单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-09-01 |
Comprehensive pan-cancer analysis reveals EPHB2 is a novel predictive biomarker for prognosis and immunotherapy response
2024-Aug-28, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12843-0
PMID:39198775
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研究论文 | 本文通过多种数据库和生物信息学工具，全面分析了EPHB2在多种癌症中的预后和免疫治疗反应预测作用 | 首次全面探讨了EPHB2在不同癌症中的免疫学作用和预后意义，并验证了其与M2巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 探索EPHB2作为预测多种癌症预后和免疫治疗反应的新型生物标志物的潜力 | EPHB2在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 基因集富集分析(GSEA), 分子对接和动力学模拟 | NA | 转录组数据, 空间转录组学, 多荧光染色 | 涉及多种癌症类型，包括肺腺癌(LUAD)细胞系 |
| 302 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA-seq reveals the transcriptional program underlying tumor progression and metastasis in neuroblastoma
2024-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1081-7
PMID:39014137
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了神经母细胞瘤从原发肿瘤到骨髓转移的转录组图谱，并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | 首次通过时间分辨分析描绘了神经母细胞瘤细胞从原发肿瘤到转移的进化轨迹，并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | NA | 探究神经母细胞瘤转移的分子机制 | 神经母细胞瘤细胞及其转移过程 | 数字病理学 | 儿童恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15447个神经母细胞瘤细胞，来自8个样本，包括原发肿瘤和骨髓转移的配对样本 |
| 303 | 2024-08-31 |
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome
2024-08-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65345-1
PMID:39191856
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据，构建并验证了一个基于急性髓系白血病（AML）肿瘤微环境（TME）的预后评分模型 | 首次基于AML的单细胞转录组数据，构建了一个包含10个关键基因的预后评分模型，用于区分AML患者的高风险和低风险组 | 需要进一步的研究来验证模型在更大样本量和其他数据集上的泛化能力 | 开发一种新的预后评分模型，以帮助预测AML患者的生存率和指导治疗策略 | 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | 预后评分模型 | 转录组数据 | 18,251个单细胞 |
| 304 | 2024-08-31 |
Assessment of SWI/SNF chromatin remodeling complex related genes as potential biomarkers and therapeutic targets in pan-cancer
2024-Aug-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02015-w
PMID:39192265
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研究论文 | 本研究全面分析了SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物途径、基质或免疫细胞浸润及药物敏感性，并评估了其在肾透明细胞癌中的进化趋势、预后标志和免疫治疗反应。 | 首次全面分析SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的多方面作用，并构建了肾透明细胞癌的预后标志。 | 研究主要集中在SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因，未涉及其他可能的生物标志物和治疗靶点。 | 探讨SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因作为潜在生物标志物和治疗靶点在泛癌中的作用。 | SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达、突变、生物途径、细胞浸润和药物敏感性。 | 数字病理学 | 泛癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, CCK-8 assay | NA | 基因表达数据 | 14种肿瘤类型的患者数据 |
| 305 | 2024-08-29 |
Correction: Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Aug-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01283-x
PMID:39192335
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-31 |
The interferon/STAT1 signaling axis is a common feature of tumor-initiating cells in breast cancer
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557958
PMID:37745510
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研究论文 | 本文研究了干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用 | 开发了一种新的STAT响应性谱系追踪系统，并结合原有的报告基因，揭示了STAT信号在肿瘤起始细胞中的作用 | 研究仅限于某些基底样三阴性乳腺癌异种移植模型 | 探讨干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用及其潜在的治疗意义 | 乳腺癌肿瘤起始细胞及其相关的信号通路 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括异种移植模型和临床样本 |
| 307 | 2024-08-31 |
Activation of limbal epithelial proliferation is partly controlled by the ACE2-LCN2 pathway
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110534
PMID:39175771
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研究论文 | 本文探讨了角膜损伤后角膜上皮干细胞及其直接后代早期过渡放大（eTA）细胞的激活机制，特别是ACE2-LCN2通路在其中的作用 | 首次揭示了ACE2在角膜上皮细胞增殖中的作用及其通过TGFA/EGFR/LCN2通路的调控机制 | NA | 研究角膜损伤后角膜上皮干细胞和eTA细胞激活的调控机制 | 角膜上皮干细胞和eTA细胞的增殖机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 308 | 2024-08-31 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
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研究论文 | 本研究探讨了在未治疗的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中使用个性化新抗原疫苗作为早期干预的效果 | 首次在人类中使用新抗原DNA疫苗治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤，并观察到稳定的疾病进展和激活的骨髓T细胞克隆 | 研究为非随机第一阶段试验，样本量较小，且未涉及标准疗法的比较 | 评估个性化新抗原疫苗在淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 九名无症状的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 九名患者 |
| 309 | 2024-08-31 |
bHLH transcription factors cooperate with chromatin remodelers to regulate cell fate decisions during Arabidopsis stomatal development
2024-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002770
PMID:39150946
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研究论文 | 本文研究了bHLH转录因子与染色质重塑因子在拟南芥气孔发育中的细胞命运决策中的协同作用 | 本文通过scRNA-seq和ChIP-seq数据分析，揭示了气孔发育中转录调控的不同阶段，并提出了bHLH转录因子和染色质重塑因子共同调控转录和染色质重塑的模型 | NA | 探讨转录因子、顺式调控元件和表观基因组在细胞命运承诺中的协同调控机制 | 拟南芥叶表皮中的气孔发育 | 分子生物学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq | bHLH转录因子, SWI/SNF染色质重塑复合体, 组蛋白乙酰转移酶HAC1 | 基因组数据 | NA |
| 310 | 2024-08-31 |
Soma-germline communication drives sex maintenance in the Drosophila testis
2024-Aug, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae215
PMID:39183747
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了果蝇睾丸中体细胞与生殖细胞间通讯在性别维持中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术，详细解析了体细胞中Chinmo蛋白在性别决定和胰岛素信号通路中的直接调控作用 | 研究主要集中在果蝇睾丸模型中，可能需要进一步在其他物种中验证相关机制 | 探讨体细胞信号如何调控生殖细胞以实现正常的配子发生 | 果蝇睾丸中的体细胞和生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CUT&Tag | NA | RNA | 多个果蝇睾丸样本 |
| 311 | 2024-08-30 |
l-Theanine Alleviates Ulcerative Colitis by Regulating Colon Immunity via the Gut Microbiota in an MHC-II-Dependent Manner
2024-Aug-28, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c04379
PMID:39197065
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研究论文 | 本研究探讨了l-茶氨酸通过调节肠道微生物群和肠道免疫来减轻溃疡性结肠炎的机制 | 首次揭示了l-茶氨酸通过调节肠道微生物群和MHC-II依赖的方式影响肠道免疫，从而减轻溃疡性结肠炎 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体试验验证 | 探索l-茶氨酸减轻溃疡性结肠炎的机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型 | NA | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 微生物群数据 | 溃疡性结肠炎小鼠 |
| 312 | 2024-08-30 |
Accurate long-read transcript discovery and quantification at single-cell, pseudo-bulk and bulk resolution with Isosceles
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51584-3
PMID:39183289
|
研究论文 | 介绍了一种名为Isosceles的计算工具包，用于在单细胞、伪批量和批量分辨率级别上提高mRNA异构体的检测灵敏度和定量准确性 | Isosceles在异构体检测灵敏度和定量准确性方面优于其他方法 | NA | 提高单细胞转录组在异构体水平的定量忠实度，并实现灵活的下游分析 | mRNA异构体的准确检测和定量 | 生物信息学 | NA | 纳米孔长读长测序 | NA | 测序数据 | 使用合成和生物学衍生的数据集进行验证 |
| 313 | 2024-08-30 |
Biomarkers associated with immune-related adverse events induced by immune checkpoint inhibitors
2024-Aug-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i8.1002
PMID:39193157
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综述 | 本文综述了与免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件相关的生物标志物 | 探讨了机器学习、单细胞RNA测序、多组学分析和肠道微生物组分析等创新方法在识别新型生物标志物中的应用 | NA | 旨在寻找能够准确预测或诊断免疫相关不良事件的可靠生物标志物 | 免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件的生物标志物 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | 机器学习 | NA | NA |
| 314 | 2024-08-30 |
The neocortical infrastructure for language involves region-specific patterns of laminar gene expression
2024-Aug-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401687121
PMID:39133845
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析了人死后皮质组织样本中语言网络核心区域的基因表达，发现特定区域的层特异性基因表达模式与语言网络有关 | 首次揭示了语言网络中特定区域的层特异性基因表达模式，并发现这些模式与个体间结构连接变异及特定脑相关疾病有关 | NA | 探讨人类大脑语言网络的分子和细胞特征 | 人类大脑皮质组织中语言网络核心区域的基因表达 | 神经科学 | 阅读障碍，精神分裂症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 大量死后皮质组织样本 |
| 315 | 2024-08-30 |
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331532
PMID:38816188
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研究论文 | 本文研究了通过移植人源肠神经系统前体细胞来改善Hirschsprung病患者的肠道功能 | 首次展示了人多能干细胞衍生的肠神经系统前体细胞能够重新填充并增加Hirschsprung病患者结肠组织的功能反应 | NA | 探索Hirschsprung病的替代治疗方案 | 人源肠神经系统前体细胞在Hirschsprung病患者肠道组织中的功能影响 | NA | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序、蛋白质表达分析、钙成像 | NA | 组织样本 | NA |
| 316 | 2024-08-30 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331773
PMID:38719336
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胆囊癌的微环境动态和免疫调节因子olfactomedin 4的作用 | 首次揭示了胆囊癌中免疫微环境的改变，并发现了olfactomedin 4在胆囊癌进展中的关键作用 | NA | 阐明胆囊癌及其良性疾病的复杂生态系统和分子特征，以促进癌症预防和优化治疗干预 | 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及邻近正常组织 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 230,737个细胞来自15个胆囊癌样本、4个胆囊炎样本、3个胆囊息肉、5个胆囊腺瘤和16个邻近正常组织 |
| 317 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA-sequencing Analysis Reveals the Promoting Role of the Hedgehog Pathway in Epithelial Cells during Cervical Cancer Progression
2024-Aug-26, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了Hedgehog通路在宫颈癌进展中对上皮细胞的促进作用 | 发现了Hedgehog通路在STYK1+和TP73+上皮细胞亚型中的异常激活，并揭示了其在宫颈癌上皮细胞增殖和病毒过程中的作用 | NA | 全面分析Hedgehog通路在宫颈癌上皮细胞中的激活机制及其对肿瘤进展的影响 | 宫颈癌上皮细胞中的Hedgehog通路 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 9种主要细胞亚群 |
| 318 | 2024-08-29 |
Comprehensive Analysis and Experimental Validation of TLL2 as a Potential New Prognostic Biomarker Associated with Immune Infiltration in Lung Adenocarcinoma
2024-Aug-26, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究全面分析并实验验证了TLL2作为肺腺癌中与免疫浸润相关的潜在新型预后生物标志物 | 首次详细探讨了TLL2在肺腺癌中的表达与免疫浸润、肿瘤干细胞指数及药物敏感性的关联 | NA | 旨在深入分析TLL2在肺腺癌中的功能及其作为预后标志物的潜力 | TLL2在肺腺癌中的表达及其与临床症状、预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA数据库中的数据以及GSE87340和细胞系样本 |
| 319 | 2024-08-29 |
Endothelial cell heterogeneity in colorectal cancer: tip cells drive angiogenesis
2024-Aug-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05411-z
PMID:39172168
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研究论文 | 本研究旨在揭示结直肠癌（CRC）中内皮细胞（ECs）的异质性及其在血管生成中的关键作用，特别是尖端细胞的作用 | 通过单细胞RNA测序分析ECs，发现CRC中的ECs主要表现为增强的血管生成和减少的抗原呈递，这种表型转变主要由尖端细胞驱动 | NA | 揭示结直肠癌中内皮细胞的异质性及其在血管生成中的作用 | 结直肠癌中的内皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 320 | 2024-08-29 |
Exploration of bacterial lipopolysaccharide-related genes signature based on T cells for predicting prognosis in colorectal cancer
2024-Aug-06, Aging
DOI:10.18632/aging.206041
PMID:39115879
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研究论文 | 本研究通过分析细菌脂多糖（LPS）相关基因与免疫细胞的关系，探索了基于T细胞的LPS相关基因特征，用于预测结直肠癌（CRC）的预后 | 首次建立了基于T细胞的LPS相关基因风险特征，用于预测CRC的预后和免疫治疗效果 | 研究受限于技术手段，对微生物在CRC中的影响尚未完全理解 | 探索新的生物标志物，用于预测结直肠癌的预后 | 结直肠癌（CRC）的预后和免疫治疗 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | TCGA-COAD队列和GSE39582队列 |