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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-02-04 |
MAPK/ERK signaling in gliomas modulates interferon responses, T cell recruitment, microglia phenotype, and immune checkpoint blockade efficacy
2024-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612571
PMID:39345374
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研究论文 | 本文探讨了MAPK/ERK信号在胶质瘤中对干扰素反应、T细胞招募、小胶质细胞表型及免疫检查点阻断疗效的调节作用 | 揭示了MAPK/ERK信号通路在胶质瘤中对免疫治疗的敏感性及机制,特别是其对干扰素反应和抗原呈递的调节作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的应用和验证仍需进一步研究 | 探讨MAPK/ERK信号通路在胶质瘤免疫治疗中的作用及其机制 | 胶质瘤细胞、T细胞、小胶质细胞 | 神经肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、体外切片培养 | 小鼠胶质瘤模型、BRAFV600E突变胶质瘤切片培养 | 基因表达数据、蛋白质磷酸化数据 | 小鼠胶质瘤模型、BRAFV600E突变的人类胶质瘤组织切片 | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2025-10-07 |
Computational estimation of clonal diversity in autoimmunity
2024-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12801
PMID:39010261
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序测量T细胞和B细胞受体多样性及其在自身免疫病研究中的应用 | 结合单细胞测序与多样性评估方法,推动自身免疫病机制发现和治疗创新 | NA | 探讨免疫受体多样性测量方法及其在自身免疫病研究中的意义 | T细胞受体和B细胞受体 | 生物信息学 | 自身免疫病 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-10-07 |
Scoping Review: Methods and Applications of Spatial Transcriptomics in Tumor Research
2024-Sep-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16173100
PMID:39272958
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综述 | 本文通过范围综述方法总结了空间转录组学在肿瘤研究中的方法学进展和应用现状 | 系统分析了截至2023年底的41篇文献和公共数据库,明确了空间转录组学在肿瘤研究中的主流平台、数据分析方法和应用趋势 | 近半数研究缺乏完整的数据处理流程描述,影响了研究的可重复性 | 评估空间转录组学在肿瘤研究中的方法学挑战和实际应用价值 | 41篇已发表文献和公共数据资源库 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学,单细胞测序,免疫组织化学 | SCTransform | 基因表达数据,空间位置信息 | 41篇文献分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |
| 284 | 2025-10-07 |
WIP1-mediated regulation of p38 MAPK signaling attenuates pyroptosis in sepsis-associated acute kidney injury
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152832
PMID:38943814
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研究论文 | 本研究探讨WIP1通过调节p38 MAPK信号通路在脓毒症相关急性肾损伤中抑制细胞焦亡的作用机制 | 首次揭示WIP1在急性肾损伤中通过p38 MAPK信号通路调控肾小管细胞焦亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和HK2细胞系,尚未在更复杂的人类病理环境中验证 | 阐明WIP1在脓毒症相关急性肾损伤中的分子调控机制 | 小鼠模型、人类HK2肾小管上皮细胞、急性肾损伤患者组织样本 | 分子病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 细胞活力检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | 小鼠模型和细胞系实验,包含人类患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 285 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of macrophage subpopulations contributing to chemotherapy resistance in ovarian cancer
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152811
PMID:38941863
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示卵巢癌化疗耐药中巨噬细胞亚群的作用机制 | 首次在单细胞水平鉴定出与卵巢癌化疗耐药相关的CXCL5+、THBS1+和MMP9+巨噬细胞亚群,并揭示其促肿瘤分子表达特征 | 样本量未明确说明,机制研究主要基于生物信息学分析缺乏实验验证 | 探究巨噬细胞在卵巢癌化疗耐药中的功能和机制 | 卵巢癌组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | Seurat分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2025-10-07 |
Identification and validation of potential biomarkers related to oxidative stress in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152791
PMID:39180853
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研究论文 | 通过生物信息学技术鉴定与特发性肺纤维化氧化应激相关的潜在诊断生物标志物 | 首次结合随机森林算法和LASSO回归从氧化应激相关基因中筛选出7个诊断基因,并构建了具有出色预测能力的列线图模型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 鉴定与特发性肺纤维化氧化应激相关的可靠诊断生物标志物 | 特发性肺纤维化患者基因表达数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 基因表达分析,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 随机森林,LASSO回归,列线图 | 基因表达数据 | GSE70866和GSE141939数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 287 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Applied in Plants
2024-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181561
PMID:39329745
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在植物研究中的应用现状、挑战与未来方向 | 首次系统梳理了scRNA-seq技术在植物科学中的研究进展,并提供了五个有助于识别不同细胞类型标记基因的数据库 | 主要关注模式植物、作物和木材植物,可能未完全覆盖所有植物物种 | 探索scRNA-seq技术在植物研究中的应用潜力 | 植物组织,特别是模式植物、作物和木材 | 植物科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2025-10-07 |
Deep Immunoprofiling of Large-Scale Tuberculosis Dataset at Single Cell Resolution Reveals a CD81bright γδ T Cell Population Associated with Latency
2024-09-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181529
PMID:39329713
|
研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序分析揭示了与结核潜伏感染相关的CD81高表达γδ T细胞亚群 | 首次在大规模结核病数据集中通过单细胞分辨率免疫分析发现CD81bright γδ T细胞亚群与潜伏感染相关 | 研究主要关注外周血γδ T细胞,未深入探讨其他免疫细胞类型或组织特异性反应 | 探索γδ T细胞不同亚群在结核病保护性免疫或疾病进展中的作用 | 结核病患者外周血γδ T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 流式细胞数据 | 大规模结核病数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2025-10-07 |
Characterizing the Tumor Microenvironment and Its Prognostic Impact in Breast Cancer
2024-09-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181518
PMID:39329702
|
研究论文 | 通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据,系统表征乳腺癌肿瘤微环境的免疫景观和细胞间通讯 | 识别了三种不同的免疫浸润患者亚型,发现中等免疫浸润患者预后最佳,并揭示了SPP1和EGF信号通路在低免疫浸润组中的特异性激活 | NA | 研究乳腺癌肿瘤微环境的免疫特征及其预后价值 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 290 | 2025-10-07 |
Cryo-PRO facilitates whole blood cryopreservation for single-cell RNA sequencing of immune cells from clinical samples
2024-Sep-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.18.24313760
PMID:39371152
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研究论文 | 开发了一种名为Cryo-PRO的全血冷冻保存方法,用于临床样本免疫细胞的单细胞RNA测序 | 首次提出直接从冷冻保存的全血中分离PBMC的方法,将现场处理时间从2小时以上缩短至15分钟以内 | 仅在23名脓毒症患者中进行了验证,样本量相对较小 | 开发更便捷的临床样本处理方法以促进单细胞RNA测序在多中心研究中的应用 | 脓毒症患者的外周血单核细胞(PBMC) | 单细胞测序 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 23名脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 291 | 2025-10-07 |
Scalable imaging-free spatial genomics through computational reconstruction
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606465
PMID:39149311
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研究论文 | 开发了一种无需成像的空间转录组学方法,通过分子扩散模式和计算重建获得空间基因组学数据 | 利用分子扩散模式计算重建空间数据,无需依赖成像或直接配准设备 | NA | 开发可扩展的无成像空间基因组学技术 | 组织中的细胞及其分子程序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,分子扩散分析,计算重建 | UMAP算法 | 空间转录组数据,分子相互作用矩阵 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-seq, Slide-tags | 二维条形码阵列 |
| 292 | 2025-10-07 |
LMNA-Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-Derived iPSC Differentiation Support Cell Type and Lineage-Specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-09-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171479
PMID:39273049
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC通过单细胞转录组学分析LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 首次在患者来源的iPSC分化过程中通过单细胞RNA测序揭示LMNA单倍体不足对心肌细胞和心外膜来源细胞基因表达和发育的细胞类型特异性调控紊乱 | 方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 研究LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 来自携带LMNA c.357-2A>G剪接位点突变家族的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本(4个患者样本,8个对照样本),涵盖7个时间点,共110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 293 | 2025-10-07 |
Keratin 8/18a.1 Expression Influences Embryonic Neural Crest Cell Dynamics and Contributes to Postnatal Corneal Regeneration in Zebrafish
2024-09-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171473
PMID:39273043
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现角蛋白中间丝基因K8和K18a.1在斑马鱼眼部发育和角膜再生中的重要作用 | 首次揭示K8和K18a.1在斑马鱼神经嵴细胞迁移和角膜再生中的功能,并发现K18a.1受视黄酸调控 | 使用吗啉代寡核苷酸进行基因敲降可能存在脱靶效应,研究主要聚焦于斑马鱼模型 | 探究神经嵴细胞在眼部发育和角膜再生中的分子机制 | 斑马鱼胚胎神经嵴细胞和成年斑马鱼角膜组织 | 发育生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫荧光显微镜, 吗啉代寡核苷酸敲降 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎和成年个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2025-10-07 |
Unraveling the phenotypic states of human innate-like T cells: Comparative insights with conventional T cells and mouse models
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114705
PMID:39264810
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了人类先天样T细胞与传统T细胞的转录特征 | 揭示了人类先天样T细胞不分化成多个效应亚群而是发展混合型1/型17效应潜能的独特特征,并发现人类缺乏2型T细胞的物种特异性差异 | 研究主要关注人类和小鼠的比较,可能不适用于其他物种的免疫机制 | 探索先天样T细胞与传统T细胞的转录特征差异及其发育途径 | 人类胸腺和血液中的先天样T细胞和传统T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 295 | 2025-10-07 |
Molecular and spatial signatures of human and rat corpus cavernosum physiopathological processes at single-cell resolution
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760
PMID:39299236
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组测序,绘制了人类和大鼠阴茎海绵体在正常和疾病状态下的空间细胞图谱 | 首次在分子水平揭示了人类和大鼠阴茎海绵体的空间异质性,并发现了机械力信号在不同区域的分布差异 | 研究仅涉及人类和大鼠两个物种,且体外实验条件可能与体内环境存在差异 | 探究阴茎海绵体在生理和病理状态下的分子解剖结构和细胞异质性 | 人类和大鼠的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类和大鼠阴茎海绵体样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 296 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics elucidates medulla niche supporting germinal center response in myasthenia gravis-associated thymoma
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114677
PMID:39180749
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研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示重症肌无力相关胸腺瘤中支持生发中心反应的髓质微环境特征 | 首次利用空间转录组技术系统描绘胸腺瘤中髓质区域的特殊微环境,发现MG特异性生发中心结构与神经肌肉髓质胸腺上皮细胞的定位特征 | 样本量有限,主要聚焦胸腺瘤和胸腺增生样本,需要更大规模研究验证 | 阐明重症肌无力在胸腺中的病理机制 | 胸腺瘤和胸腺增生样本 | 空间转录组学 | 重症肌无力 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 297 | 2025-10-07 |
Regulatory mechanisms orchestrating cellular diversity of Cd36+ olfactory sensory neurons revealed by scRNA-seq and scATAC-seq analysis
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114671
PMID:39215999
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析揭示Cd36+嗅觉感觉神经元细胞多样性的调控机制 | 首次发现Cd36+/-嗅觉感觉神经元的分化差异发生在未成熟阶段,并鉴定出Mef2a和Hdac9作为发育分岔的重要调控因子 | NA | 揭示嗅觉系统中细胞多样性的调控机制 | Cd36+和Cd36-嗅觉感觉神经元 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 298 | 2025-01-15 |
The role of GDF15 in attenuating noise-induced hidden hearing loss by alleviating oxidative stress
2024-09-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09912-2
PMID:39289208
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研究论文 | 本研究探讨了GDF15在减轻噪声引起的隐性听力损失(HHL)中的作用,通过缓解氧化应激来保护耳蜗 | 首次揭示了GDF15在HHL中的保护作用,并提出了针对GDF15的治疗策略 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 研究GDF15在噪声引起的隐性听力损失中的作用 | 小鼠耳蜗 | 生物医学 | 听力损失 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 转录组数据 | HHL小鼠的耳蜗细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 299 | 2025-01-02 |
Pan-cancer analysis of the immunological and oncogenic roles of ATAD2 with verification in papillary thyroid carcinoma
2024-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73274-2
PMID:39333272
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研究论文 | 本文通过泛癌分析探讨了ATAD2在肿瘤进展和免疫相互作用中的角色,并在甲状腺乳头状癌中进行了验证 | 首次在泛癌范围内系统分析了ATAD2的表达、突变及其与免疫浸润的关系,并在甲状腺乳头状癌中验证了其致癌功能 | 研究主要依赖于数据库分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探讨ATAD2在肿瘤进展和免疫相互作用中的共同角色,并验证其在甲状腺乳头状癌中的致癌功能 | ATAD2基因及其在多种肿瘤中的表达和突变情况 | 肿瘤学 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞测序、MTT、伤口愈合、transwell、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、突变数据、单细胞测序数据 | 利用TCGA、GTEx、CPTAC、HPA和cBioPortal数据库中的泛癌数据 | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2024-12-25 |
Dendritic cell effector mechanisms and tumor immune microenvironment infiltration define TLR8 modulation and PD-1 blockade
2024-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.610636
PMID:39282367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重染色技术,探讨了TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制 | 首次揭示了TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在人类中的作用机制,并展示了其在提高树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞密度方面的显著效果 | 研究样本量较小,仅涉及三名患者,且为预手术临床试验,结果的广泛适用性有待进一步验证 | 探讨TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三名头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |