单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 534 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
421 2024-08-17
Integration of QTL and comprehensive analysis in the circulating inflammatory cytokines for pan-cancer
2024-Aug-13, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合eQTL和pQTL分析,探讨了循环炎症细胞因子在泛癌中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 首次使用cis-pQTL工具变量进行两样本MR设计,并通过综合敏感性分析验证结果的稳健性 研究仅基于GWAS的汇总统计数据,未涉及个体水平的数据分析 探究循环炎症细胞因子在泛癌中的遗传代理作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 109种细胞因子和趋化因子在18种实体瘤中的作用 数字病理学 NA eQTL, pQTL, GWAS, scRNA细胞分析 两样本MR设计 基因组数据 18种实体瘤 NA NA NA NA
422 2024-08-17
The spatial distribution of intermediate fibroblasts and myeloid-derived cells dictate lymph node metastasis dynamics in oral cancer
2024-Aug-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 研究口腔鳞状细胞癌(GB-OSCC)肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布,以及这些分布如何影响淋巴结转移的动力学 发现了肿瘤-基质界面是GB-OSCC疾病进展最活跃的区域,并识别了与淋巴结转移和疾病进展相关的空间定位基因 NA 探讨口腔鳞状细胞癌肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布,以及这些分布如何影响淋巴结转移 口腔鳞状细胞癌(GB-OSCC)肿瘤边缘的基因和细胞类型 数字病理学 口腔癌 数字空间转录组学 NA 基因表达数据 23个切除的GB-OSCC样本 NA NA NA NA
423 2024-08-17
Toward universal cell embeddings: integrating single-cell RNA-seq datasets across species with SATURN
2024-Aug, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SATURN的深度学习方法,用于学习跨物种的通用细胞嵌入,通过结合蛋白质语言模型的蛋白质嵌入和RNA表达,实现不同物种单细胞RNA测序数据集的整合 SATURN方法能够检测跨物种共同表达的功能相关基因,并为跨物种分析重新定义差异表达 NA 开发一种方法以整合来自不同物种的单细胞RNA测序数据集,揭示细胞类型的保守性和多样性进化过程 跨物种的单细胞RNA测序数据集 机器学习 NA 深度学习 深度学习模型 RNA测序数据 涉及三种物种的整体器官图谱以及蛙和斑马鱼胚胎发育数据集 NA NA NA NA
424 2024-08-16
Treating epidermolytic ichthyosis and ichthyosis with confetti with epidermal autografts cultured from revertant skin
2024-Aug-14, The British journal of dermatology
研究论文 本文评估了从逆转皮肤培养的自体表皮移植物(CEAs)在治疗表皮松解性鱼鳞病(EI)和斑点状鱼鳞病(IWC)患者中的可行性 首次尝试使用从患者自身逆转表皮角质形成细胞生产的CEAs进行治疗,并证明了其潜在的安全性和局部治疗效果 研究样本量小,且在24周后观察到鱼鳞病病变的复发 评估从逆转表皮角质形成细胞生产的自体表皮移植物在EI和IWC患者中的治疗效果 表皮松解性鱼鳞病和斑点状鱼鳞病患者 NA 鱼鳞病 扩增子测序和液滴数字聚合酶链反应分析 NA RNA测序数据 3名患者 NA NA NA NA
425 2024-08-16
Fibroblasts with high matrix metalloproteinase 2 expression regulate CD8+ T-cell residency and inflammation via CD100 in psoriasis
2024-Aug-14, The British journal of dermatology
研究论文 本文探讨了高表达基质金属蛋白酶2(MMP2)的成纤维细胞通过CD100轴调节银屑病中CD8+ T细胞的驻留和炎症的作用。 首次揭示了MMP2hi成纤维细胞通过促进CD100从CD8+ T细胞膜上脱落以及上调CD103,增强CD8+ T细胞驻留,从而加剧银屑病炎症的新机制。 NA 阐明成纤维细胞和MMP2-CD100轴在调节银屑病炎症中的作用。 银屑病患者中的CD8+ T细胞和成纤维细胞。 数字病理学 银屑病 免疫荧光、酶联免疫吸附试验、单细胞转录组测序、细胞相互作用分析、定量逆转录聚合酶链反应。 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据。 从银屑病患者中分离的CD8+ T细胞样本。 NA NA NA NA
426 2024-08-16
[The application of the diagnosis and therapy of single cell sequencing technology in central nervous system tumors]
2024-Aug-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
综述 本文综述了单细胞测序技术在中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后方面的应用 单细胞测序技术为揭示中枢神经系统肿瘤的复杂生态系统提供了机会 大多数研究成果尚未达到临床应用水平 探讨单细胞测序在中枢神经系统肿瘤中的应用及其对肿瘤预后和复发预防的潜在影响 中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后 数字病理学 神经系统肿瘤 单细胞测序技术 NA 细胞 NA NA NA NA NA
427 2024-08-16
Integrated multi-omic analyses uncover the effects of aging on cell-type regulation in glucose-responsive tissues
2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序和代谢组学数据,探讨了衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 首次全面评估了衰老及其相关细胞类型响应的影响,并识别了潜在的血液生物标志物 NA 研究衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 脂肪组织和肌肉组织 组学 NA 转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序、代谢组学 共表达网络分析 转录组、甲基组、单细胞RNA、代谢组 NA NA NA NA NA
428 2024-08-16
Mapping the unicellular transcriptome of the ascending thoracic aorta to changes in mechanosensing and mechanoadaptation during aging
2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 研究揭示了随着年龄增长,升主动脉的单细胞转录组变化及其在机械感应和机械适应性中的作用 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了升主动脉在衰老过程中的细胞衰老、重塑和炎症反应的变化 研究主要集中在升主动脉,对其他部位的主动脉变化未进行详细探讨 探索年龄增长对升主动脉机械感应和适应性的分子机制 升主动脉的单细胞转录组及其在衰老过程中的变化 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 老年和年轻升主动脉组织的单细胞样本 NA NA NA NA
429 2024-08-15
Prdm1 positively regulates liver Group 1 ILCs cancer immune surveillance and preserves functional heterogeneity
2024-Aug-12, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示了Prdm1在调节肝脏cNK细胞和ILC1s功能中的作用,特别是在肝癌免疫监视中的重要性 首次揭示了Prdm1在维持cNK细胞和肝脏ILC1s功能异质性中的新机制 研究主要基于Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型,可能需要进一步的人体研究验证 探索Prdm1在肝脏cNK细胞和ILC1s中的调控机制及其在肝癌免疫治疗中的潜在应用 肝脏cNK细胞和ILC1s的功能及其在肝癌中的作用 免疫学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 使用Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型进行研究 NA NA NA NA
430 2024-08-15
Integrated analysis of spatial transcriptomics and CT phenotypes for unveiling the novel molecular characteristics of recurrent and non-recurrent high-grade serous ovarian cancer
2024-Aug-12, Biomarker research IF:9.5Q1
research paper 本研究通过整合空间转录组学和CT表型数据,揭示了高级别浆液性卵巢癌复发和非复发患者的分子特征 本研究首次结合空间转录组学和CT数据,识别了与高级别浆液性卵巢癌复发相关的特定细胞群富集和差异表达基因 研究样本量较小,仅包括八名患者,可能影响结果的普遍性 探索高级别浆液性卵巢癌的分子特征,为个性化医疗提供诊断和治疗靶点 高级别浆液性卵巢癌的复发和非复发患者 digital pathology 卵巢癌 空间转录组学 (ST) NA 转录组数据 8名高级别浆液性卵巢癌患者 NA NA NA NA
431 2024-08-15
Single-cell landscape revealed immune characteristics associated with disease phases in brucellosis patients
2024-Aug, iMeta IF:23.7Q1
research paper 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了布鲁氏菌病患者在不同疾病阶段的免疫特征 首次系统地揭示了布鲁氏菌病在不同感染阶段的综合免疫反应,特别是急性期的细胞因子风暴和慢性期的Th1反应失调 NA 旨在深入理解布鲁氏菌病的免疫发病机制,并为开发新的有效治疗策略提供依据 布鲁氏菌病患者及健康捐赠者的免疫细胞 digital pathology brucellosis scRNA-seq NA 细胞 290,369个细胞来自35个个体,包括29名布鲁氏菌病患者和6名健康捐赠者 NA NA NA NA
432 2024-08-15
Cell-type-specific expression analysis of liver transcriptomics with clinical parameters to decipher the cause of intrahepatic inflammation in chronic hepatitis B
2024-Aug, iMeta IF:23.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和临床参数,分析了慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的细胞类型特异性表达,以揭示其机制 采用贝叶斯线性模型和群体特异性表达分析(PSEA)将基因表达与临床参数关联,并验证了多免疫染色技术 NA 探讨慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的机制 慢性乙型肝炎患者的肝脏炎症 数字病理学 乙型肝炎 多组学研究 贝叶斯线性模型 转录组数据 来自慢性乙型肝炎患者的肝脏样本 NA NA NA NA
433 2024-08-14
STdGCN: spatial transcriptomic cell-type deconvolution using graph convolutional networks
2024-Aug-05, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了一种利用图卷积网络(STdGCN)进行空间转录组细胞类型反卷积的方法,该方法结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组(ST)数据进行细胞类型鉴定 STdGCN模型在多个数据集上表现优于17种最先进模型,能够准确地描绘肿瘤微环境和组织发育中的细胞交互 NA 开发一种新的方法来提高空间转录组数据的细胞类型分辨率 空间转录组数据中的细胞类型鉴定 数字病理学 乳腺癌,心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组(ST) 图卷积网络(GCN) 转录组数据 多个数据集,包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏ST数据 NA NA NA NA
434 2024-08-14
The society for craniofacial genetics and developmental biology 46th annual meeting
2024-08, American journal of medical genetics. Part A
会议报告 第46届颅面遗传学和发育生物学学会年会在辛辛那提儿童医院医疗中心举行,重点讨论了颅面发育、人类遗传学、转化和再生方法以及临床管理的新发现 NA NA NA NA 发育生物学 NA 空间转录组学 NA NA 122名参会者 NA NA NA NA
435 2024-08-14
Cohesin composition and dosage independently affect early development in zebrafish
2024-Aug-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 研究探讨了斑马鱼中 cohesin 复合体的组成和剂量对早期发育的独立影响 首次展示了斑马鱼中 rad21 或 stag2b 突变体独立影响胚胎尾芽发育,并揭示了 cohesin 的组成和剂量变化对发育的独立影响 研究主要集中在斑马鱼模型上,可能需要进一步的人类细胞或临床数据来验证这些发现 探究 cohesin 复合体的组成和剂量变化对斑马鱼早期发育的独立影响 斑马鱼中的 cohesin 复合体及其突变体 NA NA 单细胞 RNA 测序 NA RNA 涉及斑马鱼 rad21 和 stag2b 突变体的胚胎 NA NA NA NA
436 2024-08-13
Identification of autophagy-related signatures in nonalcoholic fatty liver disease and correlation with non-parenchymal cells of the liver
2024-Aug-12, Molecular omics IF:3.0Q3
研究论文 本研究通过基因表达数据和生物信息学方法,识别了与非酒精性脂肪肝病相关的自噬相关枢纽基因,并探讨了这些基因与肝脏非实质细胞的关系 首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序数据,揭示了非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因与肝脏非实质细胞的关系 研究仅基于两个基因表达数据集和一个单细胞RNA测序数据集,可能存在样本代表性不足的问题 探索非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因的分子机制及其与肝脏非实质细胞的关系 非酒精性脂肪肝病中的自噬相关枢纽基因及其与肝脏非实质细胞的关系 NA 非酒精性脂肪肝病 加权基因共表达网络分析(WGCNA),CIBERSORT算法,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 使用了GSE48452和GSE89632两个基因表达数据集,以及GSE129516单细胞RNA测序数据集 NA NA NA NA
437 2024-08-13
Identifying polyamine related biomarkers in diagnosis and treatment of ulcerative colitis by integrating bulk and single-cell sequencing data
2024-08-05, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合批量和单细胞测序数据,识别与溃疡性结肠炎诊断和治疗相关的聚胺相关生物标志物。 首次通过综合分析批量和单细胞测序数据,识别出与溃疡性结肠炎活动性和治疗反应相关的关键聚胺相关基因。 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在样本选择偏倚;体外和体内实验验证的样本量有限。 旨在识别关键的聚胺相关基因,并探索这些基因与溃疡性结肠炎疾病状态和治疗反应之间的关系。 溃疡性结肠炎患者的聚胺代谢酶及其相关基因。 数字病理学 消化系统疾病 mRNA测序, 单细胞测序 NA 基因表达数据 使用了来自GEO数据库的溃疡性结肠炎患者数据,具体样本数量未详细说明。 NA NA NA NA
438 2024-08-13
Intratumoral Cell Heterogeneity in Patient-Derived Glioblastoma Cell Lines Revealed by Single-Cell RNA-Sequencing
2024-Aug-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序技术研究了来自不同患者的胶质母细胞瘤细胞系的肿瘤内细胞异质性 揭示了患者来源的胶质母细胞瘤细胞系在细胞组成和基因组变异方面的差异 研究仅限于六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 探究胶质母细胞瘤细胞模型中是否保持了肿瘤内异质性 胶质母细胞瘤细胞系和肿瘤样本的细胞组成及基因组变异 数字病理学 脑癌 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 NA NA NA NA
439 2024-08-13
Definition of a Multi-Omics Signature for Esophageal Adenocarcinoma Prognosis Prediction
2024-Aug-01, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,识别了与食管腺癌(EAC)抗肿瘤反应相关的特定免疫细胞类型和差异表达基因,并验证了这些转录特征在TCGA患者队列中的预测效能。 本研究首次系统地分析了食管腺癌的转录特征,并提出了新的免疫生物标志物,用于预测术后预后和个性化辅助治疗决策。 NA 研究旨在识别和验证食管腺癌的转录特征,以预测临床结果和术后预后。 食管腺癌(EAC)的转录特征和免疫细胞类型。 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA RNA序列 TCGA患者队列 NA NA NA NA
440 2024-08-13
Single-cell transcriptomic analysis of B cells reveals new insights into atypical memory B cells in COVID-19
2024-Aug, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了康复期COVID-19患者中S1和受体结合域蛋白特异性B细胞,旨在评估非典型记忆B细胞(MBCs)在严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染中的作用和发展途径 揭示了与疾病严重程度相关的B细胞亚群中的促炎特征,并提出了非典型MBCs通过生发中心的发展途径 NA 评估非典型记忆B细胞在SARS-CoV-2感染中的作用和发展途径 康复期COVID-19患者的S1和受体结合域蛋白特异性B细胞 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 不同临床表现的康复期COVID-19患者 NA NA NA NA
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