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当前共找到 532 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Lung Single-Cell Transcriptomics in Alpha-1 Antitrypsin Deficiency
2024-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0064LE
PMID:39087828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2026-06-29 |
Single-cell RNA-seq reveals novel interaction between muscle satellite cells and fibro-adipogenic progenitors mediated with FGF7 signalling
2024-08, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13484
PMID:38751367
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肌肉卫星细胞与纤维脂肪祖细胞之间由FGF7信号介导的新型相互作用 | 首次在猪骨骼肌中通过单细胞RNA测序发现FAPs通过FGF7-FGFR2信号调控MuSCs的新机制，并验证了FGF7在肌肉再生和抗衰老中的作用 | 未提及显著的局限性 | 探索肌肉卫星细胞与微环境中其他细胞的相互作用及其在肌肉生长、损伤和衰老中的功能 | 猪背最长肌和比目鱼肌中的肌源性细胞及纤维脂肪祖细胞 | 数字病理学 | 肌肉相关疾病、衰老性疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞通讯分析（CellChat）、基因集变异分析（GSVA）、RNA速率分析 | 无特定模型，使用生物信息学工具和分析方法 | 单细胞转录组数据 | 猪背最长肌和比目鱼肌样本，加上人、小鼠数据集整合分析和体外/体内实验样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 43 | 2026-06-26 |
Identification and Validation of Prognostic Model for Tumor Microenvironment-Associated Genes in Bladder Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing Data Sets
2024-08, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO.23.00661
PMID:39151107
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据鉴定膀胱癌肿瘤微环境相关基因并构建预后模型 | 利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平解析膀胱癌肿瘤微环境与细胞异质性的关系，筛选出八个关键基因构建预后模型并验证其可靠性 | 结果依赖公共数据库数据，需体外实验进一步验证 | 阐明肿瘤微环境与膀胱癌细胞多样性的关系并构建预后模型 | 膀胱癌正常与肿瘤细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归与多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | GEO数据库单细胞数据及TCGA随访数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-06-19 |
PanIN and CAF transitions in pancreatic carcinogenesis revealed with spatial data integration
2024-08-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.001
PMID:39116880
|
研究论文 | 该研究引入一种新的成像、空间转录组学和单细胞RNA测序整合流程，以表征胰腺癌发生过程中肿瘤细胞状态转变 | 开发了一种半监督分析流程，整合了全转录组FFPE空间转录组学与单细胞RNA测序数据，首次在低级别和高级别PanIN病变中追踪癌变进程并映射细胞表型，揭示了CAF相关炎症信号向细胞增殖的转变 | 无法在FFPE样本中对人类PanIN进行严格诊断，限制了其微环境中单细胞水平的表征 | 利用空间多组学整合解析胰腺癌发生过程中的时空动态 | 低级别和高级别胰腺上皮内瘤变样本及其微环境中的肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、高维成像蛋白质组学 | 半监督学习框架 | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 罕见队列的低级别和高级别PanIN病变样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-06-19 |
Global transcription regulation revealed from dynamical correlations in time-resolved single-cell RNA sequencing
2024-08-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.002
PMID:39121860
|
研究论文 | 通过时间分辨单细胞RNA测序中的动态相关性揭示全局转录调控机制 | 提出结合细胞大小和细胞周期依赖率的随机基因表达模型，利用代谢标记和细胞周期报告基因捕获时间维度，并开发并行可扩展的近似贝叶斯计算方法校正技术变异，准确量化全转录组的爆发频率、爆发大小和降解率 | 未在摘要中明确提及局限性 | 利用时间分辨单细胞RNA测序中的动态相关性识别全局转录调控机制 | 单细胞中的基因表达动态，包括转录爆发和降解过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，代谢标记 | 随机模型，近似贝叶斯计算 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-06-18 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to predict breast cancer prognosis: A study based on natural killer cell-related genes
2024-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18549
PMID:39098994
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据与机器学习方法，基于自然杀伤细胞相关基因构建乳腺癌预后预测模型 | 首次联合101种机器学习算法筛选最佳NKRG预后模型，并整合CellChat分析和药物活性预测验证临床适用性 | 摘要未提及验证队列的多样性，也未讨论模型在多中心数据中的泛化能力 | 构建基于自然杀伤细胞相关基因的乳腺癌预后模型以优化风险分层和个体化治疗 | 乳腺癌患者的单细胞转录组数据和临床预后信息 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso-随机生存森林（RSF） | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-08, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.008
PMID:38936318
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示特发性肺纤维化中CD8+ T细胞的结构和发育轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序详细描绘了IPF患者肺部CD8+ T细胞的动态免疫状态、细胞转化及其在纤维化中的潜在作用 | 研究样本量较小（5名IPF患者和3名对照），且未进行功能验证实验 | 探究特发性肺纤维化中CD8+ T细胞亚群的转录谱、发育轨迹及其在纤维化发病机制中的贡献 | IPF患者和正常对照的肺部免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | Monocle | 单细胞转录组数据 | 5名IPF患者和3名非纤维化肺受试者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-05-27 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-08-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
|
研究论文 | 一项针对未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者的个性化新抗原DNA疫苗一期临床试验，评估其安全性和免疫反应 | 首次在人体中使用个性化新抗原DNA疫苗治疗无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者，并通过单细胞转录组学揭示了肿瘤B细胞减少和耐药机制 | 样本量小（9名患者），且为非随机化试验，未来需联合疫苗与靶向浆细胞亚群或阻断IGF-1信号的策略 | 评估个性化新抗原DNA疫苗在未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者中的安全性和免疫治疗效果 | 9名无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴浆细胞淋巴瘤 | DNA疫苗，单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名未治疗的无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3’测序 |
| 49 | 2026-05-27 |
Hydrogel crosslinking modulates macrophages, fibroblasts, and their communication, during wound healing
2024-08-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50072-y
PMID:39122702
|
研究论文 | 本研究探讨明胶基水凝胶的交联程度如何影响伤口愈合过程中巨噬细胞和成纤维细胞的行为及其相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示不同交联程度水凝胶对巨噬细胞亚群形成及与成纤维细胞RANKL信号通路的差异性调控机制 | 未明确说明样本量及临床转化可行性 | 阐明水凝胶物理特性通过调控免疫-基质细胞通讯优化伤口愈合的机制 | 雌性小鼠的伤口愈合组织 | 机器学习 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 明胶基水凝胶交联程度调控巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的单细胞转录组分析 |
| 50 | 2026-05-24 |
Cellular transitions during cranial suture establishment in zebrafish
2024-08-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50780-5
PMID:39138165
|
研究论文 | 利用斑马鱼单细胞转录组学、谱系追踪和突变分析，揭示颅缝形成过程中调控骨形成的关键细胞转变 | 首次鉴定出颅缝中部间充质细胞亚群通过表达BMP拮抗剂（如grem1a）限制骨形成，从而确保颅缝正常形态的机制 | 未提及 | 探究颅缝在颅骨扩张过程中如何控制成骨活性以促进骨生长并防止异常骨融合 | 斑马鱼胚胎颅缝组织 | 单细胞转录组学 | 颅缝相关疾病 | 单细胞转录组测序、谱系追踪、突变分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 51 | 2026-05-24 |
Single-cell long-read targeted sequencing reveals transcriptional variation in ovarian cancer
2024-08-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51252-6
PMID:39134520
|
研究论文 | 开发单细胞靶向长读长测序方法scTaILoR-seq，揭示卵巢癌转录变异 | 提出scTaILoR-seq技术，通过杂交捕获靶向一千多个基因，将每个细胞的中位数靶向转录本数提高29倍，结合长读长变异检测揭示表达SNV与可变转录结构的关联，并测量等位基因失衡 | 长读长测序通量较低且可能意外测序伪影，该方法可能仍受限于靶向基因的选择和捕获效率 | 开发并验证一种单细胞长读长靶向测序方法，用于研究RNA异构体及转录变异 | 卵巢癌细胞系和原发肿瘤样本 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 长读长测序、靶向杂交捕获 | NA | RNA序列 | 10,796个单细胞转录组（来自卵巢癌细胞系和原发肿瘤） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-05-24 |
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332043
PMID:38857990
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研究论文 | 通过患者来源的类器官生物库，发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调是严重克罗恩病的新机制 | 首次发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调（DNA甲基化缺失）是克罗恩病发病的新型机制，并通过类器官-淋巴细胞共培养和基因敲除小鼠模型验证了功能影响 | 未明确提及 | 研究肠上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 | 来自168名患者（72名CD、23名UC、73名健康对照）的312个肠上皮类器官 | 机器学习 | 克罗恩病 | DNA甲基化测序, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因编辑 | 机器学习模型 | DNA甲基化数据, RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 168名患者的312个肠上皮类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-05-24 |
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331532
PMID:38816188
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研究论文 | 本研究展示了人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植能够改善先天性巨结肠患者组织中的功能反应 | 首次证实人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞能够再定植并增加先天性巨结肠患者结肠组织的功能反应 | NA | 评估人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植对先天性巨结肠患者结肠组织的整合和功能影响 | 先天性巨结肠患者结肠组织样本，以及人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞 | 数字病理学 | 先天性巨结肠 | 单细胞RNA测序，蛋白质表达分析，钙成像，器官浴收缩性测试 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，钙成像数据 | 先天性巨结肠患者结肠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析细胞转录组特征 |
| 54 | 2026-05-24 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331773
PMID:38719336
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示胆囊癌发病过程中微环境动态变化及免疫调控因子OLFM4的作用 | 首次构建胆囊疾病多病理状态单细胞图谱，发现OLFM4通过MAPK-AP1轴上调PD-L1促进免疫逃逸，提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 部分发现需进一步在更大样本及临床队列中验证，体外和体内机制研究需补充更多分子细节 | 阐明胆囊癌及良性胆囊疾病的细胞生态系统和分子特征，为癌症预防和治疗提供新靶点 | 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及癌旁正常组织的细胞 | 机器学习 | 胆囊癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 230,737个细胞，来自15例胆囊癌、4例胆囊炎、3例胆囊息肉、5例胆囊腺瘤和16例癌旁正常组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 55 | 2026-05-23 |
Multicellular 3D bioprinted human gallbladder carcinoma forin vitromimicry of tumor microenvironment and intratumoral heterogeneity
2024-08-22, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad6d8c
PMID:39121870
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research paper | 本研究利用三维生物打印技术构建多细胞人胆囊癌模型，模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 | 首次使用同心圆柱四培养模型重建胆囊癌组织中细胞的空间分布，并通过单细胞RNA测序揭示模型内存在两种不同的胆囊癌细胞亚型，验证了肿瘤内异质性的模拟 | 未提及具体局限性 | 构建高保真多细胞三维胆囊癌模型以模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 | 人胆囊癌细胞、内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 | digital pathology | 胆囊癌 | 三维生物打印, 单细胞RNA测序 | 三维共培养模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-05-23 |
ITGB6 modulates resistance to anti-CD276 therapy in head and neck cancer by promoting PF4+ macrophage infiltration
2024-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51096-0
PMID:39152118
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研究论文 | 本研究揭示ITGB6通过促进PF4+巨噬细胞浸润调控头颈癌对anti-CD276治疗的抵抗机制 | 首次发现ITGB6通过调控CX3CL1-CX3CR1轴介导PF4+巨噬细胞招募，进而影响anti-CD276治疗效果，并阐明其在anti-PD1治疗抵抗中的逆转作用 | 研究主要基于小鼠模型，结论在人类患者中的验证尚需进一步研究 | 探究头颈鳞癌对anti-CD276治疗产生抵抗的机制及潜在干预靶点 | 头颈鳞状细胞癌小鼠模型 | 机器学习 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 化学诱导和原位癌小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Unraveling the dynamics of myometrial remodeling: insights from single-cell and spatial transcriptomics in term pregnancy
2024-08-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2026-05-22 |
Host-pathogen interactions in the Plasmodium-infected mouse liver at spatial and single-cell resolution
2024-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51418-2
PMID:39160174
|
研究论文 | 结合空间转录组学与单核RNA测序，解析疟原虫感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作 | 首次在空间和单细胞分辨率下揭示疟疾感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作，发现了感染相关脂质代谢变化、不同肝小叶区域的炎症程序差异以及‘炎症热点’区域 | 研究未提供具体局限性信息 | 探索疟原虫感染过程中宿主反应在复杂肝组织中的协调机制 | 伯氏疟原虫感染的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | 疟疾 | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 基因表达数据（空间转录组和单核RNA测序） | 多时间点的小鼠肝脏组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学，单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组，10x Chromium用于单核RNA测序 |
| 59 | 2026-05-22 |
Deciphering cell-cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network
2024-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51329-2
PMID:39155292
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研究论文 | 提出DeepTalk方法，利用子图图注意力网络整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，在单细胞分辨率下推断细胞间通讯 | 首次将子图图注意力网络应用于空间转录组学，实现单细胞分辨率的细胞间通讯推断，并能在多平台数据集上表现优异 | 未提及具体局限性，但依赖于scRNA-seq和ST数据的整合质量，可能对数据噪声敏感 | 开发一种通用方法，在单细胞分辨率下准确推断空间细胞间通讯 | 细胞间通讯、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 图注意力网络 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多个跨平台数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2026-05-22 |
Synergistic activation by Glass and Pointed promotes neuronal identity in the Drosophila eye disc
2024-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51429-z
PMID:39154080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和靶向DamID技术，揭示Glass和Pointed转录因子协同激活果蝇眼盘中的神经元身份 | 首次发现Glass和Pointed在基因组中共享许多结合位点，并通过中间转录因子Scratch和Scrape协同激活多层转录网络，诱导神经元分化 | 研究仅限于果蝇模型，未在哺乳动物系统中验证该机制的保守性 | 阐明EGFR信号通过转录因子Pointed与眼特异性转录因子Glass协同作用，促进果蝇眼盘光感受器神经元分化的机制 | 果蝇眼盘和翅盘中的发育中光感受器细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 靶向DamID, 转录组学 | 不适用 | 基因表达数据 | 果蝇眼盘和翅盘组织（具体样本量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |