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当前共找到 532 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-27 |
Connectivity Network Feature Sharing in Single-Cell RNA Sequencing Data Identifies Rare Cells
2024-Aug-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c00796
PMID:39096508
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCLCNF的新方法，通过分析单细胞RNA测序数据中的局部连接网络特征共享来识别稀有细胞 | SCLCNF通过创建细胞连接网络并利用稀有性评分来识别稀有细胞，相较于现有技术在检测稀有细胞方面表现更优 | NA | 开发一种新方法以克服传统方法在检测稀有细胞时的不足 | 稀有细胞的识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类胚胎数据集和脓毒症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-27 |
scSwinFormer: A Transformer-Based Cell-Type Annotation Method for scRNA-Seq Data Using Smooth Gene Embedding and Global Features
2024-Aug-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c00616
PMID:39101690
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Transformer的深度学习方法scSwinFormer，用于大规模scRNA-seq数据的细胞类型注释 | scSwinFormer通过平滑基因嵌入模块和自注意力模块捕获基因间的潜在依赖关系，并利用Cell Token整合scRNA-seq数据中的全局信息，提高了细胞类型注释的准确性 | NA | 开发一种新的细胞类型注释方法，以提高scRNA-seq数据分析的准确性 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | scRNA-seq | Transformer | 文本 | 多个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-27 |
Single-cell sequencing combined with spatial transcriptomics reveals that the IRF7 gene in M1 macrophages inhibits the occurrence of pancreatic cancer by regulating lipid metabolism-related mechanisms
2024-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1799
PMID:39118300
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合空间转录组学技术，揭示了M1巨噬细胞中的IRF7基因通过调控脂质代谢相关机制抑制胰腺癌的发生 | 首次揭示了IRF7在M1巨噬细胞中通过抑制RPS18的转录和转移，进而影响胰腺癌细胞中ILF3的表达，从而抑制脂质代谢和细胞增殖等过程 | 研究主要基于数据库中的scRNA-seq和ST数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探索IRF7在M1巨噬细胞中调控RPS18转录的分子机制，以及IRF7通过外泌体传递RPS18至胰腺癌细胞并调控ILF3表达的过程 | M1巨噬细胞中的IRF7基因、RPS18基因、ILF3表达及胰腺癌细胞的脂质代谢 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）、流式细胞术、CRISPR/Cas9编辑技术、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的scRNA-seq和ST数据，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-26 |
Mitochondrial DNA Leakage Promotes Persistent Pancreatic Acinar Cell Injury in Acute Pancreatitis via the cGAS-STING-NF-κB Pathway
2024-Aug-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02132-0
PMID:39180578
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研究论文 | 研究探讨了线粒体DNA泄漏通过cGAS-STING-NF-κB途径在急性胰腺炎中促进胰腺腺泡细胞损伤的作用 | 首次研究了cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的潜在炎症机制 | NA | 探讨cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的机制 | 急性胰腺炎患者的血浆和胰腺腺泡细胞 | NA | 急性胰腺炎 | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 血浆, 细胞 | 50名急性胰腺炎患者和10名健康捐赠者的血浆, 以及小鼠和细胞模型 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-26 |
Pan-cancer single-cell dissection reveals phenotypically distinct B cell subtypes
2024-Aug-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.038
PMID:39047727
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研究论文 | 本文通过整合来自19种主要癌症类型的649名患者的单细胞RNA测序数据，建立了一个全面的人类B细胞资源，并揭示了肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征的显著异质性 | 本文首次识别出应激反应记忆B细胞和肿瘤相关非典型B细胞（TAABs），这两种肿瘤富集亚群具有预后潜力，并在泛癌种中共享 | NA | 深入理解B细胞在癌症发展中的作用 | 肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 649名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-25 |
Denoiseit: denoising gene expression data using rank based isolation trees
2024-Aug-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05899-z
PMID:39169300
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研究论文 | 本文提出了一种名为DenoiseIt的方法，用于从基因表达数据中去除潜在的异常基因，以构建一个更稳健的基因集，从而提高下游基因表达分析的质量。 | DenoiseIt采用了一种反向搜索方法，结合非负矩阵分解和隔离森林来识别和去除异常基因，与传统的正向基因搜索方法不同。 | NA | 开发一种新的方法来提高基因表达数据分析的质量，通过去除异常基因来增强生物标志物的识别。 | 基因表达数据中的异常基因 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解，隔离森林 | NA | 基因表达数据 | 应用了来自TCGA和COVID-19队列的bulk和单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-24 |
Single-cell Transcriptomics, Web-based Systems Pharmacology and Integrated Transcriptomics Network Analysis Identified Diagnostic Targets and Drug Candidates for Type 2 Diabetes
2024-Aug-22, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学、基于网络的系统药理学和综合转录组网络分析，为2型糖尿病（T2D）识别新的治疗靶点和开发新的诊断模型 | 通过单细胞聚类分析，识别了正常胰岛β细胞样本与T2D胰岛β细胞样本之间的七个亚群，并筛选出27个关键基因作为T2D的诊断靶点，同时发现MME与DB05490之间具有强结合力，为T2D的治疗提供了有效的候选药物 | NA | 发现2型糖尿病（T2D）的新治疗靶点并开发新的诊断模型 | 2型糖尿病（T2D）的治疗靶点和诊断模型 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 正常胰岛β细胞样本与T2D胰岛β细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-24 |
Explore key genes of Crohn's disease based on glycerophospholipid metabolism: A comprehensive analysis Utilizing Mendelian Randomization, Multi-Omics integration, Machine Learning, and SHAP methodology
2024-Aug-21, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112905
PMID:39173401
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化、多组学整合、机器学习和SHAP方法，探索了与克罗恩病相关的关键基因和代谢物 | 首次综合运用孟德尔随机化、多组学整合、机器学习和SHAP方法，识别与克罗恩病相关的关键基因和代谢物 | 研究样本量较小，且仅限于特定的代谢物和炎症因子，可能存在未涵盖的其他重要因素 | 旨在识别克罗恩病的潜在致病基因和代谢物，为疾病的诊断和治疗提供新靶点 | 克罗恩病相关的代谢物、炎症因子和关键基因 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 孟德尔随机化、多组学整合、机器学习、SHAP | Catboost、XGboost、NGboost | 血清代谢物、炎症因子、单细胞RNA测序数据 | 1400个血清代谢物样本、91个炎症因子样本、克罗恩病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-24 |
Subtyping of gastric cancer based on basement membrane genes that stratifies the prognosis, immune infiltration and therapeutic response
2024-Aug-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01238-z
PMID:39164593
|
研究论文 | 本研究基于基底膜基因表达对胃癌进行分子分类，并探讨其与患者预后、免疫浸润及治疗反应的关系 | 首次基于基底膜基因表达定义了胃癌的新型分子分类，并开发了预测预后、免疫治疗效果和化疗抵抗的风险模型 | NA | 探讨基底膜状态、转移与患者预后的关系，并开发相关的风险预测模型 | 胃癌及其基底膜基因表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多个大型队列 | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-24 |
Spatial transcriptomics profiling of gallbladder adenocarcinoma: a detailed two-case study of progression from precursor lesions to cancer
2024-Aug-20, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12770-0
PMID:39164619
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析了两个胆囊腺癌病例，从癌前病变到癌症的进展过程 | 首次提供了支持胆囊癌起源于胆管上皮内瘤变（BilIN）或独立于BilIN的结论的空间转录组数据 | 研究仅限于两个病例，可能无法完全代表所有胆囊腺癌的进展过程 | 研究个体患者中胆囊癌肿瘤发生的空间转录组学特征 | 两个具有不同癌症病因的患者的胆囊样本，包括正常上皮、BilINs和腺癌区域 | 数字病理学 | 胆囊癌 | GeoMx数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 两个患者，每个患者分别有24和32个感兴趣区域（ROIs） | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of high-fat diet on oocyte and early embryo development in female mice
2024-Aug-20, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01279-7
PMID:39164729
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研究论文 | 本研究通过建立高脂饮食诱导的肥胖雌性小鼠模型，利用单细胞RNA测序技术探讨了高脂饮食对小鼠卵母细胞和早期胚胎发育的影响 | 首次采用单细胞RNA测序技术探索高脂饮食诱导的肥胖小鼠在不同阶段胚胎的转录组变化 | NA | 研究高脂饮食对雌性小鼠卵巢功能和早期胚胎发育的具体发病机制 | 高脂饮食诱导的肥胖雌性小鼠的系统代谢、卵巢形态和卵母细胞功能 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-24 |
Applications of single-cell technologies in drug discovery for tumor treatment
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110486
PMID:39171294
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在肿瘤治疗药物发现中的应用 | 介绍了新兴的单细胞分析技术，如多维单细胞分子特征整合、单细胞数据规模扩展、单细胞基因表型影响分析和全长度覆盖单细胞测序 | NA | 系统总结单细胞技术在肿瘤治疗药物发现各阶段的应用，并强调其在深入理解肿瘤生物学中的作用 | 单细胞技术在药物发现中的应用，包括靶点识别、高通量药物筛选和药代动力学评估 | 生物技术 | 肿瘤 | 单细胞技术 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-24 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor landscape in ovarian carcinosarcoma
2024-Aug-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2300407
PMID:39155781
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了卵巢癌肉瘤（OCS）的细胞组成和分子特征 | 首次提供了人类OCS的单细胞转录组特征，为阐明OCS的多样性提供了新的资源 | NA | 通过单细胞RNA测序技术揭示卵巢癌肉瘤的肿瘤景观 | 卵巢癌肉瘤的细胞组成和分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-24 |
A pan-cancer cuproptosis signature predicting immunotherapy response and prognosis
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35404
PMID:39170145
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research paper | 本文通过分析多个单细胞RNA测序数据集，开发了一种泛癌铜死亡特征（Cup.Sig），用于预测免疫治疗反应和预后 | 首次开发了一种泛癌铜死亡特征，用于预测免疫治疗反应和预后 | NA | 开发一种泛癌铜死亡特征，用于预测生存和免疫治疗反应 | 泛癌铜死亡特征及其在免疫治疗反应和预后预测中的应用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 28个scRNA-seq数据集，TCGA泛癌队列和10个免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-24 |
Single-cell sequencing analysis revealed that WDR72 was a novel cancer stem cells related gene in gastric cancer
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35549
PMID:39170171
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了WDR72作为胃癌中与癌症干细胞相关的新基因 | 首次发现WDR72作为胃癌中与癌症干细胞相关的新基因 | NA | 探索胃癌上皮细胞中与癌症干细胞相关的基因 | 胃癌上皮细胞中的癌症干细胞相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-24 |
Screening chondrocyte necroptosis-related genes in the diagnosis and treatment of osteoarthritis
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35263
PMID:39170298
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析了骨关节炎中软骨细胞坏死调控的相关基因，并构建了机器学习模型进行药物分子对接验证。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨关节炎中调控软骨细胞坏死的机制，并验证了nimesulide作为潜在抑制剂的可能性。 | 研究主要集中在体外实验和数据分析，需要进一步的临床试验验证nimesulide的疗效。 | 探讨骨关节炎中软骨细胞坏死相关基因的诊断和治疗潜力。 | 骨关节炎中的软骨细胞坏死相关基因。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯模型 | RNA序列 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-24 |
Single-cell RNA-Seq reveals the heterogeneity of fibroblasts within the tympanojugular paraganglioma microenvironment
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35478
PMID:39170307
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和全外显子测序分析了六例手术切除的鼓室颈静脉副神经节瘤样本，揭示了瘤内纤维母细胞的异质性及其在瘤微环境中的复杂作用 | 首次建立了针对鼓室颈静脉副神经节瘤的全面转录组图谱，并详细描述了纤维母细胞在瘤微环境中的多方面作用及其细胞间通讯网络 | NA | 研究鼓室颈静脉副神经节瘤的细胞组成和瘤内异质性，以及纤维母细胞在瘤微环境中的具体贡献 | 鼓室颈静脉副神经节瘤样本及其细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，全外显子测序 | NA | 转录组数据 | 六例手术切除的鼓室颈静脉副神经节瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-24 |
Dysregulated T-cell homeostasis and decreased CD30+ Treg proliferating in aplastic anemia
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35775
PMID:39170389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了再生障碍性贫血（AA）患者中T细胞稳态的潜在破坏，并识别了CD4 T常规细胞和Treg细胞的变化 | 首次揭示了AA患者中CD30 Treg细胞亚群的减少及其高增殖和显著的免疫抑制表型，并提出异常的TNFSF8/TNFRSF8信号通路可能通过增加CD30 Treg细胞的破坏导致T细胞免疫功能障碍 | NA | 阐明再生障碍性贫血中自身反应性T细胞在疾病发展中的精确作用，以促进治疗和诊断策略的进步 | 再生障碍性贫血患者的CD8 T细胞、常规CD4 T细胞和Treg细胞 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞转录组分析，流式细胞术，RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-24 |
Galectin-3 induces pathogenic immunosuppressive macrophages through interaction with TREM2 in lung cancer
2024-Aug-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03124-6
PMID:39135069
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研究论文 | 本研究探讨了半乳糖凝集素-3通过与TREM2相互作用诱导肺肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制作用 | 揭示了半乳糖凝集素-3与TREM2在肺肿瘤相关巨噬细胞中的未知关联，并提出同时抑制半乳糖凝集素3和TREM2作为肺肿瘤治疗的新策略 | NA | 研究TREM2表达的肿瘤相关巨噬细胞的招募机制及其介导免疫抑制的配体 | 肺肿瘤相关巨噬细胞及其免疫抑制作用 | 数字病理学 | 肺肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，质谱分析，免疫沉淀 | NA | 细胞 | 使用TREM2f/f-Lyz2-cre小鼠模型进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-24 |
Heterogeneity of Wnt1-Cre-marked and Pax2-Cre-marked first branchial arch cranial neural crest cells in mice
2024-Aug-01, Hua xi kou qiang yi xue za zhi = Huaxi kouqiang yixue zazhi = West China journal of stomatology
DOI:10.7518/hxkq.2024.2023374
PMID:39049630
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研究论文 | 本研究旨在探讨Wnt1-Cre标记和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞的异质性和基因本体 | 本研究通过单细胞RNA测序和实时荧光定量PCR技术，揭示了Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的神经嵴细胞在不同组织中的表达差异及其在细胞分化和骨化中的作用 | NA | 探索Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞的异质性和基因本体 | Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 实时荧光定量PCR | NA | RNA | Wnt1-Cre;R26RmTmG和Pax2-Cre;R26RmTmG小鼠的胚胎 | NA | NA | NA | NA |