单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
501	2024-08-05	Single-cell analyzing of tumor microenvironment and cell adhesion between early and late-stage lung cancer 2024-Jul, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2024.04.013 PMID:38696904	研究论文	本研究探讨了早期和晚期肺腺癌肿瘤微环境及细胞粘附的单细胞分析	提出了TNS1作为早期肺腺癌细胞免疫微环境中的粘附分子，并且可能成为新的预后标志物	对调控早期与晚期肺腺癌肿瘤迁移进展的具体因素的理解仍然不完全	研究肺腺癌中早期与晚期阶段细胞粘附和肿瘤微环境的差异	肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	非负矩阵分解	基因表达数据	来自GEO数据库的LUAD样本
502	2024-08-04	Single-cell transcriptomics reveals the aggressive landscape of high-grade serous carcinoma and therapeutic targets in tumor microenvironment 2024-Jul-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216928 PMID:38714290	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示了高等级浆液性癌瘤的侵袭性特征和肿瘤微环境中的治疗靶点	首次识别出与预后不良相关的S100A9肿瘤细胞亚型，并验证了其标记基因对卵巢癌生长和侵袭的抑制作用	缺乏长期随访数据来评估治疗靶点在临床应用中的有效性	探索高等级浆液性癌瘤的侵袭机制并寻找新的治疗靶点	34例高等级浆液性癌瘤患者的肿瘤样本及其转移部位的109,573个细胞	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	体内和体外模型	细胞数据	34个肿瘤样本
503	2024-08-05	Preoperative neoadjuvant targeted therapy remodels intra-tumoral heterogeneity of clear-cell renal cell carcinoma and ferroptosis inhibition induces resistance progression 2024-Jul-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216963 PMID:38768682	研究论文	本研究探讨了术前新辅助靶向治疗如何重塑透明细胞肾癌中的肿瘤内异质性，并且铁死亡抑制导致耐药进展	首次在整个新辅助管理中描述了肿瘤内异质性，并鉴定了铁死亡作为恶性细胞耐药的关键生物程序	研究局限于多中心队列样本，可能影响结果的普适性	探索新辅助治疗耐药的关键机制	透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤样本及其耐药细胞系	数字病理学	肾癌	单细胞RNA测序	细胞系模型	肿瘤组织样本	多个中心的临床试验样本，包括TCGA, ICGC, Checkmate-025和IMmotion151
504	2024-08-05	Microglial sex differences in innate high anxiety and modulatory effects of minocycline 2024-Jul, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.03.035 PMID:38552926	研究论文	研究了微胶质细胞在先天性高焦虑小鼠中性别差异以及美诺环素的调节作用	首次揭示了先天高焦虑小鼠中性别在微胶质细胞功能和表达上的显著差异	主要集中于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况	分析微胶质细胞在性别差异影响下对先天高焦虑行为的作用	先天高焦虑（HAB）与正常焦虑（NAB）小鼠模型的微胶质细胞	神经科学	焦虑障碍	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	包含不同性别的先天高焦虑和正常焦虑小鼠
505	2024-08-05	Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine 2024-Jul-01, Current opinion in urology IF:2.1Q2 DOI:10.1097/MOU.0000000000001177 PMID:38602053	review	该综述重点介绍了膀胱癌患者的新靶点、进展和治疗方法	结合抗体药物偶联物（ADC）与免疫疗法的成功被视为膀胱癌治疗的重大突破，并探讨了其他ADC作为治疗选项的兴趣	该文献没有明确提及局限性	旨在阐明膀胱癌的治疗靶点，以改善患者特异性的护理和治疗结果	膀胱癌患者及其治疗相关的新靶点和方法	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
506	2024-08-05	Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer 2024-Jul-01, Current opinion in urology IF:2.1Q2 DOI:10.1097/MOU.0000000000001183 PMID:38650456	review	这篇综述总结了单细胞和空间组学在理解膀胱癌生物学中的最新进展	介绍了单细胞RNA测序和空间组学技术在肿瘤微环境、膀胱癌异质性、癌症干性和细胞可塑性方面的创新应用	在将研究结果转化为临床实践和实施个体化治疗策略方面仍存在挑战	探讨单细胞和空间组学在膀胱癌中的应用及其对新治疗策略发展的影响	研究膀胱癌中肿瘤微环境和细胞异质性	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序和空间组学技术	NA	NA	NA
507	2024-08-05	The dysfunction of CD8+ T cells triggered by endometriotic stromal cells promotes the immune survival of endometriosis 2024-Jul, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.13786 PMID:38544333	研究论文	本研究揭示了内异症中CD8 T细胞的功能障碍及其对内异症免疫生存的影响	研究揭示了内异症中CD8 T细胞的细胞异质性和功能障碍，以及其与内膜基质细胞之间的相互作用	样本量较小，仅涉及三名卵巢内异症患者	探讨内异症中CD8 T细胞的作用及其相关机制	内异症患者的细胞样本，特别是CD8 T细胞和内膜基质细胞	数字病理学	内异症	单细胞RNA测序	裸鼠模型	细胞样本	三名卵巢内异症患者的细胞样本
508	2024-08-05	Single-cell transcriptome landscape elucidates the cellular and developmental responses to tomato chlorosis virus infection in tomato leaf 2024-Jul, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.14906 PMID:38619176	研究论文	该研究揭示了病毒感染对番茄叶片细胞和发育的反应。	首次利用单细胞RNA测序分析病毒感染阶段的细胞类型特异性表达和表观遗传特征。	未探讨不同环境条件下病毒感染对细胞响应的影响。	研究植物细胞在病毒感染下的发育和响应机制。	健康和番茄黄化病毒感染的番茄叶片中的23226个单个细胞。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	23226个单个细胞
509	2024-08-04	Lapagyl mitigates UV-induced inflammation and immunosuppression via Foxp3+ Tregs and CCL pathway: A single-cell transcriptomics study 2024-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.155679 PMID:38701542	研究论文	本研究评估了草本产品Lapagyl对紫外辐射引起的皮肤老化的疗效	揭示了Lapagyl通过调节Foxp3+ Tregs和CCL通路减轻皮肤炎症和免疫抑制的机制	模型建立在SKH-1无毛小鼠上，结果能否推广到人类尚需进一步验证	评估Lapagyl在对抗紫外辐射引起的皮肤老化中的有效性	研究对象为使用紫外辐射模型的SKH-1无毛小鼠	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	组织样本	SKH-1无毛小鼠
510	2024-08-05	New tools to study renal fibrogenesis 2024-07-01, Current opinion in nephrology and hypertension IF:2.2Q2 DOI:10.1097/MNH.0000000000000988 PMID:38587103	综述	这篇综述强调了单细胞和空间多组学技术在肾脏纤维化研究中的快速进展	介绍了新型单细胞和空间多组学工具，以探索人类肾脏纤维化发展的研究问题	需要仔细设计和优化多组学实验以回答与细胞谱系、可塑性和细胞间通信相关的问题	探讨肾脏纤维化的病理机制和细胞动态	健康人类肾脏细胞及慢性肾病患者样本	数字病理学	慢性肾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞	健康人类肾脏和慢性肾病患者样本对比
511	2024-08-07	Alveolar macrophage-CD8 T cell interactions after acute lung allograft dysfunction: Insights from single-cell RNA sequencing 2024-Jul, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation DOI:10.1016/j.healun.2024.03.003 PMID:38490571	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
512	2024-08-04	Buyang Huanwu decoction promotes angiogenesis after cerebral ischemia through modulating caveolin-1-mediated exosome MALAT1/YAP1/HIF-1α axis 2024-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.155609 PMID:38677273	研究论文	本文探讨了补阳还五汤通过调节腔蛋白1介导的外泌体MALAT1/YAP1/HIF-1α通路来促进脑缺血后的血管生成	研究首次通过单细胞测序及基因敲除小鼠系统性验证BHD在脑缺血治疗中的作用机制	尚未充分探索BHD在临床应用中的长期效果	研究补阳还五汤促进脑缺血后血管生成的机制	使用中膜动脉阻塞模型的小鼠对BHD的作用进行评估	数字病理学	脑缺血	单细胞测序	基因敲除小鼠	生物样本数据	多个剂量的BHD处理的小鼠组
513	2024-08-04	Peripheral nervous system lymphatic vessels: A simple delivery route to promote nerve regeneration 2024-Jul, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114783 PMID:38688418	研究论文	本文阐明了周围神经系统淋巴血管的存在及其在神经再生中的作用	首次证明了外围神经中的淋巴血管在促进神经再生中的独特运输能力	研究主要集中在动物模型上，缺乏临床人类样本的验证	探讨周围神经系统淋巴血管在神经再生中的作用及其输送能力	使用大鼠、PROX1-EGFP转基因小鼠和人类的周围神经样本	数字病理学	周围神经损伤	单细胞测序	NA	组织样本	使用了大鼠和转基因小鼠的样本
514	2024-08-04	Pan-cancer analysis of super-enhancer-induced LINC00862 and validation as a SIRT1-promoting factor in cervical cancer and gastric cancer 2024-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101982 PMID:38718436	研究论文	本研究探讨了LINC00862在多癌症中的生物学意义及其在宫颈癌和胃癌中的作用	揭示了LINC00862在宫颈癌和胃癌中的致癌机制，并验证了其作为生物标志物的潜力	未具体列出LINC00862在其他类型癌症中的作用及有效性	研究LINC00862在不同癌症中的表达及其与免疫疗法的关系	主要研究肿瘤和基质细胞中的LINC00862表达及其调控机制	数字病理学	宫颈癌与胃癌	染色质免疫沉淀和RNA免疫沉淀等	NA	生物信息学数据和单细胞测序数据	涉及大多数肿瘤和基质细胞的表达分析
515	2024-08-04	Dysregulation of peripheral and intratumoral KLRG1+ CD8+T cells is associated with immune evasion in patients with non-small-cell lung cancer 2024-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101968 PMID:38713923	研究论文	本研究探讨了KLRG1+ CD8+ T细胞在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中的免疫逃避中的作用	本研究首次揭示KLRG1+ CD8+ T细胞与NSCLC肿瘤免疫逃避的关联性，并提出KLRG1作为潜在的免疫治疗靶点	研究中可能缺乏大规模样本数据来验证KLRG1的预后价值	研究KLRG1在非小细胞肺癌患者中的免疫调节作用	非小细胞肺癌患者的外周血和肿瘤组织中的KLRG1+ CD8+ T细胞	数字病理学	非小细胞肺癌	流式细胞术，单细胞RNA测序	NA	基因表达数据，细胞单一测序数据	NSCLC患者与健康供体、良性肺结节患者的对比样本
516	2024-08-05	Differential role of glucocorticoid receptor based on its cell type specific expression on tumor cells and infiltrating lymphocytes 2024-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101957 PMID:38643748	研究论文	本研究探讨了糖皮质激素受体在肿瘤细胞和浸润淋巴细胞中特殊细胞类型表达的差异性作用	发展了一个与雌激素受体状态无关的糖皮质激素受体标志（GRsig），并评估其在不同乳腺癌亚型中的独立预后能力	未提及具体的实验设计或模型限制	研究糖皮质激素受体在乳腺癌不同细胞类型中的表达及其预后意义	乳腺癌肿瘤上皮细胞和浸润淋巴细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序、免疫组化	NA	基因表达数据	独立乳腺癌队列的样本数量未具体提及
517	2024-08-05	MAPKAP1 orchestrates macrophage polarization and lipid metabolism in fatty liver-enhanced colorectal cancer 2024-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101941 PMID:38692197	研究论文	本研究探讨了脂肪肝在大肠癌进展中的机械作用，重点关注巨噬细胞极化和脂质代谢。	发现MAPKAP1是通过M2巨噬细胞极化和脂质代谢重编程促进大肠癌的重要基因。	研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的复杂性。	研究脂肪肝如何影响大肠癌的进展，特别是在巨噬细胞极化和脂质代谢方面。	使用小鼠脂肪肝模型以及大肠癌特异性基因MAPKAP1进行研究。	数字病理学	大肠癌	单细胞转录组测序 (scRNA-seq)	NA	NA	小鼠模型，样本数量未具体说明
518	2024-08-04	NKX2‑1 copy number alterations are associated with oncogenic, immunological and prognostic remodeling in non‑small cell lung cancer 2024-Jul, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2024.14436 PMID:38774453	研究论文	本研究探讨了NKX2-1拷贝数变化与非小细胞肺癌的肿瘤特征及其临床意义的关系	揭示了NKX2-1拷贝数变化对非小细胞肺癌肿瘤的击打特征和预后影响，首次将其与EGFR和PD-L1状态相结合进行分析	样本主要来自菲律宾的患者，可能限制了结果的普遍性	研究NKX2-1拷贝数变化在非小细胞肺癌中的作用及其临床意义	招募了45名菲律宾患者的肿瘤样本进行分析	数字病理学	肺癌	免疫组织化学和PCR	NA	肿瘤样本数据	共分析了1,130个肺腺癌和鳞状细胞癌的样本，以及1,654个单细胞RNA测序数据
519	2024-08-04	Evaluation of novel promoters for vascular tissue-specific gene expression in Populus 2024-Jul, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112083 PMID:38588982	研究论文	该研究评估了用于水分组织特异性基因表达的新型启动子	首次识别了三种特定于水分组织的基因并克隆了其启动子，促进了森林树木的精准育种	研究只集中于三种特定基因的启动子，未涉猎其他可能影响基因表达的因素	开发针对森林树木的特定启动子以实现精准设计和育种	三种在杨树中水分组织特异性表达的基因	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	涉及'84K'杨树的三个基因启动子
520	2024-08-05	Integration analysis of cell division cycle-associated family genes revealed potential mechanisms of gliomagenesis and constructed an artificial intelligence-driven prognostic signature 2024-Jul, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111168 PMID:38599441	研究论文	本研究揭示了CDCA基因家族在胶质瘤中的潜在机制并构建了人工智能驱动的预后标志。	本研究首次系统分析了CDCA基因家族在胶质瘤中的作用，并基于机器学习构建了新的预后评分系统。	本研究未深入探讨CDCA基因家族的所有成员在不同类型胶质瘤中的具体机制。	阐明CDCA基因家族在胶质瘤中的功能及其在预后中的作用。	包括八个胶质瘤队列的病人样本。	数字病理	胶质瘤	多组学数据分析，单细胞RNA测序，空间转录组测序	机器学习	生物信息数据，组织样本	八个胶质瘤队列的样本