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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-10-28 |
A robust statistical approach for finding informative spatially associated pathways
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae543
PMID:39451157
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的统计框架，用于识别与空间变异性相关的功能通路 | 该方法通过创新地应用布朗距离协方差检验，直接识别与空间变异性相关的功能通路，避免了基因选择和参数选择的限制，允许非线性和复杂依赖关系 | NA | 旨在通过分析空间转录组数据，深入理解细胞在不同空间域中的活动协调机制 | 人类和小鼠的实际数据集 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 布朗距离协方差检验 | 基因表达数据 | 人类和小鼠的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-10-28 |
Single-cell sequencing reveals the transcriptional alternations of 17β-estradiol suppressing primordial follicle formation in neonatal mouse ovaries
2024-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13713
PMID:38988058
|
研究论文 | 研究揭示了17β-雌二醇抑制新生小鼠卵巢原始卵泡形成的转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了17β-雌二醇处理对新生小鼠卵巢原始卵泡形成和细胞增殖的抑制作用及其分子机制 | 研究仅限于新生小鼠模型，未探讨其他动物模型或人类中的情况 | 探讨雌激素在原始卵泡形成中的调控作用 | 新生小鼠卵巢中的原始卵泡和相关细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠卵巢样本 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-10-27 |
Structure-preserved integration of scRNA-seq data using heterogeneous graph neural network
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae538
PMID:39446194
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研究论文 | 提出了一种利用异构图神经网络（scHetG）进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据整合的方法 | 通过构建异构图来表示多批次细胞和基因之间的相互作用，并结合异构图神经网络和对比学习，同时获取包含结构信息的细胞和基因嵌入 | NA | 消除批次效应并保留细胞和基因的结构信息 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 异构图神经网络（Heterogeneous Graph Neural Network） | 基因表达数据 | 涉及多个物种、组织和尺度的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-10-27 |
Single-cell RNA sequencing to map tumor heterogeneity in gastric carcinogenesis paving roads to individualized therapy
2024-Sep-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03820-4
PMID:39271545
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在胃癌（GC）研究中的应用，探讨了其在揭示肿瘤异质性和个性化治疗中的潜力 | scRNA-seq技术提供了前所未有的分子、细胞和免疫层面的肿瘤微环境（TME）复杂生物组成和特征的见解 | NA | 探讨scRNA-seq在胃癌研究中的应用及其在个性化治疗中的潜力 | 胃癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-10-25 |
Points2Regions: Fast, interactive clustering of imaging-based spatial transcriptomics data
2024-Sep, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24884
PMID:38958502
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研究论文 | 介绍了一种名为Points2Regions的计算工具，用于快速识别空间转录组学数据中具有相似mRNA组成的区域 | 通过将点（代表mRNA）栅格化到金字塔网格上进行快速特征提取，并结合层次聚类和k-means聚类进行高效聚类，实现了跨多个尺度的快速区域发现 | 未提及具体限制 | 开发一种不依赖额外数据且能快速识别空间转录组学数据中相似mRNA组成区域的工具 | 空间转录组学数据中的mRNA组成区域 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 层次聚类和k-means聚类 | 空间点数据 | 两个模拟数据集和真实世界数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-10-25 |
The role of proliferating stem-like plasma cells in relapsed or refractory multiple myeloma: Insights from single-cell RNA sequencing and proteomic analysis
2024-Sep, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19486
PMID:38671576
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学数据，研究了复发或难治性多发性骨髓瘤中增殖性干细胞样浆细胞的作用 | 首次鉴定出增殖性干细胞样浆细胞（PSPCs），并发现NUCKS1和LGALS1作为其标志基因，揭示了MDK信号通路在PSPCs与微环境细胞间通信中的作用 | 样本量相对较小，且仅限于特定患者群体 | 探讨复发或难治性多发性骨髓瘤中增殖性干细胞样浆细胞的分子机制及潜在治疗策略 | 复发或难治性多发性骨髓瘤患者中的浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、质谱分析 | NA | RNA、蛋白质 | 15名浆细胞疾病患者和144名浆细胞疾病患者的CD138浆细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-07 |
FAM110A could serve as a prognostic biomarker for patients with breast cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.014
PMID:38729881
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-07 |
ACAP1 could serve as a novel prognostic biomarker associated with tumor immunity in clear-cell renal cell carcinoma: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.024
PMID:38724393
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-10-24 |
IL-1 receptor-associated kinase 3 (IRAK3) in lung adenocarcinoma predicts prognosis and immunotherapy resistance: involvement of multiple inflammation-related pathways
2024-Sep-30, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-391
PMID:39430338
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研究论文 | 研究探讨了IL-1受体相关激酶3（IRAK3）在肺腺癌（LUAD）中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了IRAK3在LUAD中的表达与预后和免疫治疗反应的关系，并探讨了其在多个炎症相关通路中的作用 | 研究主要基于数据库分析和组织微阵列，缺乏体内实验验证 | 探讨IRAK3在肺腺癌中的预后价值和免疫治疗反应中的作用 | 肺腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 基因集富集分析（GSEA）、组织微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、蛋白质表达数据 | 中国国家癌症中心（NCC）的肺腺癌患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-10-24 |
Disulfidptosis-related gene SLC7A11 predicts prognosis and indicates tumor immune infiltration in lung adenocarcinoma
2024-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1182
PMID:39430814
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研究论文 | 研究探讨了二硫化物应激相关基因SLC7A11在肺腺癌中的预后预测和肿瘤免疫浸润中的作用 | 首次系统分析了二硫化物应激在肺腺癌中的免疫调节作用，特别是SLC7A11基因的影响 | 研究结果需要进一步的实验验证 | 分析二硫化物应激相关基因在肺腺癌中的免疫调节作用 | 肺腺癌中的二硫化物应激相关基因SLC7A11 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA的数据，包括批量和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-10-24 |
Heterogeneity of tumor microenvironment cell groups in inflammatory and adenomatous polyposis coli mutant colorectal cancer based on single cell sequencing
2024-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-689
PMID:39430845
|
研究论文 | 研究了基于单细胞测序的炎症性和APC突变型结直肠癌肿瘤微环境细胞组的异质性 | 揭示了炎症性CRC和APC突变型CRC的复杂肿瘤微环境，并识别了APOE作为潜在的CRC复发生物标志物 | NA | 揭示炎症性CRC和APC突变型CRC的肿瘤微环境，并为不同亚型的CRC治疗提供理论基础 | 炎症性CRC和APC突变型CRC的肿瘤微环境细胞组 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | 8494个结直肠癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-10-24 |
Zebrafish models of human-duplicated SRGAP2 reveal novel functions in microglia and visual system development
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612570
PMID:39314374
|
研究论文 | 研究通过斑马鱼模型揭示了人类SRGAP2基因重复在微胶质细胞和视觉系统发育中的新功能 | 首次在斑马鱼中研究了人类SRGAP2基因重复的影响，揭示了其在微胶质细胞和视觉系统发育中的新功能 | 研究主要集中在斑马鱼模型，尚未在其他物种中验证 | 探讨人类SRGAP2基因重复在微胶质细胞和视觉系统发育中的作用 | 斑马鱼模型中的SRGAP2基因重复 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼幼体 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-10-24 |
A scalable, high-throughput neural development platform identifies shared impact of ASD genes on cell fate and differentiation
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614184
PMID:39386704
|
研究论文 | 本文通过优化Perturb-seq方法，结合单细胞RNA测序和结构主题建模，研究了自闭症谱系障碍（ASD）基因对细胞命运和分化的共同影响 | 本文提出了一种优化的高通量神经发育平台，结合了CRISPR干扰和单细胞RNA测序，并应用结构主题建模来同时评估细胞命运和发育阶段的影响 | 本文仅研究了60个高置信度的ASD风险基因，可能无法全面代表所有ASD基因的影响 | 识别神经发育障碍基因中的收敛通路，揭示高影响的潜在治疗靶点 | 自闭症谱系障碍（ASD）基因对神经发育的影响 | 基因组学 | 神经发育障碍 | Perturb-seq, 单细胞RNA测序 | 结构主题建模 | 基因表达数据 | 60个高置信度的ASD风险基因 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-10-24 |
Deconvolving organogenesis in space and time via spatial transcriptomics in thick tissues
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614640
PMID:39386671
|
研究论文 | 本文开发了一种名为3DEEP的组织清除和空间转录组学策略，用于分析厚度达400 µm的组织块，并成功捕捉了12小时龄小鼠皮肤中371个处于不同发育阶段的毛囊的转录组数据 | 本文首次通过空间转录组学技术，对毛囊发育过程中的时空景观进行了四维分析，揭示了毛囊发育的分子阶段和结构出现的顺序 | 研究仅基于单个时间点的数据，未来需要更多时间点的数据以全面理解毛囊发育的动态过程 | 通过空间转录组学技术解析毛囊发育的时空景观 | 小鼠皮肤中的毛囊 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 12小时龄小鼠皮肤中的371个毛囊，包含6百万个转录本和81个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-10-24 |
Novel Role of Endothelial CD45 in Regulating Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.610974
PMID:39282400
|
研究论文 | 研究探讨了内皮细胞中CD45在调节动脉粥样硬化中的内皮间质转化（EndoMT）的作用 | 首次揭示了内皮细胞中CD45缺失通过增加KLF2表达抑制TGFβ信号传导和EndoMT标记物表达，从而保护动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨内皮细胞中CD45在动脉粥样硬化中的作用及其分子机制 | 内皮细胞、动脉粥样硬化小鼠模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 内皮细胞特异性CD45缺失小鼠（EC-iCD45KO）和ApoE-/-小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-10-24 |
The Cardioprotective Role of Neutrophil-Specific STING in Myocardial Ischemia/Reperfusion Injury
2024-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.06.611551
PMID:39314411
|
研究论文 | 研究中性粒细胞特异性STING在心肌缺血/再灌注损伤中的心脏保护作用 | 首次探讨了中性粒细胞中富含I型干扰素信号的亚群及其在心肌缺血/再灌注损伤中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 研究中性粒细胞在心肌缺血/再灌注损伤中的异质性及其对心脏损伤的影响 | 中性粒细胞及其STING信号在心肌缺血/再灌注损伤中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-10-24 |
Lipid-siRNA conjugate accesses perivascular transport and achieves durable knockdown throughout the central nervous system
2024-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.09.598079
PMID:38915549
|
研究论文 | 本文描述了一种白蛋白结合脂质-siRNA偶联物，通过脑脊液途径运输，实现中枢神经系统广泛分布的持久基因敲低 | 开发了一种新的白蛋白结合脂质-siRNA偶联物，能够在中枢神经系统中实现长达五个月的持久基因敲低，且无明显毒性 | NA | 研究一种新的siRNA递送系统，以实现中枢神经系统中持久且广泛的基因抑制 | 白蛋白结合脂质-siRNA偶联物在中枢神经系统中的运输和基因敲低效果 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-10-24 |
Spatially clustered type I interferon responses at injury borderzones
2024-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07806-1
PMID:39198639
|
研究论文 | 研究心肌梗死后心肌细胞在梗死边缘区启动的I型干扰素反应 | 揭示了心肌细胞在心肌梗死边缘区启动的I型干扰素反应，并发现这种反应与心肌破裂和生存率有关 | 仅在啮齿动物模型中进行了研究，尚未在人类中验证 | 探讨心肌梗死后心肌细胞在边缘区的免疫反应及其对心脏功能的影响 | 心肌细胞、成纤维细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和内皮细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-10-20 |
Bioinformatic-Experimental Screening Uncovers Multiple Targets for Increase of MHC-I Expression through Activating the Interferon Response in Breast Cancer
2024-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910546
PMID:39408874
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验筛选，识别出多个可以增加乳腺癌中MHC-I表达的基因靶点 | 首次通过综合分析MHC-I评分、基因表达相关性、生存预测和Cibersort肿瘤浸润淋巴细胞评分，识别出144个与MHC-I表达和TILs负相关的基因，并通过实验验证了其中多个基因的有效性 | 研究主要集中在乳腺癌细胞系和患者样本，结果的普适性需要进一步验证 | 识别并验证可以增加乳腺癌中MHC-I表达的基因靶点 | 乳腺癌细胞中的MHC-I表达和肿瘤浸润淋巴细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-10-20 |
Cerebrospinal Fluid and Peripheral Blood Lymphomonocyte Single-Cell Transcriptomics in a Subject with Multiple Sclerosis Acutely Infected with HIV
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910459
PMID:39408789
|
研究论文 | 研究了多发性硬化症（MS）急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞的单细胞转录组特征 | 首次在多发性硬化症和HIV感染的临床样本中使用单细胞转录组技术，揭示了神经退行性基因表达的特征 | 无法区分多发性硬化症和HIV感染的具体原因 | 探讨多发性硬化症急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞的单细胞转录组特征 | 多发性硬化症急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 脑脊液中1446个单细胞转录组，外周血单核细胞中4647个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |