单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-09-04 |
GSDMD-Dependent Neutrophil Extracellular Traps Mediate Portal Vein Thrombosis and Associated Fibrosis in Cirrhosis
2024-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169099
PMID:39201786
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研究论文 | 本研究通过两步法全门静脉结扎在健康和硫代乙酰胺（TAA）诱导的肝硬化大鼠中建立了一种新的门静脉血栓（PVT）模型，并探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肝硬化PVT及其相关纤维化中的作用机制。 | 本研究首次验证了NETs通过促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化（MMT）介导肝硬化PVT及其相关纤维化，并发现GSDMD抑制剂disulfiram可抑制肝硬化PVT并预防相关纤维化。 | NA | 研究肝硬化门静脉血栓（PVT）的自然病程和机制。 | 肝硬化患者循环和肝脏浸润的中性粒细胞，以及肝硬化大鼠模型。 | NA | 肝硬化 | 多重免疫荧光和单细胞测序 | NA | NA | 健康和硫代乙酰胺（TAA）诱导的肝硬化大鼠 |
| 282 | 2024-09-04 |
Disturbance of Immune Microenvironment in Androgenetic Alopecia through Spatial Transcriptomics
2024-Aug-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169031
PMID:39201715
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术探讨了雄激素性脱发（AGA）中围绕毛囊上段主要部分——漏斗部的免疫细胞浸润（PII）的免疫干扰模式 | 采用空间转录组学这一高通量分析技术，详细分析了PII区域的免疫干扰，包括免疫浸润评估、基因集富集分析、细胞解卷积、差异表达分析等 | NA | 揭示雄激素性脱发中免疫微环境的精确干扰模式 | 雄激素性脱发患者的毛囊上段免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 雄激素性脱发 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 283 | 2024-09-04 |
Aggression Unleashed: Neural Circuits from Scent to Brain
2024-Aug-08, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci14080794
PMID:39199486
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综述 | 本文综述了通过嗅觉系统引发攻击行为的神经回路，并探讨了相关核心区域及其与前额叶皮层的相互作用 | 利用光遗传学、药理遗传学、单细胞RNA测序和在体电生理学等先进技术，提供了对攻击行为神经机制的新见解 | 主要关注啮齿动物的神经回路，对人类的讨论较为简略 | 探索攻击行为的神经基础，并开发新的治疗策略和临床干预措施 | 攻击行为的神经回路及其在啮齿动物和人类中的调节机制 | 神经科学 | NA | 光遗传学、药理遗传学、单细胞RNA测序、在体电生理学 | NA | NA | NA |
| 284 | 2024-09-04 |
Computational Analyses Reveal Deregulated Clock Genes Associated with Breast Cancer Development in Night Shift Workers
2024-Aug-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25168659
PMID:39201344
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研究论文 | 本研究分析了夜班工作女性乳腺癌发展中失调的时钟基因，并探讨了这些基因作为乳腺癌生物标志物的潜力 | 首次系统地评估了夜班工作对女性乳腺癌风险的影响，并鉴定了与乳腺癌相关的时钟基因和miRNA | 研究主要基于现有数据集，未来需要更多的实验验证和临床研究来确认这些发现 | 评估夜班工作暴露下时钟基因作为乳腺癌生物标志物的潜力 | 夜班工作女性的乳腺癌风险 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了Nurses' Health Studies I和II GEO数据集，以及来自健康夜班工作者和不同乳腺癌风险女性的额外基因表达数据集 |
| 285 | 2024-09-04 |
Harnessing Porphyrin Accumulation in Liver Cancer: Combining Genomic Data and Drug Targeting
2024-Aug-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080959
PMID:39199347
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研究论文 | 本文研究了健康和癌变人肝脏中血红素和卟啉代谢，利用人类肝脏转录组学和单细胞RNA测序揭示了基因表达模式，并探讨了卟啉过度驱动在癌症中的作用及潜在治疗策略。 | 发现肝癌中血红素生物合成途径的重新连接和细胞色素P450基因表达的大幅下调，以及卟啉过度驱动与侵袭性癌症患者总体生存率低的相关性。 | NA | 探讨血红素和卟啉代谢在健康和癌变人肝脏中的差异，并寻找潜在的临床治疗靶点。 | 健康和癌变的人类肝脏组织。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康和癌变的人类肝脏样本 |
| 286 | 2024-09-04 |
GRB7 Plays a Vital Role in Promoting the Progression and Mediating Immune Evasion of Ovarian Cancer
2024-Aug-07, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph17081043
PMID:39204147
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研究论文 | 本研究探讨了生长因子受体结合蛋白7（GRB7）在卵巢癌（OC）中的表达及其对疾病进展和免疫逃逸的影响 | 首次系统地研究了GRB7在卵巢癌中的表达模式及其临床意义，并证实了其在肿瘤发生和免疫调节中的功能 | NA | 寻找新的生物标志物和治疗靶点以改善卵巢癌的治疗效果 | 卵巢癌组织中GRB7的表达及其与生存率、基因网络、免疫细胞浸润和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | TCGA, GTEx, CCLE, GEO数据集分析, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 多个癌症类型的单细胞RNA测序数据 |
| 287 | 2024-09-04 |
Self-organizing models of human trunk organogenesis recapitulate spinal cord and spine co-morphogenesis
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01956-9
PMID:37709912
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研究论文 | 本文报道了生成类似人类躯干结构的方法，这些结构模拟了人类脊柱和脊髓的共同形态发生、模式化和分化 | 本文首次展示了在体外模型中实现类似体内的多组织共同形态发生和终端细胞类型的地形组织 | NA | 阐明人类器官发生中多系统事件的机制 | 人类脊柱和脊髓的共同形态发生 | 生物医学工程 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 288 | 2024-09-04 |
Prognostic model based on B cell marker genes for NSCLC patients under neoadjuvant immunotherapy by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data
2024-Aug, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03428-1
PMID:38563846
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个基于B细胞标记基因的预测模型，用于非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后评估 | 首次构建了基于B细胞标记基因的预测模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | NA | 构建和验证一个基于B细胞标记基因的预测模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | 非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的B细胞标记基因及其与临床结果的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 基于TCGA队列构建模型，并在三个独立的GSE队列中进行验证 |
| 289 | 2024-09-04 |
Scalable genetic screening for regulatory circuits using compressed Perturb-seq
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01964-9
PMID:37872410
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研究论文 | 本研究通过改进Perturb-seq设计，利用随机低维观测算法，开发了压缩Perturb-seq技术，实现了在免疫反应中对598个基因的遗传筛选，降低了成本并提高了遗传互作的学习能力。 | 压缩Perturb-seq通过测量每个细胞的多个随机扰动或每个液滴的多个细胞，并利用监管电路的稀疏结构进行计算解压缩，实现了与传统Perturb-seq相同的准确性，但成本降低了数量级。 | NA | 开发一种可扩展的遗传筛选技术，用于功能基因组学中的调控电路研究。 | 免疫反应中的598个基因。 | 功能基因组学 | 免疫疾病 | Perturb-seq | NA | RNA测序 | 598个基因 |
| 290 | 2024-09-04 |
Detection of transcriptome-wide microRNA-target interactions in single cells with agoTRIBE
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01951-0
PMID:37735263
|
research paper | 本文通过将miRNA效应蛋白Argonaute2与ADAR2的RNA编辑域融合，实现了在单细胞水平上检测转录组范围内的miRNA-靶标相互作用。 | 本文创新性地开发了agoTRIBE方法，能够在单细胞水平上检测miRNA的靶标，克服了传统方法需要大量细胞的局限。 | NA | 研究miRNA在单细胞水平上的基因调控作用及其在细胞周期中的差异靶向作用。 | miRNA及其靶标在单细胞中的相互作用。 | natural language processing | NA | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 单细胞 |
| 291 | 2024-09-04 |
Unlocking T cell exhaustion: Insights and implications for CAR-T cell therapy
2024-Aug, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.04.022
PMID:39220881
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综述 | 本文综述了T细胞耗竭的最新机制及其对优化CAR-T细胞疗法的影响 | 探讨了利用先进的基因组工程工具和单细胞测序技术克服CAR-T细胞耗竭的策略 | 尽管CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中显示出希望，但在实体瘤中的效果仍有限 | 旨在通过理解T细胞耗竭的机制来优化CAR-T细胞疗法，以应对癌症治疗中的挑战 | CAR-T细胞疗法的优化及克服T细胞耗竭的策略 | NA | 血液恶性肿瘤 | 基因组工程工具、单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-09-03 |
Dynamic changes in pyroptosis following spinal cord injury and the identification of crucial molecular signatures through machine learning and single-cell sequencing
2024-Aug-26, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2024.116449
PMID:39217701
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研究论文 | 本文研究了脊髓损伤后细胞焦亡的动态变化，并通过机器学习和单细胞测序技术识别了关键的分子特征 | 本文首次通过机器学习算法和单细胞测序数据分析，揭示了脊髓损伤后细胞焦亡的时序动态变化和关键分子特征 | NA | 阐明脊髓损伤后细胞焦亡的主要细胞类型和相关关键基因 | 脊髓损伤后的细胞焦亡及其相关基因 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了BV2细胞和脊髓组织样本 |
| 293 | 2024-09-03 |
Dissociation of Human and Mouse Tumor Tissue Samples for Single-cell RNA Sequencing
2024-Aug-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66766
PMID:39221955
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研究论文 | 本文介绍了一种快速通用的组织解离协议，用于从人和小鼠肿瘤组织样本中进行单细胞RNA测序（scRNAseq）。 | 开发了一种快速通用的解离协议，适用于多种类型的人和小鼠肿瘤样本，确保了单细胞悬液的纯净和活力。 | 解离过程可能影响单细胞的交叉污染和数据质量，以及可能导致敏感细胞群的消除和应激反应基因的上调。 | 旨在克服现有解离技术的局限性，提高单细胞RNA测序的质量和可靠性。 | 人及小鼠的肿瘤组织样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 多种类型的人和小鼠肿瘤样本 |
| 294 | 2024-09-02 |
Navigating the Landscape of Intestinal Regeneration: A Spotlight on Quiescence Regulation and Fetal Reprogramming
2024-Aug-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23176
PMID:38267367
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综述 | 本文综述了肠道再生过程中静息状态调节和胎儿重编程的关键作用 | 强调了静息干细胞和复苏干细胞在肠道再生中的重要性，并探讨了其潜在的临床应用 | NA | 探讨肠道再生过程中干细胞的调控机制及其临床应用潜力 | 肠道组织再生中的静息干细胞和复苏干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 类器官系统 | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-09-02 |
μ-Opioid receptor transcriptional variants in the murine forebrain and spinal cord
2024-Aug-24, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148890
PMID:39187136
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研究论文 | 本文通过长读RNA测序、空间和单细胞转录组学技术，全面研究了小鼠中枢神经系统中μ-阿片受体编码基因Oprm1的转录变体 | 发现了小鼠Oprm1基因的主要转录本具有一个长的3'非翻译区，这与人类OPRM1主要转录本同源，并编码相同的保守C端氨基酸序列 | NA | 探索Oprm1基因在小鼠中枢神经系统中的转录变体及其功能意义 | 小鼠的前脑和脊髓中的μ-阿片受体转录变体 | 分子生物学 | NA | 长读RNA测序、RNAscope原位杂交 | NA | RNA序列 | 小鼠的丘脑、纹状体、皮质和脊髓组织 |
| 296 | 2024-09-02 |
Advances in Melanoma: From Genetic Insights to Therapeutic Innovations
2024-Aug-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081851
PMID:39200315
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综述 | 本文综述了黑色素瘤研究中的遗传和分子机制，以及由此带来的治疗创新 | 介绍了单细胞测序、CRISPR-Cas9和AI驱动的诊断等新兴技术在黑色素瘤研究中的应用，以及免疫检查点抑制剂和个性化mRNA疫苗等免疫疗法的革命性进展 | 尽管取得了进展，但耐药机制仍然是一个挑战，需要结合疗法和持续研究以实现持久的治疗反应 | 探讨黑色素瘤的遗传和分子机制，以及这些机制如何影响肿瘤生长和治疗反应 | 黑色素瘤的遗传变异、信号通路、表观遗传修饰、肿瘤微环境以及新兴治疗技术 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
| 297 | 2024-09-02 |
A Comparison of Tools That Identify Tumor Cells by Inferring Copy Number Variations from Single-Cell Experiments in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Aug-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081759
PMID:39200223
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研究论文 | 本文比较了sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具通过推断单细胞实验中的拷贝数变异来识别胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞的性能 | 本文揭示了现有工具在识别肿瘤细胞时的局限性，强调了开发更可靠算法的重要性 | 现有工具的预测结果与肿瘤生物标志物的预测存在大量假阳性，且预测结果高度依赖于样本和使用的软件 | 比较不同工具在识别胰腺导管腺癌肿瘤细胞中的性能，并评估其可靠性 | sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具的性能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 胰腺导管腺癌患者、邻近和健康组织的测序数据 |
| 298 | 2024-09-02 |
circADAMTS6 via stabilizing CAMK2A is involved in smoking-induced emphysema through driving M2 macrophage polarization
2024-Aug, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2024.108832
PMID:38936066
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了吸烟相关肺气肿中M2巨噬细胞比例的增加，并发现circADAMTS6通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化，从而参与吸烟诱导的肺气肿。 | 本研究首次揭示了circADAMTS6在吸烟相关肺气肿中的新机制，即通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。 | 探索吸烟诱导肺气肿的分子机制，并寻找潜在的诊断和治疗标志物。 | 吸烟相关肺气肿中的M2巨噬细胞极化和circADAMTS6的作用机制。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人类和鼠类的肺组织样本 |
| 299 | 2024-09-01 |
Intramyocardial Sprouting Tip Cells Specify Coronary Arterialization
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324868
PMID:39092506
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和组织学验证，研究了冠状动脉内皮细胞在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 发现了冠状动脉起源于经历过特定尖端细胞表型的细胞，并识别了心肌内和心外膜下尖端细胞群体及其基因表达谱和调控途径 | NA | 理解冠状动脉内皮细胞如何协调血管重塑和动静脉分化，以开发恢复缺血心脏功能灌注的创新治疗策略 | 冠状动脉内皮细胞及其在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类胚胎的多个发育阶段和成年阶段样本 |
| 300 | 2024-09-01 |
Sensory nerves drive migration of dental pulp stem cells via the CGRP-Ramp1 axis in pulp repair
2024-Aug-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05400-2
PMID:39196292
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研究论文 | 研究探讨了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴促进牙髓干细胞迁移在牙髓修复中的作用 | 首次揭示了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴直接作用于牙髓干细胞，促进其向损伤部位的集体迁移，从而促进牙髓修复 | NA | 探究感觉神经在牙髓损伤后对牙髓干细胞行为的影响及其机制 | 牙髓干细胞和感觉神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析和免疫组织化学研究 | NA | 细胞 | NA |