单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 542 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-09-07 |
Single-cell network analysis reveals gene expression programs for Arabidopsis root development and metabolism
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100978
PMID:38783601
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研究论文 | 本文通过单细胞基因共表达网络分析，揭示了拟南芥根发育和代谢的基因表达程序 | 首次对拟南芥根的单细胞RNA测序数据进行全面的基因共表达网络分析，并识别出149个基因共表达模块，这些模块被认为是基因表达程序 | NA | 揭示拟南芥根发育和代谢的基因表达程序 | 拟南芥根的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SingleCellGGM算法 | 基因表达数据 | 公开的拟南芥根单细胞RNA测序数据集 |
| 222 | 2024-09-07 |
Single-cell transcriptome atlases of soybean root and mature nodule reveal new regulatory programs that control the nodulation process
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100984
PMID:38845198
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组测序和分子图谱技术，分析了成熟大豆根瘤细胞的转录组特征，揭示了氮固定和衰老细胞的共存现象，并鉴定了新的调控基因 | 首次对成熟大豆根瘤细胞的转录组进行精确表征，揭示了氮固定和衰老细胞的共存现象，并发现了新的调控基因 | NA | 研究大豆根瘤细胞的转录组特征，揭示氮固定过程中的新调控机制 | 大豆根和成熟根瘤细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 223 | 2024-09-07 |
A single-cell transcriptome atlas reveals the trajectory of early cell fate transition during callus induction in Arabidopsis
2024-Aug-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100941
PMID:38720464
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研究论文 | 研究报告了拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中0、1和4天的单细胞转录组时间序列实验，构建了愈伤组织诱导过程的详细单细胞转录组图谱 | 首次揭示了LRPI-like细胞和QC-like细胞在愈伤组织形成早期的细胞命运转变轨迹，并识别了调控这些细胞的转录因子和基因表达特征 | NA | 揭示拟南芥愈伤组织诱导过程中细胞异质性和细胞命运转变的机制 | 拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中的单细胞转录组 | 植物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 拟南芥根外植体在愈伤组织诱导培养基中0、1和4天的样本 |
| 224 | 2024-09-06 |
NKG2C/KLRC2 tumor cell expression enhances immunotherapeutic efficacy against glioblastoma
2024-Aug-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009210
PMID:39214651
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研究论文 | 研究探讨了NKG2C/KLRC2在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达及其对免疫治疗效果的影响 | 发现NKG2C/KLRC2在肿瘤细胞中的高表达与PD-1单克隆抗体治疗效果的增强相关，提示其可能作为免疫检查点抑制剂治疗的预测生物标志物 | 研究结果需要在未来的前瞻性试验中进一步验证 | 探讨NKG2C/KLRC2在GBM中的表达及其对免疫微环境的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其免疫微环境 | 免疫学 | 神经系统肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 包括大量和单细胞RNA测序的GBM数据集，以及来自两个临床试验的样本 |
| 225 | 2024-09-06 |
scParser: sparse representation learning for scalable single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Aug-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03345-0
PMID:39152499
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研究论文 | 提出了一种名为scParser的稀疏表示学习方法，用于可扩展的单细胞RNA测序数据分析 | scParser模型能够揭示基因表达如何影响表型的关键机制，并能识别出对疾病发病机制有贡献的细胞亚群中的生物过程 | NA | 开发一种可扩展的方法，用于整合分析单细胞RNA测序数据，并理解不同细胞群体中生物条件的异质性效应 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 稀疏表示学习 | scParser | RNA测序数据 | NA |
| 226 | 2024-09-06 |
Periodontal Ligament Cell Apoptosis Activates Lepr+ Osteoprogenitors in Orthodontics
2024-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241262706
PMID:39104161
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研究论文 | 研究了正畸牙齿移动过程中牙槽骨重塑的潜在机制，特别是Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞的作用 | 首次报道了正畸牙齿移动过程中压缩侧的骨形成现象，并揭示了PDLC凋亡激活Lepr+成骨前体细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类中验证 | 探讨正畸牙齿移动过程中新骨形成的潜在机制 | Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析、荧光标记技术 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型和体外细胞培养 |
| 227 | 2024-09-06 |
Identification and Validation of Prognostic Model for Tumor Microenvironment-Associated Genes in Bladder Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing Data Sets
2024-Aug, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO.23.00661
PMID:39151107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别并验证了与膀胱癌肿瘤微环境相关的预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据构建了膀胱癌的预后模型，并验证了其预测性能 | 研究主要基于公共数据库的数据，未来需进行体外验证 | 阐明膀胱癌进展中肿瘤微环境与细胞多样性的关系，并构建预后模型 | 膀胱癌的肿瘤微环境相关基因及预后模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和多变量Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的正常和肿瘤膀胱细胞数据，以及TCGA的病人随访数据 |
| 228 | 2024-09-05 |
The heart is a resident tissue for hematopoietic stem and progenitor cells in zebrafish
2024-Aug-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51920-7
PMID:39217144
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和显微镜技术，证明了斑马鱼心脏内皮细胞（EdCs）能够产生并维持稳定的造血细胞群 | 首次揭示了斑马鱼心脏内皮细胞作为造血干细胞和前体细胞的驻留组织，并提供了新的造血细胞来源 | NA | 探究斑马鱼心脏内皮细胞对造血细胞系的贡献 | 斑马鱼心脏内皮细胞及其产生的造血干细胞和前体细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 229 | 2024-09-05 |
Canine mesenteric lymph nodes (MLNs) characterization by sc-RNAseq: insights compared to human and mouse MLNs
2024-08-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71310-9
PMID:39217215
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术对犬肠系膜淋巴结（MLNs）进行表征，并与人类和小鼠的MLNs进行比较 | 首次对犬肠系膜淋巴结进行详细的单细胞RNA测序分析，并构建了预测图谱 | NA | 探究犬肠系膜淋巴结的免疫细胞组成及其与人类和小鼠的异同 | 犬肠系膜淋巴结的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 健康犬的肠系膜淋巴结样本 |
| 230 | 2024-09-05 |
Eganelisib combined with immune checkpoint inhibitor therapy and chemotherapy in frontline metastatic triple-negative breast cancer triggers macrophage reprogramming, immune activation and extracellular matrix reorganization in the tumor microenvironment
2024-Aug-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009160
PMID:39214650
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研究论文 | 本文首次报道了在一线转移性三阴性乳腺癌（mTNBC）中，Eganelisib联合免疫检查点抑制剂疗法和化疗的II期临床研究MARIO-3的转化分析结果，揭示了肿瘤微环境中巨噬细胞重编程、免疫激活和细胞外基质重组的基因特征。 | Eganelisib作为一种新型PI3K-γ抑制剂，能够重塑肿瘤微环境，通过减少骨髓细胞向肿瘤的招募并重新编程肿瘤相关巨噬细胞（TAMs），从免疫抑制转变为免疫激活表型，增强免疫检查点抑制剂的活性。 | 研究主要集中在PD-L1阴性肿瘤的治疗效果，对于其他类型的肿瘤或PD-L1阳性肿瘤的治疗效果尚未充分探讨。 | 评估Eganelisib联合抗PD-L1药物atezolizumab和nab-paclitaxel在一线mTNBC中的临床效果和机制。 | 转移性三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫荧光、GeoMx数字空间分析、免疫组织化学 | NA | 肿瘤活检样本、外周血样本 | 肿瘤活检样本11对，空间转录组学分析12对，PD-L1免疫组织化学分析18对 |
| 231 | 2024-09-05 |
High Glycolytic Activity Signature Reveals CCNB2 as a Key Therapeutic Target in Triple-Negative Breast Cancer
2024-Aug-23, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2908308
PMID:39206892
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研究论文 | 本研究通过分析糖酵解相关基因和细胞周期途径，揭示了高糖酵解活性签名（GAS）在乳腺癌中的作用，并提出CCNB2作为潜在的治疗靶点 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析了高糖酵解活性签名与CCNB2表达在三阴性乳腺癌中的正相关性，并验证了其在临床样本中的表达 | 研究主要基于GEO数据库和临床样本，未来需要更多前瞻性研究来验证这些发现 | 探讨糖酵解与细胞周期的关系，寻找乳腺癌的新治疗策略 | 乳腺癌，特别是三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR） | NA | 基因表达数据 | 涉及三个乳腺癌细胞系和三阴性乳腺癌患者的临床样本 |
| 232 | 2024-09-05 |
Morphogenic, molecular, and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2024-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608866
PMID:39229219
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研究论文 | 本研究通过多尺度3D成像和单细胞转录组学分析，揭示了鸡肺中适应单向气流的形态发生、分子和细胞特征 | 首次详细描述了鸡肺中单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制，并发现了一种新的特定于鸡的肺泡细胞类型——腔细胞 | NA | 探索肺部多样化的进化空间，并为特定物种遗传决定因素的功能分析奠定基础 | 鸡肺的形态发生、分子和细胞特征 | NA | NA | 多尺度3D成像、单细胞转录组学、Stereo-seq空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 多个发育阶段的鸡肺样本 |
| 233 | 2024-09-05 |
A gene regulatory network-aware graph learning method for cell identity annotation in single-cell RNA-seq data
2024-Aug-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278439.123
PMID:39134412
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因调控网络的图学习方法scHGR，用于单细胞RNA测序数据的细胞身份注释 | scHGR工具利用基因调控关系构建基因介导的细胞通信图，减少多源数据噪声，建立远距离细胞连接，揭示新的细胞亚型和治疗相关因子 | NA | 开发一种自动化的细胞身份注释工具，以提高单细胞转录组数据分析的准确性和一致性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞身份注释 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA测序 | 图学习 | 转录组数据 | 22个实验场景，包括56种细胞类型 |
| 234 | 2024-09-05 |
The glycolytic reaction PGAM unexpectedly restrains Th17 pathogenicity and Th17-dependent autoimmunity
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.18.607992
PMID:39229227
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研究论文 | 研究探讨了个别糖酵解反应在决定辅助性T细胞17（Th17）细胞致病性中的作用 | 发现磷酸甘油酸变位酶（PGAM）作为负调节因子，意外地抑制了Th17细胞的致病性和Th17依赖的自身免疫 | NA | 研究糖酵解反应对Th17细胞致病性的影响 | Th17细胞的糖酵解反应及其在自身免疫中的作用 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 235 | 2024-09-05 |
Dynamically visualizing profibrotic maladaptive repair after acute kidney injury by fibroblast activation protein imaging
2024-Aug-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.07.015
PMID:39098582
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研究论文 | 本研究利用急性肾损伤（AKI）模型，通过纤维母细胞激活蛋白（FAP）成像技术，动态评估损伤后的不良修复过程 | 首次使用正电子发射断层扫描（PET）/CT成像技术，通过FAP抑制剂示踪剂非侵入性地追踪肾纤维化的不良修复过程 | NA | 探索预防和早期治疗器官纤维化的有效工具 | 急性肾损伤后的不良修复过程 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 正电子发射断层扫描（PET）/CT成像 | NA | 图像 | 包括患者活检样本和小鼠模型 |
| 236 | 2024-09-05 |
Loss of Inpp5d has disease-relevant and sex-specific effects on glial transcriptomes
2024-08, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13901
PMID:38923164
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研究论文 | 研究探讨了Inpp5d缺失对野生型小鼠脑部转录组的影响，特别是其与神经退行性机制的关联。 | 首次揭示了Inpp5d缺失在雌性小鼠中导致一个保守的基因共表达模块崩溃，并影响其他细胞类型的转录组。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探究Inpp5d缺失对脑部转录组的影响及其与神经退行性疾病的关系。 | Inpp5d基因在野生型小鼠脑部的表达及其缺失后的转录组变化。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型小鼠 |
| 237 | 2024-09-04 |
Exploring the potential mechanisms of Rehmannia glutinosa in treating sepsis based on network pharmacology
2024-Aug-31, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-024-09796-x
PMID:39217296
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研究论文 | 本研究利用网络药理学方法探索地黄在治疗脓毒症中的潜在作用机制 | 通过RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接和分子动力学模拟等技术，全面分析了地黄的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点和机制 | NA | 探索地黄在治疗脓毒症中的作用机制 | 地黄的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点和机制 | 药物学 | 脓毒症 | RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | NA | RNA序列数据 | 23名脓毒症患者和10名健康个体的外周血样本 |
| 238 | 2024-09-04 |
Microglia LILRB4 upregulation reduces brain damage after acute ischemic stroke by limiting CD8+ T cell recruitment
2024-Aug-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03206-4
PMID:39217343
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞中LILRB4上调通过限制CD8+ T细胞招募减少急性缺血性卒中后脑损伤的作用及其机制 | 首次揭示了LILRB4在微胶质细胞中通过调节CD8+ T细胞浸润和激活在卒中后免疫反应中的关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 研究LILRB4在急性缺血性卒中后调节免疫反应及其对脑损伤的保护作用 | 微胶质细胞中的LILRB4及其对CD8+ T细胞招募的影响 | 神经科学 | 卒中 | 空间转录组学分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 使用LILRB4条件性敲除(LILRB4-KO)和过表达转基因(LILRB4-TG)小鼠进行研究 |
| 239 | 2024-09-04 |
Single-cell sequencing reveals glial cell involvement in development of neuropathic pain via myelin sheath lesion formation in the spinal cord
2024-Aug-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03207-3
PMID:39217340
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了脊髓中的少突胶质细胞在神经病理性疼痛发展中的作用及其与髓鞘损伤的关系 | 首次详细描述了少突胶质细胞在神经病理性疼痛发展中的作用及其与其他胶质细胞的相互作用，并提出了潜在的治疗靶点 | 研究仅在 mice 模型上进行，结果的普遍性和临床应用尚需进一步验证 | 探索神经病理性疼痛发展中少突胶质细胞的功能及其与其他胶质细胞的相互作用 | 少突胶质细胞、小胶质细胞和星形胶质细胞在神经病理性疼痛中的作用 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 使用慢性束缚损伤（CCI）模型的小鼠脊髓组织 |
| 240 | 2024-09-04 |
V1bR enhances glucose-stimulated insulin secretion by paracrine production of glucagon which activates GLP-1 receptor
2024-Aug-31, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01288-4
PMID:39217353
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研究论文 | 本研究探讨了精氨酸加压素（AVP）及其受体V1bR对胰岛素分泌和血糖稳态的调节机制 | 发现AVP通过V1bR激活α细胞分泌胰高血糖素，进而通过旁分泌方式激活β细胞上的GLP-1R，促进葡萄糖依赖的胰岛素分泌 | 研究未详细说明AVP对胰岛素分泌的具体分子机制 | 揭示AVP/V1bR与胰高血糖素/GLP-1R之间的相互作用，为开发新的血糖控制疗法提供机制基础 | 精氨酸加压素（AVP）、V1bR受体、α细胞和β细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |