单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
501	2024-08-05	Astrocyte-specific activation of sigma-1 receptors in mPFC mediates the faster onset antidepressant effect by inhibiting NF-κB-induced neuroinflammation 2024-Aug, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.06.008 PMID:38852761	研究论文	本研究探讨了σ-1受体的星形胶质细胞特异性激活如何通过抑制NF-κB引起的神经炎症，从而中介更快速的抗抑郁药效应	本研究首次揭示了YL-0919对抗抑郁效果的星形胶质细胞特异性机制，并强调了σ-1受体在快速抗抑郁中的关键作用	本研究专注于小鼠模型，可能限制了结果的广泛适用性	本研究旨在揭示YL-0919在抑郁样小鼠中通过星形胶质细胞激活σ-1受体的机制	本研究的研究对象为抑郁样小鼠及其星形胶质细胞	数字病理学	抑郁症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多个抑郁样小鼠样本
502	2024-08-05	Endogenous activation of peroxisome proliferator-activated receptor-α in proximal tubule cells in counteracting phosphate toxicity 2024-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology DOI:10.1152/ajprenal.00046.2024 PMID:38870264	研究论文	这篇文章探讨了肾小管上皮细胞内源性活化过氧化物酰化酶-α以对抗磷毒性的机制	首次揭示了PPAR-α和脂肪酸β-氧化在肾小管上皮细胞中的内源性激活作为保护肾脏免受磷毒性的机制	对内源性机制的理解仍然有限，需进一步研究	旨在识别肾脏中对抗磷过负荷的内源性保护机制	对于对照组与饮食磷负荷（Phos）小鼠肾脏进行了单细胞RNA测序分析	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因数据	对照组与磷负荷小鼠的肾脏进行了比较
503	2024-08-05	Elevated Cathepsin S Serum Levels in New-Onset Type 1 Diabetes and Autoantibody-Positive Siblings 2024-Aug-01, Diabetes IF:6.2Q1 DOI:10.2337/db23-0911 PMID:38701365	研究论文	本文研究了1型糖尿病中溶酶体蛋白酶cathepsin S的潜在生物标志物作用	研究首次揭示了1型糖尿病新发患者血清中cathepsin S水平升高与自抗体状态的关联	该研究未明确cathepsin S的保护性或有害性作用	探讨cathepsin S作为1型糖尿病的新发生物标志物的潜力	研究对象包括新发1型糖尿病儿童及其自抗体阳性和阴性兄弟姐妹	NA	1型糖尿病	ELISA、实时qPCR、免疫印迹	NA	血清	包含新发1型糖尿病儿童和其自抗体阳性及阴性兄弟姐妹的样本
504	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing reveals reduced intercellular adhesion molecule crosstalk between activated hepatic stellate cells and neutrophils alleviating liver fibrosis in hepatitis B virus transgenic mice post menstrual blood-derived mesenchymal stem cell transplantation 2024-Aug, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.654 PMID:39040848	研究论文	该研究探讨了月经血来源的间充质干细胞对乙型肝炎病毒转基因小鼠肝纤维化的治疗作用	通过单细胞RNA测序，揭示了激活的肝星状细胞与中性粒细胞之间的细胞间黏附分子相互作用减少的机制	研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类的直接验证	揭示月经血来源的间充质干细胞在肝纤维化治疗中的作用机制	研究对象为乙型肝炎病毒转基因小鼠及其肝组织中的细胞	数字病理学	肝纤维化	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	乙型肝炎病毒转基因小鼠模型，具体样本量未提及
505	2024-08-05	Amphiregulin-producing TH2 cells facilitate esophageal fibrosis of eosinophilic esophagitis 2024-Aug, The journal of allergy and clinical immunology. Global DOI:10.1016/j.jacig.2024.100287 PMID:39040657	研究论文	这篇文章探讨了TH2细胞产生的amphiregulin在嗜酸粒细胞食管炎中的作用，导致食管纤维化。	本研究首次揭示了TH2细胞产生的amphiregulin在食管纤维化中的作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性	本研究主要基于小鼠模型及少量人类样本，可能影响普适性	阐明嗜酸粒细胞食管炎中食管纤维化的细胞和分子机制	研究对象为嗜酸粒细胞食管炎模型小鼠及其对应的人类患者样本	数字病理学	嗜酸粒细胞食管炎	单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学	小鼠模型	组织活检样本	小鼠模型与少量人类患者样本
506	2024-08-05	Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice 2024-Aug, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024 PMID:38286187	研究论文	本文研究了嗜碱性粒细胞在小鼠机械损伤后皮肤屏障功能恢复中的保护作用	揭示了嗜碱性粒细胞通过下调Il17a表达来对抗IL-17A对皮肤屏障功能恢复的不良影响	研究主要在小鼠模型中进行，结果是否适用于人类尚不清楚	探索机械损伤后皮肤屏障功能恢复的机制	小鼠的皮肤屏障功能和细胞反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	细胞	NA
507	2024-08-05	LACC1 deficiency leading to juvenile arthritis and anemia 2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110290 PMID:38944365	研究论文	该研究描述了由LACC1缺失引起的青少年关节炎和贫血的病例	首次识别了两种新的LACC1基因变体，并评估了其对患者炎症标志物的影响及治疗效果	仅基于单例患者的临床数据，样本量较小，需进一步研究验证	探讨LACC1突变对青少年关节炎和贫血的影响及其潜在治疗方案	一名因LACC1的复合杂合变异而出现多关节炎和贫血的患者	数字病理学	青少年关节炎	单细胞RNA测序	NA	临床数据和血清细胞因子水平	1名患者和9名对照患者
508	2024-08-05	NLRP12-associated autoinflammatory disease: A novel causal mutation and bioinformatics analyses 2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110278 PMID:38878806	研究论文	本文报告了一例罕见的NLRP12相关自身炎症疾病及其新发现的突变	研究首次描述了A218V突变，并通过生物信息学分析提供了对NLRP12-AID机制的新见解	研究中病例数量有限，未进行更广泛的人群验证	探讨NLRP12相关自身炎症疾病的机制及其相关突变	一名患有NLRP12-AID的患者及其病理特征	数字病理学	NA	生物信息学分析，F-FDG PET/CT	NA	单细胞转录组数据	1名患者
509	2024-08-05	Determining cellular lineage directed networks in hematopoiesis using single-cell transcriptomic data and volatility-constrained correlation 2024-Aug, Bio Systems DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105248 PMID:38871242	研究论文	该研究利用单细胞转录组数据和波动约束相关性方法确定了造血过程中细胞谱系导向网络	创新点在于应用波动约束相关性方法预测造血过程中细胞类型之间的因果关系和方向性	研究主要基于小鼠骨髓细胞，可能限制其对人类造血过程的普遍适用性	旨在揭示造血过程中细胞谱系的网络结构及其因果关系	研究对象为小鼠骨髓细胞及其相关的造血细胞类型	数字病理学	NA	单细胞转录组测序 (scRNA-seq)	NA	转录组数据	小鼠骨髓细胞样本
510	2024-08-05	Integrated analysis reveals a novel 5-fluorouracil resistance-based prognostic signature with promising implications for predicting the efficacy of chemotherapy and immunotherapy in patients with colorectal cancer 2024-Aug, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1 DOI:10.1007/s10495-024-01981-2 PMID:38824480	研究论文	本文构建了一种新的5-FU耐药相关预后标志物，以预测结直肠癌患者的化疗和免疫治疗效果	建立并验证了5-FU耐药相关标志物5-FRSig模型，并与多个临床特征及治疗效果相关联	未提及具体的样本数量和相关数据的全面性	构建5-FU耐药相关标志物以预测结直肠癌患者的预后	结直肠癌患者	数字病理学	结直肠癌	RNA测序，定量实时聚合酶链反应（RT-qPCR）	统计回归模型	基因组数据	多个结直肠癌队列
511	2024-08-04	Abnormal metabolism in melanocytes participates in the activation of dendritic cell in halo nevus 2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110300 PMID:38950722	研究论文	本研究分析了光晕痣中黑色素细胞的异常代谢及其对树突状细胞激活的影响	首次揭示了光晕痣中黑色素细胞衍生的UDP-G在树突状细胞激活中的重要作用	实验中的样本量和具体机制尚需进一步研究	深入了解光晕痣的进展及其免疫反应的机制	聚焦于光晕痣中黑色素细胞、树突状细胞和相关代谢产物	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	NA	NA
512	2024-08-04	Tissue gene expression profiles and communication networks inform candidate blood biomarker identification in psoriasis and atopic dermatitis 2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110283 PMID:38880200	研究论文	本研究通过空间转录组学识别了银屑病和特应性皮炎患者的转录特征。	本研究首次通过空间转录组学结合体外预测探索了潜在的血液生物标志物，为其他炎症性疾病的研究提供了新方法。	研究可能存在样本规模限制，且对某些转录本的验证仅限于外周血T细胞。	本研究旨在识别银屑病和特应性皮炎的潜在生物标志物。	研究对象为银屑病和特应性皮炎患者的角质形成细胞和特定CD4/CD8 T淋巴细胞。	数字病理学	银屑病, 特应性皮炎	空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
513	2024-08-05	Integrated multi-omics analysis and machine learning developed diagnostic markers and prognostic model based on Efferocytosis-associated signatures for septic cardiomyopathy 2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110301 PMID:38944364	研究论文	这篇文章通过整合多组学分析，揭示了与凋亡细胞吞噬相关的关键基因及其在脓毒症心肌病中的作用	识别了一个新的与凋亡细胞吞噬相关的脓毒症心肌病亚型及诊断生物标志物	NA	探讨凋亡细胞吞噬在脓毒症心肌病中的临床和遗传作用	脓毒症患者的外周血单核细胞及其相关基因	数字病理学	脓毒症心肌病	scRNA-seq	NA	基因数据	感染脓毒症患者的外周血单核细胞
514	2024-08-05	Single-Cell Transcriptome Reveals Cell Type-Specific Molecular Pathology in a 2VO Cerebral Ischemic Mouse Model 2024-Aug, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-023-03755-4 PMID:38180614	研究论文	本研究利用小鼠双血管阻塞缺血模型分析了海马中特定细胞类型的分子病理	首次对2VO模型进行单细胞转录组分析，揭示了不同寻常的少突胶质前体细胞亚型	缺乏对其他脑区的细胞类型-specific基因表达的研究	研究缺血后海马中细胞类型特异性的分子病理	2VO小鼠模型中的海马细胞	数字病理	NA	单细胞转录组分析	2VO模型	细胞	27,069个细胞对应14种细胞类型
515	2024-08-05	Identification of Regulatory RNA-Binding Proteins Associated with Immune Infiltration in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma 2024-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2300498 PMID:38912837	研究论文	本文分析了与喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的替代剪接事件和调节RNA结合蛋白	介绍了新的剪接位点使用变异分析软件和科学反卷积算法，以识别重要的免疫细胞和调节RNA结合蛋白	只使用了从公共数据库下载的数据，可能未涵盖所有相关生物样本	识别与人类喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的调节RNA结合蛋白	研究对象包括20个喉癌及其旁癌组织样本	数字病理学	喉癌	RNA测序	NA	转录组数据	20个喉癌及旁癌组织样本和117个人喉癌样本
516	2024-08-05	Dysregulated energy and protein homeostasis and the loss of GABAergic amacrine cells in aging retina 2024-Aug, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.109985 PMID:38945518	研究论文	本研究阐明了C57BL/6小鼠在衰老过程中的主要视网膜神经元的转录组变化	首次使用单细胞RNA测序技术分析了不同类型视网膜细胞在衰老过程中的独特变化	研究主要集中于C57BL/6小鼠，结果可能不适用于其他品系或物种	探讨衰老过程中视网膜细胞转录组的变化，以理解与衰老相关的视网膜退化机制	1.5-2个月和24-30个月大的C57BL/6小鼠的视网膜细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	两组年龄小鼠(1.5-2个月与24-30个月)
517	2024-08-04	Single-cell transcriptomics of blood identified IFIT1+ neutrophil subcluster expansion in NTM-PD patients 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112412 PMID:38901242	研究论文	这项研究揭示了非结核性分枝杆菌肺病患者外周血免疫细胞的转录组特征	识别出IFIT1+中性粒细胞亚群在非结核性肺病患者中的扩张，以及其在宿主免疫防御中的潜在重要性	样本量较小，仅有六名非结核性肺病患者参与研究	解析非结核性分枝杆菌肺病患者外周血免疫细胞的转录组，以探索潜在的临床标志物	来自六名非结核性肺病患者及两名健康对照的外周血样本	数字病理学	非结核性肺病	单细胞RNA测序	NA	细胞	六名非结核性肺病患者和两名健康对照，共分析了27,898个细胞
518	2024-08-04	Selumetinib overcomes ITGA2-induced 5-fluorouracil resistance in colorectal cancer 2024-Aug-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112487 PMID:38889513	研究论文	本研究探讨了Selumetinib如何克服ITGA2诱导的结直肠癌对5-氟尿嘧啶的耐药性	发现ITGA2与5-FU耐药性之间的关键关系，并提出了结合Selumetinib改善治疗效果的新策略	本研究的结果主要基于细胞模型，临床验证仍需进一步研究	揭示结直肠癌中5-FU耐药性机制及寻找潜在的二线治疗方法	结直肠癌细胞及其与5-FU耐药性的相关基因	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	体内和体外模型	基因组数据	使用了多个GEO数据集中的结直肠癌组织的单细胞RNA测序数据
519	2024-08-05	Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Effects of Circadian Rhythm Disruption on the Metabolic Reprogramming of CD4+ T Cells in Alzheimer's Disease 2024-Aug, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-023-03907-6 PMID:38265551	研究论文	这项研究揭示了生物节律失调对阿尔茨海默病CD4+ T细胞代谢重编程的影响	提出了一种基于23个生物节律相关基因的CRDscore算法，用于有效分类阿尔茨海默病数据集中生物节律状态	缺乏对其他类型免疫细胞的深入研究	阐明生物节律相关基因对阿尔茨海默病T细胞免疫功能的影响机制	研究阿尔茨海默病中的CD4+ T细胞及其代谢	数字病理学	阿尔茨海默病	RNA测序	LASSO, SVM-RFE, RF	脑部样本	112个脑样本
520	2024-08-04	Emerging roles for stromal cells in bone metastasis 2024-Aug, Journal of bone oncology IF:3.1Q2 DOI:10.1016/j.jbo.2024.100610 PMID:38984147	研究论文	本文章探讨了基质细胞在骨转移中的新兴角色	文章强调了间质干细胞在癌症与骨微环境相互作用中的广泛功能及其在癌细胞休眠和免疫肿瘤学中的作用	文章未详细描述特定的实验方法和样本大小	研究基质细胞在癌症骨转移中的作用和机制	主要研究基质干细胞（MSCs）在恶性肿瘤骨转移中的角色	数字病理学	癌症转移	空间转录组学	NA	NA	NA