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当前共找到 498 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-12-20 |
Oligoclonal CD4+CXCR5+ T cells with a cytotoxic phenotype appear in tonsils and blood
2024-07-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06563-1
PMID:39025930
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研究论文 | 研究比较了外周血和扁桃体中CD3CD4CXCR5 T细胞的异质性，发现了一种具有细胞毒性表型的寡克隆CD4+CXCR5+ T细胞亚群 | 首次发现了一种具有细胞毒性表型的寡克隆CD4+CXCR5+ T细胞亚群，并描述了其在扁桃体和外周血中的分布特征 | 研究仅限于扁桃体和外周血样本，未涉及其他组织或疾病状态 | 探讨外周血和扁桃体中CD3CD4CXCR5 T细胞的异质性及其在临床中的潜在应用 | 外周血和扁桃体中的CD3CD4CXCR5 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 转录组、TCR库、细胞表面蛋白表达 | 外周血和扁桃体中的CD3CD4CD45RACXCR5细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-12-19 |
A point cloud segmentation framework for image-based spatial transcriptomics
2024-07-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06480-3
PMID:38971915
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图像的空间转录组学的点云分割框架ComSeg，用于在复杂组织中进行单细胞RNA定位和细胞类型识别 | ComSeg算法直接在单个RNA位置上操作，无需对细胞形状进行隐式或显式先验假设，适用于具有任意细胞形状的复杂组织 | NA | 解决在缺乏高质量膜标记的情况下，组织数据中准确细胞分割的挑战 | 单细胞RNA定位和细胞类型识别 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 模拟和实验数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-12-18 |
Single cell regulatory architecture of human pancreatic islets suggests sex differences in β cell function and the pathogenesis of type 2 diabetes
2024-Jul-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4607352/v1
PMID:39011095
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研究论文 | 研究探讨了人类胰腺胰岛中β细胞功能的性别差异及其在2型糖尿病发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和单核转座酶可及染色质测序技术，揭示了2型糖尿病患者中β细胞功能的性别差异及其与线粒体功能障碍的关系 | 研究样本量较小，且仅限于人类胰腺胰岛，可能无法完全代表所有性别差异的影响 | 探讨2型糖尿病中胰岛素分泌的性别差异机制 | 人类胰腺胰岛中的β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 52名捐赠者（包括2型糖尿病患者和非糖尿病患者） | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-12-16 |
A specialized population of monocyte-derived tracheal macrophages promote airway epithelial regeneration through a CCR2-dependent mechanism
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110169
PMID:38993668
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研究论文 | 本文研究了单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用，并揭示了CCR2依赖的机制 | 首次揭示了单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用及其CCR2依赖的招募和激活机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用及其机制 | 小鼠气管巨噬细胞及其在气道损伤后的再生作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-12-02 |
Single-cell sequencing reveals novel proliferative cell type: a key player in renal cell carcinoma prognosis and therapeutic response
2024-Jul-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01424-x
PMID:39052149
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肾细胞癌中一种新型增殖细胞类型，并探讨了其在肾细胞癌预后和治疗反应中的关键作用 | 发现了一种名为“Prol”的高度增殖细胞亚群，并开发了一种基于人工智能网络的Prol特征，能够预测肾细胞癌的预后和治疗反应 | NA | 探讨肾细胞癌的分子异质性，并开发新的预后预测特征和治疗靶点 | 肾细胞癌中的新型增殖细胞类型及其在预后和治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 人工智能网络（包括传统回归、机器学习和深度学习算法） | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-12-01 |
Empowering Precision Oncology: Advancing Cancer Research by Augmenting Single-cell RNA and Bulk RNA Sequencing for Confronting the Heterogeneity in Ovarian Cancer
2024 Jul-Sep, Journal of mid-life health
IF:1.2Q3
DOI:10.4103/jmh.jmh_93_23
PMID:39610955
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序在卵巢癌分子水平上的应用 | 强调了scRNA-Seq在揭示卵巢肿瘤复杂细胞组成和表型可塑性中的关键作用，并展示了其在新生物标志物发现和治疗靶点识别中的应用 | NA | 通过增强对卵巢癌分子水平的理解，推动精准肿瘤学的发展 | 卵巢癌的分子特征和细胞异质性 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-11-21 |
Revealing the molecular landscape of human placenta: a systematic review and meta-analysis of single-cell RNA sequencing studies
2024-07-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmae006
PMID:38478759
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综述 | 本文通过系统综述和荟萃分析单细胞RNA测序研究，揭示了人类胎盘的分子景观 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集，识别了主要胎盘细胞类型的标记基因，并强调了建立单细胞RNA测序数据注释共识的必要性 | 不同研究在采样部位、妊娠年龄、胎儿性别和后续测序及分析方法上存在差异，导致标记基因的识别存在不一致性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，系统综述和比较不同胎盘细胞类型的基因表达，识别共识标记基因，并探讨其在妊娠相关疾病研究中的应用 | 人类胎盘及其特异性细胞类型，包括细胞滋养层、合体滋养层和绒毛外滋养层 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了35,461个早期妊娠胎盘细胞和23,378个足月胎盘细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-11-15 |
Coronavirus disease 2019-related myocarditis genes contribute to ECMO prognosis
2024-07-19, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-024-04032-5
PMID:39026189
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研究论文 | 研究COVID-19相关心肌炎基因对ECMO预后的影响 | 通过分析GSE150392和GSE93101数据集，识别出与心肌炎和ECMO预后相关的差异表达基因，并验证了这些基因在不同细胞类型中的表达 | 研究主要基于已有的基因表达数据集，缺乏临床样本的直接验证 | 探讨COVID-19相关心肌炎基因对ECMO治疗预后的影响 | COVID-19相关心肌炎患者和ECMO治疗预后 | NA | 心血管疾病 | 差异表达基因分析、富集通路分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE150392、GSE93101和GSE167028数据集以及单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-11-14 |
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179472
PMID:39024569
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研究论文 | 研究了克罗恩病中肠纤维化的发病机制，特别是TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 | 首次揭示了TWIST1+FAP+成纤维细胞在肠纤维化中的关键作用，并提出了通过抑制TWIST1来治疗克罗恩病纤维化的潜在策略 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需要进一步的临床验证 | 探讨克罗恩病中肠纤维化的发病机制，并寻找有效的治疗策略 | 克罗恩病患者的纤维化和非纤维化回肠组织，以及小鼠的慢性葡聚糖硫酸钠盐结肠炎模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-11-13 |
Predicting prognosis and immunotherapy response in colorectal cancer by pericytes insights from single-cell RNA sequencing
2024-07-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae064
PMID:38652261
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析，揭示了结直肠癌微环境中周细胞的功能及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了周细胞在结直肠癌微环境中的富集及其与不良预后和免疫治疗抵抗的关系 | 研究主要基于现有数据集，缺乏体内实验验证 | 探讨周细胞在结直肠癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 结直肠癌中的周细胞及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过1000个样本，包括453个免疫治疗数据集样本 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-11-11 |
Systematic Analysis of Human Colorectal Cancer scRNA-seq Revealed Limited Pro-tumoral IL-17 Production Potential in Gamma Delta T Cells
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.18.604156
PMID:39071278
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研究论文 | 本研究重新分析了九个已发表的人类结直肠癌全组织单细胞RNA测序数据集，揭示了γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的潜力有限 | 首次系统分析了γδ T细胞在结直肠癌中的IL-17产生潜力，并发现其主要功能为细胞毒性效应细胞而非IL-17产生者 | 研究仅基于已发表的数据集，未进行新的实验验证 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的作用及其产生IL-17的潜力 | γδ T细胞在结直肠癌中的功能和IL-17产生潜力 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 165名结直肠癌患者，共951,785个细胞，其中18,483个为γδ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-11-11 |
Advances in single-cell sequencing technology in microbiome research
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101129
PMID:38545125
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综述 | 本文回顾了微生物检测技术的发展历史，分析了单细胞测序在微生物应用中的难点，并总结了新兴的微生物单细胞测序技术（Microbe-seq）的特点及应用前景 | 介绍了新兴的微生物单细胞测序技术（Microbe-seq）及其在微生物研究中的应用前景 | Microbe-seq技术仍处于优化阶段 | 促进单细胞测序技术在微生物中的广泛应用并推动技术的进一步改进 | 微生物的基因型和功能表达 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-11-08 |
Identification of novel immune-related signatures for keloid diagnosis and treatment: insights from integrated bulk RNA-seq and scRNA-seq analysis
2024-07-16, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00647-z
PMID:39014455
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，识别出与瘢痕疙瘩诊断和治疗相关的新型免疫相关基因 | 本研究首次识别出PTGFR、RBP5和LIF作为瘢痕疙瘩的免疫相关基因，并构建了基于这些基因转录组模式的人工神经网络分子诊断模型，为瘢痕疙瘩的诊断和治疗提供了新的策略 | 本研究主要基于GEO数据库中的数据进行分析，未涉及临床试验验证，因此其临床应用效果有待进一步验证 | 本研究旨在通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，识别出与瘢痕疙瘩诊断和治疗相关的新型免疫相关基因，并探索其潜在的治疗机制 | 本研究主要研究对象为瘢痕疙瘩及其相关的免疫相关基因 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq | 人工神经网络 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-10-29 |
Targeting CEBPA to restore cellular identity and tissue homeostasis in pulmonary fibrosis
2024-Jul-16, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175290
PMID:39012710
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研究论文 | 研究通过RNA-Seq数据挖掘和多种实验方法，探讨CEBPA在肺纤维化中的作用及其恢复细胞身份和组织稳态的机制 | 首次揭示CEBPA抑制与AT2细胞身份受损、组织稳态破坏和肺纤维化之间的直接机制联系 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体中验证 | 阐明CEBPA在肺纤维化中的作用及其恢复细胞身份和组织稳态的机制 | CEBPA在肺纤维化中的作用及其对AT2细胞和组织稳态的影响 | NA | 肺纤维化 | RNA-Seq、scRNA-Seq、肺类器官、小分子抑制剂、基因操作 | NA | RNA | 条件性KO小鼠、肺类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-10-25 |
Spatial transcriptomics implicates impaired BMP signaling in NF1 fracture pseudarthrosis in murine and patient tissues
2024-Jul-11, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176802
PMID:38990653
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研究论文 | 本文通过空间转录组学研究了NF1缺陷小鼠和患者组织中骨折假关节形成过程中BMP信号通路的异常 | 首次通过空间转录组学分析揭示了NF1缺陷小鼠和患者骨折假关节形成过程中BMP信号通路的异常，并提供了潜在的治疗干预策略 | 研究仅限于小鼠模型和单个患者样本，需要进一步验证和扩展 | 探讨NF1缺陷小鼠和患者骨折假关节形成过程中的分子机制 | NF1缺陷小鼠和患者的骨折组织 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和单个患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-10-24 |
Imputing abundance of over 2500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.31.605432
PMID:39131290
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研究论文 | 本文提出了一种名为SPIDER的上下文无关零样本深度集成模型，用于从单细胞转录组中大规模预测细胞表面蛋白的丰度 | SPIDER模型能够更好地泛化到各种上下文，如不同组织或疾病状态，并且能够预测超过2500种细胞表面蛋白的丰度 | NA | 开发一种能够从单细胞转录组数据中大规模预测细胞表面蛋白丰度的计算方法 | 细胞表面蛋白的丰度预测及其在细胞类型注释、生物标志物/靶点识别和细胞间相互作用分析中的应用 | 机器学习 | NA | CITE-seq | 深度集成模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-10-24 |
Integrative, high-resolution analysis of single cells across experimental conditions with PARAFAC2
2024-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.29.605698
PMID:39131377
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研究论文 | 本文介绍了使用PARAFAC2方法对跨实验条件的单细胞数据进行高分辨率分析 | 提出了PARAFAC2方法，能够在不限制假设的情况下，灵活处理跨实验条件的单细胞数据，并有效分离条件间和细胞间的变异 | NA | 开发有效的工具来探索和分析大规模单细胞测量数据 | 单细胞RNA测序数据，特别是外周免疫细胞在药物干扰和系统性红斑狼疮患者样本中的数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | PARAFAC2 | 基因表达数据 | 涉及药物干扰和系统性红斑狼疮患者样本的单细胞RNA测序实验 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-10-24 |
Modulation of Neuronal Excitability and Plasticity by BHLHE41 Conveys Lithium Non-Responsiveness
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.25.605130
PMID:39372797
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研究论文 | 研究探讨了BHLHE41基因对锂非应答性的影响及其在神经元兴奋性和可塑性中的作用 | 首次揭示了BHLHE41基因在锂非应答性中的关键作用，并通过基因集富集分析和单细胞RNA测序等技术，深入研究了锂在神经元代谢和兴奋性中的细胞特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究锂非应答性的分子机制及其与BHLHE41基因的关系 | 双敲除突变小鼠（DKO）的神经元兴奋性和可塑性 | 神经科学 | 双相情感障碍 | 基因集富集分析、单细胞RNA测序、膜片钳记录 | NA | 基因表达数据、电生理数据 | 双敲除突变小鼠（DKO） | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-10-24 |
Genetic evolution of keratinocytes to cutaneous squamous cell carcinoma
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604673
PMID:39091884
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研究论文 | 研究了表皮角质形成细胞向皮肤鳞状细胞癌的遗传演变过程 | 通过多组学分析和单细胞突变分析，揭示了皮肤癌变过程中分子转变的关键事件 | NA | 理解皮肤癌变过程中分子层面的转变 | 表皮角质形成细胞、光化性角化病和鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞突变分析、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 涉及正常皮肤、光化性角化病和鳞状细胞癌的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-10-24 |
The role of polycystic kidney disease-like homologs in planarian nervous system regeneration and function
2024-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603829
PMID:39091889
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研究论文 | 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 首次全面分析了涡虫基因组中所有相关基因的表达和功能，并开发了用于机械感觉刺激获取和分析的自动化设置 | 对数十种神经亚型的功能了解仍然不足 | 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 涡虫的神经系统再生和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及无性和雌雄同体两种涡虫品系 | NA | NA | NA | NA |