单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-10-21 |
Resilience of A Learned Motor Behavior After Chronic Disruption of Inhibitory Circuits
2024-Aug-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.17.541057
PMID:37292888
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研究论文 | 研究了斑胸草雀在抑制性神经回路慢性破坏后学习到的鸣叫行为的恢复机制 | 发现成年斑胸草雀在抑制性神经元长期沉默后，能够恢复其鸣叫行为，尽管神经活动发生了永久性改变 | 研究主要集中在斑胸草雀的鸣叫行为恢复机制，未涉及其他物种或行为 | 探讨抑制性神经回路慢性破坏后学习行为的恢复机制 | 斑胸草雀的鸣叫行为及其神经回路 | 神经科学 | NA | 细胞特异性病毒载体、单细胞RNA测序、慢性及急性电生理记录 | NA | RNA序列、电生理数据 | 成年斑胸草雀 |
| 162 | 2024-10-19 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2024-Aug-14, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
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综述 | 本文探讨了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的新兴作用 | 利用单细胞转录组学技术，研究人员能够解析肺部复杂的细胞生态系统，识别出在肺动脉高压发病机制中起关键作用的细胞类型，如内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 需要提高单细胞转录组学的分辨率以捕捉更精细的细胞变化，克服处理人类组织样本的物流障碍，并整合多种组学方法以全面理解肺动脉高压的分子基础 | 深入探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用，揭示其对理解这一复杂疾病的贡献 | 肺动脉高压的细胞生态系统及其在疾病发病机制中的作用 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 163 | 2024-10-17 |
Retinal perivascular macrophages regulate immune cell infiltration during neuroinflammation in mouse models of ocular disease
2024-Aug-29, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180904
PMID:39207852
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研究论文 | 研究了视网膜周围血管巨噬细胞在小鼠眼部疾病模型中神经炎症期间调节免疫细胞浸润的作用 | 首次揭示了视网膜周围血管巨噬细胞在调节血视网膜屏障（BRB）免疫细胞迁移中的功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨视网膜周围血管巨噬细胞在眼部炎症性疾病中的作用 | 视网膜周围血管巨噬细胞及其在神经炎症中的功能 | NA | 糖尿病视网膜病变，葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了Pf4Cre小鼠进行实验 |
| 164 | 2024-10-17 |
Spatiotemporal transcriptomic mapping of regenerative inflammation in skeletal muscle reveals a dynamic multilayered tissue architecture
2024-Aug-27, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173858
PMID:39190487
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研究论文 | 研究重建了急性损伤和早期肌营养不良肌肉中分离的骨髓细胞的动态轨迹，揭示了再生炎症的动态多层组织结构 | 首次揭示了巨噬细胞在再生组织中空间适应和功能多样化的机制，并发现了支持再生过程的多层炎症区域 | 研究主要集中在急性损伤和早期肌营养不良肌肉，未涵盖其他类型的肌肉损伤或再生情况 | 探讨巨噬细胞在肌肉再生中的作用及其在组织结构中的动态分布 | 急性损伤和早期肌营养不良肌肉中的骨髓细胞 | 数字病理学 | 肌营养不良 | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 急性损伤和早期肌营养不良肌肉中的骨髓细胞样本 |
| 165 | 2024-10-16 |
Visualizing scRNA-Seq Data at Population Scale with GloScope
2024-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542786
PMID:37398321
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研究论文 | 提出了一种名为GloScope的框架，用于在群体规模上可视化和分析scRNA-Seq数据 | 开发了一种新的生物信息学方法GloScope，用于处理样本间变异，并支持样本级别的可视化和质量控制评估 | NA | 开发一种新的方法来处理和可视化群体规模的scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据及其在不同样本中的变异 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12到超过300个样本 |
| 166 | 2024-10-13 |
MerTK-dependent efferocytosis by monocytic-MDSCs mediates resolution of ischemia/reperfusion injury after lung transplant
2024-Aug-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179876
PMID:39172530
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研究论文 | 研究了Mer酪氨酸激酶受体在单核细胞来源的髓系抑制细胞（M-MDSCs）介导的吞噬作用中对肺移植后缺血再灌注损伤（IRI）的缓解作用 | 首次探讨了MerTK在M-MDSCs介导的吞噬作用中对肺移植后IRI的缓解作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的单细胞RNA测序，缺乏大规模临床试验验证 | 探讨MerTK在M-MDSCs介导的吞噬作用中对肺移植后IRI的缓解作用 | 肺移植后缺血再灌注损伤（IRI）和慢性肺移植物功能障碍（CLAD） | NA | 肺移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括肺移植患者和小鼠模型的样本 |
| 167 | 2024-10-13 |
Bank1 modulates the differentiation and molecular profile of key B cell populations in autoimmunity
2024-Aug-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179417
PMID:39163122
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研究论文 | 本研究探讨了B细胞适配蛋白BANK1在年龄相关B细胞（ABCs）出现中的作用，特别是在两种系统性红斑狼疮（SLE）小鼠模型中的作用 | 首次揭示了BANK1在ABCs发育中的关键作用，以及其对早期B细胞向ABCs分化的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 定义B细胞适配蛋白BANK1在年龄相关B细胞（ABCs）出现中的作用 | B细胞适配蛋白BANK1在年龄相关B细胞（ABCs）中的作用 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 2种SLE小鼠模型（TLR7.tg6和咪喹莫特诱导的小鼠）与Bank1-/-小鼠杂交 |
| 168 | 2024-10-12 |
Exploring the potential molecular intersection of stroke and major depression disorder
2024-08-06, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150079
PMID:38759300
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研究论文 | 研究探讨了中风和重度抑郁症在分子层面的潜在关联机制 | 发现了Mlkl和Nlrp3两个关键基因在中风和重度抑郁症共病机制中的重要作用，并预测了六种可能的治疗药物 | 研究主要基于动物实验和生物信息学分析，缺乏人体临床数据支持 | 探索中风和重度抑郁症在基因层面的共病机制 | 中风和重度抑郁症的小鼠模型 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 转录组分析、单细胞测序、RT-PCR、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 涉及多个GEO数据库中的小鼠样本数据集（GSE104036, GSE131712, GSE81672, GSE146845） |
| 169 | 2024-10-12 |
Bone marrow cells contribute to seven different endothelial cell populations in the heart
2024-08, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01065-x
PMID:38963562
|
研究论文 | 研究探讨了骨髓细胞在心脏中形成七种不同内皮细胞群体的贡献及其在心肌缺血后的作用 | 首次揭示了骨髓来源的内皮细胞在心脏中的异质性及其对重复缺血的反应 | 研究仅限于动物模型，尚未在人体中验证 | 探讨骨髓细胞在心脏血管再生中的机制，为心肌缺血的治疗提供新策略 | 骨髓来源的内皮细胞及其在心脏功能和冠状循环中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GFP雌性大鼠的骨髓细胞移植到照射后的雄性大鼠中，共17天的重复缺血模型 |
| 170 | 2024-10-12 |
Altered lipid metabolism promoting cardiac fibrosis is mediated by CD34+ cell-derived FABP4+ fibroblasts
2024-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01309-9
PMID:39198543
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研究论文 | 研究探讨了CD34+细胞在脂质代谢异常促进心脏纤维化中的作用机制 | 首次揭示了CD34+细胞在心脏纤维化中的作用，特别是通过FABP4+成纤维细胞介导的脂质代谢异常 | 研究主要基于小鼠和人类心脏单细胞转录组数据，缺乏体内实验验证 | 探索CD34细胞在脂质代谢异常导致心脏纤维化中的分化机制 | CD34+细胞及其在心脏纤维化中的作用 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 50,870个小鼠心脏单细胞和76,851个人类心脏单细胞 |
| 171 | 2024-10-11 |
Distinct melanocyte subpopulations defined by stochastic expression of proliferation or maturation programs enable a rapid and sustainable pigmentation response
2024-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002776
PMID:39163475
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序研究了人类和斑马鱼皮肤中黑色素细胞的分化与增殖程序的分离现象 | 首次揭示了黑色素细胞中分化与增殖程序的随机表达机制，并通过系统方法构建了基因调控网络 | 研究主要集中在体外培养的黑色素细胞，对体内环境的适用性有待验证 | 探讨紫外线辐射下皮肤色素沉着反应的分子机制 | 人类和斑马鱼皮肤中的黑色素细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 基因调控网络 | RNA+ATAC | 人类和斑马鱼皮肤中的黑色素细胞 |
| 172 | 2024-10-10 |
Engineering Toxoplasma gondii secretion systems for intracellular delivery of multiple large therapeutic proteins to neurons
2024-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01750-6
PMID:39075233
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研究论文 | 本文研究了利用弓形虫的分泌系统将多种大型治疗性蛋白质递送到神经元中的方法 | 通过工程化弓形虫的内源性分泌系统，实现了将多种大型治疗性蛋白质递送到神经元中的创新方法 | 系统目前存在局限性，需要进一步改进以扩大应用范围 | 探索利用弓形虫分泌系统递送治疗性蛋白质到神经元中的潜力和局限性 | 弓形虫的分泌系统、大型治疗性蛋白质、神经元 | NA | NA | scRNA-seq、荧光报告基因 | NA | 图像、文本 | 小鼠 |
| 173 | 2024-10-09 |
A Bioinformatics-Based Study on Methylation Alterations of the FBLN1 Gene in Hippocampal Tissue of Alzheimer's Disease Model DKO and DTG Mice
2024-Aug-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169036
PMID:39201719
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研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病模型DKO和DTG小鼠海马组织中FBLN1基因的甲基化变化 | 首次通过单细胞测序和实验方法验证了FBLN1基因在阿尔茨海默病中的异常甲基化状态及其与疾病的相关性 | 样本量较小，仅限于DKO和DTG小鼠模型 | 研究阿尔茨海默病中海马组织FBLN1基因的甲基化变化及其与疾病的关系 | DKO和DTG小鼠海马组织中的FBLN1基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序、RT-PCR、Western blotting、Reduced Representation Bisulfite Sequencing | NA | 基因组DNA、mRNA、蛋白质 | DKO、DTG和CBAC57小鼠 |
| 174 | 2024-10-09 |
Simple aneuploidy evades p53 surveillance and promotes niche factor-independent growth in human intestinal organoids
2024-Aug-01, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E24-04-0166
PMID:38985518
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研究论文 | 本文研究了简单非整倍体在人类肠道类器官中逃避p53监控并促进非微环境因子依赖性生长的机制 | 发现简单非整倍体细胞能够逃避p53监控，并可能促进癌症起始结肠干细胞的非微环境因子依赖性生长 | NA | 探讨非整倍体在癌症早期演化中的作用 | 人类结肠类器官中的非整倍体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 非整倍体诱导的人类结肠类器官 |
| 175 | 2024-10-08 |
Integrated spatial and multimodal single-cell transcriptomics reveal patient-dependent cell heterogeneity in splenic marginal zone lymphoma
2024-08, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6296
PMID:38828498
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞分析技术，深入研究了脾边缘区淋巴瘤（SMZL）的生物学特征 | 首次在转录组和蛋白质水平上全面描述了SMZL的生物学标志，并揭示了患者间和患者内的异质性 | NA | 深入描述脾边缘区淋巴瘤（SMZL）的生物学特征 | 脾边缘区淋巴瘤（SMZL）的细胞异质性 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、细胞索引转录组和表位测序、V(D)J单细胞RNA测序、空间转录组学、成像质谱流式技术 | NA | 转录组数据、蛋白质数据 | 配对的血液/脾脏样本 |
| 176 | 2024-10-07 |
Integrating Multi-omics to Identify Age-Related Macular Degeneration Subtypes and Biomarkers
2024-Aug-07, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-024-02249-9
PMID:39107525
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研究论文 | 本文结合转录组测序和单细胞测序数据，探讨线粒体相关基因在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 提出了深度子空间非负矩阵分解算法，对基因表达谱进行多层非线性变换，并利用患者年龄作为先验信息改变数据分布 | NA | 识别年龄相关性黄斑变性的亚型和生物标志物 | 年龄相关性黄斑变性 | 生物信息学 | 眼科疾病 | 转录组测序 (RNA-seq), 单细胞测序 (scRNA-seq) | 深度子空间非负矩阵分解 (DS-NMF) | 基因表达数据 | NA |
| 177 | 2024-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies a prognostic T-cell signature in colorectal cancer
2024-08-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70422-6
PMID:39215032
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出结直肠癌中的预后T细胞特征 | 本研究创新性地利用单细胞测序数据，通过加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析，开发了一种基于六个T细胞相关基因的预后风险模型TRGS，相比现有免疫相关预后模型，具有更高的预测效能 | NA | 识别结直肠癌中的预后T细胞特征，优化患者对免疫治疗和化疗的反应 | 结直肠癌患者的T细胞特征及其预后影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析 | 基因表达数据 | NA |
| 178 | 2024-10-06 |
Quantification of escape from X chromosome inactivation with single-cell omics data reveals heterogeneity across cell types and tissues
2024-Aug-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100625
PMID:39084228
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研究论文 | 开发了一种名为scLinaX的方法，用于量化单细胞组学数据中的X染色体失活逃逸现象，揭示了不同细胞类型和组织间的异质性 | 首次开发了scLinaX方法，用于直接量化单细胞RNA测序数据中的失活X染色体相对基因表达，并扩展到10x多组学数据集 | 需要进一步验证和扩展到更多类型的细胞和组织中 | 研究X染色体失活逃逸现象在不同细胞类型和组织中的差异 | X染色体失活逃逸现象及其在不同细胞类型和组织中的表现 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个器官的单细胞RNA测序数据集 |
| 179 | 2024-10-05 |
Spatial Transcriptomics Analysis: Maternal Obesity Impairs Myogenic Cell Migration and Differentiation during Embryonic Limb Development
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179488
PMID:39273445
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研究论文 | 研究母体肥胖对胚胎肢体发育过程中肌细胞迁移和分化的影响 | 首次探讨了母体肥胖对肌细胞迁移相关生物过程的抑制作用 | 仅使用了C57BL/6小鼠模型，样本量较小 | 探讨母体肥胖对胚胎肢体发育过程中肌细胞迁移和分化的影响 | C57BL/6小鼠胚胎的肌细胞迁移和分化 | 数字病理学 | 肥胖症 | GeoMx DSP平台 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6小鼠胚胎，E13.5期，样本量未明确提及 |
| 180 | 2024-10-05 |
Role of Neutrophils in the Development of Steatotic Liver Disease
2024-Aug, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0044-1789207
PMID:39117322
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综述 | 本文综述了中性粒细胞在脂肪肝疾病发展中的生物学作用及其作为治疗靶点的潜力 | 本文介绍了中性粒细胞在无菌性炎症中的作用，这是脂肪肝疾病发病机制的关键组成部分 | 尽管技术进步如单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞亚群的存在，但这些不同亚群如何不同地参与脂肪肝疾病的发展仍不清楚 | 探讨中性粒细胞在脂肪肝疾病发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 中性粒细胞及其在脂肪肝疾病中的作用 | NA | 脂肪肝疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |