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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Development of human pancreatic cancer avatars as a model for dynamic immune landscape profiling and personalized therapy
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9071
PMID:38968363
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研究论文 | 开发人胰腺癌avatar模型用于动态免疫景观分析和个性化治疗评估 | 创建个性化器官型avatar模型,能够对完整原位肿瘤微环境进行时空报告并反映临床反应 | 需要手术切除组织样本,模型维持时间有限(12天) | 建立胰腺癌临床前模型以促进治疗进展 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多重免疫荧光,空间转录组学 | 器官型avatar模型 | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Identification of intracellular bacteria from multiple single-cell RNA-seq platforms using CSI-Microbes
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7402
PMID:38959321
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研究论文 | 开发了CSI-Microbes计算流程,用于从单细胞RNA测序数据中识别微生物reads并分析类群差异丰度 | 首次系统评估多种单细胞RNA测序技术回收微生物UMI的效率,发现较新的10x化学方法最适合 | NA | 研究肿瘤微生物组及其与肿瘤微环境的相互作用 | 食管癌和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 食管癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 计算流程(CSI-Microbes) | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 3' v3和5'化学方法 |
| 83 | 2025-10-06 |
Tumor suppressor FRMD3 controls mammary epithelial cell fate determination via notch signaling pathway
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8958
PMID:38959315
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研究论文 | 本研究揭示肿瘤抑制因子FRMD3通过调控Notch信号通路决定乳腺上皮细胞命运 | 首次发现FRMD3通过破坏Dvl2与去泛素化酶USP9x的相互作用促进其降解,并中断Dvl2与CK1、FOXK1/2和NICD的相互作用 | NA | 探究乳腺上皮细胞管腔-基底转化机制及FRMD3的肿瘤抑制功能 | 乳腺上皮细胞(MECs)和三阴性乳腺癌 | 分子生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Dominant dystrophic epidermolysis bullosa is associated with glycolytically active GATA3+ T helper 2 cells which may contribute to pruritus in lesional skin
2024-07-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae110
PMID:38477474
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示显性营养不良性大疱性表皮松解症瘙痒与糖酵解活性GATA3+ Th2细胞的关联 | 首次在DDEB病变皮肤中发现糖酵解活性增强的GATA3+ Th2细胞亚群,为理解疾病瘙痒机制提供新视角 | 样本量较小(6例患者),且仅针对瘙痒亚型患者进行研究 | 鉴定DDEB皮肤转录组特征以寻找减轻瘙痒的治疗靶点 | 显性营养不良性大疱性表皮松解症患者皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | 转录组数据 | 6例DDEB患者(瘙痒亚型)和4例健康个体,共13个皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
CD38+ Alveolar macrophages mediate early control of M. tuberculosis proliferation in the lung
2024-Jul-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3934768/v1
PMID:39070650
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研究论文 | 通过多模态单细胞RNA测序分析揭示了CD38+肺泡巨噬细胞在结核分枝杆菌感染早期控制细菌增殖的关键作用 | 首次发现CD38+单核细胞来源的肺泡巨噬细胞和组织驻留肺泡巨噬细胞在结核感染过程中作为细菌生长的重要控制器,并揭示其表观遗传预激活特征 | 研究聚焦于特定感染时间点的巨噬细胞亚群分析,尚未完全阐明所有巨噬细胞亚型在结核控制中的具体机制 | 探究不同巨噬细胞亚群在结核分枝杆菌感染过程中的功能作用和动态变化 | 肺泡巨噬细胞亚群,包括CD38+单核细胞来源的肺泡巨噬细胞和组织驻留肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序,scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Single-cell Profiling of Reprogrammed Human Neural Stem Cells Unveils High Similarity to Neural Progenitors in the Developing Central Nervous System
2024-07, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10698-3
PMID:38519702
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示重编程人类神经干细胞与发育早期中枢神经系统神经祖细胞的高度相似性 | 首次在单细胞水平系统比较重编程iNSCs与生理状态下神经祖细胞的转录组特征 | 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限 | 评估直接重编程的人类iNSCs与生理神经祖细胞的相似性 | 重编程的人类神经干细胞(iNSCs) | 单细胞生物学 | 神经系统发育 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Machine learning for the identification of neoantigen-reactive CD8 + T cells in gastrointestinal cancer using single-cell sequencing
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02737-0
PMID:38849478
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞测序的机器学习模型,用于识别胃肠道癌症中的新抗原反应性CD8+T细胞 | 首次结合单细胞转录组数据开发26基因机器学习模型识别新抗原反应性T细胞,相比传统方法更高效 | NA | 开发快速识别新抗原反应性T细胞及其T细胞受体的方法 | 胃肠道癌症患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 机器学习 | 胃肠道癌症 | 单细胞测序,空间转录组学,多重免疫组织化学 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组织化学数据 | 数千个肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
DLL1/NOTCH1 signaling pathway maintain angiogenesis in meniscus development and degeneration
2024-07, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2024.106589
PMID:38772475
|
研究论文 | 本研究探讨了DLL1/NOTCH1信号通路在半月板发育和退变过程中维持血管生成的作用机制 | 首次发现DLL1/NOTCH1信号通路在半月板血管网络形成中的关键作用,揭示了该通路表达缺失是血管能力下降的机制 | 研究主要基于人类胚胎和退变半月板组织,缺乏更广泛的临床验证 | 研究胚胎和退变半月板组织中内皮细胞和血管的特征 | 人类胚胎半月板和成熟半月板组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,组织学分析,计算机分析,多种染色技术 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织图像数据 | 人类胚胎组织(E12w,E14w,E35w)和骨关节炎半月板组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Caveats in Interpretation of Molecular Diagnostics in Heart Allografts
2024-07-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004895
PMID:38294835
|
综述 | 本文批判性评估了分子诊断技术在心移植排斥反应诊断中的局限性 | 首次系统分析分子诊断在心移植活检中应用的注意事项和分类方法缺陷 | 基于组织学标签的基因列表存在可重复性问题,分子分类与组织学诊断一致性低(仅40%),治疗意义未探索 | 评估分子诊断技术区分心移植排斥反应类型的准确性和可靠性 | 心脏移植活检样本 | 分子诊断 | 心血管疾病 | 分子分类器分析,生物信息学分析,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Advancing cell-based therapy in sepsis: An anesthesia outlook
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003097
PMID:38708689
|
综述 | 本文从麻醉学角度综述细胞疗法在脓毒症治疗中的研究进展、现状及围手术期管理策略 | 整合单细胞测序与基因编辑技术探讨脓毒症特异性免疫反应,提出CAR-免疫细胞疗法新方向 | 未涉及具体临床试验数据验证,主要基于理论机制探讨 | 探索细胞疗法在脓毒症围手术期管理中的应用潜力 | 脓毒症患者及免疫细胞治疗机制 | 医学研究 | 脓毒症 | 单细胞测序, 基因编辑 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Identification of potential immune-related mechanisms related to the development of multiple myeloma
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003116
PMID:38844445
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析初治多发性骨髓瘤患者的免疫微环境,特别关注单核/巨噬细胞的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统揭示初治多发性骨髓瘤患者骨髓免疫细胞特征,发现干扰素应答细胞群和免疫抑制性单核/巨噬细胞的富集 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究多发性骨髓瘤免疫微环境特征,特别关注单核/巨噬细胞的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓免疫细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 流式细胞数据 | 多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Epigenetic Alteration of Smooth Muscle Cells Regulates Endothelin-Dependent Blood Pressure and Hypertensive Arterial Remodeling
2024-Jul-10, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.07.09.24310178
PMID:39040193
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传酶JMJD3通过调控平滑肌细胞可塑性影响血压和高血压动脉重塑的机制 | 首次将高血压相关人类DNA变异与平滑肌细胞表观遗传调控联系起来,并建立了新型平滑肌细胞特异性Jmjd3缺陷小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索表观遗传机制在高血压发病和动脉重塑中的作用 | 平滑肌细胞、人类遗传变异、小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | GWAS、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、基因表达数据 | 三个独立的人类GWAS研究数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Deciphering the heterogeneity of differentiating hPSC-derived corneal limbal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-07-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.06.001
PMID:38942029
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析人源多能干细胞分化为角膜缘干细胞过程中的异质性 | 首次在hPSC-LSC分化过程中发现并描述了四种先前未知的细胞状态(中胚层样或未分化亚群) | 研究仅涉及三种hPSC细胞系,样本规模有限 | 解析hPSC分化为角膜缘干细胞过程中的细胞异质性 | 人源多能干细胞分化的角膜缘干细胞 | 单细胞组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种hPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Unraveling the Prefrontal Cortex-Basolateral Amygdala Pathway's Role on Schizophrenia's Cognitive Impairments: A Multimodal Study in Patients and Mouse Models
2024-07-27, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbae063
PMID:38811350
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研究论文 | 通过多模态方法研究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症认知障碍中的作用 | 首次结合临床患者和动物模型,综合运用光遗传学、单细胞RNA测序和神经影像学技术揭示mPFC-BLA通路在精神分裂症认知障碍中的关键作用,并发现血液外泌体mRNA作为非侵入性生物标志物的潜力 | 研究样本量未明确说明,动物模型可能无法完全模拟人类精神分裂症的复杂性 | 探究前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症相关认知障碍中的作用机制 | 精神分裂症患者和甲基氧化甲醇乙酸酯诱导的小鼠模型 | 神经科学 | 精神分裂症 | 临床量表、磁共振成像、单细胞RNA测序、光遗传学、立体定位注射 | 小鼠疾病模型 | 影像数据、基因表达数据、行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on SARS-CoV-2 Disease, Viral Dynamics, and Antiviral Immune Response in a Nonhuman Primate Model of Coinfection
2024-07-21, Viruses
DOI:10.3390/v16071173
PMID:39066335
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研究论文 | 本研究通过SIV感染的非人灵长类动物模型,探讨免疫缺陷对SARS-CoV-2感染过程及免疫应答的影响 | 首次在可控环境下直接验证HIV相关免疫缺陷对COVID-19疾病进程和病毒持久性的影响 | 样本量较小(仅2只SIV感染动物),属于初步研究 | 研究免疫缺陷状态下SARS-CoV-2的疾病表现、病毒动力学和抗病毒免疫应答 | SIV慢性感染的猪尾猕猴和SIV未感染的对照猕猴 | 免疫学 | HIV/AIDS, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,临床观察数据 | 2只SIV慢性感染猪尾猕猴,另设SIV未感染对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Differential regulation by CD47 and thrombospondin-1 of extramedullary erythropoiesis in mouse spleen
2024-Jul-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92679
PMID:38979889
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研究论文 | 本研究探讨CD47和血小板反应蛋白-1对小鼠脾脏髓外红细胞生成的差异调控机制 | 首次揭示CD47缺失通过促进脾脏Ter119-CD34-祖细胞增殖增强髓外红细胞生成,而血小板反应蛋白-1缺失则通过延缓衰老红细胞清除抑制该过程 | 研究仅使用小鼠模型,未验证人类相关机制 | 阐明CD47和血小板反应蛋白-1信号通路在调控成年小鼠脾脏髓外红细胞生成中的作用机制 | CD47或血小板反应蛋白-1基因敲除小鼠的脾脏细胞 | 分子生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,流式细胞数据 | 基因敲除小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals lasting immunological consequences of influenza infection and respiratory immunization in the pig lung
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011910
PMID:39024231
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究猪肺部流感感染和呼吸道免疫后的持久免疫学变化 | 首次在猪模型中结合scRNA-seq和流式细胞术系统分析流感感染和呼吸道免疫后肺泡灌洗液中免疫细胞的持久变化,并发现IL-1β可减少功能性Treg细胞 | 研究仅观察感染后21天的免疫变化,缺乏更长时间点的追踪数据 | 探究流感感染和呼吸道免疫在猪肺部的持久免疫学影响 | 猪肺泡灌洗液中的白细胞亚群 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 猪肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
A multidimensional analysis reveals distinct immune phenotypes and the composition of immune aggregates in pediatric acute myeloid leukemia
2024-Jul-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.03.03.23286485
PMID:37961528
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研究论文 | 本研究通过多维分析揭示了儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的特征和免疫聚集体的细胞组成 | 首次在儿童AML中发现近三分之一病例存在免疫浸润骨髓,并识别了包含CD8 T细胞、记忆B细胞、浆细胞和M1样巨噬细胞的免疫聚集热点 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 解析儿童AML骨髓免疫微环境的组成、表型和空间结构 | 儿童急性髓系白血病患者骨髓样本和非白血病对照样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 儿童AML病例和非白血病对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Accelerated dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing data with fastglmpca
2024-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.23.586420
PMID:38585920
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研究论文 | 本文提出了一种名为快速GLM-PCA的新算法,用于加速单细胞RNA测序数据的降维处理 | 开发了交替泊松回归(APR)算法,相比现有算法能产生更高质量的拟合结果且计算时间更短 | 仅在两个已发表的单细胞RNA-seq数据集上进行了验证,需要更多数据集验证通用性 | 解决单细胞RNA测序数据降维中的计算效率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GLM-PCA, 交替泊松回归(APR) | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
γδ T cell profiling in a cohort of preterm infants reveals elevated frequencies of CD83+ γδ T cells in sepsis
2024-Jul-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231987
PMID:38753245
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研究论文 | 本研究通过纵向队列分析揭示了早产儿γδ T细胞在新生儿败血症中的动态变化和表型特征 | 首次在新生儿败血症中发现HLA-DRhiCD83+ γδ T细胞亚群,并揭示其抗原呈递相关基因表达特征 | 样本仅限于早产儿队列,未包含更大规模的验证队列 | 探究早产儿γδ T细胞在新生儿败血症中的免疫学特征和功能 | 早产儿队列中的γδ T细胞 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 二代测序,流式细胞术,单细胞转录组学,功能实验 | NA | 基因组数据,蛋白质表达数据,单细胞转录组数据 | 早产儿纵向队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |