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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-07 |
Scalable imaging-free spatial genomics through computational reconstruction
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606465
PMID:39149311
|
研究论文 | 开发了一种无需成像的空间转录组学方法，通过分子扩散模式和计算重建获得空间基因组学数据 | 利用分子扩散模式计算重建空间数据，无需依赖成像或直接配准设备 | NA | 开发可扩展的无成像空间基因组学技术 | 组织中的细胞及其分子程序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，分子扩散分析，计算重建 | UMAP算法 | 空间转录组数据，分子相互作用矩阵 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-seq, Slide-tags | 二维条形码阵列 |
| 202 | 2025-10-07 |
LMNA-Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-Derived iPSC Differentiation Support Cell Type and Lineage-Specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency
2024-09-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171479
PMID:39273049
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC通过单细胞转录组学分析LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 首次在患者来源的iPSC分化过程中通过单细胞RNA测序揭示LMNA单倍体不足对心肌细胞和心外膜来源细胞基因表达和发育的细胞类型特异性调控紊乱 | 方法需要改进以进一步研究iPSC衍生模型中表观遗传和分化机制 | 研究LMNA相关扩张型心肌病的分子机制 | 来自携带LMNA c.357-2A>G剪接位点突变家族的患者来源iPSC及其分化细胞 | 单细胞转录组学 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序 | iPSC分化模型 | 单细胞转录组数据 | 12个样本（4个患者样本，8个对照样本），涵盖7个时间点，共110,521个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2025-10-07 |
Keratin 8/18a.1 Expression Influences Embryonic Neural Crest Cell Dynamics and Contributes to Postnatal Corneal Regeneration in Zebrafish
2024-09-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171473
PMID:39273043
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现角蛋白中间丝基因K8和K18a.1在斑马鱼眼部发育和角膜再生中的重要作用 | 首次揭示K8和K18a.1在斑马鱼神经嵴细胞迁移和角膜再生中的功能，并发现K18a.1受视黄酸调控 | 使用吗啉代寡核苷酸进行基因敲降可能存在脱靶效应，研究主要聚焦于斑马鱼模型 | 探究神经嵴细胞在眼部发育和角膜再生中的分子机制 | 斑马鱼胚胎神经嵴细胞和成年斑马鱼角膜组织 | 发育生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫荧光显微镜, 吗啉代寡核苷酸敲降 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎和成年个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 204 | 2025-10-07 |
Unraveling the phenotypic states of human innate-like T cells: Comparative insights with conventional T cells and mouse models
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114705
PMID:39264810
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了人类先天样T细胞与传统T细胞的转录特征 | 揭示了人类先天样T细胞不分化成多个效应亚群而是发展混合型1/型17效应潜能的独特特征，并发现人类缺乏2型T细胞的物种特异性差异 | 研究主要关注人类和小鼠的比较，可能不适用于其他物种的免疫机制 | 探索先天样T细胞与传统T细胞的转录特征差异及其发育途径 | 人类胸腺和血液中的先天样T细胞和传统T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2025-10-07 |
Molecular and spatial signatures of human and rat corpus cavernosum physiopathological processes at single-cell resolution
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760
PMID:39299236
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组测序，绘制了人类和大鼠阴茎海绵体在正常和疾病状态下的空间细胞图谱 | 首次在分子水平揭示了人类和大鼠阴茎海绵体的空间异质性，并发现了机械力信号在不同区域的分布差异 | 研究仅涉及人类和大鼠两个物种，且体外实验条件可能与体内环境存在差异 | 探究阴茎海绵体在生理和病理状态下的分子解剖结构和细胞异质性 | 人类和大鼠的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类和大鼠阴茎海绵体样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics elucidates medulla niche supporting germinal center response in myasthenia gravis-associated thymoma
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114677
PMID:39180749
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研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示重症肌无力相关胸腺瘤中支持生发中心反应的髓质微环境特征 | 首次利用空间转录组技术系统描绘胸腺瘤中髓质区域的特殊微环境，发现MG特异性生发中心结构与神经肌肉髓质胸腺上皮细胞的定位特征 | 样本量有限，主要聚焦胸腺瘤和胸腺增生样本，需要更大规模研究验证 | 阐明重症肌无力在胸腺中的病理机制 | 胸腺瘤和胸腺增生样本 | 空间转录组学 | 重症肌无力 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 207 | 2025-10-07 |
Regulatory mechanisms orchestrating cellular diversity of Cd36+ olfactory sensory neurons revealed by scRNA-seq and scATAC-seq analysis
2024-09-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114671
PMID:39215999
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析揭示Cd36+嗅觉感觉神经元细胞多样性的调控机制 | 首次发现Cd36+/-嗅觉感觉神经元的分化差异发生在未成熟阶段，并鉴定出Mef2a和Hdac9作为发育分岔的重要调控因子 | NA | 揭示嗅觉系统中细胞多样性的调控机制 | Cd36+和Cd36-嗅觉感觉神经元 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 208 | 2025-01-15 |
The role of GDF15 in attenuating noise-induced hidden hearing loss by alleviating oxidative stress
2024-09-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09912-2
PMID:39289208
|
研究论文 | 本研究探讨了GDF15在减轻噪声引起的隐性听力损失（HHL）中的作用，通过缓解氧化应激来保护耳蜗 | 首次揭示了GDF15在HHL中的保护作用，并提出了针对GDF15的治疗策略 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 研究GDF15在噪声引起的隐性听力损失中的作用 | 小鼠耳蜗 | 生物医学 | 听力损失 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 转录组数据 | HHL小鼠的耳蜗细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2025-10-07 |
Loss of p53 and SMAD4 induces adenosquamous subtype pancreatic cancer in the absence of an oncogenic KRAS mutation
2024-Sep-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101711
PMID:39232498
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型证明在KRAS野生型背景下，Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失可诱导自发性胰腺癌发生 | 首次建立KRAS野生型自发性胰腺癌小鼠模型，揭示p53和SMAD4/TGFBR2缺失可独立于致癌KRAS突变驱动胰腺癌发生 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究KRAS野生型胰腺癌的发病机制 | 基因工程小鼠模型（PPSSC和PPTTC模型） | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，基因工程小鼠模型 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 多个基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-01-02 |
Pan-cancer analysis of the immunological and oncogenic roles of ATAD2 with verification in papillary thyroid carcinoma
2024-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73274-2
PMID:39333272
|
研究论文 | 本文通过泛癌分析探讨了ATAD2在肿瘤进展和免疫相互作用中的角色，并在甲状腺乳头状癌中进行了验证 | 首次在泛癌范围内系统分析了ATAD2的表达、突变及其与免疫浸润的关系，并在甲状腺乳头状癌中验证了其致癌功能 | 研究主要依赖于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨ATAD2在肿瘤进展和免疫相互作用中的共同角色，并验证其在甲状腺乳头状癌中的致癌功能 | ATAD2基因及其在多种肿瘤中的表达和突变情况 | 肿瘤学 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞测序、MTT、伤口愈合、transwell、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、突变数据、单细胞测序数据 | 利用TCGA、GTEx、CPTAC、HPA和cBioPortal数据库中的泛癌数据 | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-12-25 |
Dendritic cell effector mechanisms and tumor immune microenvironment infiltration define TLR8 modulation and PD-1 blockade
2024-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.610636
PMID:39282367
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重染色技术，探讨了TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制 | 首次揭示了TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在人类中的作用机制，并展示了其在提高树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞密度方面的显著效果 | 研究样本量较小，仅涉及三名患者，且为预手术临床试验，结果的广泛适用性有待进一步验证 | 探讨TLR8激动剂与PD-1阻断剂联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三名头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-12-22 |
starTracer is an accelerated approach for precise marker gene identification in single-cell RNA-Seq analysis
2024-09-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06790-6
PMID:39266658
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为starTracer的新算法，用于加速单细胞RNA-seq数据中标记基因的识别 | starTracer算法通过减少冗余计算，显著提高了计算效率、特异性和准确性，相比Seurat算法速度提升了2~3个数量级 | NA | 提高单细胞RNA-seq数据中标记基因识别的效率、特异性和准确性 | 单细胞RNA-seq数据中的标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 三个独立数据集和一个模拟测试数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-12-22 |
Integrating large-scale single-cell RNA sequencing in central nervous system disease using self-supervised contrastive learning
2024-09-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06813-2
PMID:39251817
|
研究论文 | 本文介绍了一种自监督对比学习方法scCM，用于整合大规模中枢神经系统单细胞RNA测序数据 | 提出了scCM方法，通过比较基因表达的变化，将功能相关的细胞聚集在一起，同时将不相似的细胞分开，有效揭示了中枢神经系统细胞类型/亚型的异质性关系 | NA | 整合大规模中枢神经系统单细胞RNA测序数据，揭示细胞和分子机制 | 中枢神经系统细胞类型/亚型 | 单细胞RNA测序 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 自监督对比学习 | 基因表达数据 | 20个中枢神经系统数据集，涵盖4个物种和10种中枢神经系统疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-12-22 |
PHD2 safeguards modest mesendoderm development
2024-09-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06824-z
PMID:39244636
|
研究论文 | 本文研究了PHD2在调节HIF-1α水平和调控中胚层发育中的关键作用 | 首次揭示了PHD2在调控中胚层发育中的负向调节作用，并阐明了其通过HIF-1α调控Wnt/β-catenin通路的机制 | 研究主要集中在体外模型和早期胚胎阶段，缺乏对更晚期发育阶段的验证 | 探讨PHD2在中胚层发育中的作用及其与低氧和HIF-1α的相互作用 | PHD2、HIF-1α、中胚层发育、Wnt/β-catenin通路 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了小鼠胚胎干细胞（mESCs）、胚胎体和鼠胚 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-12-22 |
Deficient RPE mitochondrial energetics leads to subretinal fibrosis in age-related neovascular macular degeneration
2024-09-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06773-7
PMID:39223298
|
研究论文 | 研究揭示了视网膜色素上皮（RPE）线粒体能量代谢缺陷与年龄相关性新生血管性黄斑变性中亚视网膜纤维化的关系 | 首次揭示了VLDLR通过抑制TGFβ诱导的代谢重编程来抑制纤维化，并提出CPT1A作为治疗亚视网膜纤维化的潜在靶点 | NA | 探讨视网膜色素上皮代谢紊乱与亚视网膜纤维化的潜在机制 | 视网膜色素上皮细胞中的线粒体脂肪酸氧化相关基因 | NA | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Vldlr小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-12-19 |
A graph self-supervised residual learning framework for domain identification and data integration of spatial transcriptomics
2024-09-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06814-1
PMID:39266614
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络和边际差异差异理论的图自监督残差学习框架ResST，用于空间转录组数据的域识别和数据整合 | ResST通过整合基因表达、生物效应、空间位置和形态信息，捕捉细胞与其周围细胞之间的非线性关系，用于空间域识别，并基于MDD理论整合多个ST数据集以校正批次效应 | NA | 开发一种新的方法来准确识别空间转录组数据中的空间一致性域，并有效整合多样本数据 | 空间转录组数据中的基因表达模式和组织微环境 | 数字病理学 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 10个使用不同技术获取的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-12-19 |
SpatialCTD: A Large-Scale Tumor Microenvironment Spatial Transcriptomic Dataset to Evaluate Cell Type Deconvolution for Immuno-Oncology
2024-09, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0532
PMID:39117342
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研究论文 | 本文介绍了一个大规模的肿瘤微环境空间转录组数据集SpatialCTD，用于评估免疫肿瘤学中的细胞类型反卷积方法 | 提出了一个大规模的SpatialCTD数据集，涵盖了人类肿瘤微环境中的1.8百万个细胞和12,900个伪斑点，并提出了一种基于图神经网络的反卷积方法GNNDeconvolver | 现有的细胞类型反卷积基准数据集主要是基于模拟或规模有限，且主要涵盖小鼠数据，不适用于人类免疫肿瘤学 | 克服现有数据集的局限性，促进对人类免疫肿瘤学中细胞类型反卷积的全面研究 | 人类肿瘤微环境中的细胞类型反卷积 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 转录组数据 | 1.8百万个细胞和12,900个伪斑点 | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-12-13 |
Stem-like exhausted CD8 T cells in pleural effusions predict improved survival in non-small cell lung cancer (NSCLC) and mesothelioma
2024-Sep-30, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-284
PMID:39430319
|
研究论文 | 研究探讨了胸腔积液中干细胞样耗竭CD8 T细胞在非小细胞肺癌和间皮瘤患者中的预后意义 | 首次发现胸腔积液中干细胞样耗竭CD8 T细胞（Texstem）的频率与非小细胞肺癌和间皮瘤患者的更好生存结果相关 | 研究为回顾性分析，样本量相对较小，且仅限于特定类型的肺癌和间皮瘤患者 | 探讨干细胞样耗竭CD8 T细胞在非小细胞肺癌和间皮瘤患者中的预后价值 | 非小细胞肺癌和间皮瘤患者的胸腔积液中的CD8 T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术、质谱流式细胞术、单细胞多组学分析 | NA | 细胞 | 43例非小细胞肺癌患者和49例间皮瘤患者的胸腔积液样本，以及16例预处理胸腔积液样本和4例单细胞多组学分析样本 | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-12-13 |
Impaired Myofibroblast Proliferation is a Central Feature of Pathologic Post-Natal Alveolar Simplification
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.21.572766
PMID:38187712
|
研究论文 | 本文研究了早产儿支气管肺发育不良（BPD）中由于肺泡简化导致的气体交换受损，并探讨了肌成纤维细胞增殖受损在其中的核心作用 | 通过多重小鼠模型和单细胞RNA测序，揭示了肌成纤维细胞增殖受损在BPD病理中的关键作用，并发现抑制肌成纤维细胞增殖足以导致病理性肺泡简化 | 本文主要基于小鼠模型，研究结果的临床转化和应用仍需进一步验证 | 探讨BPD病理中肺泡简化的机制，并寻找潜在的治疗策略 | 早产儿支气管肺发育不良（BPD）中的肺泡简化及肌成纤维细胞增殖 | NA | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多重小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-12-08 |
Leveraging cell type-specificity for gene set analysis of single cell transcriptomics
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.615040
PMID:39386631
|
研究论文 | 本文描述了一种利用单细胞转录组数据中的细胞类型特异性信息来定制基因集的方法 | 提出了一种利用人类蛋白质图谱（HPA）单细胞类型图谱中的平均基因表达信息来计算细胞类型特异性基因和基因集权重的方法，以改进基因集测试的效力和可解释性 | NA | 改进单细胞转录组数据的基因集测试效力和可解释性 | 单细胞转录组数据中的基因集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 81种人类细胞类型 | NA | NA | NA | NA |