单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 493 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Deciphering the heterogeneity of differentiating hPSC-derived corneal limbal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-07-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.06.001
PMID:38942029
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析人源多能干细胞分化为角膜缘干细胞过程中的异质性 | 首次在hPSC-LSC分化过程中发现并描述了四种先前未知的细胞状态（中胚层样或未分化亚群） | 研究仅涉及三种hPSC细胞系，样本规模有限 | 解析hPSC分化为角膜缘干细胞过程中的细胞异质性 | 人源多能干细胞分化的角膜缘干细胞 | 单细胞组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种hPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
Unraveling the Prefrontal Cortex-Basolateral Amygdala Pathway's Role on Schizophrenia's Cognitive Impairments: A Multimodal Study in Patients and Mouse Models
2024-07-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae063
PMID:38811350
|
研究论文 | 通过多模态方法研究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症认知障碍中的作用 | 首次结合临床患者和动物模型，综合运用光遗传学、单细胞RNA测序和神经影像学技术揭示mPFC-BLA通路在精神分裂症认知障碍中的关键作用，并发现血液外泌体mRNA作为非侵入性生物标志物的潜力 | 研究样本量未明确说明，动物模型可能无法完全模拟人类精神分裂症的复杂性 | 探究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症相关认知障碍中的作用机制 | 精神分裂症患者和甲基氧化甲醇乙酸酯诱导的小鼠模型 | 神经科学 | 精神分裂症 | 临床量表、磁共振成像、单细胞RNA测序、光遗传学、立体定位注射 | 小鼠疾病模型 | 影像数据、基因表达数据、行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on SARS-CoV-2 Disease, Viral Dynamics, and Antiviral Immune Response in a Nonhuman Primate Model of Coinfection
2024-07-21, Viruses
DOI:10.3390/v16071173
PMID:39066335
|
研究论文 | 本研究通过SIV感染的非人灵长类动物模型，探讨免疫缺陷对SARS-CoV-2感染过程及免疫应答的影响 | 首次在可控环境下直接验证HIV相关免疫缺陷对COVID-19疾病进程和病毒持久性的影响 | 样本量较小（仅2只SIV感染动物），属于初步研究 | 研究免疫缺陷状态下SARS-CoV-2的疾病表现、病毒动力学和抗病毒免疫应答 | SIV慢性感染的猪尾猕猴和SIV未感染的对照猕猴 | 免疫学 | HIV/AIDS, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床观察数据 | 2只SIV慢性感染猪尾猕猴，另设SIV未感染对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2025-10-06 |
Differential regulation by CD47 and thrombospondin-1 of extramedullary erythropoiesis in mouse spleen
2024-Jul-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92679
PMID:38979889
|
研究论文 | 本研究探讨CD47和血小板反应蛋白-1对小鼠脾脏髓外红细胞生成的差异调控机制 | 首次揭示CD47缺失通过促进脾脏Ter119-CD34-祖细胞增殖增强髓外红细胞生成，而血小板反应蛋白-1缺失则通过延缓衰老红细胞清除抑制该过程 | 研究仅使用小鼠模型，未验证人类相关机制 | 阐明CD47和血小板反应蛋白-1信号通路在调控成年小鼠脾脏髓外红细胞生成中的作用机制 | CD47或血小板反应蛋白-1基因敲除小鼠的脾脏细胞 | 分子生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,流式细胞数据 | 基因敲除小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals lasting immunological consequences of influenza infection and respiratory immunization in the pig lung
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011910
PMID:39024231
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究猪肺部流感感染和呼吸道免疫后的持久免疫学变化 | 首次在猪模型中结合scRNA-seq和流式细胞术系统分析流感感染和呼吸道免疫后肺泡灌洗液中免疫细胞的持久变化，并发现IL-1β可减少功能性Treg细胞 | 研究仅观察感染后21天的免疫变化，缺乏更长时间点的追踪数据 | 探究流感感染和呼吸道免疫在猪肺部的持久免疫学影响 | 猪肺泡灌洗液中的白细胞亚群 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 猪肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-06 |
Accelerated dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing data with fastglmpca
2024-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.23.586420
PMID:38585920
|
研究论文 | 本文提出了一种名为快速GLM-PCA的新算法，用于加速单细胞RNA测序数据的降维处理 | 开发了交替泊松回归(APR)算法，相比现有算法能产生更高质量的拟合结果且计算时间更短 | 仅在两个已发表的单细胞RNA-seq数据集上进行了验证，需要更多数据集验证通用性 | 解决单细胞RNA测序数据降维中的计算效率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GLM-PCA, 交替泊松回归(APR) | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-06 |
Identifying proteomic risk factors for overall, aggressive, and early onset prostate cancer using Mendelian Randomisation and tumour spatial transcriptomics
2024-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105168
PMID:38878676
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和肿瘤空间转录组学识别与总体、侵袭性和早发性前列腺癌相关的蛋白质组风险因素 | 首次整合孟德尔随机化、共定位分析和空间转录组学方法系统鉴定前列腺癌风险相关蛋白，并验证其与肿瘤侵袭性的关联 | 研究主要基于遗传预测的蛋白水平，未直接测量循环蛋白浓度；部分发现需要在更多种族群体中验证 | 识别前列腺癌风险相关的循环蛋白，揭示生物学通路并发现新的癌症预防靶点 | 前列腺癌患者（总体、侵袭性和早发性疾病） | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化, 共定位分析, 空间转录组学, GWAS | NA | 遗传数据, 转录组数据 | 2002种遗传预测的循环蛋白水平，两个独立癌症GWAS数据集（欧洲和非洲 ancestry） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-06 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-07, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13892
PMID:38829682
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现早发性阿尔茨海默病患者外周血中干扰素响应性T细胞显著扩增 | 首次在早发性阿尔茨海默病患者中发现抗病毒样ISAGhi T细胞的显著扩增和干扰素信号通路基因表达上调 | 样本量较小，需要进一步研究验证这些细胞在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 研究早发性阿尔茨海默病的免疫特征变化 | 早发性阿尔茨海默病患者和临床正常对照者的外周血单核细胞及CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 微滴数字PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 16例个体进行scRNA-seq分析，19例个体进行CD4 T细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-06 |
Microglial sex differences in innate high anxiety and modulatory effects of minocycline
2024-Jul, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.03.035
PMID:38552926
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高焦虑小鼠模型中微胶质细胞存在显著性别差异，并发现米诺环素治疗可调节女性高焦虑小鼠的突触吞噬功能 | 首次在先天高焦虑小鼠模型中系统揭示微胶质细胞功能性别差异，发现女性高焦虑小鼠微胶质细胞具有更强的突触吞噬能力 | 研究仅限于小鼠模型，人类相关性尚需验证；样本规模相对有限 | 探究高焦虑行为中微胶质细胞功能的性别差异及米诺环素的调节作用 | 先天高焦虑行为(HAB)和正常焦虑行为(NAB)小鼠的脑组织微胶质细胞 | 神经科学 | 焦虑症 | 单细胞RNA测序，体外突触体吞噬实验，口服药物干预 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | 高焦虑和正常焦虑的雄性和雌性小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-06 |
Identification of signaling pathways that specify a subset of migrating enteric neural crest cells at the wavefront in mouse embryos
2024-07-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.034
PMID:38636517
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了小鼠胚胎中前沿迁移肠神经嵴细胞的分子机制和信号通路 | 首次系统描绘了前沿ENCCs在迁移过程中的时空动态变化，并鉴定了调控其特化的关键信号通路 | 研究主要基于小鼠胚胎模型，人类组织验证相对有限 | 探索肠神经系统发育过程中前沿迁移神经嵴细胞的分子调控机制 | 小鼠胚胎中的前沿迁移肠神经嵴细胞及其周围肠道组织 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics across 2,534 microbial species reveals functional heterogeneity in the rumen microbiome
2024-Jul, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01723-9
PMID:38866938
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学技术揭示了瘤胃微生物组中2,534种微生物物种的功能异质性 | 开发了微生物组单细胞转录组学方法，结合液滴单细胞RNA测序和泛基因组计算分析，首次在单细胞水平解析复杂微生物群落功能 | 研究聚焦于瘤胃微生物组，方法在其他微生物生态系统中的适用性有待验证 | 解析复杂微生物群落中单个微生物的功能异质性和生态位适应性 | 瘤胃微生物组中的微生物细胞和物种 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，泛基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 174,531个微生物细胞，2,534个物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴单细胞RNA测序 |
| 152 | 2025-10-06 |
HLA-A+ tertiary lymphoid structures with reactivated tumor infiltrating lymphocytes are associated with a positive immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02712-9
PMID:38762674
|
研究论文 | 本研究探索了食管鳞状细胞癌中HLA-A阳性三级淋巴结构与免疫检查点阻断治疗反应的关系 | 首次发现HLA-A阳性三级淋巴结构及其驻留的肿瘤浸润淋巴细胞与食管鳞癌免疫治疗反应相关 | 样本量相对有限（42例初治组织和60例患者），需要更大规模研究验证 | 识别食管鳞状细胞癌免疫检查点阻断治疗的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,数字空间分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | 42例初治ESCC肿瘤组织和60例ESCC患者 | NanoString | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NanoString GeoMx数字空间分析仪 | NanoString GeoMx数字空间分析仪用于系统评估肿瘤微环境 |
| 153 | 2025-10-07 |
Endogenous FGFs drive ERK-dependent cell fate patterning in 2D human gastruloids
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602611
PMID:39026750
|
研究论文 | 本研究揭示了FGF依赖性ERK信号在2D人类胃泌样体中驱动细胞命运模式化的新机制 | 发现了FGF4和FGF17通过基底定位的FGFR1信号诱导原始条纹样细胞的新机制，与人类和猴胚胎相似但与小鼠不同 | 研究基于体外2D胃泌样体模型，与真实胚胎环境存在差异 | 探究FGF在人类胃泌样体模型中的功能和作用机制 | 2D人类胃泌样体模型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, 原位杂交 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-07 |
Exploring the causal role of immune cells in cerebral aneurysm through single-cell transcriptomics and Mendelian randomization analysis
2024-Jul-12, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxae042
PMID:38661482
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析探索免疫细胞在脑动脉瘤中的因果作用 | 首次整合单细胞转录组学与孟德尔随机化分析，揭示脑动脉瘤与免疫细胞之间的双向因果关系 | 研究仅基于未破裂脑动脉瘤样本，缺乏破裂动脉瘤数据 | 探索免疫细胞与脑动脉瘤形成的复杂相互作用机制 | 脑动脉瘤患者和对照组的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | GSE193533数据集中的未破裂脑动脉瘤和对照组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-07 |
DVsc: An Automated Framework for Efficiently Detecting Viral Infection from Single-cell Transcriptomics Data
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzad007
PMID:39215426
|
研究论文 | 开发了一个名为DVsc的开源框架，用于从单细胞转录组数据中高效检测病毒感染 | 首个专门基于单细胞RNA测序数据高效检测病毒读段的计算框架 | NA | 开发精确定量分析单细胞转录组数据中病毒感染的计算工具 | 临床样本中的病毒感染检测 | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约200个不同的临床样本，感染超过10种不同病毒 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 兼容多种单细胞测序平台 |
| 156 | 2025-10-07 |
An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases
2024-07-05, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add8394
PMID:38963856
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类CD4 T细胞中增强子RNA和其他编码/非编码RNA的转录起始位点图谱 | 首次在人类CD4 T细胞中定义了双向转录增强子的细胞类型特异性图谱，并揭示疾病遗传性在这些增强子中的富集 | NA | 解码转录增强子与人类疾病的关联 | 人类CD4 T细胞 | 生物信息学 | 免疫介导疾病 | 5'单细胞RNA测序，单细胞染色质分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-10-07 |
A spatial portrait of the human sebaceous gland transcriptional program
2024-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107442
PMID:38838779
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术首次绘制了人类皮脂腺分化过程的高分辨率转录图谱 | 首次利用空间转录组学结合伪时间分析、RNA速率和功能富集分析，详细描述了皮脂细胞分化为皮脂的渐进性转录变化 | 研究主要基于皮脂腺增生组织，可能不完全代表正常生理状态 | 解析皮脂腺分化过程中的转录变化及其功能调控 | 人类皮脂腺组织和皮脂细胞 | 空间转录组学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学, 伪时间分析, RNA速率分析, 功能富集分析 | 无监督聚类分析 | 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-07 |
ApoE ε4-dependent alteration of CXCR3 + CD127 + CD4 + T cells is associated with elevated plasma neurofilament light chain in Alzheimer's disease
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596276
PMID:38853824
|
研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术揭示了阿尔茨海默病患者外周血中CXCR3+CD127+Th1细胞与神经丝轻链蛋白的负相关性，并发现这种关联受ApoE ε4基因型调控 | 首次发现外周免疫细胞CXCR3+CD127+Th1细胞与AD神经退行标志物NfL的ApoE ε4依赖性关联，并证实脑脊液中该细胞群的促炎能力增强 | 样本量有限，机制研究不够深入，需要进一步验证因果关系 | 探究阿尔茨海默病患者外周适应性免疫细胞组成与神经炎症的关联 | 阿尔茨海默病患者和健康对照者的外周血单核细胞和脑脊液样本 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 血浆蛋白浓度数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-07 |
Genome-wide Cas9-mediated screening of essential non-coding regulatory elements via libraries of paired single-guide RNAs
2024-07, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-024-01204-8
PMID:38778183
|
研究论文 | 开发了一种通过配对sgRNA文库进行Cas9介导的全基因组非编码调控元件功能筛选的方法 | 首次使用配对sgRNA文库系统性地删除全基因组非编码调控元件来研究其功能 | 研究仅限于K562、293T细胞系和人胚胎干细胞，尚未在更多细胞类型中验证 | 系统研究非编码调控元件的功能及其在生物学过程中的作用 | 人类基因组中的非编码调控元件 | 基因组学 | NA | CRISPR-Cas9筛选，单细胞测序 | NA | 基因组数据，测序数据 | K562细胞系、293T细胞系和人胚胎干细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-04-10 |
Deciphering brain cellular and behavioral mechanisms: Insights from single-cell and spatial RNA sequencing
2024 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1865
PMID:38972934
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在脑研究中的应用及其潜在问题和挑战 | 深入探讨了单细胞和空间RNA测序与神经科学多个方向的整合潜力，包括神经发育、新型脑微结构识别等 | 未具体说明数据处理中的具体技术限制或样本量限制 | 理解单个细胞或细胞类型在特定脑功能中的作用 | 脑细胞及其在脑功能中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |