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当前共找到 531 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-11 |
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1
PMID:39184105
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研究论文 | 本文开发了PURE-seq技术，用于高效富集和测序稀有细胞，并应用于小鼠长期造血干细胞的研究，识别出Egr1作为衰老背景下造血过程的潜在主调控因子 | 开发了PURE-seq技术，通过直接FACS加载细胞到PIP-seq反应中，减少处理步骤和细胞损失，实现了对稀有细胞（如1/1,000,000稀有度）的可扩展测序 | NA | 开发一种可扩展的稀有细胞测序方法，并研究小鼠长期造血干细胞在造血衰老中的转录组变化 | 小鼠长期造血干细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-01-24 |
Single-cell multiomics analysis reveals cell/tissue-specific associations in bipolar disorder
2024-08-06, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-03044-1
PMID:39107272
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学数据，探讨了双相情感障碍的细胞起源和组织异质性 | 识别了一个名为ADCY1的新型脑细胞簇，并从高分辨率遗传学角度揭示了胶质细胞作为双相情感障碍的主要细胞病理学关联 | 研究样本量有限，特别是单细胞RNA测序数据仅来自胚胎和胎儿脑组织，可能无法完全代表成年患者的情况 | 探究双相情感障碍的细胞起源、组织异质性及其潜在致病机制 | 双相情感障碍患者及对照组的脑组织样本 | 生物信息学 | 双相情感障碍 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 全基因组关联研究, 转录组范围关联研究 | scDRS算法 | 单细胞RNA测序数据, ATAC-seq数据, 批量RNA测序数据, GWAS汇总数据 | 单细胞RNA测序数据（n=8个样本，1,266个细胞），ATAC-seq数据（n=210），批量RNA测序数据（n=314），GWAS汇总数据（n=413,466） | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 批量RNA-seq, GWAS | NA | NA |
| 3 | 2026-01-24 |
Single-cell insights into mouse testicular toxicity under peripubertal exposure to di(2-ethylhexyl) phthalate
2024-08-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfae064
PMID:38730545
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞转录组学揭示了青春期小鼠睾丸在邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯暴露下的毒性机制 | 首次提供了青春期小鼠睾丸在DEHP暴露下的单细胞转录组图谱，明确了支持细胞和间质细胞是DEHP的关键靶点 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；实验周期限于青春期暴露，长期效应未评估 | 探究DEHP在青春期暴露下对睾丸毒性的具体细胞靶点和分化过程影响 | 青春期雄性小鼠睾丸组织 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16只3周龄雄性小鼠（对照组和DEHP暴露组各8只） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-01-21 |
The Transcriptional Landscape of Pericytes in Acute Ischemic Stroke
2024-08, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01169-x
PMID:37378751
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在小鼠永久性大脑中动脉闭塞模型中，探究了缺血性卒中后1、12和24小时周细胞转录组特征的时间差异 | 首次在急性缺血性卒中模型中，通过单细胞RNA测序揭示了周细胞在卒中后特定时间点（12和24小时）出现一个独特的亚群，该亚群以细胞因子信号和免疫反应相关基因上调为特征 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中得到验证；且仅关注了急性期（24小时内）的变化，未涉及更长期的转录组动态 | 探究急性缺血性卒中后周细胞的转录组变化，以寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠模型中的周细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠永久性大脑中动脉闭塞模型在卒中后1、12和24小时的时间点样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-01-13 |
Astaxanthin Alleviates Autoimmune Hepatitis by Modulating CD8+ T Cells: Insights From Mass Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403148
PMID:38874408
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研究论文 | 本研究探讨了虾青素通过调节CD8+ T细胞来缓解自身免疫性肝炎的作用机制 | 结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，首次系统分析了虾青素在自身免疫性肝炎中对CD8+ T细胞数量和功能的调控作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探究虾青素在自身免疫性肝炎中的作用及其对免疫微环境的调控机制 | 自身免疫性肝炎小鼠模型 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-01-13 |
Targeting Adenosine A2b Receptor Promotes Penile Rehabilitation of Refractory Erectile Dysfunction
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306514
PMID:38874549
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型，揭示了腺苷A2b受体在促进难治性勃起功能障碍阴茎康复中的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术分析人类海绵体，并结合多种腺苷受体敲除小鼠模型，明确了A2b受体在腺苷诱导勃起中的关键作用 | 研究主要基于动物模型，人类临床样本的应用有限，且难治性ED模型的复杂性可能影响结果的普适性 | 探究腺苷及其特定受体亚型在促进阴茎康复中的机制，以开发难治性勃起功能障碍的新治疗策略 | 人类海绵体组织、腺苷脱氨酶和腺苷受体敲除小鼠、原代海绵体平滑肌细胞以及三种大鼠难治性ED模型 | 单细胞测序 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类海绵体样本、多种敲除小鼠模型及三种大鼠ED模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-17 |
A single-cell and spatially resolved atlas of human osteosarcomas
2024-08-20, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01598-7
PMID:39164791
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，构建了人类骨肉瘤的细胞组成和空间组织结构图谱 | 首次提供了人类骨肉瘤的单细胞和空间分辨率转录组学综合分析，构建了细胞元图谱来解析空间转录组数据，并识别了与化疗耐药相关的独特空间生态位 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 深入理解骨肉瘤的细胞组成、组织结构、功能状态及其对化疗的反应，为靶向治疗提供基础 | 人类骨肉瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-12-12 |
Scalable spatial single-cell transcriptomics and translatomics in 3D thick tissue blocks
2024-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606553
PMID:39149316
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研究论文 | 本文开发了Deep-STARmap和Deep-RIBOmap技术，用于在200微米厚的组织块中进行三维空间单细胞转录组和翻译组量化 | 首次实现了在厚组织块（200微米）中进行三维空间单细胞转录组和翻译组分析，突破了现有技术仅限于薄切片（5-20微米）的限制 | NA | 揭示基因在三维组织环境中如何塑造组织结构和功能，以理解健康与疾病状态 | 小鼠大脑组织、人类皮肤癌组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间单细胞转录组学、空间单细胞翻译组学、多色荧光蛋白成像 | NA | 图像、转录组数据、翻译组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2025-11-25 |
PDIA3 orchestrates effector T cell program by serving as a chaperone to facilitate the non-canonical nuclear import of STAT1 and PKM2
2024-Aug-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.038
PMID:38822524
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研究论文 | 本研究揭示了PDIA3通过促进STAT1和PKM2的非经典核输入来调控效应T细胞程序的新机制 | 首次发现PDIA3作为分子伴侣促进STAT1和PKM2的非经典核输入，调控Th1和Th17细胞分化 | PDIA3的高诱导仅发生在异常外部刺激下，这一机制可能在病理条件下特异性发生 | 探索类风湿关节炎中T细胞效应程序的调控机制 | 类风湿关节炎患者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-30 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.08.607264
PMID:39149388
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研究论文 | 开发了一种无需超参数调优的广义对比主成分分析方法，用于比较高维数据集间的差异模式 | 提出了超参数自由的广义对比PCA方法，解决了传统对比PCA需要手动调参且无法对称比较两个实验条件的问题 | 论文未明确说明方法在极端高维情况下的计算效率限制或对特定数据分布的适用性限制 | 开发一种能够对称比较两个高维数据集的降维方法，提取条件特异性模式 | 高维生物数据，包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | II型糖尿病 | 单细胞RNA测序，神经生理记录分析 | 广义对比PCA | 高维生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Physical modeling of embryonic transcriptomes identifies collective modes of gene expression
2024-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.26.605398
PMID:39131269
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研究论文 | 本研究通过统计物理学方法分析海鞘胚胎单细胞测序数据，识别基因表达的集体模式 | 利用自然变异和统计物理建模技术，首次在完整互连胚胎水平研究发育过程，推断细胞间相互作用网络 | 研究基于海鞘胚胎数据，结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 | 研究胚胎发育过程中基因表达的集体协调机制 | 早期海鞘胚胎细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序 | 统计物理模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-05 |
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2024-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.23.609477
PMID:39229093
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研究论文 | 提出SPACE框架，通过调整细胞类型混杂效应改进空间可变基因聚类，以提升空间域检测精度 | 无需基因簇数量、空间模式或细胞类型信息的先验知识，通过调整细胞类型混杂效应实现空间可变基因的准确聚类 | 未明确说明方法在特定组织类型或数据质量下的性能限制 | 改进空间转录组学中空间可变基因的聚类方法以提升空间域检测准确性 | 空间可变基因(SVGs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | SPACE框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
FUSION: A web-based application for in-depth exploration of multi-omics data with brightfield histology
2024-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.09.602778
PMID:39026885
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研究论文 | 开发了一个基于网络的工具FUSION，用于深度探索多组学数据与明场组织学的关联分析 | 将分子数据与组织病理学特征整合到单一工作空间，提供端到端的功能性组织单元分析 | NA | 开发一个能够连接分子特征与组织病理学特征的分析平台 | 健康与疾病组织样本的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习算法 | 全切片图像, 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 福尔马林固定石蜡包埋和冷冻制备的数据集 |
| 14 | 2025-10-05 |
Identification of Regulatory RNA-Binding Proteins Associated with Immune Infiltration in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2024-08-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300498
PMID:38912837
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研究论文 | 通过分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别与喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的调控性RNA结合蛋白和可变剪接事件 | 首次系统鉴定与喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的RNA结合蛋白及其调控的可变剪接事件，发现RBM47在髓系细胞中上调并与预后显著相关 | 样本量有限（20对癌与癌旁组织），仅使用公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索RNA结合蛋白和可变剪接事件在喉鳞状细胞癌免疫浸润中的作用机制 | 喉鳞状细胞癌组织和免疫细胞 | 生物信息学 | 喉癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，可变剪接分析 | edgeR差异表达分析，科学反卷积算法 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 20对喉癌和癌旁组织，117个喉癌样本，2个单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies WARS1+ Mesenchymal Stem Cells with Enhanced Immunomodulatory Capacity and Improved Therapeutic Efficacy
2024-08-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300752
PMID:38856632
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定具有增强免疫调节能力的WARS1+间充质干细胞，并验证其在银屑病治疗中的疗效提升 | 首次发现WARS1是增强脐带间充质干细胞免疫调节能力的关键调控因子，并阐明其通过RhoA-Akt轴发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 提高脐带间充质干细胞对银屑病的治疗效果 | 脐带来源的间充质干细胞和银屑病小鼠模型 | 单细胞测序 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics Identifies Cellular and Molecular Characteristics of Scleroderma Skin Lesions: Pilot Study in Juvenile Scleroderma
2024-Aug-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179182
PMID:39273131
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研究论文 | 本研究首次利用空间转录组学技术分析幼年硬皮病患者皮肤病变的细胞和分子特征 | 首次将Visium CytAssist空间转录组学平台应用于幼年硬皮病皮肤病变研究，并结合单细胞RNA测序数据进行验证 | 初步研究，样本量有限 | 探索幼年硬皮病皮肤病变的细胞和分子机制 | 幼年硬皮病患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 幼年硬皮病患者皮肤病变组织（具体数量未明确） | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组学平台 |
| 17 | 2025-10-05 |
Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics
2024-Aug, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2024-100067
PMID:39149129
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析慢性乙型肝炎患者肝活检样本，揭示HBV与HDV/HIV共感染时的肝内转录景观和免疫特征 | 首次应用空间转录组学技术系统分析HBV与HDV/HIV共感染患者的肝内转录组特征和细胞组成 | 样本量较小（仅3例初治患者），属于原理验证性研究 | 评估空间转录组学在表征HBV与HDV/HIV共感染患者肝内转录景观、细胞组成和生物通路中的应用价值 | 慢性HBV感染患者的福尔马林固定石蜡包埋肝活检样本 | 空间转录组学 | 乙型肝炎 | 空间转录组学，数字空间分析 | 加权基因共表达网络分析 | 空间转录组数据 | 3例初治慢性HBV与HDV/HIV共感染患者 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx数字空间分析平台 | GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas检测 |
| 18 | 2025-10-05 |
Description of Bacterial RNA Transcripts Detected in Mycobacterium tuberculosis - Infected Cells from Peripheral Human Granulomas using Single Cell RNA Sequencing
2024-Aug-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608852
PMID:39229107
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序检测人类结核肉芽肿中结核分枝杆菌的RNA转录本 | 在针对真核mRNA设计的单细胞RNA测序文库中成功捕获并分析了结核分枝杆菌的转录本，揭示了细菌转录本的序列变异模式 | 仅包含经医院病理实验室确认的结核感染患者的细菌序列数据，样本来源有限 | 探索结核分枝杆菌在感染宿主细胞中的转录特征和序列变异 | 来自巴布亚新几内亚莫尔兹比港总医院结核病诊所患者的细针穿刺样本 | 数字病理 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 经抗酸显微镜和/或GeneXpert分析确认的结核感染患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序转录组学流程，使用poly-T引物在约30微米珠上启动mRNA扩增 |
| 19 | 2025-10-05 |
Chronic social defeat stress induces meningeal neutrophilia via type I interferon signaling
2024-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610447
PMID:39257811
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研究论文 | 本研究揭示了慢性社交挫败应激通过I型干扰素信号通路诱导脑膜中性粒细胞增多的机制 | 首次发现慢性应激通过I型干扰素信号通路驱动颅骨骨髓来源的中性粒细胞向脑膜迁移 | 研究仅使用小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探究应激相关障碍中脑膜免疫反应的分子机制 | 小鼠脑膜免疫细胞 | 神经免疫学 | 应激相关障碍 | 流式细胞术,免疫组织化学,组织透明化,单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Monocyte Single-Cell Multimodal Profiling in Cardiovascular Disease Risk States
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324457
PMID:39105287
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术对心血管疾病风险状态下单核细胞进行综合表征 | 首次采用CITE-seq和单细胞RNA测序相结合的多模态方法，系统揭示单核细胞的高度异质性及其在心血管疾病风险状态下的变化 | 研究主要关注特定心血管疾病风险因素，未涵盖所有可能的病理条件 | 探索单核细胞在心血管疾病风险状态下的异质性变化和功能特征 | 437,126个人类单核细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表位数据 | 437,126个单核细胞 | NA | 单细胞多组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |