单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
481	2024-08-07	Corrigendum to "scRNA-Seq and imaging mass cytometry analyses unveil iNKT cells-mediated anti-tumor immunity in pancreatic cancer liver metastasis" [Cancer Lett. (2023 May 1) 561 216149] 2024-Aug-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217071 PMID:38971695	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
482	2024-08-04	Blockade of Discoidin Domain Receptor Signaling with Sitravatinib Reveals DDR2 as a Mediator of Neuroblastoma Pathogenesis and Metastasis 2024-Aug-01, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1 DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0741 PMID:38670553	研究论文	本研究揭示了DDR2作为神经母细胞瘤发病机制和转移的介导者。	此文首次定义了DDR2在神经母细胞瘤中的新功能，以及sitravatinib作为其治疗剂的潜力。	研究仅在特定的肿瘤模型中进行，可能无法全面反映在临床中的效果。	研究sitravatinib对神经母细胞瘤的影响及其作用机制。	主要研究对象为神经母细胞瘤及其相关的受体酪氨酸激酶。	数字病理学	神经母细胞瘤	NA	肿瘤模型	单细胞测序数据	使用了不同的肿瘤相关模型，包括转基因小鼠和人类异种移植
483	2024-08-04	Spatial enrichment and genomic analyses reveal the link of NOMO1 with amyotrophic lateral sclerosis 2024-Aug-01, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1 DOI:10.1093/brain/awae123 PMID:38643019	研究论文	本研究揭示了NOMO1与运动神经元疾病（ALS）之间的关联	使用Entropy加权的差异基因表达矩阵工具SpatialE，首次在运动皮层中识别ALS相关基因的空间富集	本研究主要依赖于有限的样本量及特定脑区的分析，未能全面涵盖所有与ALS相关的区域	旨在研究运动皮层中ALS相关基因的空间分布和与ALS风险的关系	本研究分析了6814名ALS患者和3324名对照的基因组数据	数字病理学	运动神经元疾病	全基因组测序和空间转录组学	NA	基因组数据和转录组数据	6814名ALS患者和3324名对照
484	2024-08-05	Synovial 5-Lipoxygenase-Derived Oxylipins Define a Lympho-Myeloid-Enriched Synovium 2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.42848 PMID:38508862	研究论文	本研究探讨了合成的氧脂类在炎症关节中的作用及其与血浆中的氧脂类的关系	本研究首次揭示了滑膜5-脂氧合酶衍生的氧脂类在淋巴-骨髓丰富的滑膜中的高表达	研究样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性	确定滑膜氧脂类在炎症关节与血浆氧脂类及滑膜组织学模式的相关性	确诊的类风湿关节炎或银屑病关节炎患者的滑膜组织和血浆样本	数字病理学	风湿性关节炎	液相色谱串联质谱	NA	血浆和滑膜组织样本	32个滑膜组织样本和26个配对血浆样本
485	2024-08-05	Molecular Pathways and Cellular Subsets Associated with Adverse Clinical Outcomes in Overlapping Immune-Related Myocarditis and Myositis 2024-Aug-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0011 PMID:38768394	研究论文	该研究探讨了与免疫相关心肌炎和肌炎不良临床结果相关的分子通路和细胞亚群	本研究通过单细胞RNA测序揭示了心肌炎和肌炎中的细胞亚群及其潜在的分子机制，提出了新的治疗靶点	样本量相对较小，仅包含10例重叠心肌炎和肌炎患者	探索免疫检查点疗法引起的心肌炎和肌炎背后的分子机制	心肌炎和肌炎患者的心脏和骨骼肌活检样本	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	细胞样本	总共20个样本（心肌炎与肌炎重叠患者10个，心肌炎单独患者1个，控制组9个）
486	2024-08-05	Single-Cell Analyses Reveal the Metabolic Heterogeneity and Plasticity of the Tumor Microenvironment during Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Progression 2024-Aug-01, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1344 PMID:38718319	研究论文	本研究揭示了头颈部鳞状细胞癌进展过程中肿瘤微环境的代谢异质性和可塑性	确定了SPP1+巨噬细胞作为一种具有高果糖和甘露糖代谢的致瘤和促转移的巨噬细胞亚型	没有提供数据样本的长期随访信息	定义头颈部鳞状细胞癌发展过程中的肿瘤微环境代谢景观	对26个人类患者样本进行单细胞RNA测序	数字病理	头颈部癌症	单细胞RNA测序	NA	组织样本	26个样本，包含正常组织、癌前病变、早期癌症、晚期癌症、淋巴结转移和复发肿瘤
487	2024-08-05	Cellular and molecular landscape of primary dermatofibrosarcoma protuberans: Insights from single-cell RNA sequencing analysis 2024-Aug, Experimental dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/exd.15121 PMID:39081004	研究论文	这项研究利用单细胞 RNA 测序分析了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征。	研究揭示了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞异质性及其分子机制，并建议了潜在的治疗靶点。	研究可能受到样本数量和特定细胞类型的限制。	研究疾病皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征，以了解其生物学行为。	主要研究皮肤纤维肉瘤中的细胞群体及其相互作用。	数字病理学	皮肤癌	单细胞 RNA 测序	NA	基因表达数据	NA
488	2024-08-05	MiR-425-5p suppression of Crebzf regulates oocyte aging via chromatin modification 2024-08, GeroScience IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s11357-023-00875-6 PMID:37532927	研究论文	本研究探讨了miR-425-5p如何通过调节克雷布兹（Crebzf）来影响卵母细胞衰老	提出了miR-425-5p作为治疗女性不孕症的新潜力，并揭示了其通过调控组蛋白甲基转移酶mRNAs的机制	本文未提及具体的样本量和长期影响的研究	研究miR-425-5p在卵母细胞衰老中的作用及其潜在的治疗应用	聚焦于老年女性的卵母细胞及其衰老机制	NA	女性不孕	高通量测序和单细胞RNA测序	NA	生物样本	NA
489	2024-08-05	Correlation of Professional Antigen-Presenting Tbet+CD11c+ B Cells With Bone Destruction in Untreated Rheumatoid Arthritis 2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.42857 PMID:38570939	研究论文	本研究探讨了Tbet+CD11c+ B细胞与未治疗的类风湿关节炎（RA）患者骨破坏之间的关联	首次揭示了Tbet+CD11c+ B细胞在未治疗RA中的功能特性及其对骨破坏的促进作用	样本量较小，且仅涉及未治疗RA患者，可能影响结果的广泛性	研究CD21-/low Tbet+CD11c+ MBCs与骨破坏及其他临床参数的关联	未治疗的类风湿关节炎患者的外周血记忆B细胞	数字病理学	类风湿关节炎	流式细胞术、单细胞RNA测序和V(D)J测序	NA	血液样本	36个来自未治疗RA患者的样本
490	2024-08-04	Comprehensive analysis of single cell and bulk RNA sequencing reveals the heterogeneity of melanoma tumor microenvironment and predicts the response of immunotherapy 2024-Aug, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-024-01905-5 PMID:38896289	研究论文	本文综合分析了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性，并预测了免疫治疗的反应。	提出了一种新的预测生物标志物，揭示了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性。	未提及特定的样本数量和多样性，可能影响结果的普遍适用性	研究黑色素瘤的肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗反应的预测能力。	分析了来自两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据。	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序及批量RNA测序	机器学习模型	基因组数据	分析了两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据
491	2024-08-04	scDrug+: predicting drug-responses using single-cell transcriptomics and molecular structure 2024-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2024.117070 PMID:38964180	研究论文	本文介绍了scDrug+，一个利用单细胞转录组和药物分子结构预测药物反应的综合管道	scDrug+能够通过分析新药的分子结构来预测响应，这是一个新颖的研究方向	对新发现药物的反应预测研究仍然稀缺	研究如何基于单细胞转录组预测药物反应，以推动精准医学	研究对象为药物反应及其与转录组特征的关系	计算机视觉	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
492	2024-08-05	Single-cell insights into mouse testicular toxicity under peripubertal exposure to di(2-ethylhexyl) phthalate 2024-Aug-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2 DOI:10.1093/toxsci/kfae064 PMID:38730545	研究论文	本文首次揭示了小鼠青春期接触环境污染物DEHP后睾丸的单细胞转录组特征	研究中首次使用单细胞RNA测序技术分析DEHP暴露对小鼠睾丸的影响	研究主要基于小鼠模型，尚需进一步验证结果在其他物种中的适用性	探索DEHP在青春期对小鼠睾丸发育的影响及其细胞机制	主要研究对象为幼鼠的睾丸及其相关细胞群体	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	每组8只3周龄的小鼠
493	2024-08-05	CD8+ T Cells Drive Plaque Smooth Muscle Cell Dedifferentiation in Experimental Atherosclerosis 2024-Aug, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320084 PMID:38868941	研究论文	本研究探讨了CD8+ T细胞在既存动脉粥样硬化中对平滑肌细胞的影响	发现CD8+ T细胞能够调控平滑肌细胞的表型，促进其去分化并诱导表现出巨噬细胞样和成骨细胞样特征	研究未能检测到动脉粥样硬化病灶大小的差异	明确CD8+ T细胞在进展性动脉粥样硬化中的作用	研究对象为既有动脉粥样硬化病灶的低密度脂蛋白受体缺失小鼠及其平滑肌细胞	数字病理学	动脉粥样硬化	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	既有动脉粥样硬化病灶的Ldlr-/-小鼠和初代主动脉平滑肌细胞
494	2024-08-04	FASN-mediated fatty acid biosynthesis remodels immune environment in Clonorchis sinensis infection-related intrahepatic cholangiocarcinoma 2024-Aug, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.016 PMID:38508240	研究论文	本文探讨了克隆氏姜蚴感染相关的肝内胆管癌(iCCA)的临床影响及其潜在分子特征。	提供了关于FASN介导的脂肪酸生物合成在克隆氏姜蚴感染相关iCCA中的作用的新见解，并展示了FASN抑制剂与免疫疗法联合使用的潜力。	当前研究的分子特征尚不够明确，可能需要进一步的验证和探索。	研究克隆氏姜蚴感染与肝内胆管癌之间的关系，以及对免疫微环境的影响。	251名来自三个医疗中心的肝内胆管癌患者。	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序、全外显子测序、RNA测序、代谢组学、空间转录组学	小鼠模型	基因组数据和代谢组数据	251名肝内胆管癌患者
495	2024-08-05	Astrocyte-specific activation of sigma-1 receptors in mPFC mediates the faster onset antidepressant effect by inhibiting NF-κB-induced neuroinflammation 2024-Aug, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.06.008 PMID:38852761	研究论文	本研究探讨了σ-1受体的星形胶质细胞特异性激活如何通过抑制NF-κB引起的神经炎症，从而中介更快速的抗抑郁药效应	本研究首次揭示了YL-0919对抗抑郁效果的星形胶质细胞特异性机制，并强调了σ-1受体在快速抗抑郁中的关键作用	本研究专注于小鼠模型，可能限制了结果的广泛适用性	本研究旨在揭示YL-0919在抑郁样小鼠中通过星形胶质细胞激活σ-1受体的机制	本研究的研究对象为抑郁样小鼠及其星形胶质细胞	数字病理学	抑郁症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多个抑郁样小鼠样本
496	2024-08-05	Endogenous activation of peroxisome proliferator-activated receptor-α in proximal tubule cells in counteracting phosphate toxicity 2024-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology DOI:10.1152/ajprenal.00046.2024 PMID:38870264	研究论文	这篇文章探讨了肾小管上皮细胞内源性活化过氧化物酰化酶-α以对抗磷毒性的机制	首次揭示了PPAR-α和脂肪酸β-氧化在肾小管上皮细胞中的内源性激活作为保护肾脏免受磷毒性的机制	对内源性机制的理解仍然有限，需进一步研究	旨在识别肾脏中对抗磷过负荷的内源性保护机制	对于对照组与饮食磷负荷（Phos）小鼠肾脏进行了单细胞RNA测序分析	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因数据	对照组与磷负荷小鼠的肾脏进行了比较
497	2024-08-05	Elevated Cathepsin S Serum Levels in New-Onset Type 1 Diabetes and Autoantibody-Positive Siblings 2024-Aug-01, Diabetes IF:6.2Q1 DOI:10.2337/db23-0911 PMID:38701365	研究论文	本文研究了1型糖尿病中溶酶体蛋白酶cathepsin S的潜在生物标志物作用	研究首次揭示了1型糖尿病新发患者血清中cathepsin S水平升高与自抗体状态的关联	该研究未明确cathepsin S的保护性或有害性作用	探讨cathepsin S作为1型糖尿病的新发生物标志物的潜力	研究对象包括新发1型糖尿病儿童及其自抗体阳性和阴性兄弟姐妹	NA	1型糖尿病	ELISA、实时qPCR、免疫印迹	NA	血清	包含新发1型糖尿病儿童和其自抗体阳性及阴性兄弟姐妹的样本
498	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing reveals reduced intercellular adhesion molecule crosstalk between activated hepatic stellate cells and neutrophils alleviating liver fibrosis in hepatitis B virus transgenic mice post menstrual blood-derived mesenchymal stem cell transplantation 2024-Aug, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.654 PMID:39040848	研究论文	该研究探讨了月经血来源的间充质干细胞对乙型肝炎病毒转基因小鼠肝纤维化的治疗作用	通过单细胞RNA测序，揭示了激活的肝星状细胞与中性粒细胞之间的细胞间黏附分子相互作用减少的机制	研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类的直接验证	揭示月经血来源的间充质干细胞在肝纤维化治疗中的作用机制	研究对象为乙型肝炎病毒转基因小鼠及其肝组织中的细胞	数字病理学	肝纤维化	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	乙型肝炎病毒转基因小鼠模型，具体样本量未提及
499	2024-08-05	Amphiregulin-producing TH2 cells facilitate esophageal fibrosis of eosinophilic esophagitis 2024-Aug, The journal of allergy and clinical immunology. Global DOI:10.1016/j.jacig.2024.100287 PMID:39040657	研究论文	这篇文章探讨了TH2细胞产生的amphiregulin在嗜酸粒细胞食管炎中的作用，导致食管纤维化。	本研究首次揭示了TH2细胞产生的amphiregulin在食管纤维化中的作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性	本研究主要基于小鼠模型及少量人类样本，可能影响普适性	阐明嗜酸粒细胞食管炎中食管纤维化的细胞和分子机制	研究对象为嗜酸粒细胞食管炎模型小鼠及其对应的人类患者样本	数字病理学	嗜酸粒细胞食管炎	单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学	小鼠模型	组织活检样本	小鼠模型与少量人类患者样本
500	2024-08-05	Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice 2024-Aug, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024 PMID:38286187	研究论文	本文研究了嗜碱性粒细胞在小鼠机械损伤后皮肤屏障功能恢复中的保护作用	揭示了嗜碱性粒细胞通过下调Il17a表达来对抗IL-17A对皮肤屏障功能恢复的不良影响	研究主要在小鼠模型中进行，结果是否适用于人类尚不清楚	探索机械损伤后皮肤屏障功能恢复的机制	小鼠的皮肤屏障功能和细胞反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	细胞	NA