单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 509 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-04 |
Identification of signaling pathways that specify a subset of migrating enteric neural crest cells at the wavefront in mouse embryos
2024-Jul-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.034
PMID:38636517
|
研究论文 | 该文章探讨了小鼠胚胎中波前肠神经嵴细胞的信号通路 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了波前ENCCs的分子动态和关键信号通路 | 尚未完全理解分子机制及其与周围细胞的相互作用 | 理解肠神经系统发展中的细胞迁移和信号通路 | 小鼠胚胎的波前肠神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | 小鼠胚胎样本 |
| 402 | 2024-08-04 |
Detection of allele-specific expression in spatial transcriptomics with spASE
2024-Jul-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03317-4
PMID:38978101
|
研究论文 | 介绍了一种用于检测空间等位基因特异性表达的新计算框架spASE | 提出了spASE框架，用于估计空间等位基因特异性表达，以解决细胞类型混合和低信噪比带来的挑战 | 未提及具体的局限性 | 研究空间转录组学中等位基因特异性表达的可行性 | 小鼠小脑和海马的等位基因解析的Visium和Slide-seq数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 分层模型与加性混合空间平滑样条 | RNA数据 | NA |
| 403 | 2024-08-04 |
Advancing cell-based therapy in sepsis: An anesthesia outlook
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003097
PMID:38708689
|
综述 | 本文提供了免疫细胞治疗在脓毒症研究中的现状和进展的简要概述 | 讨论了基于干细胞的免疫调节干预和Chimeric抗原受体(CAR)免疫细胞治疗在脓毒症中的应用 | 缺乏具体的临床试验数据支持本文提出的治疗方法 | 探讨脓毒症患者围手术期管理中的创新治疗方法 | 免疫细胞治疗及其在脓毒症中的应用 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序和基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-05 |
Identification of potential immune-related mechanisms related to the development of multiple myeloma
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003116
PMID:38844445
|
研究论文 | 本研究探讨了在未接受治疗的多发性骨髓瘤患者中的免疫微环境，尤其是单核细胞/巨噬细胞。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了未治疗的多发性骨髓瘤患者中单核细胞/巨噬细胞的免疫机制及其重要性。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能未能涵盖所有免疫细胞类型的复杂交互作用。 | 本研究旨在揭示未治疗多发性骨髓瘤患者的免疫微环境特征。 | 研究对象为未治疗的多发性骨髓瘤患者及健康供体。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及的样本包括未治疗的多发性骨髓瘤患者和健康供体的单细胞RNA测序数据 |
| 405 | 2024-08-04 |
Profibrotic Subsets of SPP1+ Macrophages and POSTN+ Fibroblasts Contribute to Fibrotic Scarring in Acne Keloidalis
2024-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.014
PMID:38218364
|
研究论文 | 这篇文章探讨了在痤疮瘢痕病中，SPP1+巨噬细胞和POSTN+成纤维细胞的致纤维化亚群的作用 | 提出了POSTN成纤维细胞和SPP1巨噬细胞之间通过SPP1信号网络的交流可能在痤疮瘢痕病的发病机制中起作用 | 该研究可能局限于样本数和临床病理特征的多样性 | 进一步探索痤疮瘢痕病的发病机制 | 临床确诊的痤疮瘢痕患者的后枕部头皮活检标本 | 数字病理学 | 痤疮瘢痕病 | 大量RNA测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 组织样本 | 涉及多个患者的病变和无病变皮肤活检样本 |
| 406 | 2024-08-04 |
Identifying the Pattern Characteristics of Anoikis-Related Genes in Keloid
2024-Jul-10, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0027
PMID:38775414
|
研究论文 | 本研究首次全面分析了与细胞脱落相关基因在瘢痕疙瘩中的作用 | 识别了六个重要的ARGs并探讨了它们与免疫细胞浸润水平的显著相关性 | 仅使用了GEO数据库的RNA-seq数据，可能有限于特定样本 | 研究细胞脱落相关基因在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 | 瘢痕疙瘩的成纤维细胞及相关的细胞脱落基因 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 三个瘢痕疙瘩成纤维细胞的RNA测序数据集 |
| 407 | 2024-08-04 |
HEARTSVG: a fast and accurate method for identifying spatially variable genes in large-scale spatial transcriptomics
2024-Jul-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49846-1
PMID:38972896
|
研究论文 | 本文提出了一种新的方法HEARTSVG，用于快速准确地识别大规模空间转录组中的空间变异基因 | HEARTSVG是一种无分布假设的基于检验的方法，能够以更高的准确性和计算效率识别空间变异基因 | 未提及具体的局限性 | 理解疾病和组织结构的时空特征，识别空间变异基因 | 大规模空间转录组数据中的空间变异基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组技术 | NA | 真实数据集 | 分析了来自不同空间转录组技术的十二个真实数据集 |
| 408 | 2024-08-04 |
Genomic structural variation contributes to evolved changes in gene expression in high-altitude Tibetan sheep
2024-Jul-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322291121
PMID:38913905
|
研究论文 | 本研究探讨了基因组结构变异对高原藏羊基因表达变化的影响 | 首次表征了区分藏羊和低海拔胡羊的基因组结构变异，并揭示了与心脏功能和循环相关基因的表达差异 | 未详细探讨每种基因变异对功能表型的直接影响 | 研究高海拔适应的遗传机制 | 高原藏羊与低海拔胡羊 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 462个基因的高频结构变异 |
| 409 | 2024-08-04 |
Single-cell landscape of functionally cured chronic hepatitis B patients reveals activation of innate and altered CD4-CTL-driven adaptive immunity
2024-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.017
PMID:38423478
|
研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎患者功能治愈后的免疫病理特征，揭示了免疫系统的激活状态 | 本研究首次从单细胞水平深入解析了慢性乙型肝炎治愈机制中的免疫病理特征，并发现了CD4细胞毒性T淋巴细胞的变化以及肝脏中天然杀伤细胞的激活 | 研究没有涉及功能治愈后长期随访的影响和机制 | 旨在揭示慢性乙型肝炎功能治愈后免疫病理的基础机制 | 研究对象为慢性乙型肝炎患者及其功能治愈后的样本 | 数字病理学 | 慢性肝炎 | 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 细胞样本, 血液样本 | NA |
| 410 | 2024-08-04 |
Endothelial POFUT1 controls injury-induced liver fibrosis by repressing fibrinogen synthesis
2024-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.032
PMID:38460791
|
研究论文 | POFUT1通过抑制纤维蛋白原的合成调控损伤诱导的肝纤维化 | 揭示了POFUT1在肝脏内皮细胞中作为纤维蛋白原表达下调的关键调节因子，进而影响肝纤维化进程 | 本研究主要基于小鼠模型，临床数据的验证仍需进一步展开 | 探讨LSEC表达的POFUT1在肝纤维化中的作用及其机制 | 重点研究了LSEC及其与肝星状细胞之间的信号传导 | 数字病理学 | 肝纤维化 | RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 多组小鼠及肝硬化患者的单细胞RNA测序数据 |
| 411 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Microglia Dissected the Energy Metabolism and Revealed Potential Biomarkers in Amyotrophic Lateral Sclerosis
2024-Jul, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03806-w
PMID:38102515
|
研究论文 | 该研究分析了肌萎缩侧索硬化症患者小胶质细胞的RNA测序，揭示了能量代谢的作用及潜在生物标志物 | 首次探讨了ALS患者非神经元细胞中差异表达基因的能量代谢功能及其与小胶质细胞的相互作用 | 本研究仅限于小样本规模，可能无法全面代表ALS的病理特征 | 研究ALS的发病机制、早期诊断及潜在治疗策略 | ALS患者的非神经元细胞、SOD1突变ALS小鼠的脑干及ALS患者的全血组织 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括ALS患者和ALS小鼠的多个样本 |
| 412 | 2024-08-05 |
Van Gogh-like 2 is essential for the architectural patterning of the mammalian biliary tree
2024-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.030
PMID:38460794
|
研究论文 | 本文探讨了平面细胞极性在哺乳动物胆道结构模式中的作用 | 阐明了平面细胞极性蛋白VANGL2在胆管细胞间接触形成中的模式化作用 | 尚不清楚这些生化信号与胆管模式化之间的具体联系 | 定义胆管板从简单上皮细胞层过渡为复杂连接胆管的机制 | 胚胎小鼠肝脏中的双向表皮祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 组织器模型 | RNA数据 | 胚胎小鼠肝脏的单细胞样本 |
| 413 | 2024-08-07 |
Response to Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi24-0024
PMID:38900952
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-04 |
Increased prevalence of hybrid epithelial/mesenchymal state and enhanced phenotypic heterogeneity in basal breast cancer
