单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 634 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-10-01 |
Construction of store-operated calcium entry-related gene signature for predicting prognosis and indicates immune microenvironment infiltration in stomach adenocarcinomas
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73324-9
PMID:39333689
|
研究论文 | 研究构建了与存储操作钙进入相关的基因签名，用于预测胃腺癌的预后并指示免疫微环境浸润 | 首次系统研究了存储操作钙进入（SOCE）在胃腺癌（STAD）中的预后和免疫学价值 | NA | 开发一个风险模型，探索SOCE签名与临床特征、预后、肿瘤微环境（TME）以及对免疫治疗、化疗和靶向药物反应的相关性 | 胃腺癌（STAD）患者的SOCE相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA、GEO（GSE84437和GSE159929）、cBioPortal和TIMER数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-10-01 |
scGAA: a general gated axial-attention model for accurate cell-type annotation of single-cell RNA-seq data
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73356-1
PMID:39333739
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scGAA的新型细胞类型注释模型，用于单细胞RNA测序数据的准确注释 | 提出了基于transformer框架的轴向注意力机制，将传统的自注意力机制分解为水平和垂直注意力，显著提高了计算效率，并集成了门控单元以增强基因间关系的捕捉 | NA | 开发一种高效的细胞类型注释模型，以应对单细胞RNA测序数据的高维度和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | transformer | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-10-01 |
Oncogenic ACSM6 impairs CD8+ T cell-based immune response in bladder cancer
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00657-y
PMID:39334304
|
研究论文 | 研究了致癌基因ACSM6在膀胱癌中对CD8+ T细胞免疫反应的影响 | 发现ACSM6通过抑制CD8 T细胞的趋化性和肿瘤杀伤能力，导致非炎症性免疫微环境，从而影响膀胱癌的免疫治疗效果 | NA | 探讨ACSM6在膀胱癌免疫治疗中的作用及其作为预测膀胱癌进展的生物标志物的潜力 | 膀胱癌中的ACSM6表达及其对CD8+ T细胞功能的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-10-01 |
Single-cell sequencing to multi-omics: technologies and applications
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00643-4
PMID:39334490
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在多组学中的应用 | 介绍了单细胞多组学技术的发展及其在生物学研究和临床应用中的最新进展 | 讨论了单细胞多组学技术的局限性和面临的挑战 | 探讨单细胞测序技术在多组学中的应用及其在生物学研究和临床中的潜力 | 单细胞RNA测序及其与其他多组学的结合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-10-01 |
Functional heterogeneity of cancer-associated fibroblasts with distinct neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00656-z
PMID:39334513
|
研究论文 | 研究了食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术，揭示了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞在术前治疗后的显著变化，并发现了与不良治疗反应相关的功能性成纤维细胞亚群 | 研究样本来自单一临床试验，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自术前抗PD1联合治疗临床试验的食管鳞状细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-10-01 |
YTHDF1 in periaqueductal gray inhibitory neurons contributes to morphine withdrawal responses in mice
2024-Sep-20, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03634-2
PMID:39304892
|
研究论文 | 本文研究了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的作用，及其对小鼠吗啡戒断反应的影响 | 首次揭示了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达上调与吗啡戒断反应的关系，并探讨了其通过调节NF-κB表达和磷酸化来调控吗啡戒断反应的机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨YTHDF1在其他脑区或人类中的作用 | 探讨YTHDF1在吗啡戒断反应中的作用及其机制 | YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达及其对吗啡戒断反应的影响 | NA | NA | 腺相关病毒转染、单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57/BL6小鼠或转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-10-01 |
Berberine Targets PKM2 to Activate the t-PA-Induced Fibrinolytic System and Improves Thrombosis
2024-Sep-17, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph17091219
PMID:39338381
|
研究论文 | 研究探讨了小檗碱通过靶向PKM2激活t-PA诱导的纤溶系统，从而改善血栓形成的作用 | 首次揭示了小檗碱通过调节PKM2表达来影响纤溶系统中t-PA的表达，从而改善血栓形成 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步在临床试验中验证其效果 | 探讨小檗碱治疗动脉血栓的潜在机制 | 小檗碱对血栓形成的影响及其分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 质谱分析和单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质表达数据 | 使用大鼠作为实验对象，具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-10-01 |
scVGATAE: A Variational Graph Attentional Autoencoder Model for Clustering Single-Cell RNA-seq Data
2024-Sep-11, Biology
DOI:10.3390/biology13090713
PMID:39336140
|
研究论文 | 提出了一种名为scVGATAE的无监督聚类方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞亚群识别 | 引入了一种结合图注意力网络的变分图自编码器模型，通过网络去噪构建可靠的细胞图，并自适应确定模型训练迭代次数 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的无监督聚类方法，以提高单细胞RNA测序数据中细胞亚群识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器（VGAE） | 单细胞RNA测序数据 | 九个公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Hezuo Pig Testis Cells
2024-Sep-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25189786
PMID:39337274
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了合作猪睾丸细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了合作猪睾丸细胞的转录组特征，揭示了不同细胞类型在精子发生过程中的动态变化 | 研究仅限于4个月大的成熟合作猪，未涵盖不同年龄段的合作猪 | 探究合作猪睾丸细胞在精子发生过程中的转录组变化 | 合作猪睾丸中的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16,082个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-10-01 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Dynamic Cellular Processes in Corneal Epithelium During Wound Healing in Cynomolgus Monkeys
2024-Sep-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.11.43
PMID:39330987
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴角膜上皮细胞在伤口愈合过程中的细胞活动和转录变化 | 首次全面探索了非人灵长类动物角膜细胞在伤口愈合过程中的详细转录组特征 | NA | 揭示角膜伤口愈合过程中的动态调控机制 | 食蟹猴角膜上皮细胞在不同愈合阶段的细胞活动和转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 食蟹猴角膜边缘组织在未受伤、1天和3天愈合阶段的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-10-01 |
ICOS-expressing Regulatory T Cells Influence the Composition of Antitumor CTL Populations
2024-Sep-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300154
PMID:38995175
|
研究论文 | 研究探讨了ICOS在抗肿瘤T细胞反应和肿瘤进展中的作用，发现ICOS在调节性T细胞中的特异性敲除可以减少肿瘤负担并增加CD8+ CTLs的数量 | 首次揭示了ICOS在调节性T细胞中对CTL成熟过程的抑制作用，并提出了ICOS激动剂抗体在低调节性T细胞肿瘤中的潜在治疗效果 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，结果可能不完全适用于人类 | 探讨ICOS在抗肿瘤T细胞反应中的作用及其对肿瘤进展的影响 | ICOS在调节性T细胞和所有T细胞中的特异性敲除对肿瘤进展的影响 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 实验小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-10-01 |
IFIT3 mediates TBK1 phosphorylation to promote activation of pDCs and exacerbate systemic sclerosis in mice
2024-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1800
PMID:39305055
|
研究论文 | 研究IFIT3/TBK1信号通路在激活浆细胞样树突状细胞（pDCs）及其在系统性硬化症（SSc）发展中的作用 | 揭示了IFIT3作为TBK1的上游调节因子，通过干预IFIT3/TBK1信号通路抑制pDC激活和纤维母细胞功能，为SSc提供了新的治疗靶点 | NA | 评估IFIT3/TBK1信号通路在激活pDCs和系统性硬化症（SSc）发展中的作用 | 浆细胞样树突状细胞（pDCs）和系统性硬化症（SSc） | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和高通量转录组RNA测序 | NA | RNA | 构建了IFIT3-/-小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-09-30 |
Single-cell sequencing suggests a conserved function of Hedgehog-signalling in spider eye development
2024-Sep-26, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-024-00230-6
PMID:39327634
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序数据重新分析，揭示了Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的保守功能 | 本文首次发现Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的作用，并展示了其在蜘蛛中的保守性 | 本文主要基于已发表的单细胞测序数据进行分析，未进行新的实验验证 | 探讨Hedgehog信号通路在蜘蛛眼睛发育中的作用及其保守性 | 蜘蛛眼睛发育过程中的基因表达调控网络 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个蜘蛛物种的胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-09-30 |
POU4F3 is a Sensitive and Specific Marker of Merkel Cell Carcinoma
2024-Sep-26, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100627
PMID:39341281
|
研究论文 | 研究确定了POU4F3作为Merkel细胞癌的敏感和特异性标记物 | 首次发现POU4F3作为Merkel细胞癌的特异性标记物，并验证了其在区分Merkel细胞癌与其他类似肿瘤中的应用 | 研究样本主要集中在TCGA数据集和其他公开数据集，可能存在数据偏倚 | 寻找和验证Merkel细胞癌的敏感和特异性标记物 | Merkel细胞癌及其类似肿瘤 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA测序 | NA | RNA | 9264个实体肿瘤和超过600,000个单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-09-30 |
Single-cell RNA sequencing revealed the roles of macromolecule epidermal growth factor receptor (EGFR) in the hybrid sterility of hermaphroditic Argopecten scallops
2024-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136062
PMID:39341320
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了巨分子表皮生长因子受体（EGFR）在雌雄同体扇贝杂交不育中的作用 | 首次在杂交扇贝的性腺中进行全面的单细胞RNA测序，揭示了EGFR在杂交不育中的关键作用 | NA | 探讨EGFR在雌雄同体扇贝杂交不育中的遗传机制 | 雌雄同体扇贝的杂交不育性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌雄同体扇贝的杂交不育性腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-09-30 |
nsDCC: dual-level contrastive clustering with nonuniform sampling for scRNA-seq data analysis
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae477
PMID:39327063
|
研究论文 | 提出了一种名为nsDCC的双层对比聚类方法，结合非均匀采样技术用于单细胞RNA测序数据分析 | 引入双层对比聚类方法，结合实例级和聚类级对比，同时优化降维和聚类任务，并通过非均匀采样和注意力机制增强模型性能 | NA | 开发一种新的方法来优化单细胞RNA测序数据的降维和聚类任务 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 对比聚类模型 | RNA测序数据 | 涉及真实和模拟的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-09-30 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveal immune-related biomarkers in postmenopausal osteoporosis
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38022
PMID:39328516
|
研究论文 | 研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了绝经后骨质疏松症中的免疫相关生物标志物 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出六个免疫相关差异表达基因（IR-DEGs），并构建了绝经后骨质疏松症的分子亚型和诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的数据，缺乏临床样本的验证 | 探讨绝经后骨质疏松症的免疫调节机制和早期诊断生物标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA测序 | 随机森林（RF）、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）和LASSO回归模型 | RNA | 训练组使用GSE56815数据集，验证组使用GSE2208数据集，涉及单细胞RNA测序数据分析11个不同的细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-09-30 |
NOX2 mediates NLRP3/ROS facilitating nasal mucosal epithelial inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38029
PMID:39328569
|
研究论文 | 本研究探讨了NOX2在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中通过NLRP3/ROS途径促进鼻黏膜上皮炎症的机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示了NOX2在CRSwNP中通过ROS积累和NLRP3炎症小体激活的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨氧化应激在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）鼻黏膜上皮细胞中的机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的鼻黏膜上皮细胞 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HRA000772数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-09-30 |
Non-thermal atmospheric pressure plasma induces selective cancer cell apoptosis by modulating redox homeostasis
2024-Sep-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01810-8
PMID:39327567
|
研究论文 | 研究非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 首次详细探讨了非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 研究仅限于HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞，未涵盖其他类型的癌细胞 | 探索非热等离子体诱导选择性细胞死亡的机制及其在癌症治疗中的应用 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | NA | NA | 非热等离子体处理、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-09-30 |
Beyond the bulk: overview and novel insights into the dynamics of muscle satellite cells during muscle regeneration
2024-Sep-26, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00354-1
PMID:39327631
|
综述 | 本文综述了肌肉卫星细胞在肌肉再生过程中的动态变化，并介绍了单细胞技术在研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，揭示了肌肉再生过程中肌肉卫星细胞的动态异质性 | NA | 综述肌肉卫星细胞在肌肉再生中的作用，并探讨单细胞技术带来的新见解 | 肌肉卫星细胞及其在肌肉再生中的动态变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |