单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 537 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-15 |
Cell-type-specific expression analysis of liver transcriptomics with clinical parameters to decipher the cause of intrahepatic inflammation in chronic hepatitis B
2024-Aug, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.221
PMID:39135698
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和临床参数，分析了慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的细胞类型特异性表达，以揭示其机制 | 采用贝叶斯线性模型和群体特异性表达分析（PSEA）将基因表达与临床参数关联，并验证了多免疫染色技术 | NA | 探讨慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的机制 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏炎症 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 多组学研究 | 贝叶斯线性模型 | 转录组数据 | 来自慢性乙型肝炎患者的肝脏样本 |
| 402 | 2024-08-14 |
Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003
PMID:38776915
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析，研究了猪到人肾脏异种移植中的细胞动力学和异种移植与受者之间的相互作用。 | 首次详细描述了异种移植后肾脏和受者外周血单个核细胞的细胞动力学，为优化异种移植结果提供了新的见解。 | 本文主要集中在细胞和分子层面的分析，未涉及临床结果的长期追踪。 | 揭示异种移植过程中的细胞动力学和受者免疫反应，以优化异种移植策略。 | 猪到人肾脏异种移植中的细胞动力学和受者免疫反应。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和纵向RNA测序 | NA | RNA | 两例猪到人肾脏异种移植 |
| 403 | 2024-08-14 |
Enhanced microglial dynamics and a paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contribute to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2024-Aug-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02775-1
PMID:39102080
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研究论文 | 本研究探讨了无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者大脑中与认知抵抗相关的机制，发现AsymAD病例中核心斑块增多、纤维状斑块积累减少以及斑块周围微胶质细胞增多，且病理tau聚集较少。 | 首次揭示了AsymAD病例中斑块微环境中微胶质细胞的高效肌动蛋白细胞运动机制和减少的tau播种活性，这些机制可能保护大脑免受Aβ引发的毒性级联反应。 | NA | 探究无症状阿尔茨海默病患者大脑中抵抗病理变化和认知衰退的机制。 | 无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的大脑组织。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 一批无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的尸检大脑样本 |
| 404 | 2024-08-14 |
STdGCN: spatial transcriptomic cell-type deconvolution using graph convolutional networks
2024-Aug-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03353-0
PMID:39103939
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研究论文 | 本文介绍了一种利用图卷积网络（STdGCN）进行空间转录组细胞类型反卷积的方法，该方法结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST）数据进行细胞类型鉴定 | STdGCN模型在多个数据集上表现优于17种最先进模型，能够准确地描绘肿瘤微环境和组织发育中的细胞交互 | NA | 开发一种新的方法来提高空间转录组数据的细胞类型分辨率 | 空间转录组数据中的细胞类型鉴定 | 数字病理学 | 乳腺癌，心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组（ST） | 图卷积网络（GCN） | 转录组数据 | 多个数据集，包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏ST数据 |
| 405 | 2024-08-14 |
The society for craniofacial genetics and developmental biology 46th annual meeting
2024-08, American journal of medical genetics. Part A
DOI:10.1002/ajmg.a.63615
PMID:38563316
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会议报告 | 第46届颅面遗传学和发育生物学学会年会在辛辛那提儿童医院医疗中心举行，重点讨论了颅面发育、人类遗传学、转化和再生方法以及临床管理的新发现 | NA | NA | NA | NA | 发育生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 122名参会者 |
| 406 | 2024-08-14 |
Cohesin composition and dosage independently affect early development in zebrafish
2024-Aug-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202593
PMID:38975838
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研究论文 | 研究探讨了斑马鱼中 cohesin 复合体的组成和剂量对早期发育的独立影响 | 首次展示了斑马鱼中 rad21 或 stag2b 突变体独立影响胚胎尾芽发育，并揭示了 cohesin 的组成和剂量变化对发育的独立影响 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步的人类细胞或临床数据来验证这些发现 | 探究 cohesin 复合体的组成和剂量变化对斑马鱼早期发育的独立影响 | 斑马鱼中的 cohesin 复合体及其突变体 | NA | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | RNA | 涉及斑马鱼 rad21 和 stag2b 突变体的胚胎 |
| 407 | 2024-08-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies WARS1+ Mesenchymal Stem Cells with Enhanced Immunomodulatory Capacity and Improved Therapeutic Efficacy
2024-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300752
PMID:38856632
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现WARS1高表达的间充质干细胞具有增强的免疫调节能力和改善的治疗效果 | 首次揭示WARS1作为间充质干细胞的主要调节因子，通过维持RhoA-Akt轴来调控其免疫调节特性 | NA | 提高间充质干细胞对银屑病的治疗效果 | 间充质干细胞及其在银屑病治疗中的应用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 408 | 2024-08-13 |
Identification of autophagy-related signatures in nonalcoholic fatty liver disease and correlation with non-parenchymal cells of the liver
2024-Aug-12, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d4mo00060a
PMID:38982979
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研究论文 | 本研究通过基因表达数据和生物信息学方法，识别了与非酒精性脂肪肝病相关的自噬相关枢纽基因，并探讨了这些基因与肝脏非实质细胞的关系 | 首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序数据，揭示了非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因与肝脏非实质细胞的关系 | 研究仅基于两个基因表达数据集和一个单细胞RNA测序数据集，可能存在样本代表性不足的问题 | 探索非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因的分子机制及其与肝脏非实质细胞的关系 | 非酒精性脂肪肝病中的自噬相关枢纽基因及其与肝脏非实质细胞的关系 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），CIBERSORT算法，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 使用了GSE48452和GSE89632两个基因表达数据集，以及GSE129516单细胞RNA测序数据集 |
| 409 | 2024-08-13 |
A Low Expression of NRF2 Enhances Oxidative Stress and Autophagy in Myofibroblasts, Promoting Progression of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Aug-08, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究探讨了NRF2低表达如何通过增强氧化应激和自噬促进肌成纤维细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）进展中的作用。 | 首次揭示了NRF2低表达在肌成纤维细胞中通过激活氧化应激和自噬途径促进COPD进展的机制。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现。 | 探索慢性阻塞性肺疾病中炎症的潜在机制。 | 肌成纤维细胞在COPD进展中的作用及其与NRF2、氧化应激和自噬途径的关系。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用GSE171541数据集中的肺组织单细胞RNA测序数据，并在小鼠模型中进行了实验验证。 |
| 410 | 2024-08-13 |
Identifying polyamine related biomarkers in diagnosis and treatment of ulcerative colitis by integrating bulk and single-cell sequencing data
2024-08-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69322-6
PMID:39103474
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞测序数据，识别与溃疡性结肠炎诊断和治疗相关的聚胺相关生物标志物。 | 首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，识别出与溃疡性结肠炎活动性和治疗反应相关的关键聚胺相关基因。 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚；体外和体内实验验证的样本量有限。 | 旨在识别关键的聚胺相关基因，并探索这些基因与溃疡性结肠炎疾病状态和治疗反应之间的关系。 | 溃疡性结肠炎患者的聚胺代谢酶及其相关基因。 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的溃疡性结肠炎患者数据，具体样本数量未详细说明。 |
| 411 | 2024-08-13 |
Intratumoral Cell Heterogeneity in Patient-Derived Glioblastoma Cell Lines Revealed by Single-Cell RNA-Sequencing
2024-Aug-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25158472
PMID:39126040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究了来自不同患者的胶质母细胞瘤细胞系的肿瘤内细胞异质性 | 揭示了患者来源的胶质母细胞瘤细胞系在细胞组成和基因组变异方面的差异 | 研究仅限于六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 | 探究胶质母细胞瘤细胞模型中是否保持了肿瘤内异质性 | 胶质母细胞瘤细胞系和肿瘤样本的细胞组成及基因组变异 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 |
| 412 | 2024-08-13 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 本文探讨了如何利用系统生物学和单细胞测序技术来识别协调植物生长和发育的候选基因 | 结合系统生物学和单细胞测序技术，以及合成生物学方法来测试假设和定义基因型-表型关系 | 由于复杂的基因网络和通路，识别候选基因仍然是一个挑战 | 探索如何通过工程植物激素信号来协调植物生长、发育和环境响应 | 植物生长和发育的候选基因及其在特定时间和组织背景下的功能 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因序列 | NA |
| 413 | 2024-08-13 |
Definition of a Multi-Omics Signature for Esophageal Adenocarcinoma Prognosis Prediction
2024-Aug-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152748
PMID:39123475
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，识别了与食管腺癌（EAC）抗肿瘤反应相关的特定免疫细胞类型和差异表达基因，并验证了这些转录特征在TCGA患者队列中的预测效能。 | 本研究首次系统地分析了食管腺癌的转录特征，并提出了新的免疫生物标志物，用于预测术后预后和个性化辅助治疗决策。 | NA | 研究旨在识别和验证食管腺癌的转录特征，以预测临床结果和术后预后。 | 食管腺癌（EAC）的转录特征和免疫细胞类型。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA序列 | TCGA患者队列 |
| 414 | 2024-08-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of B cells reveals new insights into atypical memory B cells in COVID-19
2024-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29851
PMID:39132689
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了康复期COVID-19患者中S1和受体结合域蛋白特异性B细胞，旨在评估非典型记忆B细胞（MBCs）在严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染中的作用和发展途径 | 揭示了与疾病严重程度相关的B细胞亚群中的促炎特征，并提出了非典型MBCs通过生发中心的发展途径 | NA | 评估非典型记忆B细胞在SARS-CoV-2感染中的作用和发展途径 | 康复期COVID-19患者的S1和受体结合域蛋白特异性B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同临床表现的康复期COVID-19患者 |
| 415 | 2024-08-12 |
Tumor-associated macrophage clusters linked to immunotherapy in a pan-cancer census
2024-Aug-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00660-4
PMID:39117688
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研究论文 | 本研究通过跨九种癌症类型的单细胞RNA测序分析，识别了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的不同组成模式，并探讨了TAMs在塑造肿瘤微环境（TME）和影响免疫治疗中的作用。 | 首次进行了跨多种癌症类型的TAMs单细胞RNA测序分析，并开发了机器学习模型来预测免疫检查点阻断反应。 | NA | 研究TAMs在不同癌症类型中的普遍特征及其与肿瘤微环境的相互作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在肿瘤微环境（TME）中的功能。 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 九种癌症类型的样本 |
| 416 | 2024-08-12 |
The life-saving benefit of dexamethasone in severe COVID-19 is linked to a reversal of monocyte dysregulation
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.014
PMID:38964327
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research paper | 本文研究了地塞米松在严重COVID-19患者中的治疗机制，发现其通过逆转单核细胞的转录特征来改善生存率 | 首次揭示了地塞米松通过逆转严重COVID-19患者的单核细胞失调来提高生存率的分子机制 | 尽管地塞米松治疗及时，但仍有部分患者病情恶化或死亡 | 探讨地塞米松在严重COVID-19患者中的治疗机制及其对单核细胞的影响 | 严重COVID-19患者的单核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 两组独立队列的致命结果患者 |
| 417 | 2024-08-12 |
Occlusion enhanced pan-cancer classification via deep learning
2024-Aug-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05870-y
PMID:39118043
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GENESO的新框架，通过结合遮挡方法和深度学习进行泛癌分类和标记基因发现 | 提出了一种新的标记基因发现方法Symmetrical Occlusion (SO)，能够模拟基因的“功能获得”和“功能丧失”，并使用较少的关键基因训练出性能更高的LSTM模型 | NA | 开发一种新的深度学习框架，用于泛癌分类和标记基因发现 | RNA-Seq数据中的泛癌样本及其标记基因 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | LSTM | RNA表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 418 | 2024-08-12 |
Single-cell genomic profiling to study regeneration
2024-Aug, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2024.102231
PMID:39053027
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综述 | 本文综述了近年来利用高通量单细胞转录组学和其他单细胞分析技术在不同动物模型中研究再生机制的最新进展 | 探讨了不同动物和细胞类型在再生能力上的差异，并总结了关键概念 | NA | 理解再生过程中的细胞和分子机制 | 不同动物模型中的再生能力 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种动物模型 |
| 419 | 2024-08-12 |
Single-cell landscape reveals the immune heterogeneity of bone marrow involvement in peripheral T-cell lymphoma
2024-Aug, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16227
PMID:38845192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了外周T细胞淋巴瘤患者骨髓浸润的免疫异质性 | 首次揭示了外周T细胞淋巴瘤患者骨髓微环境的单细胞景观 | NA | 探讨外周T细胞淋巴瘤患者骨髓浸润的免疫景观及其与预后的关联 | 外周T细胞淋巴瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11份新鲜骨髓样本 |
| 420 | 2024-08-11 |
MICROPHERRET: MICRObial PHEnotypic tRait ClassifieR using Machine lEarning Techniques
2024-Aug-08, Environmental microbiome
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40793-024-00600-6
PMID:39113074
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研究论文 | 本文利用一系列监督机器学习算法，从广泛可获得的微生物基因组注释中建立了一系列86种代谢和其他生态功能分类模型 | 开发了一种名为MICROPHERRET的工具，能够对微生物基因组进行功能分类，适用于高质量和低质量的基因组数据 | NA | 开发快速自动化的策略，用于微生物基因组的功能分类 | 微生物基因组的功能分类 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | 监督学习模型 | 基因组注释 | 86种功能分类模型 |