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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Multi-condition and multi-modal temporal profile inference during mouse embryonic development
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.03.583179
PMID:38496477
|
研究论文 | 提出Sunbear联合建模框架,用于整合多条件和多模态的单细胞时间序列数据 | 开发能够整合多条件和多模态单细胞时间序列数据的联合建模框架,实现单细胞时间谱变化插补、多数据集多模态谱对齐以及缺失模态的外推预测 | 基于破坏性单细胞测量技术,无法捕获特定细胞的完整时间轨迹 | 开发单细胞多条件多模态时间序列数据的整合分析方法 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 联合建模框架 | 单细胞时间序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-05 |
Construction of thyroid cancer classification and iodine metabolism related diagnostic model using thyroid differentiation score and bioinformation
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039464
PMID:39252309
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研究论文 | 构建基于甲状腺分化评分和生物信息学的甲状腺癌分类及碘代谢相关诊断模型 | 首次结合甲状腺分化评分与碘代谢特征构建甲状腺癌诊断模型,识别出5个独立预测基因 | 模型验证主要依赖公共数据库数据,需要进一步临床前瞻性研究验证 | 开发甲状腺癌亚型分类诊断模型以提高诊疗准确性 | 甲状腺癌患者基因表达数据和临床病理信息 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 逻辑回归模型, 机器学习模型 | 基因表达谱, 临床数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的甲状腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-05 |
CD8+ T-cell differentiation and dysfunction inform treatment response in acute myeloid leukemia
2024-09-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021680
PMID:38776511
|
研究论文 | 本研究通过多模态方法揭示了CD8+ T细胞分化状态与急性髓系白血病治疗反应的关系 | 发现早期记忆CD8+ T细胞分化为两个不同的终末状态,并揭示CD8+衰老细胞偏向分化是治疗抵抗的标志 | NA | 探究CD8+ T细胞分化状态、功能障碍与AML治疗反应的关联机制 | 急性髓系白血病患者的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 高维流式细胞术, 单细胞转录组学 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies interferon-inducible monocytes/macrophages as a cellular target for mitigating the progression of abdominal aortic aneurysm and rupture risk
2024-09-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae117
PMID:38836630
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞是减轻腹主动脉瘤进展和破裂风险的细胞靶点 | 首次通过单细胞RNA测序在腹主动脉瘤中发现独特的干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞亚群,并揭示其在疾病进展中的关键作用 | 研究基于AngII灌注的ApoE-/-小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探索腹主动脉瘤发展和进展中涉及的细胞类型和信号通路 | AngII灌注的ApoE-/-小鼠腹主动脉标本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同病理特征的腹主动脉标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-05 |
Modeling Lewy body disease with SNCA triplication iPSC-derived cortical organoids and identifying therapeutic drugs
2024-09-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk3700
PMID:39259788
|
研究论文 | 利用SNCA基因三倍化iPSC来源的皮质类器官模拟路易体病并筛选治疗药物 | 首次建立人类皮质路易体病模型,通过高通量药物筛选发现四种能抑制α-突触核蛋白聚集的FDA批准药物 | 研究基于基因三倍化特定突变模型,可能无法完全代表散发性路易体病的病理机制 | 阐明α-突触核蛋白在皮质神经元中的病理机制并筛选治疗药物 | 路易体病患者来源的iPSC皮质类器官和兴奋性神经元 | 数字病理学 | 路易体病 | 单细胞RNA测序, 实时震动诱导转化试验 | 皮质类器官模型 | 基因表达数据, 蛋白质聚集数据 | 1280种FDA批准药物筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-05 |
A pheromone receptor in cichlid fish mediates attraction to females but inhibits male parental care
2024-Sep-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.07.029
PMID:39094572
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和基因编辑技术揭示了慈鲷鱼类中信息素受体Or113a在调控雄性求偶行为和抑制父本育幼行为中的双重功能 | 发现单一信息素受体Or113a既能介导对雌性的吸引又能在演化中获得抑制父本育幼行为的新功能 | 研究仅针对慈鲷鱼类,其他鱼类物种的信息素感知机制仍需进一步探索 | 探究脊椎动物信息素信号演化如何导致新生殖行为策略的产生 | 慈鲷鱼类(特别是单倍色鲷类群)的生殖行为调控机制 | NA | NA | 单细胞转录组学,CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据,行为观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-10-05 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008
PMID:39255776
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤通过招募和分化颅骨骨髓中的树突状样“杂交”中性粒细胞来抑制肿瘤生长的机制 | 首次发现颅骨骨髓来源的具有树突状特征的杂交中性粒细胞在胶质母细胞瘤中发挥抗肿瘤作用 | NA | 探究胶质母细胞瘤中肿瘤相关中性粒细胞的来源、分化和功能 | 胶质母细胞瘤患者和小鼠模型中的肿瘤相关中性粒细胞 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
MultiSC: a deep learning pipeline for analyzing multiomics single-cell data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae492
PMID:39376034
|
研究论文 | 提出了一种名为MultiSC的深度学习流程,用于分析多组学单细胞数据 | 开发了首个能够有效整合三种组学数据(基因表达、染色质可及性、转录因子蛋白表达)的多组学单细胞分析流程 | NA | 解决多组学单细胞数据整合分析工具缺乏的问题 | 多组学单细胞数据 | 机器学习 | NA | NEAT-seq | 多模态约束自编码器, 矩阵分解模型, 多元线性回归 | 多组学数据(基因表达、染色质可及性、蛋白表达) | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
The choroid plexus synergizes with immune cells during neuroinflammation
2024-Sep-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.002
PMID:39089253
|
研究论文 | 本研究通过活体双光子成像和单细胞转录组学揭示了脉络丛在神经炎症中与免疫细胞协同作用的机制 | 首次发现脉络丛上皮细胞会短暂特化以滋养免疫细胞,并协调其招募、存活和分化,同时调控紧密连接以控制血脑屏障通透性 | 研究使用LPS诱导的脑膜炎小鼠模型,可能与人类疾病存在物种差异 | 阐明脉络丛在神经炎症调控中的分子机制 | 清醒小鼠的脉络丛组织和免疫细胞 | 神经科学 | 脑膜炎 | 纵向双光子成像, 单细胞转录组学 | LPS诱导的脑膜炎小鼠模型 | 影像数据, 转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
HA-1-targeted T-cell receptor T-cell therapy for recurrent leukemia after hematopoietic stem cell transplantation
2024-09-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024105
PMID:38683966
|
研究论文 | 本研究评估了靶向HA-1抗原的T细胞受体T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的安全性和可行性 | 首次开发针对次要组织相容性抗原HA-1的TCR-T疗法用于移植后白血病复发治疗 | 研究样本量较小(9例患者),且非为评估疗效而设计 | 评估HA-1 TCR-T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的可行性和安全性 | 造血干细胞移植后复发白血病和髓系肿瘤患者 | 细胞治疗 | 白血病 | 单细胞RNA测序,T细胞受体基因转移 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 9例造血干细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Identification of Disulfidptosis-Related Genes in Ischemic Stroke by Combining Single-Cell Sequencing, Machine Learning Algorithms, and In Vitro Experiments
2024-09-15, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-024-08804-2
PMID:39278970
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序、机器学习算法和体外实验,探索了缺血性脑卒中中双硫死亡相关基因的作用机制 | 首次将双硫死亡机制与缺血性脑卒中研究相结合,并利用多种机器学习算法识别关键基因 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究双硫死亡相关基因在缺血性脑卒中中的作用机制及其与免疫病理特征的相关性 | 缺血性脑卒中患者外周血样本和体外氧糖剥夺模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞测序,机器学习算法,体外细胞模型 | LASSO,随机森林,SVM-RFE | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 来自GEO数据库的人类缺血性脑卒中患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Osr1-mediated mesothelial transition of liver mesenchymal cells exacerbates fibrotic liver damage
2024-Sep-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.02.024
PMID:38414241
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内谱系追踪揭示了肝星状细胞在肝损伤后向间皮细胞状态逆转的过程 | 首次发现肝星状细胞在损伤诱导下经历间充质-间皮细胞转变,并鉴定出关键转录因子Osr1在这一过程中的调控作用 | 研究主要基于小鼠NASH模型,在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究慢性肝病中肝纤维化的形成机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠非酒精性脂肪性肝炎模型中的肝星状细胞和间皮细胞 | 单细胞生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 体内谱系追踪, 双重组酶系统, 条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NASH模型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Spatial microenvironments tune immune response dynamics in the Drosophila larval fat body
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612587
PMID:39345471
|
研究论文 | 本研究通过活体光片荧光显微镜和空间转录组学技术,揭示了果蝇幼虫脂肪体免疫反应的空间动态模式 | 首次在果蝇幼虫脂肪体中发现了可重复的空间免疫反应模式,并证明该模式与微生物定位相关但不受其直接调控 | 研究局限于果蝇模型,需要在哺乳动物系统中进一步验证空间免疫组织的保守性 | 探究组织免疫反应的空间动态模式和调控机制 | 果蝇幼虫脂肪体 | 空间生物学 | 感染性疾病 | 活体光片荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | 果蝇幼虫 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury specific microenvironments and cellular interactions in kidney regeneration and disease
2024-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51186-z
PMID:39237549
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析小鼠肾脏缺血再灌注损伤中特定微环境的基因表达模式和细胞相互作用 | 首次应用空间转录组学揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式,并预测Clcf1-Crfl1在持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅针对小鼠肾脏缺血再灌注损伤模型,未涉及其他类型肾脏损伤或人类样本 | 解析肾脏损伤修复过程中的分子通路和细胞相互作用机制 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
PD-L2 drives resistance to EGFR-TKIs: dynamic changes of the tumor immune environment and targeted therapy
2024-Sep, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01317-2
PMID:38816578
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研究论文 | 本研究揭示了PD-L2通过调节肿瘤免疫环境驱动EGFR-TKIs耐药的新机制,并发现天然小分子抑制剂十一烯酸锌可逆转耐药 | 首次发现PD-L2动态变化是EGFR-TKIs获得性耐药的关键驱动因素,并鉴定出天然小分子PD-L2抑制剂十一烯酸锌 | 研究主要基于细胞系和同源肿瘤小鼠模型,尚未在临床患者中验证 | 探索EGFR-TKIs耐药机制并开发克服耐药的新策略 | EGFR突变肿瘤细胞系和同源肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Prominent role of gut dysbiosis in the pathogenesis of cystic fibrosis-related liver disease in mice
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.041
PMID:38554847
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肠道菌群失调在囊性纤维化相关肝病发病机制中的关键作用 | 首次证明肠道CFTR缺陷通过维持致病性微生物群、创造炎症环境和改变肠道通透性,成为CFLD发展的必要共因子 | 研究基于小鼠模型,需要在人类患者中进行临床验证 | 探究肠-肝轴在囊性纤维化相关肝病发病机制中的作用 | 野生型小鼠、全身性Cftr敲除小鼠和肠道校正小鼠 | NA | 囊性纤维化相关肝病 | 单细胞RNA测序, 16S核糖体RNA测序, 蛋白质组阵列, FITC-葡聚糖检测 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 蛋白质组数据 | 三种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Sex-specific effects of injury and beta-adrenergic activation on metabolic and inflammatory mediators in a murine model of post-traumatic osteoarthritis
2024-Sep, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.03.109
PMID:38527663
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研究论文 | 本研究探讨了在小鼠创伤后骨关节炎模型中,β-肾上腺素能受体激活对代谢和炎症介质的性别特异性影响 | 首次揭示了β-肾上腺素能受体激活在创伤后骨关节炎中具有性别特异性作用,女性小鼠对治疗更敏感 | 研究仅使用小鼠模型,结果需在人类中验证;代谢组学变化未受异丙肾上腺素显著影响 | 研究β-肾上腺素能受体激活对创伤后骨关节炎代谢和炎症过程的调节作用 | 12周龄雄性和雌性小鼠的膝关节组织(髌下脂肪垫和滑膜) | 骨关节炎研究 | 创伤后骨关节炎 | 组织学分析、多重基因表达分析、滑液代谢组学、机械性异常疼痛测试、单细胞RNA-seq数据分析 | 小鼠创伤后骨关节炎模型 | 基因表达数据、代谢组学数据、组织学图像、行为数据 | 12周龄雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究揭示了肾素表达抑制通过表观遗传开关从活跃状态转变为预备状态的调控机制 | 首次发现肾素表达抑制涉及从活跃状态到预备状态的表观遗传转换,并关联细胞间通讯减少和上皮-间质转化 | 研究仅使用小鼠来源的As4.1肿瘤细胞系,未在原发性细胞或体内模型中验证 | 探究肾素表达抑制的表观遗传调控机制 | 小鼠肾小球旁细胞来源的As4.1肿瘤细胞系 | 表观遗传学 | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组学数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | As4.1细胞系的生物学重复样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, CUT&Tag | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110017
PMID:39097072
|
研究论文 | 本研究探讨了通过干扰磷酸二酯酶锚定来逆转损伤相关视网膜神经节细胞基因表达的机制 | 首次证明通过表达修饰的PDE4D3 N端肽4D3(E)能够逆转视神经损伤诱导的基因表达变化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索PDE4D3位移促进神经保护作用的分子机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Flow Cytometry Panel for Analysis of Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-Sep, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.754
PMID:38606634
|
研究论文 | 本文提出了一种用于分析特发性声门下狭窄的综合流式细胞术检测方案 | 开发了针对iSGS的全面流式细胞术检测组合,首次系统描述了iSGS瘢痕组织的细胞特征 | 样本量较小(9对样本),单中心研究 | 建立特发性声门下狭窄的流式细胞术检测平台并分析其细胞组成 | 特发性声门下狭窄患者的正常组织和瘢痕组织样本 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 9对正常和瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |