单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 537 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-30 |
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331532
PMID:38816188
|
研究论文 | 本文研究了通过移植人源肠神经系统前体细胞来改善Hirschsprung病患者的肠道功能 | 首次展示了人多能干细胞衍生的肠神经系统前体细胞能够重新填充并增加Hirschsprung病患者结肠组织的功能反应 | NA | 探索Hirschsprung病的替代治疗方案 | 人源肠神经系统前体细胞在Hirschsprung病患者肠道组织中的功能影响 | NA | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序、蛋白质表达分析、钙成像 | NA | 组织样本 | NA |
| 302 | 2024-08-30 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331773
PMID:38719336
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胆囊癌的微环境动态和免疫调节因子olfactomedin 4的作用 | 首次揭示了胆囊癌中免疫微环境的改变，并发现了olfactomedin 4在胆囊癌进展中的关键作用 | NA | 阐明胆囊癌及其良性疾病的复杂生态系统和分子特征，以促进癌症预防和优化治疗干预 | 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及邻近正常组织 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 230,737个细胞来自15个胆囊癌样本、4个胆囊炎样本、3个胆囊息肉、5个胆囊腺瘤和16个邻近正常组织 |
| 303 | 2024-08-29 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文报道了一种通过吸入方式递送干细胞衍生的外泌体（SCENT）促进心肌梗死后心脏修复的非侵入性和可重复方法 | 首次提出通过吸入方式递送外泌体进行心脏修复，并使用单细胞RNA测序探索其作用机制 | 研究主要在动物模型中进行，临床应用的可行性和安全性需要进一步验证 | 验证SCENT治疗急性心肌梗死损伤的可行性、有效性和安全性，并探索其作用机制 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 |
| 304 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA-sequencing Analysis Reveals the Promoting Role of the Hedgehog Pathway in Epithelial Cells during Cervical Cancer Progression
2024-Aug-26, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了Hedgehog通路在宫颈癌进展中对上皮细胞的促进作用 | 发现了Hedgehog通路在STYK1+和TP73+上皮细胞亚型中的异常激活，并揭示了其在宫颈癌上皮细胞增殖和病毒过程中的作用 | NA | 全面分析Hedgehog通路在宫颈癌上皮细胞中的激活机制及其对肿瘤进展的影响 | 宫颈癌上皮细胞中的Hedgehog通路 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 9种主要细胞亚群 |
| 305 | 2024-08-29 |
Comprehensive Analysis and Experimental Validation of TLL2 as a Potential New Prognostic Biomarker Associated with Immune Infiltration in Lung Adenocarcinoma
2024-Aug-26, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究全面分析并实验验证了TLL2作为肺腺癌中与免疫浸润相关的潜在新型预后生物标志物 | 首次详细探讨了TLL2在肺腺癌中的表达与免疫浸润、肿瘤干细胞指数及药物敏感性的关联 | NA | 旨在深入分析TLL2在肺腺癌中的功能及其作为预后标志物的潜力 | TLL2在肺腺癌中的表达及其与临床症状、预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA数据库中的数据以及GSE87340和细胞系样本 |
| 306 | 2024-08-29 |
Endothelial cell heterogeneity in colorectal cancer: tip cells drive angiogenesis
2024-Aug-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05411-z
PMID:39172168
|
研究论文 | 本研究旨在揭示结直肠癌（CRC）中内皮细胞（ECs）的异质性及其在血管生成中的关键作用，特别是尖端细胞的作用 | 通过单细胞RNA测序分析ECs，发现CRC中的ECs主要表现为增强的血管生成和减少的抗原呈递，这种表型转变主要由尖端细胞驱动 | NA | 揭示结直肠癌中内皮细胞的异质性及其在血管生成中的作用 | 结直肠癌中的内皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 307 | 2024-08-29 |
Exploration of bacterial lipopolysaccharide-related genes signature based on T cells for predicting prognosis in colorectal cancer
2024-Aug-06, Aging
DOI:10.18632/aging.206041
PMID:39115879
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研究论文 | 本研究通过分析细菌脂多糖（LPS）相关基因与免疫细胞的关系，探索了基于T细胞的LPS相关基因特征，用于预测结直肠癌（CRC）的预后 | 首次建立了基于T细胞的LPS相关基因风险特征，用于预测CRC的预后和免疫治疗效果 | 研究受限于技术手段，对微生物在CRC中的影响尚未完全理解 | 探索新的生物标志物，用于预测结直肠癌的预后 | 结直肠癌（CRC）的预后和免疫治疗 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | TCGA-COAD队列和GSE39582队列 |
| 308 | 2024-08-29 |
NNMT switches the proangiogenic phenotype of cancer-associated fibroblasts via epigenetically regulating ETS2/VEGFA axis
2024-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03112-2
PMID:39069579
|
研究论文 | 本研究探讨了尼古丁酰胺N'-甲基转移酶（NNMT）通过表观遗传调控ETS2/VEGFA轴在口腔鳞状细胞癌（OSCC）中促进血管生成的机制 | 首次揭示了NNMT在癌症相关成纤维细胞（CAFs）中通过表观遗传重编程ETS2-VEGFA信号轴促进血管生成的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序和临床样本分析，未来需更多体内外实验验证 | 阐明NNMT在OSCC中促进血管生成的表观遗传分子调控网络 | NNMT在癌症相关成纤维细胞中的作用及机制 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个临床样本 |
| 309 | 2024-08-29 |
Egr1 regulates regenerative senescence and cardiac repair
2024-Aug, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00493-1
PMID:39196027
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术，揭示了成年小鼠心脏中再生性衰老的多组学特征，并探讨了其在新生小鼠心脏再生和成年小鼠心脏修复中的作用 | 首次报道了Egr1作为再生性衰老的调控因子，并揭示了其在新生和成年小鼠心脏再生中的具体作用机制 | NA | 探讨再生性衰老在心脏再生中的分子特征和功能益处 | 成年和新生小鼠心脏 | NA | 心血管疾病 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质, RNA | 成年和新生小鼠心脏样本 |
| 310 | 2024-08-29 |
APOE-NOTCH axis governs elastogenesis during human cardiac valve remodeling
2024-Aug, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00510-3
PMID:39196035
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类胎儿心脏瓣膜，揭示了APOE-NOTCH轴在瓣膜重塑过程中弹性蛋白生成的调控作用 | 首次发现APOE在胎儿心脏瓣膜间质细胞中调控弹性蛋白生成，并通过NOTCH2信号通路介导这一过程 | 研究主要集中在胎儿瓣膜，未来需进一步探讨在成人瓣膜中的作用 | 探讨APOE和NOTCH在人类心脏瓣膜重塑中调控弹性蛋白生成的机制 | 人类胎儿心脏瓣膜间质细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类胎儿心脏瓣膜的单细胞RNA测序数据 |
| 311 | 2024-08-28 |
ST2+ T-regulatory Cells in Renal Inflammation and Fibrosis following Ischemic Kidney Injury
2024-Aug-26, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000471
PMID:39186386
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-33/ST2信号通路在调节性T细胞（Tregs）中对肾脏损伤修复的作用 | 首次研究了内源性IL-33/ST2在Tregs中对肾脏损伤修复的贡献 | NA | 探讨IL-33/ST2信号通路在Tregs中对肾脏损伤修复的作用 | 肾脏炎症和纤维化 | NA | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了小鼠肾脏缺血-再灌注损伤模型和肾脏类器官 |
| 312 | 2024-08-28 |
Lamc1 promotes osteogenic differentiation and inhibits adipogenic differentiation of bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2024-08-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69629-4
PMID:39179716
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓间充质干细胞（BMSCs）晚期分化的分子机制，并鉴定了四个关键基因Lamc1、Tln2、Hexb和St3gal5在BMSCs分化中的作用 | 首次揭示了Lamc1在BMSCs晚期分化中的重要作用，并验证了其在脂肪形成和骨形成中的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和单细胞RNA测序数据，未进行体内实验验证 | 阐明骨髓间充质干细胞晚期分化的关键生物过程 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）的晚期分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分析了约14天的骨髓间充质干细胞在成骨、成脂和软骨分化后的公共转录组数据 |
| 313 | 2024-08-28 |
Single-cell profiling reveals altered immune landscape and impaired NK cell function in gastric cancer liver metastasis
2024-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03114-0
PMID:39060439
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨胃癌肝转移的免疫景观，揭示了肿瘤免疫微环境中多种免疫抑制成分的变化，并发现NK细胞功能受损与TGFβ的诱导有关 | 首次揭示胃癌肝转移中免疫微环境的详细变化，并发现TGFβ在NK细胞功能障碍中的作用，提出联合TGFβ抑制和NK细胞免疫疗法的新策略 | NA | 探讨胃癌肝转移的免疫景观及其对患者预后的影响 | 胃癌肝转移中的免疫细胞及其功能 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌肝转移样本 |
| 314 | 2024-08-27 |
Connectivity Network Feature Sharing in Single-Cell RNA Sequencing Data Identifies Rare Cells
2024-Aug-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c00796
PMID:39096508
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCLCNF的新方法，通过分析单细胞RNA测序数据中的局部连接网络特征共享来识别稀有细胞 | SCLCNF通过创建细胞连接网络并利用稀有性评分来识别稀有细胞，相较于现有技术在检测稀有细胞方面表现更优 | NA | 开发一种新方法以克服传统方法在检测稀有细胞时的不足 | 稀有细胞的识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类胚胎数据集和脓毒症数据集 |
| 315 | 2024-08-27 |
scSwinFormer: A Transformer-Based Cell-Type Annotation Method for scRNA-Seq Data Using Smooth Gene Embedding and Global Features
2024-Aug-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c00616
PMID:39101690
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于Transformer的深度学习方法scSwinFormer，用于大规模scRNA-seq数据的细胞类型注释 | scSwinFormer通过平滑基因嵌入模块和自注意力模块捕获基因间的潜在依赖关系，并利用Cell Token整合scRNA-seq数据中的全局信息，提高了细胞类型注释的准确性 | NA | 开发一种新的细胞类型注释方法，以提高scRNA-seq数据分析的准确性 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | scRNA-seq | Transformer | 文本 | 多个真实数据集 |
| 316 | 2024-08-27 |
Single-cell sequencing combined with spatial transcriptomics reveals that the IRF7 gene in M1 macrophages inhibits the occurrence of pancreatic cancer by regulating lipid metabolism-related mechanisms
2024-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1799
PMID:39118300
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合空间转录组学技术，揭示了M1巨噬细胞中的IRF7基因通过调控脂质代谢相关机制抑制胰腺癌的发生 | 首次揭示了IRF7在M1巨噬细胞中通过抑制RPS18的转录和转移，进而影响胰腺癌细胞中ILF3的表达，从而抑制脂质代谢和细胞增殖等过程 | 研究主要基于数据库中的scRNA-seq和ST数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探索IRF7在M1巨噬细胞中调控RPS18转录的分子机制，以及IRF7通过外泌体传递RPS18至胰腺癌细胞并调控ILF3表达的过程 | M1巨噬细胞中的IRF7基因、RPS18基因、ILF3表达及胰腺癌细胞的脂质代谢 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）、流式细胞术、CRISPR/Cas9编辑技术、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的scRNA-seq和ST数据，具体样本数量未详细说明 |
| 317 | 2024-08-26 |
Mitochondrial DNA Leakage Promotes Persistent Pancreatic Acinar Cell Injury in Acute Pancreatitis via the cGAS-STING-NF-κB Pathway
2024-Aug-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02132-0
PMID:39180578
|
研究论文 | 研究探讨了线粒体DNA泄漏通过cGAS-STING-NF-κB途径在急性胰腺炎中促进胰腺腺泡细胞损伤的作用 | 首次研究了cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的潜在炎症机制 | NA | 探讨cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的机制 | 急性胰腺炎患者的血浆和胰腺腺泡细胞 | NA | 急性胰腺炎 | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 血浆, 细胞 | 50名急性胰腺炎患者和10名健康捐赠者的血浆, 以及小鼠和细胞模型 |
| 318 | 2024-08-26 |
Pan-cancer single-cell dissection reveals phenotypically distinct B cell subtypes
2024-Aug-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.038
PMID:39047727
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研究论文 | 本文通过整合来自19种主要癌症类型的649名患者的单细胞RNA测序数据，建立了一个全面的人类B细胞资源，并揭示了肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征的显著异质性 | 本文首次识别出应激反应记忆B细胞和肿瘤相关非典型B细胞（TAABs），这两种肿瘤富集亚群具有预后潜力，并在泛癌种中共享 | NA | 深入理解B细胞在癌症发展中的作用 | 肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 649名患者 |
| 319 | 2024-08-25 |
Global transcription regulation revealed from dynamical correlations in time-resolved single-cell RNA sequencing
2024-Aug-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.002
PMID:39121860
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研究论文 | 本研究通过时间分辨的单细胞RNA测序数据，利用代谢标记协议和细胞周期报告系统，开发了一种随机基因表达模型，以揭示细胞生长和分裂过程中细胞大小和细胞周期依赖的转录动力学机制 | 本研究开发了一种高度可扩展的近似贝叶斯计算方法，能够校正技术变异并准确量化细胞周期中绝对爆发频率、爆发大小和降解率，以及转录速率与细胞大小的关系 | NA | 揭示单细胞中全局转录调控的动态机制 | 单细胞转录组动态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机模型 | RNA测序数据 | NA |
| 320 | 2024-08-25 |
Denoiseit: denoising gene expression data using rank based isolation trees
2024-Aug-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05899-z
PMID:39169300
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研究论文 | 本文提出了一种名为DenoiseIt的方法，用于从基因表达数据中去除潜在的异常基因，以构建一个更稳健的基因集，从而提高下游基因表达分析的质量。 | DenoiseIt采用了一种反向搜索方法，结合非负矩阵分解和隔离森林来识别和去除异常基因，与传统的正向基因搜索方法不同。 | NA | 开发一种新的方法来提高基因表达数据分析的质量，通过去除异常基因来增强生物标志物的识别。 | 基因表达数据中的异常基因 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解，隔离森林 | NA | 基因表达数据 | 应用了来自TCGA和COVID-19队列的bulk和单细胞RNA-seq数据 |