现有分离方法的局限性 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-09-27 |
High infiltration of immune cells with lower immune activity mediated the heterogeneity of gastric adenocarcinoma and promoted metastasis
2024-Sep-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37092
PMID:39319155
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析胃腺癌的转移特征 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了低免疫活性的免疫细胞高浸润与胃腺癌异质性和转移的关系 | 研究仅限于体外实验验证,缺乏体内实验数据 | 探索胃腺癌的转移特征 | 胃腺癌的免疫细胞和基因表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7697个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-09-27 |
A Quantitative Computational Framework for Allopolyploid Single-Cell Data Integration and Core Gene Ranking in Development
2024-Sep-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msae178
PMID:39213378
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研究论文 | 开发了一种名为“伪基因组分化量化”(pgDQ)的定量计算框架,用于量化和追踪异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 提出了pgDQ方法,能够直接在细胞水平上量化和追踪亚基因组分化,并能与单细胞RNA测序数据得出的细胞分化轨迹进行比较 | 未提及 | 探讨异源多倍体发育过程中不同基因组融合对发育的影响 | 异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-09-26 |
Transcriptomic dysregulation and autistic-like behaviors in Kmt2c haploinsufficient mice rescued by an LSD1 inhibitor
2024-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02479-8
PMID:38528071
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研究论文 | 研究探讨了Kmt2c基因半合子缺失小鼠的转录组失调和自闭症样行为,并发现LSD1抑制剂可以改善这些行为 | 首次揭示了Kmt2c基因半合子缺失导致的神经发育缺陷的分子机制,并证明了LSD1抑制剂在治疗这些缺陷中的有效性 | 研究主要集中在成年小鼠,未探讨LSD1抑制剂对幼年小鼠的影响 | 探讨Kmt2c基因半合子缺失如何导致神经发育缺陷及其治疗方法 | Kmt2c基因半合子缺失小鼠及其行为和转录组变化 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年和新生小鼠脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-09-26 |
A necroptosis-regulated model from single-cell analysis that predicts survival and identifies the Pivotal role of MAGEA6 in hepatocellular carcinoma
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37711
PMID:39315163
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞分析的坏死性凋亡调控模型,用于预测肝细胞癌患者的生存情况,并揭示了MAGEA6在肝细胞癌中的关键作用 | 本研究首次开发了一种基于坏死性凋亡相关基因的风险特征,用于预测肝细胞癌患者的预后,并通过实验验证了MAGEA6在肝癌中的作用 | 本研究的样本量较小,且仅基于TCGA和ICGC数据库进行验证,未来需要更大规模的临床验证 | 开发一种新的坏死性凋亡相关基因风险特征,用于预测肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌患者的预后预测和坏死性凋亡在肝癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 25个关键坏死性凋亡调控因子和168个坏死性凋亡相关基因,TCGA-LIHC数据集作为训练集,ICGC数据集用于验证 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-09-26 |
Meiotic chromatin-associated HSF5 is indispensable for pachynema progression and male fertility
2024-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae701
PMID:39162221
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研究论文 | 本研究鉴定了一种新的睾丸特异性蛋白HSF5,该蛋白通过染色质结合调控雄性减数分裂中的粗线期进展 | 首次发现HSF5在粗线期进展中的关键作用,并揭示了其与SMARCA5、SMARCA4和SMARCE1的生物学相互作用 | NA | 探讨HSF5在雄性减数分裂粗线期进展中的调控作用 | HSF5蛋白及其在减数分裂中的功能 | NA | NA | scRNA-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据 | Hsf5-/-个体 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-09-26 |
Patient-derived xenografts and single-cell sequencing identifies three subtypes of tumor-reactive lymphocytes in uveal melanoma metastases
2024-Sep-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91705
PMID:39312285
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和患者来源的异种移植模型,识别并验证了葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞的三个亚型 | 首次结合单细胞测序和功能分析,揭示了葡萄膜黑色素瘤肝转移中肿瘤反应性T细胞的多样性 | 研究仅限于葡萄膜黑色素瘤肝转移,结果可能不适用于其他类型的黑色素瘤或其他器官的转移 | 通过识别和功能验证肿瘤反应性T细胞,提高葡萄膜黑色素瘤肝转移的免疫治疗效果 | 葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自患者的生物样本和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | NA | NA | NA |