单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 644 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-11-17 |
Deciphering gene expression patterns using large-scale transcriptomic data and its applications
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae590
PMID:39541191
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研究论文 | 本研究分析了大规模转录组数据，探索了基因表达模式及其在癌症等疾病中的应用 | 提出了基于偏度的度量方法来量化数据集间的分布变化，并改进了朴素贝叶斯方法以提高模拟性能 | NA | 揭示基因表达模式，识别信息基因，分类样本，并理解疾病 | 基因表达模式及其在癌症等疾病中的应用 | 基因组学 | 癌症 | RNA-seq | 朴素贝叶斯 | 转录组数据 | 11,252个bulk RNA-seq样本和4,884个单细胞RNA-seq样本 |
| 182 | 2024-09-22 |
Correction: Single-cell transcriptomics reveals writers of RNA modification-mediated immune microenvironment and cardiac resident Macro-MYL2 macrophages in heart failure
2024-Sep-20, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-024-04172-8
PMID:39304827
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-11-14 |
IKKα-STAT3-S727 axis: a novel mechanism in DOX-induced cardiomyopathy
2024-Sep-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05439-1
PMID:39287798
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研究论文 | 研究探讨了IKKα在DOX诱导的心肌病中的作用及其机制 | 发现了IKKα-STAT3-S727信号通路在DOX诱导的心肌病中的关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究IKKα如何调节巨噬细胞激活并导致DOX诱导的心肌病 | 巨噬细胞IKKα在小鼠模型中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用巨噬细胞特异性IKKα敲除小鼠进行研究 |
| 184 | 2024-11-13 |
Plasma proteometabolome in lung cancer: exploring biomarkers through bidirectional Mendelian randomization and colocalization analysis
2024-09-19, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae110
PMID:39011643
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研究论文 | 研究利用孟德尔随机化方法探索肺癌相关的血浆蛋白质组和代谢组生物标志物 | 首次通过双向孟德尔随机化和共定位分析识别出与肺癌相关的血浆蛋白质和代谢物的新关联 | NA | 开发非侵入性诊断生物标志物以改善肺癌管理 | 血浆蛋白质组和代谢组 | 生物标志物 | 肺癌 | 孟德尔随机化 | NA | 蛋白质组学数据、代谢组学数据 | NA |
| 185 | 2024-11-13 |
ADAMTS12 promotes fibrosis by restructuring extracellular matrix to enable activation of injury-responsive fibroblasts
2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170246
PMID:39286973
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研究论文 | 研究揭示了ADAMTS12在纤维化过程中的作用，通过重构细胞外基质促进损伤响应性成纤维细胞的激活 | 首次发现ADAMTS12在纤维化中的关键作用，并阐明了其通过重构细胞外基质和切割HMCN1来激活特定成纤维细胞亚群的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证其结果 | 探讨ADAMTS12在纤维化中的作用及其分子机制 | ADAMTS12在心脏和肾脏纤维化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 186 | 2024-11-12 |
Integrative approach using network pharmacology, bioinformatics, and experimental methods to explore the mechanism of cantharidin in treating colorectal cancer
2024-09, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-024-03041-7
PMID:38507104
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研究论文 | 研究利用网络药理学、生物信息学和实验方法探讨斑蝥素治疗结直肠癌的机制 | 首次综合利用网络药理学、生物信息学和实验方法系统研究斑蝥素治疗结直肠癌的机制 | 研究主要集中在体外实验，缺乏体内实验验证；样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨斑蝥素治疗结直肠癌的生物活性、影响及其抗癌机制 | 斑蝥素及其在结直肠癌治疗中的作用 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 基因表达分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 197个斑蝥素相关靶基因和480个与疾病发展相关的关键基因 |
| 187 | 2024-11-09 |
Utilizing epigenetic regulators to improve HSC-based lentiviral gene therapy
2024-09-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024013047
PMID:38916861
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研究论文 | 本文探讨了利用表观遗传调节剂优化培养条件，以提高造血干细胞（HSC）为基础的慢病毒基因治疗效果 | 本文首次探索了使用组蛋白去乙酰化酶抑制剂和溴域抑制剂来增强HSC的体外扩增和基因转导效率 | NA | 优化HSC的体外扩增条件，以提高基于HSC的基因治疗效果 | 造血干细胞（HSC）及其早期祖细胞 | 基因治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 188 | 2024-11-09 |
scDTL: enhancing single-cell RNA-seq imputation through deep transfer learning with bulk cell information
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae555
PMID:39504481
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度迁移学习的单细胞RNA测序数据插补方法scDTL，通过利用批量细胞信息来增强插补效果 | scDTL利用批量RNA测序数据训练的去噪自编码器作为初始插补模型，并通过领域适应框架将批量插补模型的知识迁移到单细胞RNA测序学习任务中，同时采用1D U-Net去噪模型进行并行操作，捕捉单细胞RNA测序数据的粗粒度和细粒度特征，并通过交叉通道注意力机制融合特征 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高下游分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 去噪自编码器、1D U-Net | RNA测序数据 | NA |
| 189 | 2024-11-09 |
PAC1 constrains type 2 inflammation through promotion of CGRP signaling in ILC2s
2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180109
PMID:39287985
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研究论文 | 研究探讨了PAC1通过促进CGRP信号传导在ILC2中调节2型炎症的作用 | 首次揭示了PAC1在ILC2中通过细胞内在机制促进CGRP信号传导，从而调节2型炎症 | 研究主要基于小鼠模型和人类循环ILC2，未来需进一步验证在其他物种和疾病模型中的适用性 | 探讨PAC1在ILC2中调节2型炎症的机制 | PAC1在ILC2中的作用及其对CGRP信号传导的影响 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类循环ILC2样本 |
| 190 | 2024-11-09 |
Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma
2024-Sep-10, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175310
PMID:39255035
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研究论文 | 研究探讨了H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 | 通过全基因组CRISPR/Cas9筛选识别出H2AFY作为PD-1阻断抗体nivolumab的耐药基因，并揭示了其在单细胞RNA-Seq数据中的富集及其与患者生存的关联 | NA | 阐明H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 | H2AFY在神经母细胞瘤中的作用及其对PD-1阻断疗法的耐药性 | NA | 神经母细胞瘤 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-Seq、多组学分析 | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 191 | 2024-11-09 |
Single-cell sequencing analysis confirms the association of ANRIL with the increased smooth muscle cell proliferation and migration gene signatures in pulmonary artery hypertension in silico
2024-Sep, Advances in medical sciences
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.advms.2024.04.002
PMID:38631609
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 | 首次通过单细胞测序技术分析了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性，并证实了ANRIL表达与平滑肌细胞增殖和迁移基因特征的关联 | 研究样本量较小，仅包括三名肺动脉高压患者和三名健康对照 | 探讨肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 | 肺动脉高压患者的肺动脉平滑肌细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名肺动脉高压患者和三名健康对照的肺动脉样本 |
| 192 | 2024-11-08 |
Endosialin-positive CAFs promote hepatocellular carcinoma progression by suppressing CD8+ T cell infiltration
2024-Sep-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009111
PMID:39260826
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研究论文 | 研究了Endosialin阳性CAFs通过抑制CD8+ T细胞浸润促进肝细胞癌进展的机制 | 首次揭示了Endosialin通过抑制STAT1磷酸化和核转位，减少CXCL9/10表达和分泌，从而抑制CD8+ T细胞浸润，促进肝细胞癌进展 | NA | 探讨Endosialin阳性CAFs在肝细胞癌进展中的作用及其机制 | Endosialin阳性CAFs、CD8+ T细胞、CXCL9/10 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、流式细胞术、RNA测序 | NA | 细胞 | ENKO小鼠、Hepa1-6细胞、肝细胞癌患者肿瘤组织 |
| 193 | 2024-11-07 |
Multi-level multi-view network based on structural contrastive learning for scRNA-seq data clustering
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae562
PMID:39494609
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研究论文 | 提出了一种基于结构一致性对比学习的scRNA-seq数据聚类方法 | 引入了多层次多视角网络和对比学习，以提高scRNA-seq数据聚类的准确性 | NA | 解决scRNA-seq数据高维度和复杂性带来的聚类挑战 | scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 多层次多视角网络 | scRNA-seq数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 |
| 194 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows that Circulating Monocytes Enriched in IFN Signaling Are Associated with Nontuberculous Mycobacteria Pulmonary Disease in Cystic Fibrosis
2024-Sep-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202312-2279LE
PMID:38889330
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-11-07 |
Primate-specific BTN3A2 protects against SARS-CoV-2 infection by interacting with and reducing ACE2
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105281
PMID:39142074
|
研究论文 | 研究探讨了灵长类特异性蛋白BTN3A2通过与ACE2相互作用，减少ACE2表达，从而保护宿主细胞免受SARS-CoV-2感染的机制 | 首次揭示了BTN3A2在抑制SARS-CoV-2感染中的关键作用，并提出了通过模拟BTN3A2的单克隆抗体来开发COVID-19治疗新途径的可能性 | NA | 揭示SARS-CoV-2与宿主细胞相互作用的分子机制，为COVID-19的预防和治疗提供新思路 | BTN3A2在COVID-19中的作用及其与ACE2的相互作用 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、基因编辑、免疫沉淀、流式细胞术、生物层干涉测量、竞争性ELISA | NA | RNA | 基因编辑细胞系、转基因小鼠、COVID-19患者病理组织样本 |
| 196 | 2024-11-07 |
Intra-patient spatial comparison of non-metastatic and metastatic lymph nodes reveals the reduction of CD169+ macrophages by metastatic breast cancers
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105271
PMID:39173531
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研究论文 | 研究乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响，特别是CD169+巨噬细胞的减少 | 首次系统比较了非转移性和转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞的数量，并发现转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞显著减少 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者 | 探讨乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响机制 | 非转移性和转移性淋巴结中的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、成像质谱流式细胞术、组织学分析 | NA | 组织切片 | 6名乳腺癌患者的淋巴结样本，以及58名患者的474个组织切片 |
| 197 | 2024-11-06 |
Single-cell genomics details the maturation block in BCP-ALL and identifies therapeutic vulnerabilities in DUX4-r cases
2024-09-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021705
PMID:38968149
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研究论文 | 本文利用多模态单细胞测序技术，详细描述了B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）的成熟阻滞现象，并识别了DUX4重排（DUX4-r）亚型的治疗脆弱性 | 首次通过多模态单细胞测序技术，详细描绘了不同BCP-ALL亚型的转录组、表观遗传和免疫表型特征，并发现了DUX4-r亚型的多谱系启动和PI3K/AKT信号通路的激活 | 研究样本仅限于23例儿童BCP-ALL病例，可能无法完全代表所有BCP-ALL患者的情况 | 揭示BCP-ALL的生物学特性和治疗脆弱性，为开发新的治疗策略提供依据 | B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）及其DUX4重排（DUX4-r）亚型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 转录组、表观遗传和免疫表型数据 | 23例儿童BCP-ALL病例 |
| 198 | 2024-11-06 |
NK cells with adhesion defects and reduced cytotoxic functions are associated with a poor prognosis in multiple myeloma
2024-09-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023529
PMID:38875515
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研究论文 | 研究分析了多发性骨髓瘤患者中NK细胞的粘附缺陷和细胞毒性功能降低与预后不良的关系 | 通过单细胞RNA测序分析了多发性骨髓瘤患者和健康供体中NK细胞的转录组变化，发现MM患者中CD56dim NK细胞亚群减少，而晚期NK细胞亚群增加，这些细胞具有低CD16和CD226表达和较差的细胞毒性功能 | 研究样本量较小，且仅限于特定患者群体，可能影响结果的普适性 | 探讨多发性骨髓瘤患者中NK细胞的功能变化及其与预后的关系 | 多发性骨髓瘤患者和健康供体中的NK细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10名多发性骨髓瘤患者和10名年龄/性别匹配的健康供体 |
| 199 | 2024-11-06 |
Upregulated expression of ubiquitin ligase TRIM21 promotes PKM2 nuclear translocation and astrocyte activation in experimental autoimmune encephalomyelitis
2024-Sep-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98181
PMID:39264698
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研究论文 | 研究揭示了泛素连接酶TRIM21通过促进PKM2核转位和星形胶质细胞活化在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用 | 首次揭示了TRIM21通过泛素化介导的机制调控PKM2核转位，从而影响星形胶质细胞活化和神经炎症 | NA | 探讨代谢重编程在星形胶质细胞活化中的作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中的星形胶质细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠及小鼠原代星形胶质细胞 |
| 200 | 2024-11-06 |
HA-1-targeted T-cell receptor T-cell therapy for recurrent leukemia after hematopoietic stem cell transplantation
2024-09-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024105
PMID:38683966
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研究论文 | 本文报道了一项针对复发性白血病的HA-1靶向T细胞受体T细胞疗法的I期临床试验 | 开发了一种新的TCR-T产品，靶向HA-1抗原，用于治疗或巩固治疗复发性白血病和骨髓增生性肿瘤 | 研究未设计评估疗效，且样本量较小 | 评估HA-1 TCR-T在造血干细胞移植后治疗复发性白血病的可行性和安全性 | 复发性白血病和骨髓增生性肿瘤患者 | NA | 白血病 | T细胞受体（TCR）基因转移 | NA | RNA测序 | 9名造血干细胞移植后复发性白血病患者 |