单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 678 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-09-26 |
Meiotic chromatin-associated HSF5 is indispensable for pachynema progression and male fertility
2024-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae701
PMID:39162221
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种新的睾丸特异性蛋白HSF5，该蛋白通过染色质结合调控雄性减数分裂中的粗线期进展 | 首次发现HSF5在粗线期进展中的关键作用，并揭示了其与SMARCA5、SMARCA4和SMARCE1的生物学相互作用 | NA | 探讨HSF5在雄性减数分裂粗线期进展中的调控作用 | HSF5蛋白及其在减数分裂中的功能 | NA | NA | scRNA-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据 | Hsf5-/-个体 |
| 342 | 2024-09-26 |
Single-cell exome sequencing reveals polyclonal seeding and TRPS1 mutations in colon cancer metastasis
2024-Sep-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01960-8
PMID:39307879
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研究论文 | 研究通过单细胞外显子测序揭示了结肠癌肝转移中的多克隆播种和TRPS1基因突变 | 首次通过单细胞外显子测序揭示了结肠癌肝转移的多克隆播种机制，并发现了TRPS1基因突变在肝转移中的重要作用 | 研究仅基于一个IV期结肠癌患者的样本，结果的普适性有待进一步验证 | 探索结肠癌肝转移的克隆进化和遗传异质性，识别驱动基因突变 | 结肠癌患者的原发肿瘤、肝转移和淋巴转移的单细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞外显子测序 | NA | 基因组数据 | 150个单细胞 |
| 343 | 2024-09-26 |
Patient-derived xenografts and single-cell sequencing identifies three subtypes of tumor-reactive lymphocytes in uveal melanoma metastases
2024-Sep-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91705
PMID:39312285
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和患者来源的异种移植模型，识别并验证了葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞的三个亚型 | 首次结合单细胞测序和功能分析，揭示了葡萄膜黑色素瘤肝转移中肿瘤反应性T细胞的多样性 | 研究仅限于葡萄膜黑色素瘤肝转移，结果可能不适用于其他类型的黑色素瘤或其他器官的转移 | 通过识别和功能验证肿瘤反应性T细胞，提高葡萄膜黑色素瘤肝转移的免疫治疗效果 | 葡萄膜黑色素瘤肝转移中的肿瘤反应性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自患者的生物样本和肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 344 | 2024-09-26 |
SPRR1B+ keratinocytes prime oral mucosa for rapid wound healing via STAT3 activation
2024-Sep-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06864-5
PMID:39300285
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研究论文 | 研究通过综合分析bulk-mRNA和单细胞测序数据，揭示了STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在口腔黏膜快速愈合中的关键作用 | 首次揭示了STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在口腔黏膜快速愈合中的重要作用，并发现这些细胞在未受伤的正常黏膜中丰富，但在正常皮肤中缺失 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨口腔黏膜快速愈合的细胞机制 | 口腔黏膜和皮肤的伤口愈合过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | mRNA | 小鼠模型中的口腔黏膜和皮肤样本 |
| 345 | 2024-09-13 |
From genes to geography: Mapping allergic disease landscapes with spatial transcriptomics
2024-Sep-12, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.08.025
PMID:39260791
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-09-26 |
Comprehensive Characterization of a Subfamily of Ca2+-Binding Proteins in Mouse and Human Retinal Neurons at Single-Cell Resolution
2024-Sep, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0145-24.2024
PMID:39260891
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序数据分析了小鼠和人视网膜神经元中Ca2+结合蛋白（CaBPs）的基因表达谱 | 首次全面揭示了CaBP1、CaBP2和CaBP5在视网膜内神经元中的表达模式，并确认了CaBP1和CaBP5在单个小鼠RB细胞中的共表达 | 研究主要集中在基因表达分析，未涉及CaBPs在视网膜功能中的具体作用机制 | 探讨Ca2+结合蛋白在视网膜神经元中的表达模式及其在视觉功能中的潜在作用 | 小鼠和人视网膜神经元中的Ca2+结合蛋白 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人视网膜神经元的单细胞RNA测序数据 |
| 347 | 2024-09-25 |
Investigation of the pharmacological mechanisms of Shenfu injection in acute pancreatitis through network pharmacology and experimental validation
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37491
PMID:39309824
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研究论文 | 本研究通过网络药理学和实验验证探讨了参附注射液在急性胰腺炎治疗中的药理机制 | 首次通过网络药理学和实验验证揭示了参附注射液在急性胰腺炎治疗中的多成分、多靶点和多细胞特性 | NA | 探讨参附注射液在急性胰腺炎治疗中的潜在机制 | 参附注射液在急性胰腺炎中的作用机制 | NA | 急性胰腺炎 | 网络药理学、分子对接、单细胞转录组分析、HE染色、流式细胞术、Tunel染色、CCK-8检测、Western blot、ELISA | NA | 基因、蛋白质、细胞 | 体外实验涉及多种细胞类型，体内实验涉及急性胰腺炎大鼠模型 |
| 348 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the distinct features of colorectal cancer with or without Fusobacterium nucleatum infection in PD-L1 blockade therapy
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37511
PMID:39309908
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了在PD-L1阻断疗法下，有无Fusobacterium nucleatum感染的结直肠癌的特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Fusobacterium nucleatum感染对PD-L1阻断疗法在结直肠癌中作用的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证结果 | 探讨PD-L1阻断疗法在结直肠癌中的作用机制，特别是Fusobacterium nucleatum感染的影响 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的结直肠癌肿瘤样本 |
| 349 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals intratumoral heterogeneity and multicellular community in primary hepatocellular carcinoma underlying microvascular invasion
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37233
PMID:39309949
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了原发性肝细胞癌中微血管侵犯的肿瘤内异质性和多细胞社区 | 首次对肝细胞癌中的微血管侵犯进行了详细的单细胞分析，揭示了免疫抑制生态系统和与微血管侵犯相关的上调信号 | 样本量较小，仅包括3个微血管侵犯阳性样本和14个阴性样本 | 研究肝细胞癌中微血管侵犯的肿瘤微环境，为免疫治疗提供潜在靶点 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及其配对的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3个微血管侵犯阳性样本和14个阴性样本，以及它们的配对非肿瘤组织 |
| 350 | 2024-09-25 |
Leveraging programmed cell death patterns to predict prognosis and therapeutic sensitivity in OSCC
2024-Sep-24, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15139
PMID:39315471
|
研究论文 | 本文通过整合12种程序性细胞死亡模式，构建了一种新的生物标志物——细胞死亡指数（CDI），用于预测口腔鳞状细胞癌（OSCC）的预后和治疗敏感性 | 本文创新性地提出了细胞死亡指数（CDI），并验证了其在OSCC预后和治疗敏感性预测中的有效性 | NA | 研究程序性细胞死亡模式与口腔鳞状细胞癌预后和治疗敏感性之间的关系 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）的预后和治疗敏感性 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO分析 | 基因表达数据 | 多个独立患者队列 |
| 351 | 2024-09-25 |
Smyd3-mediated immuno-modulation in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma mouse models
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110854
PMID:39310755
|
研究论文 | 研究了SMYD3在HPV阴性头颈鳞状细胞癌小鼠模型中的免疫调节作用 | 发现SMYD3通过表观遗传抑制I型IFN反应基因，使用SMYD3 ASO和抗PD-1疗法联合治疗可以增强肿瘤对治疗的敏感性 | NA | 探讨SMYD3在HPV阴性头颈鳞状细胞癌中的免疫调节功能及其对治疗抵抗机制的影响 | SMYD3在HPV阴性头颈鳞状细胞癌中的作用及其对免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了MOC1小鼠口腔癌模型 |
| 352 | 2024-09-25 |
Single-cell transcriptome and crosstalk analysis reveals immune alterations and key pathways in the bone marrow of knee OA patients
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110827
PMID:39310769
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，研究了膝骨关节炎患者骨髓抽吸物中的免疫变化和关键通路 | 本文首次深入研究了骨髓在膝骨关节炎中的免疫变化，不同于以往关注损伤部位或外周血的研究 | NA | 揭示膝骨关节炎患者骨髓中的免疫变化和关键通路 | 膝骨关节炎患者的骨髓抽吸物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自随机临床试验（MILES: NCT03818737）的骨髓抽吸物样本 |
| 353 | 2024-09-25 |
Single-cell sequencing reveals the heterogeneity of pancreatic neuroendocrine tumors under genomic instability and histological grading
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110836
PMID:39310774
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析了胰腺神经内分泌肿瘤在基因组不稳定性和组织学分级下的异质性 | 揭示了肿瘤细胞在不同组织学分级和基因组不稳定性模式下激活的核心通路存在显著差异，并发现多种细胞类型可能参与肝转移过程 | NA | 研究胰腺神经内分泌肿瘤在基因组不稳定性和组织学分级下的异质性 | 胰腺神经内分泌肿瘤细胞及其在不同分级和基因组不稳定性下的异质性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 354 | 2024-09-25 |
Detecting anomalous anatomic regions in spatial transcriptomics with STANDS
2024-Sep-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52445-9
PMID:39300113
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于生成对抗网络的创新框架STANDS，用于从多样本空间转录组数据中检测和解剖异常组织域 | STANDS整合了多模态学习、迁移学习和风格迁移技术，解决了多样本异常组织域检测中的主要挑战 | NA | 开发一种能够从多样本空间转录组数据中进行异常组织域检测和解剖的新方法 | 多样本空间转录组数据中的异常组织域 | 生物信息学 | NA | 生成对抗网络 | 生成对抗网络 | 空间转录组数据 | 多样本 |
| 355 | 2024-09-25 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Sep-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52490-4
PMID:39294132
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研究论文 | 本文描述了一种结合高多重扰动和单细胞RNA测序（sc-RNA-seq）的实验框架，用于识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件及其调控的基因 | 本文创新性地将高多重扰动与单细胞RNA测序结合，用于识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件 | 本文未提及具体的局限性 | 识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件及其调控的基因 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元中的候选顺式调控元件 | 基因组学 | 神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 493个gRNAs，K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 |
| 356 | 2024-09-25 |
PRDM3/16 regulate chromatin accessibility required for NKX2-1 mediated alveolar epithelial differentiation and function
2024-Sep-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52154-3
PMID:39284798
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研究论文 | 研究探讨了PRDM3/16如何通过调节染色质可及性来影响NKX2-1介导的肺泡上皮细胞分化和功能 | 首次揭示了PRDM3和PRDM16在调节NKX2-1转录靶点的染色质可及性中的关键作用，以及它们在肺泡上皮细胞分化和功能中的重要性 | 研究主要集中在早期肺内胚层和AT2细胞中，未涵盖其他细胞类型和发育阶段 | 探讨NKX2-1与其他共激活因子在肺泡上皮细胞分化和功能中的相互作用机制 | PRDM3和PRDM16在肺泡上皮细胞分化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk ATAC测序、CUT&RUN技术 | NA | RNA、染色质可及性数据 | 涉及早期肺内胚层和AT2细胞的多个样本 |
| 357 | 2024-09-25 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612751
PMID:39314376
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研究论文 | 研究炎症如何通过重塑骨髓微环境中的特定区域来影响造血 | 结合scRNA-seq和流式细胞术分离技术，系统地验证了小鼠骨髓中中央骨髓和骨内膜区域的7个关键群体，并揭示了不同扰动对这些区域的具体影响 | NA | 探讨炎症和肿瘤对骨髓微环境的影响及其机制 | 造血干细胞和祖细胞及其在骨髓中的微环境 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠 |
| 358 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA-seq analysis of rat molars reveals cell identity and driver genes associated with dental mesenchymal cell differentiation
2024-Sep-11, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01996-w
PMID:39256700
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析大鼠磨牙，揭示了与牙髓间充质细胞分化相关的细胞身份和驱动基因 | 首次在大鼠磨牙的晚期钟形阶段使用单细胞RNA测序分析，揭示了牙髓间充质细胞的异质性和分化轨迹，并鉴定了新的细胞标记基因 | 研究仅限于大鼠磨牙的晚期钟形阶段，未涵盖其他物种或发育阶段 | 研究牙齿形态发生中的分子机制和信号通路，特别是牙髓间充质细胞的分化 | 大鼠下颌第一和第二磨牙的牙髓间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠下颌第一和第二磨牙的多个细胞样本 |
| 359 | 2024-09-25 |
Genomic and immune heterogeneity of multiple synchronous lung adenocarcinoma at different developmental stages
2024-Sep-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52139-2
PMID:39256403
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研究论文 | 研究分析了不同病理阶段的多发性同步肺腺癌的基因组和免疫异质性 | 揭示了多发性同步肺腺癌在不同发展阶段的克隆独立性和趋同进化，以及免疫微环境的动态变化 | 样本量较小，仅包括8名患者的16个肿瘤样本 | 探讨多发性同步肺腺癌在不同病理阶段的基因组和免疫异质性 | 多发性同步肺腺癌及其在不同发展阶段的基因组和免疫特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序和全外显子组测序 | NA | 基因组数据和免疫数据 | 8名患者的16个肿瘤样本 |
| 360 | 2024-09-25 |
A single-cell transcriptomic dataset of pluripotent stem cell-derived astrocytes via NFIB/SOX9 overexpression
2024-Sep-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03823-x
PMID:39256463
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研究论文 | 本文通过NFIB/SOX9过表达诱导多能干细胞分化为星形胶质细胞，并进行了单细胞转录组测序分析 | 建立了NFIB/SOX9诱导的星形胶质细胞分化路径的全面图谱，揭示了分化过程中的分子变化 | 对诱导星形胶质细胞的精确分化路径和分子特征的理解仍不完全 | 研究人类神经疾病并识别治疗靶点 | 多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 64,736个细胞 |