单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 638 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-10-30 |
A Single-Cell Atlas of the Substantia Nigra Reveals Therapeutic Effects of Icaritin in a Rat Model of Parkinson's Disease
2024-Sep-30, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox13101183
PMID:39456437
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了黑质中的细胞多样性，并探讨了黄酮类化合物icariin在帕金森病大鼠模型中的治疗效果 | 首次在帕金森病大鼠模型中识别出一种新的细胞亚型——突触丰富的细胞（SRCs），并发现icariin能够改善SRCs与其他细胞群的紧密相互作用，具有抗神经炎症、抗氧化和免疫改善作用 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人类中验证icariin的治疗效果 | 探讨帕金森病中黑质细胞的多样性及其在疾病中的作用，并评估icariin作为潜在治疗药物的效果 | 帕金森病大鼠模型中的黑质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 帕金森病大鼠模型中的黑质细胞 |
| 242 | 2024-10-30 |
Revolutionizing soybean genomics: How CRISPR and advanced sequencing are unlocking new potential
2024-Sep-03, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01435-7
PMID:39223394
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研究论文 | 本文探讨了CRISPR和高级测序技术如何革新大豆基因组学，推动大豆遗传改良 | 利用CRISPR-Cas9基因编辑技术和单细胞RNA测序（scRNA-seq）等先进技术，实现了对大豆基因组的精确修改和深入研究 | NA | 探索大豆基因组学的革新方法，推动大豆遗传改良 | 大豆（Glycine max L.）的基因组和遗传改良 | 基因组学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 涉及野生和栽培大豆的基因组数据 |
| 243 | 2024-10-29 |
Utilization of Microfluidic Droplet-Based Methods in Diagnosis and Treatment Methods of Hepatocellular Carcinoma: A Review
2024-Sep-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15101242
PMID:39457366
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综述 | 本文综述了微流控液滴技术在肝细胞癌诊断和治疗中的应用 | 介绍了微流控液滴技术在肝细胞癌研究中的新应用，如单细胞RNA测序和其他单细胞分析方法 | 微流控技术的应用仍有限，尤其是在肝细胞癌的分子机制研究中 | 探讨微流控液滴技术在肝细胞癌研究中的优势和局限性 | 肝细胞癌的诊断和治疗 | 数字病理学 | 肝癌 | 微流控液滴技术 | NA | 基因组和转录组数据 | 单细胞 |
| 244 | 2024-10-26 |
Single-Cell RNA Sequencing and Combinatorial Approaches for Understanding Heart Biology and Disease
2024-Sep-30, Biology
DOI:10.3390/biology13100783
PMID:39452092
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和组合方法在理解心脏生物学和疾病中的最新进展 | 结合转录组与空间维度和其他组学数据，提供对单细胞功能、微环境、动态过程及其相互关系的全面理解 | NA | 介绍单细胞分辨率下心脏健康和疾病的最新进展及其未来应用前景 | 心脏细胞的多样性及其在心脏发育和疾病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、基因组、表观基因组和蛋白质组数据 | 数百到数百万个单细胞 |
| 245 | 2024-10-28 |
Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates
2024-Sep-27, Biology
DOI:10.3390/biology13100773
PMID:39452082
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meta-analysis | 本文通过meta分析斑马鱼肾脏单细胞RNA测序数据，揭示了脊椎动物巨噬细胞和中性粒细胞的保守分子特征 | 首次对斑马鱼肾脏免疫细胞进行大规模单细胞RNA测序meta分析，确认了与哺乳动物相似的关键遗传通路 | 研究仅限于斑马鱼肾脏免疫细胞，未涵盖其他物种或组织 | 探讨脊椎动物先天免疫系统的保守分子特征 | 斑马鱼肾脏中的巨噬细胞和中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约250,000个免疫细胞 |
| 246 | 2024-10-28 |
A robust statistical approach for finding informative spatially associated pathways
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae543
PMID:39451157
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研究论文 | 本文介绍了一种新的统计框架，用于识别与空间变异性相关的功能通路 | 该方法通过创新地应用布朗距离协方差检验，直接识别与空间变异性相关的功能通路，避免了基因选择和参数选择的限制，允许非线性和复杂依赖关系 | NA | 旨在通过分析空间转录组数据，深入理解细胞在不同空间域中的活动协调机制 | 人类和小鼠的实际数据集 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 布朗距离协方差检验 | 基因表达数据 | 人类和小鼠的数据集 |
| 247 | 2024-10-28 |
Single-cell sequencing reveals the transcriptional alternations of 17β-estradiol suppressing primordial follicle formation in neonatal mouse ovaries
2024-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13713
PMID:38988058
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研究论文 | 研究揭示了17β-雌二醇抑制新生小鼠卵巢原始卵泡形成的转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了17β-雌二醇处理对新生小鼠卵巢原始卵泡形成和细胞增殖的抑制作用及其分子机制 | 研究仅限于新生小鼠模型，未探讨其他动物模型或人类中的情况 | 探讨雌激素在原始卵泡形成中的调控作用 | 新生小鼠卵巢中的原始卵泡和相关细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠卵巢样本 |
| 248 | 2024-10-27 |
Structure-preserved integration of scRNA-seq data using heterogeneous graph neural network
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae538
PMID:39446194
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研究论文 | 提出了一种利用异构图神经网络（scHetG）进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据整合的方法 | 通过构建异构图来表示多批次细胞和基因之间的相互作用，并结合异构图神经网络和对比学习，同时获取包含结构信息的细胞和基因嵌入 | NA | 消除批次效应并保留细胞和基因的结构信息 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 异构图神经网络（Heterogeneous Graph Neural Network） | 基因表达数据 | 涉及多个物种、组织和尺度的数据 |
| 249 | 2024-10-27 |
Single-cell RNA sequencing to map tumor heterogeneity in gastric carcinogenesis paving roads to individualized therapy
2024-Sep-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03820-4
PMID:39271545
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在胃癌（GC）研究中的应用，探讨了其在揭示肿瘤异质性和个性化治疗中的潜力 | scRNA-seq技术提供了前所未有的分子、细胞和免疫层面的肿瘤微环境（TME）复杂生物组成和特征的见解 | NA | 探讨scRNA-seq在胃癌研究中的应用及其在个性化治疗中的潜力 | 胃癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 250 | 2024-10-26 |
Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges
2024-Sep, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400056
PMID:38977414
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综述 | 本文综述了癌症类器官在癌症研究中的进展、应用、优势、局限性和前景 | 癌症类器官作为复杂肿瘤微环境的模型，有望提高肿瘤药物开发的成功率并重现最有效的治疗方案 | 癌症类器官的应用仍面临挑战，包括技术限制和标准化问题 | 探讨癌症类器官在临床肿瘤治疗中的应用潜力 | 癌症类器官及其在肿瘤药物开发中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-10-26 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice
2024-Sep, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400120
PMID:38864263
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了雷公藤内酯诱导的小鼠肾毒性效应及其机制 | 首次在单细胞分辨率下全面描述了雷公藤内酯处理后肾脏细胞的转录组变化和细胞组成 | NA | 揭示雷公藤内酯诱导的肾毒性机制 | 雷公藤内酯处理后的小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组和雷公藤内酯处理组的小鼠肾脏组织 |
| 252 | 2024-10-25 |
Points2Regions: Fast, interactive clustering of imaging-based spatial transcriptomics data
2024-Sep, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24884
PMID:38958502
|
研究论文 | 介绍了一种名为Points2Regions的计算工具，用于快速识别空间转录组学数据中具有相似mRNA组成的区域 | 通过将点（代表mRNA）栅格化到金字塔网格上进行快速特征提取，并结合层次聚类和k-means聚类进行高效聚类，实现了跨多个尺度的快速区域发现 | 未提及具体限制 | 开发一种不依赖额外数据且能快速识别空间转录组学数据中相似mRNA组成区域的工具 | 空间转录组学数据中的mRNA组成区域 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 层次聚类和k-means聚类 | 空间点数据 | 两个模拟数据集和真实世界数据集 |
| 253 | 2024-10-25 |
The role of proliferating stem-like plasma cells in relapsed or refractory multiple myeloma: Insights from single-cell RNA sequencing and proteomic analysis
2024-Sep, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19486
PMID:38671576
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学数据，研究了复发或难治性多发性骨髓瘤中增殖性干细胞样浆细胞的作用 | 首次鉴定出增殖性干细胞样浆细胞（PSPCs），并发现NUCKS1和LGALS1作为其标志基因，揭示了MDK信号通路在PSPCs与微环境细胞间通信中的作用 | 样本量相对较小，且仅限于特定患者群体 | 探讨复发或难治性多发性骨髓瘤中增殖性干细胞样浆细胞的分子机制及潜在治疗策略 | 复发或难治性多发性骨髓瘤患者中的浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、质谱分析 | NA | RNA、蛋白质 | 15名浆细胞疾病患者和144名浆细胞疾病患者的CD138浆细胞 |
| 254 | 2024-08-07 |
FAM110A could serve as a prognostic biomarker for patients with breast cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.014
PMID:38729881
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-07 |
ACAP1 could serve as a novel prognostic biomarker associated with tumor immunity in clear-cell renal cell carcinoma: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.024
PMID:38724393
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-10-24 |
IL-1 receptor-associated kinase 3 (IRAK3) in lung adenocarcinoma predicts prognosis and immunotherapy resistance: involvement of multiple inflammation-related pathways
2024-Sep-30, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-391
PMID:39430338
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研究论文 | 研究探讨了IL-1受体相关激酶3（IRAK3）在肺腺癌（LUAD）中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了IRAK3在LUAD中的表达与预后和免疫治疗反应的关系，并探讨了其在多个炎症相关通路中的作用 | 研究主要基于数据库分析和组织微阵列，缺乏体内实验验证 | 探讨IRAK3在肺腺癌中的预后价值和免疫治疗反应中的作用 | 肺腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 基因集富集分析（GSEA）、组织微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、蛋白质表达数据 | 中国国家癌症中心（NCC）的肺腺癌患者队列 |
| 257 | 2024-10-24 |
Disulfidptosis-related gene SLC7A11 predicts prognosis and indicates tumor immune infiltration in lung adenocarcinoma
2024-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1182
PMID:39430814
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研究论文 | 研究探讨了二硫化物应激相关基因SLC7A11在肺腺癌中的预后预测和肿瘤免疫浸润中的作用 | 首次系统分析了二硫化物应激在肺腺癌中的免疫调节作用，特别是SLC7A11基因的影响 | 研究结果需要进一步的实验验证 | 分析二硫化物应激相关基因在肺腺癌中的免疫调节作用 | 肺腺癌中的二硫化物应激相关基因SLC7A11 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA的数据，包括批量和单细胞RNA测序数据 |
| 258 | 2024-10-24 |
Heterogeneity of tumor microenvironment cell groups in inflammatory and adenomatous polyposis coli mutant colorectal cancer based on single cell sequencing
2024-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-689
PMID:39430845
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研究论文 | 研究了基于单细胞测序的炎症性和APC突变型结直肠癌肿瘤微环境细胞组的异质性 | 揭示了炎症性CRC和APC突变型CRC的复杂肿瘤微环境，并识别了APOE作为潜在的CRC复发生物标志物 | NA | 揭示炎症性CRC和APC突变型CRC的肿瘤微环境，并为不同亚型的CRC治疗提供理论基础 | 炎症性CRC和APC突变型CRC的肿瘤微环境细胞组 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | 8494个结直肠癌细胞 |
| 259 | 2024-10-24 |
Zebrafish models of human-duplicated SRGAP2 reveal novel functions in microglia and visual system development
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612570
PMID:39314374
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研究论文 | 研究通过斑马鱼模型揭示了人类SRGAP2基因重复在微胶质细胞和视觉系统发育中的新功能 | 首次在斑马鱼中研究了人类SRGAP2基因重复的影响，揭示了其在微胶质细胞和视觉系统发育中的新功能 | 研究主要集中在斑马鱼模型，尚未在其他物种中验证 | 探讨人类SRGAP2基因重复在微胶质细胞和视觉系统发育中的作用 | 斑马鱼模型中的SRGAP2基因重复 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼幼体 |
| 260 | 2024-10-24 |
A scalable, high-throughput neural development platform identifies shared impact of ASD genes on cell fate and differentiation
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614184
PMID:39386704
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研究论文 | 本文通过优化Perturb-seq方法，结合单细胞RNA测序和结构主题建模，研究了自闭症谱系障碍（ASD）基因对细胞命运和分化的共同影响 | 本文提出了一种优化的高通量神经发育平台，结合了CRISPR干扰和单细胞RNA测序，并应用结构主题建模来同时评估细胞命运和发育阶段的影响 | 本文仅研究了60个高置信度的ASD风险基因，可能无法全面代表所有ASD基因的影响 | 识别神经发育障碍基因中的收敛通路，揭示高影响的潜在治疗靶点 | 自闭症谱系障碍（ASD）基因对神经发育的影响 | 基因组学 | 神经发育障碍 | Perturb-seq, 单细胞RNA测序 | 结构主题建模 | 基因表达数据 | 60个高置信度的ASD风险基因 |