单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 537 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-09-02 |
Advances in Melanoma: From Genetic Insights to Therapeutic Innovations
2024-Aug-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081851
PMID:39200315
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综述 | 本文综述了黑色素瘤研究中的遗传和分子机制，以及由此带来的治疗创新 | 介绍了单细胞测序、CRISPR-Cas9和AI驱动的诊断等新兴技术在黑色素瘤研究中的应用，以及免疫检查点抑制剂和个性化mRNA疫苗等免疫疗法的革命性进展 | 尽管取得了进展，但耐药机制仍然是一个挑战，需要结合疗法和持续研究以实现持久的治疗反应 | 探讨黑色素瘤的遗传和分子机制，以及这些机制如何影响肿瘤生长和治疗反应 | 黑色素瘤的遗传变异、信号通路、表观遗传修饰、肿瘤微环境以及新兴治疗技术 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
| 282 | 2024-09-02 |
A Comparison of Tools That Identify Tumor Cells by Inferring Copy Number Variations from Single-Cell Experiments in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Aug-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081759
PMID:39200223
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研究论文 | 本文比较了sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具通过推断单细胞实验中的拷贝数变异来识别胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞的性能 | 本文揭示了现有工具在识别肿瘤细胞时的局限性，强调了开发更可靠算法的重要性 | 现有工具的预测结果与肿瘤生物标志物的预测存在大量假阳性，且预测结果高度依赖于样本和使用的软件 | 比较不同工具在识别胰腺导管腺癌肿瘤细胞中的性能，并评估其可靠性 | sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具的性能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 胰腺导管腺癌患者、邻近和健康组织的测序数据 |
| 283 | 2024-09-02 |
circADAMTS6 via stabilizing CAMK2A is involved in smoking-induced emphysema through driving M2 macrophage polarization
2024-Aug, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2024.108832
PMID:38936066
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了吸烟相关肺气肿中M2巨噬细胞比例的增加，并发现circADAMTS6通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化，从而参与吸烟诱导的肺气肿。 | 本研究首次揭示了circADAMTS6在吸烟相关肺气肿中的新机制，即通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。 | 探索吸烟诱导肺气肿的分子机制，并寻找潜在的诊断和治疗标志物。 | 吸烟相关肺气肿中的M2巨噬细胞极化和circADAMTS6的作用机制。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人类和鼠类的肺组织样本 |
| 284 | 2024-09-01 |
Intramyocardial Sprouting Tip Cells Specify Coronary Arterialization
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324868
PMID:39092506
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和组织学验证，研究了冠状动脉内皮细胞在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 发现了冠状动脉起源于经历过特定尖端细胞表型的细胞，并识别了心肌内和心外膜下尖端细胞群体及其基因表达谱和调控途径 | NA | 理解冠状动脉内皮细胞如何协调血管重塑和动静脉分化，以开发恢复缺血心脏功能灌注的创新治疗策略 | 冠状动脉内皮细胞及其在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类胚胎的多个发育阶段和成年阶段样本 |
| 285 | 2024-09-01 |
Sensory nerves drive migration of dental pulp stem cells via the CGRP-Ramp1 axis in pulp repair
2024-Aug-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05400-2
PMID:39196292
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研究论文 | 研究探讨了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴促进牙髓干细胞迁移在牙髓修复中的作用 | 首次揭示了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴直接作用于牙髓干细胞，促进其向损伤部位的集体迁移，从而促进牙髓修复 | NA | 探究感觉神经在牙髓损伤后对牙髓干细胞行为的影响及其机制 | 牙髓干细胞和感觉神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析和免疫组织化学研究 | NA | 细胞 | NA |
| 286 | 2024-09-01 |
Comprehensive pan-cancer analysis reveals EPHB2 is a novel predictive biomarker for prognosis and immunotherapy response
2024-Aug-28, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12843-0
PMID:39198775
|
研究论文 | 本文通过多种数据库和生物信息学工具，全面分析了EPHB2在多种癌症中的预后和免疫治疗反应预测作用 | 首次全面探讨了EPHB2在不同癌症中的免疫学作用和预后意义，并验证了其与M2巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 探索EPHB2作为预测多种癌症预后和免疫治疗反应的新型生物标志物的潜力 | EPHB2在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 基因集富集分析(GSEA), 分子对接和动力学模拟 | NA | 转录组数据, 空间转录组学, 多荧光染色 | 涉及多种癌症类型，包括肺腺癌(LUAD)细胞系 |
| 287 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA-seq reveals the transcriptional program underlying tumor progression and metastasis in neuroblastoma
2024-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1081-7
PMID:39014137
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了神经母细胞瘤从原发肿瘤到骨髓转移的转录组图谱，并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | 首次通过时间分辨分析描绘了神经母细胞瘤细胞从原发肿瘤到转移的进化轨迹，并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | NA | 探究神经母细胞瘤转移的分子机制 | 神经母细胞瘤细胞及其转移过程 | 数字病理学 | 儿童恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15447个神经母细胞瘤细胞，来自8个样本，包括原发肿瘤和骨髓转移的配对样本 |
| 288 | 2024-08-31 |
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome
2024-08-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65345-1
PMID:39191856
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据，构建并验证了一个基于急性髓系白血病（AML）肿瘤微环境（TME）的预后评分模型 | 首次基于AML的单细胞转录组数据，构建了一个包含10个关键基因的预后评分模型，用于区分AML患者的高风险和低风险组 | 需要进一步的研究来验证模型在更大样本量和其他数据集上的泛化能力 | 开发一种新的预后评分模型，以帮助预测AML患者的生存率和指导治疗策略 | 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | 预后评分模型 | 转录组数据 | 18,251个单细胞 |
| 289 | 2024-08-31 |
Assessment of SWI/SNF chromatin remodeling complex related genes as potential biomarkers and therapeutic targets in pan-cancer
2024-Aug-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02015-w
PMID:39192265
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研究论文 | 本研究全面分析了SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物途径、基质或免疫细胞浸润及药物敏感性，并评估了其在肾透明细胞癌中的进化趋势、预后标志和免疫治疗反应。 | 首次全面分析SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的多方面作用，并构建了肾透明细胞癌的预后标志。 | 研究主要集中在SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因，未涉及其他可能的生物标志物和治疗靶点。 | 探讨SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因作为潜在生物标志物和治疗靶点在泛癌中的作用。 | SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达、突变、生物途径、细胞浸润和药物敏感性。 | 数字病理学 | 泛癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, CCK-8 assay | NA | 基因表达数据 | 14种肿瘤类型的患者数据 |
| 290 | 2024-08-29 |
Correction: Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Aug-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01283-x
PMID:39192335
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2024-08-31 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
|
研究论文 | 本文介绍了Morphology-Enhanced Spatial Transcriptome Analysis Integrator (METI)框架，该框架通过整合细胞形态学和空间转录组学来深入分析肿瘤生态系统 | METI框架结合了空间转录组学、细胞形态学和精选基因签名，增强了我们对组织内分子景观和细胞相互作用的理解 | NA | 开发和评估一种新的分析工具METI，用于改善肿瘤微环境研究中的细胞类型和状态的分层以及细胞共定位分析 | 胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 | 数字病理学 | 胃癌, 肺癌, 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因数据 | 多种肿瘤组织样本，包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 |
| 292 | 2024-08-31 |
The interferon/STAT1 signaling axis is a common feature of tumor-initiating cells in breast cancer
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557958
PMID:37745510
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研究论文 | 本文研究了干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用 | 开发了一种新的STAT响应性谱系追踪系统，并结合原有的报告基因，揭示了STAT信号在肿瘤起始细胞中的作用 | 研究仅限于某些基底样三阴性乳腺癌异种移植模型 | 探讨干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用及其潜在的治疗意义 | 乳腺癌肿瘤起始细胞及其相关的信号通路 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括异种移植模型和临床样本 |
| 293 | 2024-08-31 |
Activation of limbal epithelial proliferation is partly controlled by the ACE2-LCN2 pathway
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110534
PMID:39175771
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研究论文 | 本文探讨了角膜损伤后角膜上皮干细胞及其直接后代早期过渡放大（eTA）细胞的激活机制，特别是ACE2-LCN2通路在其中的作用 | 首次揭示了ACE2在角膜上皮细胞增殖中的作用及其通过TGFA/EGFR/LCN2通路的调控机制 | NA | 研究角膜损伤后角膜上皮干细胞和eTA细胞激活的调控机制 | 角膜上皮干细胞和eTA细胞的增殖机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 294 | 2024-08-31 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
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研究论文 | 本研究探讨了在未治疗的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中使用个性化新抗原疫苗作为早期干预的效果 | 首次在人类中使用新抗原DNA疫苗治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤，并观察到稳定的疾病进展和激活的骨髓T细胞克隆 | 研究为非随机第一阶段试验，样本量较小，且未涉及标准疗法的比较 | 评估个性化新抗原疫苗在淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 九名无症状的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 九名患者 |
| 295 | 2024-08-31 |
bHLH transcription factors cooperate with chromatin remodelers to regulate cell fate decisions during Arabidopsis stomatal development
2024-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002770
PMID:39150946
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研究论文 | 本文研究了bHLH转录因子与染色质重塑因子在拟南芥气孔发育中的细胞命运决策中的协同作用 | 本文通过scRNA-seq和ChIP-seq数据分析，揭示了气孔发育中转录调控的不同阶段，并提出了bHLH转录因子和染色质重塑因子共同调控转录和染色质重塑的模型 | NA | 探讨转录因子、顺式调控元件和表观基因组在细胞命运承诺中的协同调控机制 | 拟南芥叶表皮中的气孔发育 | 分子生物学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq | bHLH转录因子, SWI/SNF染色质重塑复合体, 组蛋白乙酰转移酶HAC1 | 基因组数据 | NA |
| 296 | 2024-08-31 |
Soma-germline communication drives sex maintenance in the Drosophila testis
2024-Aug, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae215
PMID:39183747
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了果蝇睾丸中体细胞与生殖细胞间通讯在性别维持中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术，详细解析了体细胞中Chinmo蛋白在性别决定和胰岛素信号通路中的直接调控作用 | 研究主要集中在果蝇睾丸模型中，可能需要进一步在其他物种中验证相关机制 | 探讨体细胞信号如何调控生殖细胞以实现正常的配子发生 | 果蝇睾丸中的体细胞和生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CUT&Tag | NA | RNA | 多个果蝇睾丸样本 |
| 297 | 2024-08-30 |
l-Theanine Alleviates Ulcerative Colitis by Regulating Colon Immunity via the Gut Microbiota in an MHC-II-Dependent Manner
2024-Aug-28, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c04379
PMID:39197065
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研究论文 | 本研究探讨了l-茶氨酸通过调节肠道微生物群和肠道免疫来减轻溃疡性结肠炎的机制 | 首次揭示了l-茶氨酸通过调节肠道微生物群和MHC-II依赖的方式影响肠道免疫，从而减轻溃疡性结肠炎 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体试验验证 | 探索l-茶氨酸减轻溃疡性结肠炎的机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型 | NA | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 微生物群数据 | 溃疡性结肠炎小鼠 |
| 298 | 2024-08-30 |
Accurate long-read transcript discovery and quantification at single-cell, pseudo-bulk and bulk resolution with Isosceles
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51584-3
PMID:39183289
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研究论文 | 介绍了一种名为Isosceles的计算工具包，用于在单细胞、伪批量和批量分辨率级别上提高mRNA异构体的检测灵敏度和定量准确性 | Isosceles在异构体检测灵敏度和定量准确性方面优于其他方法 | NA | 提高单细胞转录组在异构体水平的定量忠实度，并实现灵活的下游分析 | mRNA异构体的准确检测和定量 | 生物信息学 | NA | 纳米孔长读长测序 | NA | 测序数据 | 使用合成和生物学衍生的数据集进行验证 |
| 299 | 2024-08-30 |
Biomarkers associated with immune-related adverse events induced by immune checkpoint inhibitors
2024-Aug-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i8.1002
PMID:39193157
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综述 | 本文综述了与免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件相关的生物标志物 | 探讨了机器学习、单细胞RNA测序、多组学分析和肠道微生物组分析等创新方法在识别新型生物标志物中的应用 | NA | 旨在寻找能够准确预测或诊断免疫相关不良事件的可靠生物标志物 | 免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件的生物标志物 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | 机器学习 | NA | NA |
| 300 | 2024-08-30 |
The neocortical infrastructure for language involves region-specific patterns of laminar gene expression
2024-Aug-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401687121
PMID:39133845
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析了人死后皮质组织样本中语言网络核心区域的基因表达，发现特定区域的层特异性基因表达模式与语言网络有关 | 首次揭示了语言网络中特定区域的层特异性基因表达模式，并发现这些模式与个体间结构连接变异及特定脑相关疾病有关 | NA | 探讨人类大脑语言网络的分子和细胞特征 | 人类大脑皮质组织中语言网络核心区域的基因表达 | 神经科学 | 阅读障碍，精神分裂症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 大量死后皮质组织样本 |