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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-10-09 |
COFFEE: consensus single cell-type specific inference for gene regulatory networks
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae457
PMID:39311699
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Borda投票的共识算法COFFEE，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | COFFEE算法通过整合10种已建立的基因调控网络推断方法，提高了在合成、精选和实验数据集上的性能 | COFFEE算法目前仅在10种算法上进行了基准测试，未来可能需要扩展到更多算法 | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的共识基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识算法 | 基因调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-10-09 |
Application of Unsupervised Multi-Omic Factor Analysis to Uncover Patterns of Variation and Molecular Processes Linked to Cardiovascular Disease
2024-Sep-20, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66659
PMID:39373483
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研究论文 | 本文展示了一种无监督的多组学因子分析方法，用于揭示与心血管疾病相关的变异模式和分子过程 | 本文提出了多组学因子分析（MOFA）方法，用于无监督地分析复杂的多组学数据集，揭示主要的变异轴和相关的分子特征 | 本文主要集中在心血管疾病的急性冠状动脉综合征和慢性冠状动脉综合征，未涵盖其他疾病类型 | 研究目的是通过多组学数据分析，揭示与心血管疾病相关的分子过程和变异模式 | 研究对象包括急性冠状动脉综合征和慢性冠状动脉综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 多组学因子分析（MOFA） | NA | 多组学数据 | 多个患者的血液样本，包括不同时间点的测量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-10-09 |
Exploring public cancer gene expression signatures across bulk, single-cell and spatial transcriptomics data with signifinder Bioconductor package
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae138
PMID:39363890
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研究论文 | 本文介绍了一个名为signifinder的R Bioconductor包，用于在批量、单细胞和空间转录组数据中探索和使用公共癌症基因表达特征 | 开发了signifinder包，整合了批量、单细胞和空间转录组数据中的癌症基因表达特征，提供了一个全面的框架来解释高分辨率数据并解决肿瘤复杂性 | NA | 探索癌症机制、定义亚型、预测预后和评估治疗效果 | 癌症基因表达特征在批量、单细胞和空间转录组数据中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-10-08 |
RNA Sequencing Reveals a Strong Predominance of THRA Splicing Isoform 2 in the Developing and Adult Human Brain
2024-Sep-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25189883
PMID:39337374
|
研究论文 | 研究通过RNA测序分析了人类大脑发育和成年期THRA剪接异构体2的表达情况 | 首次在健康人体组织和发育中的大脑中研究了THRA1和THRA2剪接异构体的表达模式 | 研究仅限于RNA测序数据，未涉及蛋白质水平的验证 | 探讨THRA剪接异构体在人类大脑发育和成年期的表达模式 | THRA1和THRA2剪接异构体在人类大脑和中枢神经系统的表达 | 基因表达 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 四个bulk RNA-seq数据集和两个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-10-08 |
Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology
2024-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000387
PMID:37002587
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在肝脏生物学中的应用，涵盖了肝脏稳态、发育、再生、慢性肝病和癌症等方面的关键生物学见解 | 本文介绍了肝脏细胞图谱的最新进展，包括细胞组成的全面特征、多样性和功能、空间结构如肝脏分区、细胞通信和邻近关系、细胞身份转换和与肝脏病理相关的细胞特异性改变，以及新的治疗靶点 | 本文讨论了当前研究中的突出挑战，并提出了先进的实验技术和计算方法来解决这些挑战 | 综述单细胞和空间转录组学技术在肝脏生物学中的应用，并讨论相关技术的进展和挑战 | 肝脏稳态、发育、再生、慢性肝病和癌症 | 基因组学 | 肝病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-10-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights TNFAIP3 as an immune-related prognostic biomarker in neuroblastoma
2024-Sep, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01914-4
PMID:39028490
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研究论文 | 本文通过转录组表达谱分析，鉴定出TNFAIP3作为神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次将TNFAIP3鉴定为神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并验证了其在免疫治疗中的潜在作用 | 初步实验验证了TNFAIP3在TAMs中的生物学功能，但仍需进一步的临床试验验证其作为治疗靶点的有效性 | 鉴定神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并探讨其在免疫治疗中的潜在作用 | 神经母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其相关基因 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 17个临床神经母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-10-07 |
Full-length nanopore sequencing of circular RNA landscape in peripheral blood cells following sequential BNT162b2 mRNA vaccination
2024-Sep-27, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148971
PMID:39343185
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研究论文 | 本研究评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后外周血细胞中内源性circRNA的响应 | 通过纳米孔全长测序技术，识别了4217种在疫苗接种期间特异性表达的新circRNA，并发现这些circRNA富集在应激颗粒组装和SARS-CoV-2 RNA结合蛋白的结合基序中 | 样本量较小，仅包括五名无SARS-CoV-2感染或既往疫苗接种史的医护人员 | 研究BNT162b2 mRNA疫苗接种后外周血细胞中circRNA的表达变化 | circRNA在疫苗接种后的表达变化及其与应激颗粒组装和SARS-CoV-2 RNA结合蛋白的关系 | 数字病理学 | NA | 纳米孔全长测序 | NA | RNA | 15个样本，包括接种前、第一次和第二次接种后的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of MYH11+ tumour-associated fibroblasts between left-sided and right-sided colorectal cancer
2024-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70102
PMID:39294858
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了左半结肠癌和右半结肠癌中MYH11+肿瘤相关成纤维细胞的异质性 | 首次全面注释了左半结肠癌和右半结肠癌的特征和差异，并发现了一种新的MYH11+癌症相关成纤维细胞亚群 | 样本量较小，仅包括12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 | 探讨左半结肠癌和右半结肠癌的异质性及其潜在机制 | 左半结肠癌和右半结肠癌患者的免疫和基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-10-05 |
Identification of functional heterogeneity of immune cells and tubular-immune cellular interplay action in diabetic kidney disease
2024-Sep, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2023-0130
PMID:39360161
|
研究论文 | 研究探讨了糖尿病肾病中免疫细胞的功能异质性和肾小管-免疫细胞相互作用 | 首次揭示了dapagliflozin治疗对M2巨噬细胞抗炎功能的代谢转变，并识别了新的分子特征和信号通路 | 研究主要基于数据库分析和免疫组化验证，缺乏体内实验验证 | 探讨糖尿病肾病中免疫细胞的异质性和治疗机制 | 糖尿病肾病中的免疫细胞和肾小管细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 58760个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-10-04 |
Dynamic glycolytic reprogramming effects on dendritic cells in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Sep-30, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03192-8
PMID:39343933
|
研究论文 | 研究胰腺导管腺癌中葡萄糖和乳酸水平对树突状细胞抗原呈递功能的影响 | 首次阐明葡萄糖和乳酸水平对胰腺导管腺癌中树突状细胞抗原呈递功能的影响及其机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的类器官，可能与人体实际情况存在差异 | 探讨葡萄糖和乳酸水平对胰腺导管腺癌中树突状细胞功能的影响 | 胰腺导管腺癌中的树突状细胞及其抗原呈递功能 | NA | 胰腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用患者来源的类器官和切除标本，以及KPC小鼠的细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-10-04 |
SPP1+ macrophages in HR+ breast cancer are associated with tumor-infiltrating lymphocytes
2024-Sep-30, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-024-00695-7
PMID:39349495
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研究论文 | 研究探讨了HR+乳腺癌中SPP1+巨噬细胞与肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）之间的关系 | 揭示了SPP1+巨噬细胞在TIL-high HR+乳腺癌中对T细胞的新影响 | 研究样本量较小，仅涉及31名乳腺癌患者 | 探索不同乳腺癌亚型中TIL水平的变化及其对预后的影响 | HR+乳腺癌中的SPP1+巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 31名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-10-04 |
Integrated analysis to identify biological features and molecular markers of poorly cohesive gastric carcinoma (PCC)
2024-09-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73062-y
PMID:39349535
|
研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序和批量数据，揭示了低黏附性胃癌（PCC）的生物学特征和分子标记 | 首次识别出IGFBP7作为深层PCC成分的标记物，并揭示了PCC在深层DGC中的特定免疫抑制特征 | 研究主要基于数据库中的数据，缺乏临床样本的验证 | 揭示低黏附性胃癌（PCC）的分子异质性和生物学特征 | 低黏附性胃癌（PCC）及其在弥漫性胃癌（DGC）中的分布和特征 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自肿瘤免疫单细胞中心、公共基因表达综合数据库和癌症基因组图谱数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-10-04 |
Low protein diet protects the liver from Salmonella Typhimurium-mediated injury by modulating the mTOR/autophagy axis in macrophages
2024-Sep-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06932-w
PMID:39349819
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研究论文 | 研究低蛋白饮食对小鼠肝脏在沙门氏菌感染下的保护作用及其机制 | 首次探讨了低蛋白饮食通过调节mTOR/自噬轴在巨噬细胞中对肝脏的保护作用 | 研究仅限于小鼠模型和人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞，未涉及其他物种或细胞类型 | 探讨低蛋白饮食对肝脏在细菌感染下的免疫反应的影响 | 小鼠肝脏和巨噬细胞 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-10-04 |
Exploring the interaction between immune cells in the prostate cancer microenvironment combining weighted correlation gene network analysis and single-cell sequencing: An integrated bioinformatics analysis
2024-Sep-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01399-x
PMID:39349877
|
研究论文 | 本文通过结合加权相关基因网络分析和单细胞测序技术，研究了前列腺癌微环境中免疫细胞之间的相互作用 | 本文创新性地结合了加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术，识别出九个与前列腺癌进展相关的失调免疫枢纽基因 | 本文主要基于TCGA数据库的高通量基因组数据进行分析，未涉及实验验证 | 研究前列腺癌微环境中免疫细胞之间的相互作用，以期为前列腺癌的精准治疗提供新思路 | 前列腺癌微环境中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因组数据 | 基于TCGA数据库的高通量基因组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-10-04 |
Single-cell analysis of preimplantation embryonic development in guinea pigs
2024-Sep-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10815-z
PMID:39350018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了豚鼠植入前胚胎发育过程中的转录组变化 | 首次系统构建了豚鼠植入前胚胎发育的细胞图谱，并揭示了细胞类型分化和关键基因激活的时间点 | NA | 探究豚鼠植入前胚胎发育的详细过程，并比较其与人类胚胎发育的异同 | 豚鼠植入前胚胎的细胞类型及其转录组特征 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 从受精卵到植入前阶段的豚鼠胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-10-04 |
Single cell RNA sequencing provides novel cellular transcriptional profiles and underlying pathogenesis of presbycusis
2024-Sep-30, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-02001-7
PMID:39350266
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和老年小鼠耳蜗样本的转录组，揭示了与年龄相关听力损失（ARHL）相关的细胞转录谱和潜在分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ARHL的细胞转录谱和潜在分子机制，并分析了细胞间通信 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 揭示年龄相关听力损失（ARHL）的潜在分子机制 | 年轻和老年小鼠的耳蜗样本 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的耳蜗样本 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-10-04 |
Exploring a new signature for lung adenocarcinoma: analyzing cuproptosis-related genes through Integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01389-z
PMID:39342548
|
研究论文 | 研究探索了肺腺癌中与铜死亡相关基因的新特征，通过整合单细胞和批量RNA测序数据进行分析 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别与肺腺癌进展相关的铜死亡相关基因，并构建了新的预后特征 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限 | 研究肺腺癌的异质性，识别与疾病进展相关的关键基因，并探索细胞间通信网络 | 肺腺癌细胞及其异质性、铜死亡相关基因、细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | LASSO回归 | RNA | 单细胞RNA测序数据来自TISCH2，批量RNA测序数据来自TCGA | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-10-04 |
Pan-cancer analysis reveals that TK1 promotes tumor progression by mediating cell proliferation and Th2 cell polarization
2024-Sep-29, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03515-x
PMID:39343871
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研究论文 | 研究探讨了TK1在泛癌中的作用及其对肿瘤进展和免疫微环境的影响 | 首次全面分析了TK1在泛癌中的表达及其对肿瘤诊断、预后和免疫细胞浸润的影响 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探究TK1在泛癌中的综合作用及其对肿瘤进展和免疫微环境的影响 | TK1在不同癌症类型中的表达及其对肿瘤细胞增殖和Th2细胞极化的影响 | NA | NA | qPCR, 免疫印迹, 免疫组化, CCK-8, 集落形成, ELISA, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 涉及TCGA, TARGET, GTEx, CPTAC等多个数据库的数据, 以及肝细胞癌组织和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-10-04 |
Combination of bulk RNA and single-cell sequencing unveils PANoptosis-related immunological ecology hallmarks and classification for clinical decision-making in hepatocellular carcinoma
2024-09-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73847-1
PMID:39342037
|
研究论文 | 本文通过结合bulk RNA和单细胞测序技术，揭示了肝细胞癌中PANoptosis相关的免疫生态特征，并提出了用于临床决策的分类系统 | 本文首次结合bulk RNA和单细胞测序技术，系统解析了PANoptosis在肝细胞癌中的分子和免疫生态特征，并开发了基于机器学习的PANoptosis评分系统，为个性化治疗提供了新思路 | 本文主要基于RNA测序数据，未涉及其他类型的数据如蛋白质组学数据，可能影响结果的全面性 | 研究PANoptosis在肝细胞癌中的免疫生态特征及其对临床决策的影响 | 肝细胞癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | 机器学习 | RNA | 101个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-10-04 |
Immunosuppressive tumor microenvironment in gastric signet-ring cell carcinoma
2024-Sep-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i9.1126
PMID:39351457
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研究论文 | 研究胃印戒细胞癌（GSRCC）的免疫抑制性肿瘤微环境（TME）及其与预后的关系 | 通过单细胞RNA测序和时间飞行质谱流式细胞术技术，揭示了GSRCC中独特的免疫抑制性TME，并探讨了其与预后的关联 | NA | 探讨胃印戒细胞癌的免疫抑制性肿瘤微环境及其与预后的关系，以期开发更有效的免疫治疗策略 | 胃印戒细胞癌（GSRCC）的肿瘤微环境及其免疫抑制性特征 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序、时间飞行质谱流式细胞术 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |