单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 572 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-09-02 |
Advances in Melanoma: From Genetic Insights to Therapeutic Innovations
2024-Aug-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081851
PMID:39200315
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综述 | 本文综述了黑色素瘤研究中的遗传和分子机制，以及由此带来的治疗创新 | 介绍了单细胞测序、CRISPR-Cas9和AI驱动的诊断等新兴技术在黑色素瘤研究中的应用，以及免疫检查点抑制剂和个性化mRNA疫苗等免疫疗法的革命性进展 | 尽管取得了进展，但耐药机制仍然是一个挑战，需要结合疗法和持续研究以实现持久的治疗反应 | 探讨黑色素瘤的遗传和分子机制，以及这些机制如何影响肿瘤生长和治疗反应 | 黑色素瘤的遗传变异、信号通路、表观遗传修饰、肿瘤微环境以及新兴治疗技术 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞测序、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-09-02 |
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1
PMID:39184105
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研究论文 | 本文开发了PURE-seq技术，用于高效测序稀有细胞，并利用该技术研究了小鼠长期造血干细胞在造血衰老过程中的转录组变化，发现了Egr1作为潜在的主调控因子。 | 开发了PURE-seq技术，该技术能够直接从FACS加载细胞到PIP-seq反应中，减少细胞处理和损失，可靠地捕获稀有细胞。 | NA | 研究小鼠长期造血干细胞在造血衰老过程中的转录组变化，并识别潜在的主调控因子。 | 小鼠长期造血干细胞及其在造血衰老过程中的转录组。 | 单细胞测序 | NA | PURE-seq | NA | 转录组数据 | 数十个稀有细胞，稀有度为1/1,000,000 |
| 243 | 2024-09-02 |
A Comparison of Tools That Identify Tumor Cells by Inferring Copy Number Variations from Single-Cell Experiments in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Aug-05, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081759
PMID:39200223
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研究论文 | 本文比较了sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具通过推断单细胞实验中的拷贝数变异来识别胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞的性能 | 本文揭示了现有工具在识别肿瘤细胞时的局限性，强调了开发更可靠算法的重要性 | 现有工具的预测结果与肿瘤生物标志物的预测存在大量假阳性，且预测结果高度依赖于样本和使用的软件 | 比较不同工具在识别胰腺导管腺癌肿瘤细胞中的性能，并评估其可靠性 | sciCNV、InferCNV、CopyKAT和SCEVAN工具的性能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 胰腺导管腺癌患者、邻近和健康组织的测序数据 |
| 244 | 2024-09-02 |
circADAMTS6 via stabilizing CAMK2A is involved in smoking-induced emphysema through driving M2 macrophage polarization
2024-Aug, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2024.108832
PMID:38936066
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了吸烟相关肺气肿中M2巨噬细胞比例的增加，并发现circADAMTS6通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化，从而参与吸烟诱导的肺气肿。 | 本研究首次揭示了circADAMTS6在吸烟相关肺气肿中的新机制，即通过稳定CAMK2A mRNA促进M2巨噬细胞极化。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，需要进一步的人体临床研究来验证这些发现。 | 探索吸烟诱导肺气肿的分子机制，并寻找潜在的诊断和治疗标志物。 | 吸烟相关肺气肿中的M2巨噬细胞极化和circADAMTS6的作用机制。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人类和鼠类的肺组织样本 |
| 245 | 2024-09-01 |
Intramyocardial Sprouting Tip Cells Specify Coronary Arterialization
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324868
PMID:39092506
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和组织学验证，研究了冠状动脉内皮细胞在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 发现了冠状动脉起源于经历过特定尖端细胞表型的细胞，并识别了心肌内和心外膜下尖端细胞群体及其基因表达谱和调控途径 | NA | 理解冠状动脉内皮细胞如何协调血管重塑和动静脉分化，以开发恢复缺血心脏功能灌注的创新治疗策略 | 冠状动脉内皮细胞及其在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类胚胎的多个发育阶段和成年阶段样本 |
| 246 | 2024-09-01 |
Sensory nerves drive migration of dental pulp stem cells via the CGRP-Ramp1 axis in pulp repair
2024-Aug-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05400-2
PMID:39196292
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研究论文 | 研究探讨了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴促进牙髓干细胞迁移在牙髓修复中的作用 | 首次揭示了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴直接作用于牙髓干细胞，促进其向损伤部位的集体迁移，从而促进牙髓修复 | NA | 探究感觉神经在牙髓损伤后对牙髓干细胞行为的影响及其机制 | 牙髓干细胞和感觉神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析和免疫组织化学研究 | NA | 细胞 | NA |
| 247 | 2024-09-01 |
Comprehensive pan-cancer analysis reveals EPHB2 is a novel predictive biomarker for prognosis and immunotherapy response
2024-Aug-28, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12843-0
PMID:39198775
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研究论文 | 本文通过多种数据库和生物信息学工具，全面分析了EPHB2在多种癌症中的预后和免疫治疗反应预测作用 | 首次全面探讨了EPHB2在不同癌症中的免疫学作用和预后意义，并验证了其与M2巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 探索EPHB2作为预测多种癌症预后和免疫治疗反应的新型生物标志物的潜力 | EPHB2在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 基因集富集分析(GSEA), 分子对接和动力学模拟 | NA | 转录组数据, 空间转录组学, 多荧光染色 | 涉及多种癌症类型，包括肺腺癌(LUAD)细胞系 |
| 248 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA sequencing reveals dynamics of gene expression for 2D elongation and 3D growth in Physcomitrium patens
2024-Aug-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114524
PMID:39046878
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了苔藓植物Physcomitrium patens从二维（2D）到三维（3D）生长的基因表达动态变化 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了苔藓植物Physcomitrium patens从2D到3D生长转变的分子特征 | NA | 研究苔藓植物Physcomitrium patens从二维到三维生长过程中的细胞异质性和分子机制 | 苔藓植物Physcomitrium patens的2D和3D结构 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过17,000个单细胞 |
| 249 | 2024-09-01 |
Lipid-associated macrophages for osimertinib resistance and leptomeningeal metastases in NSCLC
2024-Aug-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114613
PMID:39116206
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了非小细胞肺癌（NSCLC）患者脑脊液（CSF）中的脂质相关巨噬细胞（RNASE1_M）与奥希替尼耐药及脑膜转移的关系 | 发现了与奥希替尼耐药和脑膜转移相关的特定亚型巨噬细胞（RNASE1_M），并揭示了Midkine（MDK）在其中的调控作用 | NA | 揭示与奥希替尼耐药和脑膜转移相关的特定亚型巨噬细胞，并探索其潜在的治疗靶点 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者的脑脊液（CSF）中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 250 | 2024-09-01 |
A human fetal cerebellar map of the late second trimester reveals developmental molecular characteristics and abnormality in trisomy 21
2024-Aug-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114586
PMID:39137113
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了人类胎儿小脑在妊娠周18-25期间的发育分子特征及唐氏综合症（21三体）中的异常情况 | 首次揭示了人类胎儿小脑在晚期第二孕期中的发育分子特征，并识别了从星形胶质细胞生成性放射状胶质细胞（ARGs）到Bergmann胶质前体细胞（BGPs）的两条轨迹，以及作为原始少突胶质前体细胞（PriOPCs）来源的少突胶质生成性放射状胶质细胞（ORGs） | NA | 探究人类胎儿小脑在晚期第二孕期的正常及异常发育情况 | 人类胎儿小脑样本 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 妊娠周18-25的人类胎儿小脑样本 |
| 251 | 2024-09-01 |
Human liver sinusoidal endothelial cells support the development of functional human pluripotent stem cell-derived Kupffer cells
2024-Aug-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114629
PMID:39146183
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研究论文 | 研究通过模拟人类多能干细胞（hPSCs）中的卵黄囊样造血作用，并将衍生的巨噬细胞前体移植到预先用人源化hPSC-肝窦内皮细胞（LSECs）处理的NSG小鼠中，探讨了人类枯否细胞（KCs）的发育 | 首次证明了hPSC-LSECs能够促进hPSC-YS-巨噬细胞的稳定植入，并揭示了植入的YS-巨噬细胞具有一致的MARCO表达KC基因特征 | 研究主要在NSG小鼠模型中进行，可能与人类实际情况存在差异 | 探讨人类枯否细胞的发育过程 | 人类多能干细胞衍生的枯否细胞 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 至少7周的稳定植入巨噬细胞 |
| 252 | 2024-09-01 |
Heavy Metal Exposure-Mediated Dysregulation of Sphingolipid Metabolism
2024-Aug-12, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox13080978
PMID:39199224
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研究论文 | 本研究探讨了局部高浓度特定重金属（NaAsO、MnCl和CdCl）暴露对鞘脂代谢和氧化应激的影响 | 本研究首次使用体外模型系统和三维体外人组织模型，评估了特定重金属暴露对鞘脂代谢酶表达的差异调节 | 研究主要集中在体外和体外组织模型上，未涉及体内实验 | 研究重金属暴露对鞘脂代谢和氧化应激的影响 | 特定重金属（NaAsO、MnCl和CdCl）暴露对鞘脂代谢和氧化应激的影响 | NA | 哮喘 | 空间转录组学和定量实时PCR | NA | 转录组数据 | 特定重金属暴露的细胞和人体肺组织 |
| 253 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA-seq reveals the transcriptional program underlying tumor progression and metastasis in neuroblastoma
2024-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1081-7
PMID:39014137
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了神经母细胞瘤从原发肿瘤到骨髓转移的转录组图谱，并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | 首次通过时间分辨分析描绘了神经母细胞瘤细胞从原发肿瘤到转移的进化轨迹，并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | NA | 探究神经母细胞瘤转移的分子机制 | 神经母细胞瘤细胞及其转移过程 | 数字病理学 | 儿童恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15447个神经母细胞瘤细胞，来自8个样本，包括原发肿瘤和骨髓转移的配对样本 |
| 254 | 2024-09-01 |
The proteogenomic landscape of multiple myeloma reveals insights into disease biology and therapeutic opportunities
2024-Aug, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00784-3
PMID:38942927
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，包括基于深度串联质量标签的定量全局（磷酸化）蛋白质组学、RNA测序和纳米孔DNA测序，探讨了多发性骨髓瘤的蛋白质组学特征及其在疾病生物学和治疗中的应用。 | 首次系统评估了多发性骨髓瘤的蛋白质组，揭示了疾病生物学的新见解和改进的预后标志物，并整合了功能遗传学和单细胞RNA测序数据，识别了潜在的治疗靶点。 | 研究样本仅包括138例患者来源的浆细胞恶性肿瘤，可能未涵盖所有多发性骨髓瘤的亚型。 | 旨在通过蛋白质组学研究揭示多发性骨髓瘤的疾病生物学特征和治疗机会。 | 研究对象包括未经治疗的多发性骨髓瘤、浆细胞白血病、未确定意义的单克隆免疫球蛋白病和健康对照。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 深度串联质量标签（TMT）定量蛋白质组学、RNA测序、纳米孔DNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、转录组学数据、基因组学数据 | 138例患者来源的浆细胞恶性肿瘤样本及健康对照 |
| 255 | 2024-08-31 |
Genetic Implication of Prenatal GABAergic and Cholinergic Neuron Development in Susceptibility to Schizophrenia
2024-Aug-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae083
PMID:38869145
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研究论文 | 本研究探讨了产前GABA能和胆碱能神经元发育与精神分裂症易感性之间的遗传关联 | 结合大规模全基因组关联研究和单细胞RNA测序数据，测试了精神分裂症风险变异在具有高表达特异性的GE细胞群中的富集情况，并使用snATAC-Seq技术映射了GE中个体细胞群的潜在调控基因组区域 | NA | 测试胚胎期GE神经元发育在介导精神分裂症遗传风险中的潜在作用 | GABA能和胆碱能神经元的产前发育与精神分裂症易感性之间的关系 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序, snATAC-Seq | NA | 基因表达数据 | 大规模基因组关联研究数据和人类GE的单细胞RNA测序数据 |
| 256 | 2024-08-31 |
A single-cell atlas of the miracidium larva of Schistosoma mansoni reveals cell types, developmental pathways, and tissue architecture
2024-Aug-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95628
PMID:39190022
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序创建了Schistosoma mansoni的miracidium幼虫的全身体细胞图谱，揭示了其细胞类型、发育途径和组织结构 | 首次为miracidium幼虫创建了包含约365个细胞的单细胞图谱，并通过原位杂交和轨迹分析揭示了细胞类型特异性和干细胞的性别偏倚转录特征 | NA | 旨在深入理解miracidium幼虫在细胞和分子水平上的特性 | Schistosoma mansoni的miracidium幼虫 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 约365个细胞 |
| 257 | 2024-08-31 |
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome
2024-08-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65345-1
PMID:39191856
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据，构建并验证了一个基于急性髓系白血病（AML）肿瘤微环境（TME）的预后评分模型 | 首次基于AML的单细胞转录组数据，构建了一个包含10个关键基因的预后评分模型，用于区分AML患者的高风险和低风险组 | 需要进一步的研究来验证模型在更大样本量和其他数据集上的泛化能力 | 开发一种新的预后评分模型，以帮助预测AML患者的生存率和指导治疗策略 | 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | 预后评分模型 | 转录组数据 | 18,251个单细胞 |
| 258 | 2024-08-31 |
Assessment of SWI/SNF chromatin remodeling complex related genes as potential biomarkers and therapeutic targets in pan-cancer
2024-Aug-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02015-w
PMID:39192265
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研究论文 | 本研究全面分析了SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物途径、基质或免疫细胞浸润及药物敏感性，并评估了其在肾透明细胞癌中的进化趋势、预后标志和免疫治疗反应。 | 首次全面分析SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的多方面作用，并构建了肾透明细胞癌的预后标志。 | 研究主要集中在SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因，未涉及其他可能的生物标志物和治疗靶点。 | 探讨SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因作为潜在生物标志物和治疗靶点在泛癌中的作用。 | SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达、突变、生物途径、细胞浸润和药物敏感性。 | 数字病理学 | 泛癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, CCK-8 assay | NA | 基因表达数据 | 14种肿瘤类型的患者数据 |
| 259 | 2024-08-29 |
Correction: Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Aug-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01283-x
PMID:39192335
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-31 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | 本文介绍了Morphology-Enhanced Spatial Transcriptome Analysis Integrator (METI)框架，该框架通过整合细胞形态学和空间转录组学来深入分析肿瘤生态系统 | METI框架结合了空间转录组学、细胞形态学和精选基因签名，增强了我们对组织内分子景观和细胞相互作用的理解 | NA | 开发和评估一种新的分析工具METI，用于改善肿瘤微环境研究中的细胞类型和状态的分层以及细胞共定位分析 | 胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 | 数字病理学 | 胃癌, 肺癌, 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因数据 | 多种肿瘤组织样本，包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 |