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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Somatic epigenetic drift during shoot branching: a cell lineage-based model
2024-Aug-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae091
PMID:38809088
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研究论文 | 提出基于细胞谱系的模型研究植物分枝过程中的体细胞表观遗传漂变 | 首次形式化分离分生组织模型中细胞随机采样过程,揭示分枝过程中细胞谱系混合现象 | 理论模型需要实验验证,未考虑环境因素对表观遗传的影响 | 研究植物分枝过程中体细胞表观遗传变异的积累机制 | 植物顶端分生组织细胞 | 计算生物学 | NA | 理论建模 | 细胞谱系模型 | 理论模拟数据 | NA | NA | 单细胞测序,批量测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Morphine-responsive neurons that regulate mechanical antinociception
2024-08-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.ado6593
PMID:39208104
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术识别并操控了小鼠延髓头端腹内侧区中对吗啡有反应的神经元,揭示了调控机械性伤害感受的特定神经回路 | 首次识别出延髓头端腹内侧区中特定兴奋性投射神经元集群,这些神经元通过脑源性神经营养因子/原肌球蛋白受体激酶B依赖机制调控吗啡诱导的机械性镇痛作用 | 研究仅限于小鼠模型中的机械性伤害感受,未涉及其他类型疼痛或物种 | 阐明阿片类药物镇痛的神经解剖学基础 | 小鼠延髓头端腹内侧区神经元 | 神经科学 | 疼痛管理 | 单细胞转录组学,神经元操控技术 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Type I Interferonopathy among Non-Elderly Female Patients with Post-Acute Sequelae of COVID-19
2024-08-28, Viruses
DOI:10.3390/v16091369
PMID:39339845
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研究论文 | 本研究通过分析非老年女性COVID-19急性后遗症患者的单细胞转录组数据,揭示了与I型干扰素信号异常激活相关的CD14STAT2单核细胞亚群特征 | 首次在非老年女性PASC患者中发现特征性CD14STAT2单核细胞亚群,并证实其与STAT2/IRF9转录因子活性和I型干扰素信号通路异常激活相关 | 研究基于公共数据库的回顾性数据分析,样本来源和数量有限,需要进一步实验验证 | 探索非老年女性COVID-19急性后遗症患者的免疫机制 | 非老年女性PASC患者、急性SARS-CoV-2感染患者及健康对照的外周血样本 | 生物信息学 | COVID-19后遗症 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的非老年女性患者和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of the miracidium larva of Schistosoma mansoni reveals cell types, developmental pathways, and tissue architecture
2024-Aug-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95628
PMID:39190022
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了曼氏血吸虫毛蚴幼虫阶段的全细胞图谱,揭示了其细胞类型组成、发育路径和组织结构 | 首次在单细胞水平上解析了血吸虫毛蚴幼虫的细胞组成,发现神经元是最多样化的体细胞类型,并识别出两个具有性别偏倚转录特征的主要干细胞群 | 研究仅聚焦于毛蚴这一特定发育阶段,未涵盖血吸虫完整生命周期 | 在细胞和分子水平上理解曼氏血吸虫毛蚴幼虫的生物学特性 | 曼氏血吸虫毛蚴幼虫 | 单细胞生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 约365个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-associated platelet bias are evolutionarily conserved
2024-08-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk3469
PMID:39178276
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序揭示了人类造血干细胞的功能和转录谱系偏好,并发现血小板偏向性HSC随年龄增长而增加 | 首次在人类造血干细胞中证实了功能性和转录性谱系偏好的存在,并揭示了血小板偏向性HSC在衰老过程中的进化保守性 | 研究基于异种移植模型,可能无法完全模拟人体内环境;样本来源有限 | 探究人类造血干细胞的异质性和年龄相关的血小板偏向性 | 成年人类骨髓造血干细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,分子条形码技术,异种移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老骨髓来源的人类造血干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高通量单细胞RNA测序 |
| 86 | 2025-10-06 |
Multimodal analysis unveils tumor microenvironment heterogeneity linked to immune activity and evasion
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110529
PMID:39161957
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研究论文 | 通过多模态分析方法揭示肿瘤微环境异质性及其与免疫活性和免疫逃逸的关联 | 开发了名为iHet的肿瘤微环境异质性特征,该特征在不同癌症中具有保守性,并能预测免疫治疗效果 | 研究主要基于转录组学数据,可能未涵盖肿瘤微环境的所有分子层面 | 解析肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗的影响 | 肺癌肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 系统生物学方法,单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1
PMID:39184105
|
研究论文 | 开发了PURE-seq技术用于稀有细胞测序,并应用于小鼠造血衰老研究 | 开发了PURE-seq技术,能够直接从FACS分选细胞进行测序,有效捕获稀有细胞(百万分之一的稀有度) | 未明确说明技术验证的样本规模和应用范围限制 | 研究造血衰老过程中长寿命造血干细胞及其转录组特征 | 小鼠长寿命造血干细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数十个细胞(百万分之一稀有度) | NA | 单细胞RNA-seq | PURE-seq | PIP-seq for Rare-cell Enrichment and Sequencing,支持直接从FACS加载细胞 |
| 88 | 2025-10-06 |
High-dimensional single-cell analysis of human natural killer cell heterogeneity
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01883-0
PMID:38956378
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术解析人类自然杀伤细胞的异质性 | 首次在健康人血液中鉴定出三个主要NK细胞亚群及其六个亚组,揭示了NK细胞的两种不同发育起源 | 样本来源仅限于健康个体和部分肿瘤组织,未涵盖其他疾病状态 | 系统解析人类自然杀伤细胞的异质性和功能特征 | 人类自然杀伤细胞 | 单细胞生物学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白数据 | 健康人血液、肺组织、扁桃体、上皮内淋巴细胞及22种肿瘤类型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Genetic Implication of Prenatal GABAergic and Cholinergic Neuron Development in Susceptibility to Schizophrenia
2024-08-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae083
PMID:38869145
|
研究论文 | 本研究通过整合精神分裂症全基因组关联研究和人类神经节隆起单细胞测序数据,探讨了产前GABA能及胆碱能神经元发育在精神分裂症遗传易感性中的作用 | 首次结合GWAS数据与人类神经节隆起单细胞转录组和染色质可及性数据,系统揭示了精神分裂症遗传风险在特定发育神经元群体中的富集模式 | 研究主要基于相关性分析,需要进一步功能实验验证 | 探究神经节隆起神经元发育在介导精神分裂症遗传风险中的潜在作用 | 人类胎儿神经节隆起的发育神经元群体 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 全基因组关联分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Adaptation to ex vivo culture reduces human hematopoietic stem cell activity independently of the cell cycle
2024-08-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021426
PMID:38805639
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能分析揭示了人类长期造血干细胞在体外培养中功能丧失的机制 | 发现HSC功能丧失发生在细胞周期进展之前,且与细胞周期无关,并证明通过抑制JAK/STAT信号可改善HSC功能 | 研究主要关注早期培养阶段(6-24小时),长期培养效应需进一步研究 | 探究人类长期造血干细胞在体外培养中功能丧失的动力学和机制 | 人类长期造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 功能分析, 细胞周期阻滞 | NA | 单细胞转录组数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332043
PMID:38857990
|
研究论文 | 本研究通过患者来源的肠道类器官生物库,发现克罗恩病中肠道上皮MHC-I表观遗传失调的新机制 | 首次在克罗恩病中鉴定出肠道上皮MHC-I的表观遗传调控机制,并开发了疾病预后的表观遗传分子标志物 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证 | 研究肠道上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 | 168名患者(克罗恩病72人,溃疡性结肠炎23人,健康对照73人)的肠道黏膜活检样本 | 表观遗传学 | 克罗恩病 | DNA甲基化分析,bulk RNA测序,单细胞RNA测序,基因编辑,类器官-淋巴细胞共培养 | 机器学习 | 表观基因组数据,转录组数据 | 312个肠道上皮类器官,来自168名患者 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Endothelial Heterogeneity in the Response to Autophagy Drives Small Vessel Muscularization in Pulmonary Hypertension
2024-Aug-06, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了自噬激活通过诱导肺动脉内皮细胞增殖和微血管内皮细胞凋亡,驱动肺动脉高压中小血管肌化的机制 | 首次阐明不同内皮细胞亚群对缺氧的自噬反应差异是导致血管重塑的关键机制,并证明自噬介导的微血管内皮细胞被肺动脉内皮细胞替代是远端血管肌化的直接原因 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人类样本中的验证仍需进一步扩展 | 探究肺动脉高压中内皮细胞异质性对血管重塑的影响机制 | 小鼠、大鼠和人类的内皮细胞及肺组织 | 细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 药理学抑制 | 动物模型, 体外细胞培养 | 基因表达数据, 组织切片图像 | 多种物种的内皮细胞和肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Generation and characterisation of scalable and stable human pluripotent stem cell-derived microvascular-like endothelial cells for cardiac applications
2024-Aug, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09929-5
PMID:38775849
|
研究论文 | 开发可扩展的3D培养方案生成稳定的人多能干细胞来源心脏微血管样内皮细胞 | 建立基于3D搅拌釜生物反应器的可扩展分化方案,通过高浓度VEGF-A处理获得表型稳定的心脏特异性微血管样内皮细胞 | 未提及临床前或临床应用验证数据 | 开发适用于心脏微血管疾病研究和组织工程应用的稳健细胞模型 | 人多能干细胞来源的内皮细胞和周细胞样细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉微血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),3D细胞培养 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024-Aug-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.07.597992
PMID:38915654
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定前列腺增生组织中富含脂质的巨噬细胞亚群及其与前列腺体积增大的关联 | 首次在前列腺增生组织中鉴定出TREM2+和MARCO+巨噬细胞亚群,这些脂质代谢重编程的巨噬细胞不遵循传统M1/M2分类 | 需要进一步研究评估靶向这些细胞对前列腺增生的治疗价值 | 探究巨噬细胞亚群在前列腺增生发病机制中的作用 | 人类良性前列腺增生组织中的CD45+白细胞 | 单细胞测序分析 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 20例人类前列腺组织(10例大前列腺>90克,10例小前列腺<40克) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Huntington's disease cellular phenotypes are rescued non-cell autonomously by healthy cells in mosaic telencephalic organoids
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50877-x
PMID:39095390
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研究论文 | 本研究通过构建亨廷顿病镶嵌型端脑类器官,揭示了健康细胞通过非细胞自主机制挽救疾病细胞表型的能力 | 首次在镶嵌型端脑类器官中证明健康细胞可通过细胞间接触恢复亨廷顿病细胞的神经元特性、发育轨迹和突触功能 | 研究主要关注发育阶段,对成熟神经元退行性病变的长期影响仍需进一步验证 | 探究亨廷顿病中不同基因型细胞间的非细胞自主相互作用机制 | 健康与亨廷顿病基因型的端脑类器官 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics: deciphering technological landscape of integration of multi-omics and its applications
2024-08-24, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01596-9
PMID:39182134
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综述 | 本文全面回顾了空间多组学技术的发展历程及其在生物医学研究中的应用 | 系统梳理了空间多组学技术在过去十年中的演进与完善,重点关注通量、分辨率、模态整合和准确性的提升 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体实施细节 | 探讨多组学整合的技术格局及其在生物医学领域的应用 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和表观基因组的整合分析 | 空间生物学 | 癌症 | 空间多组学技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间多组学 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
SUV39H1 Preserves Cancer Stem Cell Chromatin State and Properties in Glioblastoma
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.607856
PMID:39229036
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持和肿瘤进展中的关键作用 | 首次证明SUV39H1通过调控染色质可及性和干细胞特性在胶质母细胞瘤干细胞维持中发挥关键作用 | 研究主要基于患者来源的肿瘤干细胞和异种移植模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤干细胞维持的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤干细胞和肿瘤组织 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤样本和正常脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Apolipoprotein E is a novel marker for chondrocytes in the growth plate resting zone
2024-Aug-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4656728/v1
PMID:39149484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现载脂蛋白E是生长板静息区软骨细胞的新型标志物 | 首次发现载脂蛋白E可作为小鼠和人类生长板静息区软骨细胞的全面标志物 | 研究未详细探讨载脂蛋白E在静息区软骨细胞中的具体功能机制 | 寻找生长板静息区软骨细胞的可靠分子标志物 | 小鼠和人类生长板静息区软骨细胞 | 单细胞生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 基因敲入技术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Cross-species imputation and comparison of single-cell transcriptomic profiles
2024-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.19.563173
PMID:37905060
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研究论文 | 开发了用于跨物种单细胞转录组数据插补和比较的神经网络框架Icebear | 首次实现了跨物种单细胞基因表达谱的准确预测,并揭示了哺乳动物X染色体上调的进化适应性 | 未明确说明样本规模和具体数据集限制 | 开发跨物种单细胞转录组比较和预测方法 | 真兽类哺乳动物和鸡的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2024-Aug-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4819117/v1
PMID:39149508
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研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法,用于改进scRNA-seq数据的因子分析 | 通过消除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的非解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |