单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 537 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-17 |
Mutual exclusivity and co-occurrence patterns of immune checkpoints indicate NKG2A relates to anti-PD-1 resistance in gastric cancer
2024-Aug-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05503-1
PMID:39097734
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和多元线性回归交互模型，分析了胃癌中CD8+ T细胞的免疫检查点表达特征及其与抗PD-1治疗抵抗的关系。 | 揭示了两种不同的免疫检查点表达模式（ICEP），并阐明了NKG2A与PD-1的互斥性和共现特征，为胃癌提供了新的免疫治疗靶点。 | NA | 探索克服胃癌中抗PD-1治疗抵抗的新机会，并识别与抗PD-1抑制剂联合使用的最佳免疫检查点抑制剂组合方案。 | 胃癌中的CD8+ T细胞及其免疫检查点表达模式。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 多元线性回归交互模型 | RNA | NA |
| 382 | 2024-08-17 |
The shared role of neutrophils in ankylosing spondylitis and ulcerative colitis
2024-Aug, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00286-3
PMID:39060428
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析，探讨了强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞的相互作用 | 发现了中性粒细胞在两种疾病中的重要作用，并识别出XBP1作为潜在的治疗靶点 | 样本量较小，仅包括三名强直性脊柱炎患者 | 研究强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞的相互作用 | 强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎患者的椎骨骨髓血液 | NA | 强直性脊柱炎, 溃疡性结肠炎 | 10X单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 三名强直性脊柱炎患者 |
| 383 | 2024-08-17 |
Toward universal cell embeddings: integrating single-cell RNA-seq datasets across species with SATURN
2024-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02191-z
PMID:38366243
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SATURN的深度学习方法，用于学习跨物种的通用细胞嵌入，通过结合蛋白质语言模型的蛋白质嵌入和RNA表达，实现不同物种单细胞RNA测序数据集的整合 | SATURN方法能够检测跨物种共同表达的功能相关基因，并为跨物种分析重新定义差异表达 | NA | 开发一种方法以整合来自不同物种的单细胞RNA测序数据集，揭示细胞类型的保守性和多样性进化过程 | 跨物种的单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | RNA测序数据 | 涉及三种物种的整体器官图谱以及蛙和斑马鱼胚胎发育数据集 |
| 384 | 2024-08-16 |
Treating epidermolytic ichthyosis and ichthyosis with confetti with epidermal autografts cultured from revertant skin
2024-Aug-14, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae193
PMID:38739763
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研究论文 | 本文评估了从逆转皮肤培养的自体表皮移植物（CEAs）在治疗表皮松解性鱼鳞病（EI）和斑点状鱼鳞病（IWC）患者中的可行性 | 首次尝试使用从患者自身逆转表皮角质形成细胞生产的CEAs进行治疗，并证明了其潜在的安全性和局部治疗效果 | 研究样本量小，且在24周后观察到鱼鳞病病变的复发 | 评估从逆转表皮角质形成细胞生产的自体表皮移植物在EI和IWC患者中的治疗效果 | 表皮松解性鱼鳞病和斑点状鱼鳞病患者 | NA | 鱼鳞病 | 扩增子测序和液滴数字聚合酶链反应分析 | NA | RNA测序数据 | 3名患者 |
| 385 | 2024-08-16 |
Fibroblasts with high matrix metalloproteinase 2 expression regulate CD8+ T-cell residency and inflammation via CD100 in psoriasis
2024-Aug-14, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae205
PMID:38752329
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研究论文 | 本文探讨了高表达基质金属蛋白酶2（MMP2）的成纤维细胞通过CD100轴调节银屑病中CD8+ T细胞的驻留和炎症的作用。 | 首次揭示了MMP2hi成纤维细胞通过促进CD100从CD8+ T细胞膜上脱落以及上调CD103，增强CD8+ T细胞驻留，从而加剧银屑病炎症的新机制。 | NA | 阐明成纤维细胞和MMP2-CD100轴在调节银屑病炎症中的作用。 | 银屑病患者中的CD8+ T细胞和成纤维细胞。 | 数字病理学 | 银屑病 | 免疫荧光、酶联免疫吸附试验、单细胞转录组测序、细胞相互作用分析、定量逆转录聚合酶链反应。 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据。 | 从银屑病患者中分离的CD8+ T细胞样本。 |
| 386 | 2024-08-16 |
[The application of the diagnosis and therapy of single cell sequencing technology in central nervous system tumors]
2024-Aug-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后方面的应用 | 单细胞测序技术为揭示中枢神经系统肿瘤的复杂生态系统提供了机会 | 大多数研究成果尚未达到临床应用水平 | 探讨单细胞测序在中枢神经系统肿瘤中的应用及其对肿瘤预后和复发预防的潜在影响 | 中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后 | 数字病理学 | 神经系统肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA |
| 387 | 2024-08-16 |
Integrated Single-Cell RNA-seq and ATAC-seq Reveals Heterogeneous Differentiation of CD4+ Naive T Cell Subsets is Associated with Response to Antidepressant Treatment in Major Depressive Disorder
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308393
PMID:38867657
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC-seq技术，分析了8名健康个体和8名重度抑郁症（MDD）患者在接受抗抑郁治疗前后的外周血单个核细胞，揭示了CD4+幼稚T细胞亚群的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联。 | 本研究首次结合scRNA-seq和ATAC-seq技术，揭示了MDD患者中CD4+幼稚T细胞的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联，并识别出响应者中特定激活的CD4+幼稚T细胞群及其上游调控因子ETS。 | 研究样本量较小，且仅包括8名MDD患者和8名健康个体，可能影响结果的普遍性。 | 探讨重度抑郁症患者抗抑郁治疗反应的分子机制。 | 重度抑郁症（MDD）患者和健康个体的外周血单个核细胞。 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC-seq | NA | RNA和染色质可及性数据 | 8名MDD患者和8名健康个体 |
| 388 | 2024-08-16 |
Unraveling the connection between Hashimoto's Thyroiditis and non-alcoholic fatty liver disease: exploring the role of CD4+central memory T cells through integrated genetic approaches
2024-Aug, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03745-z
PMID:38400881
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研究论文 | 本研究通过综合遗传方法探讨桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的联系，特别是CD4+中央记忆T细胞的作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化等方法，揭示了CD4+中央记忆T细胞在桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病中的关键作用，并鉴定了MAGI3基因作为这两种疾病的标志基因。 | NA | 探索桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的潜在联系。 | 桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的CD4+中央记忆T细胞。 | 遗传学 | 桥本甲状腺炎，非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据 | 桥本甲状腺炎、非酒精性脂肪肝病及健康对照的单细胞RNA测序数据 |
| 389 | 2024-08-16 |
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-Aug-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000503
PMID:39082968
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研究论文 | 本文研究了慢性HCV感染患者中表达突变IGHV1-69编码抗原受体的B细胞，这些细胞与病毒中和相关，并显示出类似淋巴瘤的转录组特征 | 首次揭示了淋巴瘤样细胞可能源自抗HCV免疫反应，并提供了这些细胞在病毒清除后仍持续存在并可能导致B细胞功能障碍和淋巴瘤风险的机制基础 | NA | 探讨慢性HCV感染患者中B细胞的免疫反应及其与淋巴瘤样细胞的关系 | 慢性HCV感染患者及接受直接抗病毒治疗的患者的B细胞受体（BCR） | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 慢性HCV感染患者及HCV治疗后持续病毒学应答（SVR）患者的样本 |
| 390 | 2024-08-16 |
In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution
2024-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07663-y
PMID:39020166
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研究论文 | 本文开发了一种体内单细胞CRISPR策略，用于系统研究150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态，揭示了肿瘤坏死因子（TNF）信号模块在肿瘤进化中的作用。 | 首次采用体内单细胞CRISPR筛选技术，结合超声引导的子宫内慢病毒微注射、单细胞RNA测序和引导捕获，实时监测克隆扩展并记录其背后的基因程序。 | NA | 研究肿瘤进化模型中，恶性转化前随机分布的驱动突变如何导致少数克隆转化为恶性肿瘤的机制。 | 150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态。 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 391 | 2024-08-16 |
Integrated multi-omic analyses uncover the effects of aging on cell-type regulation in glucose-responsive tissues
2024-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14199
PMID:38932492
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序和代谢组学数据，探讨了衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 | 首次全面评估了衰老及其相关细胞类型响应的影响，并识别了潜在的血液生物标志物 | NA | 研究衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 | 脂肪组织和肌肉组织 | 组学 | NA | 转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序、代谢组学 | 共表达网络分析 | 转录组、甲基组、单细胞RNA、代谢组 | NA |
| 392 | 2024-08-16 |
Tracing Immunological Interaction in Trimethylamine N-Oxide Hydrogel-Derived Zwitterionic Microenvironment During Promoted Diabetic Wound Regeneration
2024-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202402738
PMID:38885961
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研究论文 | 本研究开发了一种新型三甲胺N-氧化物（TMAO）衍生的两性离子水凝胶，用于促进糖尿病伤口愈合，并探索了两性离子水凝胶周围的多细胞生态系统 | 首次使用两性离子水凝胶促进糖尿病伤口愈合，并通过单细胞RNA测序揭示了不同细胞在两性离子微环境中的作用 | NA | 解析糖尿病伤口愈合过程中的多细胞特征并寻求治疗策略 | 糖尿病伤口愈合过程中的免疫调节机制 | 生物材料 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 393 | 2024-08-16 |
Astaxanthin Alleviates Autoimmune Hepatitis by Modulating CD8+ T Cells: Insights From Mass Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403148
PMID:38874408
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研究论文 | 本研究通过使用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析，探讨了虾青素（ASX）通过调节CD8+ T细胞减轻自身免疫性肝炎（AIH）的作用。 | 本研究首次通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，揭示了虾青素对CD8+ T细胞数量和功能的调节作用，并预测了关键的转录因子及构建了细胞间通信网络。 | 研究仅在AIH的小鼠模型中进行，未来需要进一步在人体中验证虾青素的效果和机制。 | 探讨虾青素在自身免疫性肝炎中的作用及其对CD8+ T细胞的调节机制。 | 自身免疫性肝炎（AIH）的小鼠模型及CD8+ T细胞。 | NA | 自身免疫性疾病 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 小鼠模型中的多个样本 |
| 394 | 2024-08-16 |
Sexually Dimorphic Response to Hepatic Injury in Newborn Suffering from Intrauterine Growth Restriction
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403095
PMID:38867614
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了宫内生长受限（IUGR）新生猪肝脏细胞的景观，揭示了性别依赖的IUGR诱导的肝脏损伤模式 | 首次探索了利用早期发育可塑性逆转不良胎儿编程结果的可能性，并发现了Apolipoprotein A4（APOA4）作为IUGR男性中对抗缺氧的保护性反应的新型生物标志物 | 研究仅限于猪模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 研究宫内生长受限对新生儿肝脏功能的影响及性别差异 | 宫内生长受限的新生猪 | NA | 肝脏疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 来自同一胎儿的猪仔 |
| 395 | 2024-08-16 |
Identification and Characterization of Metastasis-Initiating Cells in ESCC in a Multi-Timepoint Pulmonary Metastasis Mouse Model
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401590
PMID:38864342
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，在多时间点肺转移小鼠模型中鉴定并表征了食管鳞状细胞癌（ESCC）中的转移起始细胞（MICs）。 | 本研究首次鉴定出ESCC中的转移起始细胞，并识别出一组7个转移起始标志基因（MIS），这些基因在功能研究和生物信息学分析中显示出对早期转移微环境的潜在重塑作用。 | 本研究主要基于小鼠模型和临床样本，未来需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。 | 旨在鉴定和表征食管鳞状细胞癌中的转移起始细胞，并探索其在早期转移中的作用。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的转移起始细胞（MICs）及其相关标志基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的肺转移小鼠模型中的ESCC细胞 |
| 396 | 2024-08-16 |
Mapping the unicellular transcriptome of the ascending thoracic aorta to changes in mechanosensing and mechanoadaptation during aging
2024-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14197
PMID:38825882
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研究论文 | 研究揭示了随着年龄增长，升主动脉的单细胞转录组变化及其在机械感应和机械适应性中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了升主动脉在衰老过程中的细胞衰老、重塑和炎症反应的变化 | 研究主要集中在升主动脉，对其他部位的主动脉变化未进行详细探讨 | 探索年龄增长对升主动脉机械感应和适应性的分子机制 | 升主动脉的单细胞转录组及其在衰老过程中的变化 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 老年和年轻升主动脉组织的单细胞样本 |
| 397 | 2024-08-15 |
Prdm1 positively regulates liver Group 1 ILCs cancer immune surveillance and preserves functional heterogeneity
2024-Aug-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92948
PMID:39133873
|
研究论文 | 本研究揭示了Prdm1在调节肝脏cNK细胞和ILC1s功能中的作用，特别是在肝癌免疫监视中的重要性 | 首次揭示了Prdm1在维持cNK细胞和肝脏ILC1s功能异质性中的新机制 | 研究主要基于Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型，可能需要进一步的人体研究验证 | 探索Prdm1在肝脏cNK细胞和ILC1s中的调控机制及其在肝癌免疫治疗中的潜在应用 | 肝脏cNK细胞和ILC1s的功能及其在肝癌中的作用 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 使用Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型进行研究 |
| 398 | 2024-08-15 |
Integrated analysis of spatial transcriptomics and CT phenotypes for unveiling the novel molecular characteristics of recurrent and non-recurrent high-grade serous ovarian cancer
2024-Aug-12, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00632-7
PMID:39135097
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research paper | 本研究通过整合空间转录组学和CT表型数据，揭示了高级别浆液性卵巢癌复发和非复发患者的分子特征 | 本研究首次结合空间转录组学和CT数据，识别了与高级别浆液性卵巢癌复发相关的特定细胞群富集和差异表达基因 | 研究样本量较小，仅包括八名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索高级别浆液性卵巢癌的分子特征，为个性化医疗提供诊断和治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌的复发和非复发患者 | digital pathology | 卵巢癌 | 空间转录组学 (ST) | NA | 转录组数据 | 8名高级别浆液性卵巢癌患者 |
| 399 | 2024-08-15 |
Single-cell multiomics analysis reveals cell/tissue-specific associations in bipolar disorder
2024-Aug-06, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-03044-1
PMID:39107272
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，探讨了双相情感障碍（BD）的细胞起源和组织异质性 | 本研究首次发现了一个名为ADCY1的新脑细胞簇，并从高分辨率遗传角度揭示了胶质细胞是与BD相关的主要细胞病理 | NA | 探讨双相情感障碍的细胞起源和组织异质性 | 双相情感障碍（BD）的细胞和组织特征 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATAC-seq、RNA-seq、全基因组关联研究（GWAS） | NA | 基因组数据 | 包括8个胚胎和胎儿脑样本（1,266个细胞）、210个成人脑ATAC-seq数据、314个成人脑bulk RNA-seq数据和413,466个GWAS汇总数据 |
| 400 | 2024-08-15 |
Single-cell landscape revealed immune characteristics associated with disease phases in brucellosis patients
2024-Aug, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.226
PMID:39135683
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了布鲁氏菌病患者在不同疾病阶段的免疫特征 | 首次系统地揭示了布鲁氏菌病在不同感染阶段的综合免疫反应，特别是急性期的细胞因子风暴和慢性期的Th1反应失调 | NA | 旨在深入理解布鲁氏菌病的免疫发病机制，并为开发新的有效治疗策略提供依据 | 布鲁氏菌病患者及健康捐赠者的免疫细胞 | digital pathology | brucellosis | scRNA-seq | NA | 细胞 | 290,369个细胞来自35个个体，包括29名布鲁氏菌病患者和6名健康捐赠者 |