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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-07 |
Stellate cells are in utero markers of pancreatic disease in cystic fibrosis
2024-Aug-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00871-2
PMID:39112965
|
研究论文 | 本研究利用绵羊囊性纤维化模型探究胰腺疾病在妊娠期的演变过程 | 首次在囊性纤维化动物模型中通过单细胞RNA测序鉴定出星状细胞在妊娠期显著过度富集 | 研究仅限于动物模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究囊性纤维化胰腺疾病的发病机制和演变过程 | 囊性纤维化绵羊模型的胎儿胰腺组织 | 单细胞组学 | 囊性纤维化 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 妊娠期6个时间点的胎儿胰腺样本(从50天到足月) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-10-07 |
Unravelling CD4+ T cell diversity and tissue adaptation of Tregs in abdominal aortic aneurysms through single-cell sequencing
2024-08, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13796
PMID:38637948
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的多样性及调节性T细胞的组织适应性 | 首次发现腹主动脉瘤中调节性T细胞的组织特异性表型是在主动脉中获得的,并识别了其前体细胞 | NA | 探究腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的异质性和调节性T细胞的发育机制 | 从腹主动脉瘤主动脉和脾脏分离的CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-07 |
Oral Cannabidiol Treatment Is Associated with an Anti-Inflammatory Gene Expression Signature in Myeloid Cells of People Living with HIV
2024-Aug, Cannabis and cannabinoid research
IF:3.1Q2
DOI:10.1089/can.2023.0139
PMID:38252549
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析HIV感染者接受口服大麻二酚治疗后髓系细胞的基因表达变化 | 首次在HIV感染者中通过单细胞RNA测序揭示大麻二酚治疗与髓系细胞抗炎基因表达特征的关联 | 样本量较小(仅3名HIV感染者),观察时间较短(27-60天) | 探究大麻二酚治疗对HIV感染者外周血单个核细胞基因表达的影响 | HIV感染者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 3名HIV感染者,约41,000个外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-07 |
Stem-like T cells in cancer and autoimmunity
2024-08, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13356
PMID:38804499
|
综述 | 本文综述了干细胞样T细胞在癌症和自身免疫疾病中的双重作用及其调控机制 | 系统阐述了干细胞样T细胞在肿瘤免疫和自身免疫中的相反作用,并探讨了微生物组和代谢对其调控的影响 | NA | 探讨干细胞样T细胞在癌症和自身免疫疾病中的功能及其临床意义 | 干细胞样T细胞 | 免疫学 | 癌症, 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-07 |
Exploit Spatially Resolved Transcriptomic Data to Infer Cellular Features from Pathology Imaging Data
2024-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606654
PMID:39149252
|
研究论文 | 提出一种利用空间转录组数据标注病理图像的新方法,开发STpath模型预测细胞类型比例和肿瘤微环境分类 | 首次利用配对的空间转录组数据解决病理图像标注稀缺问题,开发了创新的迁移学习神经网络模型STpath | 训练数据有限,模型性能可能受细胞类型比例变化和图像分辨率影响 | 从病理成像数据中推断细胞特征,解决病理图像标注稀缺问题 | 乳腺癌数据集中的病理图像和空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,深度学习 | 迁移学习神经网络,STpath | 病理图像,空间转录组数据 | 三个不同的乳腺癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-02-04 |
Reconstruction of single-cell lineage trajectories and identification of diversity in fates during the epithelial-to-mesenchymal transition
2024-Aug-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406842121
PMID:39093947
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和最优传输分析,重建了MCF10A细胞系中TGF-β诱导的上皮-间质转化(EMT)过程中不同细胞命运的历史轨迹,并识别了EMT过程中的多样性 | 使用最优传输分析重建单细胞谱系轨迹,并精确识别了EMT过程中基因表达上调的时间点,揭示了潜在的细胞周期调控靶点 | 研究依赖于TGF-β诱导的MCF10A细胞系,可能无法完全反映其他细胞类型或条件下的EMT过程 | 探索上皮-间质转化(EMT)过程中细胞命运的多样性和机制 | MCF10A细胞系 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,最优传输分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | MCF10A细胞系中的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2025-10-07 |
Discovery of a monoclonal, high-affinity CD8+ T-cell clone following natural hepatitis C virus infection
2024-08, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12791
PMID:38855806
|
研究论文 | 在自然HCV感染后发现了一个具有高亲和力的单克隆CD8+ T细胞克隆 | 发现了在急性HCV感染后持续存在的单克隆CD8+ T细胞群体,其TCR-pMHC相互作用的解离时间异常长 | 研究样本量有限,仅从两名个体中分析HCV特异性T细胞群体 | 研究HCV感染后CD8+ T细胞的特异性免疫应答 | HCV感染个体的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞测序,HLA多聚体染色 | NA | 测序数据,流式细胞术数据 | 两名HCV感染个体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-07 |
Delving deeper into the mechanisms fundamental to HIV-associated immunopathology using single-cell sequencing techniques: A scoping review of current literature
2024-Aug-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35856
PMID:39224354
|
综述 | 通过系统回顾14项HIV相关单细胞RNA测序研究,深入探讨HIV感染免疫病理机制 | 首次系统整合单细胞RNA测序技术在HIV免疫病理机制研究中的应用现状 | 仅纳入14项研究,样本量有限,且为范围综述而非系统性荟萃分析 | 阐明HIV相关免疫病理机制并探索疾病进展和治疗的潜在生物标志物 | HIV感染者的免疫细胞(CD4 T细胞、CD8 T细胞、B细胞、NK细胞、髓样树突状细胞) | 单细胞组学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14项已发表研究 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-10-07 |
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae032
PMID:39872864
|
研究论文 | 通过比较分析人类iPSC-NK细胞分化与NK细胞发育的转录景观,识别诱导分化过程中的关键缺失因子 | 首次对胎儿肝脏NK细胞和iPSC-NK细胞进行关键分化阶段的比较性单细胞转录组分析,并创建具有NK细胞和巨噬细胞双重特征的STAT5A-iPSC新细胞系 | 未明确说明样本数量和实验重复次数,STAT5A-iPSC新细胞系的功能验证需要进一步临床前研究 | 解析iPSC-NK细胞分化机制以改进治疗性iNK细胞的生产和工程化 | 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-10-07 |
TRIM44, a Novel Prognostic Marker, Supports the Survival of Proteasome-Resistant Multiple Myeloma Cells
2024-08-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171431
PMID:39273003
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM44在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗抵抗机制 | 首次系统阐明TRIM44通过连接泛素-蛋白酶体系统和自噬途径,支持蛋白酶体抑制剂耐药性骨髓瘤细胞生存的新机制 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要进一步的前瞻性研究验证TRIM44的临床价值 | 探讨TRIM44在多发性骨髓瘤预后和治疗抵抗中的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞系 | 癌症生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 858例多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-07 |
3D-Bioprinted Co-Cultures of Glioblastoma Multiforme and Mesenchymal Stromal Cells Indicate a Role for Perivascular Niche Cells in Shaping Glioma Chemokine Microenvironment
2024-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171404
PMID:39272976
|
研究论文 | 本研究利用3D生物打印技术构建胶质母细胞瘤与间充质基质细胞共培养模型,探索血管周围微环境细胞在塑造胶质瘤趋化因子微环境中的作用 | 首次结合公共测序数据分析和3D生物打印技术,揭示血管周围微环境细胞对胶质母细胞瘤趋化因子谱多样性的关键调控作用 | 研究仅使用两种胶质母细胞瘤细胞系,未涵盖GBM的完整异质性;体外模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究胶质母细胞瘤微环境中不同细胞类型对趋化因子分泌的贡献 | 胶质母细胞瘤细胞系(U-251和DK-MG)和间充质基质细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 3D生物打印,单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 3D共培养模型 | RNA测序数据,分泌组数据 | 两种胶质母细胞瘤细胞系和间充质基质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-10-07 |
Genome Restructuring around Innate Immune Genes in Monocytes in Alcohol-associated Hepatitis
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.07.607014
PMID:39211112
|
研究论文 | 本研究通过Hi-C技术分析酒精相关性肝炎患者单核细胞的基因组三维结构变化 | 首次在酒精相关性肝炎患者单核细胞中发现基因组三维结构的显著改变,特别是在天然免疫基因簇区域 | 样本量较小(仅4例患者和4例对照),需要更大规模研究验证 | 探究酒精相关性肝炎中单核细胞基因组三维结构变化及其对炎症基因表达的调控 | 酒精相关性肝炎患者和健康对照者的单核细胞 | 基因组学 | 酒精相关性肝炎 | Hi-C, scRNA-seq | NA | 基因组三维构象数据, 单细胞转录组数据 | 4例AH患者和4例健康对照 | NA | 高通量染色质构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-07 |
circRNAs as Epigenetic Regulators of Integrity in Blood-Brain Barrier Architecture: Mechanisms and Therapeutic Strategies in Multiple Sclerosis
2024-08-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13161316
PMID:39195206
|
综述 | 本文综述了环状RNA通过调节血脑屏障完整性在多发性硬化症中的作用机制及治疗策略 | 首次系统阐述circRNAs通过表观遗传调控血脑屏障完整性的机制,为多发性硬化症治疗提供新靶点 | 目前仍处于机制探索阶段,缺乏临床验证数据 | 探讨circRNAs在维持血脑屏障完整性中的作用及其在多发性硬化症治疗中的应用潜力 | 血脑屏障内皮细胞、紧密连接和粘附连接蛋白、环状RNA | 神经科学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-07 |
Bioinformatics and machine learning approaches reveal key genes and underlying molecular mechanisms of atherosclerosis: A review
2024-Aug-02, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038744
PMID:39093811
|
综述 | 通过生物信息学和机器学习方法探索动脉粥样硬化的关键基因及分子机制 | 整合多种生物信息学工具和机器学习算法识别动脉粥样硬化的关键基因,并首次分析其与铁死亡基因的关联 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 揭示动脉粥样硬化的遗传调控机制和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化相关基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因表达分析 | LASSO回归,随机森林 | 基因表达数据 | GSE20129和GSE90074数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-07 |
DCX knockout ferret reveals a neurogenic mechanism in cortical development
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114508
PMID:39018244
|
研究论文 | 本研究通过建立DCX基因敲除雪貂模型,揭示了无脑回畸形皮质发育的神经发生机制 | 首次建立DCX基因敲除雪貂模型,准确再现人类无脑回畸形表型,并利用单核RNA测序和空间转录组学绘制了无脑回皮质图谱 | 未明确说明样本规模和模型验证的局限性 | 探究无脑回畸形的细胞和分子机制,以及DCX在皮质发育中的作用 | DCX基因敲除雪貂模型及其脑组织 | 神经科学 | 无脑回畸形 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 基因敲除 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 136 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals dynamics of gene expression for 2D elongation and 3D growth in Physcomitrium patens
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114524
PMID:39046878
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小立碗藓从2D伸长到3D生长过程中基因表达的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下系统分析苔藓植物2D向3D生长转变的细胞异质性和分子特征 | 研究仅针对小立碗藓,结果在其他植物中的普适性有待验证 | 探究植物从2D向3D生长转变的分子机制和细胞异质性 | 小立碗藓(Physcomitrium patens)的所有主要营养组织 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 超过17,000个单细胞,涵盖2D丝状体(叶绿丝和茎丝)和3D结构(芽和配子体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-10-07 |
Transcriptional noise, gene activation, and roles of SAGA and Mediator Tail measured using nucleotide recoding single-cell RNA-seq
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114593
PMID:39102335
|
研究论文 | 开发了一种时间分辨的新生单细胞RNA测序方法,用于测量酿酒酵母中基因特异性转录噪声和活跃基因比例 | 首次使用时间分辨的新生单细胞RNA测序方法量化转录噪声和基因激活状态,揭示了SAGA和Mediator Tail在调控基因激活中的新功能 | 研究仅限于酿酒酵母模型,未在其他生物系统中验证 | 测量基因特异性转录噪声和活跃基因比例,研究转录调控机制 | 酿酒酵母基因转录过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-10-07 |
Lipid-associated macrophages for osimertinib resistance and leptomeningeal metastases in NSCLC
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114613
PMID:39116206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现脂质相关巨噬细胞RNASE1_M与奥希替尼耐药和肺癌软脑膜转移相关 | 首次在EGFR突变非小细胞肺癌患者脑脊液中鉴定出与奥希替尼耐药和软脑膜转移相关的特定巨噬细胞亚型RNASE1_M | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 探索非小细胞肺癌奥希替尼耐药后软脑膜转移的免疫机制 | EGFR突变非小细胞肺癌伴中枢神经系统转移患者的脑脊液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2025-10-07 |
A human fetal cerebellar map of the late second trimester reveals developmental molecular characteristics and abnormality in trisomy 21
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114586
PMID:39137113
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制人类胎儿小脑在妊娠晚期第二季度的发育图谱,揭示正常发育特征及21三体综合征异常 | 首次系统描绘人类胎儿小脑在妊娠18-25周的关键发育期细胞图谱,发现UBC祖细胞分布规律及胶质细胞发育轨迹,并揭示21三体综合征的分子异常 | 研究样本仅涵盖特定发育阶段(GW18-25),样本量有限,且未验证功能机制 | 解析人类胎儿小脑在妊娠晚期第二季度的正常与异常发育分子特征 | 人类胎儿小脑组织样本(包括正常和21三体综合征样本) | 单细胞基因组学 | 21三体综合征(唐氏综合征) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 妊娠18-25周人类胎儿小脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-07 |
Human liver sinusoidal endothelial cells support the development of functional human pluripotent stem cell-derived Kupffer cells
2024-08-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114629
PMID:39146183
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞成功培育出功能性的库普弗细胞,并证实肝窦内皮细胞对其发育的关键支持作用 | 首次证明人类多能干细胞来源的卵黄囊样造血祖细胞可在肝窦内皮细胞支持下发育为功能性库普弗细胞 | 研究主要基于小鼠模型,在人类体内的实际应用效果仍需进一步验证 | 研究人类库普弗细胞的发育机制 | 人类多能干细胞、肝窦内皮细胞、卵黄囊样造血祖细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NSG小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |