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当前共找到 631 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-19 |
Imputing abundance of over 2,500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-09-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.08.006
PMID:39243755
|
研究论文 | 提出了基于单细胞转录组的上下文无关零样本深度集成模型SPIDER，可预测超过2500种表面蛋白的丰度 | 首次实现零样本预测超过2500种表面蛋白丰度，并具有良好的跨上下文泛化能力 | 未提及模型预测在真实实验验证中的具体准确率限制 | 开发能够从单细胞转录组数据大规模预测表面蛋白丰度的计算方法 | 单细胞转录组数据与表面蛋白丰度预测 | 机器学习 | 肝细胞癌，结直肠癌 | 单细胞RNA测序，CITE-seq | 深度集成模型（零样本学习） | 转录组数据（单细胞水平） | 涉及肝细胞癌和结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-06-19 |
Increased autoreactivity and maturity of EBI2+ antibody-secreting cells from nasal polyps
2024-09-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177729
PMID:39253973
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研究论文 | 该研究探究了鼻息肉组织中表达EBI2的抗体分泌细胞的自身反应性和成熟度增加的特征 | 首次揭示了鼻息肉中EBI2+抗体分泌细胞具有更高的自身抗体产生倾向及其分子特征，包括抗dsDNA IgG的增加和成熟浆细胞分化标志 | 未具体说明研究局限性 | 研究鼻息肉中表达EBI2的B细胞对自身抗体产生的倾向性，并评估鼻息肉抗体分泌细胞的分子特征 | 鼻息肉和扁桃体组织中的B细胞及抗体分泌细胞 | 自然语言处理 | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 基因表达数据 | 包括鼻息肉和扁桃体样本，具体数量未提及 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 23 | 2026-06-19 |
Transcriptomic dysregulation and autistic-like behaviors in Kmt2c haploinsufficient mice rescued by an LSD1 inhibitor
2024-09, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02479-8
PMID:38528071
|
研究论文 | 本研究通过Kmt2c单倍性不足小鼠模型，发现转录组失调与自闭症样行为，并证明LSD1抑制剂可缓解社交缺陷 | 首次整合单细胞RNA测序与ChIP-seq分析，揭示Kmt2c单倍性不足导致径向胶质细胞和未成熟神经元中ASD相关转录组改变，并发现LSD1抑制剂可逆转大部分差异表达基因 | 未详细说明样本量及行为测试的性别差异；仅关注成年小鼠和新生小鼠的大脑，缺乏发育全过程的纵向分析 | 探究KMT2C单倍性不足导致神经发育缺陷的分子机制及潜在治疗方法 | Kmt2c杂合移码突变小鼠（Kmt2c+/-） | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，ChIP-seq，批量RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据（基因表达） | 未明确说明，涉及成年小鼠和新生小鼠的大脑样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，ChIP-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-06-17 |
Characteristics and functions of an atypical inflammation-associated GZMK+GZMB+CD8+ T subset in people living with HIV-1
2024-09, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.003
PMID:39053388
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研究论文 | 分析了HIV-1感染者中一个非典型炎症相关GZMK+GZMB+CD8+ T细胞亚群的特征和功能 | 首次详细描述了GZMK+GZMB+CD8+ T细胞亚群在HIV-1慢性感染中的异质性、分化状态和炎症诱导功能，揭示了其与疾病标志物的相关性 | 对GZMK+GZMB+CD8+ T细胞亚群的机制研究主要基于体外实验，体内功能尚未完全阐明 | 阐明慢性HIV-1感染中GZMK+CD8+ T细胞亚群的表型、功能特征及其与疾病的相关性 | HIV-1感染者的CD8+ T细胞亚群，特别是GZMK+和GZMB+细胞 | 单细胞转录组学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞术数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3' 测序 |
| 25 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptome sequencing partially revealed the changes of T cells in the early stage of aging kidney
2024-09, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.005
PMID:39059207
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序部分揭示了早期衰老肾脏中T细胞的变化 | 首次在单细胞水平上分析早期衰老肾脏中T细胞的分子表型和组成变化，并鉴定出GZMK CD8 T细胞和Il17a T细胞两个亚群 | 仅关注肾脏老化的早期阶段，未涵盖整个衰老过程；且主要基于小鼠模型，人类肾脏老化的适用性需进一步验证 | 探究肾脏早期衰老过程中免疫细胞特别是T细胞的分子变化及其在炎症和组织损伤中的作用 | 早期衰老小鼠的肾脏组织 | 单细胞转录组学 | 肾脏衰老 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肾脏样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis" [Mol. Immunol. 172 (2024) 85-95]
