单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
361	2024-08-21	Transcriptomic analysis unveils bona fide molecular signatures of microglia under conditions of homeostasis and viral encephalitis 2024-Aug-17, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03197-2 PMID:39153993	研究论文	本研究通过多种实验方法描绘了病毒感染期间小胶质细胞的转录组图谱，并发现细胞分选过程中的剪切应力是激活基因人工诱导的关键因素	开发了一种利用核糖体标签方法富集小胶质细胞特异性转录本的策略，并定义了健康和病毒感染条件下小胶质细胞的真实分子特征	NA	研究小胶质细胞在健康和病毒性脑炎条件下的转录组特征	小胶质细胞在健康和病毒感染条件下的转录组	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	大规模
362	2024-08-21	Breaking barriers: improving time and space resolution of arbuscular mycorrhizal symbiosis with single-cell sequencing approaches 2024-Aug-17, Biology direct IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13062-024-00501-1 PMID:39154166	研究论文	本文通过采用单细胞RNA测序技术，提高了丛枝菌根共生体时间和空间分辨率的细胞和分子基础研究	采用单细胞RNA测序技术，提供了对植物-微生物相互作用转录组复杂性的前所未有的洞察	单细胞分析虽然提高了分辨率，但牺牲了空间视角，需要与空间转录组学方法结合以获得全面概览	深入解析丛枝菌根共生体的复杂相互作用和关键过程	丛枝菌根共生体的细胞和分子基础	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
363	2024-08-21	Combining single-cell spatial transcriptomics and molecular simulation to develop in vivo probes targeting the perineural invasion region of adenoid cystic carcinoma 2024-Aug-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34628 PMID:39157355	研究论文	本文通过结合单细胞空间转录组学和分子模拟技术，开发了一种针对腺样囊性癌神经周围侵犯区域的体内探针	设计了基于神经周围侵犯区域施万细胞抗原呈递特性的肽探针，用于动态标记肿瘤细胞侵入神经的过程	NA	开发针对腺样囊性癌神经周围侵犯区域的体内探针	腺样囊性癌的神经周围侵犯区域	数字病理学	头颈部肿瘤	空间转录组学和单细胞转录组测序	NA	转录组数据	一例腺样囊性癌伴有神经周围侵犯的组织样本
364	2024-08-21	Identification of epithelial-related artificial neural network prognostic models for the prediction of bladder cancer prognosis through comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA sequencing 2024-Aug-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34632 PMID:39157397	研究论文	本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出与膀胱癌预后相关的上皮细胞相关的人工神经网络预测模型	本研究创新性地融合了单细胞RNA测序和RNA测序评估，以识别膀胱癌的新型生物标志物，并构建了包含17个特征基因的人工神经网络预后模型	NA	旨在通过融合单细胞RNA测序和RNA测序评估，识别膀胱癌的潜在生物标志物，并建立实用的临床预后模型	膀胱癌（BLCA）及其相关生物标志物	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	人工神经网络	RNA测序数据	训练集来自TCGA数据库，验证集（GSE32894）和单细胞数据集（GSE135337）来自GEO数据库
365	2024-08-21	Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues 2024-Aug, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-024-01885-y PMID:38956380	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究了人类组织中第1组先天淋巴细胞（ILC1s）的多样性	首次在人类组织中识别出高度可变的ILC1亚型，并描述了不同组织中ILC1和自然杀伤（NK）细胞的表达谱	NA	探究人类组织中第1组先天淋巴细胞（ILC1s）的多样性及其在疾病中的潜在作用	人类组织中的第1组先天淋巴细胞（ILC1s）及其亚型	免疫学	NA	单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	RNA	多个组织样本
366	2024-08-21	ScRNA-seq revealed the tumor microenvironment heterogeneity related to the occurrence and metastasis in upper urinary tract urothelial carcinoma 2024-Aug, Cancer gene therapy IF:4.8Q1 DOI:10.1038/s41417-024-00779-3 PMID:38877164	研究论文	本文通过单细胞转录组测序技术，研究了上尿路上皮癌（UTUC）的肿瘤微环境异质性及其与发生和转移的关系	首次揭示了UTUC肿瘤细胞的起源及其与转移性肿瘤细胞的同源性，并发现UTUC肿瘤微环境中不存在免疫抑制现象	研究样本仅来自3名高级别UTUC患者，可能存在样本量较小的问题	探索UTUC发生和转移的可能机制，并寻找潜在的诊断和治疗靶点	上尿路上皮癌的正常组织、原发肿瘤病变和淋巴转移	数字病理学	泌尿系统疾病	单细胞RNA测序（ScRNA-seq）	NA	转录组数据	28,315个细胞来自3名高级别UTUC患者
367	2024-08-19	Requirement of Pdgfrα+ cells for calvarial bone repair 2024-Aug-16, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1093/stcltm/szae041 PMID:38986535	研究论文	本文研究了血小板衍生生长因子受体α（PDGFRα）阳性细胞在颅骨修复中的作用	首次详细探讨了PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨愈合过程中的贡献	NA	探究PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨修复中的作用	PDGFRα阳性间充质细胞	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	细胞	使用Pdgfrα-CreERTM;mT/mG报告动物模型进行研究
368	2024-08-19	Exploring the molecular mechanisms and shared potential drugs between rheumatoid arthritis and arthrofibrosis based on large language model and synovial microenvironment analysis 2024-08-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69080-5 PMID:39147768	研究论文	本研究基于大型语言模型和滑膜微环境分析，探索类风湿性关节炎和关节纤维化的分子机制及潜在共享药物	本研究采用文本挖掘方法和药物再定位技术，发现并验证了针对类风湿性关节炎和关节纤维化的新型潜在药物	NA	旨在全面分析类风湿性关节炎和关节纤维化之间的关系，并识别新的临床用药	类风湿性关节炎和关节纤维化	NA	类风湿性关节炎，关节纤维化	文本挖掘，单细胞测序	NA	基因表达数据	5个批量测序数据集和4个单细胞测序数据集
369	2024-08-19	Janus liposozyme for the modulation of redox and immune homeostasis in infected diabetic wounds 2024-Aug, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-024-01660-y PMID:38740936	研究论文	本文报道了一种名为Janus脂酶的新型治疗剂，用于治疗糖尿病伤口感染并促进伤口愈合	开发了一种包含脂质体样硒酶的Janus脂酶，用于清除活性氧（ROS）以恢复组织氧化还原和免疫稳态，并结合光动力疗法治疗感染	NA	研究Janus脂酶在治疗糖尿病伤口感染和促进伤口愈合中的应用	糖尿病伤口感染及伤口愈合过程	NA	糖尿病	光动力疗法	NA	RNA序列	使用T细胞缺陷的Rag1小鼠和迷你猪进行实验
370	2024-08-18	Effects of HOX family regulator-mediated modification patterns and immunity characteristics on tumor-associated cell type in endometrial cancer 2024-08-14, Molecular biomedicine IF:6.3Q1 DOI:10.1186/s43556-024-00196-w PMID:39138733	研究论文	本研究分析了HOX基因在子宫内膜癌中对多种细胞类型表达机制及肿瘤微环境细胞浸润发展的潜在作用	开发了一种新的评分系统来量化子宫内膜癌中的个体HOX模式，并揭示了HOX基因在肿瘤发展和免疫反应中的关键作用	NA	探讨HOX基因在子宫内膜癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响	子宫内膜癌患者的转录组数据和临床信息	数字病理学	子宫内膜癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	529名子宫内膜癌患者
371	2024-08-18	Mechanism exploration of synergistic photo-immunotherapy strategy based on a novel exosome-like nanosystem for remodeling the immune microenvironment of HCC 2024-Aug-14, Nano convergence IF:13.4Q1 DOI:10.1186/s40580-024-00441-6 PMID:39141072	研究论文	本研究开发了一种基于新型外泌体样纳米系统的协同光免疫疗法策略，用于重塑肝细胞癌（HCC）的免疫微环境	通过载有介孔多巴胺（MPDA）和吲哚菁绿（ICG）的M1巨噬细胞衍生的纳米囊泡（M1NVs），实现对肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的M1极化，从而增强抗肿瘤免疫效果	NA	探索基于新型外泌体样纳米系统的协同光免疫疗法策略对肝细胞癌免疫微环境的影响	肝细胞癌（HCC）的免疫微环境	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	比较了HCC组织在接受MPDA/ICG@M1NVs + NIR治疗前后的细胞组成和基因表达
372	2024-08-18	Generation of a conditional cellular senescence model using proximal tubule cells and fibroblasts from human kidneys 2024-Aug-14, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-024-02131-y PMID:39143064	研究论文	本研究通过使用人肾近端小管上皮细胞（PTECs）和成纤维细胞，生成了一个条件性永生化的细胞衰老模型	本研究提供了一个新的体外细胞模型，用于研究肾脏衰老，并可作为大规模化合物测试的平台	NA	研究细胞衰老在慢性肾脏疾病（CKD）中的具体机制和相关因素	人肾近端小管上皮细胞（PTECs）和成纤维细胞	NA	慢性肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	76个人类肾脏组织切片
373	2024-08-18	Spatial multiomics reveals a subpopulation of fibroblasts associated with cancer stemness in human hepatocellular carcinoma 2024-Aug-13, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01367-8 PMID:39138551	研究论文	本研究通过结合多区域蛋白质组学、10X Genomics Visium空间转录组学和多重成像技术，揭示了肝癌微环境中与癌症干细胞特性相关的纤维母细胞亚群F5-CAF的表达异质性、功能多样性、空间分布、共定位和相互作用。	首次鉴定出与肝癌干细胞特性相关的纤维母细胞亚群F5-CAF，并阐明了其在肝癌微环境中的作用机制。	研究样本量相对较小，未来需要更大规模的研究来验证这些发现。	揭示肝癌微环境中纤维母细胞亚群与癌症干细胞特性的关联及其对肝癌发展的影响。	肝癌微环境中的纤维母细胞亚群及其与癌症干细胞的相互作用。	数字病理学	肝癌	多区域蛋白质组学、10X Genomics Visium空间转录组学、多重成像技术	NA	蛋白质组学数据、转录组学数据、成像数据	6名患者的多区域蛋白质组学样本、11名患者的空间转录组学样本、92名患者的多重成像样本
374	2024-08-18	CXCR6 expression correlates with radiotherapy response and immune context in triple-negative breast cancer-experimental studies 2024-Aug-01, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000001546 PMID:39143706	研究论文	本研究探讨了CXCR6在三阴性乳腺癌中的表达及其与放疗反应和免疫环境的关系	首次揭示了CXCR6在三阴性乳腺癌中的临床意义及其与放疗的关联	NA	阐明CXCR6在三阴性乳腺癌中的预后价值及其在乳腺肿瘤微环境中的作用	CXCR6在三阴性乳腺癌中的mRNA和蛋白质表达及其与生存率的关联	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序、批量转录组测序数据和基于荧光的多重免疫组织化学技术	NA	mRNA、蛋白质	NA
375	2024-08-17	Histone lactylation dynamics: Unlocking the triad of metabolism, epigenetics, and immune regulation in metastatic cascade of pancreatic cancer 2024-Aug-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217117 PMID:39019144	研究论文	本研究通过多组学方法探讨了组蛋白乳酸化在胰腺导管腺癌（PDAC）进展中的病理作用及其对预后预测、患者分层和肿瘤微环境（TME）表征的潜在影响	本研究揭示了“LDHA-H4K12la-免疫基因”轴在代谢-表观遗传-免疫调控框架中的新节点，为PDAC进展提供了新的视角	NA	探索组蛋白乳酸化在胰腺癌转移过程中的作用及其对代谢、表观遗传和免疫调控的影响	胰腺导管腺癌（PDAC）的进展和转移	表观遗传学	胰腺癌	多组学方法（bulk和单细胞RNA测序、代谢组学、ATAC-seq和CUT&Tag）	NA	RNA序列、代谢数据	NA
376	2024-08-17	A single-cell analysis of the NK-cell landscape reveals that dietary restriction boosts NK cell antitumor immunity via Eomesdermin 2024-Aug-16, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0944 PMID:39150687	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了饮食限制（DR）如何通过Eomesdermin增强NK细胞的抗肿瘤免疫	首次揭示了饮食限制通过Eomesdermin调控NK细胞，增强其抗肿瘤免疫功能	NA	研究饮食限制如何通过调节免疫细胞增强抗肿瘤免疫	NK细胞及其在饮食限制下的抗肿瘤免疫作用	免疫学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及小鼠模型和NK细胞样本
377	2024-08-17	Bipotential B-neutrophil progenitors are present in human and mouse bone marrow and emerge in the periphery upon stress hematopoiesis 2024-Aug-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.01599-24 PMID:39012145	研究论文	本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了健康对照组和COVID-19患者的嗜中性粒细胞，揭示了在严重感染情况下B细胞和嗜中性粒细胞谱系之间的潜在关系。	首次在人类和小鼠骨髓中发现双潜能B-嗜中性粒细胞前体，并揭示了在应激造血过程中这些细胞在周围组织中的出现及其在严重感染中的潜在作用。	NA	探究COVID-19患者中嗜中性粒细胞反应的复杂性，并揭示B细胞和嗜中性粒细胞谱系在严重感染中的关系。	健康对照组和COVID-19患者的嗜中性粒细胞，以及人类和小鼠骨髓中的粒细胞。	数字病理学	NA	RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	RNA	健康对照组和COVID-19患者的嗜中性粒细胞样本，以及人类和小鼠骨髓中的粒细胞样本。
378	2024-08-17	Cryptosporidium impacts epithelial turnover and is resistant to induced death of the host cell 2024-Aug-14, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.01720-24 PMID:38995074	研究论文	研究了隐孢子虫感染对小肠上皮细胞动态结构的影响	发现隐孢子虫感染的上皮细胞不易发生凋亡，且感染导致上皮细胞增殖和迁移增加	NA	探讨隐孢子虫感染对小肠上皮细胞动态结构的影响及其对细胞凋亡的调节作用	隐孢子虫感染的小肠上皮细胞	NA	腹泻疾病	单细胞RNA测序	NA	图像和分子数据	NA
379	2024-08-17	Integration of QTL and comprehensive analysis in the circulating inflammatory cytokines for pan-cancer 2024-Aug-13, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-024-12726-4 PMID:39138392	研究论文	本研究通过整合eQTL和pQTL分析，探讨了循环炎症细胞因子在泛癌中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响	首次使用cis-pQTL工具变量进行两样本MR设计，并通过综合敏感性分析验证结果的稳健性	研究仅基于GWAS的汇总统计数据，未涉及个体水平的数据分析	探究循环炎症细胞因子在泛癌中的遗传代理作用及其对肿瘤免疫微环境的影响	109种细胞因子和趋化因子在18种实体瘤中的作用	数字病理学	NA	eQTL, pQTL, GWAS, scRNA细胞分析	两样本MR设计	基因组数据	18种实体瘤
380	2024-08-17	The spatial distribution of intermediate fibroblasts and myeloid-derived cells dictate lymph node metastasis dynamics in oral cancer 2024-Aug-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05511-1 PMID:39138492	研究论文	研究口腔鳞状细胞癌（GB-OSCC）肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布，以及这些分布如何影响淋巴结转移的动力学	发现了肿瘤-基质界面是GB-OSCC疾病进展最活跃的区域，并识别了与淋巴结转移和疾病进展相关的空间定位基因	NA	探讨口腔鳞状细胞癌肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布，以及这些分布如何影响淋巴结转移	口腔鳞状细胞癌（GB-OSCC）肿瘤边缘的基因和细胞类型	数字病理学	口腔癌	数字空间转录组学	NA	基因表达数据	23个切除的GB-OSCC样本