单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202408-202408] [清除筛选条件]
当前共找到 534 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2025-10-06
Airway epithelial cell response to RSV is mostly impaired in goblet and multiciliated cells in asthma
2024-08-19, Thorax IF:9.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了哮喘患者和健康捐赠者支气管上皮细胞对呼吸道合胞病毒(RSV)感染的转录反应 首次在单细胞分辨率下揭示了哮喘患者杯状细胞和多纤毛细胞对RSV感染的应答受损 样本量较小(哮喘患者n=8,健康捐赠者n=8),需要更大规模研究验证 探究哮喘患者支气管上皮细胞对RSV感染的分子应答机制 原代支气管上皮细胞(pBECs) 单细胞转录组学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16例(8例哮喘患者,8例健康捐赠者) NA 单细胞RNA-seq NA NA
142 2025-10-06
scGPT: toward building a foundation model for single-cell multi-omics using generative AI
2024-Aug, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 开发基于生成式预训练变换器的单细胞多组学基础模型scGPT 首次将生成式预训练模型应用于单细胞生物学领域,构建了包含3300多万个细胞的跨组学基础模型 NA 探索基础模型在细胞生物学和遗传研究中的适用性 单细胞测序数据中的基因和细胞 机器学习 NA 单细胞测序 生成式预训练变换器 单细胞多组学数据 超过3300万个细胞 NA 单细胞多组学 NA NA
143 2025-10-06
Origin, structure, and composition of the spider major ampullate silk fiber revealed by genomics, proteomics, and single-cell and spatial transcriptomics
2024-08-16, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过多组学方法揭示蜘蛛大壶腹丝纤维的起源、结构和组成 首次识别出18种构成蜘蛛最强丝纤维的蛋白质,并通过单细胞和空间转录组学发现丝腺分泌上皮存在六种细胞类型,这些细胞类型局限于三个不同的腺体区域 NA 理解蜘蛛丝纤维的生物加工过程和组成成分 蜘蛛大壶腹丝腺及其产生的丝纤维 生物信息学 NA 基因组学,蛋白质组学,单细胞RNA测序,空间转录组学,图像分析 NA 基因组数据,蛋白质数据,单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织切片图像 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
144 2025-10-06
Nanos2 marks precursors of somatic lineages and is required for germline formation in the sea anemone Nematostella vectensis
2024-08-16, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过转基因报告基因和单细胞转录组学技术,在海葵中鉴定表达生殖系相关标记的细胞群体,并证明Nanos2对生殖系形成不可或缺 首次在刺胞动物中证明Nanos2在体细胞和生殖系干细胞中的保守作用,揭示了刺胞动物干细胞系统的共同进化起源 研究仅聚焦于海葵这一特定物种,需要更多刺胞动物物种验证结果的普适性 表征海葵中保守的干细胞标记基因,探索刺胞动物干细胞系统的进化起源 海葵Nematostella vectensis的干细胞群体 发育生物学 NA 转基因报告基因,单细胞转录组学,基因敲除 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
145 2025-10-06
Microglia-specific IL-10 gene delivery inhibits neuroinflammation and neurodegeneration in a mouse model of Parkinson's disease
2024-08-21, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究开发了一种小胶质细胞特异性IL-10基因递送方法,在帕金森病小鼠模型中抑制神经炎症和神经退行性变 首次实现小胶质细胞特异性IL-10基因递送,通过单细胞转录组学揭示IL-10诱导独特的小胶质细胞状态 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 开发针对帕金森病神经炎症的靶向基因治疗方法 帕金森病小鼠模型中的多巴胺能神经元和小胶质细胞 神经科学 帕金森病 单细胞转录组学,病毒基因递送 NA 基因表达数据,细胞表型数据 多个常用帕金森病小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
146 2025-10-06
Natural killer cells promote neutrophil extracellular traps and restrain macular degeneration in mice
2024-08-14, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究揭示自然杀伤细胞通过促进中性粒细胞胞外诱捕网形成抑制小鼠黄斑变性的机制 首次发现NK细胞在脉络膜新生血管病变中的关键保护作用,并阐明其通过CCR5介导的招募机制和NKG2D依赖的NETs形成通路 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;年龄相关NK细胞功能变化机制需进一步探索 探究自然杀伤细胞在新生血管性年龄相关性黄斑变性发病机制中的作用 nvAMD患者样本、小鼠模型、人源NK细胞 免疫学 年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序,Olink蛋白质组学分析,基因敲除研究 NA 基因表达数据,蛋白质组数据,病理图像 nvAMD患者和小鼠模型的未明确样本量 NA 单细胞RNA测序,蛋白质组学 NA NA
147 2025-10-06
Spatial transcriptomic characterization of pathologic niches in IPF
2024-08-09, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术表征特发性肺纤维化中的病理生态位 首次通过空间转录组学结合单细胞RNA测序图谱,识别出IPF中三种具有独特细胞组成和定位的疾病相关生态位 NA 解析特发性肺纤维化的空间病理生态位特征 IPF患者和对照组的肺组织 空间转录组学 特发性肺纤维化 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 空间基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
148 2025-10-06
3D chromatin architecture, BRD4, and Mediator have distinct roles in regulating genome-wide transcriptional bursting and gene network
2024-08-09, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过数学建模分析单细胞RNA测序数据,揭示了3D染色质结构、BRD4和Mediator在调控全基因组转录爆发和基因网络中的不同作用 首次系统比较了不同调控因子在转录爆发动力学中的特异性作用,发现MED26主要调控爆发频率,MYC调控爆发大小,而cohesin和BRD4可同时调控两者 研究基于数学建模推断,需要进一步实验验证具体分子机制 解析转录爆发的分子调控机制 基因转录爆发动力学 基因组学 NA 单细胞RNA测序,数学建模 数学建模 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
149 2025-10-06
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals mitochondrial calcium signaling as a modulator of endothelial-to-mesenchymal transition
2024-08-09, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析发现线粒体钙信号是内皮-间质转化的调节因子 首次识别线粒体钙摄取作为EndMT的关键驱动因素,并证明抑制MCU可阻止EndMT 研究主要基于体外模型,临床样本有限 探索内皮-间质转化的分子机制及其在心血管疾病中的作用 内皮细胞、三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育、外周动脉疾病模型 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育样本、外周动脉疾病模型、严重肢体缺血患者组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
150 2025-10-06
Distinct tumor-TAM interactions in IDH-stratified glioma microenvironments unveiled by single-cell and spatial transcriptomics
2024-08-16, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学揭示IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的独特相互作用 首次在IDH定义的胶质瘤类别中系统比较肿瘤-TAM相互作用,发现IDH-WT胶质母细胞瘤中两个间充质表型TAM亚群与患者预后不良相关,并鉴定SLAMF9受体作为潜在治疗靶点 研究主要基于转录组学分析,需要进一步的功能实验验证发现的相互作用机制 阐明IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用特征 胶质瘤患者肿瘤样本中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, RT-qPCR, 基因调控网络推断 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
151 2025-10-06
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-08, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E 仅使用四种性能最佳的差异表达分析方法进行集成学习,相比现有方法scDEA使用的12种方法更为精简高效 方法性能评估主要基于有限的六个真实数据集和一个模拟数据集 开发更准确稳定的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 集成学习 基因表达数据 六个真实数据集和一个模拟数据集 NA single-cell RNA-seq NA NA
152 2025-10-06
Vaccines combining slow delivery and follicle targeting of antigens increase germinal center B cell clonal diversity and clonal expansion
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究分析了结合磷酸丝氨酸标记抗原与铝佐剂及皂苷纳米颗粒佐剂的联合佐剂策略对生发中心B细胞反应的影响 首次证明两种作用机制互补的佐剂(缓释抗原递送和改变淋巴结摄取的佐剂)可协同增强生发中心B细胞克隆多样性和克隆扩增 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 探索联合佐剂策略增强体液免疫应答的机制 小鼠模型中的生发中心B细胞和HIV Env三聚体抗原 免疫学 HIV感染 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 NA 单细胞测序数据, 抗原分布数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 NA NA
153 2025-10-06
Enhanced microglial dynamics and a paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contribute to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2024-08-05, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨无症状阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块微环境特征及其对认知韧性的保护机制 发现无症状AD患者斑块微环境中存在增强的小胶质细胞动态活动和减少的tau蛋白播种活性 基于死后脑组织研究,无法观察动态过程;样本量有限 揭示阿尔茨海默病病理条件下认知韧性的神经保护机制 无症状阿尔茨海默病患者和典型AD患者的死后脑组织 神经科学 阿尔茨海默病 空间转录组学 NA 脑组织样本,转录组数据 一组无症状AD受试者队列 NA 空间转录组学 NA NA
154 2025-10-06
CilioGenics: an integrated method and database for predicting novel ciliary genes
2024-Aug-12, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 开发了一种名为CilioGenics的整合方法,用于预测新型纤毛基因并建立了相关数据库 首次整合单细胞RNA测序、蛋白质相互作用、比较基因组学、转录因子网络分析和文本挖掘等多种方法预测纤毛基因 方法中约30%的基因仍为候选基因,需要进一步实验验证 预测人类纤毛基因以促进纤毛病诊断 人类基因组的全部基因 生物信息学 纤毛病 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用分析,比较基因组学,转录因子网络分析,文本挖掘 整合预测模型 基因组数据,转录组数据,蛋白质相互作用数据,文献数据 全人类基因组基因 NA 单细胞RNA-seq NA NA
155 2025-10-06
Morphine-responsive neurons that regulate mechanical antinociception
2024-08-30, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过单细胞转录组学技术识别并操控了小鼠延髓头端腹内侧区中对吗啡有反应的神经元,揭示了调控机械性伤害感受的特定神经回路 首次识别出延髓头端腹内侧区中特定兴奋性投射神经元集群,这些神经元通过脑源性神经营养因子/原肌球蛋白受体激酶B依赖机制调控吗啡诱导的机械性镇痛作用 研究仅限于小鼠模型中的机械性伤害感受,未涉及其他类型疼痛或物种 阐明阿片类药物镇痛的神经解剖学基础 小鼠延髓头端腹内侧区神经元 神经科学 疼痛管理 单细胞转录组学,神经元操控技术 NA 基因表达数据,行为学数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
156 2025-10-06
Type I Interferonopathy among Non-Elderly Female Patients with Post-Acute Sequelae of COVID-19
2024-08-28, Viruses
研究论文 本研究通过分析非老年女性COVID-19急性后遗症患者的单细胞转录组数据,揭示了与I型干扰素信号异常激活相关的CD14STAT2单核细胞亚群特征 首次在非老年女性PASC患者中发现特征性CD14STAT2单核细胞亚群,并证实其与STAT2/IRF9转录因子活性和I型干扰素信号通路异常激活相关 研究基于公共数据库的回顾性数据分析,样本来源和数量有限,需要进一步实验验证 探索非老年女性COVID-19急性后遗症患者的免疫机制 非老年女性PASC患者、急性SARS-CoV-2感染患者及健康对照的外周血样本 生物信息学 COVID-19后遗症 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 来自GEO数据库的非老年女性患者和对照样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
157 2025-10-06
A single-cell atlas of the miracidium larva of Schistosoma mansoni reveals cell types, developmental pathways, and tissue architecture
2024-Aug-27, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了曼氏血吸虫毛蚴幼虫阶段的全细胞图谱,揭示了其细胞类型组成、发育路径和组织结构 首次在单细胞水平上解析了血吸虫毛蚴幼虫的细胞组成,发现神经元是最多样化的体细胞类型,并识别出两个具有性别偏倚转录特征的主要干细胞群 研究仅聚焦于毛蚴这一特定发育阶段,未涵盖血吸虫完整生命周期 在细胞和分子水平上理解曼氏血吸虫毛蚴幼虫的生物学特性 曼氏血吸虫毛蚴幼虫 单细胞生物学 血吸虫病 单细胞RNA测序,原位杂交 轨迹分析 单细胞转录组数据 约365个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
158 2025-10-06
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-associated platelet bias are evolutionarily conserved
2024-08-23, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究通过高通量单细胞RNA测序揭示了人类造血干细胞的功能和转录谱系偏好,并发现血小板偏向性HSC随年龄增长而增加 首次在人类造血干细胞中证实了功能性和转录性谱系偏好的存在,并揭示了血小板偏向性HSC在衰老过程中的进化保守性 研究基于异种移植模型,可能无法完全模拟人体内环境;样本来源有限 探究人类造血干细胞的异质性和年龄相关的血小板偏向性 成年人类骨髓造血干细胞 单细胞组学 血液系统疾病 单细胞RNA测序,分子条形码技术,异种移植 NA 单细胞转录组数据 年轻和年老骨髓来源的人类造血干细胞 NA 单细胞RNA-seq NA 高通量单细胞RNA测序
159 2025-10-06
Multimodal analysis unveils tumor microenvironment heterogeneity linked to immune activity and evasion
2024-Aug-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过多模态分析方法揭示肿瘤微环境异质性及其与免疫活性和免疫逃逸的关联 开发了名为iHet的肿瘤微环境异质性特征,该特征在不同癌症中具有保守性,并能预测免疫治疗效果 研究主要基于转录组学数据,可能未涵盖肿瘤微环境的所有分子层面 解析肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗的影响 肺癌肿瘤微环境 生物信息学 肺癌 系统生物学方法,单细胞转录组测序,空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
160 2025-10-06
High-dimensional single-cell analysis of human natural killer cell heterogeneity
2024-Aug, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术解析人类自然杀伤细胞的异质性 首次在健康人血液中鉴定出三个主要NK细胞亚群及其六个亚组,揭示了NK细胞的两种不同发育起源 样本来源仅限于健康个体和部分肿瘤组织,未涵盖其他疾病状态 系统解析人类自然杀伤细胞的异质性和功能特征 人类自然杀伤细胞 单细胞生物学 肿瘤免疫 单细胞RNA测序, CITE-seq NA 单细胞转录组数据, 表面蛋白数据 健康人血液、肺组织、扁桃体、上皮内淋巴细胞及22种肿瘤类型样本 NA 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 NA NA
回到顶部