单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
521	2024-08-04	Identification of key genes and immune infiltration in peripheral blood biomarker analysis of delayed cerebral ischemia: Valproic acid as a potential therapeutic drug 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112408 PMID:38897129	研究论文	本研究开发了一种基于外周血生物标志物的预测模型，用于延迟性脑缺血的关键基因和免疫浸润的分析	该研究通过多种生物信息学分析方法识别出与延迟性脑缺血相关的关键基因，并提出了丙戊酸作为潜在的治疗药物	未提及具体的实验样本数量和潜在的研究局限性	研究延迟性脑缺血（DCI）的病因和开发新的治疗方法	通过外周血生物标志物分析识别与DCI相关的关键基因	数字病理学	心脑血管疾病	基因表达谱分析	机器学习算法	生物标志物数据	涉及六个数据集与小鼠单细胞RNA-seq数据
522	2024-08-04	Transcriptional switches in melanoma T Cells: Facilitating polarizing into regulatory T cells 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112484 PMID:38885605	研究论文	本研究揭示了黑色素瘤T细胞中的转录开关，助力于调节性T细胞的极化。	首次识别了与黑色素瘤Treg相关的新的功能分子，并通过SERS技术实现了疾病监测的新方法。	尚未明确转录因子在调节性T细胞功能中的具体作用机制。	研究调节性T细胞在黑色素瘤中的作用及其自我维持机制。	研究黑色素瘤患者的调节性T细胞及其相关转录因子。	数字病理学	黑色素瘤	SERS技术	NA	临床样本	验证在大量临床样本中
523	2024-08-05	The significance of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes exhaustion heterogeneity and its underlying mechanism in diffuse large B-cell lymphoma 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112447 PMID:38909497	研究论文	这篇文章探讨了CD8+肿瘤浸润淋巴细胞的耗竭异质性及其机制在弥漫大B细胞淋巴瘤中的临床意义	研究揭示了CD8+ TILs的耗竭状态存在异质性，并指出CD39/A2AR相关信号通路可能促进其转变	样本量相对较小，尤其是单细胞RNA测序仅有7个样本	研究CD8+ TILs的耗竭异质性及其在弥漫大B细胞淋巴瘤中的作用	CD8+ TILs在弥漫大B细胞淋巴瘤中的不同耗竭状态	数字病理学	弥漫大B细胞淋巴瘤	单细胞RNA测序、整体RNA测序、免疫组化、逆转录定量聚合酶链反应	NA	RNA数据	7个单细胞样本，3300个整体RNA样本，116个免疫组化样本，95个逆转录定量PCR样本，48个肿瘤细胞的体细胞突变数据
524	2024-08-05	Three-gene signature revealing the dynamics of lymphocyte infiltration in subchondral bone during osteoarthritis progression 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112431 PMID:38897125	研究论文	本研究揭示了在骨关节炎进展过程中，次软骨骨中的淋巴细胞浸润动态的三基因特征	识别出三种基因作为骨关节炎早期阶段的潜在生物标志物，并揭示了淋巴细胞浸润的主要特征	该研究的结果可能受限于所使用的数据集以及样本大小的影响	研究骨关节炎的免疫浸润变化及其相关生物标志物	关注早期和晚期骨关节炎次软骨骨中的免疫相关基因	数字病理学	骨关节炎	LASSO回归, 单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用GSE515188数据集的样本
525	2024-08-05	DNA damage response-related signatures characterize the immune landscape and predict the prognosis of HCC via integrating single-cell and bulk RNA-sequencing 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112475 PMID:38909498	研究论文	本文探讨了与DNA损伤反应相关的标志物如何影响肝细胞癌（HCC）的免疫特征和预后	创新性地整合了单细胞RNA测序和大规模RNA测序，构建了与DNA损伤反应相关的预后模型	NA	探讨与DNA损伤反应相关的生物标记，以帮助预测HCC的预后和免疫特征	肝细胞癌患者的肿瘤和正常样本	数字病理学	肝癌	RNA测序	Cox和LASSO回归模型	基因表达数据	使用了单细胞RNA测序数据集GSE242889以及对应的肝细胞癌样本
526	2024-08-05	Identification of oxidative stress signatures of lung adenocarcinoma and prediction of patient prognosis or treatment response with single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing data 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112495 PMID:38901238	研究论文	本研究系统地调查了肺腺癌中的氧化应激调控模式和其与肿瘤微环境的关系	首次全面分析了肺腺癌中的氧化应激，建立了预后相关的预测模型	没有涉及氧化应激对其他肺癌亚型的影响	探讨肺腺癌中的氧化应激信号及其对患者预后或治疗反应的预测能力	针对肺腺癌患者的氧化应激相关基因进行研究	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序和总体RNA测序	Cox回归分析	基因表达数据	NA
527	2024-08-05	Machine learning algorithms integrate bulk and single-cell RNA data to unveil oxidative stress following intracerebral hemorrhage 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112449 PMID:38865753	研究论文	本研究通过机器学习算法整合了大规模和单细胞RNA数据，以揭示脑内出血后氧化应激的变化	首次结合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，以识别与脑内出血后的氧化应激相关的核心基因	研究主要基于动物实验，可能限制结果在临床上的推广性	识别与脑内出血后氧化应激相关的最佳基因，增强对该过程的理解	研究了氧化应激在脑内出血后在不同细胞层中的异质性	机器学习	脑内出血	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	机器学习算法（如极端梯度提升、Boruta、随机森林、最小绝对收缩和选择算子）	RNA数据	涉及脑内出血动物实验的样本
528	2024-08-05	The Transcriptional Landscape of Pericytes in Acute Ischemic Stroke 2024-Aug, Translational stroke research IF:3.8Q2 DOI:10.1007/s12975-023-01169-x PMID:37378751	研究论文	本研究探讨了急性缺血性中风中周细胞的转录组特征	首次揭示了缺血性中风后周细胞特有的转录变化和潜在的治疗靶点	研究仅基于小鼠模型，可能无法完全代表人类缺血性中风的复杂性	改善缺血性中风的治疗效果，寻找新的治疗靶点	急性缺血性中风中的周细胞	数字病理学	缺血性中风	单细胞RNA测序	小鼠模型	转录组数据	通过中动脉闭塞模型获得的样本在1小时、12小时和24小时后进行分析
529	2024-08-04	Immunophenotypic characterization of leukemic stem cells in acute myeloid leukemia using single tube 10-colour panel by multiparametric flow cytometry: Deciphering the spectrum, complexity and immunophenotypic heterogeneity 2024-Aug, International journal of laboratory hematology IF:2.2Q3 DOI:10.1111/ijlh.14250 PMID:38456256	研究论文	本研究通过多参数流式细胞术对急性髓性白血病中的白血病干细胞进行免疫表型特征的全面分析。	提出了一种单管10色多参数流式细胞术面板，能够轻松、可重复地区分白血病干细胞和正常造血干细胞，并揭示了免疫表型的异质性。	研究中样本数量有限，且对不同亚群的区分可能受到样本特征的影响。	探讨急性髓性白血病中白血病干细胞的免疫表型特征及其异质性。	急性髓性白血病患者的骨髓抽取样本。	数字病理	急性髓性白血病	多参数流式细胞术（MFC）和单细胞测序	NA	生物样本（骨髓抽取样本）	从255个样本中评估225个白血病干细胞和183个正常造血干细胞
530	2024-08-04	Integrating bulk and single-cell sequencing reveals metastasis-associated CAFs in head and neck squamous cell carcinoma 2024-Aug-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.122768 PMID:38851417	研究论文	本研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAFs)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)转移中的作用	首次识别出与HNSCC转移相关的CAFs中的基因，具体验证了TIMPI1在转移CAF中的上调及其对HNSCC细胞转移的影响	未详细探讨CAFs在HNSCC转移中的其他潜在机制	识别与HNSCC转移相关的CAFs中的基因，并评估其对转移的影响	主要研究头颈部鳞状细胞癌的CAFs及其转移相关基因	数字病理学	头颈癌	单细胞和大规模RNA测序	LASSO回归分析	RNA序列数据	来自转移性和非转移性CAFs的细胞和组织样本
531	2024-08-04	GJA4 expressed on cancer associated fibroblasts (CAFs)-A 'promoter' of the mesenchymal phenotype 2024-Aug, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102009 PMID:38833783	研究论文	研究发现癌相关成纤维细胞上的GJA4能够促进结直肠癌的间充质表型。	揭示了GJA4在肿瘤基质中的致恶机制和其与M2巨噬细胞的协同作用。	未详细探讨GJA4对肿瘤微环境中其他细胞类型的影响。	探讨GJA4在促进结直肠癌中的作用和机制。	结直肠癌（CRC）中的癌相关成纤维细胞（CAFs）。	数字病理学	结直肠癌	单细胞分析、空间转录组学、免疫荧光染色等	NA	组织样本	涉及的样本数量未指定
532	2024-08-04	Zinc ions regulate mitochondrial quality control in neurons under oxidative stress and reduce PANoptosis in spinal cord injury models via the Lgals3-Bax pathway 2024-Aug-20, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2024.05.037 PMID:38782079	研究论文	本研究探讨了锌离子如何通过Lgals3-Bax通路在脊髓损伤模型中调节线粒体质量控制并降低PANoptosis	研究揭示了锌离子在氧化应激下通过靶向Lgals3-Bax通路保护线粒体的机制，为脊髓损伤的治疗提供了一种新的方法	研究对锌离子的作用机制进行了探讨，但可能需要更多的临床数据来进一步验证	本研究旨在探讨锌离子在脊髓损伤中的保护作用及其机制	研究对象为脊髓损伤模型中的神经元	数字病理学	脊髓损伤	单细胞测序	NA	NA	NA
533	2024-08-04	Dysregulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase in cancers: A comprehensive analysis 2024-Aug, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111198 PMID:38697449	研究论文	这篇文章全面分析了磷酸烯醇丙酮酸羧化酶在癌症中的失调及其潜在机制	本研究揭示了PEPCK在不同癌症类型中的表达与临床预后、基因突变及免疫细胞浸润的相关性，并确定了可能的预测生物标志物	尚未深入探讨PEPCK的机制以及在所有癌种中的具体功能	研究PEPCK在不同癌症类型中的表达模式及其与临床相关性的关系	涉及33种不同类型癌症的PEPCK基因表达分析	数字病理学	NA	TCGA数据分析、单细胞测序	NA	基因表达数据、临床数据	33种不同类型癌症的数据集
534	2024-08-04	Blocking the MIR155HG/miR-155 axis reduces CTGF-induced inflammatory cytokine production and α-SMA expression via upregulating AZGP1 in hypertrophic scar fibroblasts 2024-Aug, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111202 PMID:38729323	研究论文	本文探讨了MIR155HG/miR-155轴在增生性瘢痕成纤维细胞中调节细胞因子和α-SMA表达的机制	发现MIR155HG在增生性瘢痕组织中由于DNA甲基化降低而上调，并通过调控miR-155-5p/-3p及AZGP1影响细胞因子产生	研究主要集中在体外模型，可能无法完全反映体内的复杂生理环境	探讨MIR155HG在增生性瘢痕中的作用及其潜在的机制	增生性瘢痕成纤维细胞（HSFBs）及其在细胞因子产生中的作用	数字病理学	NA	qRT-PCR, 西方印迹法, ELISA	NA	RNA测序数据	使用临床样本和各种细胞类型的单细胞测序数据
535	2024-08-05	CXCR4-mediated neutrophil dynamics in periodontitis 2024-Aug, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111212 PMID:38719020	研究论文	本研究旨在通过生物信息学方法识别与免疫相关的致病基因，并分析牙周炎中的免疫细胞浸润与功能	首次证明了CXCR4在牙周炎中的重要致病作用，以及其在调节中性粒细胞动态中的潜在功能	研究中主要依赖于生物信息学分析和动物模型，临床应用效果仍需进一步验证	识别与牙周炎相关的关键免疫致病基因	牙周炎中的中性粒细胞及其相关的免疫反应	数字病理学	牙周炎	scRNA-seq	NA	转录组数据	临床样本和小鼠牙周炎模型
536	2024-08-05	Targeting BMP2 for therapeutic strategies against hepatocellular carcinoma 2024-Aug, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101970 PMID:38797016	研究论文	本研究探讨了BMP2在肝细胞癌（HCC）生长和转移中的作用	文章创新性地结合了单细胞RNA测序和整体RNA测序来分析BMP2在HCC中的关键作用	NA	研究BMP2在肝细胞癌进展中的作用，评估其作为治疗靶点的潜力	肝细胞癌细胞系Huh-7及其相关的HCC模型	数字病理学	肝癌	scRNA-seq和RNA-seq	NA	基因表达数据	NA
537	2024-08-04	The art of healing hearts: Mastering advanced RNA therapeutic techniques to shape the evolution of cardiovascular medicine in biomedical science 2024-Aug, Current problems in cardiology IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102627 PMID:38723793	综述	本文深入分析了心血管疾病背景下RNA疗法的发展状态	强调了各种针对分子生物学基本法则不同阶段的RNA疗法方法	本文未提及具体实验数据或临床试验结果	探讨新的RNA治疗方法及其在心血管疾病中的应用	心血管疾病中的多种编码和非编码RNA候选者	生物医学	心血管疾病	下一代测序技术，单细胞测序技术	NA	RNA，基因组数据	NA
538	2024-08-05	Single-cell transcriptomic analysis of the immune microenvironment in pediatric acute leukemia 2024-Aug-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217018 PMID:38844062	研究论文	该文章对儿童急性白血病的免疫微环境进行了单细胞转录组分析	揭示了不同T细胞亚群与急性髓性白血病（AML）进展和复发相关的特定功能表达程序，并识别了潜在的免疫治疗靶点	文章未提到样本的地理分布和数量限制	深入分析儿童白血病中的肿瘤微环境以改善免疫治疗的有效性	主要研究儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）和急性髓性白血病（AML）患者的骨髓来源T细胞	数字病理学	儿童白血病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA序列数据	儿童B-ALL和AML患者的样本，具体数量未提及
539	2024-08-04	Single-cell transcriptomics reveal the microenvironment landscape of perfluorooctane sulfonate-induced liver injury in female mice 2024-Aug-25, The Science of the total environment DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.173562 PMID:38825197	研究论文	该研究探讨了PFOS对雌性小鼠肝脏微环境的影响	首次通过单细胞转录组学揭示PFOS诱导的肝损伤微环境全景	研究只针对雌性小鼠，可能不适用于其他性别或物种	了解PFOS对雌性小鼠肝脏微环境的影响	以C57BL/6雌性小鼠为研究对象	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	细胞	使用了36529个细胞
540	2024-08-05	Lipidomics and single-cell RNA sequencing reveal lipid and cell dynamics of porcine glycerol-injured skeletal muscle regeneration model 2024-Aug-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.122742 PMID:38797365	研究论文	本文研究了猪的甘油损伤骨骼肌再生模型中的脂质和细胞动态	揭示了TGF-β/SMAD信号通路在脂肪生成和纤维化中的关键调控作用	研究主要集中在猪模型，可能无法完全转化为人类应用	探讨骨骼肌损伤和再生过程中脂质代谢和细胞动态的机制	使用甘油注射诱导的猪骨骼肌损伤模型进行研究	数字病理学	NA	脂质组学, 单细胞RNA测序	NA	NA	使用甘油损伤模型的猪样本