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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-04-17
Tumor immune microenvironment of NSCLC with EGFR exon 20 insertions may predict efficacy of first-line ICI-combined regimen
2024-09, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序和多重免疫荧光染色,探讨了EGFR外显子20插入突变非小细胞肺癌的肿瘤免疫微环境特征及其与免疫检查点抑制剂联合方案疗效的关联 首次在单细胞水平上比较了EGFR外显子20插入突变、L858R突变和野生型非小细胞肺癌的免疫微环境差异,并揭示了ex20ins患者中更抑制性的免疫微环境特征 样本量相对有限(scRNA-seq仅15例,mIF分析共62例),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证结论 探究EGFR外显子20插入突变非小细胞肺癌的肿瘤免疫微环境特征,并分析其与免疫检查点抑制剂联合方案疗效的相关性 非小细胞肺癌患者,包括EGFR外显子20插入突变、L858R突变和野生型三种亚型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 NA 单细胞转录组数据, 组织图像数据 scRNA-seq分析15例初治NSCLC样本,mIF分析62例(ex20ins 28例,L858R 30例,野生型4例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-04-15
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过抑制TRPC3通道,改善了阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 首次发现TRPC3在AD患者和模型中的上调,并鉴定出抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 研究主要基于动物和细胞模型,尚未在人类临床试验中验证 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病神经退行性变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 AD患者脑组织、AD小鼠模型(急性和慢性)以及培养的大鼠海马神经元 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、RNA-seq NA RNA-seq数据、细胞和动物模型数据 AD患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据、死后AD脑组织、急性和慢性AD小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-04-15
Lin-CD117+CD34+FcεRI+ progenitor cells are increased in chronic spontaneous urticaria and predict clinical responsiveness to anti-IgE therapy
2024-09, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究探讨了慢性自发性荨麻疹患者外周血中Lin-CD117+CD34+FcεRI+祖细胞的增加及其对抗IgE疗法临床反应性的预测价值 首次将外周血中特定的祖细胞亚群(Lin-CD34+CD117+FcεRI+)与CSU的临床表型及抗IgE治疗反应相关联,并利用单细胞RNA测序揭示了其细胞谱系组成 样本量相对有限(CSU患者n=55,对照组n=22),单细胞RNA测序仅在部分患者(n=8)和对照(n=4)中进行,需要更大规模的研究验证 探究慢性自发性荨麻疹的病理机制,并寻找预测抗IgE治疗(奥马珠单抗)临床反应性的生物标志物 慢性自发性荨麻疹患者(n=55,其中12人接受奥马珠单抗治疗)和健康对照(n=22)的外周血样本 免疫学,皮肤病学 慢性自发性荨麻疹 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 流式细胞数据,单细胞转录组数据 CSU患者55例(其中12例接受奥马珠单抗),健康对照22例;scRNA-Seq子集:CSU患者8例,健康对照4例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-04-11
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-09-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性的顺式调控元件及其调控基因 开发了一种将高度多重CRISPRa扰动与scRNA-seq结合的新方法,首次在单细胞水平上系统评估细胞类型特异性增强子和启动子对基因表达的调控作用 研究仅针对K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元两种细胞类型,未涵盖更广泛的细胞类型或体内环境 开发一种高通量筛选方法,以识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件及其靶基因 K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 基因组学 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 CRISPRa, 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用493个gRNA靶向候选顺式调控元件 NA 单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-04-09
Revealing a cancer-associated fibroblast-based risk signature for pancreatic adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA-seq analysis
2024-09-26, Aging
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA-seq分析,揭示了胰腺腺癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)的风险特征,并构建了一个七基因风险特征用于预测预后和免疫治疗反应 首次探索了基于CAF的风险特征在胰腺腺癌中的预后意义,并构建了一个结合年龄和CAF特征的列线图模型,用于准确预测患者预后和免疫治疗反应 研究依赖于公开数据库数据,可能受样本异质性和数据质量限制,且风险特征在临床验证前需进一步外部验证 探索癌症相关成纤维细胞(CAF)在胰腺腺癌中的预后价值,并构建预测模型 胰腺腺癌(PAAD)患者样本 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),微阵列分析 LASSO回归,Cox回归,列线图模型 RNA-seq数据,微阵列数据 来自GSE155698(单细胞数据)、TCGA-PAAD队列和GEO数据库的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
26 2026-04-09
The cell rejuvenation atlas: leveraging network biology to identify master regulators of rejuvenation strategies
2024-09-09, Aging
研究论文 本研究开发了一个名为SINGULAR的细胞年轻化图谱,通过单细胞RNA-seq和网络生物学方法,系统分析了多种年轻化策略在多个器官中的分子机制 首次构建了统一的细胞年轻化图谱,利用网络生物学在单细胞分辨率下比较不同年轻化策略,并识别出调控年轻化反应的关键主调节因子 未在摘要中明确提及具体限制,但可能涉及数据覆盖范围或实验验证的局限性 旨在揭示年轻化策略的分子机制,以设计更全面的细胞年轻化干预措施 多种年轻化策略(如热量限制和部分重编程)在多个器官中的细胞 网络生物学 老年疾病 单细胞RNA-seq NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2026-04-09
A broken network of susceptibility genes in the monocytes of Crohn's disease patients
2024-09, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和两个独立的单细胞转录组数据集,探索了克罗恩病患者和健康对照中232个易感基因的表达网络 揭示了易感基因在人类肠道单核细胞中特异性严格表达,并首次在单细胞水平上展示了健康对照中易感基因网络的完整性及其在克罗恩病患者中的破坏 研究依赖于两个独立数据集,样本量可能有限,且未详细探讨环境因素如何具体影响基因网络 研究克罗恩病中大量易感基因的表达机制及其网络状态 克罗恩病患者和健康对照的肠道单核细胞 数字病理学 克罗恩病 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA-seq数据 两个独立数据集,具体样本数未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2026-04-05
Human organoids with an autologous tissue-resident immune compartment
2024-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究开发了包含自体组织驻留免疫细胞的人类肠道免疫类器官,用于模拟上皮与免疫系统的相互作用 首次构建了整合自体组织驻留记忆T细胞的人类肠道免疫类器官,能够模拟体内免疫-上皮相互作用 类器官系统可能无法完全复制体内复杂的微环境,且研究主要聚焦于T细胞,未涵盖所有免疫细胞类型 研究组织驻留免疫细胞与上皮细胞的相互作用机制,及其在疾病中的作用 人类肠道上皮细胞和自体组织驻留记忆T细胞 细胞生物学 自身免疫疾病和癌症 单细胞转录组学 人类肠道免疫类器官 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2026-04-02
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 首次发现中脑胆碱能神经元的长程投射通过M1和M3毒蕈碱受体促进DMG生长,并揭示了其与健康少突胶质前体细胞增殖的平行效应 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,人类患者样本验证有限,且胆碱能神经元亚群的具体作用机制仍需进一步探索 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 弥漫性中线胶质瘤细胞、健康少突胶质前体细胞、胆碱能神经元 神经科学 弥漫性中线胶质瘤 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 小鼠模型、hiPSC衍生神经元模型 基因表达数据、细胞增殖数据 原发性患者DMG样本、DMG荷瘤小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
30 2026-03-24
Comprehensive review on single-cell RNA sequencing: A new frontier in Alzheimer's disease research
2024-09, Ageing research reviews IF:12.5Q1
综述 本文全面综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在阿尔茨海默病研究中的应用、贡献与挑战 系统总结了scRNA-seq如何革新对AD细胞异质性的理解,并重点介绍了其在发现新生物标志物、揭示疾病相关通路及阐明非神经元细胞作用方面的最新进展 作为综述文章,未进行原始数据研究,主要总结现有文献,可能未涵盖所有最新研究 探讨scRNA-seq在阿尔茨海默病研究中的应用,以增进对疾病机制的理解并推动靶向治疗开发 阿尔茨海默病相关的脑组织细胞,特别是神经元、小胶质细胞和星形胶质细胞等 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
31 2026-03-21
Single-cell RNA sequencing reveals microenvironmental infiltration in non-small cell lung cancer with different responses to immunotherapy
2024-09, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析非小细胞肺癌中免疫治疗不同反应样本的肿瘤微环境,揭示了CD8+ T细胞、巨噬细胞和肿瘤上皮细胞的差异,并识别了与不良预后相关的生物标志物 首次在非小细胞肺癌中结合单细胞RNA测序技术,比较主要病理反应和非主要病理反应样本的肿瘤微环境细胞组成差异,并发现新的预测免疫治疗反应的生物标志物 样本量较小(仅12个样本),且仅基于公开数据集GSE207422,缺乏独立验证队列 探索非小细胞肺癌对免疫治疗不同反应的肿瘤微环境机制,并寻找预测治疗反应的生物标志物 非小细胞肺癌患者肿瘤组织样本(包括4个主要病理反应和8个非主要病理反应样本) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 12个非小细胞肺癌原发肿瘤样本(4个MPR,8个NMPR) NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2026-03-20
FAT1 as a tumor mutation burden specific gene affects the immunotherapy effect in head and neck squamous cell cancer
2024-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了FAT1基因突变作为头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性标志物,及其对免疫治疗效果的影响 首次在头颈部鳞状细胞癌中揭示FAT1基因突变与高肿瘤突变负荷及免疫治疗耐药性的特异性关联,并利用单细胞RNA测序技术解析了高TMB样本中免疫微环境的特征细胞群 样本量较小(仅33例患者),且为单中心研究,需要更大规模的多中心队列进行验证 探究头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性遗传突变及其对免疫治疗反应的影响机制 头颈部鳞状细胞癌患者 肿瘤免疫学 头颈部鳞状细胞癌 二代测序,单细胞RNA测序,转录组分析 NA 基因组测序数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 33例头颈部鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
33 2026-03-20
A distinct subset of urothelial cells with enhanced EMT features promotes chemotherapy resistance and cancer recurrence by increasing COL4A1-ITGB1 mediated angiogenesis
2024-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在尿路上皮癌中发现了一个具有上皮-间质转化特征的细胞亚群,该亚群通过介导COL4A1-ITGB1相互作用促进血管生成,从而导致化疗耐药和癌症复发 首次在尿路上皮癌中通过单细胞RNA测序鉴定出具有EMT特征的特定尿路上皮细胞亚群,并揭示了其通过COL4A1-ITGB1相互作用介导血管生成和化疗耐药的新机制 研究未明确说明单细胞测序样本的具体数量,且EMT-UC样细胞是通过过表达ZEB1和DES构建的,可能与体内天然存在的EMT-UC存在差异 探究尿路上皮癌化疗耐药和肿瘤复发的潜在机制 尿路上皮癌患者组织样本、构建的EMT-UC样细胞 单细胞组学 尿路上皮癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-03-19
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-09-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为scDist的计算工具,用于在单细胞RNA-seq数据中稳健地识别受扰动的细胞类型 基于混合效应模型,提供统计严谨且计算高效的方法,以克服个体和队列变异导致的假阳性问题 未在摘要中明确提及 检测单细胞转录组数据中因疾病或条件变化而改变的细胞类型 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型,特别是免疫细胞如树突状细胞、浆细胞样树突状细胞和FCER1G+NK细胞 单细胞转录组学 COVID-19 单细胞RNA-seq 混合效应模型 单细胞转录组数据 未在摘要中明确提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
35 2026-03-17
Endothelial-adipocyte Cx43 Mediated Gap Junctions Can Regulate Adiposity
2024-09-10, Function (Oxford, England)
研究论文 本研究探讨了内皮细胞与脂肪细胞间通过Cx43介导的间隙连接在调节脂肪组织功能和肥胖中的作用 首次通过单细胞RNA测序和透射电镜揭示了脂肪毛细血管内皮细胞与脂肪细胞间的直接异细胞接触,并发现Cx43介导的间隙连接在调节脂肪堆积和脂质代谢中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;体外共培养系统可能无法完全模拟体内复杂微环境 研究脂肪毛细血管内皮细胞与脂肪细胞相互作用的机制及其对代谢功能的影响 高脂饮食小鼠的脂肪组织、内皮细胞和脂肪细胞 单细胞组学 肥胖 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、透射电镜(TEM) NA 单细胞转录组数据、图像数据 高脂饮食小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-03-14
Inferring cell differentiation maps from lineage tracing data
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于潜能概念的细胞分化图数学框架,并开发了算法,用于从单细胞谱系追踪数据中推断最优细胞分化图 引入基于潜能概念的细胞分化图数学框架,开发算法平衡分化图复杂性与谱系树上未观察到的细胞类型转换数量,相比现有方法更准确地推断分化图 NA 推断细胞分化图,以描述多能细胞在发育过程中通过逐渐受限的祖细胞类型层次分化为特化细胞类型的过程 哺乳动物躯干发育模型和小鼠造血系统 机器学习 NA 单细胞谱系追踪技术 NA 单细胞谱系追踪数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2026-03-06
Spatial multi-omics reveal intratumoral humoral immunity niches associated with tertiary lymphoid structures in pancreatic cancer immunotherapy pathologic responders
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间多组学分析揭示了胰腺癌免疫治疗病理应答者中三级淋巴结构相关的瘤内体液免疫微环境 首次结合机器学习H&E图像分类模型和无监督基因表达矩阵分解方法,系统表征了三级淋巴结构微环境中的细胞状态,并发现了与PDAC患者生存改善显著相关的TLS特异性空间基因表达特征 样本量相对较小(仅26个PDAC肿瘤),且研究局限于接受联合免疫治疗的患者群体 探究胰腺癌中三级淋巴结构在肿瘤微环境中的空间关系及其在免疫治疗中的作用机制 接受联合免疫治疗的胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学、空间蛋白质组学、BCR测序 机器学习图像分类模型、无监督基因表达矩阵分解方法 H&E图像、空间转录组数据、空间蛋白质组数据 26个PDAC肿瘤样本 NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, BCR测序 NA NA
38 2026-03-04
Single-cell DNA methylation analysis tool Amethyst reveals distinct noncanonical methylation patterns in human glial cells
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为Amethyst的综合性R软件包,用于处理和分析图谱规模的单细胞甲基化测序数据 开发了首个用于图谱规模单细胞甲基化测序数据分析的综合性R软件包Amethyst,并利用该工具在人类大脑数据集中发现并描述了星形胶质细胞和少突胶质细胞中存在非典型甲基化模式,挑战了该甲基化形式主要与大脑神经元相关的传统观点 未明确提及具体局限性 开发单细胞甲基化测序数据分析工具,并探索人类胶质细胞中的甲基化模式 人类外周血单个核细胞(PBMC)、人类大脑皮层细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞 生物信息学 NA 单细胞甲基化测序 NA 甲基化测序数据 NA NA 单细胞甲基化测序 NA NA
39 2026-03-03
A single-cell transcriptomic dataset of pluripotent stem cell-derived astrocytes via NFIB/SOX9 overexpression
2024-09-10, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,构建了NFIB/SOX9过表达诱导人多能干细胞分化为星形胶质细胞的全面转录组图谱 首次利用单细胞RNA测序技术,系统描绘了NFIB/SOX9过表达诱导星形胶质细胞分化的详细路径和分子特征 诱导星形胶质细胞的精确分化路径和分子特征仍未完全阐明 解析NFIB/SOX9诱导星形胶质细胞分化的分子机制,为神经系统疾病研究提供模型 人多能干细胞(iPSCs)及其NFIB/SOX9过表达诱导分化的星形胶质细胞 单细胞转录组学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 64,736个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
40 2026-03-02
Expression patterns of keratin family members during tooth development and the role of keratin 17 in cytodifferentiation of stratum intermedium and stellate reticulum
2024-09, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和微阵列分析,揭示了角蛋白家族成员在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式,并发现角蛋白17(Krt17)对中间层和星网状层细胞分化至关重要 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析牙齿发育过程中角蛋白家族的动态表达谱,并明确了Krt17在中间层细胞分化中的特异性功能 研究主要基于小鼠模型,人类牙齿发育中的角蛋白表达模式仍需验证;细胞功能实验仅在SF2细胞系中进行,体内功能需进一步证实 阐明角蛋白家族在牙齿发育过程中的表达规律及其在细胞分化中的作用机制 出生后第1天小鼠磨牙的牙胚组织及SF2牙上皮细胞系 发育生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列分析、细胞功能实验 NA 单细胞转录组数据、微阵列数据 未明确样本数量(基于出生后第1天小鼠磨牙的scRNA-seq数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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