单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 632 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-07 |
Characterization of a novel mitophagy-related 5-genes signature for diagnosis of acute myocardial infarction
2024-09, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2024.107417
PMID:39159737
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于5个线粒体自噬相关基因的诊断标志物，用于急性心肌梗死的诊断 | 首次基于线粒体自噬相关基因表达将心肌梗死患者分为三个亚群，并建立了5基因诊断标志物 | 研究样本量未明确说明，需要进一步验证 | 开发心肌梗死的诊断标志物 | 心肌梗死患者的心脏组织和外周血样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序，支持向量机-递归特征消除，随机森林 | SVM-RFE，随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2025-10-07 |
GSK-3β in Dendritic Cells Exerts Opposite Functions in Regulating Cross-Priming and Memory CD8 T Cell Responses Independent of β-Catenin
2024-Sep-10, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines12091037
PMID:39340067
|
研究论文 | 本研究揭示了树突状细胞中GSK-3β在调控交叉呈递和记忆CD8 T细胞应答中的相反功能，且该功能不依赖于β-连环蛋白 | 首次发现GSK-3β在树突状细胞中独立于β-连环蛋白调控CD8 T细胞免疫应答的双重功能 | 研究主要基于基因敲除小鼠模型，尚未在人类细胞中验证 | 探究GSK-3β在树突状细胞中对CD8 T细胞免疫应答的调控机制 | CD11c-GSK-3β条件性敲除小鼠的树突状细胞和CD8 T细胞 | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序, Western blot, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-07 |
Twin study identifies early immunological and metabolic dysregulation of CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-09-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj8094
PMID:39331727
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化症患者CD8+ T细胞的免疫和代谢失调 | 首次在同卵双胞胎研究中揭示CD8+ T细胞在多发性硬化症亚临床阶段的早期免疫代谢异常 | 样本量有限，主要基于双胞胎队列研究 | 探究CD8+ T细胞在多发性硬化症发病机制中的作用 | 同卵双胞胎队列（包括健康、亚临床神经炎症和确诊多发性硬化症个体） | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 同卵双胞胎队列及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-10-07 |
Targeting Fibroblast-Endothelial Interactions in LAM Pathogenesis: 3D Spheroid and Spatial Transcriptomic Insights for Therapeutic Innovation
2024-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.12.544372
PMID:37398026
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和3D球体模型探索淋巴管平滑肌瘤病中成纤维细胞-内皮细胞相互作用的机制 | 首次使用空间转录组学技术识别LAM中与肌成纤维细胞相关的激酶信号通路基因簇，并发现多激酶抑制剂索拉非尼比雷帕霉素更有效抑制细胞侵袭 | 研究样本量有限，主要基于体外模型，需要进一步临床验证 | 探索LAM疾病发病机制并寻找新的治疗靶点 | 淋巴管平滑肌瘤病肺组织、原发性LAM成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和TSC2缺失的AML细胞 | 空间转录组学 | 肺部疾病 | 空间转录组学, 3D球体共培养, 激酶阵列分析 | 3D共培养球体模型 | 空间转录组数据, 细胞侵袭数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-07 |
A practical handbook on single-cell RNA sequencing data quality control and downstream analysis
2024-Sep, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100103
PMID:39094968
|
综述 | 提供单细胞RNA测序数据质量控制与下游分析的实用指南 | 系统性地提出单细胞分析中高质量细胞筛选标准和分析流程的规范化指南 | NA | 改善单细胞分析质量，为研究人员提供标准化分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling Uncovers Evolutionary Divergence of Hypocretin/Orexin Neuronal Subpopulations
2024-Sep-04, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0095-24.2024
PMID:39122556
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示下丘脑食欲素神经元亚群的进化分歧和功能异质性 | 首次在斑马鱼中鉴定出21种谷氨酸能和28种GABA能细胞类型，发现食欲素神经元存在功能异质性，并揭示跨物种保守和分歧的下丘脑细胞类型 | 研究主要聚焦于斑马鱼和小鼠的比较，可能不适用于所有脊椎动物物种 | 探究下丘脑食欲素神经元的功能异质性和进化分歧 | 成年雄性和雌性斑马鱼下丘脑室周区神经元 | 单细胞生物学 | 睡眠障碍 | 单细胞RNA测序, 高分辨率成像 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 斑马鱼下丘脑神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2025-10-07 |
Acyl-coenzyme a binding protein (ACBP) - a risk factor for cancer diagnosis and an inhibitor of immunosurveillance
2024-Sep-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02098-5
PMID:39242519
|
研究论文 | 本研究探讨了酰基辅酶A结合蛋白(ACBP/DBI)作为癌症风险因子和免疫监视抑制剂的作用 | 首次发现ACBP/DBI可作为癌症发展的风险预测因子，并证明其中和抗体能增强化疗免疫疗法的疗效 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探究ACBP/DBI在癌症发展和免疫监视中的作用机制 | 癌症患者、遗传性癌症易感人群、小鼠癌症模型 | 癌症免疫学 | 肺癌、乳腺癌、肉瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质浓度数据、基因表达数据 | 癌症患者、遗传易感人群和健康对照群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-07 |
Intestinal Stromal Cells in the Turmoil of Inflammation and Defective Connective Tissue Remodeling in Inflammatory Bowel Disease
2024-09-03, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae066
PMID:38581412
|
综述 | 本文综述了肠道基质细胞在炎症性肠病中对炎症反应和细胞外基质重塑的调控作用 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了基质细胞表型复杂性及空间功能分区，为靶向治疗提供新视角 | 当前IBD治疗主要针对炎症过程，对纤维狭窄或瘘管性疾病疗效有限 | 探讨肠道基质细胞在IBD发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 肠道上皮下肌成纤维细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 269 | 2025-10-07 |
scMGATGRN: a multiview graph attention network-based method for inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae526
PMID:39417321
|
研究论文 | 提出基于多视图图注意力网络的scMGATGRN方法，用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络 | 首次将多视图图注意力网络应用于基因调控网络推断，能够同时利用局部特征信息和高阶邻居特征信息 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更准确的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络(GAT), 多视图注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 7个基准单细胞RNA测序数据集，来自5个细胞系（2个人类，3个小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 270 | 2025-10-07 |
Identification of microenvironment features associated with primary resistance to anti-PD-1/PD-L1 + antiangiogenesis in gastric cancer through spatial transcriptomics and plasma proteomics
2024-Sep-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02092-x
PMID:39272096
|
研究论文 | 通过空间转录组学和血浆蛋白质组学分析胃癌对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的肿瘤微环境特征 | 首次结合空间转录组学和血浆蛋白质组学系统分析胃癌联合治疗耐药机制，发现M2巨噬细胞浸润和S100A10过表达的关键作用 | 研究样本仅限REGOMUNE II期临床试验的 Caucasian 患者群体，样本代表性有限 | 探究胃癌患者对抗PD-1/PD-L1+抗血管生成联合疗法原发性耐药的分子机制 | 晚期胃癌患者 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学, 生物标志物分析 | NA | 空间转录组数据, 血浆蛋白质数据, 临床数据 | REGOMUNE II期临床试验患者群体 | NA | 空间转录组学, 血浆蛋白质组学 | NA | NA |
| 271 | 2025-02-21 |
Correlation of LLT-1 and NLRC4 inflammasome and its effect on glioblastoma prognosis
2024-Sep, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04750-y
PMID:38907949
|
研究论文 | 本研究探讨了LLT-1与NLRC4炎症小体在胶质母细胞瘤（GBM）组织中的表达及其相互作用，揭示了它们与肿瘤恶性程度和预后的潜在关联 | 揭示了LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的共表达及其与肿瘤炎症和进展的潜在关联，提出了新的NK细胞介导的抗胶质瘤途径 | 研究样本量相对较小，且主要基于中国人群数据，可能限制了结果的普适性 | 探讨LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的表达及其相互作用，以揭示其与肿瘤恶性程度和预后的关联 | 胶质母细胞瘤（GBM）组织 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序（RNA-seq）、免疫荧光实验、单细胞RNA测序分析 | NA | RNA-seq数据、免疫荧光图像 | 296名患者来自中国胶质瘤基因组图谱，52名患者来自CHA医疗记录 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2025-10-07 |
CD8+ tissue-resident memory T cells are expanded in primary Sjögren's disease and can be therapeutically targeted by CD103 blockade
2024-Sep-30, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225069
PMID:38777379
|
研究论文 | 本研究探讨了组织驻留记忆T细胞在原发性干燥综合征中的作用及CD103阻断的治疗潜力 | 首次系统表征pSS中CD8+组织驻留记忆T细胞的表型功能，并证明CD103阻断可改善疾病症状 | 动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证 | 研究组织驻留记忆T细胞在原发性干燥综合征发病机制中的作用及治疗靶点 | 原发性干燥综合征患者、非特异性干燥综合征患者、实验性干燥综合征小鼠模型 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 临床指标 | 人类唾液腺组织和外周血样本, 实验性干燥综合征小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-07 |
Characterization and bioinformatic filtering of ambient gRNAs in single-cell CRISPR screens using CLEANSER
2024-Sep-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.04.611293
PMID:39282389
|
研究论文 | 开发了一种名为CLEANSER的混合模型，用于识别和过滤单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA噪声 | 利用CRISPR混合实验表征环境gRNA噪声，开发了包含gRNA和细胞特异性归一化参数的混合模型 | NA | 提高单细胞CRISPR筛选实验中gRNA-细胞分配准确性 | 单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA噪声 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序CRISPR筛选 | 混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-10-07 |
New dimension in viral hepatitis research
2024-Sep, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2024-100136
PMID:39944365
|
研究论文 | 使用GeoMx数字空间分析技术研究乙型肝炎患者肝组织中基因表达的空间分布特征 | 首次应用GeoMx DSP技术对HBV感染肝组织进行空间转录组分析，能够靶向选择特定组织区域进行精确基因表达定位 | 样本量较小（仅3例患者），目前仍处于概念验证阶段 | 通过空间转录组学技术深入了解肝脏免疫反应和HBV感染细胞分布，最终实现HBV功能性治愈 | 三名患者的肝组织（一名HBV单感染、一名HBV/HDV共感染、一名HBV/HIV共感染） | 空间转录组学 | 病毒性肝炎 | 数字空间分析，空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 3例患者肝组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析技术，支持靶向选择特定组织区域（感兴趣区域）进行分析 |
| 275 | 2024-08-08 |
Correction to: Machine learning applications on intratumoral heterogeneity in glioblastoma using single-cell RNA sequencing data
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad022
PMID:37226813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2025-10-07 |
NR3C2 affects the proliferation and invasiveness of colon cancer cells through the Wnt/β-Catenin signaling pathway
2024-Sep-05, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05935-8
PMID:39237674
|
研究论文 | 本研究探讨NR3C2通过Wnt/β-Catenin信号通路调控结肠癌细胞增殖和侵袭的机制 | 首次揭示NR3C2通过调控Wnt/β-Catenin信号通路影响结肠癌细胞增殖、侵袭、自噬和凋亡的分子机制 | 研究样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要更多临床样本验证 | 探索NR3C2与结肠癌预后的相关性及其作用机制 | 结肠癌组织、结肠癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 生物信息学分析、慢病毒转染、CCK-8检测、Transwell实验、Western blot | 动物移植瘤模型、细胞模型 | mRNA表达数据、单细胞转录组数据、临床数据 | TCGA数据库结肠癌数据、GEO数据库单细胞数据、3对新鲜结肠癌及癌旁样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2025-10-07 |
Leukocyte-and Platelet-Rich Fibrin for enhanced tissue repair: an in vitro study characterizing cellular composition, growth factor kinetics and transcriptomic insights
2024-Sep-04, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09890-y
PMID:39230578
|
研究论文 | 本研究通过体外实验深入分析白细胞和富血小板纤维蛋白的细胞组成、生长因子动力学和转录组特征 | 首次在细胞、蛋白质组和转录组水平上全面表征L-PRF，揭示了单核细胞向巨噬细胞分化的过程 | 样本量较小（流式细胞术n=4，单细胞RNA测序n=5），仅为体外研究 | 深入了解L-PRF的组成及其在组织愈合中的可能机制作用 | 人类L-PRF膜和液体L-PRF胶 | 组织工程 | 组织修复 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，RT-qPCR，ELISA | NA | 细胞计数数据，基因表达数据，蛋白质浓度数据 | 流式细胞术4个样本，单细胞RNA测序5个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-07 |
A unique human cord blood CD8+CD45RA+CD27+CD161+ T-cell subset identified by flow cytometric data analysis using Seurat
2024-09, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13803
PMID:38798051
|
研究论文 | 本研究将原本用于单细胞RNA测序分析的Seurat软件包成功应用于高维流式细胞术数据分析，并鉴定出脐带血中独特的CD8+CD45RA+CD27+CD161+ T细胞亚群 | 首次将Seurat软件包重新用于流式细胞术数据分析，并发现脐带血中特有的T细胞亚群 | 方法验证相对有限，仅与另一种分析包和传统手动分析进行了比较 | 开发高维流式细胞术数据分析方法并鉴定新型免疫细胞亚群 | 成人血液和脐带血中的T细胞 | 临床免疫学 | NA | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | Seurat, Spectre | 流式细胞术数据, 单细胞RNA测序数据 | 成人血液和脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 20标记抗体panel |
| 279 | 2025-10-07 |
Screening and identification of susceptibility genes for cervical cancer via bioinformatics analysis and the construction of an mitophagy-related genes diagnostic model
2024-Sep-19, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05952-7
PMID:39294534
|
研究论文 | 通过生物信息学方法筛选宫颈癌易感基因并构建线粒体自噬相关基因诊断模型 | 首次结合单细胞RNA测序数据和机器学习算法构建宫颈癌线粒体自噬相关基因的临床预后模型 | 未提及外部验证队列或模型泛化能力的详细评估 | 探索宫颈癌发病机制并改善早期诊断和治疗 | 宫颈癌患者和对照组的基因组数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 通路富集分析, 机器学习 | 临床预后模型 | 基因表达谱, 单核苷酸多态性数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-10-07 |
An 18-gene signature of recurrence-associated endothelial cells predicts tumor progression and castration resistance in prostate cancer
2024-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02761-0
PMID:38997406
|
研究论文 | 本研究开发了一个18基因复发相关内皮细胞特征，用于预测前列腺癌的肿瘤进展和去势抵抗 | 首次识别并验证了与前列腺癌复发相关的内皮细胞亚群及其18基因特征，该特征在预测肿瘤复发和去势抵抗方面优于临床病理因素和商业基因签名 | 研究基于多个队列但样本量有限，需要进一步的功能验证和前瞻性研究确认临床适用性 | 探索前列腺癌中内皮细胞异质性对肿瘤复发和去势抵抗的预后和治疗意义 | 前列腺癌患者样本中的内皮细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，机器学习算法 | 11种机器学习算法通过嵌套交叉验证比较 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 8个批量转录组队列和4个单细胞RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |