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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
Macrophages preserve endothelial cell specialization in the adrenal gland to modulate aldosterone secretion and blood pressure
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114395
PMID:38941187
|
研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞通过VEGF-A信号维持肾上腺内皮细胞特化,调控醛固酮分泌和血压的机制 | 首次发现巨噬细胞通过VEGF-A信号维持肾上腺球状带PLVAP窗孔内皮细胞,提出“haptosecretagogue”信号新概念 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究巨噬细胞在肾上腺内皮细胞特化和醛固酮分泌调控中的作用 | 肾上腺巨噬细胞、内皮细胞、醛固酮分泌机制 | 分子生物学 | 原发性醛固酮增多症 | 单细胞转录组测序、功能表型分析、基因特异性敲除 | NA | 基因表达数据、生理指标数据 | 基因工程小鼠模型、人类醛固酮产生腺瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
Insulin and leptin oscillations license food-entrained browning and metabolic flexibility
2024-07-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114390
PMID:38900636
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研究论文 | 本研究揭示了定时喂养通过诱导胰岛素和瘦素的双相振荡促进皮下白色脂肪组织褐变和代谢灵活性的机制 | 首次发现胰岛素和瘦素的双相振荡是定时喂养诱导脂肪褐变的关键许可信号,并阐明其通过ILC2细胞招募和神经支配依赖的机制 | 研究主要基于动物模型,人类临床相关性尚需验证;具体信号通路细节仍需进一步阐明 | 探索定时喂养促进脂肪组织褐变和能量消耗的整合机制 | 小鼠皮下白色脂肪组织(sWAT)、先天淋巴样2型细胞(ILC2)、胰岛素和瘦素信号通路 | 代谢生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、神经切除手术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、代谢参数 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-07 |
Tropism for ciliated cells is the dominant driver of influenza viral burst size in the human airway
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320303121
PMID:39008691
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研究论文 | 本研究利用原代人气道培养物探究不同上皮细胞类型对流感病毒复制动力学和病毒产量的影响 | 发现纤毛细胞和分泌细胞虽然都是流感病毒主要感染的细胞类型,但只有纤毛细胞与病毒产量增加相关,而感染分泌细胞反而降低总体病毒输出 | 研究基于体外培养系统,可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究流感病毒在不同上皮细胞类型中的复制动力学和病毒产量差异 | 原代人气道培养物中的上皮细胞 | 病毒学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个供体和30个独立分化条件的气道培养物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
Myeloid-Specific Thrombospondin-1 Deficiency Exacerbates Aortic Rupture via Broad Suppression of Extracellular Matrix Proteins
2024-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.30.605216
PMID:39211130
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研究论文 | 本研究探讨骨髓细胞特异性血栓反应蛋白-1缺失通过广泛抑制细胞外基质蛋白加剧主动脉破裂的机制 | 首次揭示骨髓细胞来源的TSP1通过促进血管平滑肌细胞基质修复表型负向调控动脉瘤破裂 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 研究不同细胞群中TSP1缺失对腹主动脉瘤破裂的影响机制 | 基因编辑小鼠模型和人类AAA组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 基因编辑小鼠模型和人类AAA组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组分析 |
| 165 | 2025-10-07 |
The Effect of Exposure to Neighborhood Violence on Glucocorticoid Receptor Signaling in Lung Tumors
2024-07-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0032
PMID:38912926
|
研究论文 | 本研究探讨了居住区暴力犯罪暴露对肺肿瘤中糖皮质激素受体信号通路的影响 | 首次将社区暴力犯罪暴露与肺肿瘤中糖皮质激素受体染色质招募的重新编程联系起来 | 样本量较小(仅15个肺肿瘤样本),研究结果需要更大样本验证 | 研究社会压力暴露与肺肿瘤基因表达之间的关系 | 肺肿瘤样本和居住区暴力犯罪率 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学,CUT&RUN(ChIP测序技术) | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 15个肺肿瘤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.16.603809
PMID:39071282
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组学构建小鼠大脑时空图谱,开发空间衰老时钟模型揭示衰老和 rejuvenation 过程中的细胞邻近效应 | 首次开发基于空间转录组学的机器学习模型(空间衰老时钟),系统揭示衰老过程中细胞对邻近细胞的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类大脑的适用性需要进一步验证 | 探究大脑衰老过程中细胞间相互作用的分子机制及其对组织功能衰退的影响 | 小鼠大脑细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞空间转录组测序 | 深度学习, 机器学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞,来自20个不同年龄阶段的小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-07 |
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322864121
PMID:38976727
|
研究论文 | 本研究揭示了涡虫在伤口诱导下通过NFY转录因子调控神经元分化的机制 | 首次发现伤口诱导的NFY转录因子结合在脑再生早期启动神经分化通路 | 研究仅聚焦于涡虫模型,机制在其他再生动物中的普适性尚未验证 | 探究伤口诱导的转录调控事件如何启动神经元分化和脑再生 | 具有高再生能力的涡虫 | 发育生物学 | NA | 染色质可及性分析,单细胞转录组测序,功能研究 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2024-12-21 |
