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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Sensitive Multiplexed MicroRNA Spatial Profiling and Data Classification Framework Applied to Murine Breast Tumors
2024-08-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01773
PMID:39044395
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研究论文 | 开发了一种高灵敏度的多重microRNA空间分析方法和数据分类框架,并应用于小鼠乳腺肿瘤 | 结合滚环扩增技术和双扫描方法,在纳升孔阵列中实现7种miRNA的同时定量和空间检测,检测限达0.17 zeptomoles | NA | 开发高灵敏度的空间转录组学方法用于miRNA检测 | 小鼠乳腺肿瘤组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 滚环扩增, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 纳升孔阵列与嵌入式水凝胶柱 |
| 42 | 2025-10-06 |
Vagal TRPV1 + sensory neurons regulate myeloid cell dynamics and protect against influenza virus infection
2024-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.609013
PMID:39229208
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研究论文 | 本研究揭示迷走神经TRPV1+感觉神经元通过调控髓系细胞动态和免疫病理来保护宿主免受甲型流感病毒感染 | 首次发现迷走神经TRPV1+伤害性感受器通过调控髓系细胞反应而非直接影响病毒载量来促进流感病毒感染后的生存 | 未明确TRPV1神经元调控髓系细胞反应的具体分子机制 | 探究迷走神经TRPV1+感觉神经元在肺部抗病毒防御中的作用机制 | 小鼠模型和甲型流感病毒(IAV) | 免疫学 | 流感病毒感染 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice
2024-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024
PMID:38286187
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研究论文 | 本研究揭示了嗜碱性粒细胞通过下调IL-17A表达在皮肤机械损伤后屏障功能恢复中的保护作用 | 首次发现嗜碱性粒细胞通过拮抗IL-17A对表皮和脂质代谢基因表达的影响,促进皮肤屏障功能恢复 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中得到验证 | 探究皮肤机械损伤后屏障功能恢复的分子机制 | 小鼠皮肤机械损伤模型 | 免疫学 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Spock2 Functions as a Key Time-Series Gene of Endothelial Cells in Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Aug-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001577
PMID:39115722
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研究论文 | 本研究通过分析脓毒症小鼠模型和单细胞测序数据,揭示了Spock2作为内皮细胞关键时间序列基因在脓毒症心肌病中的保护作用 | 首次发现Spock2是脓毒症心肌病中内皮细胞的关键时间依赖性差异表达基因,并证实其具有抗凋亡保护功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类脓毒症患者中进行验证 | 探究脓毒症心肌病的发病机制 | 脓毒症小鼠模型和人类脐静脉内皮细胞 | 生物信息学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 加权基因共表达网络分析, 时间序列分析, 免疫荧光 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | GSE171546和GSE207363数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Digital Spatial Profiling Identifies Distinct Molecular Signatures of Vascular Lesions in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202307-1310OC
PMID:38568479
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研究论文 | 本研究利用数字空间转录组技术识别肺动脉高压中血管病变的独特分子特征 | 首次在微观水平上系统比较IPAH不同类型血管病变的分子特征,发现丛状病变和IPAH外膜具有最显著的基因表达差异 | 样本量相对有限(IPAH=11,对照=5),仅分析了转录组水平的变化 | 验证IPAH血管病变表达独特分子谱的假设 | 特发性肺动脉高压患者的肺血管病变和对照肺动脉 | 数字病理 | 肺动脉高压 | 数字空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | IPAH肺组织11例,对照肺动脉5例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 探讨利用系统生物学和单细胞测序技术识别候选基因,通过合成生物学方法协调植物生长、发育与环境响应的策略 | 提出整合系统生物学、单细胞测序与合成生物学来解析基因多效性,建立基因型-表型关系的新方法 | NA | 开发通过工程化植物激素信号传导来协调植物生长、发育与环境响应的育种和基因工程策略 | 植物基因网络和信号通路 | 合成生物学 | NA | 单细胞测序, 基因编辑(CRISPR), 合成生物学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Synovial 5-Lipoxygenase-Derived Oxylipins Define a Lympho-Myeloid-Enriched Synovium
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42848
PMID:38508862
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研究论文 | 本研究探讨滑膜组织中氧脂素与血浆氧脂素的相关性及其与滑膜组织学模式的关系 | 首次系统分析炎症关节中滑膜氧脂素与血浆氧脂素的相关性,并发现5-脂氧合酶衍生的氧脂素在淋巴-髓系富集滑膜中特异性高表达 | 样本量有限(32例滑膜组织和26例配对血浆样本),仅纳入类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 确定炎症关节中滑膜氧脂素是否与血浆氧脂素及滑膜组织学模式相关 | 已确诊的类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 生物医学研究 | 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 | 液相色谱-串联质谱法, 单细胞RNA测序 | NA | 生物分子数据, 基因表达数据 | 32例滑膜组织样本和26例配对血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Molecular Changes Implicate Angiogenesis and Arterial Remodeling in Systemic Sclerosis-Associated and Idiopathic Pulmonary Hypertension
2024-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320005
PMID:38841857
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压患者肺组织中血管细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示肺动脉高压中三种疾病相关内皮细胞亚群的特征及其分子调控机制 | 样本量有限(特发性肺动脉高压组仅3例),且使用离体肺组织可能无法完全反映疾病早期变化 | 阐明系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压的血管病理生物学机制 | 系统性硬化症相关肺动脉高压患者(16例)、特发性肺动脉高压患者(3例)和健康对照者(15例)的离体肺组织 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 34例人类肺组织样本(16例SSc-PH,3例IPAH,15例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Expression of L1 Cell Adhesion Molecule, a Nephronal Principal Cell Marker, in Nephrogenic Adenoma
2024-Aug, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100540
PMID:38901674
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定L1CAM作为肾源性腺瘤的潜在生物标志物,并揭示了其与肾单位集合管主细胞的表达关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术发现L1CAM可作为肾源性腺瘤的特异性生物标志物,并建立了肾单位特异性标志物组合 | 样本量有限(35例患者样本),需要更大规模研究验证标志物的临床适用性 | 探索肾源性腺瘤的细胞起源并开发特异性诊断标志物 | 肾源性腺瘤患者组织样本及正常尿路上皮、前列腺组织等对照样本 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 35例肾源性腺瘤患者样本及多种对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Identification of novel compound heterozygous ZFP36L2 variants implicated in oocyte maturation defects and female infertility
2024-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-024-03154-1
PMID:38829516
|
研究论文 | 本研究通过鉴定ZFP36L2新型复合杂合变异并揭示其在卵母细胞成熟缺陷和女性不孕中的作用机制 | 首次发现ZFP36L2复合杂合变异与人类卵母细胞转录组改变的直接关联,并系统阐明其通过影响ZFP36L2-CNOT6L复合物功能和mRNA降解导致卵母细胞成熟缺陷的分子机制 | 研究样本量有限,功能验证主要在HeLa细胞和小鼠卵母细胞中进行,人类卵母细胞数据相对较少 | 探索卵母细胞成熟缺陷的发病机制 | 携带卵母细胞成熟缺陷的患者及其家系成员,HeLa细胞,小鼠和人类卵母细胞 | 生殖医学 | 女性不孕症 | 全外显子组测序,Sanger测序,实时RT-PCR,单细胞RNA测序,瞬时转染 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质相互作用数据 | 1名患者及其家系成员,HeLa细胞系,小鼠和人类卵母细胞样本 | NA | 全外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Lung Single-Cell Transcriptomics in Alpha-1 Antitrypsin Deficiency
2024-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0064LE
PMID:39087828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
Analyzing Single Cell RNA Sequencing with Topological Nonnegative Matrix Factorization
2024-Aug-01, Journal of computational and applied mathematics
IF:2.1Q1
DOI:10.1016/j.cam.2024.115842
PMID:38464901
|
研究论文 | 本文提出了两种基于持久拉普拉斯正则化的非负矩阵分解方法,用于分析单细胞RNA测序数据 | 引入了拓扑非负矩阵分解(TNMF)和鲁棒拓扑非负矩阵分解(rTNMF),解决了传统NMF方法缺乏多尺度分析的问题 | NA | 开发新的计算方法以更好地分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF), 拓扑非负矩阵分解(TNMF), 鲁棒拓扑非负矩阵分解(rTNMF) | 基因表达数据 | 12个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Dissecting the Implications of Calumenin in Malignancy and Heterogeneity of the Microenvironment of Clear Cell Renal Cell Carcinoma Using Multi-Omics Data
2024-Aug, Phenomics (Cham, Switzerland)
DOI:10.1007/s43657-024-00169-7
PMID:39583311
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研究论文 | 通过多组学数据研究Calumenin在透明细胞肾细胞癌恶性进展和肿瘤微环境异质性中的作用 | 首次系统揭示CALU在ccRCC中的表达特征及其与肿瘤微环境免疫细胞组成的关联,并发现CALU表达影响化疗药物敏感性 | 研究样本量未明确说明,机制研究仍需深入验证 | 探讨Calumenin在透明细胞肾细胞癌发生发展中的作用机制 | 透明细胞肾细胞癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 多组学数据分析,单细胞测序,分子生物学实验 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学整合分析 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
cytoKernel: Robust kernel embeddings for assessing differential expression of single cell data
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.16.608287
PMID:39229233
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研究论文 | 提出一种基于核嵌入的稳健方法cytoKernel,用于评估单细胞数据的差异表达 | 使用基于核的评分检验,能够检测单细胞数据中常被忽视的多模态特征变化 | NA | 开发评估单细胞数据差异表达的稳健方法 | 单细胞RNA测序数据和高维流式或质谱流式数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式技术 | 核嵌入方法,基于核的评分检验 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,质谱流式技术 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Molecular Pathways and Cellular Subsets Associated with Adverse Clinical Outcomes in Overlapping Immune-Related Myocarditis and Myositis
2024-Aug-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0011
PMID:38768394
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析免疫检查点疗法引发的心肌炎和肌炎患者的组织样本,揭示相关的分子通路和免疫细胞亚群 | 首次在活体患者中鉴定出与免疫相关心肌炎和肌炎不良临床结局相关的CD8+ T细胞和髓系细胞亚群,特别是表达FcγRIIIa和IL1B+TNF+的炎症性髓系细胞 | 样本量较小(n=20),仅包含接受免疫检查点治疗的癌症患者,所有活检均在临床表现96小时内获取 | 阐明免疫检查点疗法引发的心肌炎和肌炎的分子机制和免疫细胞基础 | 接受免疫检查点治疗的癌症患者并发心肌炎和/或肌炎的组织样本 | 单细胞组学 | 心肌炎和肌炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 20例患者(10例重叠心肌炎加肌炎,1例单纯心肌炎,9例对照)共58,523个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Revealing the crucial roles of suppressive immune microenvironment in cardiac myxoma progression
2024-08-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01912-2
PMID:39090109
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了心脏粘液瘤中抑制性免疫微环境的关键作用 | 首次构建心脏粘液瘤的单细胞图谱,发现粘液瘤细胞具有成纤维细胞样特征但表达独特的磷酸二酯酶和增殖相关基因,并揭示了M2样巨噬细胞浸润与栓塞发生的临床关联 | 样本数量有限,体外共培养实验未能完全模拟体内复杂微环境 | 解析心脏粘液瘤的细胞组成和免疫微环境特征 | 心脏粘液瘤组织和其中的细胞群体 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 75,641个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Multi-omics integration reveals the oncogenic role of eccDNAs in diffuse large B-cell lymphoma through STING signalling
2024-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1815
PMID:39183480
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析揭示了DNA损伤诱导的eccDNAs通过cGAS非依赖性方式激活STING信号通路在弥漫大B细胞淋巴瘤中的致癌作用 | 首次报道eccDNAs在DLBCL中的表达谱及其致癌功能,发现DNA损伤诱导的eccDNAs通过cGAS非依赖性方式激活STING信号通路的新机制 | 未明确说明样本数量和研究人群特征,缺乏临床转化验证数据 | 探究eccDNAs在弥漫大B细胞淋巴瘤中的表达特征、功能机制及治疗意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞、动物模型、GEO数据库 | 多组学整合分析 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 环状DNA测序,原子力显微镜,CCK-8,单细胞RNA测序,化疗药物处理 | 动物模型 | 基因组数据,转录组数据,显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,环状DNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Machine Learning Uncovers Vascular Endothelial Cell Identity Genes by Expression Regulation Features in Single Cells
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609808
PMID:39253493
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研究论文 | 提出了一种名为SCIG的机器学习方法,用于在单细胞水平识别细胞身份基因 | 利用细胞身份基因独特的遗传序列特征(如顺式调控元件富集模式)和单细胞RNA-seq数据,无需与其他细胞比较即可识别细胞身份基因 | NA | 识别血管内皮细胞的身份基因,理解细胞分化和发育机制 | 人类内皮细胞图谱中的血管内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据,遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
Dysregulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase in cancers: A comprehensive analysis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111198
PMID:38697449
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研究论文 | 通过多组学分析探讨磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(PEPCK)在泛癌中的表达失调及其临床意义 | 首次在33种癌症类型中系统分析PEPCK两个亚型(PCK1和PCK2)的表达模式及其与临床预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于胶质母细胞瘤 | 阐明PEPCK在癌症发生发展中的作用机制及其临床价值 | 33种癌症类型的患者样本和胶质母细胞瘤细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析(重点关注胶质母细胞瘤) | 生物信息学分析、单细胞测序、体外实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据、突变数据 | TCGA数据库中33种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Blocking the MIR155HG/miR-155 axis reduces CTGF-induced inflammatory cytokine production and α-SMA expression via upregulating AZGP1 in hypertrophic scar fibroblasts
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111202
PMID:38729323
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研究论文 | 本研究揭示了MIR155HG/miR-155/AZGP1轴在调控增生性瘢痕成纤维细胞中炎症因子产生和α-SMA表达的作用机制 | 首次发现CTGF通过磷酸化STAT3结合MIR155HG启动子刺激其表达,并阐明MIR155HG通过miR-155-5p/-3p靶向AZGP1调控瘢痕形成的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步体内实验验证 | 探究MIR155HG在增生性瘢痕纤维化中的作用机制 | 增生性瘢痕成纤维细胞(HSFBs) | 分子生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, western blotting, ELISA, 双荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 临床HS和正常皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |