单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 678 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-10-04 |
Low protein diet protects the liver from Salmonella Typhimurium-mediated injury by modulating the mTOR/autophagy axis in macrophages
2024-Sep-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06932-w
PMID:39349819
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研究论文 | 研究低蛋白饮食对小鼠肝脏在沙门氏菌感染下的保护作用及其机制 | 首次探讨了低蛋白饮食通过调节mTOR/自噬轴在巨噬细胞中对肝脏的保护作用 | 研究仅限于小鼠模型和人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞，未涉及其他物种或细胞类型 | 探讨低蛋白饮食对肝脏在细菌感染下的免疫反应的影响 | 小鼠肝脏和巨噬细胞 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 |
| 222 | 2024-10-04 |
Exploring the interaction between immune cells in the prostate cancer microenvironment combining weighted correlation gene network analysis and single-cell sequencing: An integrated bioinformatics analysis
2024-Sep-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01399-x
PMID:39349877
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研究论文 | 本文通过结合加权相关基因网络分析和单细胞测序技术，研究了前列腺癌微环境中免疫细胞之间的相互作用 | 本文创新性地结合了加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术，识别出九个与前列腺癌进展相关的失调免疫枢纽基因 | 本文主要基于TCGA数据库的高通量基因组数据进行分析，未涉及实验验证 | 研究前列腺癌微环境中免疫细胞之间的相互作用，以期为前列腺癌的精准治疗提供新思路 | 前列腺癌微环境中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因组数据 | 基于TCGA数据库的高通量基因组数据 |
| 223 | 2024-10-04 |
Single-cell analysis of preimplantation embryonic development in guinea pigs
2024-Sep-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10815-z
PMID:39350018
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了豚鼠植入前胚胎发育过程中的转录组变化 | 首次系统构建了豚鼠植入前胚胎发育的细胞图谱，并揭示了细胞类型分化和关键基因激活的时间点 | NA | 探究豚鼠植入前胚胎发育的详细过程，并比较其与人类胚胎发育的异同 | 豚鼠植入前胚胎的细胞类型及其转录组特征 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 从受精卵到植入前阶段的豚鼠胚胎细胞 |
| 224 | 2024-10-04 |
Deciphering the role of LGALS2: insights into tertiary lymphoid structure-associated dendritic cell activation and immunotherapeutic potential in breast cancer patients
2024-Sep-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02126-4
PMID:39350165
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研究论文 | 本文通过综合分析大量转录组数据，揭示了LGALS2在三级淋巴结构中的关键作用及其在乳腺癌免疫治疗中的潜力 | 首次通过生物网络计算策略和机器学习方法，识别出LGALS2作为三级淋巴结构中的关键标记物，并揭示其在树突状细胞激活中的作用 | NA | 探讨LGALS2在乳腺癌中的作用及其在免疫治疗中的潜力 | LGALS2在三级淋巴结构中的作用及其对乳腺癌患者生存的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 超过6000个乳腺癌样本 |
| 225 | 2024-10-04 |
Single cell RNA sequencing provides novel cellular transcriptional profiles and underlying pathogenesis of presbycusis
2024-Sep-30, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-02001-7
PMID:39350266
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和老年小鼠耳蜗样本的转录组，揭示了与年龄相关听力损失（ARHL）相关的细胞转录谱和潜在分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ARHL的细胞转录谱和潜在分子机制，并分析了细胞间通信 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 揭示年龄相关听力损失（ARHL）的潜在分子机制 | 年轻和老年小鼠的耳蜗样本 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的耳蜗样本 |
| 226 | 2024-10-04 |
Exploring a new signature for lung adenocarcinoma: analyzing cuproptosis-related genes through Integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01389-z
PMID:39342548
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研究论文 | 研究探索了肺腺癌中与铜死亡相关基因的新特征，通过整合单细胞和批量RNA测序数据进行分析 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别与肺腺癌进展相关的铜死亡相关基因，并构建了新的预后特征 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限 | 研究肺腺癌的异质性，识别与疾病进展相关的关键基因，并探索细胞间通信网络 | 肺腺癌细胞及其异质性、铜死亡相关基因、细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | LASSO回归 | RNA | 单细胞RNA测序数据来自TISCH2，批量RNA测序数据来自TCGA |
| 227 | 2024-10-04 |
Pan-cancer analysis reveals that TK1 promotes tumor progression by mediating cell proliferation and Th2 cell polarization
2024-Sep-29, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03515-x
PMID:39343871
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研究论文 | 研究探讨了TK1在泛癌中的作用及其对肿瘤进展和免疫微环境的影响 | 首次全面分析了TK1在泛癌中的表达及其对肿瘤诊断、预后和免疫细胞浸润的影响 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探究TK1在泛癌中的综合作用及其对肿瘤进展和免疫微环境的影响 | TK1在不同癌症类型中的表达及其对肿瘤细胞增殖和Th2细胞极化的影响 | NA | NA | qPCR, 免疫印迹, 免疫组化, CCK-8, 集落形成, ELISA, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 涉及TCGA, TARGET, GTEx, CPTAC等多个数据库的数据, 以及肝细胞癌组织和细胞系 |
| 228 | 2024-10-04 |
A sexually dimorphic hepatic cycle of periportal VLDL generation and subsequent pericentral VLDLR-mediated re-uptake
2024-Sep-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52751-2
PMID:39341814
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研究论文 | 研究揭示了性别差异对肝脏功能时空逻辑的影响，特别是VLDL的生成和再摄取过程 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了性别、空间和时间对肝脏解毒和脂蛋白代谢的显著影响 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，且未涵盖所有年龄段和性别 | 探讨性别差异如何影响肝脏功能的时空逻辑 | 小鼠和人类的肝脏功能，特别是VLDL的生成和再摄取 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本，具体数量未明确提及 |
| 229 | 2024-10-04 |
Combination of bulk RNA and single-cell sequencing unveils PANoptosis-related immunological ecology hallmarks and classification for clinical decision-making in hepatocellular carcinoma
2024-09-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73847-1
PMID:39342037
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研究论文 | 本文通过结合bulk RNA和单细胞测序技术，揭示了肝细胞癌中PANoptosis相关的免疫生态特征，并提出了用于临床决策的分类系统 | 本文首次结合bulk RNA和单细胞测序技术，系统解析了PANoptosis在肝细胞癌中的分子和免疫生态特征，并开发了基于机器学习的PANoptosis评分系统，为个性化治疗提供了新思路 | 本文主要基于RNA测序数据，未涉及其他类型的数据如蛋白质组学数据，可能影响结果的全面性 | 研究PANoptosis在肝细胞癌中的免疫生态特征及其对临床决策的影响 | 肝细胞癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | 机器学习 | RNA | 101个样本 |
| 230 | 2024-10-04 |
Pharmacological targets and validation of remdesivir for the treatment of COVID-19-associated pulmonary fibrosis: A network-based pharmacology and bioinformatics study
2024-Sep-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039062
PMID:39331891
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研究论文 | 本研究利用生物信息学和网络药理学方法，探讨瑞德西韦在治疗COVID-19相关肺纤维化中的靶点和分子机制 | 本研究首次通过网络药理学和生物信息学方法，系统分析了瑞德西韦在COVID-19相关肺纤维化治疗中的潜在机制，并验证了其关键靶点 | 研究主要基于公开数据库和模拟分析，缺乏体内外实验验证 | 探讨瑞德西韦在治疗COVID-19相关肺纤维化中的靶点和分子机制 | 瑞德西韦在COVID-19相关肺纤维化治疗中的靶点和分子机制 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 网络药理学、分子对接 | NA | 基因组数据、蛋白质相互作用数据 | 利用公开的组织学和单细胞测序数据库进行验证 |
| 231 | 2024-10-04 |
Adaptive circuits for action and value information in rodent operant learning
2024-Sep-26, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2024.09.003
PMID:39341460
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综述 | 本文综述了啮齿动物操作性学习中支持行为和价值信息适应的神经回路 | 探讨了中脑多巴胺神经元在整合动作启动和奖励反馈中的复杂作用，并讨论了单细胞RNA测序等转录组分析技术在操作性学习中的应用 | NA | 深入理解啮齿动物操作性学习中的神经回路机制 | 啮齿动物操作性学习中的神经回路、突触可塑性和基因表达变化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 232 | 2024-10-04 |
In vivo CRISPR screens identify Mga as an immunotherapy target in triple-negative breast cancer
2024-Sep-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406325121
PMID:39298484
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研究论文 | 通过体内CRISPR筛选，识别出Mga作为三阴性乳腺癌的免疫治疗靶点 | 首次通过体内CRISPR筛选识别出Mga在三阴性乳腺癌中的免疫治疗潜力 | 需要进一步研究Mga调节肿瘤免疫环境的精确机制 | 识别和验证三阴性乳腺癌中的免疫治疗靶点 | 三阴性乳腺癌及其免疫逃逸机制 | 癌症研究 | 乳腺癌 | CRISPR筛选 | NA | 转录组学和单细胞RNA测序数据 | 七个同基因肿瘤模型 |
| 233 | 2024-10-04 |
Immunosuppressive tumor microenvironment in gastric signet-ring cell carcinoma
2024-Sep-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i9.1126
PMID:39351457
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研究论文 | 研究胃印戒细胞癌（GSRCC）的免疫抑制性肿瘤微环境（TME）及其与预后的关系 | 通过单细胞RNA测序和时间飞行质谱流式细胞术技术，揭示了GSRCC中独特的免疫抑制性TME，并探讨了其与预后的关联 | NA | 探讨胃印戒细胞癌的免疫抑制性肿瘤微环境及其与预后的关系，以期开发更有效的免疫治疗策略 | 胃印戒细胞癌（GSRCC）的肿瘤微环境及其免疫抑制性特征 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序、时间飞行质谱流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 234 | 2024-10-04 |
Uncovering the Bronchoalveolar Single-Cell Landscape of Patients With Pulmonary Tuberculosis With Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coinfection
2024-Sep-23, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae042
PMID:38412342
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研究论文 | 研究了HIV-1和肺结核共感染患者的支气管肺泡灌洗液中的单细胞转录组景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了HIV-1和肺结核共感染患者的肺部免疫细胞组成和功能变化 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨HIV-1感染对肺结核患者肺部免疫反应的影响 | HIV-1和肺结核共感染患者的支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19名患者，其中9名HIV-1和肺结核共感染，10名仅肺结核 |
| 235 | 2024-10-04 |
Single-cell Transcriptomic Analysis Identifies Senescent Osteocytes that Trigger Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-Sep-23, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0857
PMID:39312185
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研究论文 | 研究揭示了乳腺癌骨转移中衰老的成骨细胞通过分泌衰老相关分泌表型（SASP）促进骨破坏的机制 | 首次发现乳腺癌骨转移中的成骨细胞会提前衰老并表现出SASP，从而促进骨破坏 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨乳腺癌骨转移中骨微环境的重新编程机制，寻找治疗骨转移的新方法 | 乳腺癌骨转移中的成骨细胞及其衰老状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和乳腺癌患者的成骨细胞样本 |
| 236 | 2024-10-04 |
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532947
PMID:36993595
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研究论文 | 开发了一个名为mosna的Python包，用于分析空间组学数据并整合临床或生物学数据，以揭示细胞相互作用模式或组织架构 | mosna包整合了多种算法和条件，如临床数据，使得空间组学数据的分析更加便捷和全面 | NA | 开发一种工具，使空间组学数据的分析更加便捷，并能整合临床数据以揭示细胞相互作用和组织架构 | 空间组学数据和临床数据 | 生物信息学 | 癌症 | 空间组学 | 机器学习模型 | 蛋白质组学数据 | 两个空间解析的蛋白质组学数据集 |
| 237 | 2024-10-04 |
DrugReSC: targeting disease-critical cell subpopulations with single-cell transcriptomic data for drug repurposing in cancer
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae490
PMID:39350337
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研究论文 | 本文提出了一种利用单细胞转录组数据进行药物再利用的新方法DrugReSC | DrugReSC利用单细胞RNA测序数据，针对疾病病理关键的细胞亚群进行药物再利用，构建了药物与细胞的转录关系矩阵，并使用基于排列的方法评估药物对细胞表型变化的贡献 | NA | 开发一种利用单细胞转录组数据进行药物再利用的新方法，以推进癌症精准医学 | 癌症中的关键细胞亚群 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个癌症案例 |
| 238 | 2024-10-04 |
scPanel: a tool for automatic identification of sparse gene panels for generalizable patient classification using scRNA-seq datasets
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae482
PMID:39350339
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研究论文 | 介绍了一种名为scPanel的计算框架，用于从scRNA-seq数据中自动识别稀疏基因面板，以实现患者分类 | scPanel通过数据驱动的方式自动确定最小数量的信息性生物标志物基因，并在多个疾病数据集上展示了高分类准确性 | NA | 开发一种计算工具，用于从scRNA-seq数据中识别稀疏基因面板，以实现患者分类并降低测序成本 | scRNA-seq数据中的稀疏基因面板 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及硬皮病、结直肠癌和COVID-19的数据集 |
| 239 | 2024-10-04 |
Developmental regulation of dermal adipose tissue by BCL11b
2024-Sep-19, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351907.124
PMID:39266447
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研究论文 | 研究探讨了BCL11b在皮肤脂肪组织发育中的调控作用 | 发现了BCL11b通过调节Wnt信号微环境促进皮肤白色脂肪组织分化 | NA | 研究皮肤脂肪组织的胚胎起源及其在代谢疾病中的作用 | 皮肤白色脂肪组织及其发育调控机制 | NA | 代谢疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎发育过程中的细胞样本 |
| 240 | 2024-10-04 |
Decoding the genetic landscape of autism: A comprehensive review
2024-Sep-09, World journal of clinical pediatrics
DOI:10.5409/wjcp.v13.i3.98468
PMID:39350903
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综述 | 本文综述了自闭症谱系障碍（ASD）的遗传和表观遗传机制，探讨了基因突变和基因-环境相互作用对ASD的影响 | 本文整合了基因变异、表观遗传机制（如DNA甲基化和组蛋白修饰）以及新兴技术（如CRISPR-Cas9和单细胞RNA测序）的研究成果，提供了对ASD遗传景观的全面理解 | 尽管识别了许多与ASD相关的风险基因和突变，但仍有许多病例无法通过已知因素解释，表明存在未发现的遗传成分 | 探索ASD的遗传结构，阐明基因突变的机制，并研究基因-环境相互作用 | 自闭症谱系障碍（ASD）的遗传和表观遗传机制 | NA | 自闭症 | CRISPR-Cas9、单细胞RNA测序、DNA甲基化、组蛋白修饰 | NA | 基因组数据 | NA |