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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of high-fat diet on oocyte and early embryo development in female mice
2024-Aug-20, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01279-7
PMID:39164729
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研究论文 | 本研究通过建立高脂饮食诱导的肥胖雌性小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术探讨了高脂饮食对小鼠卵母细胞和早期胚胎发育的影响 | 首次采用单细胞RNA测序技术探索高脂饮食诱导的肥胖小鼠在不同阶段胚胎的转录组变化 | NA | 研究高脂饮食对雌性小鼠卵巢功能和早期胚胎发育的具体发病机制 | 高脂饮食诱导的肥胖雌性小鼠的系统代谢、卵巢形态和卵母细胞功能 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-24 |
Applications of single-cell technologies in drug discovery for tumor treatment
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110486
PMID:39171294
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综述 | 本文综述了单细胞技术在肿瘤治疗药物发现中的应用 | 介绍了新兴的单细胞分析技术,如多维单细胞分子特征整合、单细胞数据规模扩展、单细胞基因表型影响分析和全长度覆盖单细胞测序 | NA | 系统总结单细胞技术在肿瘤治疗药物发现各阶段的应用,并强调其在深入理解肿瘤生物学中的作用 | 单细胞技术在药物发现中的应用,包括靶点识别、高通量药物筛选和药代动力学评估 | 生物技术 | 肿瘤 | 单细胞技术 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-24 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor landscape in ovarian carcinosarcoma
2024-Aug-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2300407
PMID:39155781
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析了卵巢癌肉瘤(OCS)的细胞组成和分子特征 | 首次提供了人类OCS的单细胞转录组特征,为阐明OCS的多样性提供了新的资源 | NA | 通过单细胞RNA测序技术揭示卵巢癌肉瘤的肿瘤景观 | 卵巢癌肉瘤的细胞组成和分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-24 |
A pan-cancer cuproptosis signature predicting immunotherapy response and prognosis
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35404
PMID:39170145
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research paper | 本文通过分析多个单细胞RNA测序数据集,开发了一种泛癌铜死亡特征(Cup.Sig),用于预测免疫治疗反应和预后 | 首次开发了一种泛癌铜死亡特征,用于预测免疫治疗反应和预后 | NA | 开发一种泛癌铜死亡特征,用于预测生存和免疫治疗反应 | 泛癌铜死亡特征及其在免疫治疗反应和预后预测中的应用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 28个scRNA-seq数据集,TCGA泛癌队列和10个免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-24 |
Single-cell sequencing analysis revealed that WDR72 was a novel cancer stem cells related gene in gastric cancer
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35549
PMID:39170171
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了WDR72作为胃癌中与癌症干细胞相关的新基因 | 首次发现WDR72作为胃癌中与癌症干细胞相关的新基因 | NA | 探索胃癌上皮细胞中与癌症干细胞相关的基因 | 胃癌上皮细胞中的癌症干细胞相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-24 |
Screening chondrocyte necroptosis-related genes in the diagnosis and treatment of osteoarthritis
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35263
PMID:39170298
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析了骨关节炎中软骨细胞坏死调控的相关基因,并构建了机器学习模型进行药物分子对接验证。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨关节炎中调控软骨细胞坏死的机制,并验证了nimesulide作为潜在抑制剂的可能性。 | 研究主要集中在体外实验和数据分析,需要进一步的临床试验验证nimesulide的疗效。 | 探讨骨关节炎中软骨细胞坏死相关基因的诊断和治疗潜力。 | 骨关节炎中的软骨细胞坏死相关基因。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 贝叶斯模型 | RNA序列 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-24 |
Single-cell RNA-Seq reveals the heterogeneity of fibroblasts within the tympanojugular paraganglioma microenvironment
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35478
PMID:39170307
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和全外显子测序分析了六例手术切除的鼓室颈静脉副神经节瘤样本,揭示了瘤内纤维母细胞的异质性及其在瘤微环境中的复杂作用 | 首次建立了针对鼓室颈静脉副神经节瘤的全面转录组图谱,并详细描述了纤维母细胞在瘤微环境中的多方面作用及其细胞间通讯网络 | NA | 研究鼓室颈静脉副神经节瘤的细胞组成和瘤内异质性,以及纤维母细胞在瘤微环境中的具体贡献 | 鼓室颈静脉副神经节瘤样本及其细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,全外显子测序 | NA | 转录组数据 | 六例手术切除的鼓室颈静脉副神经节瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-24 |
Dysregulated T-cell homeostasis and decreased CD30+ Treg proliferating in aplastic anemia
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35775
PMID:39170389
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了再生障碍性贫血(AA)患者中T细胞稳态的潜在破坏,并识别了CD4 T常规细胞和Treg细胞的变化 | 首次揭示了AA患者中CD30 Treg细胞亚群的减少及其高增殖和显著的免疫抑制表型,并提出异常的TNFSF8/TNFRSF8信号通路可能通过增加CD30 Treg细胞的破坏导致T细胞免疫功能障碍 | NA | 阐明再生障碍性贫血中自身反应性T细胞在疾病发展中的精确作用,以促进治疗和诊断策略的进步 | 再生障碍性贫血患者的CD8 T细胞、常规CD4 T细胞和Treg细胞 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞转录组分析,流式细胞术,RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-24 |
Galectin-3 induces pathogenic immunosuppressive macrophages through interaction with TREM2 in lung cancer
2024-Aug-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03124-6
PMID:39135069
|
研究论文 | 本研究探讨了半乳糖凝集素-3通过与TREM2相互作用诱导肺肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制作用 | 揭示了半乳糖凝集素-3与TREM2在肺肿瘤相关巨噬细胞中的未知关联,并提出同时抑制半乳糖凝集素3和TREM2作为肺肿瘤治疗的新策略 | NA | 研究TREM2表达的肿瘤相关巨噬细胞的招募机制及其介导免疫抑制的配体 | 肺肿瘤相关巨噬细胞及其免疫抑制作用 | 数字病理学 | 肺肿瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,质谱分析,免疫沉淀 | NA | 细胞 | 使用TREM2f/f-Lyz2-cre小鼠模型进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-24 |
Heterogeneity of Wnt1-Cre-marked and Pax2-Cre-marked first branchial arch cranial neural crest cells in mice
2024-Aug-01, Hua xi kou qiang yi xue za zhi = Huaxi kouqiang yixue zazhi = West China journal of stomatology
DOI:10.7518/hxkq.2024.2023374
PMID:39049630
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研究论文 | 本研究旨在探讨Wnt1-Cre标记和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞的异质性和基因本体 | 本研究通过单细胞RNA测序和实时荧光定量PCR技术,揭示了Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的神经嵴细胞在不同组织中的表达差异及其在细胞分化和骨化中的作用 | NA | 探索Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞的异质性和基因本体 | Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 实时荧光定量PCR | NA | RNA | Wnt1-Cre;R26RmTmG和Pax2-Cre;R26RmTmG小鼠的胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-24 |
scRNMF: An imputation method for single-cell RNA-seq data by robust and non-negative matrix factorization
2024-Aug, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012339
PMID:39116191
|
研究论文 | 本文提出了一种基于鲁棒和非负矩阵分解的单细胞RNA测序数据插补方法scRNMF | scRNMF方法结合了L2损失和C损失函数,C损失函数对大误差的惩罚较小,使得在处理异常值时更加鲁棒 | NA | 开发有效的插补方法以克服单细胞RNA测序数据中的高缺失率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 非负矩阵分解 | NA | RNA测序数据 | 使用了不同大小和零率的各种数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-24 |
Neutrophil extracellular trap related risk score exhibits crucial prognostic value in skin cutaneous melanoma, associating with distinct immune characteristics
2024-Aug, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.70008
PMID:39167030
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研究论文 | 本文构建了与中性粒细胞外陷阱(NETs)相关的基因特征,并探讨了其在皮肤皮肤黑色素瘤(SKCM)中的预后价值及免疫特征 | 首次构建了基于五个NET基因的预后模型,并探讨了其在SKCM中的预后能力和免疫特征 | NA | 研究NETs在皮肤皮肤黑色素瘤中的预后价值及免疫特征 | 皮肤皮肤黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | LASSO Cox回归分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA-SKCM队列和GSE115978数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-23 |
Single-cell RNA sequencing of OSCC primary tumors and lymph nodes reveals distinct origin and phenotype of fibroblasts
2024-Aug-20, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217180
PMID:39154702
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了口腔鳞状细胞癌(OSCC)原发肿瘤和淋巴结中成纤维细胞的表型、功能和起源差异 | 首次系统地研究了OSCC中淋巴结转移灶内成纤维细胞的表型和功能异质性,并揭示了两种不同亚型的癌症相关肌成纤维细胞(mCAFs)的起源 | 研究样本仅限于三名OSCC患者,可能影响结果的普遍性 | 探究OSCC中原发肿瘤和淋巴结中成纤维细胞的表型、功能和起源差异 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 44,052个成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-23 |
Targeting treatment resistance: unveiling the potential of RNA methylation regulators and TG-101,209 in pan-cancer neoadjuvant therapy
2024-Aug-19, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03111-x
PMID:39160604
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研究论文 | 本研究探讨了RNA甲基化调控因子(RMRs)和TG-101,209在泛癌新辅助治疗中的潜在作用 | 揭示了RMRs在泛癌新辅助治疗中的预测作用,并验证了JAK抑制剂TG-101,209对高RMR表达肿瘤的免疫微环境的影响 | 需要进一步的验证研究以全面理解RNA甲基化调控因子在临床应用中的效用及其对患者预后的影响 | 研究RMRs在泛癌新辅助治疗中的作用,并探索TG-101,209作为辅助治疗策略的效果 | 泛癌患者的新辅助化疗和免疫治疗效果 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、全基因组测序、RNA测序、蛋白质组学、机器学习 | 机器学习算法 | 单细胞测序数据、多组学数据 | 泛癌队列 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-23 |
Reorganization of H3K9me heterochromatin leads to neuronal impairment via the cascading destruction of the KDM3B-centered epigenomic network
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110380
PMID:39165843
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研究论文 | 研究探讨了年龄依赖的转录组分析在终末分化的小鼠视网膜中识别异染色质重组相关的表观遗传调控因子 | 揭示了KDM3B中心表观遗传网络在调节老化过程中锥体感光细胞稳态的重要性 | NA | 研究组织特异性基因如何在分化细胞中逃脱异染色质的影响 | 小鼠视网膜中的锥体感光细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12个月大的小鼠视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-23 |
SARS-CoV2 infection in whole lung primarily targets macrophages that display subset-specific responses
2024-Aug-15, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05322-z
PMID:39147987
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研究论文 | 本研究开发了一种创新的体外人肺感染SARS-CoV-2模型,通过单细胞RNA测序揭示了肺泡和单核细胞来源的巨噬细胞是病毒的初始目标 | 首次使用体外人肺感染模型研究SARS-CoV-2的初始感染步骤,并通过单细胞RNA测序技术详细分析了不同巨噬细胞亚群的反应 | 研究主要集中在体外模型,可能与人体内的实际情况存在差异 | 解析SARS-CoV-2感染的初始步骤及其对COVID-19结果的影响 | SARS-CoV-2病毒在人肺中的初始感染目标及其对不同巨噬细胞亚群的影响 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肺泡巨噬细胞、单核细胞来源的巨噬细胞、经典单核细胞和非经典单核细胞等多种细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-23 |
Comprehensive pan-cancer analysis of ACSS3 as a biomarker for prognosis and immunotherapy response
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35231
PMID:39165934
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研究论文 | 本文通过综合泛癌分析,探讨了ACSS3作为预后和免疫治疗反应生物标志物的潜力 | ACSS3被发现是一个新的生物标志物,能够预测不同人类癌症的预后,并通过调节免疫微环境影响生物学过程 | NA | 研究ACSS3在多种肿瘤中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | ACSS3在不同肿瘤类型中的表达及其与临床特征、预后和免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及TCGA数据库中的26种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-23 |
Comprehensive analysis of shared risk genes and immunity-metabolisms between non-alcoholic fatty liver disease and atherosclerosis via bulk and single-cell transcriptome analyses
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35453
PMID:39165965
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析,探讨了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)与动脉粥样硬化(AS)之间的病理关系,并利用批量和单细胞转录组分析揭示了两者共享的风险基因及免疫代谢机制 | 本研究首次综合分析了NAFLD与AS之间的共享风险基因,并通过单细胞转录组分析揭示了不同免疫细胞中这些基因的异常表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析,未来需要更多的实验验证 | 探讨NAFLD与AS之间的病理关系,并寻找可能的干预策略 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)与动脉粥样硬化(AS) | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病,动脉粥样硬化 | WGCNA分析,单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 4851名参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-23 |
Heterogeneity effects of bisphenol A and its substitute, fluorene-9-bisphenol, on intestinal homeostasis
2024-Aug-13, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2024.108948
PMID:39167857
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研究论文 | 本研究结合肠道类器官和单细胞RNA测序技术,探讨了双酚A及其替代品氟硼酸对肠道细胞组成、分化和功能的影响 | 首次详细研究了双酚A及其替代品氟硼酸对肠道上皮细胞的细胞类型特异性影响,并通过构建小鼠模型进一步验证了其对肠道形态的影响 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上,对人类的具体影响还需进一步研究 | 探讨双酚A及其替代品氟硼酸对肠道稳态的影响 | 双酚A及其替代品氟硼酸对肠道上皮细胞的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a decrease in the frequency of macrophage-RGS1high subsets in patients with osteoarticular tuberculosis
2024-Aug-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00886-9
PMID:39123125
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨关节结核患者中免疫细胞亚群的表型和功能 | 首次揭示了骨关节结核患者中巨噬细胞-RGS1高表达亚群频率的降低,并探讨了其在结核感染中的作用 | 研究仅限于病理组织和健康邻近组织的单细胞RNA测序分析,未涉及更广泛的样本类型 | 探究骨关节结核患者中免疫细胞亚群的表型和功能 | 骨关节结核患者的病理组织和健康邻近组织 | 数字病理学 | 骨关节疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨关节结核患者和健康对照组的组织样本 | NA | NA | NA | NA |