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110116
PMID:38974967
|
研究论文 | 本文研究了基础型乳腺癌中混合上皮/间充质状态和表型异质性的增加 | 通过多模态转录组数据和数学建模，揭示了表型异质性中的不同生物轴之间的相互关系 | 未在文中提及具体的临床应用或实验验证 | 理解基础型乳腺癌中的表型异质性及其分子机制 | 乳腺癌细胞系和原发性肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组学 | 数学建模 | 多模态转录组数据 | 包括乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本 |
| 415 | 2024-08-05 |
An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases
2024-Jul-05, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add8394
PMID:38963856
|
研究论文 | 本研究揭示了人类CD4 T细胞中的转录增强子图谱及其与疾病的关联 | 首次利用单细胞RNA测序和染色质轮廓整合，系统解析了与免疫介导疾病相关的遗传变异 | 研究可能受限于样本的多样性和细胞类型的复杂性 | 探究转录增强子在不同Helper T细胞类型中的作用及其与人类疾病的关系 | 人类CD4 T细胞及其转录增强子 | 数字病理学 | 免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 人类CD4 T细胞样本 |
| 416 | 2024-08-04 |
Emerging trends in the study of spiralian larvae
2024-Jul, Evolution & development
IF:2.6Q2
DOI:10.1111/ede.12459
PMID:37787615
|
评论 | 这篇综述探讨了螺旋动物幼虫的发育与进化研究的最新趋势。 | 文章结合经典研究与现代高通量技术，提出了对幼虫发育和生命周期演化机制的新可测试假设。 | 没有提供具体的数据或实证研究，仅为理论上的探讨。 | 研究螺旋动物幼虫的发育机制及其演化背景。 | 螺旋动物及其幼虫形态特征，包括前神经系统、纤毛带和后底泡。 | 生物学 | NA | 比较基因组学、单细胞转录组学、表观基因组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 417 | 2024-08-05 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-Jul-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
|
研究论文 | 本研究探讨了与铜死亡相关的分子标志物在脓毒症患者中的表达及其对预后的影响 | 识别了与铜死亡相关的新型分子标志物，并提出其作为脓毒症患者的预后指标的潜力 | 关于GLS水平变化与铜之间关系的进一步研究仍需进行 | 探索脓毒症患者中与铜死亡相关的分子标志物，以改善患者的分层和预后 | 脓毒症患者的外周血样本和免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq, 免疫印迹, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 生物样本 | 脓毒症患者的外周血样本 |
| 418 | 2024-08-05 |
Generating Neuroimmune Assembloids Using Human Induced Pluripotent Stem Cell (iPSC)-Derived Cortical Organoids and Microglia
2024-Jul-09, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2024_554
PMID:38976205
|
研究论文 | 本研究提出了一种新方法，通过人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的皮层类器官和小胶质细胞生成神经免疫组合体 | 创新点在于将小胶质细胞整合到皮层类器官模型中，以反映神经免疫交互作用 | 研究中没有提及样本的广泛性或不同类型的小胶质细胞对结果的影响 | 研究旨在开发一种能够更好地模拟神经发育和神经疾病中神经细胞与免疫细胞相互作用的体外模型 | 研究对象为人诱导多能干细胞衍生的皮层类器官和小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-08-04 |
Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells
2024-Jul-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae030
PMID:38655770
|
研究论文 | 本研究首次揭示了循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化和在生理过程中的作用 | 首次对循环髓系细胞的研究价值进行了系统分析，并确定了其特定类型的亚群 | 本研究的具体样本大小和实验条件未详细说明 | 研究循环髓系细胞在生理和病理过程中的起源和功能 | 循环髓系细胞，特别是亚群a的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | NA |
| 420 | 2024-08-04 |
Establishment of an ovarian cancer exhausted CD8+T cells-related genes model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jul-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01948-8
PMID:38970067
|
研究论文 | 建立了一种与卵巢癌耗竭CD8+T细胞相关的基因模型 | 首次识别了与耗竭的CD8+T细胞相关的基因，并提出了其在卵巢癌中的预后意义 | 模型的临床适用性需要在更多样本上进行进一步验证 | 识别与卵巢癌中耗竭CD8+T细胞相关的基因及其预后意义 | 卵巢癌患者的肿瘤样本及相关基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的大样本 |