单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 531 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 221 | 2024-09-20 |
Single-cell transcriptomics reveal transcriptional programs underlying male and female cell fate during Plasmodium falciparum gametocytogenesis
2024-Aug-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51201-3
PMID:39187486
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫配子体发育过程中雄性和雌性细胞命运的转录程序 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，定义了恶性疟原虫配子体发育过程中雄性和雌性细胞的转录程序，并预测了潜在的驱动基因 | NA | 阐明在没有性染色体的情况下，恶性疟原虫雄性和雌性配子体如何分化 | 恶性疟原虫的配子体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-09-20 |
Activation of Nrf2 inhibits atherosclerosis in ApoE-/- mice through suppressing endothelial cell inflammation and lipid peroxidation
2024-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103229
PMID:38870781
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研究论文 | 研究Nrf2在ApoE-/-小鼠中通过抑制内皮细胞炎症和脂质过氧化来抑制动脉粥样硬化的作用 | 首次探讨了内皮Nrf2在动脉粥样硬化中的作用及其激活机制，并提出了Nrf2作为治疗动脉粥样硬化的新策略 | NA | 探讨Nrf2在动脉粥样硬化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | ApoE-/-小鼠和内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE-/-小鼠和Cdh5CreCas9floxed-stopApoE-/-小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-09-20 |
Therapy-induced senescence through the redox lens
2024-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2024.103228
PMID:38865902
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综述 | 本文综述了治疗诱导的衰老肿瘤细胞通过活性氧（ROS）及其相关的氧化还原信号网络在肿瘤复发和疾病复发中的作用 | 本文探讨了ROS和氧化还原状态动态在微调稳态过程中驱动治疗诱导的细胞命运向衰老建立的作用，并提供了干预策略的见解，特别是利用调节氧化还原和抗氧化途径的senotherapeutics | NA | 探讨治疗诱导的衰老通过氧化还原视角的作用机制，并评估其对肿瘤起始和复发的潜在影响 | 治疗诱导的衰老肿瘤细胞、活性氧（ROS）、氧化还原信号网络、衰老相关分泌表型（SASP） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-09-19 |
Single-cell transcriptomics reveals neural stem cell trans-differentiation and cell subpopulations in whole heart decellularized extracellular matrix
2024-Aug-31, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240011
PMID:39281200
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化及其细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化机制，并发现了心脏样细胞具有神经外胚层和心脏中胚层的双重特征 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内实验验证 | 探讨神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化机制，为心脏再生提供新的理论基础 | 神经干细胞在全心脱细胞基质中的跨分化及其细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2765个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-09-19 |
Preclinical development of a novel CCR8/CTLA-4 bispecific antibody for cancer treatment by disrupting CTLA-4 signaling on CD8 T cells and specifically depleting tumor-resident Tregs
2024-Aug-09, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03794-3
PMID:39123089
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研究论文 | 开发了一种新型CCR8/CTLA-4双特异性抗体，用于癌症治疗，通过破坏CD8 T细胞上的CTLA-4信号并特异性清除肿瘤内Tregs | 提出了一种新型双特异性抗体，能够同时靶向CCR8和CTLA-4，增强T细胞激活并特异性清除肿瘤内Tregs | NA | 开发新一代CTLA-4治疗药物，平衡调节性T细胞（Tregs）的清除和CD8 T细胞的激活 | CCR8和CTLA-4双特异性抗体及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了hCCR8或hCTLA-4人源化小鼠模型和hCCR8/hCTLA-4双敲入小鼠模型，以及食蟹猴模型 | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-09-19 |
Deciphering the interplay of HPV infection, MHC-II expression, and CXCL13+ CD4+ T cell activation in oropharyngeal cancer: implications for immunotherapy
2024-Aug-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03789-0
PMID:39105803
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研究论文 | 研究HPV感染、MHC-II表达和CXCL13+ CD4+ T细胞激活在口咽癌中的相互作用及其对免疫治疗的启示 | 揭示了HPV阳性口咽鳞状细胞癌（OPSCC）肿瘤细胞与肿瘤微环境（TME）之间的独特相互作用，特别是HPV+ OPSCC肿瘤细胞通过增强干扰素反应和MHC-II表达来增强肿瘤识别和免疫反应，并发现CXCL13+CD4+ T细胞在HPV+ OPSCC中的重要作用 | 研究仅基于6个样本（3个HPV+ OPSCC肿瘤、3个HPV- OPSCC肿瘤和1个正常扁桃体组织），样本量较小可能影响结果的普适性 | 探讨HPV感染、MHC-II表达和CXCL13+ CD4+ T细胞激活在口咽癌中的相互作用，为口咽癌的免疫治疗提供新的策略 | HPV阳性（HPV+）和HPV阴性（HPV-）口咽鳞状细胞癌（OPSCC）肿瘤细胞及其与肿瘤微环境（TME）的相互作用 | 数字病理学 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本（3个HPV+ OPSCC肿瘤、3个HPV- OPSCC肿瘤和1个正常扁桃体组织） | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-09-19 |
Highlighting immune features of the tumor ecosystem and prognostic value of Tfh and Th17 cell infiltration in head and neck squamous cell carcinoma by single-cell RNA-seq
2024-Aug-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03767-6
PMID:39093451
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并评估了Tfh和Th17细胞浸润的预后价值 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并发现了Tfh和Th17细胞浸润与患者预后的显著相关性 | 研究样本量有限，且仅限于头颈部鳞状细胞癌，可能限制了结果的普适性 | 深入了解头颈部鳞状细胞癌中肿瘤生态系统的免疫特征，并评估特定免疫细胞浸润的预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26,496个细胞样本和502名头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-09-19 |
A spatial expression atlas of the adult human proximal small intestine
2024-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07793-3
PMID:39112711
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研究论文 | 本文利用空间转录组学、空间蛋白质组学和单分子荧光原位杂交技术，构建了成人近端小肠的综合空间表达图谱 | 首次揭示了成人小肠中存在的空间异质性，并描述了上皮细胞、间充质细胞和免疫细胞类型的区域表达和细胞类型分布 | NA | 探究成人小肠中的空间基因表达异质性 | 成人近端小肠的基因表达和蛋白质表达 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单分子荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 成人近端小肠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-09-17 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Opening New Horizons for Breast Cancer Research
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179482
PMID:39273429
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对理解乳腺癌生物学和个性化治疗策略的潜在影响 | 单细胞RNA测序技术为乳腺癌研究提供了前所未有的细胞异质性和复杂性洞察 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用及其对个性化治疗策略的潜在影响 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-09-17 |
Deciphering Dormant Cells of Lung Adenocarcinoma: Prognostic Insights from O-glycosylation-Related Tumor Dormancy Genes Using Machine Learning
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179502
PMID:39273449
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术，揭示了肺腺癌中休眠细胞与O-糖基化相关基因的关系，并开发了一个预测肺腺癌预后的风险评分模型 | 首次揭示了O-糖基化在肺腺癌休眠细胞中的关键作用，并开发了一个基于机器学习的高精度预后预测模型 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及临床样本的验证 | 揭示肺腺癌中休眠细胞的分子机制，并开发一个预测肺腺癌预后的模型 | 肺腺癌中的休眠细胞及其与O-糖基化相关基因的关系 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-09-17 |
Potential molecular metabolic mechanisms underlying the effects of cimifugin in gastric cancer through single-cell and bulk RNA sequencing combined with network pharmacology
2024-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-413
PMID:39279957
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研究论文 | 研究了传统中药刺五加素在胃癌中的潜在分子代谢机制，通过单细胞和批量RNA测序结合网络药理学的方法 | 首次通过单细胞RNA测序和网络药理学方法，揭示了刺五加素在胃癌微环境和代谢途径中的潜在作用机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探讨刺五加素在胃癌中的分子机制，为胃癌治疗提供新的策略 | 胃癌细胞、胃癌微环境细胞类型及其代谢途径 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学 | NA | RNA | 使用了GSE134520数据库中的单细胞RNA测序数据和TCGA数据库中的胃腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-09-17 |
Proteome-wide Mendelian randomization and single-cell sequencing analysis identify the association between plasma proteins and gastric cancer
2024-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-200
PMID:39279974
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组范围的孟德尔随机化分析和单细胞测序分析，识别了与胃癌相关的血浆蛋白质 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞测序技术，系统地识别了与胃癌因果相关的血浆蛋白质 | 研究仅基于现有数据进行分析，未进行实验验证 | 识别与胃癌因果相关的血浆蛋白质，探索新的遗传靶点 | 胃癌及其相关血浆蛋白质 | 数字病理学 | 胃癌 | 孟德尔随机化分析、单细胞测序 | NA | 蛋白质数据、基因表达数据 | 4907个血浆蛋白质样本、基因表达数据库中的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-09-17 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Effects of Ionizing Radiation on Bone Marrow Mononuclear Cells in Mice
2024-Aug-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179287
PMID:39273235
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示电离辐射对小鼠骨髓单核细胞的早期影响 | 首次通过单细胞转录组测序技术研究电离辐射对骨髓中不同造血细胞群体的早期响应基因，揭示了放射敏感性和放射抗性细胞之间的基因表达差异 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本 | 探讨电离辐射对骨髓中不同造血细胞群体的放射敏感性和抗性的分子机制 | 小鼠骨髓中的单核细胞，包括粒细胞-巨噬细胞祖细胞、造血干细胞/祖细胞、B细胞、中性粒细胞、自然杀伤细胞、T细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多种骨髓造血细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-09-17 |
Integrating Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data to Identify Prognostic Features Related to Activated Dendritic Cells in Clear-Cell Renal-Cell Carcinoma
2024-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179235
PMID:39273185
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研究论文 | 本研究整合了批量和单细胞RNA测序数据，识别了与激活树突状细胞相关的预后特征，用于透明细胞肾细胞癌 | 首次从免疫激活的角度研究树突状细胞与透明细胞肾细胞癌的关系，并构建了一个包含五个基因的预后模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来确认模型的临床应用价值 | 研究激活树突状细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用，并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌患者的预后特征和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个验证集（GSE167573, ICGC, E-MTAB-1980）和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-09-17 |
Interleukin-7 expression by CAR-T cells improves CAR-T cell survival and efficacy in chordoma
2024-Aug-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03756-9
PMID:39093440
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了14个脊索瘤样本，识别出B7-H3和IL-7作为潜在的靶点和增强因子，并评估了B7-H3 CAR-T细胞和表达IL-7的B7-H3 CAR-T细胞的抗肿瘤活性 | 首次将IL-7表达引入CAR-T细胞，增强了CAR-T细胞的存活和疗效，提供了一种新的双重治疗策略 | NA | 识别脊索瘤的潜在新型免疫治疗靶点，并通过肿瘤微环境因素增强疗效 | 脊索瘤样本和CAR-T细胞 | NA | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞 | RNA | 14个脊索瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-09-17 |
Kidney Organoid Modeling of WT1 Mutations Reveals Key Regulatory Paths Underlying Podocyte Development
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308556
PMID:38810140
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研究论文 | 研究通过肾脏类器官模型揭示WT1突变对足细胞发育的关键调控路径 | 首次通过单细胞染色质可及性和基因表达图谱，结合CRISPR-Cas9基因编辑技术，揭示了WT1突变对足细胞发育的影响 | 研究主要集中在WT1突变的影响，未涉及其他可能影响足细胞发育的因素 | 揭示WT1突变对足细胞发育的表观基因组机制 | 胎儿肾脏和肾脏类器官中的足细胞发育 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 包括胎儿肾脏和肾脏类器官的单细胞样本，以及来自WT1突变患者的诱导多能干细胞 (iPSCs) 衍生的肾脏类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-09-17 |
Podocyte Pathogenic Bone Morphogenetic Protein-2 Pathway and Immune Cell Behaviors in Primary Membranous Nephropathy
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404151
PMID:38785168
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了11名原发性膜性肾病（PMN）患者和7名健康个体的肾活检样本，揭示了PMN中足细胞的致病性骨形态发生蛋白-2（BMP2）通路以及免疫细胞的行为 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PMN中足细胞的BMP2/pSMAD1/COL4通路，并发现了免疫细胞的增强浸润和激活 | 样本量较小，仅包括11名PMN患者和7名健康个体 | 揭示原发性膜性肾病（PMN）的病理机制 | 足细胞和免疫细胞在PMN中的作用 | NA | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11名PMN患者和7名健康个体的肾活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-09-15 |
Identifying epithelial-mesenchymal transition-related genes as prognostic biomarkers and therapeutic targets of hepatocellular carcinoma by integrated analysis of single-cell and bulk-RNA sequencing data
2024-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-521
PMID:39262476
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一种用于肝细胞癌（HCC）预后预测的新型模型 | 本研究的创新点在于结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，开发了一种新的肝细胞癌预后预测模型，并揭示了与上皮-间质转化（EMT）相关的基因在HCC进展中的临床意义 | 本研究的局限性在于仅基于特定的基因表达数据构建模型，未考虑其他可能影响预后的因素 | 本研究旨在通过整合单细胞和批量RNA测序数据，发现新的肝细胞癌预后生物标志物，并提高预后预测的准确性 | 本研究的研究对象是肝细胞癌（HCC）患者及其预后相关的基因和临床特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-09-15 |
Upregulation of CKS2 in immunosuppressive cells is associated with metastasis and poor prognosis in prostate cancer: a single-cell RNA-sequencing analysis
2024-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-2100
PMID:39262475
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研究论文 | 研究探讨了免疫抑制细胞中CKS2的上调与前列腺癌转移和预后不良的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了CKS2在免疫抑制细胞中的上调与前列腺癌转移和预后不良的关联 | 研究主要基于GEO数据库的数据，可能存在数据偏差 | 探究免疫抑制环境如何促进前列腺癌转移并恶化患者预后 | 前列腺癌患者的免疫抑制细胞和CKS2基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-09-15 |
Identifying novel risk genes in intracranial aneurysm by integrating human proteomes and genetics
2024-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae111
PMID:39084678
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研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组和遗传数据，识别颅内动脉瘤的新风险基因 | 采用多维高通量数据整合蛋白质组关联研究、转录组关联研究、孟德尔随机化分析和贝叶斯共定位分析，优先筛选出可能增加颅内动脉瘤风险的基因 | 未发现具有顺式调控血浆蛋白水平的显著基因与颅内动脉瘤相关 | 识别颅内动脉瘤的新风险基因 | 颅内动脉瘤的风险基因 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 全基因组关联研究 (GWAS), 蛋白质组关联研究 (PWAS), 转录组关联研究 (TWAS), 孟德尔随机化 (MR), 贝叶斯共定位分析, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 基因集富集分析 (GSEA) | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |