单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 638 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-11-09 |
scDTL: enhancing single-cell RNA-seq imputation through deep transfer learning with bulk cell information
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae555
PMID:39504481
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度迁移学习的单细胞RNA测序数据插补方法scDTL，通过利用批量细胞信息来增强插补效果 | scDTL利用批量RNA测序数据训练的去噪自编码器作为初始插补模型，并通过领域适应框架将批量插补模型的知识迁移到单细胞RNA测序学习任务中，同时采用1D U-Net去噪模型进行并行操作，捕捉单细胞RNA测序数据的粗粒度和细粒度特征，并通过交叉通道注意力机制融合特征 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高下游分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 去噪自编码器、1D U-Net | RNA测序数据 | NA |
| 222 | 2024-11-09 |
PAC1 constrains type 2 inflammation through promotion of CGRP signaling in ILC2s
2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180109
PMID:39287985
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研究论文 | 研究探讨了PAC1通过促进CGRP信号传导在ILC2中调节2型炎症的作用 | 首次揭示了PAC1在ILC2中通过细胞内在机制促进CGRP信号传导，从而调节2型炎症 | 研究主要基于小鼠模型和人类循环ILC2，未来需进一步验证在其他物种和疾病模型中的适用性 | 探讨PAC1在ILC2中调节2型炎症的机制 | PAC1在ILC2中的作用及其对CGRP信号传导的影响 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类循环ILC2样本 |
| 223 | 2024-11-09 |
Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma
2024-Sep-10, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175310
PMID:39255035
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研究论文 | 研究探讨了H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 | 通过全基因组CRISPR/Cas9筛选识别出H2AFY作为PD-1阻断抗体nivolumab的耐药基因，并揭示了其在单细胞RNA-Seq数据中的富集及其与患者生存的关联 | NA | 阐明H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 | H2AFY在神经母细胞瘤中的作用及其对PD-1阻断疗法的耐药性 | NA | 神经母细胞瘤 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-Seq、多组学分析 | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 224 | 2024-11-09 |
Single-cell sequencing analysis confirms the association of ANRIL with the increased smooth muscle cell proliferation and migration gene signatures in pulmonary artery hypertension in silico
2024-Sep, Advances in medical sciences
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.advms.2024.04.002
PMID:38631609
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 | 首次通过单细胞测序技术分析了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性，并证实了ANRIL表达与平滑肌细胞增殖和迁移基因特征的关联 | 研究样本量较小，仅包括三名肺动脉高压患者和三名健康对照 | 探讨肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 | 肺动脉高压患者的肺动脉平滑肌细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名肺动脉高压患者和三名健康对照的肺动脉样本 |
| 225 | 2024-11-08 |
Endosialin-positive CAFs promote hepatocellular carcinoma progression by suppressing CD8+ T cell infiltration
2024-Sep-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009111
PMID:39260826
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研究论文 | 研究了Endosialin阳性CAFs通过抑制CD8+ T细胞浸润促进肝细胞癌进展的机制 | 首次揭示了Endosialin通过抑制STAT1磷酸化和核转位，减少CXCL9/10表达和分泌，从而抑制CD8+ T细胞浸润，促进肝细胞癌进展 | NA | 探讨Endosialin阳性CAFs在肝细胞癌进展中的作用及其机制 | Endosialin阳性CAFs、CD8+ T细胞、CXCL9/10 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、流式细胞术、RNA测序 | NA | 细胞 | ENKO小鼠、Hepa1-6细胞、肝细胞癌患者肿瘤组织 |
| 226 | 2024-11-07 |
Multi-level multi-view network based on structural contrastive learning for scRNA-seq data clustering
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae562
PMID:39494609
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研究论文 | 提出了一种基于结构一致性对比学习的scRNA-seq数据聚类方法 | 引入了多层次多视角网络和对比学习，以提高scRNA-seq数据聚类的准确性 | NA | 解决scRNA-seq数据高维度和复杂性带来的聚类挑战 | scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 多层次多视角网络 | scRNA-seq数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 |
| 227 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows that Circulating Monocytes Enriched in IFN Signaling Are Associated with Nontuberculous Mycobacteria Pulmonary Disease in Cystic Fibrosis
2024-Sep-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202312-2279LE
PMID:38889330
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-11-07 |
Primate-specific BTN3A2 protects against SARS-CoV-2 infection by interacting with and reducing ACE2
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105281
PMID:39142074
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研究论文 | 研究探讨了灵长类特异性蛋白BTN3A2通过与ACE2相互作用，减少ACE2表达，从而保护宿主细胞免受SARS-CoV-2感染的机制 | 首次揭示了BTN3A2在抑制SARS-CoV-2感染中的关键作用，并提出了通过模拟BTN3A2的单克隆抗体来开发COVID-19治疗新途径的可能性 | NA | 揭示SARS-CoV-2与宿主细胞相互作用的分子机制，为COVID-19的预防和治疗提供新思路 | BTN3A2在COVID-19中的作用及其与ACE2的相互作用 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、基因编辑、免疫沉淀、流式细胞术、生物层干涉测量、竞争性ELISA | NA | RNA | 基因编辑细胞系、转基因小鼠、COVID-19患者病理组织样本 |
| 229 | 2024-11-07 |
Intra-patient spatial comparison of non-metastatic and metastatic lymph nodes reveals the reduction of CD169+ macrophages by metastatic breast cancers
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105271
PMID:39173531
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研究论文 | 研究乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响，特别是CD169+巨噬细胞的减少 | 首次系统比较了非转移性和转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞的数量，并发现转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞显著减少 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者 | 探讨乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响机制 | 非转移性和转移性淋巴结中的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、成像质谱流式细胞术、组织学分析 | NA | 组织切片 | 6名乳腺癌患者的淋巴结样本，以及58名患者的474个组织切片 |
| 230 | 2024-11-06 |
Single-cell genomics details the maturation block in BCP-ALL and identifies therapeutic vulnerabilities in DUX4-r cases
2024-09-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021705
PMID:38968149
|
研究论文 | 本文利用多模态单细胞测序技术，详细描述了B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）的成熟阻滞现象，并识别了DUX4重排（DUX4-r）亚型的治疗脆弱性 | 首次通过多模态单细胞测序技术，详细描绘了不同BCP-ALL亚型的转录组、表观遗传和免疫表型特征，并发现了DUX4-r亚型的多谱系启动和PI3K/AKT信号通路的激活 | 研究样本仅限于23例儿童BCP-ALL病例，可能无法完全代表所有BCP-ALL患者的情况 | 揭示BCP-ALL的生物学特性和治疗脆弱性，为开发新的治疗策略提供依据 | B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）及其DUX4重排（DUX4-r）亚型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 转录组、表观遗传和免疫表型数据 | 23例儿童BCP-ALL病例 |
| 231 | 2024-11-06 |
Upregulated expression of ubiquitin ligase TRIM21 promotes PKM2 nuclear translocation and astrocyte activation in experimental autoimmune encephalomyelitis
2024-Sep-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98181
PMID:39264698
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研究论文 | 研究揭示了泛素连接酶TRIM21通过促进PKM2核转位和星形胶质细胞活化在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用 | 首次揭示了TRIM21通过泛素化介导的机制调控PKM2核转位，从而影响星形胶质细胞活化和神经炎症 | NA | 探讨代谢重编程在星形胶质细胞活化中的作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中的星形胶质细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠及小鼠原代星形胶质细胞 |
| 232 | 2024-11-06 |
Activation of cGAS/STING Drives Inflammation and Cellular Senescence of Macrophages in Ovarian Endometrioma Induced by Endometriotic Cyst Fluid
2024-Sep, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300711
PMID:38864247
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研究论文 | 研究探讨了卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其机制 | 发现cGAS/STING信号通路的激活在卵巢子宫内膜异位囊肿液诱导的炎症和细胞衰老中的作用，并验证了STING抑制剂H-151的缓解效果 | NA | 探讨卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其分子和细胞机制 | 卵巢子宫内膜异位囊肿液、卵巢功能、巨噬细胞 | NA | 卵巢疾病 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 233 | 2024-11-06 |
Loss of NLRP6 increases the severity of kidney fibrosis
2024-Sep, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31347
PMID:38934623
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研究论文 | 研究探讨了NLRP6在慢性肾脏疾病（CKD）中的作用及其在肾脏纤维化中的分子机制 | 首次揭示了NLRP6在肾脏纤维化中的保护作用，并阐明了其通过调节p38 MAPK信号通路影响纤维化进程的机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养，缺乏人类临床数据的支持 | 探讨NLRP6在慢性肾脏疾病中的作用及其分子机制 | NLRP6在肾脏纤维化中的作用及其分子机制 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和Nlrp6缺陷小鼠，以及培养的近端小管细胞 |
| 234 | 2024-11-06 |
Expression patterns of keratin family members during tooth development and the role of keratin 17 in cytodifferentiation of stratum intermedium and stellate reticulum
2024-Sep, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31387
PMID:39014890
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研究论文 | 研究分析了角质蛋白家族成员在牙齿发育过程中的时空表达模式，并探讨了角质蛋白17在中间层和星网状结构细胞分化中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了角质蛋白家族成员在牙齿发育过程中的表达模式，并揭示了角质蛋白17在中间层细胞分化中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨角质蛋白家族成员在牙齿发育中的表达模式及其在细胞分化中的作用 | 角质蛋白家族成员在牙齿发育中的表达及其对细胞分化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自出生后第1天小鼠臼齿的单细胞RNA测序数据 |
| 235 | 2024-11-04 |
Graph contrastive learning as a versatile foundation for advanced scRNA-seq data analysis
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae558
PMID:39487083
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研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习的新框架scSimGCL，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | scSimGCL结合了细胞-细胞图结构和对比学习，显著提升了细胞聚类的性能 | NA | 开发一种简单而有效的框架，用于生成高质量的表示，以实现稳健的细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 机器学习 | NA | 图对比学习 | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 236 | 2024-11-04 |
NKG2C and NKG2A coexpression defines a highly functional antiviral NK population in spontaneous HIV control
2024-Sep-17, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182660
PMID:39288262
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研究论文 | 本研究全面分析了长期病毒控制下的HIV精英控制者（ECs）的NK细胞库，发现NKG2C+CD57+记忆样NK细胞在ECs中显著富集，并揭示了这些细胞在抗HIV感染中的关键作用 | 首次揭示了NKG2C和NKG2A共表达的记忆样NK细胞在HIV控制中的重要作用，并发现了这些细胞独特的转录特征 | 研究主要集中在NK细胞的功能和表型分析，未涉及其他免疫细胞的相互作用 | 探讨NK细胞在HIV精英控制者中的作用及其机制 | HIV精英控制者的NK细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | HIV精英控制者和未感染个体的NK细胞 |
| 237 | 2024-11-04 |
Human breastmilk memory T cells throughout lactation manifest activated tissue-oriented profile with prominent regulation
2024-Sep-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181788
PMID:39435660
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研究论文 | 研究分析了母乳中记忆T细胞在哺乳期的特征及其在免疫调节中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序和流式细胞术对母乳中的T细胞进行全面表征，揭示了其独特的组织适应性和免疫调节功能 | 研究主要集中在母乳T细胞的表型和功能分析，未深入探讨其在新生儿免疫支持中的具体机制 | 探讨母乳中不同免疫活性成分对新生儿免疫的贡献 | 母乳中的记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表面标记数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 238 | 2024-11-02 |
Six1 Regulates Mouse Incisor Development by Promoting Dlx1/2/5 Expression
2024-Sep, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241256286
PMID:39101661
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研究论文 | 研究探讨了Six1在调控小鼠下门齿发育中的关键作用及其分子机制 | 首次揭示了Six1通过促进Dlx1/2/5表达在牙胚发育中的重要作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 阐明Six1在牙胚发育中的调控作用及其分子机制 | 小鼠下门齿发育过程中的牙胚细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙胚发育不同阶段的样本 |
| 239 | 2024-11-02 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-Sep, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 研究探讨了APOE ε4等位基因对IL-7/IL-7R通路的影响及其在阿尔茨海默病中的作用 | 揭示了APOE ε4等位基因下调IL-7/IL-7R通路在调节神经炎症和海马萎缩中的作用 | NA | 探讨APOE ε4等位基因对IL-7/IL-7R通路的影响及其在阿尔茨海默病中的作用 | APOE ε4携带者和非携带者的外周血单核细胞 | NA | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | RNA | 54名晚期阿尔茨海默病患者（包括28名APOE ε4携带者和26名非携带者） |
| 240 | 2024-11-02 |
Autophagy Regulates Age-Related Jawbone Loss via LepR+ Stromal Cells
2024-Sep, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241264810
PMID:39185629
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研究论文 | 研究探讨了自噬在年龄相关性下颌骨丢失中的作用，特别是通过LepR+基质细胞 | 首次揭示了自噬在年龄相关性下颌骨丢失中的关键作用，并提出了通过激活自噬来缓解下颌骨丢失的新方法 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类中验证 | 研究自噬在下颌骨老化和骨量减少中的作用 | 下颌骨及其衍生的基质细胞（JBSCs） | NA | NA | RNA测序、单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | 包括老年人和老年小鼠的下颌骨样本，以及LepR-Cre/JBSCs |