单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
381	2024-08-19	Janus liposozyme for the modulation of redox and immune homeostasis in infected diabetic wounds 2024-Aug, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-024-01660-y PMID:38740936	研究论文	本文报道了一种名为Janus脂酶的新型治疗剂，用于治疗糖尿病伤口感染并促进伤口愈合	开发了一种包含脂质体样硒酶的Janus脂酶，用于清除活性氧（ROS）以恢复组织氧化还原和免疫稳态，并结合光动力疗法治疗感染	NA	研究Janus脂酶在治疗糖尿病伤口感染和促进伤口愈合中的应用	糖尿病伤口感染及伤口愈合过程	NA	糖尿病	光动力疗法	NA	RNA序列	使用T细胞缺陷的Rag1小鼠和迷你猪进行实验
382	2024-08-18	Effects of HOX family regulator-mediated modification patterns and immunity characteristics on tumor-associated cell type in endometrial cancer 2024-08-14, Molecular biomedicine IF:6.3Q1 DOI:10.1186/s43556-024-00196-w PMID:39138733	研究论文	本研究分析了HOX基因在子宫内膜癌中对多种细胞类型表达机制及肿瘤微环境细胞浸润发展的潜在作用	开发了一种新的评分系统来量化子宫内膜癌中的个体HOX模式，并揭示了HOX基因在肿瘤发展和免疫反应中的关键作用	NA	探讨HOX基因在子宫内膜癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响	子宫内膜癌患者的转录组数据和临床信息	数字病理学	子宫内膜癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	529名子宫内膜癌患者
383	2024-08-18	Mechanism exploration of synergistic photo-immunotherapy strategy based on a novel exosome-like nanosystem for remodeling the immune microenvironment of HCC 2024-Aug-14, Nano convergence IF:13.4Q1 DOI:10.1186/s40580-024-00441-6 PMID:39141072	研究论文	本研究开发了一种基于新型外泌体样纳米系统的协同光免疫疗法策略，用于重塑肝细胞癌（HCC）的免疫微环境	通过载有介孔多巴胺（MPDA）和吲哚菁绿（ICG）的M1巨噬细胞衍生的纳米囊泡（M1NVs），实现对肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的M1极化，从而增强抗肿瘤免疫效果	NA	探索基于新型外泌体样纳米系统的协同光免疫疗法策略对肝细胞癌免疫微环境的影响	肝细胞癌（HCC）的免疫微环境	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	比较了HCC组织在接受MPDA/ICG@M1NVs + NIR治疗前后的细胞组成和基因表达
384	2024-08-18	Generation of a conditional cellular senescence model using proximal tubule cells and fibroblasts from human kidneys 2024-Aug-14, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-024-02131-y PMID:39143064	研究论文	本研究通过使用人肾近端小管上皮细胞（PTECs）和成纤维细胞，生成了一个条件性永生化的细胞衰老模型	本研究提供了一个新的体外细胞模型，用于研究肾脏衰老，并可作为大规模化合物测试的平台	NA	研究细胞衰老在慢性肾脏疾病（CKD）中的具体机制和相关因素	人肾近端小管上皮细胞（PTECs）和成纤维细胞	NA	慢性肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	76个人类肾脏组织切片
385	2024-08-18	Spatial multiomics reveals a subpopulation of fibroblasts associated with cancer stemness in human hepatocellular carcinoma 2024-Aug-13, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01367-8 PMID:39138551	研究论文	本研究通过结合多区域蛋白质组学、10X Genomics Visium空间转录组学和多重成像技术，揭示了肝癌微环境中与癌症干细胞特性相关的纤维母细胞亚群F5-CAF的表达异质性、功能多样性、空间分布、共定位和相互作用。	首次鉴定出与肝癌干细胞特性相关的纤维母细胞亚群F5-CAF，并阐明了其在肝癌微环境中的作用机制。	研究样本量相对较小，未来需要更大规模的研究来验证这些发现。	揭示肝癌微环境中纤维母细胞亚群与癌症干细胞特性的关联及其对肝癌发展的影响。	肝癌微环境中的纤维母细胞亚群及其与癌症干细胞的相互作用。	数字病理学	肝癌	多区域蛋白质组学、10X Genomics Visium空间转录组学、多重成像技术	NA	蛋白质组学数据、转录组学数据、成像数据	6名患者的多区域蛋白质组学样本、11名患者的空间转录组学样本、92名患者的多重成像样本
386	2024-08-18	CXCR6 expression correlates with radiotherapy response and immune context in triple-negative breast cancer-experimental studies 2024-Aug-01, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000001546 PMID:39143706	研究论文	本研究探讨了CXCR6在三阴性乳腺癌中的表达及其与放疗反应和免疫环境的关系	首次揭示了CXCR6在三阴性乳腺癌中的临床意义及其与放疗的关联	NA	阐明CXCR6在三阴性乳腺癌中的预后价值及其在乳腺肿瘤微环境中的作用	CXCR6在三阴性乳腺癌中的mRNA和蛋白质表达及其与生存率的关联	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序、批量转录组测序数据和基于荧光的多重免疫组织化学技术	NA	mRNA、蛋白质	NA
387	2024-08-17	Histone lactylation dynamics: Unlocking the triad of metabolism, epigenetics, and immune regulation in metastatic cascade of pancreatic cancer 2024-Aug-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217117 PMID:39019144	研究论文	本研究通过多组学方法探讨了组蛋白乳酸化在胰腺导管腺癌（PDAC）进展中的病理作用及其对预后预测、患者分层和肿瘤微环境（TME）表征的潜在影响	本研究揭示了“LDHA-H4K12la-免疫基因”轴在代谢-表观遗传-免疫调控框架中的新节点，为PDAC进展提供了新的视角	NA	探索组蛋白乳酸化在胰腺癌转移过程中的作用及其对代谢、表观遗传和免疫调控的影响	胰腺导管腺癌（PDAC）的进展和转移	表观遗传学	胰腺癌	多组学方法（bulk和单细胞RNA测序、代谢组学、ATAC-seq和CUT&Tag）	NA	RNA序列、代谢数据	NA
388	2024-08-17	A single-cell analysis of the NK-cell landscape reveals that dietary restriction boosts NK cell antitumor immunity via Eomesdermin 2024-Aug-16, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0944 PMID:39150687	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了饮食限制（DR）如何通过Eomesdermin增强NK细胞的抗肿瘤免疫	首次揭示了饮食限制通过Eomesdermin调控NK细胞，增强其抗肿瘤免疫功能	NA	研究饮食限制如何通过调节免疫细胞增强抗肿瘤免疫	NK细胞及其在饮食限制下的抗肿瘤免疫作用	免疫学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及小鼠模型和NK细胞样本
389	2024-08-17	Bipotential B-neutrophil progenitors are present in human and mouse bone marrow and emerge in the periphery upon stress hematopoiesis 2024-Aug-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.01599-24 PMID:39012145	研究论文	本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了健康对照组和COVID-19患者的嗜中性粒细胞，揭示了在严重感染情况下B细胞和嗜中性粒细胞谱系之间的潜在关系。	首次在人类和小鼠骨髓中发现双潜能B-嗜中性粒细胞前体，并揭示了在应激造血过程中这些细胞在周围组织中的出现及其在严重感染中的潜在作用。	NA	探究COVID-19患者中嗜中性粒细胞反应的复杂性，并揭示B细胞和嗜中性粒细胞谱系在严重感染中的关系。	健康对照组和COVID-19患者的嗜中性粒细胞，以及人类和小鼠骨髓中的粒细胞。	数字病理学	NA	RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	RNA	健康对照组和COVID-19患者的嗜中性粒细胞样本，以及人类和小鼠骨髓中的粒细胞样本。
390	2024-08-17	Cryptosporidium impacts epithelial turnover and is resistant to induced death of the host cell 2024-Aug-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.01720-24 PMID:38995074	研究论文	研究了隐孢子虫感染对小肠上皮细胞动态结构的影响	发现隐孢子虫感染的上皮细胞不易发生凋亡，且感染导致上皮细胞增殖和迁移增加	NA	探讨隐孢子虫感染对小肠上皮细胞动态结构的影响及其对细胞凋亡的调节作用	隐孢子虫感染的小肠上皮细胞	NA	腹泻疾病	单细胞RNA测序	NA	图像和分子数据	NA
391	2024-08-17	Integration of QTL and comprehensive analysis in the circulating inflammatory cytokines for pan-cancer 2024-Aug-13, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-024-12726-4 PMID:39138392	研究论文	本研究通过整合eQTL和pQTL分析，探讨了循环炎症细胞因子在泛癌中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响	首次使用cis-pQTL工具变量进行两样本MR设计，并通过综合敏感性分析验证结果的稳健性	研究仅基于GWAS的汇总统计数据，未涉及个体水平的数据分析	探究循环炎症细胞因子在泛癌中的遗传代理作用及其对肿瘤免疫微环境的影响	109种细胞因子和趋化因子在18种实体瘤中的作用	数字病理学	NA	eQTL, pQTL, GWAS, scRNA细胞分析	两样本MR设计	基因组数据	18种实体瘤
392	2024-08-17	The spatial distribution of intermediate fibroblasts and myeloid-derived cells dictate lymph node metastasis dynamics in oral cancer 2024-Aug-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05511-1 PMID:39138492	研究论文	研究口腔鳞状细胞癌（GB-OSCC）肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布，以及这些分布如何影响淋巴结转移的动力学	发现了肿瘤-基质界面是GB-OSCC疾病进展最活跃的区域，并识别了与淋巴结转移和疾病进展相关的空间定位基因	NA	探讨口腔鳞状细胞癌肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布，以及这些分布如何影响淋巴结转移	口腔鳞状细胞癌（GB-OSCC）肿瘤边缘的基因和细胞类型	数字病理学	口腔癌	数字空间转录组学	NA	基因表达数据	23个切除的GB-OSCC样本
393	2024-08-17	Single-cell long-read targeted sequencing reveals transcriptional variation in ovarian cancer 2024-Aug-12, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51252-6 PMID:39134520	研究论文	本文开发了一种名为scTaILoR-seq的单细胞靶向长读长测序方法，用于揭示卵巢癌中的转录变异	scTaILoR-seq方法通过靶向捕获感兴趣的基因，提高了单细胞中目标转录本的检测数量，增强了RNA异构体的全面表征能力	长读长测序技术在单细胞RNA异构体检测中受到通量较低和非预期序列伪影的影响	开发一种新的单细胞长读长靶向测序方法，以探索单细胞分辨率下的转录变异	卵巢癌细胞系和原发性肿瘤中的RNA异构体	数字病理学	卵巢癌	单细胞靶向异构体长读长测序（scTaILoR-seq）	NA	转录组数据	10,796个单细胞转录组
394	2024-08-17	Mutual exclusivity and co-occurrence patterns of immune checkpoints indicate NKG2A relates to anti-PD-1 resistance in gastric cancer 2024-Aug-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05503-1 PMID:39097734	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和多元线性回归交互模型，分析了胃癌中CD8+ T细胞的免疫检查点表达特征及其与抗PD-1治疗抵抗的关系。	揭示了两种不同的免疫检查点表达模式（ICEP），并阐明了NKG2A与PD-1的互斥性和共现特征，为胃癌提供了新的免疫治疗靶点。	NA	探索克服胃癌中抗PD-1治疗抵抗的新机会，并识别与抗PD-1抑制剂联合使用的最佳免疫检查点抑制剂组合方案。	胃癌中的CD8+ T细胞及其免疫检查点表达模式。	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	多元线性回归交互模型	RNA	NA
395	2024-08-17	The shared role of neutrophils in ankylosing spondylitis and ulcerative colitis 2024-Aug, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-024-00286-3 PMID:39060428	研究论文	本研究通过单细胞测序数据分析，探讨了强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞的相互作用	发现了中性粒细胞在两种疾病中的重要作用，并识别出XBP1作为潜在的治疗靶点	样本量较小，仅包括三名强直性脊柱炎患者	研究强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞的相互作用	强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎患者的椎骨骨髓血液	NA	强直性脊柱炎, 溃疡性结肠炎	10X单细胞测序	NA	单细胞数据	三名强直性脊柱炎患者
396	2024-08-17	Toward universal cell embeddings: integrating single-cell RNA-seq datasets across species with SATURN 2024-Aug, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02191-z PMID:38366243	研究论文	本文介绍了一种名为SATURN的深度学习方法，用于学习跨物种的通用细胞嵌入，通过结合蛋白质语言模型的蛋白质嵌入和RNA表达，实现不同物种单细胞RNA测序数据集的整合	SATURN方法能够检测跨物种共同表达的功能相关基因，并为跨物种分析重新定义差异表达	NA	开发一种方法以整合来自不同物种的单细胞RNA测序数据集，揭示细胞类型的保守性和多样性进化过程	跨物种的单细胞RNA测序数据集	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	RNA测序数据	涉及三种物种的整体器官图谱以及蛙和斑马鱼胚胎发育数据集
397	2024-08-16	Treating epidermolytic ichthyosis and ichthyosis with confetti with epidermal autografts cultured from revertant skin 2024-Aug-14, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljae193 PMID:38739763	研究论文	本文评估了从逆转皮肤培养的自体表皮移植物（CEAs）在治疗表皮松解性鱼鳞病（EI）和斑点状鱼鳞病（IWC）患者中的可行性	首次尝试使用从患者自身逆转表皮角质形成细胞生产的CEAs进行治疗，并证明了其潜在的安全性和局部治疗效果	研究样本量小，且在24周后观察到鱼鳞病病变的复发	评估从逆转表皮角质形成细胞生产的自体表皮移植物在EI和IWC患者中的治疗效果	表皮松解性鱼鳞病和斑点状鱼鳞病患者	NA	鱼鳞病	扩增子测序和液滴数字聚合酶链反应分析	NA	RNA测序数据	3名患者
398	2024-08-16	Fibroblasts with high matrix metalloproteinase 2 expression regulate CD8+ T-cell residency and inflammation via CD100 in psoriasis 2024-Aug-14, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljae205 PMID:38752329	研究论文	本文探讨了高表达基质金属蛋白酶2（MMP2）的成纤维细胞通过CD100轴调节银屑病中CD8+ T细胞的驻留和炎症的作用。	首次揭示了MMP2hi成纤维细胞通过促进CD100从CD8+ T细胞膜上脱落以及上调CD103，增强CD8+ T细胞驻留，从而加剧银屑病炎症的新机制。	NA	阐明成纤维细胞和MMP2-CD100轴在调节银屑病炎症中的作用。	银屑病患者中的CD8+ T细胞和成纤维细胞。	数字病理学	银屑病	免疫荧光、酶联免疫吸附试验、单细胞转录组测序、细胞相互作用分析、定量逆转录聚合酶链反应。	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据。	从银屑病患者中分离的CD8+ T细胞样本。
399	2024-08-16	[The application of the diagnosis and therapy of single cell sequencing technology in central nervous system tumors] 2024-Aug-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine] DOI:10.3760/cma.j.cn112150-20231208-00417 PMID:39142884	综述	本文综述了单细胞测序技术在中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后方面的应用	单细胞测序技术为揭示中枢神经系统肿瘤的复杂生态系统提供了机会	大多数研究成果尚未达到临床应用水平	探讨单细胞测序在中枢神经系统肿瘤中的应用及其对肿瘤预后和复发预防的潜在影响	中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后	数字病理学	神经系统肿瘤	单细胞测序技术	NA	细胞	NA
400	2024-08-16	Integrated Single-Cell RNA-seq and ATAC-seq Reveals Heterogeneous Differentiation of CD4+ Naive T Cell Subsets is Associated with Response to Antidepressant Treatment in Major Depressive Disorder 2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202308393 PMID:38867657	研究论文	本研究通过综合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC-seq技术，分析了8名健康个体和8名重度抑郁症（MDD）患者在接受抗抑郁治疗前后的外周血单个核细胞，揭示了CD4+幼稚T细胞亚群的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联。	本研究首次结合scRNA-seq和ATAC-seq技术，揭示了MDD患者中CD4+幼稚T细胞的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联，并识别出响应者中特定激活的CD4+幼稚T细胞群及其上游调控因子ETS。	研究样本量较小，且仅包括8名MDD患者和8名健康个体，可能影响结果的普遍性。	探讨重度抑郁症患者抗抑郁治疗反应的分子机制。	重度抑郁症（MDD）患者和健康个体的外周血单个核细胞。	数字病理学	抑郁症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC-seq	NA	RNA和染色质可及性数据	8名MDD患者和8名健康个体