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.013
PMID:39088936
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-06-15 |
Glucose deprivation-induced disulfidptosis in human nucleus pulposus cells: a novel pathological mechanism of intervertebral disc degeneration
2024-09-12, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00528-4
PMID:39267140
|
研究论文 | 发现葡萄糖剥夺诱导的人髓核细胞二硫下垂是椎间盘退变的新病理机制 | 首次证实髓核细胞中二硫下垂的存在并鉴定出新的二硫下垂相关细胞亚群，揭示了营养不良与椎间盘退变的新联系 | 仅使用一个正常样本和一个椎间盘退变样本进行单细胞RNA测序分析，样本量有限 | 探究营养剥夺诱导的细胞死亡（特别是二硫下垂）在椎间盘退变中的作用 | 人髓核细胞、软骨细胞亚群、椎间盘退变组织 | 自然语言处理 | 椎间盘退变 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组DNA甲基化测序, 机器学习 | 预测模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据 | 一个正常样本和一个椎间盘退变样本（用于单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-06-15 |
Integrative genomics unveils basement membrane-related diagnostic markers and therapeutic targets in esophageal squamous cell carcinoma
2024-09-11, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00529-3
PMID:39256753
|
研究论文 | 利用整合基因组学揭示食管鳞状细胞癌中基底膜相关的诊断标志物和治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序数据结合多种机器学习算法，鉴定出七个基底膜相关基因（BGN、LAMB3、SPARC、MMP1、LUM、COL4A1和NELL2）作为ESCC诊断标志物，并发现BGN作为潜在药物靶点 | 当前对基底膜相关基因在ESCC诊断中的研究仍较稀疏 | 识别基底膜相关诊断标志物并构建ESCC诊断模型，探索潜在治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌（ESCC） | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、SVM-RFE | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的食管鳞状细胞癌样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序数据来源GEO数据库 |
| 29 | 2026-06-01 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-09-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
|
研究论文 | 提出了面向最终用户的单细胞RNA-seq数据在线分析工具scRNA-Explorer，支持基因相关性分析和数据过滤 | 开发了交互式在线工具，整合基因相关性分析、生物学重要性评估和基因富集分析，简化了单细胞RNA-seq数据的下游分析 | NA | 简化单细胞RNA-seq数据分析流程，提供面向非专业用户的交互式在线分析工具 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-05-29 |
Comprehensive profiling of the human fecal proteome from IBD patients with DIA-MS enables evaluation of disease-relevant proteins
2024-09, Proteomics. Clinical applications
DOI:10.1002/prca.202300075
PMID:38552248
|
研究论文 | 使用DIA-MS技术对炎症性肠病（IBD）患者粪便蛋白质组进行综合分析，识别与疾病活动相关的非侵入性生物标志物 | 首次采用数据非依赖采集（DIA）LC-MS/MS方法系统分析IBD患者的粪便蛋白质组，在两个独立队列中鉴定了523种常见蛋白质，并发现了新的粪便蛋白质与免疫细胞浸润和溃疡/直肠出血等IBD病理标志相关 | 样本量相对较小（健康对照组25例，UC患者15例，CD患者15例），研究结果需在更大规模队列中验证 | 识别可用于监测炎症性肠病疾病活动性的非侵入性粪便生物标志物 | 炎症性肠病（IBD）患者，包括溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD）患者，以及健康对照者 | 蛋白质组学 | 炎症性肠病 | DIA-MS（数据非依赖采集质谱） | NA | 蛋白质质谱数据，单细胞RNA测序数据 | 队列1：健康5例，UC 5例，CD 5例；队列2：健康20例，UC 10例，CD 10例（共计健康25例，UC 15例，CD 15例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-05-28 |
Low protein diet protects the liver from Salmonella Typhimurium-mediated injury by modulating the mTOR/autophagy axis in macrophages
2024-09-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06932-w
PMID:39349819
|
研究论文 | 研究低蛋白饮食对小鼠肝脏抵抗鼠伤寒沙门氏菌感染的保护作用及其机制 | 首次揭示低蛋白饮食通过调控巨噬细胞中mTOR/自噬轴来保护肝脏免受细菌感染损伤 | NA | 探究低蛋白饮食对先天免疫系统的影响及其在肝脏细菌感染中的保护机制 | 小鼠肝脏细胞及人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 | NA | 感染性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠肝脏细胞及人外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-05-28 |
Full-length single-cell BCR sequencing paired with RNA sequencing reveals convergent responses to pneumococcal vaccination
2024-09-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06823-0
PMID:39341987
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研究论文 | 提出一种从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列的方法，并应用于分析肺炎球菌疫苗诱导的B细胞应答 | 首次实现从广泛使用的3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列，能够同时获取转录组和BCR信息，并揭示疫苗诱导的趋同应答 | 方法在婴儿恒河猴模型中验证，尚需在更大样本和更广泛疫苗接种场景中进一步验证 | 开发并验证从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长BCR序列的方法，以解析疫苗诱导的B细胞应答特征 | 5只婴儿恒河猴的B细胞（针对肺炎球菌血清型3荚膜多糖的糖缀合疫苗应答） | 单细胞测序、免疫学 | 肺炎球菌感染 | 单细胞RNA测序、BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、BCR序列数据 | 5只婴儿恒河猴 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 3'条形码单细胞RNA测序文库（具体版本未提及） |
| 33 | 2026-05-20 |
Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester - An analysis by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100919
PMID:38941941
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类妊娠早期胎盘绒毛周细胞的基因表达谱 | 首次鉴定出REN和AREG阳性成纤维细胞特异性表达经典周细胞标志物，并发现AREG在早期胎盘绒毛周细胞中特异性转录但蛋白定位于合体滋养层 | 未明确说明具体局限性 | 探究胎盘绒毛周细胞作为胎盘绒毛间充质细胞亚群的标志物和功能 | 人类妊娠早期胎盘绒毛组织中的周细胞 | 数字病理学 | 胎盘相关妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 34 | 2026-05-19 |
Sex-specific effects of injury and beta-adrenergic activation on metabolic and inflammatory mediators in a murine model of post-traumatic osteoarthritis
2024-09, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.03.109
PMID:38527663
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研究论文 | 研究损伤和β-肾上腺素能激活对小鼠创伤后骨关节炎代谢和炎症介质的性别特异性影响 | 首次揭示β-肾上腺素受体激动剂异丙肾上腺素在雌性而非雄性小鼠中抑制创伤后骨关节炎相关炎症，表明交感神经信号通路治疗存在性别差异 | 研究仅观察急性效应，未评估长期治疗结果；仅使用单一βAR激动剂，未测试其他激动剂或拮抗剂 | 探究关节内β-肾上腺素受体刺激对创伤后骨关节炎相关炎症的抑制作用及其性别差异 | 12周龄雄性和雌性小鼠的膝部损伤模型，特别是髌下脂肪垫和滑膜组织 | NA | 创伤后骨关节炎 | 多重基因表达分析、滑液代谢组学、单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据、组织学图像 | 12周龄雄性和雌性小鼠，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 分析已发表的单细胞RNA测序数据，未指定具体平台 |
| 35 | 2026-05-17 |
The proteomic landscape and temporal dynamics of mammalian gastruloid development
2024-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.609098
PMID:39282277
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研究论文 | 通过定量蛋白质组学分析人类和小鼠原肠胚模型在四个关键分化阶段的蛋白质景观与动态变化，揭示早期哺乳动物发育中翻译与翻译后调控的物种特异性特征 | 首次系统描绘哺乳动物原肠胚发育的蛋白质组学景观，整合蛋白质组、磷酸化组与转录组数据揭示翻译与翻译后调控的物种差异，并鉴定先天性疾病的保守蛋白网络 | 未明确说明局限性 | 利用定量蛋白质组学技术解析哺乳动物原肠胚发育过程中的蛋白质动态变化与调控机制 | 人类和小鼠的原肠胚模型（包括naïve ESC、primed ESC、早期原肠胚、晚期原肠胚） | 蛋白质组学 | 先天性遗传病 | 定量蛋白质组学、RNA-seq、磷酸化位点分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、磷酸化数据 | 未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-05-17 |
Targeting EFHD2 inhibits interferon-γ signaling and ameliorates non-alcoholic steatohepatitis
2024-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.04.009
PMID:38670321
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研究论文 | 研究EFHD2在非酒精性脂肪性肝炎中的作用机制及靶向治疗效果 | 首次发现EFHD2是免疫细胞特异性分子，通过与YWHAZ相互作用介导IFNγR2膜转位，驱动干扰素-γ信号过度激活，促进NASH炎症；设计靶向EFHD2的钉肽展示治疗潜力 | 机制研究主要基于小鼠模型，人类NASH患者样本验证有限；钉肽的临床安全性及长期效果未评估 | 探究EFHD2在NASH发病中的免疫调控作用及其作为治疗靶点的可行性 | NASH患者肝脏样本、两种饮食诱导的NASH小鼠模型、髓系特异性EFHD2敲除小鼠 | 机器学习 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序、双重免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像 | NASH患者肝脏样本和两种不同饮食诱导的小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 37 | 2026-05-16 |
INSPIRE: interpretable, flexible and spatially-aware integration of multiple spatial transcriptomics datasets from diverse sources
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614539
PMID:39386646
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研究论文 | 提出INSPIRE，一种基于深度学习的多空间转录组数据集整合方法，可解释、灵活且空间感知 | 结合图神经网络和对抗学习机制，实现空间感知的数据整合；使用非负矩阵分解揭示可解释的空间因子和基因程序，并能够构建3D组织模型 | 未在论文标题和摘要中明确提及 | 开发一种方法，有效整合和解释来自不同样本、技术和发育阶段的多空间转录组数据集 | 人类皮层切片、小鼠脑切片、小鼠海马和胚胎切片、时空器官发生图谱（包含50万个空间点） | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 1D | 多种数据集，包括人类皮层切片、小鼠脑切片、小鼠海马和胚胎切片，以及包含约50万个空间点的时空器官发生图谱 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-12 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.26.600782
PMID:38979296
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研究论文 | 提出了一种计算框架STAN，用于推断空间信息指导的转录因子活性 | 首次利用空间转录组数据系统估计细胞身份相关的转录因子活性，并整合了形态学特征 | 未明确提及局限性 | 开发一种计算方法，从空间转录组数据推断转录因子的空间活性 | 空间转录组数据集中的点（spots） | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据、空间坐标、形态学特征 | 三个数据集：淋巴结、乳腺癌、胶质母细胞瘤 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-05-10 |
Muscle-resident mesenchymal progenitors sense and repair peripheral nerve injury via the GDNF-BDNF axis
2024-Sep-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97662
PMID:39324575
|
研究论文 | 发现肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）通过GDNF-BDNF轴感知并修复周围神经损伤 | 首次揭示FAPs在周围神经再生中的先前未被认识的作用，以及其通过GDNF-BDNF轴响应损伤的分子机制 | 未提及明显局限性 | 研究FAPs如何感知解剖上遥远的周围神经损伤及其对神经再生的直接贡献 | 肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）和周围神经损伤 | NA | 周围神经损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（包括年轻和年老小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-09 |
The transcriptome of CD14 + CD163 - HLA-DR low monocytes predicts mortality in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Sep-11, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.08.07.24311386
PMID:39211854
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析外周血单核细胞中CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组，发现其能够预测特发性肺纤维化患者的死亡率 | 首次发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的230个基因表达特征可独立预测IPF死亡率，并验证了T细胞共刺激基因的低表达与高风险相关 | 样本量相对较小，且研究主要基于外周血和支气管肺泡灌洗液，未全面探索肺组织中其他免疫细胞的贡献 | 确定与特发性肺纤维化（IPF）死亡率相关的免疫细胞特异性转录组特征 | 416例IPF患者来自六个队列，外加一个独立验证队列（38例），包括外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型 | 基因表达数据（单细胞RNA测序数据） | 初始队列18例（包括IPF、COVID-19、COVID-19后间质性肺病和对照组），验证队列416例来自六个队列，独立验证38例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |