单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer and scRNA-seq analyses identify a prognostic coagulation-related gene signature associated with tumor microenvironment in lower-grade glioma
2024-Jul-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01114-w
PMID:38955935
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研究论文 | 该文章通过整合泛癌症和单细胞RNA测序分析，识别出与下级别胶质瘤肿瘤微环境相关的预后凝血相关基因特征 | 本研究创新性地结合了临床特征与基因表达分析，提出了用于下级别胶质瘤预后的凝血相关基因签名 | 研究主要集中在特定癌症类型，对其他癌症类型的适用性尚需进一步验证 | 探讨凝血路径与下级别胶质瘤患者预后的关系 | 本研究聚焦于下级别胶质瘤及其他癌症类型的患者 | 数字病理 | NA | 单样本基因集富集分析（ssGSEA），LASSO回归，CIBERSORT，单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 442 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic profiling unveils insights into ovarian fibrosis in obese mice
2024-Jul-02, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00496-9
PMID:38956667
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研究论文 | 本研究建立了肥胖小鼠模型以探讨肥胖对卵巢微环境的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术构建了肥胖小鼠卵巢组织的单细胞图谱，揭示了功能失衡的细胞亚群和其相互作用 | 研究只在小鼠模型中进行，尚需在人类身上验证 | 探讨肥胖如何影响卵巢微环境及其与生育健康的关系 | 肥胖小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 18周饲喂的成年雌性小鼠 |
| 443 | 2024-08-05 |
Identification of unique cell type responses in pancreatic islets to stress
2024-Jul-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49724-w
PMID:38956087
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研究论文 | 该文章分析了胰岛细胞对糖尿病相关压力的特定反应 | 通过多重单细胞RNA测序，定义了暴露于内质网和炎症压力的原代人胰岛细胞的转录特征 | 未提及具体的样本数量和来源 | 更好地表征细胞类型特异性的压力反应 | 主要研究原代人胰岛细胞在不同糖尿病相关压力下的基因表达变化 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 444 | 2024-08-04 |
Building and analyzing metacells in single-cell genomics data
2024-Jul, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00045-6
PMID:38811801
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评论 | 本文回顾了单细胞基因组学数据中元细胞的构建和分析方法 | 介绍了元细胞的概念及其在简化单细胞基因组学数据中的应用 | 未具体提到元细胞的局限性 | 探讨如何利用元细胞分析单细胞基因组学数据 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 445 | 2024-08-04 |
Mapping the complexity and diversity of tertiary lymphoid structures in primary and peritoneal metastatic gastric cancer
2024-Jul-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009243
PMID:38955417
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研究论文 | 本文探讨了原发性胃癌和腹膜转移性胃癌中三级淋巴结构的复杂性和多样性。 | 该研究揭示了胃癌中三级淋巴结构的细胞组成和成熟状态在不同肿瘤位置和免疫环境中的显著差异。 | 该研究未讨论长时间随访的影响，可能无法全面捕捉TLS的动态变化。 | 研究三级淋巴结构对胃癌抗肿瘤免疫及预后的影响。 | 分析胃癌原发肿瘤及腹膜转移样本中的免疫细胞组成和功能。 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学和免疫组化 | NA | 组织样本 | 使用了来自胃癌原发肿瘤和腹膜转移的存档切除标本 |
| 446 | 2024-08-04 |
Heterogeneous pseudobulk simulation enables realistic benchmarking of cell-type deconvolution methods
2024-07-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03292-w
PMID:38956606
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研究论文 | 该文章展示了一种异质性伪混合物模拟方法，以改进细胞类型去卷积方法的基准评估 | 提出了一种异质性模拟策略，以创建更具生物学变异的合成混合样本，从而增强基准测试的可靠性 | 标准方法使用随机选取的单细胞，未考虑细胞间的内在差异，导致合成混合物缺乏适当的生物学变异 | 旨在改进和评估细胞类型去卷积方法的基准测试 | 研究对象为不同去卷积方法在多个数据集上的表现 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 回归方法 | 数据集 | 八个不同的数据集 |
| 447 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome dissecting the microenvironment remodeled by PD1 blockade combined with photodynamic therapy in a mouse model of oral carcinogenesis
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.636
PMID:38962427
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研究论文 | 本研究揭示了PD1阻断联合光动力疗法在小鼠口腔癌发生模型中重塑微环境的效果 | 创新之处在于通过单细胞转录组测序揭示了口腔癌进展过程中微环境的失调，并提出了一种新的治疗策略 | 本研究的局限性在于模型仅使用小鼠，未在临床中进行验证 | 探讨有效的策略以阻止口腔潜在恶性疾病向口腔鳞状细胞癌的进展 | 建立小鼠口腔癌发生模型，研究PD1阻断与光动力疗法的联合效果 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 448 | 2024-08-05 |
LSD1/KDM1A and GFI1B repress endothelial fate and induce hematopoietic fate in induced pluripotent stem cell-derived hemogenic endotheliums
2024-Jul-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285214
PMID:38961746
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子GFI1B及其共因子LSD1/KDM1A在胚胎内皮转化过程中的作用 | 揭示了LSD1/KDM1A和GFI1B在不同细胞亚群中的时间点功能对血液生成的影响 | 未能在未分化的HE细胞中检测到GFI1B的表达 | 理解诱导多能干细胞转化为血液生成细胞的机制 | 使用患者来源的iPSC线和健康的iPSC线进行对比研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多条患者来源的iPSC线和健康iPSC线 |
| 449 | 2024-08-04 |
Spatial Dissection of the Immune Landscape of Solid Tumors to Advance Precision Medicine
2024-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0699
PMID:38657223
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综述 | 本论文概述了在实体肿瘤中空间免疫景观的分析方法，以促进精准医疗。 | 介绍了空间转录组学和蛋白质组学的最新进展及其在肿瘤免疫细胞组成分析中的应用 | 未提及具体的研究限制 | 深入了解实体肿瘤的异质性免疫景观，以改善预后和治疗反应预测 | 重点研究实体肿瘤中的免疫细胞成分及其在肿瘤微环境中的角色 | 数字病理学 | 固体恶性肿瘤 | 空间多组学技术 | NA | RNA和蛋白质数据 | NA |
| 450 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing: Technological Progress and Biomedical Application in Cancer Research
2024-Jul, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00777-0
PMID:37322261
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其在癌症研究中的应用 | 强调了scRNA-seq在肿瘤异质性分析和个性化医学中的潜在应用 | 未提及具体的技术局限性 | 探讨单细胞RNA测序在癌症研究中的应用和技术进展 | 单细胞RNA测序技术及其对癌症和疾病的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 451 | 2024-08-04 |
Comprehensive investigation of malignant epithelial cell-related genes in clear cell renal cell carcinoma: development of a prognostic signature and exploration of tumor microenvironment interactions
2024-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05426-x
PMID:38951896
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研究论文 | 本文全面研究了透明细胞肾细胞癌中的恶性上皮细胞相关基因及其临床相关性 | 建立了一个预后模型MECRGS，并在多个队列中显示出优越的预测性能 | 未提及具体的样本来源和大小 | 探讨恶性上皮细胞相关基因在透明细胞肾细胞癌中的功能和临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌中的219个恶性上皮细胞相关基因 | 数字病理 | 肾癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | NA |
| 452 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of Crohn's disease: Unveiling heterogeneity and evaluating ustekinumab outcomes
2024-Jul, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3715
PMID:38962887
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序揭示克罗恩病的细胞复杂性，识别关键细胞群体及其转录组特征 | 揭示了克罗恩病中八种不同细胞类型及其重要的成纤维细胞和T细胞相互作用，为疾病机制和治疗靶点提供了新见解 | 未提及具体的样本大小和长期疗效评估 | 探究克罗恩病的细胞组成及其与健康对照的差异 | 克罗恩病患者与健康对照者的细胞组成 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 453 | 2024-08-05 |
Exploring the role of CD8+ T cells in clear renal cell carcinoma metastasis
2024-Jul, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13819
PMID:38872260
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研究论文 | 本研究探讨了CD8+ T细胞在透明细胞肾细胞癌转移中的作用 | 首次将CD8 T细胞根据其基因特征分类为四个亚群，并发现其与预后差相关 | 缺乏临床样本的直接验证 | 揭示透明细胞肾细胞癌转移中CD8 T细胞的功能和特征 | 透明细胞肾细胞癌中的CD8 T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 454 | 2024-08-05 |
Combining single-cell and bulk RNA sequencing, NK cell marker genes reveal a prognostic and immune status in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-07-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65917-1
PMID:38951569
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研究论文 | 该研究探讨了NK细胞标记基因与胰腺导管腺癌患者的预后和免疫反应之间的关系 | 本研究首次通过构建NK细胞标记基因的签名预测胰腺癌患者的预后，并与免疫状态显示了强相关性 | 本研究的局限性在于样本主要依赖于公开数据库，可能存在选择偏倚 | 研究NK细胞在胰腺导管腺癌中的作用及其对患者预后的影响 | 研究胰腺导管腺癌患者中的NK细胞标记基因及其相关性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和RNA测序 | Cox分析 | 基因表达数据 | 纳入7个NK细胞标记基因，验证了6个GEO数据集的预测能力 |
| 455 | 2024-08-04 |
SLC16A3 is a Prognostic Marker and Affects Immune Regulation in Bladder Cancer
2024-Jul-02, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究探讨了SLC16A3在膀胱癌中的表达及其预后标志物功能。 | 首次系统分析SLC16A3在膀胱癌中的作用及其与免疫调节的关系。 | 研究内容主要基于公共数据库，可能存在样本选择偏倚。 | 探讨SLC16A3在膀胱癌中的预后和免疫调节作用。 | 412名膀胱癌患者及3115个膀胱癌细胞样本。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序、逆转录定量聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据、细胞样本 | 412名膀胱癌患者和3115个膀胱癌细胞样本 |
| 456 | 2024-08-04 |
Spatial heterogeneity and functional zonation of living tissues and organs in situ
2024-Jul-02, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvae049
PMID:38953373
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研究论文 | 介绍了活体组织和器官内的空间异质性和功能分区 | 利用最新的成像和转录组技术，揭示了器官内的分区及其生理作用 | 传统分析方法难以详细调查这些分区 | 深入理解器官中免疫系统的空间差异 | 各个器官的不同区域及其免疫系统 | 数字病理学 | NA | 活体成像、空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing in exploring the pathogenesis of diabetic retinopathy
2024-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1751
PMID:38946005
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综述 | 本综述总结了单细胞RNA测序在探索糖尿病视网膜病变病因中的应用 | 强调了通过单细胞RNA测序识别差异表达基因、关键细胞亚群体和复杂细胞间相互作用的创新点 | 缺乏对糖尿病视网膜病变的全面理解，尤其是涉及到的细胞多样性和分子异质性 | 研究糖尿病视网膜病变的发病机制 | 包括糖尿病视网膜病变患者、非人灵长类动物和小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 包括糖尿病视网膜病变患者及多个模型的研究 |
| 458 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptional atlas of human adenomyosis deciphered by the integration of single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics
2024-Jul-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae012
PMID:38486356
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研究论文 | 本研究揭示了人类腺肌症的转录组特征，整合了单细胞RNA测序和空间转录组学 | 首次识别腺肌症病灶中的独特上皮和侵袭性基质亚群体，支持病因学中的‘内陷’与‘化生’理论的复杂相互作用 | 对腺肌症的研究仍处于起步阶段，相关理论存在争议 | 揭示腺肌症的转录组变化，为准确诊断与治疗策略的发展提供基础 | 研究了正常内膜、病灶及内膜-肌层交界处的转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 459 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the correlation of aggrephagy signaling and multiple myeloma immune microenvironment composition
2024-Jul, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3712
PMID:38949072
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研究论文 | 本研究揭示了聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境成分之间的相关性 | 首次揭示了聚合自噬在多发性骨髓瘤中的作用以及其与免疫微环境和疾病预后的关系 | 尚未全面证明聚合自噬在多发性骨髓瘤中的所有作用 | 研究聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境的相关性及其对疾病预后的影响 | 包含来自七个多发性骨髓瘤骨髓样本和七个健康骨髓样本的12,187个单细胞的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12,187个单细胞样本 |
| 460 | 2024-08-05 |
Activated Clec4nhi Neutrophils Aggravate Lung Injury in an Endothelial IGFBP7-Dependent Manner
2024-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0017OC
PMID:38574235
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞亚型在急性肺损伤中的作用，尤其是IGFBP7在调节炎症反应和屏障功能中的影响 | 揭示了IGFBP7在不同类型内皮细胞中的差异表达及其在急性肺损伤中引发的炎症和屏障功能障碍 | 具体亚型的内皮细胞在临床上的作用仍需进一步研究 | 研究IGFBP7在急性肺损伤中的角色及其潜在的治疗靶点 | 急性肺损伤模型中的内皮细胞和炎症细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 用脂多糖建立的急性肺损伤模型小鼠 |