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当前共找到 493 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2024-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602313
PMID:39026724
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研究论文 | 本研究通过构建食管上皮细胞Ikkβ条件性敲除小鼠模型，揭示了上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的关键保护作用 | 首次在实验性过敏小鼠模型中证明食管上皮细胞特异性Ikkβ缺失会加剧嗜酸性食管炎病理特征，并利用单细胞RNA测序技术深入解析了上皮分化和屏障完整性的破坏机制 | 研究基于小鼠模型，其病理特征与人类疾病的完全对应性仍需进一步验证 | 探究上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 食管上皮细胞条件性Ikkβ敲除小鼠 | 单细胞测序分析 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序，RNA测序，组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像数据 | Ikkβ EEC-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
STFormer: Learning to Explore Spot Relationships for Spatial Transcriptomics Prediction from Histology of Colorectal Cancer
2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10782295
PMID:40031511
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研究论文 | 提出STFormer深度学习模型，通过组织学图像预测结直肠癌空间转录组数据 | 引入Style-Aug模块增强特征泛化能力，采用Cross-WSI Transformer模块有效捕获跨WSI的spot关系 | 在有限WSI数据场景下的性能表现未充分验证 | 开发从组织学图像预测空间转录组数据的成本效益方法 | 结直肠癌组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，深度学习 | Transformer | 图像，基因表达数据 | 内部和外部数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-07 |
Molecular and network disruptions in neurodevelopment uncovered by single cell transcriptomics analysis of CHD8 heterozygous cerebral organoids
2024-Jul-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34862
PMID:39149047
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CHD8杂合脑类器官，揭示神经发育过程中的分子和网络紊乱 | 首次在脑类器官模型中系统研究CHD8单倍体不足对早期神经发育的影响，发现细胞组成变化和细胞间通讯紊乱 | 研究基于体外脑类器官模型，可能与体内真实神经发育存在差异 | 研究CHD8基因在神经和大脑发育中的分子和细胞功能，并探索其与自闭症谱系障碍临床表现的关联 | CHD8杂合敲除的脑类器官及其同基因对照 | 单细胞转录组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
Nociceptor-immune interactomes reveal insult-specific immune signatures of pain
2024-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01857-2
PMID:38806708
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了三种皮肤炎症疼痛模型中与疼痛发展相关的免疫基因特征和神经免疫相互作用 | 首次系统绘制了损伤特异性神经免疫相互作用组，发现免疫细胞上调的血栓反应蛋白-1能抑制伤害感受器敏化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病中得到验证 | 解析疼痛发展的免疫机制和神经免疫相互作用 | 小鼠皮肤炎症疼痛模型（酵母聚糖注射、皮肤切口和紫外线烧伤） | 单细胞转录组学 | 炎症性疼痛 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三种小鼠皮肤炎症疼痛模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2025-10-07 |
Timing and location dictate monocyte fate and their transition to tumor-associated macrophages
2024-07-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk3981
PMID:39058763
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和高维流式细胞术揭示了胰腺导管腺癌中单细胞向肿瘤相关巨噬细胞的转化过程 | 首次在胰腺导管腺癌模型中系统描绘了单细胞向肿瘤相关巨噬细胞分化的动态过程，发现了一个短暂存在的中间TAM群体及其产生的两个终末分化TAM谱系 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞的起源、分化过程及其在肿瘤发展中的演变 | 胰腺导管腺癌小鼠模型和人类PDAC患者样本中的单核细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 诱导性单核细胞命运图谱小鼠和人类PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans
2024-07-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20240768
PMID:38904098
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫定位技术对小鼠、大鼠和人类肾脏中的内皮素系统进行全面分析 | 首次结合单细胞RNA测序数据和免疫定位技术，跨物种比较肾脏内皮素系统的表达特征 | 商业抗体在不同物种间效果不一致，RNA表达水平与蛋白质水平并不总是相关 | 表征人类和啮齿类动物肾脏中内皮素系统的表达特征 | 人类、大鼠和小鼠的肾脏组织样本 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫定位 | NA | 基因表达数据, 蛋白质定位数据 | 多物种肾脏样本（人类活体供者活检组织、大鼠和小鼠肾脏样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-07 |
CTHRC1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages synergistically contribute to pro-tumorigenic tumor microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68109-z
PMID:39075108
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了胰腺导管腺癌中CTHRC1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞的协同促癌作用 | 首次发现SPP1+巨噬细胞与CTHRC1+肌成纤维细胞在空间上共定位并协同促进免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 探索胰腺导管腺癌肿瘤微环境中细胞群体间的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤微环境细胞群体 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-07 |
Intestinal strictures in Crohn's disease: An update from 2023
2024-07, United European gastroenterology journal
IF:5.8Q1
DOI:10.1002/ueg2.12568
PMID:38546434
|
综述 | 本文对2023年克罗恩病肠道狭窄领域的最新研究进展进行了全面回顾 | 整合了单细胞测序等新技术在肠道狭窄研究中的应用，提供了对肠道纤维化狭窄的精准理解 | NA | 回顾克罗恩病肠道狭窄的研究进展，为研究人员和临床医生提供前沿信息 | 克罗恩病患者的肠道狭窄病变 | NA | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-07 |
Zika virus exists in enterocytes and enteroendocrine cells of the Aedes aegypti midgut
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110353
PMID:39055935
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究寨卡病毒在埃及伊蚊中肠细胞中的分布和感染机制 | 首次在单细胞水平揭示寨卡病毒主要感染特定肠上皮细胞和肠内分泌细胞亚群，并发现载脂蛋白III在病毒感染中的关键作用 | 研究仅聚焦于中肠组织，未涉及其他可能受感染的蚊虫组织器官 | 阐明寨卡病毒在蚊媒中肠的细胞特异性感染机制 | 埃及伊蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 寨卡病毒感染后的12个中肠细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-07 |
nf-core/airrflow: An adaptive immune receptor repertoire analysis workflow employing the Immcantation framework
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012265
PMID:39058741
|
研究论文 | 开发了一个名为nf-core/airrflow的适应性免疫受体库分析工作流程，用于处理AIRR-seq数据 | 整合了Immcantation框架，提供端到端的批量和单细胞AIRR-seq数据处理，解决了现有工具在并行化、可扩展性和高性能计算适应性方面的限制 | NA | 开发一个高效、可扩展的适应性免疫受体库测序数据分析工作流程 | B细胞和T细胞受体序列 | 生物信息学 | 传染病(COVID-19) | AIRR-seq(适应性免疫受体库测序) | NA | 测序数据 | 196个样本(97名COVID-19感染者和99名健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2025-10-07 |
Investigating gene functions and single-cell expression profiles of de novo variants in orofacial clefts
2024-Jul-18, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100313
PMID:38807368
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研究论文 | 本研究通过分析唇腭裂中的新生变异基因功能及其单细胞表达谱，探索了非OMIM数据库基因在颅面发育中的作用 | 首次将新生变异基因与OMIM已知基因进行系统性比较，并利用单细胞RNA测序技术揭示这些基因在鼠唇发育过程中的细胞类型特异性表达模式 | CPO基因集分析因DNV基因数量有限而未获得显著发现 | 探索唇腭裂中新生变异基因的功能及其在颅面发育中的表达特征 | 853个含新生变异基因（其中230个与CL/P相关，23个与CPO相关）及OMIM数据库中的455个已知基因（178个CL/P基因，277个CPO基因） | 基因组学 | 唇腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞表达数据 | 960个新生变异 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-07 |
HyperCell: Advancing Cell Type Classification with Hyperdimensional Computing
2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10782122
PMID:40039180
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研究论文 | 提出一种基于超维度计算的新方法，用于提高单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类准确性 | 首次将超维度计算应用于单细胞RNA测序数据分析，通过QuantHD方法进行高维超向量编码和迭代训练 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 超维度计算, QuantHD | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-07 |
spatialGE: A user-friendly web application to democratize spatial transcriptomics analysis
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.27.601050
PMID:39005315
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研究论文 | 开发了一个用户友好的网络应用程序spatialGE，用于简化空间转录组学数据分析 | 提供了一个无需编程专业知识即可进行空间转录组学数据分析的友好界面，支持多种分析流程和ST技术 | 未在摘要中明确说明具体的技术限制 | 开发简化空间转录组学数据分析的工具，使其更易于被广泛科学界使用 | 黑色素瘤脑转移和默克尔细胞癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 黑色素瘤,默克尔细胞癌 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-07 |
Secreted clusterin inhibits tumorigenesis by modulating tumor cells and macrophages in human meningioma
2024-07-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae034
PMID:38416702
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了分泌型簇集蛋白(CLU)通过诱导线粒体损伤和触发1型干扰素通路抑制脑膜瘤肿瘤发生和恶性转化的机制 | 首次发现分泌型CLU通过同步调控肿瘤细胞和巨噬细胞抑制脑膜瘤恶性转化，并揭示TNFα可增强CLU的抑癌作用 | 研究样本量相对有限，动物模型验证需要进一步扩展 | 探索脑膜瘤恶性转化的生物学机制并识别潜在治疗靶点 | 人类脑膜瘤组织样本，包括正常脑膜、良性肿瘤、高级别原位肿瘤和肺转移灶 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 18个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2025-10-07 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts determine the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008721
PMID:39067872
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据、空间转录组学和多重免疫荧光技术，揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌免疫治疗抵抗中的关键作用 | 首次系统鉴定POSTN+ CAF亚群在肝癌免疫治疗中的屏障作用，并阐明其通过IL-6/STAT3信号通路招募SPP1+巨噬细胞形成免疫抑制微空间的机制 | 研究基于六个数据集的220个样本，样本来源和数量可能存在局限性 | 探究肝细胞癌免疫治疗抵抗机制，特别关注癌症相关成纤维细胞亚群的作用 | 肝细胞癌患者肿瘤微环境中的细胞组成和相互作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 220个样本来自六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-07 |
Accurate and efficient integrative reference-informed spatial domain detection for spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02284-9
PMID:38844627
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研究论文 | 开发了一种名为IRIS的计算方法，用于在空间转录组学研究中准确高效地检测空间域 | 独特利用单细胞RNA测序数据进行参考信息化的空间域检测，整合多个SRT切片并同时考虑切片内和切片间的相关性 | NA | 表征空间转录组学研究中的组织空间组织结构 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 脑部疾病,肿瘤,糖尿病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 计算方法 | 空间转录组数据 | 六个SRT数据集，涵盖不同技术、组织、物种和分辨率 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 10x Xenium,Stereo-seq | NA |
| 177 | 2025-10-07 |
Characterisation of choroid plexus-infiltrating T cells reveals novel therapeutic targets in murine neuropsychiatric lupus
2024-Jul-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224689
PMID:38531610
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了神经精神性狼疮小鼠模型中脉络丛浸润T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 | 首次在神经精神性狼疮小鼠模型中系统表征脉络丛浸润T细胞，发现特异性T细胞克隆并验证VCAM/VLA-4信号通路作为潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究神经精神性狼疮疾病进展中脉络丛浸润免疫细胞的作用机制 | MRL/lpr小鼠（神经精神性狼疮模型）的脉络丛组织 | 单细胞组学 | 神经精神性狼疮 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | MRL/lpr小鼠在疾病早期和晚期的脉络丛组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞转录组分析平台 |
| 178 | 2025-10-07 |
The dysfunction of CD8+ T cells triggered by endometriotic stromal cells promotes the immune survival of endometriosis
2024-07, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13786
PMID:38544333
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示子宫内膜异位症中CD8+ T细胞功能失调促进疾病免疫逃逸的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘子宫内膜异位症的细胞图谱，发现子宫内膜基质细胞通过STAT1/PDCD1通路和代谢重编程诱导CD8+ T细胞功能失调的新机制 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究子宫内膜异位症的细胞异质性及CD8 T细胞在疾病进展中的作用 | 卵巢子宫内膜异位症患者组织样本及小鼠模型 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例卵巢子宫内膜异位症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-07 |
BANMF-S: a blockwise accelerated non-negative matrix factorization framework with structural network constraints for single cell imputation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae432
PMID:39242194
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研究论文 | 提出一种带有结构网络约束的分块加速非负矩阵分解框架BANMF-S，用于单细胞RNA测序数据的插补 | 通过构建基因-基因相似性网络和细胞-细胞相似性网络作为正则化项，并采用分块化策略通过分布式随机梯度下降加速优化 | NA | 解决单细胞RNA测序中的dropout事件问题，提高数据质量 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF), 随机梯度下降 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-07 |
Preoperative electroacupuncture versus sham electroacupuncture for the treatment of postoperative ileus after laparoscopic surgery for colorectal cancer in China: a study protocol for a multicentre, randomised, sham-controlled trial
2024-07-05, BMJ open
IF:2.4Q1
DOI:10.1136/bmjopen-2023-083460
PMID:38969370
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研究论文 | 评估术前电针与假电针对结直肠癌腹腔镜手术后肠梗阻恢复效果的多中心随机对照试验 | 首次采用多中心随机假对照试验设计评估术前电针对POI的预防作用，并结合单细胞RNA测序进行机制研究 | 样本量相对较小（80例），仅在中国进行，结果可能受文化背景和医疗实践差异影响 | 评估术前电针对结直肠癌腹腔镜手术后肠梗阻的预防和恢复效果 | 接受结直肠癌腹腔镜手术的患者 | 临床医学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 随机对照试验 | 临床数据，生物样本 | 80例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |