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当前共找到 534 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-23 |
Mutual exclusivity and co-occurrence patterns of immune checkpoints indicate NKG2A relates to anti-PD-1 resistance in gastric cancer
2024-08-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05503-1
PMID:39097734
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多元线性回归交互模型，揭示胃癌中免疫检查点的互斥与共现模式，并指出NKG2A与抗PD-1耐药性相关 | 揭示了PD-1与NKG2A的共现模式和互斥性，鉴定了两种不同的免疫检查点表达模式（ICEP1和ICEP2），并发现ICEP2 CD8+ T细胞与抗PD-1治疗耐药性相关 | 未明确提及，可能需要进一步验证小样本或特定机制的局限性 | 分析胃癌中免疫检查点表达模式，识别最优的抗PD-1与其他免疫检查点抑制剂的联合治疗策略 | 胃癌中CD8+ T细胞及其免疫检查点表达特征 | 机器学习和数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 多元线性回归交互模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确提及，可能包括多个胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-07-06 |
Retinal perivascular macrophages regulate immune cell infiltration during neuroinflammation in mouse models of ocular disease
2024-08-29, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180904
PMID:39207852
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研究论文 | 研究发现视网膜血管周围巨噬细胞在眼部疾病小鼠模型的神经炎症过程中调控免疫细胞浸润 | 首次揭示视网膜血管周围巨噬细胞通过表达促趋化转录组和血小板因子4（Pf4/CXCL4）作为标志物，并证明其在调控免疫细胞穿越血-视网膜屏障中的关键作用 | 主要基于小鼠模型和CCL2诱导的炎症模型，可能无法完全代表人类疾病复杂性；且未深入探讨Pf4在人类中的对应机制 | 阐明视网膜血管周围巨噬细胞在血-视网膜屏障功能和神经炎症中的功能 | 视网膜血管周围巨噬细胞及其在眼部炎症（糖尿病视网膜病变和葡萄膜炎）中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变, 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | Pf4Cre转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明，但使用小鼠模型和CCL2注射实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-06 |
Spatiotemporal transcriptomic mapping of regenerative inflammation in skeletal muscle reveals a dynamic multilayered tissue architecture
2024-08-27, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173858
PMID:39190487
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研究论文 | 通过时空转录组学解析骨骼肌再生炎症，揭示动态多层组织结构 | 首次整合空间转录组学与免疫荧光技术，发现受损肌纤维周围有序分布的巨噬细胞亚群形成功能性再生炎症区（RIZs），并揭示其组织结构和动态变化 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类骨骼肌再生过程；间歇性糖皮质激素治疗的观察未深入探讨其长期影响 | 研究巨噬细胞在骨骼肌再生中的空间适应性和功能多样性，以及如何构建支持有效组织修复的有序组织架构 | 急性损伤和早期肌营养不良的骨骼肌组织中的髓系细胞（单核细胞、巨噬细胞和树突状细胞） | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 肌营养不良症 | 空间转录组学, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-06 |
Single-cell multiomic analysis identifies macrophage subpopulations in promoting cardiac repair
2024-08-27, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175297
PMID:39190625
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析鉴定巨噬细胞亚群在促进心脏修复中的作用 | 利用时空单细胞表观基因组学分析，首次在再生（P1）和非再生（P10）小鼠心脏中鉴定出修复性Arg1+巨噬细胞和促炎性S100a9+Ly6c+单核细胞的不同作用，并通过阻断CXCR2趋化因子改善非再生心脏的伤口修复反应 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类心脏组织中进行验证 | 阐明心脏单核吞噬细胞在心脏修复中的功能和细胞命运决定机制 | 再生（P1）和非再生（P10）小鼠心脏中的心脏单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞多组学分析、单细胞RNA测序、单细胞表观基因组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、单细胞表观基因组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞表观基因组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞表观基因组学分析平台 |
| 5 | 2026-07-03 |
Single-Cell Profiling Reveals Immune Aberrations in Progressive Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-08-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0979OC
PMID:38717443
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示特发性肺纤维化中外周免疫系统的变化 | 首次在高分辨率下系统描绘稳定性和进展性IPF中外周免疫系统变化图谱，发现经典单核细胞和调节性T细胞的预后预测性增加，并揭示肺-血免疫招募轴 | 样本量有限（38个PBMC样本），验证队列规模较小，未完全校正混杂因素 | 研究特发性肺纤维化中外周血免疫系统在稳定和进展状态下的变化 | 特发性肺纤维化患者和对照个体的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 38份PBMC样本，来自25名IPF患者和13名匹配对照个体，共149,564个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 5'单细胞RNA测序 |
| 6 | 2026-07-03 |
Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.005
PMID:38925112
|
研究论文 | 引入CPA-Perturb-seq，结合多重扰动筛选与单细胞RNA测序，研究42种CPA调控因子如何影响polyA位点选择 | 开发了CPA-Perturb-seq多重扰动筛选方法，结合3'端单细胞RNA测序实现全转录组polyA位点使用的推断，并训练了深度神经网络APARENT-Perturb来预测串联polyA位点使用 | 未提及明显限制，但可能局限于已知CPA调控因子及体外细胞模型 | 探究剪切和多聚腺苷酸化（CPA）调控因子如何控制polyA位点选择 | 42种CPA调控因子及其对polyA位点使用的影响 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 涉及42种CPA调控因子的多重扰动筛选数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,多重扰动筛选 | 10x Chromium | 基于3'端单细胞RNA测序的多重扰动筛选平台 |
| 7 | 2026-07-01 |
ResSAT: Enhancing Spatial Transcriptomics Prediction from H&E- Stained Histology Images with Interactive Spot Transformer
2024-Aug-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4707959/v1
PMID:39149477
|
研究论文 | 提出ResSAT框架，利用残差网络和自注意力变换器从H&E染色组织学图像预测空间转录组数据 | 通过交互式点变换器捕捉组织结构的空间关系，突破了现有方法忽略空间关联的局限 | 未提及局限性 | 开发从H&E图像预测空间基因表达的算法，降低空间转录组分析成本 | H&E染色组织学图像与空间转录组数据 | 数字病理学 | 未指定疾病 | 空间转录组学 | 残差网络结合自注意力变换器（ResSAT） | 图像与基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 8 | 2026-06-30 |
Lipid Deficiency Contributes to Impaired Alveolar Progenitor Cell Function in Aging and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0290OC
PMID:38657143
|
研究论文 | 研究发现脂质代谢缺乏导致衰老和特发性肺纤维化中肺泡祖细胞功能受损 | 通过单细胞RNA测序首次揭示特发性肺纤维化患者和老年小鼠肺泡II型细胞中脂质代谢相关基因下调，并证实脂质补充可增强祖细胞更新能力 | 未明确脂质代谢恢复对体内肺纤维化治疗效果的验证 | 探究脂质代谢在肺泡祖细胞功能维持及特发性肺纤维化发病中的作用 | 来自特发性肺纤维化患者和健康供体的人类肺泡II型细胞，以及博来霉素损伤的年轻和老年小鼠肺泡II型细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，流式细胞术，三维类器官培养 | NA | 基因表达数据、图像 | 人类样本：多个特发性肺纤维化患者和健康供体；小鼠样本：不同年龄组博来霉素损伤模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 9 | 2024-08-07 |
Lung Single-Cell Transcriptomics in Alpha-1 Antitrypsin Deficiency
2024-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0064LE
PMID:39087828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-06-29 |
Single-cell RNA-seq reveals novel interaction between muscle satellite cells and fibro-adipogenic progenitors mediated with FGF7 signalling
2024-08, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13484
PMID:38751367
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肌肉卫星细胞与纤维脂肪祖细胞之间由FGF7信号介导的新型相互作用 | 首次在猪骨骼肌中通过单细胞RNA测序发现FAPs通过FGF7-FGFR2信号调控MuSCs的新机制，并验证了FGF7在肌肉再生和抗衰老中的作用 | 未提及显著的局限性 | 探索肌肉卫星细胞与微环境中其他细胞的相互作用及其在肌肉生长、损伤和衰老中的功能 | 猪背最长肌和比目鱼肌中的肌源性细胞及纤维脂肪祖细胞 | 数字病理学 | 肌肉相关疾病、衰老性疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞通讯分析（CellChat）、基因集变异分析（GSVA）、RNA速率分析 | 无特定模型，使用生物信息学工具和分析方法 | 单细胞转录组数据 | 猪背最长肌和比目鱼肌样本，加上人、小鼠数据集整合分析和体外/体内实验样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 11 | 2026-06-26 |
Identification and Validation of Prognostic Model for Tumor Microenvironment-Associated Genes in Bladder Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing Data Sets
2024-08, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO.23.00661
PMID:39151107
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据鉴定膀胱癌肿瘤微环境相关基因并构建预后模型 | 利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平解析膀胱癌肿瘤微环境与细胞异质性的关系，筛选出八个关键基因构建预后模型并验证其可靠性 | 结果依赖公共数据库数据，需体外实验进一步验证 | 阐明肿瘤微环境与膀胱癌细胞多样性的关系并构建预后模型 | 膀胱癌正常与肿瘤细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归与多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | GEO数据库单细胞数据及TCGA随访数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-19 |
PanIN and CAF transitions in pancreatic carcinogenesis revealed with spatial data integration
2024-08-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.001
PMID:39116880
|
研究论文 | 该研究引入一种新的成像、空间转录组学和单细胞RNA测序整合流程，以表征胰腺癌发生过程中肿瘤细胞状态转变 | 开发了一种半监督分析流程，整合了全转录组FFPE空间转录组学与单细胞RNA测序数据，首次在低级别和高级别PanIN病变中追踪癌变进程并映射细胞表型，揭示了CAF相关炎症信号向细胞增殖的转变 | 无法在FFPE样本中对人类PanIN进行严格诊断，限制了其微环境中单细胞水平的表征 | 利用空间多组学整合解析胰腺癌发生过程中的时空动态 | 低级别和高级别胰腺上皮内瘤变样本及其微环境中的肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、高维成像蛋白质组学 | 半监督学习框架 | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 罕见队列的低级别和高级别PanIN病变样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-19 |
Global transcription regulation revealed from dynamical correlations in time-resolved single-cell RNA sequencing
2024-08-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.002
PMID:39121860
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研究论文 | 通过时间分辨单细胞RNA测序中的动态相关性揭示全局转录调控机制 | 提出结合细胞大小和细胞周期依赖率的随机基因表达模型，利用代谢标记和细胞周期报告基因捕获时间维度，并开发并行可扩展的近似贝叶斯计算方法校正技术变异，准确量化全转录组的爆发频率、爆发大小和降解率 | 未在摘要中明确提及局限性 | 利用时间分辨单细胞RNA测序中的动态相关性识别全局转录调控机制 | 单细胞中的基因表达动态，包括转录爆发和降解过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，代谢标记 | 随机模型，近似贝叶斯计算 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-18 |
3D-Bioprinted Co-Cultures of Glioblastoma Multiforme and Mesenchymal Stromal Cells Indicate a Role for Perivascular Niche Cells in Shaping Glioma Chemokine Microenvironment
2024-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13171404
PMID:39272976
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研究论文 | 利用3D生物打印技术共培养胶质母细胞瘤与间充质基质细胞，揭示血管周围微环境细胞在塑造胶质瘤趋化因子微环境中的作用 | 首次通过3D生物打印共培养模型证实血管周围微环境细胞（周细胞和内皮细胞）在胶质母细胞瘤趋化因子分泌中的关键作用 | NA | 研究血管周围微环境细胞如何影响胶质母细胞瘤的趋化因子微环境 | 胶质母细胞瘤细胞系（U-251和DK-MG）与间充质基质细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 3D生物打印、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 两种胶质母细胞瘤细胞系（U-251和DK-MG），与间充质基质细胞共培养 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-18 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to predict breast cancer prognosis: A study based on natural killer cell-related genes
2024-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18549
PMID:39098994
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据与机器学习方法，基于自然杀伤细胞相关基因构建乳腺癌预后预测模型 | 首次联合101种机器学习算法筛选最佳NKRG预后模型，并整合CellChat分析和药物活性预测验证临床适用性 | 摘要未提及验证队列的多样性，也未讨论模型在多中心数据中的泛化能力 | 构建基于自然杀伤细胞相关基因的乳腺癌预后模型以优化风险分层和个体化治疗 | 乳腺癌患者的单细胞转录组数据和临床预后信息 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso-随机生存森林（RSF） | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-08, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.008
PMID:38936318
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示特发性肺纤维化中CD8+ T细胞的结构和发育轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序详细描绘了IPF患者肺部CD8+ T细胞的动态免疫状态、细胞转化及其在纤维化中的潜在作用 | 研究样本量较小（5名IPF患者和3名对照），且未进行功能验证实验 | 探究特发性肺纤维化中CD8+ T细胞亚群的转录谱、发育轨迹及其在纤维化发病机制中的贡献 | IPF患者和正常对照的肺部免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | Monocle | 单细胞转录组数据 | 5名IPF患者和3名非纤维化肺受试者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-27 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-08-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
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研究论文 | 一项针对未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者的个性化新抗原DNA疫苗一期临床试验，评估其安全性和免疫反应 | 首次在人体中使用个性化新抗原DNA疫苗治疗无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者，并通过单细胞转录组学揭示了肿瘤B细胞减少和耐药机制 | 样本量小（9名患者），且为非随机化试验，未来需联合疫苗与靶向浆细胞亚群或阻断IGF-1信号的策略 | 评估个性化新抗原DNA疫苗在未治疗淋巴浆细胞淋巴瘤患者中的安全性和免疫治疗效果 | 9名无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴浆细胞淋巴瘤 | DNA疫苗，单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名未治疗的无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3’测序 |
| 18 | 2026-05-27 |
Hydrogel crosslinking modulates macrophages, fibroblasts, and their communication, during wound healing
2024-08-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50072-y
PMID:39122702
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研究论文 | 本研究探讨明胶基水凝胶的交联程度如何影响伤口愈合过程中巨噬细胞和成纤维细胞的行为及其相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示不同交联程度水凝胶对巨噬细胞亚群形成及与成纤维细胞RANKL信号通路的差异性调控机制 | 未明确说明样本量及临床转化可行性 | 阐明水凝胶物理特性通过调控免疫-基质细胞通讯优化伤口愈合的机制 | 雌性小鼠的伤口愈合组织 | 机器学习 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 明胶基水凝胶交联程度调控巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的单细胞转录组分析 |
| 19 | 2026-05-24 |
Cellular transitions during cranial suture establishment in zebrafish
2024-08-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50780-5
PMID:39138165
|
研究论文 | 利用斑马鱼单细胞转录组学、谱系追踪和突变分析，揭示颅缝形成过程中调控骨形成的关键细胞转变 | 首次鉴定出颅缝中部间充质细胞亚群通过表达BMP拮抗剂（如grem1a）限制骨形成，从而确保颅缝正常形态的机制 | 未提及 | 探究颅缝在颅骨扩张过程中如何控制成骨活性以促进骨生长并防止异常骨融合 | 斑马鱼胚胎颅缝组织 | 单细胞转录组学 | 颅缝相关疾病 | 单细胞转录组测序、谱系追踪、突变分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 20 | 2026-05-24 |
Single-cell long-read targeted sequencing reveals transcriptional variation in ovarian cancer
2024-08-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51252-6
PMID:39134520
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研究论文 | 开发单细胞靶向长读长测序方法scTaILoR-seq，揭示卵巢癌转录变异 | 提出scTaILoR-seq技术，通过杂交捕获靶向一千多个基因，将每个细胞的中位数靶向转录本数提高29倍，结合长读长变异检测揭示表达SNV与可变转录结构的关联，并测量等位基因失衡 | 长读长测序通量较低且可能意外测序伪影，该方法可能仍受限于靶向基因的选择和捕获效率 | 开发并验证一种单细胞长读长靶向测序方法，用于研究RNA异构体及转录变异 | 卵巢癌细胞系和原发肿瘤样本 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 长读长测序、靶向杂交捕获 | NA | RNA序列 | 10,796个单细胞转录组（来自卵巢癌细胞系和原发肿瘤） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |