本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Genomic and single-cell characterization of patient-derived tumor organoid models of head and neck squamous cell carcinoma
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601068
PMID:39005427
|
研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官模型,揭示了肿瘤异质性特征及其与顺铂治疗反应的关系 | 首次在头颈部鳞癌类器官模型中系统表征基因组特征和单细胞异质性,发现混合上皮-间质转化状态与顺铂耐药的相关性 | 样本量相对有限(31例患者),需要更大规模验证研究结果 | 建立头颈部鳞癌患者来源肿瘤类器官模型,研究肿瘤异质性与治疗反应机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官 | 数字病理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 患者来源肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 31例头颈部鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
RAS/RAF landscape in monoclonal plasma cell conditions
2024-07-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022295
PMID:38643494
|
研究论文 | 通过分析10,000多名浆细胞疾病患者的RAS/RAF基因突变情况,揭示了该通路在多发性骨髓瘤等疾病中的突变特征 | 首次在如此大规模浆细胞疾病队列中系统描述RAS/RAF突变谱,并通过单细胞测序证实突变发生在不同亚克隆中 | 研究基于常规测序面板,可能未覆盖所有相关突变 | 描述浆细胞疾病中RAS/RAF通路的突变特征和临床意义 | 10,000多名不同浆细胞疾病患者 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 二代测序,单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | >10,000名患者,其中29名患者进行了单细胞测序 | NA | 单细胞测序,二代测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Exploring the immune landscape and drug prediction of an M2 tumor-associated macrophage-related gene signature in EGFR-negative lung adenocarcinoma
2024-07, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15375
PMID:38886907
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建了M2肿瘤相关巨噬细胞相关基因特征,用于探索EGFR阴性肺腺癌的免疫景观并预测免疫治疗反应 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建M2-TAM相关基因特征,用于EGFR阴性肺腺癌的免疫治疗预测 | 研究基于回顾性数据分析,需要进一步实验验证 | 改善EGFR阴性肺腺癌患者的免疫治疗效果 | EGFR阴性肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Metabolic coordination between skin epithelium and type 17 immunity sustains chronic skin inflammation
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.022
PMID:38772365
|
研究论文 | 本研究揭示了皮肤炎症中上皮细胞与免疫细胞通过代谢协调维持慢性炎症的机制 | 发现HIF1α驱动的糖酵解代谢通路在上皮细胞和γδ T17细胞间建立代谢层级协调,共同维持皮肤炎症 | 研究主要基于小鼠模型和离体人类病变组织,在体人类验证尚需进一步研究 | 探究皮肤炎症疾病中上皮细胞与免疫细胞代谢协调的分子机制 | 银屑病皮肤病变组织、小鼠皮肤炎症模型 | 空间转录组学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,免疫荧光 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | 人类银屑病病变组织和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis
2024-07-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03835-9
PMID:39020442
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示面部浸润性脂肪增多症中FKBP5作为治疗靶点的作用机制 | 首次在单细胞水平解析面部脂肪组织的细胞图谱,发现FIL患者FAP细胞中FKBP5特异性高表达并证实其通过PI3K-AKT通路调控脂肪生成 | 样本量有限,具体PIK3CA变异与FKBP5表达关联的分子机制仍需深入探索 | 探究面部浸润性脂肪增多症的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 面部脂肪组织中的基质血管组分(SVF)和纤维脂肪生成前体细胞(FAPs) | 单细胞生物学 | 面部浸润性脂肪增多症 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FIL患者和非FIL个体的面部脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Decoding cellular plasticity and niche regulation of limbal stem cells during corneal wound healing
2024-07-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03816-y
PMID:38971839
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了角膜缘干细胞在角膜伤口愈合过程中的分子特征和细胞命运 | 首次在单细胞水平定义了LSCs的分子特征,发现了转录因子Creb5在损伤反应中的关键作用,并鉴定出Arg1+巨噬细胞通过分泌OSM促进伤口愈合的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 探索角膜缘干细胞及其微环境细胞在角膜损伤修复中的分子和功能响应机制 | 正常小鼠和角膜上皮缺损模型小鼠的角膜组织 | 单细胞生物学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,基因敲低实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠角膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
B-cell-directed CAR T-cell therapy activates CD8+ cytotoxic CARneg bystander T cells in patients and nonhuman primates
2024-07-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022717
PMID:38558106
|
研究论文 | 本研究首次全面鉴定并分析了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CD8+ CARneg旁观者T细胞的激活机制及其抗白血病作用 | 首次发现CAR T细胞治疗可激活CD8+ CARneg旁观者T细胞,并揭示其通过T细胞受体非依赖性机制杀伤白血病细胞 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探究B细胞靶向CAR T细胞治疗中旁观者T细胞的激活机制及其在抗肿瘤反应中的作用 | 非人灵长类动物和患者来源的T细胞 | 免疫治疗 | B细胞恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非人灵长类模型和临床试验NCT03369353患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2
2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028
PMID:38796708
|
研究论文 | 研究发现PSMP/MSMP通过CCR2促进急性肾损伤,可能成为治疗新靶点 | 首次揭示PSMP在急性肾损伤中的关键作用机制,证明其通过CCR2介导巨噬细胞浸润和M1极化 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究PSMP在急性肾损伤中的作用机制及治疗潜力 | 急性肾损伤患者样本和AKI小鼠模型 | 生物医学研究 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肾组织、尿液和血浆样本,多种AKI小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Validation of an organ mapping antibody panel for cyclical immunofluorescence microscopy on normal human kidneys
2024-Jul-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00426.2023
PMID:38721662
|
研究论文 | 验证用于正常人肾脏循环免疫荧光显微镜检查的器官定位抗体组合 | 开发标准化抗体验证方法,建立可识别18种主要细胞类型和5种细胞外基质区室的器官定位抗体组合,实现无需专业仪器的多重成像 | NA | 解决抗体验证标准化问题,提高人类研究的可重复性 | 正常人肾脏组织 | 数字病理 | NA | 循环免疫荧光显微镜检查 | NA | 图像 | NA | NA | 免疫荧光显微镜,空间转录组学,成像质谱 | NA | 荧光显微镜和数字扫描仪 |
| 70 | 2025-10-06 |
Control of goal-directed and inflexible actions by dorsal striatal melanocortin systems, in coordination with the central nucleus of the amygdala
2024-Jul, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102629
PMID:38763506
|
研究论文 | 本研究揭示了背侧纹状体黑皮质素系统与杏仁核中央核协同调控目标导向行为和刻板行为的作用机制 | 首次发现表达黑皮质素-4受体的多巴胺D1受体纹状体神经元群体,并阐明其在行为灵活性调控中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究背侧纹状体在行为灵活性调控中的神经机制 | 小鼠的背内侧纹状体和背外侧纹状体神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学,行为实验,神经元功能调控 | NA | 基因表达数据,行为数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Wnt Signaling Inhibition Prevents Postnatal Inflammation and Disease Progression in Mouse Congenital Myxomatous Valve Disease
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320388
PMID:38660802
|
研究论文 | 本研究通过抑制Wnt信号通路,探索其在预防小鼠先天性黏液样瓣膜疾病发生和进展中的作用 | 首次发现Wnt信号在黏液样瓣膜疾病早期激活,并证明早期而非晚期抑制Wnt信号可预防疾病发生 | 研究仅使用小鼠模型,Wnt抑制在疾病进展阶段无效 | 阐明Wnt信号在先天性黏液样瓣膜疾病发生发展中的作用机制 | Fbn1C1039G/+马凡综合征模型小鼠的 mitral 瓣膜 | 单细胞转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,组织学评估 | 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 野生型和Fbn1C1039G/+突变型小鼠 mitral 瓣膜 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Salivary Gland Tissue Recombination Can Modify Cell Fate
2024-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241247484
PMID:38715201
|
研究论文 | 通过唾液腺组织重组实验探索间充质在细胞命运决定中的作用 | 首次采用单细胞RNA测序和成像分析对重组组织进行无偏倚分子表征,发现双向诱导现象 | 研究仅限于小鼠胚胎唾液腺,体外重组环境可能无法完全模拟体内条件 | 阐明组织相互作用在细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠胚胎腮腺和颌下腺的上皮与间充质组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,成像分析 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠胚胎唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway
2024-Jul, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31376
PMID:38450771
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和相似性网络分析研究特发性声门下狭窄患者近端气道适应性免疫应答的T细胞受体特征 | 首次在近端气道黏膜中应用GLIPH2算法进行T细胞受体相似性网络分析,揭示了iSGS患者瘢痕组织中低频率克隆共享抗原靶点的现象 | 样本量相对有限(iSGS患者32例,健康对照10例),且为观察性研究 | 探究近端气道黏膜适应性免疫应答中T细胞库的分布特征和抗原靶点 | 特发性声门下狭窄患者和健康对照者的气道黏膜组织 | 免疫学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,相似性网络分析 | GLIPH2算法 | 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据 | 32例iSGS患者,10例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Non-canonical Wnt pathway expression in the developing mouse and human retina
2024-Jul, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109947
PMID:38815793
|
研究论文 | 本研究通过分析小鼠和人类视网膜及视网膜类器官的单细胞RNA测序数据,探索非经典Wnt通路在视网膜发育中的作用 | 首次系统比较了小鼠和人类视网膜发育过程中非经典Wnt通路组分的表达差异,并发现了物种特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证相对有限 | 阐明非经典Wnt通路在视网膜发育和突触形成中的作用 | 小鼠视网膜、人类视网膜、人类视网膜类器官 | 发育生物学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 多个发育时间点的小鼠视网膜、人类视网膜和视网膜类器官scRNAseq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Molecular heterogeneity of quiescent melanocyte stem cells revealed by single-cell RNA-sequencing
2024-07, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13169
PMID:38613320
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示毛囊中静止黑色素干细胞分子异质性 | 首次在单细胞水平鉴定出静止黑色素干细胞新亚群,包括两个具有差异免疫豁免状态的亚群 | 研究仅使用成年雌性C57BL/6J小鼠,样本来源和数量有限 | 解析静止黑色素干细胞转录组景观和分子异质性 | 毛囊静止黑色素干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雌性C57BL/6J小鼠皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes..
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0041
PMID:38900953
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics at the brain-electrode interface in rat motor cortex and the relationship to recording quality
2024-07-31, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ad5936
PMID:38885679
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析大鼠运动皮层中电极植入引起的基因表达变化及其与记录质量的关系 | 首次将空间转录组学应用于脑电极界面研究,识别出与记录质量相关的潜在生物标志物基因 | 研究仅在大鼠模型中进行,样本数量有限,需要进一步验证 | 探究脑部电极植入引起的组织反应及其对设备功能的影响 | 大鼠运动皮层中植入的密歇根式微电极阵列 | 空间转录组学 | 神经植入物相关组织反应 | 空间转录组学,免疫标记,电生理记录 | 回归分析 | 基因表达数据,电生理信号,免疫组织化学图像 | 大鼠脑组织切片,植入后24小时、1周和6周时间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct metabolic "microniches" and close host-symbiont interactions in deep-sea chemosynthetic tubeworm
2024-07-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3053
PMID:39047091
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示深海化能合成管虫体内代谢微环境及其与内共生菌的相互作用机制 | 首次在深海化能合成生态系统中应用原位单细胞固定技术,发现管虫通过控制化学合成气体和代谢物可用性在共生器官中维持两种不同的代谢微环境 | 研究仅针对一种冷泉管虫物种,尚未验证在其他化能合成生态系统中的普适性 | 阐明深海管虫与内共生菌之间的分子相互作用机制 | 冷泉管虫及其硫氧化γ-变形菌内共生体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 冷泉管虫共生器官组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深海原位单细胞固定技术 |
| 79 | 2025-10-06 |
The brain microvasculature is a primary mediator of interferon-α neurotoxicity in human cerebral interferonopathies
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.017
PMID:38878770
|
研究论文 | 本研究揭示大脑微血管是干扰素-α神经毒性的主要介导者,为Aicardi-Goutières综合征提供了新的治疗靶点 | 首次证实大脑是神经毒性IFN-α的主要来源,并确定脑内皮细胞中的IFNAR信号通路是导致脑血管疾病的关键机制 | 动物模型与人类疾病存在差异,需要进一步验证治疗策略的临床适用性 | 探究Aicardi-Goutières综合征中神经毒性IFN-α的来源和作用机制 | Aicardi-Goutières综合征患者和小鼠模型 | 神经科学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 磁共振成像, 单分子ELISA | NA | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质检测数据 | 人类患者和小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Pulmonary osteoclast-like cells in silica induced pulmonary fibrosis
2024-07-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4913
PMID:38985878
|
研究论文 | 本研究探讨了二氧化硅诱导肺纤维化的机制,发现肺内破骨样细胞分化是导致肺损伤的关键因素 | 首次发现二氧化硅暴露可诱导肺泡巨噬细胞和单核细胞分化为肺内破骨样细胞,并证实抗RANKL抗体治疗可抑制此过程并减轻肺纤维化 | 研究样本量有限,机制研究主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索矽肺发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 职业性二氧化硅暴露患者的肺组织样本和矽肺小鼠模型 | 病理生理学 | 矽肺 | 单细胞RNA测序,组织学分析,生化检测,生理功能评估 | NA | 基因表达数据,组织图像,生化指标,生理参数 | 人类职业暴露患者肺样本和纵向小鼠矽肺模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 全肺单细胞RNA测序 |