单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
401	2024-08-16	Unraveling the connection between Hashimoto's Thyroiditis and non-alcoholic fatty liver disease: exploring the role of CD4+central memory T cells through integrated genetic approaches 2024-Aug, Endocrine IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s12020-024-03745-z PMID:38400881	研究论文	本研究通过综合遗传方法探讨桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的联系，特别是CD4+中央记忆T细胞的作用。	本研究首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化等方法，揭示了CD4+中央记忆T细胞在桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病中的关键作用，并鉴定了MAGI3基因作为这两种疾病的标志基因。	NA	探索桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的潜在联系。	桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的CD4+中央记忆T细胞。	遗传学	桥本甲状腺炎，非酒精性脂肪肝病	单细胞RNA测序，孟德尔随机化	NA	基因表达数据	桥本甲状腺炎、非酒精性脂肪肝病及健康对照的单细胞RNA测序数据
402	2024-08-16	In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution 2024-Aug, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07663-y PMID:39020166	研究论文	本文开发了一种体内单细胞CRISPR策略，用于系统研究150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态，揭示了肿瘤坏死因子（TNF）信号模块在肿瘤进化中的作用。	首次采用体内单细胞CRISPR筛选技术，结合超声引导的子宫内慢病毒微注射、单细胞RNA测序和引导捕获，实时监测克隆扩展并记录其背后的基因程序。	NA	研究肿瘤进化模型中，恶性转化前随机分布的驱动突变如何导致少数克隆转化为恶性肿瘤的机制。	150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态。	数字病理学	鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA
403	2024-08-16	Integrated multi-omic analyses uncover the effects of aging on cell-type regulation in glucose-responsive tissues 2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14199 PMID:38932492	研究论文	本研究通过整合转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序和代谢组学数据，探讨了衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响	首次全面评估了衰老及其相关细胞类型响应的影响，并识别了潜在的血液生物标志物	NA	研究衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响	脂肪组织和肌肉组织	组学	NA	转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序、代谢组学	共表达网络分析	转录组、甲基组、单细胞RNA、代谢组	NA
404	2024-08-16	Tracing Immunological Interaction in Trimethylamine N-Oxide Hydrogel-Derived Zwitterionic Microenvironment During Promoted Diabetic Wound Regeneration 2024-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202402738 PMID:38885961	研究论文	本研究开发了一种新型三甲胺N-氧化物（TMAO）衍生的两性离子水凝胶，用于促进糖尿病伤口愈合，并探索了两性离子水凝胶周围的多细胞生态系统	首次使用两性离子水凝胶促进糖尿病伤口愈合，并通过单细胞RNA测序揭示了不同细胞在两性离子微环境中的作用	NA	解析糖尿病伤口愈合过程中的多细胞特征并寻求治疗策略	糖尿病伤口愈合过程中的免疫调节机制	生物材料	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
405	2024-08-16	Astaxanthin Alleviates Autoimmune Hepatitis by Modulating CD8+ T Cells: Insights From Mass Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analyses 2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202403148 PMID:38874408	研究论文	本研究通过使用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析，探讨了虾青素（ASX）通过调节CD8+ T细胞减轻自身免疫性肝炎（AIH）的作用。	本研究首次通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，揭示了虾青素对CD8+ T细胞数量和功能的调节作用，并预测了关键的转录因子及构建了细胞间通信网络。	研究仅在AIH的小鼠模型中进行，未来需要进一步在人体中验证虾青素的效果和机制。	探讨虾青素在自身免疫性肝炎中的作用及其对CD8+ T细胞的调节机制。	自身免疫性肝炎（AIH）的小鼠模型及CD8+ T细胞。	NA	自身免疫性疾病	质谱流式细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞数据	小鼠模型中的多个样本
406	2024-08-16	Sexually Dimorphic Response to Hepatic Injury in Newborn Suffering from Intrauterine Growth Restriction 2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202403095 PMID:38867614	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了宫内生长受限（IUGR）新生猪肝脏细胞的景观，揭示了性别依赖的IUGR诱导的肝脏损伤模式	首次探索了利用早期发育可塑性逆转不良胎儿编程结果的可能性，并发现了Apolipoprotein A4（APOA4）作为IUGR男性中对抗缺氧的保护性反应的新型生物标志物	研究仅限于猪模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果	研究宫内生长受限对新生儿肝脏功能的影响及性别差异	宫内生长受限的新生猪	NA	肝脏疾病	scRNA-seq	NA	细胞	来自同一胎儿的猪仔
407	2024-08-16	Identification and Characterization of Metastasis-Initiating Cells in ESCC in a Multi-Timepoint Pulmonary Metastasis Mouse Model 2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202401590 PMID:38864342	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，在多时间点肺转移小鼠模型中鉴定并表征了食管鳞状细胞癌（ESCC）中的转移起始细胞（MICs）。	本研究首次鉴定出ESCC中的转移起始细胞，并识别出一组7个转移起始标志基因（MIS），这些基因在功能研究和生物信息学分析中显示出对早期转移微环境的潜在重塑作用。	本研究主要基于小鼠模型和临床样本，未来需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。	旨在鉴定和表征食管鳞状细胞癌中的转移起始细胞，并探索其在早期转移中的作用。	食管鳞状细胞癌（ESCC）中的转移起始细胞（MICs）及其相关标志基因。	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多个时间点的肺转移小鼠模型中的ESCC细胞
408	2024-08-16	Mapping the unicellular transcriptome of the ascending thoracic aorta to changes in mechanosensing and mechanoadaptation during aging 2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14197 PMID:38825882	研究论文	研究揭示了随着年龄增长，升主动脉的单细胞转录组变化及其在机械感应和机械适应性中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了升主动脉在衰老过程中的细胞衰老、重塑和炎症反应的变化	研究主要集中在升主动脉，对其他部位的主动脉变化未进行详细探讨	探索年龄增长对升主动脉机械感应和适应性的分子机制	升主动脉的单细胞转录组及其在衰老过程中的变化	数字病理学	老年疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	老年和年轻升主动脉组织的单细胞样本
409	2024-08-15	Prdm1 positively regulates liver Group 1 ILCs cancer immune surveillance and preserves functional heterogeneity 2024-Aug-12, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.92948 PMID:39133873	研究论文	本研究揭示了Prdm1在调节肝脏cNK细胞和ILC1s功能中的作用，特别是在肝癌免疫监视中的重要性	首次揭示了Prdm1在维持cNK细胞和肝脏ILC1s功能异质性中的新机制	研究主要基于Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型，可能需要进一步的人体研究验证	探索Prdm1在肝脏cNK细胞和ILC1s中的调控机制及其在肝癌免疫治疗中的潜在应用	肝脏cNK细胞和ILC1s的功能及其在肝癌中的作用	免疫学	肝癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA	使用Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型进行研究
410	2024-08-15	Integrated analysis of spatial transcriptomics and CT phenotypes for unveiling the novel molecular characteristics of recurrent and non-recurrent high-grade serous ovarian cancer 2024-Aug-12, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00632-7 PMID:39135097	research paper	本研究通过整合空间转录组学和CT表型数据，揭示了高级别浆液性卵巢癌复发和非复发患者的分子特征	本研究首次结合空间转录组学和CT数据，识别了与高级别浆液性卵巢癌复发相关的特定细胞群富集和差异表达基因	研究样本量较小，仅包括八名患者，可能影响结果的普遍性	探索高级别浆液性卵巢癌的分子特征，为个性化医疗提供诊断和治疗靶点	高级别浆液性卵巢癌的复发和非复发患者	digital pathology	卵巢癌	空间转录组学 (ST)	NA	转录组数据	8名高级别浆液性卵巢癌患者
411	2024-08-15	Single-cell multiomics analysis reveals cell/tissue-specific associations in bipolar disorder 2024-Aug-06, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-024-03044-1 PMID:39107272	研究论文	本研究通过整合多组学数据，探讨了双相情感障碍（BD）的细胞起源和组织异质性	本研究首次发现了一个名为ADCY1的新脑细胞簇，并从高分辨率遗传角度揭示了胶质细胞是与BD相关的主要细胞病理	NA	探讨双相情感障碍的细胞起源和组织异质性	双相情感障碍（BD）的细胞和组织特征	数字病理学	精神疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATAC-seq、RNA-seq、全基因组关联研究（GWAS）	NA	基因组数据	包括8个胚胎和胎儿脑样本（1,266个细胞）、210个成人脑ATAC-seq数据、314个成人脑bulk RNA-seq数据和413,466个GWAS汇总数据
412	2024-08-15	Single-cell landscape revealed immune characteristics associated with disease phases in brucellosis patients 2024-Aug, iMeta IF:23.7Q1 DOI:10.1002/imt2.226 PMID:39135683	research paper	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了布鲁氏菌病患者在不同疾病阶段的免疫特征	首次系统地揭示了布鲁氏菌病在不同感染阶段的综合免疫反应，特别是急性期的细胞因子风暴和慢性期的Th1反应失调	NA	旨在深入理解布鲁氏菌病的免疫发病机制，并为开发新的有效治疗策略提供依据	布鲁氏菌病患者及健康捐赠者的免疫细胞	digital pathology	brucellosis	scRNA-seq	NA	细胞	290,369个细胞来自35个个体，包括29名布鲁氏菌病患者和6名健康捐赠者
413	2024-08-15	Cell-type-specific expression analysis of liver transcriptomics with clinical parameters to decipher the cause of intrahepatic inflammation in chronic hepatitis B 2024-Aug, iMeta IF:23.7Q1 DOI:10.1002/imt2.221 PMID:39135698	研究论文	本研究通过整合多组学数据和临床参数，分析了慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的细胞类型特异性表达，以揭示其机制	采用贝叶斯线性模型和群体特异性表达分析（PSEA）将基因表达与临床参数关联，并验证了多免疫染色技术	NA	探讨慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的机制	慢性乙型肝炎患者的肝脏炎症	数字病理学	乙型肝炎	多组学研究	贝叶斯线性模型	转录组数据	来自慢性乙型肝炎患者的肝脏样本
414	2024-08-14	Enhanced microglial dynamics and a paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contribute to cognitive resilience in Alzheimer's disease 2024-Aug-05, Acta neuropathologica IF:9.3Q1 DOI:10.1007/s00401-024-02775-1 PMID:39102080	研究论文	本研究探讨了无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者大脑中与认知抵抗相关的机制，发现AsymAD病例中核心斑块增多、纤维状斑块积累减少以及斑块周围微胶质细胞增多，且病理tau聚集较少。	首次揭示了AsymAD病例中斑块微环境中微胶质细胞的高效肌动蛋白细胞运动机制和减少的tau播种活性，这些机制可能保护大脑免受Aβ引发的毒性级联反应。	NA	探究无症状阿尔茨海默病患者大脑中抵抗病理变化和认知衰退的机制。	无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的大脑组织。	神经科学	阿尔茨海默病	空间转录组学	NA	组织样本	一批无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的尸检大脑样本
415	2024-08-14	STdGCN: spatial transcriptomic cell-type deconvolution using graph convolutional networks 2024-Aug-05, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-024-03353-0 PMID:39103939	研究论文	本文介绍了一种利用图卷积网络（STdGCN）进行空间转录组细胞类型反卷积的方法，该方法结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST）数据进行细胞类型鉴定	STdGCN模型在多个数据集上表现优于17种最先进模型，能够准确地描绘肿瘤微环境和组织发育中的细胞交互	NA	开发一种新的方法来提高空间转录组数据的细胞类型分辨率	空间转录组数据中的细胞类型鉴定	数字病理学	乳腺癌，心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组（ST）	图卷积网络（GCN）	转录组数据	多个数据集，包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏ST数据
416	2024-08-14	The society for craniofacial genetics and developmental biology 46th annual meeting 2024-08, American journal of medical genetics. Part A DOI:10.1002/ajmg.a.63615 PMID:38563316	会议报告	第46届颅面遗传学和发育生物学学会年会在辛辛那提儿童医院医疗中心举行，重点讨论了颅面发育、人类遗传学、转化和再生方法以及临床管理的新发现	NA	NA	NA	NA	发育生物学	NA	空间转录组学	NA	NA	122名参会者
417	2024-08-14	Cohesin composition and dosage independently affect early development in zebrafish 2024-Aug-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.202593 PMID:38975838	研究论文	研究探讨了斑马鱼中 cohesin 复合体的组成和剂量对早期发育的独立影响	首次展示了斑马鱼中 rad21 或 stag2b 突变体独立影响胚胎尾芽发育，并揭示了 cohesin 的组成和剂量变化对发育的独立影响	研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步的人类细胞或临床数据来验证这些发现	探究 cohesin 复合体的组成和剂量变化对斑马鱼早期发育的独立影响	斑马鱼中的 cohesin 复合体及其突变体	NA	NA	单细胞 RNA 测序	NA	RNA	涉及斑马鱼 rad21 和 stag2b 突变体的胚胎
418	2024-08-14	Single-Cell RNA Sequencing Identifies WARS1+ Mesenchymal Stem Cells with Enhanced Immunomodulatory Capacity and Improved Therapeutic Efficacy 2024-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2300752 PMID:38856632	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，发现WARS1高表达的间充质干细胞具有增强的免疫调节能力和改善的治疗效果	首次揭示WARS1作为间充质干细胞的主要调节因子，通过维持RhoA-Akt轴来调控其免疫调节特性	NA	提高间充质干细胞对银屑病的治疗效果	间充质干细胞及其在银屑病治疗中的应用	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
419	2024-08-13	Identification of autophagy-related signatures in nonalcoholic fatty liver disease and correlation with non-parenchymal cells of the liver 2024-Aug-12, Molecular omics IF:3.0Q3 DOI:10.1039/d4mo00060a PMID:38982979	研究论文	本研究通过基因表达数据和生物信息学方法，识别了与非酒精性脂肪肝病相关的自噬相关枢纽基因，并探讨了这些基因与肝脏非实质细胞的关系	首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序数据，揭示了非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因与肝脏非实质细胞的关系	研究仅基于两个基因表达数据集和一个单细胞RNA测序数据集，可能存在样本代表性不足的问题	探索非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因的分子机制及其与肝脏非实质细胞的关系	非酒精性脂肪肝病中的自噬相关枢纽基因及其与肝脏非实质细胞的关系	NA	非酒精性脂肪肝病	加权基因共表达网络分析（WGCNA），CIBERSORT算法，单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据，单细胞RNA测序数据	使用了GSE48452和GSE89632两个基因表达数据集，以及GSE129516单细胞RNA测序数据集
420	2024-08-13	A Low Expression of NRF2 Enhances Oxidative Stress and Autophagy in Myofibroblasts, Promoting Progression of Chronic Obstructive Pulmonary Disease 2024-Aug-08, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0109298673326250240806051127 PMID:39129168	研究论文	本研究探讨了NRF2低表达如何通过增强氧化应激和自噬促进肌成纤维细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）进展中的作用。	首次揭示了NRF2低表达在肌成纤维细胞中通过激活氧化应激和自噬途径促进COPD进展的机制。	研究主要基于单细胞RNA测序数据和小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现。	探索慢性阻塞性肺疾病中炎症的潜在机制。	肌成纤维细胞在COPD进展中的作用及其与NRF2、氧化应激和自噬途径的关系。	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	使用GSE171541数据集中的肺组织单细胞RNA测序数据，并在小鼠模型中进行了实验验证。