单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 531 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals dynamics of gene expression for 2D elongation and 3D growth in Physcomitrium patens
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114524
PMID:39046878
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小立碗藓从2D伸长到3D生长过程中基因表达的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下系统分析苔藓植物2D向3D生长转变的细胞异质性和分子特征 | 研究仅针对小立碗藓，结果在其他植物中的普适性有待验证 | 探究植物从2D向3D生长转变的分子机制和细胞异质性 | 小立碗藓(Physcomitrium patens)的所有主要营养组织 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 超过17,000个单细胞，涵盖2D丝状体(叶绿丝和茎丝)和3D结构(芽和配子体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2025-10-07 |
Transcriptional noise, gene activation, and roles of SAGA and Mediator Tail measured using nucleotide recoding single-cell RNA-seq
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114593
PMID:39102335
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研究论文 | 开发了一种时间分辨的新生单细胞RNA测序方法，用于测量酿酒酵母中基因特异性转录噪声和活跃基因比例 | 首次使用时间分辨的新生单细胞RNA测序方法量化转录噪声和基因激活状态，揭示了SAGA和Mediator Tail在调控基因激活中的新功能 | 研究仅限于酿酒酵母模型，未在其他生物系统中验证 | 测量基因特异性转录噪声和活跃基因比例，研究转录调控机制 | 酿酒酵母基因转录过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-10-07 |
Lipid-associated macrophages for osimertinib resistance and leptomeningeal metastases in NSCLC
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114613
PMID:39116206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现脂质相关巨噬细胞RNASE1_M与奥希替尼耐药和肺癌软脑膜转移相关 | 首次在EGFR突变非小细胞肺癌患者脑脊液中鉴定出与奥希替尼耐药和软脑膜转移相关的特定巨噬细胞亚型RNASE1_M | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现 | 探索非小细胞肺癌奥希替尼耐药后软脑膜转移的免疫机制 | EGFR突变非小细胞肺癌伴中枢神经系统转移患者的脑脊液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
A human fetal cerebellar map of the late second trimester reveals developmental molecular characteristics and abnormality in trisomy 21
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114586
PMID:39137113
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制人类胎儿小脑在妊娠晚期第二季度的发育图谱，揭示正常发育特征及21三体综合征异常 | 首次系统描绘人类胎儿小脑在妊娠18-25周的关键发育期细胞图谱，发现UBC祖细胞分布规律及胶质细胞发育轨迹，并揭示21三体综合征的分子异常 | 研究样本仅涵盖特定发育阶段（GW18-25），样本量有限，且未验证功能机制 | 解析人类胎儿小脑在妊娠晚期第二季度的正常与异常发育分子特征 | 人类胎儿小脑组织样本（包括正常和21三体综合征样本） | 单细胞基因组学 | 21三体综合征（唐氏综合征） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 妊娠18-25周人类胎儿小脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
Human liver sinusoidal endothelial cells support the development of functional human pluripotent stem cell-derived Kupffer cells
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114629
PMID:39146183
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研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞成功培育出功能性的库普弗细胞，并证实肝窦内皮细胞对其发育的关键支持作用 | 首次证明人类多能干细胞来源的卵黄囊样造血祖细胞可在肝窦内皮细胞支持下发育为功能性库普弗细胞 | 研究主要基于小鼠模型，在人类体内的实际应用效果仍需进一步验证 | 研究人类库普弗细胞的发育机制 | 人类多能干细胞、肝窦内皮细胞、卵黄囊样造血祖细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NSG小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400023
PMID:38828688
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研究论文 | 本研究揭示TRIM24通过与Ras突变协同作用，通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs驱动胶质瘤进展的分子机制 | 首次发现TRIM24与Ras突变协同驱动胶质瘤进展的新机制，阐明PHAX/U3 snoRNA/DNA-PKcs信号轴在表观遗传重编程中的作用 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质瘤进展的表观遗传调控机制 | 胶质瘤细胞、人类神经干细胞、临床Ep-GBM标本 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床Ep-GBM标本及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
Interferon signaling and ferroptosis in tumor immunology and therapy
2024-Aug-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00668-w
PMID:39127858
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研究论文 | 本研究阐明了干扰素信号通路通过调控铁死亡影响CD8+T细胞耗竭的机制及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次揭示干扰素信号通路与铁死亡的相互作用机制，并发现沉默HSPA6或DNAJB1可增强PD-1疗法疗效 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究干扰素信号通路对肿瘤细胞铁死亡的影响及其与CD8+T细胞耗竭的关联机制 | 肿瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、体外实验、体内验证 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞活性数据 | TCGA数据库数据及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2025-01-04 |
Single-cell multi-omic and spatial profiling of human kidneys implicates the fibrotic microenvironment in kidney disease progression
2024-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01802-x
PMID:39048792
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学和空间分析技术，研究了人类肾脏在健康和疾病状态下的空间和分子特征，特别是纤维化微环境在肾脏疾病进展中的作用 | 结合单细胞、单核、空间RNA表达和单核开放染色质数据，首次全面绘制了人类肾脏的空间分子图谱，并揭示了纤维化微环境在疾病分类和预后中的临床价值 | 研究样本数量有限（81个），且主要关注糖尿病和高血压相关的肾脏疾病，可能无法完全代表其他类型的肾脏疾病 | 揭示肾脏健康和疾病状态下的空间和分子特征，特别是纤维化微环境的作用 | 人类肾脏样本（健康、糖尿病和高血压相关疾病） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞多组学、空间RNA表达（Visium、CosMx）、单核开放染色质分析 | NA | 单细胞RNA表达数据、空间RNA表达数据、单核开放染色质数据 | 81个样本（包括健康、糖尿病和高血压相关疾病的肾脏样本） | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2025-01-01 |
Functional cure and long-term survival in multiple myeloma: how to challenge the previously impossible
2024-08-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283058
PMID:38356448
|
综述 | 本文探讨了多发性骨髓瘤（MM）的功能性治愈和长期生存的可能性 | 提出了功能性治愈的概念，并讨论了通过新型诊断和治疗手段实现长期疾病控制的可能性 | 尽管功能性治愈的概念提出，但实际治愈仍难以实现，且长期疗效仍需进一步验证 | 探讨多发性骨髓瘤的功能性治愈和长期生存策略 | 多发性骨髓瘤患者 | NA | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-12-29 |
Single-Cell RNA-Seq Debiased Clustering via Batch Effect Disentanglement
2024-08, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2023.3260003
PMID:37030864
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SCDC的单细胞RNA-seq去偏聚类方法，通过分离生物和非生物信息来解决批次效应问题 | SCDC方法在数据分区过程中分离生物和非生物信息，从而在存在批次效应的情况下实现去偏聚类 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA-seq数据中批次效应对聚类结果的影响 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-12-22 |
Single-cell analysis of chromatin and expression reveals age- and sex-associated alterations in the human heart
2024-08-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06582-y
PMID:39187646
|
研究论文 | 研究通过单细胞核组合索引（sci）ATAC-Seq和RNA-Seq分析，揭示了人类心脏中与年龄和性别相关的染色质和表达变化 | 首次大规模分析了人类心脏中单细胞水平的年龄和性别相关变化，并结合了多个已发表的数据集进行综合分析 | 研究仅限于健康成年心脏样本，未涵盖疾病状态下的心脏变化 | 探讨人类心脏中不同细胞类型在年龄和性别影响下的分子程序变化 | 人类心脏样本中的单细胞核染色质和基因表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞核组合索引（sci）ATAC-Seq和RNA-Seq | 预测模型 | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 9名捐赠者的心脏样本，并结合了5个已发表的单核RNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-12-22 |
SLIVER: Unveiling large scale gene regulatory networks of single-cell transcriptomic data through causal structure learning and modules aggregation
2024-08, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108690
PMID:38879931
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研究论文 | 本文提出了一种名为SLIVER的算法，通过因果结构学习和模块聚合来揭示单细胞转录组数据的大规模基因调控网络 | SLIVER算法通过引入因子节点来整合基因之间的调控关系，将基因调控网络简化为两个低维矩阵的乘积，从而降低了计算复杂度 | NA | 从因果角度推断基因调控网络 | 单细胞转录组数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 结构因果模型 | 基因表达数据 | 12个真实单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-12-21 |
Divergent venom effectors correlate with ecological niche in neuropteran predators
2024-08-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06666-9
PMID:39134630
|
研究论文 | 研究了神经翅目捕食者的毒液效应器与其生态位之间的关系 | 首次通过空间转录组学、蛋白质组学、形态学分析和生物测定研究了不同生态位中的毒液系统，并发现了E. nostras毒液的独特分子特征 | 对不同科的毒液部署的生态和进化了解不足 | 探讨神经翅目捕食者的毒液在不同生态位中的进化和生态作用 | 蚁狮E. nostras和草蛉C. carnea的毒液系统 | NA | NA | 空间转录组学、蛋白质组学、形态学分析、生物测定 | NA | 分子数据、形态数据 | 蚁狮E. nostras和草蛉C. carnea | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-12-21 |
Epithelium/imcDC2 axis facilitates the resistance of neoadjuvant anti-PD-1 in human NSCLC
2024-Aug-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007854
PMID:39134346
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研究论文 | 本文研究了非小细胞肺癌患者在接受新辅助抗PD-1治疗时，上皮细胞/imcDC2轴如何促进治疗抵抗的机制 | 揭示了galectin-9表达的肿瘤细胞通过galectin-9/TIM-3介导的抑制作用，维持了新辅助抗PD-1治疗在非小细胞肺癌中的初级抵抗 | 本文主要基于实验数据和动物模型，尚未在更大规模的人体临床试验中验证 | 探讨新辅助抗PD-1治疗在非小细胞肺癌中的抵抗机制 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本和肺组织，以及肺癌细胞系和小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 多组学分析，包括质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、批量RNA测序和多色流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 一批接受新辅助抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤样本和配对的肺组织，以及新鲜的组织样本和肺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-12-19 |
A single-cell transcriptomic landscape of cadmium-hindered brain development in mice
2024-08-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06685-6
PMID:39147853
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研究论文 | 本文研究了镉暴露对小鼠胚胎大脑发育的影响，通过单细胞RNA测序揭示了不同细胞亚群对镉暴露的反应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了镉暴露对小鼠胚胎大脑发育的多层次影响，包括细胞亚群的变化和神经行为的改变 | 研究仅限于小鼠模型，且仅探讨了低剂量镉暴露的影响，可能无法完全反映人类情况 | 探讨镉暴露对小鼠胚胎大脑发育的影响及其机制 | 小鼠胚胎大脑中的不同细胞亚群及其对镉暴露的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 怀孕小鼠及其胚胎大脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-12-19 |
High-mobility group box 1 fragment ameliorates chronic pancreatitis induced by caerulein in mice
2024-08, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-024-02112-z
PMID:38727823
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研究论文 | 研究探讨了高迁移率族蛋白1片段（HMGB1）在治疗小鼠胆囊素诱导的慢性胰腺炎（CP）中的潜在疗效 | 首次研究了HMGB1片段通过系统给药在CP小鼠模型中的治疗效果，并验证了其通过动员间充质干细胞（MSCs）减轻胰腺纤维化的潜力 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在临床试验中验证其疗效 | 探讨HMGB1片段在治疗慢性胰腺炎中的潜在疗效 | 胆囊素诱导的慢性胰腺炎小鼠模型 | NA | 慢性胰腺炎 | 免疫组织化学、实时PCR、血清分析、单细胞转录组分析 | NA | 组织、血清、基因表达 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-12-14 |
Aging- and alcohol-associated spatial transcriptomic signature in mouse acute pancreatitis reveals heterogeneity of inflammation and potential pathogenic factors
2024-08, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-024-02460-6
PMID:38940937
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研究论文 | 本研究通过建立衰老酒精性急性胰腺炎小鼠模型，应用Visium空间转录组学技术，揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎空间转录组特征 | 首次通过空间转录组学技术揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的炎症异质性，并识别出潜在的致病因素 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 阐明衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的空间转录组特征及其潜在机制 | 衰老和年轻小鼠的急性胰腺炎模型 | NA | 胰腺炎 | Visium空间转录组学 | NA | 转录组 | 衰老小鼠（18个月）和年轻小鼠（3个月）各一组 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-12-13 |
Spatial transcriptomic analysis of tumour-immune cell interactions in melanoma arising from congenital melanocytic nevus
2024-Aug, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19881
PMID:38420727
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研究论文 | 研究先天性黑色素细胞痣（CMN）来源的黑色素瘤中肿瘤浸润免疫细胞（TIICs）与肿瘤细胞的相互作用 | 首次探讨了CMN来源的黑色素瘤中TIICs与肿瘤细胞的相互作用，并使用空间转录组学技术分析了不同侵袭深度下的基因表达变化 | 样本量未明确提及，且未讨论研究结果的临床应用潜力 | 确定TIICs和肿瘤细胞在侵袭和转移过程中的肿瘤内免疫景观 | 先天性黑色素细胞痣（CMN）来源的黑色素瘤组织样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-12-11 |
Graph-Regularized Non-Negative Matrix Factorization for Single-Cell Clustering in scRNA-Seq Data
2024-08, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3400050
PMID:38787664
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研究论文 | 本文提出了一种基于图正则化的非负矩阵分解方法（Sc-GNNMF），用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 创新点在于采用图正则化的非负矩阵分解算法（GNNMF），通过拉普拉斯核和p-最近邻图估计细胞间和基因间的稀疏相似性，并使用加权p-最近已知邻居优化单细胞RNA测序数据 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性，揭示细胞异质性的潜在机制 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图正则化非负矩阵分解（GNNMF） | 基因表达数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-12-02 |
Integrative single-cell and bulk transcriptome analyses identify a distinct pro-tumor macrophage signature that has a major prognostic impact on glioblastomas
2024-Aug-13, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01454-5
PMID:39136841
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研究论文 | 本研究整合单细胞和批量转录组数据，识别出与胶质母细胞瘤预后相关的独特促肿瘤巨噬细胞特征 | 本研究首次识别出一种新的促肿瘤巨噬细胞亚群，标记为S100A9，可能通过与内皮细胞相互作用促进肿瘤进展 | NA | 解析胶质母细胞瘤的分子景观及异质性巨噬细胞群在胶质母细胞瘤进展中的作用 | 胶质母细胞瘤及其相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |