单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 678 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-10-02 |
ASIC1/RIP1 accelerates atherosclerosis via disrupting lipophagy
2024-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.11.004
PMID:37931656
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研究论文 | 研究探讨了ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其通过干扰脂噬机制的潜在机制 | 揭示了ASIC1与RIP1相互作用抑制脂噬，从而促进动脉粥样硬化的关键作用 | NA | 研究ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | ASIC1在动脉粥样硬化中的作用及其与RIP1的相互作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 人类动脉粥样硬化病变区域和ApoE-/-小鼠模型 |
| 262 | 2024-10-02 |
The Role of Activator Protein-1 Complex in Diabetes-Associated Atherosclerosis: Insights From Single-Cell RNA Sequencing
2024-Sep-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0167
PMID:38905153
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研究论文 | 研究了激活蛋白-1复合物在糖尿病相关动脉粥样硬化中的作用，通过单细胞RNA测序揭示了其在动脉粥样硬化病理中的新靶点 | 首次通过单细胞RNA测序识别出激活蛋白-1复合物作为糖尿病相关动脉粥样硬化的新靶点，并验证了其抑制剂T-5224在糖尿病Apoe-/-小鼠模型中的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床试验中验证 | 探索糖尿病相关动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 糖尿病Apoe-/-小鼠模型、人颈动脉内膜切除术标本、人主动脉内皮细胞和THP-1衍生的巨噬细胞 |
| 263 | 2024-10-02 |
Pan-cancer integrative analyses dissect the remodeling of endothelial cells in human cancers
2024-Sep, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae231
PMID:39345334
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研究论文 | 本文通过整合575名癌症患者的单细胞RNA测序数据，分析了19种实体肿瘤类型中肿瘤内皮细胞（TECs）的表型多样性 | 揭示了TECs在泛癌视角下的组成和功能异质性，并发现了两种主要亚型：tip细胞和veins细胞，它们在空间组织模式和功能上表现出显著差异 | NA | 深入理解肿瘤内皮细胞的异质性及其在抗血管生成疗法和免疫疗法中的作用 | 肿瘤内皮细胞（TECs）及其在不同癌症类型中的表型多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 575名癌症患者 |
| 264 | 2024-10-02 |
StableMate: a statistical method to select stable predictors in omics data
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae130
PMID:39345755
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研究论文 | 本文介绍了一种名为StableMate的统计方法，用于在组学数据中选择稳定的预测因子 | StableMate通过跨异质数据集的变量选择过程，解决了组学数据复杂性和变异性导致的关联缺乏可重复性和可解释性的问题 | NA | 开发一种能够在不同环境中选择稳定预测因子的统计方法，以提高生物学关联的可重复性和可解释性 | 乳腺癌RNA测序数据、结肠癌宏基因组数据和胶质母细胞瘤单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 回归分析 | 回归框架 | 组学数据 | NA |
| 265 | 2024-10-01 |
scCrab: A Reference-Guided Cancer Cell Identification Method based on Bayesian Neural Networks
2024-Sep-30, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00655-6
PMID:39348073
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研究论文 | 本文提出了一种基于贝叶斯神经网络的参考引导癌症细胞识别方法scCrab | scCrab通过贝叶斯神经网络和多头自注意力机制进行集成学习，能够有效整合外部参考数据作为先验信息，提高了癌症细胞识别的性能 | NA | 开发一种高效的癌症细胞识别方法，以提高癌症诊断的准确性和效率 | 癌症细胞的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯神经网络（BNN） | 基因表达数据 | 涉及多种数据集的实验验证了scCrab的性能 |
| 266 | 2024-10-01 |
Exploring the heterogeneity of interstitial cells of Cajal and their properties in gastrointestinal mesenchymal tumors applying single-cell RNA sequencing analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01372-8
PMID:39331193
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析探索胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性及其特性 | 揭示了胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性和干细胞特性，并发现了潜在的治疗靶点 | NA | 研究胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的特性和分子机制 | 胃肠间质瘤中的间质细胞Cajal | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 34,861个细胞 |
| 267 | 2024-10-01 |
Exploring copper metabolism-induced cell death in gastric cancer: a single-cell RNA sequencing study and prognostic model development
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01374-6
PMID:39331287
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索胃癌中铜代谢诱导的细胞死亡，并开发基于铜代谢相关基因表达的预后模型 | 首次在单细胞水平上研究铜代谢在胃癌中的作用，并开发了基于铜代谢相关基因的预后模型 | NA | 研究胃癌中铜代谢的作用，并开发预后模型 | 胃癌组织和正常组织的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和随机生存森林 | RNA | NA |
| 268 | 2024-10-01 |
Identification of immune patterns in idiopathic pulmonary fibrosis patients driven by PLA2G7-positive macrophages using an integrated machine learning survival framework
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73625-z
PMID:39333367
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研究论文 | 本研究通过集成机器学习生存框架，识别特发性肺纤维化患者中由PLA2G7阳性巨噬细胞驱动的免疫模式 | 首次通过免疫相关风险评分（IRS）识别PLA2G7作为特发性肺纤维化的新型生物标志物，并验证了塞来昔布与PLA2G7的有效结合 | NA | 识别特发性肺纤维化患者中的新免疫模式和生物标志物，以改善早期诊断和干预 | 特发性肺纤维化患者及其免疫微环境 | 机器学习 | 肺病 | 单细胞测序 | 集成机器学习框架 | 基因数据 | NA |
| 269 | 2024-10-01 |
Deciphering the role of sphingolipid metabolism in the immune microenvironment and prognosis of esophageal cancer via single-cell sequencing and bulk data analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01379-1
PMID:39333432
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和批量数据分析，揭示了鞘脂代谢在食管癌免疫微环境和预后中的作用 | 结合单细胞和转录组数据，提供了与鞘脂代谢相关的可靠预后模型，并为食管鳞状细胞癌的免疫治疗和药物治疗提供了遗传学层面的指导 | NA | 探讨鞘脂代谢在食管鳞状细胞癌中的作用及其对预后的影响 | 食管鳞状细胞癌的鞘脂代谢相关基因及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO和TCGA的数据，分析了97个基因在食管鳞状细胞癌上皮细胞中的表达 |
| 270 | 2024-10-01 |
Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq
2024-Sep-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52717-4
PMID:39333520
|
研究论文 | 介绍了一种合成的热稳定RNase抑制剂用于单细胞RNA测序 | 合成的RNase抑制剂SEQURNA在单细胞RNA测序中表现出与普遍使用的蛋白质重组RNase抑制剂（RRIs）相等或更优的质量，并提供了更高的可重复性和通量，支持新的实验流程，包括在整个热循环过程中保留RNase抑制 | NA | 改进单细胞RNA测序中的RNA完整性保护 | 单细胞RNA测序中的RNA完整性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 271 | 2024-10-01 |
Construction of store-operated calcium entry-related gene signature for predicting prognosis and indicates immune microenvironment infiltration in stomach adenocarcinomas
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73324-9
PMID:39333689
|
研究论文 | 研究构建了与存储操作钙进入相关的基因签名，用于预测胃腺癌的预后并指示免疫微环境浸润 | 首次系统研究了存储操作钙进入（SOCE）在胃腺癌（STAD）中的预后和免疫学价值 | NA | 开发一个风险模型，探索SOCE签名与临床特征、预后、肿瘤微环境（TME）以及对免疫治疗、化疗和靶向药物反应的相关性 | 胃腺癌（STAD）患者的SOCE相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA、GEO（GSE84437和GSE159929）、cBioPortal和TIMER数据库中的数据 |
| 272 | 2024-10-01 |
scGAA: a general gated axial-attention model for accurate cell-type annotation of single-cell RNA-seq data
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73356-1
PMID:39333739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGAA的新型细胞类型注释模型，用于单细胞RNA测序数据的准确注释 | 提出了基于transformer框架的轴向注意力机制，将传统的自注意力机制分解为水平和垂直注意力，显著提高了计算效率，并集成了门控单元以增强基因间关系的捕捉 | NA | 开发一种高效的细胞类型注释模型，以应对单细胞RNA测序数据的高维度和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | transformer | 基因表达数据 | NA |
| 273 | 2024-10-01 |
Endocytosis as a critical regulator of hematopoietic stem cell fate -implications for hematopoietic stem cell and gene therapy
2024-Sep-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03927-6
PMID:39334274
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评论 | 本文讨论了内吞作用在造血干细胞命运调控中的关键作用及其对造血干细胞和基因治疗的启示 | 揭示了MYCT1蛋白在造血干细胞维持中的新作用，特别是其在调节内吞作用和环境感知中的关键角色 | 尽管取得了显著进展，但仍存在对造血干细胞内在机制及其在体外培养中变化的全面理解不足的问题 | 探讨内吞作用在造血干细胞维持和功能中的作用，并讨论其在细胞治疗和基因治疗应用中的潜在影响 | 造血干细胞（HSCs）及其在体外培养中的维持和扩展 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 274 | 2024-10-01 |
Oncogenic ACSM6 impairs CD8+ T cell-based immune response in bladder cancer
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00657-y
PMID:39334304
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研究论文 | 研究了致癌基因ACSM6在膀胱癌中对CD8+ T细胞免疫反应的影响 | 发现ACSM6通过抑制CD8 T细胞的趋化性和肿瘤杀伤能力，导致非炎症性免疫微环境，从而影响膀胱癌的免疫治疗效果 | NA | 探讨ACSM6在膀胱癌免疫治疗中的作用及其作为预测膀胱癌进展的生物标志物的潜力 | 膀胱癌中的ACSM6表达及其对CD8+ T细胞功能的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 275 | 2024-10-01 |
Single-cell sequencing to multi-omics: technologies and applications
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00643-4
PMID:39334490
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在多组学中的应用 | 介绍了单细胞多组学技术的发展及其在生物学研究和临床应用中的最新进展 | 讨论了单细胞多组学技术的局限性和面临的挑战 | 探讨单细胞测序技术在多组学中的应用及其在生物学研究和临床中的潜力 | 单细胞RNA测序及其与其他多组学的结合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 276 | 2024-10-01 |
Functional heterogeneity of cancer-associated fibroblasts with distinct neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Sep-27, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00656-z
PMID:39334513
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研究论文 | 研究了食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术，揭示了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞在术前治疗后的显著变化，并发现了与不良治疗反应相关的功能性成纤维细胞亚群 | 研究样本来自单一临床试验，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞在术前免疫治疗联合化疗中的功能异质性及其对治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自术前抗PD1联合治疗临床试验的食管鳞状细胞癌样本 |
| 277 | 2024-10-01 |
YTHDF1 in periaqueductal gray inhibitory neurons contributes to morphine withdrawal responses in mice
2024-Sep-20, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03634-2
PMID:39304892
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研究论文 | 本文研究了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的作用，及其对小鼠吗啡戒断反应的影响 | 首次揭示了YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达上调与吗啡戒断反应的关系，并探讨了其通过调节NF-κB表达和磷酸化来调控吗啡戒断反应的机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨YTHDF1在其他脑区或人类中的作用 | 探讨YTHDF1在吗啡戒断反应中的作用及其机制 | YTHDF1在导水管周围灰质抑制性神经元中的表达及其对吗啡戒断反应的影响 | NA | NA | 腺相关病毒转染、单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57/BL6小鼠或转基因小鼠 |
| 278 | 2024-10-01 |
Berberine Targets PKM2 to Activate the t-PA-Induced Fibrinolytic System and Improves Thrombosis
2024-Sep-17, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph17091219
PMID:39338381
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研究论文 | 研究探讨了小檗碱通过靶向PKM2激活t-PA诱导的纤溶系统，从而改善血栓形成的作用 | 首次揭示了小檗碱通过调节PKM2表达来影响纤溶系统中t-PA的表达，从而改善血栓形成 | 研究主要在动物模型中进行，需要进一步在临床试验中验证其效果 | 探讨小檗碱治疗动脉血栓的潜在机制 | 小檗碱对血栓形成的影响及其分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 质谱分析和单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质表达数据 | 使用大鼠作为实验对象，具体样本数量未明确提及 |
| 279 | 2024-10-01 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 研究探讨了TRPC3通道在阿尔茨海默病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了TRPC3在阿尔茨海默病发病机制中的独特作用，并验证了其作为治疗靶点的有效性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨TRPC3在阿尔茨海默病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | TRPC3通道在阿尔茨海默病中的表达和功能 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、钙成像 | NA | RNA序列数据 | 包括阿尔茨海默病患者和小鼠模型的样本 |
| 280 | 2024-10-01 |
scVGATAE: A Variational Graph Attentional Autoencoder Model for Clustering Single-Cell RNA-seq Data
2024-Sep-11, Biology
DOI:10.3390/biology13090713
PMID:39336140
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研究论文 | 提出了一种名为scVGATAE的无监督聚类方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞亚群识别 | 引入了一种结合图注意力网络的变分图自编码器模型，通过网络去噪构建可靠的细胞图，并自适应确定模型训练迭代次数 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的无监督聚类方法，以提高单细胞RNA测序数据中细胞亚群识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器（VGAE） | 单细胞RNA测序数据 | 九个公共数据集 |