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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-09-04 |
Prognostic model based on B cell marker genes for NSCLC patients under neoadjuvant immunotherapy by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data
2024-Aug, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03428-1
PMID:38563846
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,构建了一个基于B细胞标记基因的预测模型,用于非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后评估 | 首次构建了基于B细胞标记基因的预测模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | NA | 构建和验证一个基于B细胞标记基因的预测模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | 非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的B细胞标记基因及其与临床结果的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 基于TCGA队列构建模型,并在三个独立的GSE队列中进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-09-04 |
Detection of transcriptome-wide microRNA-target interactions in single cells with agoTRIBE
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01951-0
PMID:37735263
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research paper | 本文通过将miRNA效应蛋白Argonaute2与ADAR2的RNA编辑域融合,实现了在单细胞水平上检测转录组范围内的miRNA-靶标相互作用。 | 本文创新性地开发了agoTRIBE方法,能够在单细胞水平上检测miRNA的靶标,克服了传统方法需要大量细胞的局限。 | NA | 研究miRNA在单细胞水平上的基因调控作用及其在细胞周期中的差异靶向作用。 | miRNA及其靶标在单细胞中的相互作用。 | natural language processing | NA | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-09-04 |
Unlocking T cell exhaustion: Insights and implications for CAR-T cell therapy
2024-Aug, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.04.022
PMID:39220881
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综述 | 本文综述了T细胞耗竭的最新机制及其对优化CAR-T细胞疗法的影响 | 探讨了利用先进的基因组工程工具和单细胞测序技术克服CAR-T细胞耗竭的策略 | 尽管CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中显示出希望,但在实体瘤中的效果仍有限 | 旨在通过理解T细胞耗竭的机制来优化CAR-T细胞疗法,以应对癌症治疗中的挑战 | CAR-T细胞疗法的优化及克服T细胞耗竭的策略 | NA | 血液恶性肿瘤 | 基因组工程工具、单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-09-03 |
Dynamic changes in pyroptosis following spinal cord injury and the identification of crucial molecular signatures through machine learning and single-cell sequencing
2024-Aug-26, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2024.116449
PMID:39217701
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研究论文 | 本文研究了脊髓损伤后细胞焦亡的动态变化,并通过机器学习和单细胞测序技术识别了关键的分子特征 | 本文首次通过机器学习算法和单细胞测序数据分析,揭示了脊髓损伤后细胞焦亡的时序动态变化和关键分子特征 | NA | 阐明脊髓损伤后细胞焦亡的主要细胞类型和相关关键基因 | 脊髓损伤后的细胞焦亡及其相关基因 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了BV2细胞和脊髓组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-09-03 |
Dissociation of Human and Mouse Tumor Tissue Samples for Single-cell RNA Sequencing
2024-Aug-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66766
PMID:39221955
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研究论文 | 本文介绍了一种快速通用的组织解离协议,用于从人和小鼠肿瘤组织样本中进行单细胞RNA测序(scRNAseq)。 | 开发了一种快速通用的解离协议,适用于多种类型的人和小鼠肿瘤样本,确保了单细胞悬液的纯净和活力。 | 解离过程可能影响单细胞的交叉污染和数据质量,以及可能导致敏感细胞群的消除和应激反应基因的上调。 | 旨在克服现有解离技术的局限性,提高单细胞RNA测序的质量和可靠性。 | 人及小鼠的肿瘤组织样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 细胞 | 多种类型的人和小鼠肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-09-02 |
Navigating the Landscape of Intestinal Regeneration: A Spotlight on Quiescence Regulation and Fetal Reprogramming
2024-Aug-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23176
PMID:38267367
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综述 | 本文综述了肠道再生过程中静息状态调节和胎儿重编程的关键作用 | 强调了静息干细胞和复苏干细胞在肠道再生中的重要性,并探讨了其潜在的临床应用 | NA | 探讨肠道再生过程中干细胞的调控机制及其临床应用潜力 | 肠道组织再生中的静息干细胞和复苏干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 类器官系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-09-02 |
μ-Opioid receptor transcriptional variants in the murine forebrain and spinal cord
2024-Aug-24, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148890
PMID:39187136
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研究论文 | 本文通过长读RNA测序、空间和单细胞转录组学技术,全面研究了小鼠中枢神经系统中μ-阿片受体编码基因Oprm1的转录变体 | 发现了小鼠Oprm1基因的主要转录本具有一个长的3'非翻译区,这与人类OPRM1主要转录本同源,并编码相同的保守C端氨基酸序列 | NA | 探索Oprm1基因在小鼠中枢神经系统中的转录变体及其功能意义 | 小鼠的前脑和脊髓中的μ-阿片受体转录变体 | 分子生物学 | NA | 长读RNA测序、RNAscope原位杂交 | NA | RNA序列 | 小鼠的丘脑、纹状体、皮质和脊髓组织 | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-09-02 |
Advances in Melanoma: From Genetic Insights to Therapeutic Innovations
2024-Aug-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081851
PMID:39200315
|
综述 | 本文综述了黑色素瘤研究中的遗传和分子机制,以及由此带来的治疗创新 | 介绍了单细胞测序、CRISPR-Cas9和AI驱动的诊断等新兴技术在黑色素瘤研究中的应用,以及免疫检查点抑制剂和个性化mRNA疫苗等免疫疗法的革命性进展 | 尽管取得了进展,但耐药机制仍然是一个挑战,需要结合疗法和持续研究以实现持久的治疗反应 | 探讨黑色素瘤的遗传和分子机制,以及这些机制如何影响肿瘤生长和治疗反应 | 黑色素瘤的遗传变异、信号通路、表观遗传修饰、肿瘤微环境以及新兴治疗技术 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-09-02 |
A Comparison of Tools That Identify Tumor Cells by Inferring Copy Number Variations from Single-Cell Experiments in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Aug-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081759
PMID:39200223
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研究论文 | 本文比较了sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具通过推断单细胞实验中的拷贝数变异来识别胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞的性能 | 本文揭示了现有工具在识别肿瘤细胞时的局限性,强调了开发更可靠算法的重要性 | 现有工具的预测结果与肿瘤生物标志物的预测存在大量假阳性,且预测结果高度依赖于样本和使用的软件 | 比较不同工具在识别胰腺导管腺癌肿瘤细胞中的性能,并评估其可靠性 | sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具的性能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 胰腺导管腺癌患者、邻近和健康组织的测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-09-02 |
circADAMTS6 via stabilizing CAMK2A is involved in smoking-induced emphysema through driving M2 macrophage polarization
2024-Aug, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2024.108832
PMID:38936066
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了吸烟相关肺气肿中M2巨噬细胞比例的增加,并发现circADAMTS6通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化,从而参与吸烟诱导的肺气肿。 | 本研究首次揭示了circADAMTS6在吸烟相关肺气肿中的新机制,即通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上,需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。 | 探索吸烟诱导肺气肿的分子机制,并寻找潜在的诊断和治疗标志物。 | 吸烟相关肺气肿中的M2巨噬细胞极化和circADAMTS6的作用机制。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人类和鼠类的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-09-01 |
Intramyocardial Sprouting Tip Cells Specify Coronary Arterialization
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324868
PMID:39092506
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和组织学验证,研究了冠状动脉内皮细胞在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 发现了冠状动脉起源于经历过特定尖端细胞表型的细胞,并识别了心肌内和心外膜下尖端细胞群体及其基因表达谱和调控途径 | NA | 理解冠状动脉内皮细胞如何协调血管重塑和动静脉分化,以开发恢复缺血心脏功能灌注的创新治疗策略 | 冠状动脉内皮细胞及其在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类胚胎的多个发育阶段和成年阶段样本 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-09-01 |
Sensory nerves drive migration of dental pulp stem cells via the CGRP-Ramp1 axis in pulp repair
2024-Aug-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05400-2
PMID:39196292
|
研究论文 | 研究探讨了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴促进牙髓干细胞迁移在牙髓修复中的作用 | 首次揭示了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴直接作用于牙髓干细胞,促进其向损伤部位的集体迁移,从而促进牙髓修复 | NA | 探究感觉神经在牙髓损伤后对牙髓干细胞行为的影响及其机制 | 牙髓干细胞和感觉神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析和免疫组织化学研究 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-09-01 |
Comprehensive pan-cancer analysis reveals EPHB2 is a novel predictive biomarker for prognosis and immunotherapy response
2024-Aug-28, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12843-0
PMID:39198775
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研究论文 | 本文通过多种数据库和生物信息学工具,全面分析了EPHB2在多种癌症中的预后和免疫治疗反应预测作用 | 首次全面探讨了EPHB2在不同癌症中的免疫学作用和预后意义,并验证了其与M2巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 探索EPHB2作为预测多种癌症预后和免疫治疗反应的新型生物标志物的潜力 | EPHB2在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 基因集富集分析(GSEA), 分子对接和动力学模拟 | NA | 转录组数据, 空间转录组学, 多荧光染色 | 涉及多种癌症类型,包括肺腺癌(LUAD)细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA-seq reveals the transcriptional program underlying tumor progression and metastasis in neuroblastoma
2024-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1081-7
PMID:39014137
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了神经母细胞瘤从原发肿瘤到骨髓转移的转录组图谱,并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | 首次通过时间分辨分析描绘了神经母细胞瘤细胞从原发肿瘤到转移的进化轨迹,并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | NA | 探究神经母细胞瘤转移的分子机制 | 神经母细胞瘤细胞及其转移过程 | 数字病理学 | 儿童恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15447个神经母细胞瘤细胞,来自8个样本,包括原发肿瘤和骨髓转移的配对样本 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-31 |
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome
2024-08-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65345-1
PMID:39191856
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据,构建并验证了一个基于急性髓系白血病(AML)肿瘤微环境(TME)的预后评分模型 | 首次基于AML的单细胞转录组数据,构建了一个包含10个关键基因的预后评分模型,用于区分AML患者的高风险和低风险组 | 需要进一步的研究来验证模型在更大样本量和其他数据集上的泛化能力 | 开发一种新的预后评分模型,以帮助预测AML患者的生存率和指导治疗策略 | 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | 预后评分模型 | 转录组数据 | 18,251个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-31 |
Assessment of SWI/SNF chromatin remodeling complex related genes as potential biomarkers and therapeutic targets in pan-cancer
2024-Aug-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02015-w
PMID:39192265
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研究论文 | 本研究全面分析了SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物途径、基质或免疫细胞浸润及药物敏感性,并评估了其在肾透明细胞癌中的进化趋势、预后标志和免疫治疗反应。 | 首次全面分析SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的多方面作用,并构建了肾透明细胞癌的预后标志。 | 研究主要集中在SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因,未涉及其他可能的生物标志物和治疗靶点。 | 探讨SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因作为潜在生物标志物和治疗靶点在泛癌中的作用。 | SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达、突变、生物途径、细胞浸润和药物敏感性。 | 数字病理学 | 泛癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, CCK-8 assay | NA | 基因表达数据 | 14种肿瘤类型的患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-29 |
Correction: Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Aug-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01283-x
PMID:39192335
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-31 |
The interferon/STAT1 signaling axis is a common feature of tumor-initiating cells in breast cancer
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557958
PMID:37745510
|
研究论文 | 本文研究了干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用 | 开发了一种新的STAT响应性谱系追踪系统,并结合原有的报告基因,揭示了STAT信号在肿瘤起始细胞中的作用 | 研究仅限于某些基底样三阴性乳腺癌异种移植模型 | 探讨干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用及其潜在的治疗意义 | 乳腺癌肿瘤起始细胞及其相关的信号通路 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括异种移植模型和临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-31 |
Activation of limbal epithelial proliferation is partly controlled by the ACE2-LCN2 pathway
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110534
PMID:39175771
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研究论文 | 本文探讨了角膜损伤后角膜上皮干细胞及其直接后代早期过渡放大(eTA)细胞的激活机制,特别是ACE2-LCN2通路在其中的作用 | 首次揭示了ACE2在角膜上皮细胞增殖中的作用及其通过TGFA/EGFR/LCN2通路的调控机制 | NA | 研究角膜损伤后角膜上皮干细胞和eTA细胞激活的调控机制 | 角膜上皮干细胞和eTA细胞的增殖机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-31 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
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研究论文 | 本研究探讨了在未治疗的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中使用个性化新抗原疫苗作为早期干预的效果 | 首次在人类中使用新抗原DNA疫苗治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤,并观察到稳定的疾病进展和激活的骨髓T细胞克隆 | 研究为非随机第一阶段试验,样本量较小,且未涉及标准疗法的比较 | 评估个性化新抗原疫苗在淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 九名无症状的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 九名患者 | NA | NA | NA | NA |