单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 505 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-05 |
Generating Neuroimmune Assembloids Using Human Induced Pluripotent Stem Cell (iPSC)-Derived Cortical Organoids and Microglia
2024-Jul-09, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2024_554
PMID:38976205
|
研究论文 | 本研究提出了一种新方法，通过人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的皮层类器官和小胶质细胞生成神经免疫组合体 | 创新点在于将小胶质细胞整合到皮层类器官模型中，以反映神经免疫交互作用 | 研究中没有提及样本的广泛性或不同类型的小胶质细胞对结果的影响 | 研究旨在开发一种能够更好地模拟神经发育和神经疾病中神经细胞与免疫细胞相互作用的体外模型 | 研究对象为人诱导多能干细胞衍生的皮层类器官和小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-08-04 |
Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells
2024-Jul-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae030
PMID:38655770
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研究论文 | 本研究首次揭示了循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化和在生理过程中的作用 | 首次对循环髓系细胞的研究价值进行了系统分析，并确定了其特定类型的亚群 | 本研究的具体样本大小和实验条件未详细说明 | 研究循环髓系细胞在生理和病理过程中的起源和功能 | 循环髓系细胞，特别是亚群a的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | NA |
| 423 | 2024-08-04 |
Establishment of an ovarian cancer exhausted CD8+T cells-related genes model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jul-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01948-8
PMID:38970067
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研究论文 | 建立了一种与卵巢癌耗竭CD8+T细胞相关的基因模型 | 首次识别了与耗竭的CD8+T细胞相关的基因，并提出了其在卵巢癌中的预后意义 | 模型的临床适用性需要在更多样本上进行进一步验证 | 识别与卵巢癌中耗竭CD8+T细胞相关的基因及其预后意义 | 卵巢癌患者的肿瘤样本及相关基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的大样本 |
| 424 | 2024-08-05 |
Deciphering lineage specification during early embryogenesis in mouse gastruloids using multilayered proteomics
2024-Jul-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.017
PMID:38754429
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研究论文 | 本研究利用多层质谱技术研究了小鼠胃胚体早期发育中的蛋白质表达动态 | 首次使用多层质谱技术对小鼠胃胚体发育中的蛋白质进行全面分析，发现了各个胚层特有的时间性表达模式 | 缺乏对早期哺乳动物胚胎发育的蛋白质组学研究，现有研究较为稀缺 | 探讨小鼠胃胚体发育过程中胚层特异性蛋白质的表达和功能 | 小鼠胃胚体和发育过程中相关的蛋白质 | 数字病理学 | NA | 质谱 | NA | 蛋白质组数据 | 研究涉及的小鼠胃胚体样本数量NA |
| 425 | 2024-08-07 |
Author Correction: The shaky foundations of simulating single-cell RNA sequencing data
2024-Jul-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03329-0
PMID:38970115
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2024-08-05 |
Harnessing Single-Cell Technologies in the Search for New Therapies for Diamond-Blackfan Anemia Syndrome
2024-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104235
PMID:38740323
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综述 | 本文讨论了单细胞技术在钻石-黑凡贫血综合症(DBA)新疗法研究中的应用。 | 该文章创新性地探索了单细胞研究对理解DBA病理机制及新疗法开发的启示。 | 本文主要为综述，具体的实验数据和结果较为有限。 | 研究DBA的病理机制及其新疗法的潜在开发。 | 钻石-黑凡贫血综合症及其相关的单细胞技术研究。 | 数字病理学 | 其他血液疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 克隆细胞培养测定 | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-04 |
A single-cell transcriptomic study of heterogeneity in human embryonic tanycytes
2024-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66044-7
PMID:38965316
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研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎tanycytes的异质性 | 首次利用单细胞转录组数据分析人类胚胎tanycytes的群体和基因调控网络 | 人类tanycytes的研究仍相对有限，可能影响对其生物学功能的全面理解 | 研究人类胚胎tanycytes的异质性及其在能量平衡中的作用 | 人类胚胎tanycytes | 数字病理学 | 肥胖与糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 428 | 2024-08-05 |
Differences in microenvironment of lung cancer and pleural effusions by single-cell RNA sequencing
2024-Jul, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2024.107847
PMID:38889499
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序比较肺癌和胸腔积液的微环境 | 该研究首次对相同患者的肺癌活检和胸腔积液进行直接比较，揭示了微环境的显著差异 | 样本量较小，仅研究了十名患者，结果的普遍适用性可能受到限制 | 研究肺癌微环境及其与胸腔积液微环境的比较 | 十名肺癌患者的匹配活检和胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 10名患者的匹配样本 |
| 429 | 2024-08-05 |
SingmiR: a single-cell miRNA alignment and analysis tool
2024-Jul-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae225
PMID:38572750
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研究论文 | 本研究介绍了SingmiR工具，通过提供针对单细胞miRNA-seq数据的快速处理与定量分析。 | SingmiR是首个专为单细胞miRNA-seq数据设计的网络服务器，具有自解释界面并提供全面的分析功能 | 目前尚无针对大规模单细胞miRNA-seq数据的扩展验证 | 本研究旨在加速生物学家开发单细胞miRNA-seq协议的原型流程 | 研究对象为人类的非编码单细胞样本中的miRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 小到中等规模的数据集 |
| 430 | 2024-08-05 |
Multiplexed imaging to reveal tissue dendritic cell spatial localisation and function
2024-Jul-05, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14962
PMID:38969618
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综述 | 本文简要概述了多重成像技术在识别树突状细胞及其组织特异性功能中的应用 | 提出了多重成像技术作为一种新方法来理解树突状细胞的空间定位和功能 | 未提及具体的实验数据或案例分析 | 理解树突状细胞在组织中的空间组织和细胞间相互作用 | 树突状细胞及其在组织特异性中的功能 | 数字病理学 | NA | 多重成像技术 | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-08-04 |
Growth hormone promotes myelin repair after chronic hypoxia via triggering pericyte-dependent angiogenesis
2024-Jul-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.026
PMID:38653248
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研究论文 | 这篇文章探讨了生长激素在慢性缺氧后促进髓鞘修复的机制。 | 该研究首次展示了生长激素通过触发周细胞依赖的血管生成来改善白质损伤。 | 该研究未提供对人类疾病的直接临床相关性 | 研究生长激素在缺氧导致的白质损伤中的作用及其机制 | 以缺氧新生小鼠为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 小鼠模型 | 新生小鼠及其后代 |
| 432 | 2024-08-04 |
Integrating single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics to elucidate a specialized subpopulation of astrocytes, microglia and vascular cells in brains of mouse model of lipopolysaccharide-induced sepsis-associated encephalopathy
2024-Jul-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03161-0
PMID:38961424
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研究论文 | 本研究揭示了在脂多糖诱导的败血症相关脑病小鼠模型中，特定星形胶质细胞、微胶质细胞和血管细胞的亚群体及其相互作用。 | 结合使用单核RNA测序和空间转录组学，确认了Astro-2、Micro-2与Vas-1细胞之间的独特共定位关系，并发现其相关的配体-受体上调。 | 研究未能观察到Anxa1-/-和野生型小鼠在其他脑细胞类型、数量或分布上的显著差异。 | 揭示败血症相关脑病的细胞和分子机制。 | 使用脂多糖注射建立小鼠模型，分析不同时间点的脑组织。 | 数字病理学 | 败血症相关脑病 | 单核RNA测序(snRNA-seq)和立体测序(Stereo-seq) | 小鼠模型 | 脑组织 | 野生型小鼠和Anxa1-/-小鼠 |
| 433 | 2024-08-05 |
ezSingleCell: an integrated one-stop single-cell and spatial omics analysis platform for bench scientists
2024-Jul-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48188-2
PMID:38961061
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研究论文 | ezSingleCell是一个互动且易于使用的应用程序，用于分析各种单细胞和空间组学数据类型 | 结合了公开可用的最佳方法进行深入数据分析、整合和交互式数据可视化 | NA | 提供一个便捷的平台供科研人员分析单细胞和空间组学数据 | 单细胞和空间组学数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 3000个细胞的标准scRNA-seq数据集 |
| 434 | 2024-08-04 |
Harnessing spatial transcriptomics for advancing plant regeneration research
2024-Jul, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.02.004
PMID:38418271
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究番茄愈伤组织中不同细胞的分子特征 | 本研究展示了空间转录组学在植物生物学中推进植物再生研究的潜力 | NA | 探讨植物再生中的分子机制 | 番茄愈伤组织中的不同类型细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-08-04 |
10× single-cell sequencing revealed cellular composition heterogeneity in cardiac myxoma with malignant glandular properties
2024-07, Microvascular research
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.mvr.2024.104697
PMID:38801942
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研究论文 | 本研究揭示了心脏粘液瘤的细胞组成异质性及其恶性腺体特性 | 首次通过10×单细胞测序分析心脏粘液瘤的细胞成分及其基因表达 | 样本数量有限，仅来源于4例手术切除的心脏粘液瘤 | 探究心脏粘液瘤细胞成分及其基因表达在肿瘤发展中的作用 | 4例手术切除的心脏粘液瘤样本，包含1例腺体粘液瘤和3例非腺体粘液瘤 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 10×单细胞测序 | NA | 活细胞 | 4例心脏粘液瘤样本 |
| 436 | 2024-08-05 |
What Single Cell RNA Sequencing Has Taught Us about Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Jul, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2024.0001
PMID:38369875
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评论 | 本文概述了单细胞RNA测序技术及其在慢性阻塞性肺病中的应用和所得教训 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示慢性阻塞性肺病的细胞和分子网络 | 缺乏对慢性阻塞性肺病的病理生物学的深入理解和指导治疗的生物标志物稀缺 | 探讨慢性阻塞性肺病的分子机制和细胞网络以支持治疗发现 | 研究慢性阻塞性肺病（COPD）中的细胞和分子网络 | 数字病理学 | COPD | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-08-04 |
Identification of intracellular bacteria from multiple single-cell RNA-seq platforms using CSI-Microbes
2024-Jul-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7402
PMID:38959321
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研究论文 | 本文研究了使用CSI-Microbes从单细胞RNA测序数据中识别微生物的管道 | 首次系统评估了多种单细胞RNA测序技术在恢复微生物唯一分子标识符的有效性 | 未提供关于样本多样性或外部验证的数据 | 开发计算管道以识别和分析肿瘤微生物组中的微生物 | 主要分析食管癌和结直肠癌患者的样本 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 食管癌和结直肠癌患者的样本 |
| 438 | 2024-08-04 |
Leveraging a neutrophil-derived PCD signature to predict and stratify patients with acute myocardial infarction: from AI prediction to biological interpretation
2024-Jul-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05415-0
PMID:38956669
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研究论文 | 本文提出了一种中性粒细胞衍生的程序性细胞死亡（PCD）特征，旨在预测和分层急性心肌梗死（AMI）患者 | 创新地利用机器学习生成了一种预测性的中性粒细胞衍生PCD特征，并探讨了其生物机制 | 虽然探讨了中性粒细胞相关PCD的临床意义，但生物机制尚未完全阐明 | 旨在通过预测和分层急性心肌梗死患者来改善治疗管理 | 研究对象为急性心肌梗死患者的外周血样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 机器学习，单细胞转录组学，孟德尔随机化 | 随机森林 | 微阵列数据 | 五个独立的微阵列队列 |
| 439 | 2024-08-04 |
A unified model-based framework for doublet or multiplet detection in single-cell multiomics data
2024-Jul-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49448-x
PMID:38956023
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研究论文 | 本文提出了一种基于复合泊松模型的框架，用于在单细胞多组学数据中检测多细胞聚集体。 | 创新之处在于使用复合泊松模型来检测细胞聚集体，并利用实验细胞哈希结果作为多细胞状态的真实数据。 | 本研究的局限性在于尚未涵盖所有单细胞多组学技术的整合应用。 | 研究的目的是在单细胞多组学数据中准确检测和消除多细胞聚集体。 | 研究对象为280,123个液滴的单细胞多组学数据。 | 数字病理学 | NA | DOGMA-seq | 复合泊松模型 | 数据集包含液滴信息 | 280,123个液滴来自两个组织 |
| 440 | 2024-08-04 |
NOX4-mediated astrocyte ferroptosis in Alzheimer's disease
2024-Jul-02, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01266-w
PMID:38956702
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研究论文 | 本研究探讨了NADPH氧化酶4（NOX4）在阿尔茨海默病（AD）中对铁介导的星形胶质细胞死亡的作用 | 研究首次揭示了NOX4在阿尔茨海默病星形胶质细胞铁死亡中的关键作用 | 研究可能受到样本选择和实验条件的限制 | 研究NOX4与阿尔茨海默病相关的星形胶质细胞铁死亡机制 | 本研究的对象为阿尔茨海默病中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了AD的单细胞RNA测序数据 |