Exploring the immune characteristions of CRKP pneumonia at single-cell level
2024-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108574
PMID:38772102
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)肺炎患者的免疫特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了CRKP肺炎患者从轻度到重度转变过程中免疫细胞的动态特征和功能特性,并发现了与NK细胞、巨噬细胞和单核细胞相关的细胞标志物 | 样本量较小,仅包括3名患者的5份外周血样本,且未涵盖更多不同严重程度的病例 | 探讨CRKP肺炎患者的免疫失调特征及其与COVID-19的比较 | 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)肺炎患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 5份外周血样本来自3名中度和重度CRKP肺炎患者,以及2名COVID-19患者的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-12-20 |
Oligoclonal CD4+CXCR5+ T cells with a cytotoxic phenotype appear in tonsils and blood
2024-07-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06563-1
PMID:39025930
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研究论文 | 研究比较了外周血和扁桃体中CD3CD4CXCR5 T细胞的异质性,发现了一种具有细胞毒性表型的寡克隆CD4+CXCR5+ T细胞亚群 | 首次发现了一种具有细胞毒性表型的寡克隆CD4+CXCR5+ T细胞亚群,并描述了其在扁桃体和外周血中的分布特征 | 研究仅限于扁桃体和外周血样本,未涉及其他组织或疾病状态 | 探讨外周血和扁桃体中CD3CD4CXCR5 T细胞的异质性及其在临床中的潜在应用 | 外周血和扁桃体中的CD3CD4CXCR5 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 转录组、TCR库、细胞表面蛋白表达 | 外周血和扁桃体中的CD3CD4CD45RACXCR5细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-12-19 |
A point cloud segmentation framework for image-based spatial transcriptomics
2024-07-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06480-3
PMID:38971915
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图像的空间转录组学的点云分割框架ComSeg,用于在复杂组织中进行单细胞RNA定位和细胞类型识别 | ComSeg算法直接在单个RNA位置上操作,无需对细胞形状进行隐式或显式先验假设,适用于具有任意细胞形状的复杂组织 | NA | 解决在缺乏高质量膜标记的情况下,组织数据中准确细胞分割的挑战 | 单细胞RNA定位和细胞类型识别 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 模拟和实验数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-12-18 |
Single cell regulatory architecture of human pancreatic islets suggests sex differences in β cell function and the pathogenesis of type 2 diabetes
2024-Jul-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4607352/v1
PMID:39011095
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研究论文 | 研究探讨了人类胰腺胰岛中β细胞功能的性别差异及其在2型糖尿病发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和单核转座酶可及染色质测序技术,揭示了2型糖尿病患者中β细胞功能的性别差异及其与线粒体功能障碍的关系 | 研究样本量较小,且仅限于人类胰腺胰岛,可能无法完全代表所有性别差异的影响 | 探讨2型糖尿病中胰岛素分泌的性别差异机制 | 人类胰腺胰岛中的β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核转座酶可及染色质测序(snATAC-seq) | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 52名捐赠者(包括2型糖尿病患者和非糖尿病患者) | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-12-16 |
A specialized population of monocyte-derived tracheal macrophages promote airway epithelial regeneration through a CCR2-dependent mechanism
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110169
PMID:38993668
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研究论文 | 本文研究了单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用,并揭示了CCR2依赖的机制 | 首次揭示了单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用及其CCR2依赖的招募和激活机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨单核细胞衍生的气管巨噬细胞在气道上皮再生中的作用及其机制 | 小鼠气管巨噬细胞及其在气道损伤后的再生作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-12-02 |
Single-cell sequencing reveals novel proliferative cell type: a key player in renal cell carcinoma prognosis and therapeutic response
2024-Jul-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-024-01424-x
PMID:39052149
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肾细胞癌中一种新型增殖细胞类型,并探讨了其在肾细胞癌预后和治疗反应中的关键作用 | 发现了一种名为“Prol”的高度增殖细胞亚群,并开发了一种基于人工智能网络的Prol特征,能够预测肾细胞癌的预后和治疗反应 | NA | 探讨肾细胞癌的分子异质性,并开发新的预后预测特征和治疗靶点 | 肾细胞癌中的新型增殖细胞类型及其在预后和治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 人工智能网络(包括传统回归、机器学习和深度学习算法) | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-12-01 |
Empowering Precision Oncology: Advancing Cancer Research by Augmenting Single-cell RNA and Bulk RNA Sequencing for Confronting the Heterogeneity in Ovarian Cancer
2024 Jul-Sep, Journal of mid-life health
IF:1.2Q3
DOI:10.4103/jmh.jmh_93_23
PMID:39610955
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序在卵巢癌分子水平上的应用 | 强调了scRNA-Seq在揭示卵巢肿瘤复杂细胞组成和表型可塑性中的关键作用,并展示了其在新生物标志物发现和治疗靶点识别中的应用 | NA | 通过增强对卵巢癌分子水平的理解,推动精准肿瘤学的发展 | 卵巢癌的分子特征和细胞异质性 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-11-21 |
Revealing the molecular landscape of human placenta: a systematic review and meta-analysis of single-cell RNA sequencing studies
2024-07-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmae006
PMID:38478759
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综述 | 本文通过系统综述和荟萃分析单细胞RNA测序研究,揭示了人类胎盘的分子景观 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集,识别了主要胎盘细胞类型的标记基因,并强调了建立单细胞RNA测序数据注释共识的必要性 | 不同研究在采样部位、妊娠年龄、胎儿性别和后续测序及分析方法上存在差异,导致标记基因的识别存在不一致性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术,系统综述和比较不同胎盘细胞类型的基因表达,识别共识标记基因,并探讨其在妊娠相关疾病研究中的应用 | 人类胎盘及其特异性细胞类型,包括细胞滋养层、合体滋养层和绒毛外滋养层 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了35,461个早期妊娠胎盘细胞和23,378个足月胎盘细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-11-15 |
Coronavirus disease 2019-related myocarditis genes contribute to ECMO prognosis
2024-07-19, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-024-04032-5
PMID:39026189
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研究论文 | 研究COVID-19相关心肌炎基因对ECMO预后的影响 | 通过分析GSE150392和GSE93101数据集,识别出与心肌炎和ECMO预后相关的差异表达基因,并验证了这些基因在不同细胞类型中的表达 | 研究主要基于已有的基因表达数据集,缺乏临床样本的直接验证 | 探讨COVID-19相关心肌炎基因对ECMO治疗预后的影响 | COVID-19相关心肌炎患者和ECMO治疗预后 | NA | 心血管疾病 | 差异表达基因分析、富集通路分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE150392、GSE93101和GSE167028数据集以及单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-11-14 |
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179472
PMID:39024569
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研究论文 | 研究了克罗恩病中肠纤维化的发病机制,特别是TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 | 首次揭示了TWIST1+FAP+成纤维细胞在肠纤维化中的关键作用,并提出了通过抑制TWIST1来治疗克罗恩病纤维化的潜在策略 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据,需要进一步的临床验证 | 探讨克罗恩病中肠纤维化的发病机制,并寻找有效的治疗策略 | 克罗恩病患者的纤维化和非纤维化回肠组织,以及小鼠的慢性葡聚糖硫酸钠盐结肠炎模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-11-13 |
Predicting prognosis and immunotherapy response in colorectal cancer by pericytes insights from single-cell RNA sequencing
2024-07-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddae064
PMID:38652261
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析,揭示了结直肠癌微环境中周细胞的功能及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了周细胞在结直肠癌微环境中的富集及其与不良预后和免疫治疗抵抗的关系 | 研究主要基于现有数据集,缺乏体内实验验证 | 探讨周细胞在结直肠癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 结直肠癌中的周细胞及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过1000个样本,包括453个免疫治疗数据集样本 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-11-11 |
Systematic Analysis of Human Colorectal Cancer scRNA-seq Revealed Limited Pro-tumoral IL-17 Production Potential in Gamma Delta T Cells
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.18.604156
PMID:39071278
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研究论文 | 本研究重新分析了九个已发表的人类结直肠癌全组织单细胞RNA测序数据集,揭示了γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的潜力有限 | 首次系统分析了γδ T细胞在结直肠癌中的IL-17产生潜力,并发现其主要功能为细胞毒性效应细胞而非IL-17产生者 | 研究仅基于已发表的数据集,未进行新的实验验证 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的作用及其产生IL-17的潜力 | γδ T细胞在结直肠癌中的功能和IL-17产生潜力 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 165名结直肠癌患者,共951,785个细胞,其中18,483个为γδ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-11-11 |
Advances in single-cell sequencing technology in microbiome research
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101129
PMID:38545125
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综述 | 本文回顾了微生物检测技术的发展历史,分析了单细胞测序在微生物应用中的难点,并总结了新兴的微生物单细胞测序技术(Microbe-seq)的特点及应用前景 | 介绍了新兴的微生物单细胞测序技术(Microbe-seq)及其在微生物研究中的应用前景 | Microbe-seq技术仍处于优化阶段 | 促进单细胞测序技术在微生物中的广泛应用并推动技术的进一步改进 | 微生物的基因型和功能表达 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |