单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 572 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-09-04 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals altered peripheral blood immune cells in patients with severe tuberculosis
2024-Aug-29, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01991-5
PMID:39198909
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了严重结核病患者外周血免疫细胞的变化 | 首次详细描述了不同阶段结核感染中循环细胞亚群的特征和功能，特别是严重结核病患者中CD8+ T细胞的高交互强度 | 研究仅限于外周血免疫细胞的分析，未涉及其他组织或器官的免疫细胞变化 | 探讨结核病患者外周血免疫细胞的变化及其对疾病严重程度的影响 | 健康捐赠者、轻度结核病患者和严重结核病患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 包括健康捐赠者、轻度结核病患者和严重结核病患者的外周血免疫细胞样本 |
| 222 | 2024-09-04 |
Investigating the role of senescence biomarkers in colorectal cancer heterogeneity by bulk and single-cell RNA sequencing
2024-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70300-1
PMID:39209895
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序探讨了细胞衰老标志物在结直肠癌异质性中的作用 | 开发了一个与衰老相关的模型来计算衰老相关评分，全面探索每个结直肠癌样本的异质性，并通过单细胞分析和免疫荧光染色验证了不同衰老相关模型基因富集组间的免疫细胞浸润差异 | NA | 探索细胞衰老对结直肠癌预后、肿瘤微环境和治疗的影响 | 结直肠癌样本的异质性和细胞衰老标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA | 多个结直肠癌样本 |
| 223 | 2024-09-04 |
Bioinformatic analysis reveals the relationship between macrophage infiltration and Cybb downregulation in hyperoxia-induced bronchopulmonary dysplasia
2024-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70877-7
PMID:39209930
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了巨噬细胞浸润与Cybb下调在超氧诱导的支气管肺发育不良中的关系 | 首次揭示了Cybb下调与巨噬细胞浸润在支气管肺发育不良中的密切关系，并通过细胞间相互作用分析探索了潜在的信号通路 | 研究主要基于mRNA-seq和scRNA-seq数据集，需要在更多样本和实验中进一步验证 | 探索支气管肺发育不良的免疫特征及其相关基因 | 支气管肺发育不良中的免疫细胞类型及相关基因 | 生物信息学 | 支气管肺发育不良 | mRNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用GSE25286和GSE209664数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 224 | 2024-09-04 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2024-Aug-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51450-2
PMID:39198404
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和分子病理学研究，探讨了MYC驱动的肿瘤微环境在人类和小鼠前列腺癌中的变化 | 首次通过单细胞RNA测序和分子病理学方法，系统地研究了MYC信号在人类和小鼠前列腺癌肿瘤微环境中的作用 | 由于无法在人类组织中进行疾病的纵向研究，部分研究结果受限 | 揭示前列腺癌细胞及其前体如何通过改变肿瘤微环境来驱动前列腺癌进展 | 人类和小鼠的前列腺癌肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠的前列腺癌组织 |
| 225 | 2024-09-04 |
GSDMD-Dependent Neutrophil Extracellular Traps Mediate Portal Vein Thrombosis and Associated Fibrosis in Cirrhosis
2024-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169099
PMID:39201786
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研究论文 | 本研究通过两步法全门静脉结扎在健康和硫代乙酰胺（TAA）诱导的肝硬化大鼠中建立了一种新的门静脉血栓（PVT）模型，并探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）在肝硬化PVT及其相关纤维化中的作用机制。 | 本研究首次验证了NETs通过促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化（MMT）介导肝硬化PVT及其相关纤维化，并发现GSDMD抑制剂disulfiram可抑制肝硬化PVT并预防相关纤维化。 | NA | 研究肝硬化门静脉血栓（PVT）的自然病程和机制。 | 肝硬化患者循环和肝脏浸润的中性粒细胞，以及肝硬化大鼠模型。 | NA | 肝硬化 | 多重免疫荧光和单细胞测序 | NA | NA | 健康和硫代乙酰胺（TAA）诱导的肝硬化大鼠 |
| 226 | 2024-09-04 |
Disturbance of Immune Microenvironment in Androgenetic Alopecia through Spatial Transcriptomics
2024-Aug-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169031
PMID:39201715
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术探讨了雄激素性脱发（AGA）中围绕毛囊上段主要部分——漏斗部的免疫细胞浸润（PII）的免疫干扰模式 | 采用空间转录组学这一高通量分析技术，详细分析了PII区域的免疫干扰，包括免疫浸润评估、基因集富集分析、细胞解卷积、差异表达分析等 | NA | 揭示雄激素性脱发中免疫微环境的精确干扰模式 | 雄激素性脱发患者的毛囊上段免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 雄激素性脱发 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 227 | 2024-09-04 |
Aggression Unleashed: Neural Circuits from Scent to Brain
2024-Aug-08, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci14080794
PMID:39199486
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综述 | 本文综述了通过嗅觉系统引发攻击行为的神经回路，并探讨了相关核心区域及其与前额叶皮层的相互作用 | 利用光遗传学、药理遗传学、单细胞RNA测序和在体电生理学等先进技术，提供了对攻击行为神经机制的新见解 | 主要关注啮齿动物的神经回路，对人类的讨论较为简略 | 探索攻击行为的神经基础，并开发新的治疗策略和临床干预措施 | 攻击行为的神经回路及其在啮齿动物和人类中的调节机制 | 神经科学 | NA | 光遗传学、药理遗传学、单细胞RNA测序、在体电生理学 | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-09-04 |
Computational Analyses Reveal Deregulated Clock Genes Associated with Breast Cancer Development in Night Shift Workers
2024-Aug-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25168659
PMID:39201344
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研究论文 | 本研究分析了夜班工作女性乳腺癌发展中失调的时钟基因，并探讨了这些基因作为乳腺癌生物标志物的潜力 | 首次系统地评估了夜班工作对女性乳腺癌风险的影响，并鉴定了与乳腺癌相关的时钟基因和miRNA | 研究主要基于现有数据集，未来需要更多的实验验证和临床研究来确认这些发现 | 评估夜班工作暴露下时钟基因作为乳腺癌生物标志物的潜力 | 夜班工作女性的乳腺癌风险 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了Nurses' Health Studies I和II GEO数据集，以及来自健康夜班工作者和不同乳腺癌风险女性的额外基因表达数据集 |
| 229 | 2024-09-04 |
Harnessing Porphyrin Accumulation in Liver Cancer: Combining Genomic Data and Drug Targeting
2024-Aug-07, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080959
PMID:39199347
|
研究论文 | 本文研究了健康和癌变人肝脏中血红素和卟啉代谢，利用人类肝脏转录组学和单细胞RNA测序揭示了基因表达模式，并探讨了卟啉过度驱动在癌症中的作用及潜在治疗策略。 | 发现肝癌中血红素生物合成途径的重新连接和细胞色素P450基因表达的大幅下调，以及卟啉过度驱动与侵袭性癌症患者总体生存率低的相关性。 | NA | 探讨血红素和卟啉代谢在健康和癌变人肝脏中的差异，并寻找潜在的临床治疗靶点。 | 健康和癌变的人类肝脏组织。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康和癌变的人类肝脏样本 |
| 230 | 2024-09-04 |
GRB7 Plays a Vital Role in Promoting the Progression and Mediating Immune Evasion of Ovarian Cancer
2024-Aug-07, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph17081043
PMID:39204147
|
研究论文 | 本研究探讨了生长因子受体结合蛋白7（GRB7）在卵巢癌（OC）中的表达及其对疾病进展和免疫逃逸的影响 | 首次系统地研究了GRB7在卵巢癌中的表达模式及其临床意义，并证实了其在肿瘤发生和免疫调节中的功能 | NA | 寻找新的生物标志物和治疗靶点以改善卵巢癌的治疗效果 | 卵巢癌组织中GRB7的表达及其与生存率、基因网络、免疫细胞浸润和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | TCGA, GTEx, CCLE, GEO数据集分析, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 多个癌症类型的单细胞RNA测序数据 |
| 231 | 2024-09-04 |
Self-organizing models of human trunk organogenesis recapitulate spinal cord and spine co-morphogenesis
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01956-9
PMID:37709912
|
研究论文 | 本文报道了生成类似人类躯干结构的方法，这些结构模拟了人类脊柱和脊髓的共同形态发生、模式化和分化 | 本文首次展示了在体外模型中实现类似体内的多组织共同形态发生和终端细胞类型的地形组织 | NA | 阐明人类器官发生中多系统事件的机制 | 人类脊柱和脊髓的共同形态发生 | 生物医学工程 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 232 | 2024-09-04 |
Prognostic model based on B cell marker genes for NSCLC patients under neoadjuvant immunotherapy by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data
2024-Aug, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03428-1
PMID:38563846
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个基于B细胞标记基因的预测模型，用于非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后评估 | 首次构建了基于B细胞标记基因的预测模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | NA | 构建和验证一个基于B细胞标记基因的预测模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的预后和免疫反应 | 非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗时的B细胞标记基因及其与临床结果的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 基于TCGA队列构建模型，并在三个独立的GSE队列中进行验证 |
| 233 | 2024-09-04 |
Scalable genetic screening for regulatory circuits using compressed Perturb-seq
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01964-9
PMID:37872410
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研究论文 | 本研究通过改进Perturb-seq设计，利用随机低维观测算法，开发了压缩Perturb-seq技术，实现了在免疫反应中对598个基因的遗传筛选，降低了成本并提高了遗传互作的学习能力。 | 压缩Perturb-seq通过测量每个细胞的多个随机扰动或每个液滴的多个细胞，并利用监管电路的稀疏结构进行计算解压缩，实现了与传统Perturb-seq相同的准确性，但成本降低了数量级。 | NA | 开发一种可扩展的遗传筛选技术，用于功能基因组学中的调控电路研究。 | 免疫反应中的598个基因。 | 功能基因组学 | 免疫疾病 | Perturb-seq | NA | RNA测序 | 598个基因 |
| 234 | 2024-09-04 |
Detection of transcriptome-wide microRNA-target interactions in single cells with agoTRIBE
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01951-0
PMID:37735263
|
research paper | 本文通过将miRNA效应蛋白Argonaute2与ADAR2的RNA编辑域融合，实现了在单细胞水平上检测转录组范围内的miRNA-靶标相互作用。 | 本文创新性地开发了agoTRIBE方法，能够在单细胞水平上检测miRNA的靶标，克服了传统方法需要大量细胞的局限。 | NA | 研究miRNA在单细胞水平上的基因调控作用及其在细胞周期中的差异靶向作用。 | miRNA及其靶标在单细胞中的相互作用。 | natural language processing | NA | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | 单细胞 |
| 235 | 2024-09-04 |
Unlocking T cell exhaustion: Insights and implications for CAR-T cell therapy
2024-Aug, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.04.022
PMID:39220881
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综述 | 本文综述了T细胞耗竭的最新机制及其对优化CAR-T细胞疗法的影响 | 探讨了利用先进的基因组工程工具和单细胞测序技术克服CAR-T细胞耗竭的策略 | 尽管CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中显示出希望，但在实体瘤中的效果仍有限 | 旨在通过理解T细胞耗竭的机制来优化CAR-T细胞疗法，以应对癌症治疗中的挑战 | CAR-T细胞疗法的优化及克服T细胞耗竭的策略 | NA | 血液恶性肿瘤 | 基因组工程工具、单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-09-03 |
Dynamic changes in pyroptosis following spinal cord injury and the identification of crucial molecular signatures through machine learning and single-cell sequencing
2024-Aug-26, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2024.116449
PMID:39217701
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研究论文 | 本文研究了脊髓损伤后细胞焦亡的动态变化，并通过机器学习和单细胞测序技术识别了关键的分子特征 | 本文首次通过机器学习算法和单细胞测序数据分析，揭示了脊髓损伤后细胞焦亡的时序动态变化和关键分子特征 | NA | 阐明脊髓损伤后细胞焦亡的主要细胞类型和相关关键基因 | 脊髓损伤后的细胞焦亡及其相关基因 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了BV2细胞和脊髓组织样本 |
| 237 | 2024-09-03 |
Dissociation of Human and Mouse Tumor Tissue Samples for Single-cell RNA Sequencing
2024-Aug-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66766
PMID:39221955
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研究论文 | 本文介绍了一种快速通用的组织解离协议，用于从人和小鼠肿瘤组织样本中进行单细胞RNA测序（scRNAseq）。 | 开发了一种快速通用的解离协议，适用于多种类型的人和小鼠肿瘤样本，确保了单细胞悬液的纯净和活力。 | 解离过程可能影响单细胞的交叉污染和数据质量，以及可能导致敏感细胞群的消除和应激反应基因的上调。 | 旨在克服现有解离技术的局限性，提高单细胞RNA测序的质量和可靠性。 | 人及小鼠的肿瘤组织样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 多种类型的人和小鼠肿瘤样本 |
| 238 | 2024-09-02 |
Navigating the Landscape of Intestinal Regeneration: A Spotlight on Quiescence Regulation and Fetal Reprogramming
2024-Aug-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23176
PMID:38267367
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综述 | 本文综述了肠道再生过程中静息状态调节和胎儿重编程的关键作用 | 强调了静息干细胞和复苏干细胞在肠道再生中的重要性，并探讨了其潜在的临床应用 | NA | 探讨肠道再生过程中干细胞的调控机制及其临床应用潜力 | 肠道组织再生中的静息干细胞和复苏干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 类器官系统 | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-09-02 |
Hydrogel biomaterials that stiffen and soften on demand reveal that skeletal muscle stem cells harbor a mechanical memory
2024-Aug-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406787121
PMID:39163337
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研究论文 | 研究使用动态水凝胶生物材料，探究骨骼肌干细胞是否具有对其过去微环境的机械记忆，并测试这种记忆是否可以被克服 | 首次发现骨骼肌干细胞具有对基质硬度的持久记忆，并揭示了这种机械记忆的分子特征 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的体内实验验证 | 探究骨骼肌干细胞是否具有机械记忆及其对干细胞功能的影响 | 骨骼肌干细胞及其在不同硬度基质上的行为 | 生物材料 | 肌肉疾病 | 水凝胶生物材料 | NA | 细胞 | 未具体说明 |
| 240 | 2024-09-02 |
μ-Opioid receptor transcriptional variants in the murine forebrain and spinal cord
2024-Aug-24, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148890
PMID:39187136
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研究论文 | 本文通过长读RNA测序、空间和单细胞转录组学技术，全面研究了小鼠中枢神经系统中μ-阿片受体编码基因Oprm1的转录变体 | 发现了小鼠Oprm1基因的主要转录本具有一个长的3'非翻译区，这与人类OPRM1主要转录本同源，并编码相同的保守C端氨基酸序列 | NA | 探索Oprm1基因在小鼠中枢神经系统中的转录变体及其功能意义 | 小鼠的前脑和脊髓中的μ-阿片受体转录变体 | 分子生物学 | NA | 长读RNA测序、RNAscope原位杂交 | NA | RNA序列 | 小鼠的丘脑、纹状体、皮质和脊髓组织 |