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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-10 |
Insights into immune microenvironment and therapeutic targeting in androgen-associated prostate cancer subtypes
2024-08-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68863-0
PMID:39098988
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研究论文 | 本研究通过共识聚类分析基于雄激素反应基因的表达谱，将TCGA数据库中的前列腺癌患者分为C1和C2两个亚型，并探讨了各亚型的免疫浸润差异、突变景观和基因功能通路，以及潜在的治疗靶点 | 本研究通过整合生物信息学方法和机器学习技术，识别了BIRC5、CENPA和MMP11等关键基因作为潜在的治疗靶点，并进行了单细胞转录组分析和虚拟筛选，为个性化治疗策略提供了新见解 | NA | 深入理解前列腺癌生物学特性，为个性化治疗干预和更有效的治疗方法提供依据 | 前列腺癌患者及其雄激素反应基因表达模式 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 共识聚类分析、机器学习技术、单细胞转录组分析、虚拟筛选 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据库中的前列腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-08-10 |
Broadening oncological boundaries: the intratumoral microbiota
2024-Aug, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.01.007
PMID:38310023
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物群的研究现状，探讨了其在肿瘤发生和发展中的功能机制，并提出了未来研究面临的挑战和综合策略 | 本文利用先进技术如单细胞测序，以及逐步优化的功能实验和基于培养的方法，深入探讨肿瘤内微生物群的潜在机制 | 肿瘤内微生物群的低生物量给相关研究带来了重大挑战 | 探讨肿瘤内微生物群作为多种癌症潜在生物标志物的可能性 | 肿瘤内微生物群及其在肿瘤发生和发展中的作用 | NA | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-08-10 |
GATA2 heterozygosity causes an epigenetic feedback mechanism resulting in myeloid and erythroid dysplasia
2024-Aug, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19585
PMID:38887897
|
研究论文 | 本文通过生成带有gata2b杂合突变的斑马鱼模型，研究了GATA2半合子不足对造血的影响，并探讨了其导致的髓系和红细胞发育异常的表观遗传反馈机制。 | 首次通过斑马鱼模型研究GATA2半合子不足对造血的影响，并揭示了表观遗传反馈机制在髓系和红细胞发育异常中的作用。 | NA | 探索GATA2半合子不足对造血的影响及其表观遗传机制。 | GATA2半合子不足对造血的影响及其表观遗传机制。 | NA | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | NA | RNA、染色质可及性数据 | 斑马鱼模型 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-08-09 |
Cisplatin resistance-related transcriptome and methylome integration identifies PCDHB4 as a novel prognostic biomarker in small cell lung cancer
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110413
PMID:39108724
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研究论文 | 本研究通过整合小细胞肺癌的转录组和甲基化组数据，发现PCDHB4作为新的预后生物标志物与顺铂化疗耐药相关 | 首次发现PCDHB4在顺铂耐药的小细胞肺癌中的表达与患者生存率相关，并通过单细胞RNA测序进一步验证了其在肿瘤干细胞特性和上皮-间质转化中的作用 | NA | 探索小细胞肺癌中与顺铂化疗耐药相关的新的预后生物标志物 | 小细胞肺癌患者及顺铂化疗耐药机制 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | RNA测序, 甲基化测序 | Cox回归模型 | 转录组数据, 甲基化数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-08-09 |
scPriorGraph: constructing biosemantic cell-cell graphs with prior gene set selection for cell type identification from scRNA-seq data
2024-Aug-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03357-w
PMID:39103856
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPriorGraph的双通道图神经网络，用于整合多层次基因生物语义，以提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | scPriorGraph通过构建生物语义细胞-细胞图并结合先验基因集选择，有效利用了基因间的生物学意义关系，从而提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-08-09 |
Machine learning-based biomarker screening for acute myeloid leukemia prognosis and therapy from diverse cell-death patterns
2024-08-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68755-3
PMID:39090256
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研究论文 | 本文利用13种程序性细胞死亡途径和73种机器学习组合，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）临床结果和药物反应的6基因指数（PPCDI） | 开发了一种新的6基因指数（PPCDI），该指数通过综合分析多种程序性细胞死亡途径，显示出预测AML患者临床预后和药物敏感性表型的潜力 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测急性髓系白血病的临床预后和药物反应 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 白血病 | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-AML、Tyner和GSE37642-GPL96队列的bulk RNA测序和单细胞RNA测序转录组数据以及匹配的临床病理信息 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-08-09 |
Metastasis-associated fibroblasts in peritoneal surface malignancies
2024-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02717-4
PMID:38783165
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研究论文 | 本文探讨了腹膜表面恶性肿瘤（PSMs）中与转移相关的成纤维细胞（MAFs）的作用及其异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫调节性癌相关成纤维细胞（iCAFs）在PSMs中的普遍性，并探讨了其他主要亚型如肌成纤维细胞样CAFs（myCAFs）和基质CAFs（mCAFs）的分布 | NA | 旨在理解腹膜MAFs与肿瘤细胞间的复杂相互作用，以开发针对性和局部治疗策略，改善PSMs患者的治疗效果 | 腹膜表面恶性肿瘤中的转移相关成纤维细胞及其亚型 | NA | 腹膜表面恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-08-08 |
scTab: Scaling cross-tissue single-cell annotation models
2024-Aug-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51059-5
PMID:39098889
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scTab的自动化细胞类型预测模型，专门针对表格数据，并使用一种新颖的数据增强方案在大量单细胞RNA-seq数据集上进行训练 | scTab模型能够处理大规模数据集，并在跨组织细胞注释中表现出良好的泛化能力，同时数据增强方案提高了模型的泛化性能 | NA | 开发一种能够在大规模单细胞RNA-seq数据集上进行跨组织细胞类型预测的自动化模型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 表格数据 | 2220万细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome reveals the region-specific genes and pathways regulated by Satb2 in neocortical development
2024-Aug-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10672-w
PMID:39095712
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫染色技术，系统研究了Satb2基因在不同新皮质区域发育中的区域特异性基因调控。 | 首次全面描绘了Satb2基因在新皮质发育中的空间调控途径，并揭示了其在不同区域的具体调控基因和通路。 | 研究主要集中在胚胎阶段的Satb2+/+和Satb2-/-小鼠，未涉及成年阶段或其他相关基因的影响。 | 探究Satb2基因在新皮质发育中的区域特异性基因调控及其相关通路。 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的新皮质区域，包括室管膜区（VZ）、室下区（SVZ）、中间区（IZ）和皮质板（CP）。 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，免疫染色 | NA | 转录组数据 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的胚胎阶段样本 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-08-08 |
Genome-wide CRISPR screening identifies tyrosylprotein sulfotransferase-2 as a target for augmenting anti-PD1 efficacy
2024-Aug-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02068-x
PMID:39095793
|
研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选，发现酪氨酰蛋白磺基转移酶-2（TPST2）是增强抗PD1疗效的潜在靶点 | 首次揭示了TPST2在癌症免疫中的抑制作用，并提出其作为免疫检查点疗法治疗靶点的可能性 | NA | 探索影响抗PD1反应性的肿瘤细胞内在因素，并评估TPST2在癌症免疫中的具体作用 | TPST2在癌症免疫中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | NA | NA | CRISPR筛选，共免疫沉淀，质谱分析，RNA测序 | NA | 基因组数据，蛋白质数据，RNA数据 | 在人源化小鼠中进行实验，使用同基因小鼠肿瘤模型进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-08-08 |
Bioengineered human colon organoids with in vivo-like cellular complexity and function
2024-Aug-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.05.007
PMID:38876106
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型的人类结肠类器官模型——“迷你结肠”，通过结合类器官和芯片上的器官技术，实现了与体内组织高度相似的细胞复杂性和功能 | 采用非对称刺激与生长因子结合的方法，显著增强了组织寿命，并模拟了体内细胞类型的多样性和排列 | NA | 开发一种能够精确模拟人体肠道生理和病理的先进类器官模型 | 人类结肠类器官及其在肠道生理和病理研究中的应用 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals that an imbalance in monocyte subsets rather than changes in gene expression patterns is a feature of postmenopausal osteoporosis
2024-Aug-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae065
PMID:38652170
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了绝经后骨质疏松症患者骨髓单核细胞的基因表达模式和亚群比例变化 | 首次揭示了绝经后骨质疏松症中单核细胞亚群比例失衡而非基因表达模式变化是其特征 | 研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以增强结论的普遍性 | 探究绝经后骨质疏松症中单核细胞重编程的机制 | 绝经后骨质疏松症患者的骨髓单核细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6名参与者（3名正常骨密度和3名绝经后骨质疏松症患者） | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-08-07 |
Evaluating batch correction methods for image-based cell profiling
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50613-5
PMID:39095341
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研究论文 | 本文评估了十种单细胞RNA测序（scRNA-seq）批次校正技术在图像细胞分析中的表现 | 提出了一个新的基准框架和评估指标，用于未来批次校正方法的评估 | NA | 解决不同实验室和设备间图像细胞分析数据集成和解释的批次效应问题 | 十种scRNA-seq批次校正技术在Cell Painting数据集上的表现 | 计算机视觉 | NA | scRNA-seq | NA | 图像 | 数十亿个细胞，数千种扰动 | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-08-07 |
Unveiling novel double-negative prostate cancer subtypes through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Aug-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00667-x
PMID:39095562
|
研究论文 | 本研究通过整合多个来源的单细胞RNA测序数据，建立了人类和小鼠的前列腺单细胞图谱，并识别出两种新的双阴性前列腺癌亚型 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出两种新的双阴性前列腺癌亚型，并开发了一个用于可视化基因表达的网络应用 | NA | 揭示前列腺癌中未被识别的亚型，为临床诊断和治疗提供新策略 | 前列腺癌的亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开可用的队列和本研究团队生成的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-08-07 |
The cell fates of intermediate cell population in prostate development
2024-Aug, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2024.100182
PMID:39100536
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析新生泌尿生殖窦组织，揭示了前列腺中间细胞在前列腺发育中的身份、命运和功能 | 发现了前列腺中间细胞在前列腺发育中从表达神经内分泌标记物的中间细胞向神经内分泌细胞的转变，并展示了这些细胞具有显著的干细胞能力 | NA | 探究前列腺中间细胞在前列腺发育中的身份、命运和功能 | 前列腺中间细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 新生泌尿生殖窦组织 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-08-07 |
FLT3+ DC inhibits immune rejection via interaction with Treg in liver transplantation
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112289
PMID:38889505
|
研究论文 | 研究探讨了FLT3+ DC在肝脏移植中通过与Treg相互作用抑制免疫排斥的作用 | 首次揭示了FLT3DCs与调节性T细胞（Tregs）在肝脏移植中的关系，并提出FLT3DCs可能成为减轻肝脏移植免疫排斥的新靶点 | NA | 研究FLT3DCs在肝脏移植中的免疫调节作用 | FLT3+ DCs和调节性T细胞（Tregs） | NA | 肝脏移植 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 包括肝脏移植患者的外周血样本和肝脏组织，以及肝脏移植小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-08-07 |
Akt is a mediator of artery specification during zebrafish development
2024-Aug-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202727
PMID:39101673
|
研究论文 | 本文研究了蛋白激酶B（Akt）在斑马鱼发育过程中对背主动脉（DA）形成的作用 | 揭示了Akt激酶在动脉内皮细胞中作为Notch信号通路上游的作用，并参与正确胚胎动脉的形成 | NA | 探究Akt在斑马鱼胚胎心血管系统中对背主动脉形成的作用 | 斑马鱼胚胎的背主动脉形成过程 | NA | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 四重突变体（aktΔ/Δ）中的akt 1, 2, 3a, 和 3b基因表达和活性显著降低的斑马鱼胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-08-07 |
Exploring prognostic DNA methylation genes in bladder cancer: a comprehensive analysis
2024-Aug-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01206-7
PMID:39095590
|
研究论文 | 本研究旨在探讨膀胱癌中具有预后DNA甲基化位点的基因状态 | 利用多种机器学习算法筛选关键基因，并构建Nomogram模型进行预后评估和药物敏感性分析 | NA | 探索膀胱癌中预后DNA甲基化基因，为预后评估和药物选择提供参考 | 膀胱癌中的DNA甲基化基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 甲基化测序 | Nomogram | 基因组数据 | 来自公共数据库的膀胱癌bulk转录组测序数据、甲基化数据和单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-08-07 |
Advances in single-cell transcriptomics in animal research
2024-Aug-02, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-024-01063-y
PMID:39090689
|
综述 | 本文介绍了单细胞转录组技术的发展，并回顾了其在动物研究中的过程、进展和应用 | 单细胞转录组技术为研究动物不同组织/器官的高通量单细胞基因表达提供了有效方法，能够识别细胞类型/亚型及其标记基因，推断细胞命运轨迹，并揭示细胞间的相互作用 | 讨论了单细胞转录组技术在当前阶段的局限性和展望 | 旨在通过单细胞转录组技术深入理解动物营养与健康、生殖性能、遗传学和不同畜种的疾病模型 | 动物研究中的不同组织/器官的单细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 基于大量案例积累的实践经验 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-08-07 |
Generation of human vascularized and chambered cardiac organoids for cardiac disease modelling and drug evaluation
2024-Aug, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13631
PMID:38453465
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法，通过结合人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的血管球和直接分化的hiPSC心肌细胞，生成具有血管化和心室样结构的人心脏类器官（vcCOs），并探讨了其在心脏损伤模型和药物评估中的应用。 | 本文创新性地开发了一种三步法，用于生成具有心室样结构和血管化的复杂vcCOs，这些vcCOs显示出高自发跳动比率和多细胞类型组成。 | 尽管vcCOs在心脏疾病模型和药物评估中显示出潜力，但其低重复性、有限血管化和心室形成困难等问题仍需进一步解决。 | 研究目的是开发一种新方法，用于生成具有血管化和心室样结构的人心脏类器官，并探索其在心脏疾病模型和药物筛选中的应用。 | 研究对象包括人诱导多能干细胞衍生的心脏类器官（vcCOs）及其在心脏损伤模型和药物评估中的应用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | vcCOs中包含六种细胞类型，包括心肌细胞、心脏前体细胞、内皮细胞、成纤维细胞等 | NA | NA | NA | NA |