单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 678 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-10-08 |
Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology
2024-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000387
PMID:37002587
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在肝脏生物学中的应用，涵盖了肝脏稳态、发育、再生、慢性肝病和癌症等方面的关键生物学见解 | 本文介绍了肝脏细胞图谱的最新进展，包括细胞组成的全面特征、多样性和功能、空间结构如肝脏分区、细胞通信和邻近关系、细胞身份转换和与肝脏病理相关的细胞特异性改变，以及新的治疗靶点 | 本文讨论了当前研究中的突出挑战，并提出了先进的实验技术和计算方法来解决这些挑战 | 综述单细胞和空间转录组学技术在肝脏生物学中的应用，并讨论相关技术的进展和挑战 | 肝脏稳态、发育、再生、慢性肝病和癌症 | 基因组学 | 肝病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 202 | 2024-10-08 |
Deciphering cellular heterogeneity in Spodoptera frugiperda midgut cell line through single cell RNA sequencing
2024-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110898
PMID:39047877
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了秋粘虫中肠细胞系的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了秋粘虫中肠细胞系的细胞异质性，并鉴定了多种细胞类型及其特异性标记基因 | NA | 揭示秋粘虫中肠细胞系的细胞异质性，并研究呼吸和肠道膜杀虫剂靶标基因的表达 | 秋粘虫中肠细胞系SfMG-0617的细胞异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,794个细胞 |
| 203 | 2024-10-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights TNFAIP3 as an immune-related prognostic biomarker in neuroblastoma
2024-Sep, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01914-4
PMID:39028490
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研究论文 | 本文通过转录组表达谱分析，鉴定出TNFAIP3作为神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次将TNFAIP3鉴定为神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并验证了其在免疫治疗中的潜在作用 | 初步实验验证了TNFAIP3在TAMs中的生物学功能，但仍需进一步的临床试验验证其作为治疗靶点的有效性 | 鉴定神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并探讨其在免疫治疗中的潜在作用 | 神经母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其相关基因 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 17个临床神经母细胞瘤样本 |
| 204 | 2024-10-08 |
Analyses of combined Merkel cell carcinomas with neuroblastic components suggests that loss of T antigen expression in Merkel cell carcinoma may result in cell cycle arrest and neuroblastic transdifferentiation
2024-09, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6304
PMID:39049595
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研究论文 | 本文描述了两例伴有神经母细胞分化的Merkel细胞癌（MCC），并进行了全面的形态学、免疫组化、转录组学、遗传学和表观遗传学分析 | 首次报道了两例伴有神经母细胞分化的MCC，并提出了TA抗原表达缺失可能导致细胞周期停滞和神经母细胞转分化的假设 | 样本量较小，仅两例病例 | 探讨MCC中TA抗原表达缺失与神经母细胞转分化的关系 | 伴有神经母细胞分化的MCC | 数字病理学 | 皮肤癌 | 全外显子测序、空间转录组学、DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 两例老年男性患者的MCC样本 |
| 205 | 2024-10-08 |
Genetic structure analysis of yak breeds and their response to adaptive evolution
2024-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110933
PMID:39218165
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研究论文 | 研究了牦牛品种的遗传结构及其对适应性进化的响应 | 首次系统地分析了牦牛的细胞水平适应性特征，并结合scRNA-seq方法构建了牦牛肺组织和皮肤组织的转录图谱 | 研究主要集中在牦牛的遗传结构和适应性基因上，未涉及其他可能影响适应性的因素 | 探讨牦牛品种的遗传结构及其对高海拔环境的适应性进化 | 牦牛的遗传多样性和适应性相关基因 | 遗传学 | NA | WGRS, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及八个牦牛群体的基因数据和牦牛肺组织及皮肤组织的单细胞RNA测序数据 |
| 206 | 2024-10-08 |
Multi-omics analysis reveals a pericyte-associated gene expression signature for predicting prognosis and therapeutic responses in solid cancers
2024-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110942
PMID:39326641
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了与周细胞相关的基因表达特征，用于预测实体癌的预后和治疗反应 | 首次通过整合转录组和蛋白质组数据，识别出肿瘤来源周细胞中的51个差异表达基因，并构建了预测肝癌和肺癌预后及治疗反应的风险模型 | 研究主要集中在肝癌和肺癌，未涵盖其他类型的实体癌 | 探讨周细胞在肿瘤微环境中的作用，并开发预测实体癌预后和治疗反应的基因表达特征 | 肿瘤来源周细胞及其相关基因 | 数字病理学 | NA | 转录组分析、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 涉及TCGA数据库和GEO数据库中的多个样本 |
| 207 | 2024-10-07 |
Full-length nanopore sequencing of circular RNA landscape in peripheral blood cells following sequential BNT162b2 mRNA vaccination
2024-Sep-27, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148971
PMID:39343185
|
研究论文 | 本研究评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后外周血细胞中内源性circRNA的响应 | 通过纳米孔全长测序技术，识别了4217种在疫苗接种期间特异性表达的新circRNA，并发现这些circRNA富集在应激颗粒组装和SARS-CoV-2 RNA结合蛋白的结合基序中 | 样本量较小，仅包括五名无SARS-CoV-2感染或既往疫苗接种史的医护人员 | 研究BNT162b2 mRNA疫苗接种后外周血细胞中circRNA的表达变化 | circRNA在疫苗接种后的表达变化及其与应激颗粒组装和SARS-CoV-2 RNA结合蛋白的关系 | 数字病理学 | NA | 纳米孔全长测序 | NA | RNA | 15个样本，包括接种前、第一次和第二次接种后的外周血样本 |
| 208 | 2024-10-07 |
Protocol to study the immune profile of syngeneic mouse tumor models
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103139
PMID:38878286
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于研究同基因小鼠肿瘤模型免疫特征的实验方案 | 本文提供了一种系统的方法来表征肿瘤微环境中免疫细胞的特征 | NA | 研究肿瘤微环境中免疫细胞的特征 | 同基因小鼠肿瘤模型中的免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 209 | 2024-10-06 |
Single-cell analysis revealing the metabolic landscape of prostate cancer
2024-Sep-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja20243
PMID:38657119
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了前列腺癌的代谢景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术展示了前列腺癌中上皮细胞和基质细胞的代谢活性差异，并识别了神经内分泌细胞的高代谢率 | 研究主要集中在前列腺癌的代谢特征，未涉及其他癌症类型的比较 | 揭示前列腺癌的代谢重编程机制及其在治疗中的应用潜力 | 前列腺癌中的上皮细胞、基质细胞和神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 210 | 2024-10-06 |
Probing Dermal Immunity to Mycobacteria through a Controlled Human Infection Model
2024-Sep-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2400053
PMID:39283647
|
研究论文 | 研究通过受控的人类感染模型探讨皮肤对分枝杆菌的免疫反应 | 揭示了非免疫细胞在皮肤对分枝杆菌免疫反应中的潜在作用，并展示了人类挑战研究在增进对分枝杆菌感染理解方面的实用性 | 研究样本量较小，且未观察到治疗组之间的差异 | 通过受控的人类感染模型研究皮肤对分枝杆菌的免疫反应，以期为新的治疗方法提供启示 | 皮肤对分枝杆菌的免疫反应及不同细胞类型间的相互作用 | NA | NA | 流式细胞术、批量RNA测序（RNA-seq）、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 血液、皮肤活检 | 10名参与者 |
| 211 | 2024-10-05 |
Hypoxia induces ROS-resistant memory upon reoxygenation in vivo promoting metastasis in part via MUC1-C
2024-Sep-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51995-2
PMID:39341835
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研究论文 | 研究探讨了缺氧诱导的ROS抗性记忆在再氧合过程中的作用及其通过MUC1-C促进转移的机制 | 首次揭示了缺氧后细胞在再氧合过程中保留缺氧诱导基因表达的现象，并证明了MUC1-C在其中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证 | 探讨缺氧如何通过MUC1-C促进肿瘤转移 | 乳腺癌细胞及其在缺氧和再氧合条件下的基因表达和转移能力 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及动物模型和患者来源的异种移植模型 |
| 212 | 2024-10-05 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008
PMID:39255776
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研究论文 | 研究揭示了胶质母细胞瘤如何诱导颅骨骨髓中的中性粒细胞招募和分化为具有树突状特征的“混合”中性粒细胞，并探讨了这些细胞在肿瘤微环境中的作用 | 首次发现胶质母细胞瘤诱导颅骨骨髓中的中性粒细胞分化为具有树突状特征的“混合”中性粒细胞，并揭示了这些细胞在抑制肿瘤生长中的作用 | NA | 探讨肿瘤相关中性粒细胞在胶质母细胞瘤生物学中的作用 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关中性粒细胞、颅骨骨髓 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者和鼠类胶质母细胞瘤样本 |
| 213 | 2024-10-05 |
Immunobiology of primary sclerosing cholangitis
2024-Sep-02, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001080
PMID:39226402
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综述 | 本文综述了原发性硬化性胆管炎（PSC）的免疫生物学最新进展 | 重点介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在PSC研究中的应用 | NA | 全面概述PSC的免疫生物学机制 | PSC相关的免疫细胞类型及其在疾病中的作用 | NA | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of MYH11+ tumour-associated fibroblasts between left-sided and right-sided colorectal cancer
2024-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70102
PMID:39294858
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了左半结肠癌和右半结肠癌中MYH11+肿瘤相关成纤维细胞的异质性 | 首次全面注释了左半结肠癌和右半结肠癌的特征和差异，并发现了一种新的MYH11+癌症相关成纤维细胞亚群 | 样本量较小，仅包括12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 | 探讨左半结肠癌和右半结肠癌的异质性及其潜在机制 | 左半结肠癌和右半结肠癌患者的免疫和基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 |
| 215 | 2024-10-05 |
Identification of functional heterogeneity of immune cells and tubular-immune cellular interplay action in diabetic kidney disease
2024-Sep, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2023-0130
PMID:39360161
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研究论文 | 研究探讨了糖尿病肾病中免疫细胞的功能异质性和肾小管-免疫细胞相互作用 | 首次揭示了dapagliflozin治疗对M2巨噬细胞抗炎功能的代谢转变，并识别了新的分子特征和信号通路 | 研究主要基于数据库分析和免疫组化验证，缺乏体内实验验证 | 探讨糖尿病肾病中免疫细胞的异质性和治疗机制 | 糖尿病肾病中的免疫细胞和肾小管细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 58760个细胞 |
| 216 | 2024-10-04 |
Single-cell transcriptomes and chromatin accessibility of endothelial cells unravel transcription factors associated with dysregulated angiogenesis in systemic sclerosis
2024-Sep-30, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225415
PMID:38754983
|
研究论文 | 研究揭示了系统性硬化症中内皮细胞的单细胞转录组和染色质可及性，并识别了与失调血管生成相关的转录因子 | 首次整合单细胞RNA测序和单核转座酶可及染色质测序，揭示了系统性硬化症中内皮细胞的转录和染色质改变，并提出了ELK4、ERF和ETS1作为治疗血管并发症的新靶点 | NA | 揭示系统性硬化症中内皮细胞的转录组和表观基因组变化，以理解其机制 | 系统性硬化症中的内皮细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、单核转座酶可及染色质测序 | NA | 转录组、染色质可及性 | NA |
| 217 | 2024-10-04 |
Dynamic glycolytic reprogramming effects on dendritic cells in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Sep-30, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03192-8
PMID:39343933
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研究论文 | 研究胰腺导管腺癌中葡萄糖和乳酸水平对树突状细胞抗原呈递功能的影响 | 首次阐明葡萄糖和乳酸水平对胰腺导管腺癌中树突状细胞抗原呈递功能的影响及其机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的类器官，可能与人体实际情况存在差异 | 探讨葡萄糖和乳酸水平对胰腺导管腺癌中树突状细胞功能的影响 | 胰腺导管腺癌中的树突状细胞及其抗原呈递功能 | NA | 胰腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用患者来源的类器官和切除标本，以及KPC小鼠的细胞系 |
| 218 | 2024-10-02 |
The estrogen response in fibroblasts promotes ovarian metastases of gastric cancer
2024-Sep-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52615-9
PMID:39349474
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研究论文 | 研究揭示了雌激素在胃癌卵巢转移中的作用机制 | 首次发现卵巢成纤维细胞中的雌激素受体和midkine通过ER-MDK-LRP1信号轴促进胃癌的卵巢转移 | 样本量较小，仅涉及18名患者 | 探讨胃癌卵巢转移的分子机制 | 胃癌患者的卵巢转移样本 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 45个肿瘤样本，来自18名胃癌患者 |
| 219 | 2024-10-04 |
SPP1+ macrophages in HR+ breast cancer are associated with tumor-infiltrating lymphocytes
2024-Sep-30, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-024-00695-7
PMID:39349495
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研究论文 | 研究探讨了HR+乳腺癌中SPP1+巨噬细胞与肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）之间的关系 | 揭示了SPP1+巨噬细胞在TIL-high HR+乳腺癌中对T细胞的新影响 | 研究样本量较小，仅涉及31名乳腺癌患者 | 探索不同乳腺癌亚型中TIL水平的变化及其对预后的影响 | HR+乳腺癌中的SPP1+巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 31名乳腺癌患者 |
| 220 | 2024-10-04 |
Integrated analysis to identify biological features and molecular markers of poorly cohesive gastric carcinoma (PCC)
2024-09-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73062-y
PMID:39349535
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序和批量数据，揭示了低黏附性胃癌（PCC）的生物学特征和分子标记 | 首次识别出IGFBP7作为深层PCC成分的标记物，并揭示了PCC在深层DGC中的特定免疫抑制特征 | 研究主要基于数据库中的数据，缺乏临床样本的验证 | 揭示低黏附性胃癌（PCC）的分子异质性和生物学特征 | 低黏附性胃癌（PCC）及其在弥漫性胃癌（DGC）中的分布和特征 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自肿瘤免疫单细胞中心、公共基因表达综合数据库和癌症基因组图谱数据库的数据 |