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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics: deciphering technological landscape of integration of multi-omics and its applications
2024-08-24, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01596-9
PMID:39182134
|
综述 | 本文全面回顾了空间多组学技术的发展历程及其在生物医学研究中的应用 | 系统梳理了空间多组学技术在过去十年中的演进与完善,重点关注通量、分辨率、模态整合和准确性的提升 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体实施细节 | 探讨多组学整合的技术格局及其在生物医学领域的应用 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组的整合分析 | 空间生物学 | 癌症 | 空间多组学技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间多组学 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
SUV39H1 Preserves Cancer Stem Cell Chromatin State and Properties in Glioblastoma
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.607856
PMID:39229036
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持和肿瘤进展中的关键作用 | 首次证明SUV39H1通过调控染色质可及性和干细胞特性在胶质母细胞瘤干细胞维持中发挥关键作用 | 研究主要基于患者来源的肿瘤干细胞和异种移植模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤干细胞维持的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤干细胞和肿瘤组织 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤样本和正常脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Apolipoprotein E is a novel marker for chondrocytes in the growth plate resting zone
2024-Aug-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4656728/v1
PMID:39149484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现载脂蛋白E是生长板静息区软骨细胞的新型标志物 | 首次发现载脂蛋白E可作为小鼠和人类生长板静息区软骨细胞的全面标志物 | 研究未详细探讨载脂蛋白E在静息区软骨细胞中的具体功能机制 | 寻找生长板静息区软骨细胞的可靠分子标志物 | 小鼠和人类生长板静息区软骨细胞 | 单细胞生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 基因敲入技术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
Cross-species imputation and comparison of single-cell transcriptomic profiles
2024-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.19.563173
PMID:37905060
|
研究论文 | 开发了用于跨物种单细胞转录组数据插补和比较的神经网络框架Icebear | 首次实现了跨物种单细胞基因表达谱的准确预测,并揭示了哺乳动物X染色体上调的进化适应性 | 未明确说明样本规模和具体数据集限制 | 开发跨物种单细胞转录组比较和预测方法 | 真兽类哺乳动物和鸡的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2024-Aug-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4819117/v1
PMID:39149508
|
研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法,用于改进scRNA-seq数据的因子分析 | 通过消除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的非解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-07 |
Bioinformatics analysis of the tumor microenvironment in melanoma - Constructing a prognostic model based on CD8+ T cell-related genes: An observational study
2024-Aug-09, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000038924
PMID:39121331
|
研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤肿瘤微环境中CD8+ T细胞相关基因构建预后模型 | 整合单细胞测序和多组学分析识别CD8+ T细胞特异性转录因子并构建预后模型 | 观察性研究设计,需要进一步实验验证 | 探索黑色素瘤肿瘤微环境并构建预后预测模型 | 黑色素瘤患者和肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序,多组学分析,生物信息学分析 | COX回归模型,LASSO回归模型 | 单细胞测序数据,基因表达数据 | 使用GSE65904和GSE35640数据集进行验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-07 |
Immunotherapy drives mesenchymal tumor cell state shift and TME immune response in glioblastoma patients
2024-08-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae085
PMID:38695342
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗胶质母细胞瘤时肿瘤细胞向间充质状态转变的耐药机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了免疫治疗驱动的胶质母细胞瘤肿瘤细胞向间充质干细胞样状态转变的耐药机制 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证研究结果 | 探索胶质母细胞瘤对免疫检查点抑制剂治疗的耐药机制 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 76个肿瘤样本(主要研究)+ 298个外部验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-10-07 |
Robust single nucleus RNA sequencing reveals depot-specific cell population dynamics in adipose tissue remodeling during obesity
2024-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588525
PMID:38645263
|
研究论文 | 本研究开发了一种稳健的单核RNA测序技术,并应用于揭示肥胖过程中脂肪组织重塑的细胞群动态变化 | 开发了适用于多种组织类型的核分离技术,显著提高了snRNA-seq数据质量;首次系统表征了肥胖过程中脂肪组织不同区域的细胞动态变化;通过整合bulk核RNA测序识别了按大小和功能分类的脂肪细胞亚群 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 研究肥胖过程中脂肪组织重塑的细胞群动态变化机制 | 脂肪组织中的各种细胞类型,特别是不同大小的脂肪细胞亚群 | 单细胞测序 | 肥胖 | 单核RNA测序(snRNA-seq), bulk核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-07 |
The proteogenomic landscape of multiple myeloma reveals insights into disease biology and therapeutic opportunities
2024-08, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00784-3
PMID:38942927
|
研究论文 | 通过蛋白质基因组学分析多发性骨髓瘤的疾病生物学特征和潜在治疗靶点 | 首次系统评估多发性骨髓瘤蛋白质组,整合磷酸化蛋白质组学、RNA测序和纳米孔DNA测序进行多组学分析 | 样本量相对有限(138例),需要进一步验证研究 | 探索多发性骨髓瘤的蛋白质基因组学特征以改善风险分层和发现新疗法 | 138例原发性患者来源的浆细胞恶性肿瘤,包括初治多发性骨髓瘤、浆细胞白血病和意义未明的单克隆丙种球蛋白病以及健康对照 | 癌症研究 | 多发性骨髓瘤 | 串联质量标签定量蛋白质组学、RNA测序、纳米孔DNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、基因组数据 | 138例患者样本和健康对照 | Oxford Nanopore | 蛋白质组学、RNA测序、DNA测序、单细胞RNA测序 | 纳米孔测序 | 基于串联质量标签的定量全局(磷酸化)蛋白质组学 |
| 110 | 2025-10-07 |
The Loss of PPARγ Expression and Signaling Is a Key Feature of Cutaneous Actinic Disease and Squamous Cell Carcinoma: Association with Tumor Stromal Inflammation
2024-08-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13161356
PMID:39195246
|
研究论文 | 本研究通过分析PPARγ缺陷小鼠的转录组变化,揭示了PPARγ在皮肤光化性疾病和鳞状细胞癌中的关键抑制作用 | 首次通过单细胞测序证实PPARγ缺失导致肿瘤基质炎症变化,并发现PPAR信号通路是光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌中最受抑制的经典通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究PPARγ在皮肤炎症和癌变过程中的作用机制 | PPARγ缺陷小鼠、人类和小鼠的光化性角化病及皮肤鳞状细胞癌样本 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 转录组分析, 基因集富集分析 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | PPARγ缺陷小鼠模型及公共数据库中的人类和小鼠AKs、SCCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-07 |
BAG6 restricts pancreatic cancer progression by suppressing the release of IL33-presenting extracellular vesicles and the activation of mast cells
2024-Aug, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01195-1
PMID:38942797
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研究论文 | 本研究揭示BAG6通过抑制携带IL33的细胞外囊泡释放和肥大细胞激活来限制胰腺癌进展的新机制 | 首次发现BAG6在胰腺癌中的肿瘤抑制作用,阐明其通过调控EVs释放和肥大细胞激活影响肿瘤微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究BAG6在胰腺癌进展中的作用机制及其对肿瘤微环境的调控 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型、人类类器官和患者样本 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、Cre/loxP报告系统、类器官培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞转录组数据 | 小鼠PDAC模型、人类类器官和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-10-07 |
Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases
2024-Aug-15, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1124/pharmrev.123.000928
PMID:38866561
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综述 | 本文综述了硫化氢及其供体在心脏代谢疾病中的生理作用和药理机制 | 重点关注硫化氢通过蛋白质硫巯基化修饰调控心脏代谢疾病的新机制,并探讨新兴技术在相关研究中的应用前景 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨硫化氢在心脏代谢疾病中的治疗潜力及其药理作用机制 | 内源性硫化氢及其供体在细胞、动物和临床研究中的作用 | 药理学 | 心脏代谢疾病 | 多组学分析、肠道菌群分析、类器官、单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-07 |
Teplizumab induces persistent changes in the antigen-specific repertoire in individuals at risk for type 1 diabetes
2024-Aug-13, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177492
PMID:39137044
|
研究论文 | 研究Teplizumab治疗对1型糖尿病高危人群抗原特异性T细胞库的长期影响 | 首次揭示Teplizumab通过激活后耗竭和调节机制促进操作耐受性,并阻止自身反应性T细胞扩增的长期作用机制 | 研究样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索Teplizumab在1型糖尿病高危人群中的长期免疫调节机制 | 1型糖尿病高危人群的外周血CD8+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究参与者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2025-10-07 |
Scupa: Single-cell unified polarization assessment of immune cells using the single-cell foundation model
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.608093
PMID:39229048
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研究论文 | 开发了首个用于全面分析免疫细胞极化的计算方法Scupa | 首个利用单细胞基础模型系统评估免疫细胞极化的计算方法 | NA | 解决缺乏系统检测细胞因子效应和免疫细胞极化方法的问题 | 免疫细胞极化状态 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | Universal Cell Embeddings基础模型 | 单细胞转录组数据 | 基于免疫词典中14种免疫细胞类型的66种细胞因子驱动极化状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-10-07 |
Modulation of blood-tumor barrier transcriptional programs improves intra-tumoral drug delivery and potentiates chemotherapy in GBM
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609797
PMID:39253453
|
研究论文 | 本研究通过识别血脑肿瘤屏障的12基因特征并开发BIA纳米颗粒制剂,改善了胶质母细胞瘤的化疗药物递送效率 | 首次发现CDH5作为血脑肿瘤屏障核心分子,开发具有双重功能的BIA衍生物既能破坏屏障又能增强化疗效果 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 改善胶质母细胞瘤化疗药物的肿瘤内递送效率 | 胶质母细胞瘤血管系统、血脑肿瘤屏障、内皮细胞单层和3D球体模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、纳米颗粒制剂 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 胶质母细胞瘤患者标本、荷瘤小鼠模型、患者来源的胶质母细胞瘤异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies distinct CD4+ T cells associated with the pathobiology of pediatric obesity-related asthma
2024-Aug-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607447
PMID:39211259
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研究论文 | 通过单细胞分析识别与儿童肥胖相关哮喘病理生物学相关的不同CD4+ T细胞亚型 | 首次在单细胞水平揭示肥胖哮喘中特定CD4+ T细胞亚群的CDC42上调、Th1炎症和类固醇耐药性特征 | 未明确说明样本量大小和研究人群的具体特征 | 探索儿童肥胖相关哮喘中CD4+ T细胞亚型的分子特征及其与疾病表型的关系 | 儿童肥胖相关哮喘患者的CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-10-07 |
Emerging advances in defining the molecular and therapeutic landscape of small-cell lung cancer
2024-Aug, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-024-00914-x
PMID:38965396
|
综述 | 全面概述小细胞肺癌的分子特征和新兴治疗策略的最新进展 | 首次系统总结基于四种转录因子表达状态的SCLC分子分型,并整合单细胞RNA测序揭示肿瘤异质性与治疗耐药性的关联 | 缺乏有效生物标志物用于患者选择,且面临治疗耐药性快速发展的挑战 | 改善小细胞肺癌患者预后的治疗策略开发 | 小细胞肺癌的分子特征和治疗方法 | 肿瘤学 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,基因组评估,转录组分析 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-07 |
Transcriptional regulation of the postnatal cardiac conduction system heterogeneity
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50849-1
PMID:39095365
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了小鼠出生后心脏传导系统的转录组景观和区域特异性基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下结合空间信息展示出生后心脏传导系统的转录组景观,并发现Tbx3和Irx3转录因子在区域特异性基因调控中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类心脏传导系统中的适用性需要进一步验证 | 阐明出生后心脏传导系统的分子组成和调控机制 | 出生后小鼠心脏传导系统细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,ATAC-seq,ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据,表观基因组数据 | 小鼠心脏传导系统不同区域细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,ATAC-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-10-07 |
Cellular transitions during cranial suture establishment in zebrafish
2024-Aug-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50780-5
PMID:39138165
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了斑马鱼颅缝发育过程中非成骨性间充质细胞通过BMP拮抗作用调控骨形成的机制 | 首次在斑马鱼颅缝中段鉴定出表达BMP拮抗剂和促血管生成因子的非成骨性间充质细胞亚群 | 研究局限于斑马鱼模型,未验证在哺乳动物中的保守性 | 探究颅缝发育过程中骨形成调控机制 | 斑马鱼颅缝发育 | 发育生物学 | 颅缝早闭 | 单细胞转录组学,谱系追踪,突变分析 | NA | 基因表达数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of the human brain vasculature across development, adulthood and disease
2024-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07493-y
PMID:38987604
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了人类大脑血管系统在发育期、成年期和疾病状态下的分子图谱 | 首次在单细胞水平系统描绘人类大脑血管系统的分子异质性,揭示了疾病状态下动静脉分化改变和胎儿期基因重新激活等新现象 | 样本来源和数量仍有限,未能覆盖所有脑部血管疾病类型 | 解析人类大脑血管系统的细胞和分子结构 | 人类胎儿和成年患者的大脑血管内皮细胞、周细胞及其他组织来源细胞 | 单细胞基因组学 | 脑部血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 117个样本,606,380个细胞,来自68名人类胎儿和成年患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |