单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 493 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-05 |
Integrated single cell-RNA sequencing and Mendelian randomization for ischemic stroke and metabolic syndrome
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110240
PMID:39021802
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化，探讨代谢综合征与缺血性中风之间的分子机制和遗传关联 | 首次识别缺血性中风与代谢综合征之间的共同分子特征和遗传关联 | 未能深入探讨具体的代谢失调机制和环境因素的影响 | 理解代谢失调在缺血性中风中的作用 | 缺血性中风和代谢综合征之间的遗传关联 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | 随机森林, Lasso回归, XGBoost | 基因表达数据 | 涉及多个细胞群体的标准化数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity and key subsets of tissue-resident memory T cells in cervical cancer
2024-Jul-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00637-3
PMID:39014148
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研究论文 | 本研究分析了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的细胞异质性及其关键亚群 | 首次揭示了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的异质性及其在免疫反应中的作用 | 研究仅基于有限的样本数量和组织来源，可能无法涵盖所有的细胞特性 | 探讨组织驻留记忆T细胞在宫颈癌中的异质性及其对癌症免疫的贡献 | 来自11个宫颈癌组织和5个正常宫颈组织的组织驻留记忆T细胞及非组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12945个组织驻留记忆T细胞和25627个非组织驻留记忆T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-08-05 |
Establishing an oxidative stress mitochondria-related prognostic model in hepatocellular carcinoma based on multi-omics characteristics and machine learning computational framework
2024-Jul-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01147-1
PMID:39014263
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研究论文 | 本文建立了一种基于多组学特征和机器学习计算框架的氧化应激线粒体相关预后模型，用于肝细胞癌的预测 | 采用多种机器学习算法构建了一种包含26个基因的共识氧化应激线粒体相关标志物，并筛选出6个具有良好预后价值的基因 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能存在数据异质性和外部验证不足的问题 | 本文旨在探讨线粒体功能与氧化应激在肝细胞癌中的预后价值 | 研究对象为肝细胞癌患者的基因表达数据 | 机器学习 | 肝癌 | 基因表达分析，机器学习 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用来自TCGA、GEO和ICGC的HCC样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-05 |
Single cell profiling to determine influence of wheeze and early-life viral infection on developmental programming of airway epithelium
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602506
PMID:39026695
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研究论文 | 本研究旨在表征哮喘儿童气道上皮的发育表型及其与早期呼吸道病毒感染的关系 | 研究发现哮喘儿童的气道上皮在发育过程中表现出异常分化和基底细胞活化，这为理解哮喘的生物学基础提供了新见解 | 该研究主要集中于特定年龄段的儿童，可能无法代表所有年龄组的情况 | 探索幼儿哮喘与早期RSV感染对气道上皮发育编程的影响 | 从不同组别的哮喘与非哮喘儿童中收集的鼻气道上皮细胞 | 数字病理学 | 幼儿哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 共计涉及来自四个相互排斥组的儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-08-05 |
T-distributed Stochastic Neighbor Network for unsupervised representation learning
2024-Jul-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2024.106520
PMID:39024709
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研究论文 | 本文提出了一种简单的端到端T-分布随机邻居网络（TsNet）用于无监督表示学习和聚类下游任务 | 引入了适应性连接分布学习模块和基于T-分布随机邻居嵌入的损失函数，显著提高了表示的区分度 | 未提及具体的局限性 | 探索如何从通用数据中提取有意义的结构信息 | 通用数据的聚类表示学习，包括向量、图像和表格数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | TsNet | 图像，文本 | 涉及真实单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集的聚类 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-08-04 |
Applications of single-cell multi-omics in liver cancer
2024-Jul, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101094
PMID:39022385
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综述 | 本文探讨了单细胞多组学在肝癌研究中的应用。 | 强调通过整合多种单模态技术到单细胞分辨率的多组学方法中，推动个体化治疗的发展。 | 当前单细胞多组学在肝癌研究中的应用仍然有限。 | 旨在深入理解肝癌的生物学及其临床影响。 | 主要关注肝细胞癌（HCC）的细胞异质性及其治疗反应机制。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-08-05 |
Translational regulation enhances distinction of cell types in the nervous system
2024-Jul-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90713
PMID:39010741
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研究论文 | 这篇文章揭示了转录后调控在神经系统细胞类型区分中的重要性 | 研究首次将转录后调控与细胞类型特异性蛋白表达联系起来，为理解细胞多样性的分子机制提供了新见解 | 研究仅在特定的转基因小鼠模型中进行，可能不适用于所有类型的神经细胞 | 揭示转录后调控对神经系统细胞类型区分的影响 | 研究基因定义的脑细胞的转录组和翻译组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq | NA | RNA数据 | 基因定义的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-08-05 |
Generation of musculoskeletal cells from human urine epithelium-derived presomitic mesoderm cells
2024-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01274-w
PMID:39010176
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研究论文 | 本研究探讨了从人尿上皮衍生的前体中胚层细胞生成肌肉骨骼细胞的过程。 | 本研究首次展示了UiPSM细胞的分化潜力，并证明其在移植后能够形成成熟的骨骼肌细胞。 | 研究未详细探讨UiPSM细胞在不同体内环境下的长期表现及其潜在的不良反应。 | 研究UiPSM细胞的分化潜力及其在肌肉骨骼发展中的应用。 | 本研究主要对象为从人尿上皮提取的UiPSM细胞及其衍生的骨骼肌细胞。 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 生物发光成像，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞培养，生物成像 | 使用了在MITRG小鼠前胫肌中的UiPSM细胞移植进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-08-04 |
Advance and Application of Single-cell Transcriptomics in Auditory Research
2024-Jul, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01149-z
PMID:38015350
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综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在听觉研究中的应用 | 文章创新性地应用单细胞RNA测序技术揭示听觉器官中细胞的复杂生物机制 | 对于内耳的细胞异质性及其有限的细胞数量的深入研究仍然不足 | 本研究旨在提供听觉器官发展的参考、听力损失的发病机制以及再生疗法的基础 | 研究对象为听觉器官中的不同类型细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-04 |
Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics
2024-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.04.015
PMID:38692412
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究肾移植排斥反应的潜力 | 结合公共单细胞RNA测序数据，首次应用空间转录组学技术研究肾移植排斥反应 | 关于该技术的发展和未来应用的限制需要考虑 | 研究肾移植排斥反应的分子和细胞机制 | 分析非排斥、T细胞介导的急性排斥、间质纤维化和肾小管萎缩的活检样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 活检样本 | 多种病理状态下的活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing advances in research on mesenchymal stem/stromal cells
2024-Jul, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01076-9
PMID:38743204
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综述 | 本文回顾了单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用及其前景 | 强调了单细胞测序技术在揭示间充质干细胞异质性和分子特征中的重要性 | 未提及具体的局限性 | 审视单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞（MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-07 |
Decoding the building blocks of cellular processes from single-cell transcriptomics data
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01967-6
PMID:37735267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptome atlas of human euploid and aneuploid blastocysts
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01788-6
PMID:38839885
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研究论文 | 该文章探讨了人类正常和非正常胚泡的单细胞转录组图谱 | 本研究首次系统性地分析了人类非正常胚泡中转录组的改变，揭示了基因剂量效应和特定信号通路的影响 | 研究主要集中于初期的人类胚泡，可能无法完全推及其他发育阶段或物种 | 了解非正常胚泡中染色体异常如何影响细胞功能和胚胎发育 | 203个人类正常与非正常胚泡中的14,908个单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 203个胚泡包含14,908个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-05 |
Microwave ablation combined with PD-L1 blockade synergistically promotes Cxcl9-mediated antitumor immunity
2024-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16182
PMID:38655660
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研究论文 | 本研究探讨了微波消融与PD-L1拮抗，协同促进Cxcl9介导的抗肿瘤免疫 | 发表了微波消融结合抗PD-L1治疗对肿瘤免疫的改善作用的新发现 | 研究局限于小鼠模型，临床应用尚需进一步验证 | 探究微波消融与PD-L1拮抗结合对结直肠癌肝转移防治的潜力 | 使用经过微波消融的前临床小鼠模型进行研究 | 数字病理 | 结直肠癌 | 微波消融和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本和肿瘤细胞 | 小鼠模型，样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-08-05 |
IRF8 configures enhancer landscape in postnatal microglia and directs microglia specific transcriptional programs
2024-Jul-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.25.546453
PMID:37645844
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF8在后天小胶质细胞发育中的作用 | IRF8通过结合增强子区域调控小胶质细胞特异性的转录程序，揭示了其在小胶质细胞发育中的关键作用 | 研究未涉及IRF8在其他类型免疫细胞中的潜在作用 | 了解IRF8在后天小胶质细胞发育及特异性转录调控中的角色 | 后天发育的小胶质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | 5xFAD模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-08-07 |
A one-stop shop for 3D spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01847-y
PMID:39009876
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-08-04 |
Paris saponin VII inhibits triple-negative breast cancer by targeting the MEK/ERK/STMN1 signaling axis
2024-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155746
PMID:38763012
|
研究论文 | 本研究探讨了Paris saponin VII对三阴性乳腺癌的治疗效果及其潜在机制 | 首次表明STMN1磷酸化的抑制可能是PSⅦ抗癌作用的机制 | 尚未进行临床试验验证 | 阐明PSⅦ对三阴性乳腺癌的治疗作用 | 研究对象为三阴性乳腺癌细胞及相关基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 分子对接、分子动力学、西方印迹 | NA | 单细胞测序数据 | 4T1异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-05 |
Altered tumor microenvironment heterogeneity of penile cancer during progression from non-lymphatic to lymphatic metastasis
2024-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70025
PMID:39003681
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研究论文 | 本研究首次探讨了阴茎癌在从非淋巴转移到淋巴转移过程中肿瘤微环境异质性的变化 | 研究揭示了阴茎癌微环境中上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞之间的相互作用以及肿瘤进展和淋巴结转移中功能合作的重要性 | 研究样本量较小，仅涉及六名进行单细胞RNA测序的患者和七名进行整体RNA测序的患者 | 研究阴茎癌的肿瘤微环境如何随着从非淋巴转移到淋巴转移的进展而变化 | 六名阴茎癌患者的细胞，分别为四名淋巴转移患者（IV期）和两名非淋巴转移患者（I期） | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | NA | 细胞 | 六名患者的46,861个细胞和七名患者的RNA样本 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-08-05 |
Colorectal cancer-associated fibroblasts inhibit effector T cells via NECTIN2 signaling
2024-Jul-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216985
PMID:38821255
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研究论文 | 研究揭示了结直肠癌相关成纤维细胞通过NECTIN2信号抑制效应性T细胞的机制 | 首次识别出一种新的免疫抑制性 CAF 群体，并表明 NECTIN2 是T细胞抑制的关键驱动因子 | 尚缺乏对结直肠癌中 CAF 的全面特征描述 | 探究结直肠癌中成纤维细胞的异质性及其对效应性T细胞的影响 | 健康人类结肠和结直肠癌患者中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq 和空间蛋白组学 | NA | 细胞样本 | 近23,000个成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-08-04 |
Benchmarking and integrating human B-cell receptor genomic and antibody proteomic profiling
2024-Jul-12, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00402-z
PMID:38997321
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研究论文 | 本文研究了人类B细胞受体和抗体的联合特征分析 | 创新点在于首次对bulkBCR-seq、scBCR-seq和Ab-seq三种技术生成的数据进行了综合分析 | 本研究仍需进一步验证多样本的普遍性 | 研究旨在评估B细胞受体和抗体组库的特征及其相关性 | 研究对象为健康人群的外周血B细胞和血清抗体 | 系统免疫学 | NA | bulkBCR-seq, scBCR-seq, Ab-seq | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 健康人捐赠者的外周血B细胞样本 | NA | NA | NA | NA |