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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-24 |
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332043
PMID:38857990
|
研究论文 | 通过患者来源的类器官生物库，发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调是严重克罗恩病的新机制 | 首次发现肠上皮MHC-I的表观遗传失调（DNA甲基化缺失）是克罗恩病发病的新型机制，并通过类器官-淋巴细胞共培养和基因敲除小鼠模型验证了功能影响 | 未明确提及 | 研究肠上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 | 来自168名患者（72名CD、23名UC、73名健康对照）的312个肠上皮类器官 | 机器学习 | 克罗恩病 | DNA甲基化测序, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因编辑 | 机器学习模型 | DNA甲基化数据, RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 168名患者的312个肠上皮类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-05-24 |
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331532
PMID:38816188
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研究论文 | 本研究展示了人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植能够改善先天性巨结肠患者组织中的功能反应 | 首次证实人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞能够再定植并增加先天性巨结肠患者结肠组织的功能反应 | NA | 评估人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞移植对先天性巨结肠患者结肠组织的整合和功能影响 | 先天性巨结肠患者结肠组织样本，以及人类多能干细胞衍生的肠神经系统祖细胞 | 数字病理学 | 先天性巨结肠 | 单细胞RNA测序，蛋白质表达分析，钙成像，器官浴收缩性测试 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，钙成像数据 | 先天性巨结肠患者结肠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析细胞转录组特征 |
| 23 | 2026-05-24 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-08-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331773
PMID:38719336
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示胆囊癌发病过程中微环境动态变化及免疫调控因子OLFM4的作用 | 首次构建胆囊疾病多病理状态单细胞图谱，发现OLFM4通过MAPK-AP1轴上调PD-L1促进免疫逃逸，提出其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 部分发现需进一步在更大样本及临床队列中验证，体外和体内机制研究需补充更多分子细节 | 阐明胆囊癌及良性胆囊疾病的细胞生态系统和分子特征，为癌症预防和治疗提供新靶点 | 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及癌旁正常组织的细胞 | 机器学习 | 胆囊癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 230,737个细胞，来自15例胆囊癌、4例胆囊炎、3例胆囊息肉、5例胆囊腺瘤和16例癌旁正常组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 24 | 2026-05-23 |
Multicellular 3D bioprinted human gallbladder carcinoma forin vitromimicry of tumor microenvironment and intratumoral heterogeneity
2024-08-22, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad6d8c
PMID:39121870
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research paper | 本研究利用三维生物打印技术构建多细胞人胆囊癌模型，模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 | 首次使用同心圆柱四培养模型重建胆囊癌组织中细胞的空间分布，并通过单细胞RNA测序揭示模型内存在两种不同的胆囊癌细胞亚型，验证了肿瘤内异质性的模拟 | 未提及具体局限性 | 构建高保真多细胞三维胆囊癌模型以模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 | 人胆囊癌细胞、内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 | digital pathology | 胆囊癌 | 三维生物打印, 单细胞RNA测序 | 三维共培养模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-05-23 |
ITGB6 modulates resistance to anti-CD276 therapy in head and neck cancer by promoting PF4+ macrophage infiltration
2024-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51096-0
PMID:39152118
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研究论文 | 本研究揭示ITGB6通过促进PF4+巨噬细胞浸润调控头颈癌对anti-CD276治疗的抵抗机制 | 首次发现ITGB6通过调控CX3CL1-CX3CR1轴介导PF4+巨噬细胞招募，进而影响anti-CD276治疗效果，并阐明其在anti-PD1治疗抵抗中的逆转作用 | 研究主要基于小鼠模型，结论在人类患者中的验证尚需进一步研究 | 探究头颈鳞癌对anti-CD276治疗产生抵抗的机制及潜在干预靶点 | 头颈鳞状细胞癌小鼠模型 | 机器学习 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 化学诱导和原位癌小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Unraveling the dynamics of myometrial remodeling: insights from single-cell and spatial transcriptomics in term pregnancy
2024-08-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-05-22 |
Host-pathogen interactions in the Plasmodium-infected mouse liver at spatial and single-cell resolution
2024-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51418-2
PMID:39160174
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研究论文 | 结合空间转录组学与单核RNA测序，解析疟原虫感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作 | 首次在空间和单细胞分辨率下揭示疟疾感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作，发现了感染相关脂质代谢变化、不同肝小叶区域的炎症程序差异以及‘炎症热点’区域 | 研究未提供具体局限性信息 | 探索疟原虫感染过程中宿主反应在复杂肝组织中的协调机制 | 伯氏疟原虫感染的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | 疟疾 | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 基因表达数据（空间转录组和单核RNA测序） | 多时间点的小鼠肝脏组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学，单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组，10x Chromium用于单核RNA测序 |
| 28 | 2026-05-22 |
Deciphering cell-cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network
2024-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51329-2
PMID:39155292
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研究论文 | 提出DeepTalk方法，利用子图图注意力网络整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，在单细胞分辨率下推断细胞间通讯 | 首次将子图图注意力网络应用于空间转录组学，实现单细胞分辨率的细胞间通讯推断，并能在多平台数据集上表现优异 | 未提及具体局限性，但依赖于scRNA-seq和ST数据的整合质量，可能对数据噪声敏感 | 开发一种通用方法，在单细胞分辨率下准确推断空间细胞间通讯 | 细胞间通讯、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 图注意力网络 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多个跨平台数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-22 |
Synergistic activation by Glass and Pointed promotes neuronal identity in the Drosophila eye disc
2024-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51429-z
PMID:39154080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和靶向DamID技术，揭示Glass和Pointed转录因子协同激活果蝇眼盘中的神经元身份 | 首次发现Glass和Pointed在基因组中共享许多结合位点，并通过中间转录因子Scratch和Scrape协同激活多层转录网络，诱导神经元分化 | 研究仅限于果蝇模型，未在哺乳动物系统中验证该机制的保守性 | 阐明EGFR信号通过转录因子Pointed与眼特异性转录因子Glass协同作用，促进果蝇眼盘光感受器神经元分化的机制 | 果蝇眼盘和翅盘中的发育中光感受器细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 靶向DamID, 转录组学 | 不适用 | 基因表达数据 | 果蝇眼盘和翅盘组织（具体样本量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 30 | 2026-05-22 |
Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases
2024-08-15, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1124/pharmrev.123.000928
PMID:38866561
|
综述 | 综述硫化氢及其供体在心脏代谢疾病中的生理和药理作用，并探讨多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序等新技术在该领域的应用前景 | 系统总结了硫化氢通过过硫化修饰调控蛋白质的新机制，并强调了多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序等新兴技术在硫化氢药理学研究中的应用潜力 | 未明确提及具体局限性，但隐含指出硫化氢在心脏代谢疾病中的作用机制仍需进一步阐明，且相关技术仍面临挑战 | 探讨内源性硫化氢的生理作用及各种硫化氢供体在心脏代谢疾病中的药理角色，并评估新兴技术在该领域的应用前景 | 心脏代谢疾病，包括其细胞、动物和临床研究层面 | 机器学习 | 心血管疾病 | 多组学、肠道菌群分析、类器官分析、单细胞测序 | NA | 文本， 图像， 序列数据 | NA | 10x Genomics， Illumina | 单细胞RNA测序， 多组学， 肠道菌群分析， 类器官分析 | 10x Chromium， Illumina NovaSeq | 用于单细胞测序和基于测序的多组学分析 |
| 31 | 2026-05-20 |
Optics-free Spatial Genomics for Mapping Mouse Brain Aging
2024-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.06.606712
PMID:39149282
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研究论文 | 介绍一种无光学元件的空间基因组学技术，用于绘制小鼠脑衰老图谱 | 开发无光学元件的空间转录组学平台，无需预定义捕获阵列或大量成像，能同时处理多个组织切片且快速经济 | 未提及具体限制 | 研究小鼠脑衰老过程中区域特异性基因表达和细胞动力学变化 | 成年和老年小鼠的三十个脑区 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年和老年小鼠的三十个脑区 | NA | 空间转录组学 | NA | 无光学元件的空间转录组学平台 |
| 32 | 2026-05-19 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | METI通过整合细胞形态与空间转录组学，深度描绘肿瘤生态系统 | 提出了形态学增强空间转录组分析整合器（METI），弥补了现有工具未充分考虑组织学特征且依赖单细胞RNA测序数据的不足 | 文中未提及具体限制 | 开发一种整合细胞形态与空间转录组学的分析框架，以更深入地理解肿瘤微环境中的分子景观和细胞相互作用 | 多种肿瘤组织，包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前病变组织 | 计算机视觉, 机器学习 | 肺癌, 胃癌, 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-18 |
Accurate long-read transcript discovery and quantification at single-cell, pseudo-bulk and bulk resolution with Isosceles
2024-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51584-3
PMID:39183289
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研究论文 | 介绍Isosceles计算工具包，用于从纳米孔长读长测序数据中准确检测和定量mRNA异构体，涵盖单细胞、伪批量及批量分辨率 | Isosceles在异构体检测敏感性和定量准确性上优于现有方法，能提高单细胞转录组在异构体水平的定量保真度，并揭示神经元分化谱系内和谱系间的协调剪接 | 依赖纳米孔长读长测序技术，可能受制于该技术的噪声和误差 | 开发一种计算工具，提升从纳米孔长读长测序数据中检测和定量mRNA异构体的准确性，支持单细胞、伪批量及批量分辨率 | 纳米孔长读长测序数据中的mRNA异构体 | 自然语言处理， 计算机视觉 | NA | 纳米孔测序 | Isosceles | 测序数据 | 合成数据集和生物学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-05-18 |
FASN-mediated fatty acid biosynthesis remodels immune environment in Clonorchis sinensis infection-related intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.016
PMID:38508240
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研究论文 | 通过多组学方法揭示华支睾吸虫感染相关肝内胆管癌中FASN介导的脂肪酸合成重塑免疫环境 | 首次综合运用单细胞RNA测序、全外显子组测序、RNA测序、代谢组学及空间转录组学分析华支睾吸虫相关肝内胆管癌的代谢重塑和免疫微环境，发现FASN抑制剂联合免疫治疗可逆转免疫抑制微环境 | 未明确指出具体局限性 | 研究华支睾吸虫感染相关肝内胆管癌的临床影响及潜在分子特征 | 251例肝内胆管癌患者（来自三个医学中心）及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, RNA测序, 代谢组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 基因组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 251例肝内胆管癌患者样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全外显子组测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学，Illumina NovaSeq用于全外显子组测序及RNA测序 |
| 35 | 2026-05-16 |
Physical modeling of embryonic transcriptomes identifies collective modes of gene expression
2024-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.26.605398
PMID:39131269
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研究论文 | 利用统计物理学方法和早期海鞘胚胎的单细胞测序数据，构建胚胎转录组的物理模型，识别基因表达的集体模式 | 整合自然变异与统计物理的建模及推断技术，从完整互联胚胎层面分析转录组，通过统计相关性揭示细胞间相互作用网络及基因表达的集体模式 | 未明确提及，可能依赖于特定物种（海鞘）的数据，方法推广性有待验证 | 从单细胞基因表达测量中推断空间相互作用及其诱导的集体表达模式，探索整体胚胎转录组的动态特性 | 早期海鞘胚胎的转录组 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 利用近期早期海鞘胚胎的单细胞测序数据（具体样本量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-05-16 |
Somatic BrafV600E mutation in the cerebral endothelium induces brain arteriovenous malformations
2024-08, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09918-8
PMID:38700584
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研究论文 | 通过脑内皮细胞中的体细胞BrafV600E突变成功诱导出与人类病变高度相似的小鼠脑动静脉畸形模型 | 首次在脑内皮细胞中引入BrafV600E突变，开发出与人类临床表型一致的散发性脑动静脉畸形小鼠模型 | 达拉非尼对成熟脑动静脉畸形病变的疗效仍不确定 | 探索脑动静脉畸形的发病机制并评估潜在治疗策略 | 携带脑内皮细胞Braf突变的小鼠 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄组及不同脑区的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序系统 |
| 37 | 2026-05-16 |
Generation and characterisation of scalable and stable human pluripotent stem cell-derived microvascular-like endothelial cells for cardiac applications
2024-08, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09929-5
PMID:38775849
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研究论文 | 开发并表征了一种可规模化、稳定的基于人多能干细胞的心肌微血管样内皮细胞生成方案 | 首次利用三维搅拌罐生物反应器结合高浓度VEGF-A处理，从血管类器官中生成表型稳定且具有心脏特异性的微血管样内皮细胞和壁细胞 | 未明确说明局限性，但可能涉及长期稳定性及体内功能验证的不足 | 为冠状动脉微血管疾病的研究及心脏组织工程应用提供可靠的细胞模型 | 人多能干细胞来源的内皮细胞和壁细胞 | 机器学习和数字病理学 | 冠状动脉微血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 38 | 2026-05-15 |
The Impact of Low Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569988
PMID:38106143
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研究论文 | 利用先进成像和单细胞RNA测序技术，探究低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响 | 首次结合断层成像、共聚焦成像和单细胞RNA测序，全面揭示母体低蛋白饮食导致肾单位数量减少的细胞和分子机制 | 研究中提到低蛋白饮食对代谢、细胞周期、表观遗传调控和信号传导具有多效性影响，但未明确这些变化的因果关系或长期后果 | 阐明母体低蛋白饮食如何通过改变细胞和分子过程影响胎儿肾脏发育中的肾单位形成 | 小鼠胚胎肾脏样本（E14.5和P0阶段） | 机器学习，数字病理学 | 慢性肾脏病，高血压 | 单细胞RNA测序，光学投影断层成像，共聚焦成像 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 小鼠胚胎肾脏样本（E14.5和P0阶段），具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-05-10 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 研究组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其通过调控巨噬细胞极化抑制牙槽骨丢失的机制 | 首次探讨JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调控作用及其对牙槽骨丢失的保护机制 | 研究结果主要基于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体体内直接验证；且样本量较小 | 探究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调控牙周炎的潜在机制 | 人牙龈组织样本（健康与炎症各9例）、小鼠牙周炎模型、巨噬细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞测序、RT-qPCR、免疫组化、Western blotting、免疫荧光染色、siRNA转染 | NA | 基因表达数据、组织样本数据 | 9例健康牙龈组织、9例炎症牙龈组织；小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-10 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析人牙槽骨炎症微环境中肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱以阐明其自然转归的潜在结局 | 首次通过单细胞RNA测序构建了人牙槽骨不同类型肉芽组织的单细胞图谱，揭示了炎症肉芽组织在自然消退后与修复性肉芽组织在细胞组成和基因表达上的相似性，并鉴定了与炎症调控和血管生成相关的关键基因（如Igbp5、Zfp36、Timp3等） | 未提供明确的局限性描述 | 探究人牙槽窝肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱，以揭示炎症微环境中肉芽组织自然转归的潜在结局 | 人牙槽窝肉芽组织样本（来自牙周炎拔牙后行延迟位点保存或自体牙移植的12名患者） | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、HE染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个牙槽窝肉芽组织样本，共捕获20,448个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |