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当前共找到 531 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
|
研究论文 | 开发了一种整合细胞形态和空间转录组学的肿瘤生态系统深度分析框架METI | 首次将空间转录组学、细胞形态学和基因特征整合到端到端分析框架中，无需匹配单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本量的具体数量和研究设计的局限性 | 开发能够增强肿瘤微环境中细胞相互作用理解的分析工具 | 胃癌、肺癌、膀胱癌肿瘤组织及癌前组织 | 数字病理学 | 多癌种肿瘤 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 空间转录组数据、细胞形态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过吸入干细胞外泌体治疗心肌梗死的无创方法 | 首次报道通过吸入方式递送干细胞外泌体的无创治疗方法，并发现内皮细胞CD36在心脏修复中的新机制 | 研究主要基于动物模型，尚未进行临床试验验证 | 开发心肌梗死后心脏修复的无创治疗方法 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，心脏磁共振成像，超声心动图 | NA | 基因表达数据，影像数据，组织学数据 | 小鼠和猪的心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic map of the developing Atoh1 lineage identifies neural fate decisions and neuronal diversity in the hindbrain
2024-08-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.007
PMID:39106860
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序绘制发育中小鼠后脑Atoh1谱系的转录图谱，揭示神经命运决定和神经元多样性 | 首次在单细胞分辨率下揭示Atoh1谱系神经元的转录程序，发现增殖性单极刷细胞前体群 | 研究仅限于小鼠模型，人类相关性的验证需要进一步研究 | 解析Atoh1谱系神经元的命运决定机制和多样性 | 发育中小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | 单细胞生物学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，ATOH1 DNA结合分析 | NA | 单细胞转录组数据，DNA结合数据 | 小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Hydrogel biomaterials that stiffen and soften on demand reveal that skeletal muscle stem cells harbor a mechanical memory
2024-Aug-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406787121
PMID:39163337
|
研究论文 | 本研究利用可光控软硬变化的动态水凝胶生物材料，揭示了骨骼肌干细胞具有对基质硬度的机械记忆 | 首次开发可动态调控硬度的水凝胶材料，并发现肌干细胞在培养早期形成对基质硬度的持久记忆 | 研究主要基于体外实验，体内验证尚需进一步研究 | 探究肌干细胞是否具有机械记忆特性及其分子机制 | 骨骼肌干细胞 | 组织工程 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，药理学抑制 | NA | 基因表达数据，细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
PanIN and CAF transitions in pancreatic carcinogenesis revealed with spatial data integration
2024-Aug-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.001
PMID:39116880
|
研究论文 | 本研究开发了一种整合成像、空间转录组学和单细胞RNA测序的新流程，用于表征胰腺癌发生过程中的肿瘤细胞状态转变 | 开发了半监督学习框架整合空间多组学数据，首次在人类FFPE样本中实现了PanIN病变的单细胞水平特征分析 | 基于FFPE样本的严格诊断限制了在微环境中对人类PanIN的单细胞表征 | 解析胰腺癌发生过程中的细胞状态转变和肿瘤微环境动态变化 | 胰腺上皮内瘤变(PanIN)病变和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 成像蛋白质组学 | 半监督学习框架 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | 匹配的低级别和高级别PanIN病变队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | 全转录组FFPE空间转录组学 |
| 26 | 2025-10-06 |
Breaking barriers: improving time and space resolution of arbuscular mycorrhizal symbiosis with single-cell sequencing approaches
2024-08-17, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00501-1
PMID:39154166
|
综述 | 本文探讨如何利用单细胞测序技术提高丛枝菌根共生研究的时间和空间分辨率 | 首次系统评述单细胞RNA测序技术在植物-微生物互作研究中的应用潜力，特别是针对丛枝菌根共生这一复杂生物学过程 | 目前植物-微生物互作的单细胞研究数量有限，且单细胞分析会损失空间信息，需要与空间转录组学技术整合 | 提高丛枝菌根共生研究的分辨率，深入理解其时空发育动态 | 丛枝菌根共生体系中的植物细胞和真菌细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 激光显微切割 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Integrated analysis reveals a novel 5-fluorouracil resistance-based prognostic signature with promising implications for predicting the efficacy of chemotherapy and immunotherapy in patients with colorectal cancer
2024-08, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01981-2
PMID:38824480
|
研究论文 | 开发基于5-氟尿嘧啶耐药性的预后特征模型，用于预测结直肠癌患者化疗和免疫治疗效果 | 首次构建5-氟尿嘧啶耐药相关特征模型，整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别化疗和免疫治疗获益人群 | 需要进一步实验验证预测的潜在化合物疗效 | 预测结直肠癌患者预后及化疗和免疫治疗效果 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | 逐步回归模型, 无监督共识聚类 | RNA测序数据, 临床数据 | 多个结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
CXCR6 expression correlates with radiotherapy response and immune context in triple-negative breast cancer-experimental studies
2024-Aug-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001546
PMID:39143706
|
研究论文 | 本研究探讨CXCR6在三阴性乳腺癌中的表达与放疗反应及免疫微环境的关系 | 首次揭示CXCR6表达与三阴性乳腺癌放疗疗效和免疫应答的临床相关性，并阐明其在CD8+ T细胞分化和免疫细胞间通讯中的作用机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步的前瞻性研究验证 | 阐明CXCR6在三阴性乳腺癌中的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 多重免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Transcription Factor Activity Regulating Macrophage Heterogeneity during Skin Wound Healing
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400172
PMID:38940624
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，揭示了转录因子在皮肤伤口愈合过程中调控巨噬细胞异质性的机制 | 改进了贝叶斯推断TF活性模型，首次结合scRNA-seq和scATAC-seq数据推断伤口愈合过程中Mos/Mϕs的转录因子活性，并验证了NR4A1在炎症调控中的关键作用 | 转录因子活性与mRNA或蛋白表达并不总是相关，可能存在其他调控机制未被充分探索 | 研究皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞异质性的转录因子调控机制 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的单核细胞和巨噬细胞 | 单细胞多组学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 基因敲除 | 贝叶斯推断模型, 网络分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | Nr4a1基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Neutrophil Heterogeneity Is Modified during Acute Lung Inflammation in Apoa1-/- Mice
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300459
PMID:38912868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析载脂蛋白A-I缺失对急性肺部炎症中中性粒细胞异质性的影响 | 首次揭示Apoa1缺失通过改变中性粒细胞和巨噬细胞亚群分布及促炎基因表达来调控急性气道炎症 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探讨载脂蛋白A-I调节急性气道炎症的分子机制 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞转录组学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析，轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠经LPS+屋尘螨诱导的炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Single-Cell Profiling Reveals Immune Aberrations in Progressive Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Aug-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0979OC
PMID:38717443
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示特发性肺纤维化患者外周免疫系统的异常变化 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘IPF患者外周免疫细胞图谱，发现经典单核细胞和调节性T细胞的预后预测价值 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 构建特发性肺纤维化患者外周免疫系统的单细胞图谱 | 特发性肺纤维化患者和对照受试者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，蛋白质浓度测量 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，蛋白质浓度数据 | 38个PBMC样本（25名IPF患者，13名对照受试者），共149,564个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 5'单细胞RNA测序 |
| 32 | 2025-10-06 |
Scalable genetic screening for regulatory circuits using compressed Perturb-seq
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01964-9
PMID:37872410
|
研究论文 | 本研究开发了一种压缩Perturb-seq方法，通过算法优化显著降低了单细胞CRISPR筛选技术的成本 | 将压缩感知算法应用于Perturb-seq技术设计，实现了在单个细胞或液滴中测量多个随机扰动 | NA | 开发可扩展的基因调控回路筛选方法 | 598个与细菌脂多糖免疫反应相关的基因 | 功能基因组学 | 免疫疾病 | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | 压缩感知算法 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Perturb-seq（CRISPR扰动与单细胞RNA测序结合技术） |
| 33 | 2025-10-06 |
TRANSCRIPTOMIC DIFFERENCES IN PERIPHERAL MONOCYTE POPULATIONS IN SEPTIC PATIENTS BASED ON OUTCOME
2024-08-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002379
PMID:38713581
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者外周血单核细胞亚群的转录组差异与临床结局的关系 | 首次在单细胞水平揭示不同临床结局脓毒症患者的经典与非经典单核细胞转录组差异，发现TNF-α产生相关的基因表达模式 | 样本量未明确说明，研究结果需要更大规模验证 | 阐明决定脓毒症患者不同临床轨迹的免疫学机制 | 脓毒症患者的外周血经典和非经典单核细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，通路分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Scanorama: integrating large and diverse single-cell transcriptomic datasets
2024-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00991-3
PMID:38844552
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研究论文 | 介绍用于整合大型多样化单细胞转录组数据集的Scanorama工具及其使用流程 | 开发了能够有效整合来自不同实验、实验室和技术的单细胞RNA测序数据的工具，解决了数据集间技术变异问题 | 需要用户具备细胞生物学、转录组技术和生物信息学的基础知识 | 提高异质性单细胞RNA测序数据的质量和解释能力 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Dynamic intrauterine crosstalk promotes porcine embryo implantation during early pregnancy
2024-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2557-x
PMID:38748354
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示猪胚胎着床过程中母胎对话的动态机制 | 开发了新型工具ExtraCellTalk构建母胎对话动态图谱，并发现保守的RBP4/STRA6信号通路 | 研究局限于猪模型，人类临床适用性需进一步验证 | 探究胚胎着床过程中的母胎对话机制 | 猪围植入期胚胎和对应母体子宫内膜 | 单细胞组学 | 生殖医学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003
PMID:38776915
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析猪到人肾脏异种移植中的细胞动态变化和免疫反应 | 首次在猪到人肾脏异种移植中应用纵向单细胞转录组分析，揭示了时间分辨的细胞动态变化和免疫反应 | 仅分析了两例异种移植案例，样本量有限 | 研究异种移植过程中移植肾脏与受体之间的相互作用和免疫反应 | 猪肾脏异种移植受体和移植肾脏组织 | 单细胞生物学 | 器官移植 | 单细胞RNA测序, 纵向RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | 2例猪到人肾脏异种移植案例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-08-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000503
PMID:39082968
|
研究论文 | 本研究通过分析慢性HCV感染患者的B细胞受体库和单细胞转录组，揭示了表达病毒中和性抗原受体的B细胞具有淋巴瘤样转录组特征 | 首次发现表达IGHV1-69编码的HCV中和性抗原受体的B细胞在慢性HCV感染患者中表现出持续的致癌转录组特征，即使病毒清除后仍长期存在 | 研究样本量有限，体外信号传导实验可能无法完全反映体内复杂环境 | 探究慢性HCV感染与B细胞异常增殖及淋巴瘤风险增加的机制关联 | 慢性HCV感染患者和经直接抗病毒治疗获得持续病毒学应答的患者 | 免疫学 | 丙型肝炎病毒感染 | B细胞受体测序，单细胞RNA测序，体外信号传导实验 | TKO模型 | 基因组测序数据，转录组数据 | 慢性HCV感染患者和HCV SVR患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Epsins oversee smooth muscle cell reprograming by influencing master regulators KLF4 and OCT4
2024-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.08.574714
PMID:39131381
|
研究论文 | 本研究揭示了Epsins通过调控主调控因子KLF4和OCT4来监督平滑肌细胞重编程的机制 | 首次发现Epsins通过不同方式调控OCT4和KLF4来引导平滑肌细胞向有益细胞类型重编程 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Epsins在平滑肌细胞重编程中的作用及其与冠状动脉疾病的关系 | 小鼠和人体的平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.005
PMID:38925112
|
研究论文 | 本研究通过开发CPA-Perturb-seq多路复用单细胞扰动筛选技术，系统解析了42种切割加尾调控因子对多聚腺苷酸化位点选择的调控机制 | 首次将多路复用单细胞扰动筛选与3'单细胞RNA测序相结合，开发了APARENT-Perturb深度神经网络模型解析串联多聚腺苷酸化位点的顺式调控机制 | 研究仅针对42种已知的CPA调控因子，可能未涵盖所有相关调控因子 | 深入理解切割加尾机制调控多聚腺苷酸化位点选择的分子机制 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化位点及其调控因子 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 多路复用扰动筛选, 深度神经网络 | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42种CPA调控因子的扰动数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 3' scRNA-seq | NA | 3'单细胞RNA测序 |
| 40 | 2025-10-06 |
[Ionizing radiation-induced damage (IRD) to and repair mechanisms of the male reproductive system: Report of testicular function changes in a case of IRD]
2024-Aug, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:40778793
|
研究论文 | 研究电离辐射对睾丸结构和功能的损伤机制及L-肉碱的干预效果 | 首次结合单细胞转录组测序与动物模型验证，揭示电离辐射通过干扰Leydig细胞和巨噬细胞的脂代谢通路导致生殖损伤 | 仅基于单个病例报告和小鼠模型，样本量有限 | 探究电离辐射对男性生殖系统的损伤机制及防治策略 | 人类睾丸组织和小鼠模型 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序, 辐射剂量模拟, 精液分析, 激素检测, 电子显微镜 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 精液样本, 激素水平数据, 电子显微镜图像 | 1例人类病例+小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |