单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 524 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-07 |
Response to Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi24-0024
PMID:38900952
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-08-04 |
Increased prevalence of hybrid epithelial/mesenchymal state and enhanced phenotypic heterogeneity in basal breast cancer
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110116
PMID:38974967
|
研究论文 | 本文研究了基础型乳腺癌中混合上皮/间充质状态和表型异质性的增加 | 通过多模态转录组数据和数学建模，揭示了表型异质性中的不同生物轴之间的相互关系 | 未在文中提及具体的临床应用或实验验证 | 理解基础型乳腺癌中的表型异质性及其分子机制 | 乳腺癌细胞系和原发性肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组学 | 数学建模 | 多模态转录组数据 | 包括乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本 |
| 423 | 2024-08-04 |
Recent Innovations and Technical Advances in High-Throughput Parallel Single-Cell Whole-Genome Sequencing Methods
2024-Jul-09, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400789
PMID:38979872
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综述 | 本文回顾了高通量单细胞全基因组测序方法的技术进展 | 阐明了高通量单细胞全基因组测序在策略设计、数据效率及并行处理平台方面的技术创新 | 尽管技术进步，仍然面临总成本的限制 | 探讨高通量单细胞全基因组测序方法的技术进步及其在人类基因组中的应用 | 高通量单细胞全基因组测序技术及其应用 | 数字病理学 | 癌症 | 高通量测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 424 | 2024-08-05 |
SCRN: Single-cell Gene Regulatory Network Identification in Alzheimer's Disease
2024-Jul-08, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3424400
PMID:38976461
|
研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞数据的图学习方法SCRN，用于识别阿尔茨海默病中的基因调控网络 | SCRN利用图神经网络实现了γ衰减启发式链接预测，能够基于局部闭合集群识别可靠的基因调控网络 | 未提及具体的样本限制或数据集的多样性问题 | 深入了解阿尔茨海默病中基因调控的机制 | 使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析阿尔茨海默病患者与正常样本之间的基因调控差异 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 425 | 2024-08-05 |
An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases
2024-Jul-05, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add8394
PMID:38963856
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研究论文 | 本研究揭示了人类CD4 T细胞中的转录增强子图谱及其与疾病的关联 | 首次利用单细胞RNA测序和染色质轮廓整合，系统解析了与免疫介导疾病相关的遗传变异 | 研究可能受限于样本的多样性和细胞类型的复杂性 | 探究转录增强子在不同Helper T细胞类型中的作用及其与人类疾病的关系 | 人类CD4 T细胞及其转录增强子 | 数字病理学 | 免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 人类CD4 T细胞样本 |
| 426 | 2024-08-04 |
Emerging trends in the study of spiralian larvae
2024-Jul, Evolution & development
IF:2.6Q2
DOI:10.1111/ede.12459
PMID:37787615
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评论 | 这篇综述探讨了螺旋动物幼虫的发育与进化研究的最新趋势。 | 文章结合经典研究与现代高通量技术，提出了对幼虫发育和生命周期演化机制的新可测试假设。 | 没有提供具体的数据或实证研究，仅为理论上的探讨。 | 研究螺旋动物幼虫的发育机制及其演化背景。 | 螺旋动物及其幼虫形态特征，包括前神经系统、纤毛带和后底泡。 | 生物学 | NA | 比较基因组学、单细胞转录组学、表观基因组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 427 | 2024-08-05 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-Jul-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
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研究论文 | 本研究探讨了与铜死亡相关的分子标志物在脓毒症患者中的表达及其对预后的影响 | 识别了与铜死亡相关的新型分子标志物，并提出其作为脓毒症患者的预后指标的潜力 | 关于GLS水平变化与铜之间关系的进一步研究仍需进行 | 探索脓毒症患者中与铜死亡相关的分子标志物，以改善患者的分层和预后 | 脓毒症患者的外周血样本和免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq, 免疫印迹, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 生物样本 | 脓毒症患者的外周血样本 |
| 428 | 2024-08-05 |
Generating Neuroimmune Assembloids Using Human Induced Pluripotent Stem Cell (iPSC)-Derived Cortical Organoids and Microglia
2024-Jul-09, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2024_554
PMID:38976205
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研究论文 | 本研究提出了一种新方法，通过人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的皮层类器官和小胶质细胞生成神经免疫组合体 | 创新点在于将小胶质细胞整合到皮层类器官模型中，以反映神经免疫交互作用 | 研究中没有提及样本的广泛性或不同类型的小胶质细胞对结果的影响 | 研究旨在开发一种能够更好地模拟神经发育和神经疾病中神经细胞与免疫细胞相互作用的体外模型 | 研究对象为人诱导多能干细胞衍生的皮层类器官和小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-08-04 |
Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells
2024-Jul-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae030
PMID:38655770
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研究论文 | 本研究首次揭示了循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化和在生理过程中的作用 | 首次对循环髓系细胞的研究价值进行了系统分析，并确定了其特定类型的亚群 | 本研究的具体样本大小和实验条件未详细说明 | 研究循环髓系细胞在生理和病理过程中的起源和功能 | 循环髓系细胞，特别是亚群a的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | NA |
| 430 | 2024-08-04 |
Establishment of an ovarian cancer exhausted CD8+T cells-related genes model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jul-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01948-8
PMID:38970067
|
研究论文 | 建立了一种与卵巢癌耗竭CD8+T细胞相关的基因模型 | 首次识别了与耗竭的CD8+T细胞相关的基因，并提出了其在卵巢癌中的预后意义 | 模型的临床适用性需要在更多样本上进行进一步验证 | 识别与卵巢癌中耗竭CD8+T细胞相关的基因及其预后意义 | 卵巢癌患者的肿瘤样本及相关基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的大样本 |
| 431 | 2024-08-05 |
Deciphering lineage specification during early embryogenesis in mouse gastruloids using multilayered proteomics
2024-Jul-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.017
PMID:38754429
|
研究论文 | 本研究利用多层质谱技术研究了小鼠胃胚体早期发育中的蛋白质表达动态 | 首次使用多层质谱技术对小鼠胃胚体发育中的蛋白质进行全面分析，发现了各个胚层特有的时间性表达模式 | 缺乏对早期哺乳动物胚胎发育的蛋白质组学研究，现有研究较为稀缺 | 探讨小鼠胃胚体发育过程中胚层特异性蛋白质的表达和功能 | 小鼠胃胚体和发育过程中相关的蛋白质 | 数字病理学 | NA | 质谱 | NA | 蛋白质组数据 | 研究涉及的小鼠胃胚体样本数量NA |
| 432 | 2024-08-07 |
Author Correction: The shaky foundations of simulating single-cell RNA sequencing data
2024-Jul-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03329-0
PMID:38970115
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-08-04 |
Deciphering brain cellular and behavioral mechanisms: Insights from single-cell and spatial RNA sequencing
2024 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1865
PMID:38972934
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综述 | 概述了单细胞RNA测序和空间转录组学在大脑研究中的应用和挑战 | 强调了将单细胞RNA测序与神经科学前沿方向深度整合的重要性 | 提及数据处理中的潜在问题和挑战，但未深入探讨具体局限性 | 探讨单细胞和空间RNA测序在理解大脑细胞及其行为机制中的重要性 | 重点讨论不同细胞类型在大脑功能中的角色及其基因表达 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 434 | 2024-08-05 |
Harnessing Single-Cell Technologies in the Search for New Therapies for Diamond-Blackfan Anemia Syndrome
2024-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104235
PMID:38740323
|
综述 | 本文讨论了单细胞技术在钻石-黑凡贫血综合症(DBA)新疗法研究中的应用。 | 该文章创新性地探索了单细胞研究对理解DBA病理机制及新疗法开发的启示。 | 本文主要为综述，具体的实验数据和结果较为有限。 | 研究DBA的病理机制及其新疗法的潜在开发。 | 钻石-黑凡贫血综合症及其相关的单细胞技术研究。 | 数字病理学 | 其他血液疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 克隆细胞培养测定 | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-08-04 |
A single-cell transcriptomic study of heterogeneity in human embryonic tanycytes
2024-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66044-7
PMID:38965316
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研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎tanycytes的异质性 | 首次利用单细胞转录组数据分析人类胚胎tanycytes的群体和基因调控网络 | 人类tanycytes的研究仍相对有限，可能影响对其生物学功能的全面理解 | 研究人类胚胎tanycytes的异质性及其在能量平衡中的作用 | 人类胚胎tanycytes | 数字病理学 | 肥胖与糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 436 | 2024-08-05 |
Differences in microenvironment of lung cancer and pleural effusions by single-cell RNA sequencing
2024-Jul, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2024.107847
PMID:38889499
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序比较肺癌和胸腔积液的微环境 | 该研究首次对相同患者的肺癌活检和胸腔积液进行直接比较，揭示了微环境的显著差异 | 样本量较小，仅研究了十名患者，结果的普遍适用性可能受到限制 | 研究肺癌微环境及其与胸腔积液微环境的比较 | 十名肺癌患者的匹配活检和胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 10名患者的匹配样本 |
| 437 | 2024-08-05 |
SingmiR: a single-cell miRNA alignment and analysis tool
2024-Jul-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae225
PMID:38572750
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研究论文 | 本研究介绍了SingmiR工具，通过提供针对单细胞miRNA-seq数据的快速处理与定量分析。 | SingmiR是首个专为单细胞miRNA-seq数据设计的网络服务器，具有自解释界面并提供全面的分析功能 | 目前尚无针对大规模单细胞miRNA-seq数据的扩展验证 | 本研究旨在加速生物学家开发单细胞miRNA-seq协议的原型流程 | 研究对象为人类的非编码单细胞样本中的miRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 小到中等规模的数据集 |
| 438 | 2024-08-05 |
Multiplexed imaging to reveal tissue dendritic cell spatial localisation and function
2024-Jul-05, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14962
PMID:38969618
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综述 | 本文简要概述了多重成像技术在识别树突状细胞及其组织特异性功能中的应用 | 提出了多重成像技术作为一种新方法来理解树突状细胞的空间定位和功能 | 未提及具体的实验数据或案例分析 | 理解树突状细胞在组织中的空间组织和细胞间相互作用 | 树突状细胞及其在组织特异性中的功能 | 数字病理学 | NA | 多重成像技术 | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-08-04 |
Growth hormone promotes myelin repair after chronic hypoxia via triggering pericyte-dependent angiogenesis
2024-Jul-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.026
PMID:38653248
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研究论文 | 这篇文章探讨了生长激素在慢性缺氧后促进髓鞘修复的机制。 | 该研究首次展示了生长激素通过触发周细胞依赖的血管生成来改善白质损伤。 | 该研究未提供对人类疾病的直接临床相关性 | 研究生长激素在缺氧导致的白质损伤中的作用及其机制 | 以缺氧新生小鼠为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 小鼠模型 | 新生小鼠及其后代 |
| 440 | 2024-08-04 |
Integrating single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics to elucidate a specialized subpopulation of astrocytes, microglia and vascular cells in brains of mouse model of lipopolysaccharide-induced sepsis-associated encephalopathy
2024-Jul-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03161-0
PMID:38961424
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研究论文 | 本研究揭示了在脂多糖诱导的败血症相关脑病小鼠模型中，特定星形胶质细胞、微胶质细胞和血管细胞的亚群体及其相互作用。 | 结合使用单核RNA测序和空间转录组学，确认了Astro-2、Micro-2与Vas-1细胞之间的独特共定位关系，并发现其相关的配体-受体上调。 | 研究未能观察到Anxa1-/-和野生型小鼠在其他脑细胞类型、数量或分布上的显著差异。 | 揭示败血症相关脑病的细胞和分子机制。 | 使用脂多糖注射建立小鼠模型，分析不同时间点的脑组织。 | 数字病理学 | 败血症相关脑病 | 单核RNA测序(snRNA-seq)和立体测序(Stereo-seq) | 小鼠模型 | 脑组织 | 野生型小鼠和Anxa1-/-小鼠 |