单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
341	2024-08-23	Comprehensive pan-cancer analysis of ACSS3 as a biomarker for prognosis and immunotherapy response 2024-Aug-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35231 PMID:39165934	研究论文	本文通过综合泛癌分析，探讨了ACSS3作为预后和免疫治疗反应生物标志物的潜力	ACSS3被发现是一个新的生物标志物，能够预测不同人类癌症的预后，并通过调节免疫微环境影响生物学过程	NA	研究ACSS3在多种肿瘤中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响	ACSS3在不同肿瘤类型中的表达及其与临床特征、预后和免疫微环境的关系	数字病理学	泛癌	单细胞测序	NA	基因表达数据	涉及TCGA数据库中的26种癌症类型
342	2024-08-23	Comprehensive analysis of shared risk genes and immunity-metabolisms between non-alcoholic fatty liver disease and atherosclerosis via bulk and single-cell transcriptome analyses 2024-Aug-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35453 PMID:39165965	研究论文	本研究通过生物信息学分析，探讨了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）与动脉粥样硬化（AS）之间的病理关系，并利用批量和单细胞转录组分析揭示了两者共享的风险基因及免疫代谢机制	本研究首次综合分析了NAFLD与AS之间的共享风险基因，并通过单细胞转录组分析揭示了不同免疫细胞中这些基因的异常表达模式	研究主要基于生物信息学分析，未来需要更多的实验验证	探讨NAFLD与AS之间的病理关系，并寻找可能的干预策略	非酒精性脂肪肝病（NAFLD）与动脉粥样硬化（AS）	生物信息学	非酒精性脂肪肝病，动脉粥样硬化	WGCNA分析，单细胞转录组分析	NA	转录组数据	4851名参与者
343	2024-08-23	Heterogeneity effects of bisphenol A and its substitute, fluorene-9-bisphenol, on intestinal homeostasis 2024-Aug-13, Environment international IF:10.3Q1 DOI:10.1016/j.envint.2024.108948 PMID:39167857	研究论文	本研究结合肠道类器官和单细胞RNA测序技术，探讨了双酚A及其替代品氟硼酸对肠道细胞组成、分化和功能的影响	首次详细研究了双酚A及其替代品氟硼酸对肠道上皮细胞的细胞类型特异性影响，并通过构建小鼠模型进一步验证了其对肠道形态的影响	研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，对人类的具体影响还需进一步研究	探讨双酚A及其替代品氟硼酸对肠道稳态的影响	双酚A及其替代品氟硼酸对肠道上皮细胞的影响	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
344	2024-08-23	Single-cell transcriptomic analysis reveals a decrease in the frequency of macrophage-RGS1high subsets in patients with osteoarticular tuberculosis 2024-Aug-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-024-00886-9 PMID:39123125	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨关节结核患者中免疫细胞亚群的表型和功能	首次揭示了骨关节结核患者中巨噬细胞-RGS1高表达亚群频率的降低，并探讨了其在结核感染中的作用	研究仅限于病理组织和健康邻近组织的单细胞RNA测序分析，未涉及更广泛的样本类型	探究骨关节结核患者中免疫细胞亚群的表型和功能	骨关节结核患者的病理组织和健康邻近组织	数字病理学	骨关节疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	骨关节结核患者和健康对照组的组织样本
345	2024-08-23	Cancer-Associated Fibroblasts in Intrahepatic Cholangiocarcinoma: Insights into Origins, Heterogeneity, Lymphangiogenesis, and Peritoneal Metastasis 2024-Aug-06, The American journal of pathology DOI:10.1016/j.ajpath.2024.07.009 PMID:39117110	研究论文	本文探讨了肝内胆管癌中的癌症相关成纤维细胞的起源、异质性、淋巴管生成和腹膜转移机制	利用先进的单细胞RNA测序和扩展的生物标志物分析，揭示了癌症相关成纤维细胞的起源和生物复杂性	NA	研究肝内胆管癌中癌症相关成纤维细胞的复杂性和其在淋巴管生成及腹膜转移中的作用	肝内胆管癌中的癌症相关成纤维细胞	数字病理学	肝内胆管癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
346	2024-08-23	The influence of CLEC5A on early macrophage-mediated inflammation in COPD progression 2024-Aug-04, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-024-05375-0 PMID:39097839	研究论文	本研究分析了早期慢性阻塞性肺病（COPD）患者的肺组织测序数据和烟雾暴露小鼠模型，通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习识别潜在致病基因，并使用单细胞测序和细胞间通讯分析来验证CLEC5A在早期COPD中的作用。	本研究首次将CLEC5A确定为早期COPD的关键基因，并通过体外实验验证了其在促进炎症反应中的作用。	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，需要进一步的体内实验来全面验证CLEC5A在COPD中的作用。	阐明影响早期COPD进展的遗传因素，特别是与气道炎症和重塑相关的基因。	早期COPD患者的肺组织和烟雾暴露小鼠。	数字病理学	慢性阻塞性肺病	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、机器学习	NA	基因表达数据	包括早期COPD患者的肺组织和烟雾暴露小鼠的样本。
347	2024-08-23	Somatic BrafV600E mutation in the cerebral endothelium induces brain arteriovenous malformations 2024-Aug, Angiogenesis IF:9.2Q1 DOI:10.1007/s10456-024-09918-8 PMID:38700584	研究论文	本文开发了一种新的脑动静脉畸形（BAVM）小鼠模型，该模型与人类临床表现一致	成功诱导了与人类病变相似的BAVM小鼠模型，并进行了单细胞测序以揭示差异表达基因	Dabrafenib在治疗已建立的BAVM病变中的疗效尚不确定	开发一种临床一致的BAVM动物模型，以研究其生物学机制并开发创新治疗策略	脑动静脉畸形（BAVM）及其治疗策略	NA	脑血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	不同年龄组和脑区域的小鼠
348	2024-08-23	Bariatric surgery induces pancreatic cell transdifferentiation as indicated by single-cell transcriptomics in Zucker diabetic rats 2024-Aug, Journal of diabetes IF:3.0Q2 DOI:10.1111/1753-0407.13521 PMID:38149757	研究论文	本研究通过单细胞转录组学技术，探讨了减肥手术如何影响Zucker糖尿病肥胖大鼠胰腺细胞亚群的分化和转变	首次通过单细胞转录组图谱，全面描述了减肥手术后胰腺内分泌细胞的异质性和分化情况	需要进一步研究以阐明这些结果	旨在阐明减肥手术如何修改胰腺细胞亚群的分化和转变	8周龄的Zucker糖尿病肥胖大鼠	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	25只大鼠（袖状胃切除术9只，Roux-en-Y胃旁路手术9只，假手术7只）
349	2024-08-23	Single-cell RNA sequencing technology in human spermatogenesis: Progresses and perspectives 2024-Aug, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-023-04840-x PMID:37659974	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在人类精子发生中的应用及其进展和展望	介绍了单细胞RNA测序技术在男性生殖领域的独特洞察力和深度挖掘分析能力	讨论了该技术在男性生殖应用中的挑战	总结单细胞RNA测序技术在不同发育阶段和病理状态下精子发生中的研究成果和应用方向	研究对象包括原始生殖细胞、精原干细胞、Sertoli细胞等关键细胞以及不同类型的男性不育疾病	NA	男性不育	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	涵盖新生儿、青春期前、青春期和成年阶段的不同时期数据
350	2024-08-22	Blood Lipoproteins Shape the Phenotype and Lipid Content of Early Atherosclerotic Lesion Macrophages: A Dual-Structured Mathematical Model 2024-Aug-02, Bulletin of mathematical biology IF:2.0Q3 DOI:10.1007/s11538-024-01342-9 PMID:39093509	研究论文	本文开发了一种双结构数学模型，用于研究早期动脉粥样硬化病变中巨噬细胞的表型和脂质含量	提出了一个数学模型，通过分析低密度脂蛋白（LDL）和高密度脂蛋白（HDL）的血液密度，来理解巨噬细胞表型和脂质含量的关系	需要通过单细胞RNA测序数据来验证模型	探讨早期动脉粥样硬化病变中巨噬细胞的表型分布及其与脂质含量的关系	早期动脉粥样硬化病变中的巨噬细胞	NA	心血管疾病	NA	数学模型	NA	NA
351	2024-08-22	Stem-like T cells in cancer and autoimmunity 2024-Aug, Immunological reviews IF:7.5Q1 DOI:10.1111/imr.13356 PMID:38804499	综述	本文综述了干细胞样T细胞在癌症和自身免疫中的作用及其对临床治疗策略的影响	利用单细胞RNA测序和谱系追踪技术揭示了干细胞样T细胞在癌症和自身免疫中的重要作用	NA	探讨干细胞样T细胞在癌症和自身免疫中的功能及其对临床治疗的影响	干细胞样T细胞在癌症和自身免疫中的作用	NA	癌症, 自身免疫疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 谱系追踪技术	NA	RNA	NA
352	2024-08-21	Role of pericytes in regulating penile angiogenesis and nerve regeneration 2024-Aug-20, Asian journal of andrology IF:3.0Q1 DOI:10.4103/aja202455 PMID:39162179	综述	本文综述了2000年至2023年间PubMed上的研究成果，探讨了周细胞功能障碍在勃起功能障碍（ED）中的具体作用，特别是糖尿病性和神经源性ED	利用单细胞RNA测序等体外和体内技术，扩展了对周细胞的理解	周细胞在各种生理和病理条件下，特别是在ED中的具体机制仍不完全清楚	分析周细胞在ED中的具体作用，特别是糖尿病性和神经源性ED	周细胞在勃起功能障碍中的作用	NA	勃起功能障碍	单细胞RNA测序	NA	文本	NA
353	2024-08-21	Prognostic and immune infiltration implications of SIGLEC9 in SKCM 2024-Aug-17, Diagnostic pathology IF:2.4Q2 DOI:10.1186/s13000-024-01536-8 PMID:39153970	研究论文	本研究探讨了SIGLEC9在皮肤黑色素瘤（SKCM）中的表达、预后及免疫相关性	首次详细分析了SIGLEC9在SKCM中的表达与患者预后及免疫细胞浸润的关系	NA	探究SIGLEC9在SKCM中的表达与患者预后及免疫细胞浸润的关系	SIGLEC9在SKCM中的表达及其对患者预后和免疫细胞浸润的影响	数字病理学	皮肤黑色素瘤	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	基于TCGA-SKCM数据
354	2024-08-21	TLR9 activation in large wound induces tissue repair and hair follicle regeneration via γδT cells 2024-Aug-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06994-y PMID:39153998	研究论文	本研究利用成年小鼠的伤口诱导毛发新生（WIHN）模型，探讨了损伤程度与愈合过程及结果之间的关联，并揭示了 toll 样受体 9（TLR9）在感知皮肤损伤和通过调节 γδT 细胞迁移影响组织修复和再生的新作用。	首次揭示了 TLR9 在感知皮肤损伤和通过调节 γδT 细胞迁移影响组织修复和再生的新作用，并识别了 TLR9-γδT 细胞-areg 轴作为增强组织再生的新潜在靶点。	NA	探讨损伤程度与愈合过程及结果之间的关联，并揭示 TLR9 在组织修复和再生中的作用。	成年小鼠的伤口诱导毛发新生（WIHN）模型。	免疫学	NA	单细胞 RNA 测序	NA	RNA	TLR9 缺陷小鼠及伤口注射 TLR9 拮抗剂的小鼠，以及抑制 γδT 细胞迁移或敲除 γδT 细胞的小鼠。
355	2024-08-21	Transcriptomic analysis unveils bona fide molecular signatures of microglia under conditions of homeostasis and viral encephalitis 2024-Aug-17, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03197-2 PMID:39153993	研究论文	本研究通过多种实验方法描绘了病毒感染期间小胶质细胞的转录组图谱，并发现细胞分选过程中的剪切应力是激活基因人工诱导的关键因素	开发了一种利用核糖体标签方法富集小胶质细胞特异性转录本的策略，并定义了健康和病毒感染条件下小胶质细胞的真实分子特征	NA	研究小胶质细胞在健康和病毒性脑炎条件下的转录组特征	小胶质细胞在健康和病毒感染条件下的转录组	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	大规模
356	2024-08-21	Breaking barriers: improving time and space resolution of arbuscular mycorrhizal symbiosis with single-cell sequencing approaches 2024-Aug-17, Biology direct IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13062-024-00501-1 PMID:39154166	研究论文	本文通过采用单细胞RNA测序技术，提高了丛枝菌根共生体时间和空间分辨率的细胞和分子基础研究	采用单细胞RNA测序技术，提供了对植物-微生物相互作用转录组复杂性的前所未有的洞察	单细胞分析虽然提高了分辨率，但牺牲了空间视角，需要与空间转录组学方法结合以获得全面概览	深入解析丛枝菌根共生体的复杂相互作用和关键过程	丛枝菌根共生体的细胞和分子基础	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
357	2024-08-21	Combining single-cell spatial transcriptomics and molecular simulation to develop in vivo probes targeting the perineural invasion region of adenoid cystic carcinoma 2024-Aug-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34628 PMID:39157355	研究论文	本文通过结合单细胞空间转录组学和分子模拟技术，开发了一种针对腺样囊性癌神经周围侵犯区域的体内探针	设计了基于神经周围侵犯区域施万细胞抗原呈递特性的肽探针，用于动态标记肿瘤细胞侵入神经的过程	NA	开发针对腺样囊性癌神经周围侵犯区域的体内探针	腺样囊性癌的神经周围侵犯区域	数字病理学	头颈部肿瘤	空间转录组学和单细胞转录组测序	NA	转录组数据	一例腺样囊性癌伴有神经周围侵犯的组织样本
358	2024-08-21	Identification of epithelial-related artificial neural network prognostic models for the prediction of bladder cancer prognosis through comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA sequencing 2024-Aug-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34632 PMID:39157397	研究论文	本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出与膀胱癌预后相关的上皮细胞相关的人工神经网络预测模型	本研究创新性地融合了单细胞RNA测序和RNA测序评估，以识别膀胱癌的新型生物标志物，并构建了包含17个特征基因的人工神经网络预后模型	NA	旨在通过融合单细胞RNA测序和RNA测序评估，识别膀胱癌的潜在生物标志物，并建立实用的临床预后模型	膀胱癌（BLCA）及其相关生物标志物	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	人工神经网络	RNA测序数据	训练集来自TCGA数据库，验证集（GSE32894）和单细胞数据集（GSE135337）来自GEO数据库
359	2024-08-21	High-dimensional single-cell analysis of human natural killer cell heterogeneity 2024-Aug, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-024-01883-0 PMID:38956378	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和细胞转录组和表位的测序索引（CITE-seq）技术，分析了人类自然杀伤（NK）细胞的异质性	首次详细描述了健康人血液中三种主要NK细胞亚群（NK1、NK2和NK3）及其六个不同子群的分子特征、关键转录因子、生物学功能、代谢特性和细胞因子反应	NA	旨在阐明人类NK细胞的异质性及其在不同组织和肿瘤类型中的分布	人类自然杀伤细胞及其在健康和肿瘤环境中的分布	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和细胞转录组和表位的测序索引（CITE-seq）	NA	转录组	健康个体及22种肿瘤类型的NK细胞
360	2024-08-21	Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues 2024-Aug, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-024-01885-y PMID:38956380	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究了人类组织中第1组先天淋巴细胞（ILC1s）的多样性	首次在人类组织中识别出高度可变的ILC1亚型，并描述了不同组织中ILC1和自然杀伤（NK）细胞的表达谱	NA	探究人类组织中第1组先天淋巴细胞（ILC1s）的多样性及其在疾病中的潜在作用	人类组织中的第1组先天淋巴细胞（ILC1s）及其亚型	免疫学	NA	单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	RNA	多个组织样本