单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 534 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-09-25 |
ZEB1-mediated fibroblast polarization controls inflammation and sensitivity to immunotherapy in colorectal cancer
2024-Aug, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00186-7
PMID:38937629
|
研究论文 | 研究ZEB1在结直肠癌相关成纤维细胞中的作用及其对免疫治疗敏感性的影响 | 首次揭示ZEB1在癌症相关成纤维细胞中的极化作用，及其对炎症和免疫治疗敏感性的调控机制 | NA | 探讨ZEB1在结直肠癌相关成纤维细胞中的功能及其对肿瘤免疫治疗的影响 | ZEB1在癌症相关成纤维细胞中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用免疫功能正常的结直肠癌小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-09-25 |
Causal association of monocytes with chronic kidney disease and the mediation role of frailty: A study integrating large-scale two-sample Mendelian randomization and single-cell analysis
2024-08, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2024.105435
PMID:38583266
|
研究论文 | 本研究通过整合大规模的两样本孟德尔随机化分析和单细胞转录组分析，探讨了单核细胞与慢性肾病及虚弱之间的因果关系 | 首次通过大规模孟德尔随机化分析和单细胞转录组分析，揭示了单核细胞与慢性肾病及虚弱之间的因果关系，并发现了潜在的共同遗传变异位点 | 研究依赖于现有的基因组关联研究数据集，可能存在数据偏倚；单细胞转录组分析的样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨单核细胞与慢性肾病及虚弱之间的因果关系，并确定单核细胞在其中的中介作用 | 慢性肾病患者、虚弱患者及单核细胞 | NA | 慢性肾病 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 基于441个全基因组关联研究数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-09-23 |
Human genetics and epigenetics of alcohol use disorder
2024-Aug-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172885
PMID:39145449
|
综述 | 本文综述了酒精使用障碍（AUD）的遗传学和表观遗传学研究进展 | 本文总结了从早期候选基因研究到当前全基因组扫描的技术进步，揭示了AUD的众多遗传和表观遗传风险因素 | 本文讨论了当前研究的局限性，包括增加GWAS和EWAS研究的能力以及扩大分析中包含的群体多样性 | 探讨酒精使用障碍的遗传学和表观遗传学机制 | 酒精使用障碍（AUD）及其遗传和表观遗传风险因素 | NA | 酒精使用障碍 | 全基因组关联研究（GWAS）、表观基因组关联研究（EWAS）、全基因组测序、多组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 超过一百万参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-09-23 |
Integrative single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics analyses reveal diverse apoptosis-related gene expression profiles in EGFR-mutated lung cancer
2024-Aug-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06940-y
PMID:39122703
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了EGFR突变型肺癌中与细胞凋亡相关的基因表达谱的多样性 | 首次综合利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统分析了EGFR突变型肺癌中细胞凋亡相关基因的表达变化 | 研究主要基于细胞系和转基因小鼠模型，可能与人类肺癌的实际情况存在差异 | 探讨EGFR突变型肺癌中细胞凋亡相关基因在EGFR-TKI耐药性发展过程中的表达变化 | EGFR突变型肺癌细胞系和患者样本，以及EGFR驱动型肺癌的转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | NA | RNA | EGFR突变型肺癌细胞系和患者样本，以及EGFR驱动型肺癌的转基因小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-09-23 |
Benchmarking clustering, alignment, and integration methods for spatial transcriptomics
2024-Aug-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03361-0
PMID:39123269
|
研究论文 | 本文系统地评估了多种最先进的算法在空间转录组学数据上的聚类、对齐和整合性能 | 首次对空间转录组学数据的聚类、对齐和整合方法进行了全面的基准测试 | 未提及具体限制 | 评估和比较不同空间转录组学数据处理方法的性能 | 空间转录组学数据的聚类、对齐和整合方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 涉及多种真实和模拟数据集，大小、技术、物种和复杂性各异 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-09-23 |
Transcriptomic changes and gene fusions during the progression from Barrett's esophagus to esophageal adenocarcinoma
2024-Aug-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00623-8
PMID:39113153
|
研究论文 | 研究了从Barrett食管到食管腺癌进展过程中的转录组变化和基因融合 | 首次全面分析了Barrett食管到食管腺癌进展过程中的转录组变化和基因融合 | 样本量较小，仅包括8个个体 | 揭示Barrett食管到食管腺癌进展过程中的转录组变化和基因融合 | Barrett食管和食管腺癌组织 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8个个体 | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-09-21 |
Ferrostatin-1 alleviates skin inflammation and inhibits ferroptosis of neutrophils and CD8+ T cells in allergic contact dermatitis
2024-Aug-29, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2024.08.004
PMID:39299894
|
研究论文 | 研究了铁死亡在过敏性接触性皮炎中的作用及Ferrostatin-1对其的抑制效果 | 首次揭示了铁死亡在过敏性接触性皮炎中的作用，并证明了Ferrostatin-1对中性粒细胞和CD8+ T细胞铁死亡的抑制作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨铁死亡在过敏性接触性皮炎中的作用及Ferrostatin-1的治疗效果 | 过敏性接触性皮炎中的铁死亡现象及Ferrostatin-1的作用 | NA | 皮肤炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用1-氯-2,4-二硝基氯苯诱导的过敏性接触性皮炎小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-09-21 |
Identification of Siglec-10 as a new dendritic cell checkpoint for cervical cancer immunotherapy
2024-Aug-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009404
PMID:39209455
|
研究论文 | 研究揭示了Siglec-10在宫颈癌免疫治疗中的新作用，作为树突状细胞的检查点 | 首次发现Siglec-10作为宫颈癌中树突状细胞的抑制性检查点，并提出靶向Siglec-10可能是宫颈癌免疫治疗的新途径 | NA | 揭示宫颈癌微环境与先天免疫细胞之间的相互作用，寻找潜在的治疗策略 | 宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据和原发性肿瘤样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 宫颈癌患者的原发性肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-09-21 |
Upregulation of hsa-miR-141-3p promotes uterine cervical carcinoma progression via targeting dual-specificity protein phosphatase 1
2024-Aug-14, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01413-z
PMID:39138666
|
研究论文 | 研究了hsa-miR-141-3p和双特异性蛋白磷酸酶1（DUSP1）在子宫颈癌（UCC）中的异常表达及其相关机制 | 首次揭示了hsa-miR-141-3p通过靶向DUSP1促进子宫颈癌进展的机制 | 研究主要集中在细胞水平，缺乏临床样本的验证 | 探讨hsa-miR-141-3p和DUSP1在子宫颈癌中的异常表达及其相关机制 | hsa-miR-141-3p和DUSP1在子宫颈癌中的表达及其功能 | 数字病理学 | 子宫颈癌 | 定量逆转录聚合酶链反应（RT-qPCR）、免疫组织化学（IHC）染色、基因芯片、RNA测序、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 558个子宫颈癌组织样本和1,268个样本用于DUSP1表达分析 | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-09-21 |
Single-cell analysis identified PDIA3 as regulator of malignant characteristics and macrophage function in human cancers
2024-Aug-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01416-w
PMID:39138692
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了PDIA3在人类癌症中的恶性特征和巨噬细胞功能调控作用 | 首次系统探讨了PDIA3在单细胞水平上的免疫功能，包括细胞通讯、细胞代谢、细胞进化和表观遗传修饰，并验证了其在免疫治疗反应中的预测价值 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨PDIA3在不同肿瘤恶性特征和肿瘤免疫中的作用 | PDIA3在人类癌症中的表达及其对肿瘤细胞和巨噬细胞功能的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 多个数据库的泛癌数据 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-09-20 |
Combined single cell and spatial transcriptome analysis reveals hedgehog pathway-related genes as potential therapeutic targets for cervical cancer
2024-Aug-28, Cancer treatment and research communications
DOI:10.1016/j.ctarc.2024.100841
PMID:39293140
|
研究论文 | 本研究结合单细胞测序和空间转录组学分析，揭示了刺猬信号通路相关基因作为宫颈癌潜在治疗靶点的可能性 | 首次整合单细胞测序和空间转录组学数据，深入研究了刺猬信号通路在宫颈癌中的作用，并发现了MYH9在宫颈癌中的关键作用 | NA | 揭示刺猬信号通路相关基因在宫颈癌中的潜在治疗靶点 | 宫颈癌组织中的刺猬信号通路相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-09-20 |
Activation of Nrf2 inhibits atherosclerosis in ApoE-/- mice through suppressing endothelial cell inflammation and lipid peroxidation
2024-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103229
PMID:38870781
|
研究论文 | 研究Nrf2在ApoE-/-小鼠中通过抑制内皮细胞炎症和脂质过氧化来抑制动脉粥样硬化的作用 | 首次探讨了内皮Nrf2在动脉粥样硬化中的作用及其激活机制，并提出了Nrf2作为治疗动脉粥样硬化的新策略 | NA | 探讨Nrf2在动脉粥样硬化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | ApoE-/-小鼠和内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE-/-小鼠和Cdh5CreCas9floxed-stopApoE-/-小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-09-20 |
Therapy-induced senescence through the redox lens
2024-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103228
PMID:38865902
|
综述 | 本文综述了治疗诱导的衰老肿瘤细胞通过活性氧（ROS）及其相关的氧化还原信号网络在肿瘤复发和疾病复发中的作用 | 本文探讨了ROS和氧化还原状态动态在微调稳态过程中驱动治疗诱导的细胞命运向衰老建立的作用，并提供了干预策略的见解，特别是利用调节氧化还原和抗氧化途径的senotherapeutics | NA | 探讨治疗诱导的衰老通过氧化还原视角的作用机制，并评估其对肿瘤起始和复发的潜在影响 | 治疗诱导的衰老肿瘤细胞、活性氧（ROS）、氧化还原信号网络、衰老相关分泌表型（SASP） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-09-19 |
Single-cell transcriptomics reveals neural stem cell trans-differentiation and cell subpopulations in whole heart decellularized extracellular matrix
2024-Aug-31, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240011
PMID:39281200
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化及其细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化机制，并发现了心脏样细胞具有神经外胚层和心脏中胚层的双重特征 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内实验验证 | 探讨神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化机制，为心脏再生提供新的理论基础 | 神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化及其细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2765个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-09-19 |
Preclinical development of a novel CCR8/CTLA-4 bispecific antibody for cancer treatment by disrupting CTLA-4 signaling on CD8 T cells and specifically depleting tumor-resident Tregs
2024-Aug-09, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03794-3
PMID:39123089
|
研究论文 | 开发了一种新型CCR8/CTLA-4双特异性抗体，用于癌症治疗，通过破坏CD8 T细胞上的CTLA-4信号并特异性清除肿瘤内Tregs | 提出了一种新型双特异性抗体，能够同时靶向CCR8和CTLA-4，增强T细胞激活并特异性清除肿瘤内Tregs | NA | 开发新一代CTLA-4治疗药物，平衡调节性T细胞（Tregs）的清除和CD8 T细胞的激活 | CCR8和CTLA-4双特异性抗体及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了hCCR8或hCTLA-4人源化小鼠模型和hCCR8/hCTLA-4双敲入小鼠模型，以及食蟹猴模型 | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-09-19 |
Deciphering the interplay of HPV infection, MHC-II expression, and CXCL13+ CD4+ T cell activation in oropharyngeal cancer: implications for immunotherapy
2024-Aug-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03789-0
PMID:39105803
|
研究论文 | 研究HPV感染、MHC-II表达和CXCL13+ CD4+ T细胞激活在口咽癌中的相互作用及其对免疫治疗的启示 | 揭示了HPV阳性口咽鳞状细胞癌（OPSCC）肿瘤细胞与肿瘤微环境（TME）之间的独特相互作用，特别是HPV+ OPSCC肿瘤细胞通过增强干扰素反应和MHC-II表达来增强肿瘤识别和免疫反应，并发现CXCL13+CD4+ T细胞在HPV+ OPSCC中的重要作用 | 研究仅基于6个样本（3个HPV+ OPSCC肿瘤、3个HPV- OPSCC肿瘤和1个正常扁桃体组织），样本量较小可能影响结果的普适性 | 探讨HPV感染、MHC-II表达和CXCL13+ CD4+ T细胞激活在口咽癌中的相互作用，为口咽癌的免疫治疗提供新的策略 | HPV阳性（HPV+）和HPV阴性（HPV-）口咽鳞状细胞癌（OPSCC）肿瘤细胞及其与肿瘤微环境（TME）的相互作用 | 数字病理学 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本（3个HPV+ OPSCC肿瘤、3个HPV- OPSCC肿瘤和1个正常扁桃体组织） | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-09-19 |
Highlighting immune features of the tumor ecosystem and prognostic value of Tfh and Th17 cell infiltration in head and neck squamous cell carcinoma by single-cell RNA-seq
2024-Aug-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03767-6
PMID:39093451
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并评估了Tfh和Th17细胞浸润的预后价值 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并发现了Tfh和Th17细胞浸润与患者预后的显著相关性 | 研究样本量有限，且仅限于头颈部鳞状细胞癌，可能限制了结果的普适性 | 深入了解头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并评估特定免疫细胞浸润的预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26,496个细胞样本和502名头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-09-17 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Opening New Horizons for Breast Cancer Research
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179482
PMID:39273429
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对理解乳腺癌生物学和个性化治疗策略的潜在影响 | 单细胞RNA测序技术为乳腺癌研究提供了前所未有的细胞异质性和复杂性洞察 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对个性化治疗策略的潜在影响 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-09-17 |
Deciphering Dormant Cells of Lung Adenocarcinoma: Prognostic Insights from O-glycosylation-Related Tumor Dormancy Genes Using Machine Learning
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179502
PMID:39273449
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术，揭示了肺腺癌中休眠细胞与O-糖基化相关基因的关系，并开发了一个预测肺腺癌预后的风险评分模型 | 首次揭示了O-糖基化在肺腺癌休眠细胞中的关键作用，并开发了一个基于机器学习的高精度预后预测模型 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及临床样本的验证 | 揭示肺腺癌中休眠细胞的分子机制，并开发一个预测肺腺癌预后的模型 | 肺腺癌中的休眠细胞及其与O-糖基化相关基因的关系 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-09-17 |
Potential molecular metabolic mechanisms underlying the effects of cimifugin in gastric cancer through single-cell and bulk RNA sequencing combined with network pharmacology
2024-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-413
PMID:39279957
|
研究论文 | 研究了传统中药刺五加素在胃癌中的潜在分子代谢机制，通过单细胞和批量RNA测序结合网络药理学的方法 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，揭示了刺五加素在胃癌微环境和代谢途径中的潜在作用机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨刺五加素在胃癌中的分子机制，为胃癌治疗提供新的策略 | 胃癌细胞、胃癌微环境细胞类型及其代谢途径 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学 | NA | RNA | 使用了GSE134520数据库中的单细胞RNA测序数据和TCGA数据库中的胃腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |