单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 505 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-05 |
Colorectal cancer-associated fibroblasts inhibit effector T cells via NECTIN2 signaling
2024-Jul-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216985
PMID:38821255
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研究论文 | 研究揭示了结直肠癌相关成纤维细胞通过NECTIN2信号抑制效应性T细胞的机制 | 首次识别出一种新的免疫抑制性 CAF 群体，并表明 NECTIN2 是T细胞抑制的关键驱动因子 | 尚缺乏对结直肠癌中 CAF 的全面特征描述 | 探究结直肠癌中成纤维细胞的异质性及其对效应性T细胞的影响 | 健康人类结肠和结直肠癌患者中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq 和空间蛋白组学 | NA | 细胞样本 | 近23,000个成纤维细胞 |
| 382 | 2024-08-04 |
Benchmarking and integrating human B-cell receptor genomic and antibody proteomic profiling
2024-Jul-12, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00402-z
PMID:38997321
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研究论文 | 本文研究了人类B细胞受体和抗体的联合特征分析 | 创新点在于首次对bulkBCR-seq、scBCR-seq和Ab-seq三种技术生成的数据进行了综合分析 | 本研究仍需进一步验证多样本的普遍性 | 研究旨在评估B细胞受体和抗体组库的特征及其相关性 | 研究对象为健康人群的外周血B细胞和血清抗体 | 系统免疫学 | NA | bulkBCR-seq, scBCR-seq, Ab-seq | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 健康人捐赠者的外周血B细胞样本 |
| 383 | 2024-08-04 |
Deubiquitylase ubiquitin-specific protease 7 plays a crucial role in the lineage differentiation of preimplantation blastocysts†
2024-Jul-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae034
PMID:38438135
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研究论文 | 该文章研究了去泛素化酶USP7在早期胚胎发育中的角色 | 首次揭示USP7在早期胚胎发育过程中通过调节谱系分化和关键表观遗传修饰的作用 | 研究主要集中在小鼠胚胎上，缺乏人类胚胎的相关数据 | 探讨USP7在早期胚胎发育中的功能和机制 | 小鼠胚胎的发育过程及相关基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA干扰, 小分子抑制剂, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎，样本量不明确 |
| 384 | 2024-08-05 |
Analyzing the molecular mechanism of Scutellaria Radix in the treatment of sepsis using RNA sequencing
2024-Jul-12, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-024-09589-2
PMID:38997656
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研究论文 | 本文系统分析了黄芩根在脓毒症治疗中的分子机制 | 研究基于网络药理学、RNA测序和分子对接，揭示了黄芩根活性成分与靶点之间的关系 | 研究可能受样本量和个体差异的限制 | 探讨黄芩根对脓毒症的治疗作用及其分子机制 | 脓毒症患者与健康志愿者 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者和健康志愿者的样本 |
| 385 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals plasmid constrains bacterial population heterogeneity and identifies a non-conjugating subpopulation
2024-Jul-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49793-x
PMID:38997267
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研究论文 | 该文章研究了质粒与细菌亚群形成的关系 | 本研究揭示了质粒如何限制细菌群体异质性并识别出不进行结合传递的细胞亚群 | 文章未提及实验的特定局限性 | 研究质粒与细菌亚群形成之间的相互关系 | 细菌亚群体和质粒载体 | 微生物学 | NA | 微生物分裂池连接转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 386 | 2024-08-04 |
[Isolation and characterization of normal mandibular periosteal stem cells from human and macaca mulatta and cross-species single-cell analysis]
2024-Jul-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本文研究了人类和猕猴下颌骨膜干细胞的分离和特征化。 | 首次稳定分离和鉴定正常下颌骨膜干细胞，提供了研究下颌骨膜内膜成骨机制的细胞基础。 | 研究未涉及更多动物模型和临床应用的长时间随访数据。 | 探讨人类和非人灵长类动物下颌骨膜中不同于间充质干细胞的干细胞群体的特性。 | 研究对象为人类和猕猴的下颌骨膜干细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 人类18-24岁患者的下颌膜和6岁猕猴的下颌膜 |
| 387 | 2024-08-07 |
TMEM176B Promotes EMT via FGFR/JNK Signalling in Development and Tumourigenesis of Lung Adenocarcinoma
2024-Jul-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16132447
PMID:39001509
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研究论文 | 本研究探讨了TMEM176B在肺腺癌发展中的作用及其通过FGFR/JNK信号通路促进EMT的机制 | 本研究首次揭示了TMEM176B在肺腺癌中的表达增强及其与较短总生存期的关联，并证明了TMEM176B通过FGFR1/JNK/Vimentin/Snail信号通路调控EMT | NA | 探索TMEM176B作为肺腺癌治疗潜在靶点的可能性 | TMEM176B在肺腺癌发展中的作用及其分子机制 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞测序, 蛋白质组学, Co-IP | NA | 组织 | 肺腺癌组织样本 |
| 388 | 2024-08-05 |
PFHpA alters lipid metabolism and increases the risk of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease in youth-a translational research framework
2024-Jul-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.07.01.24309775
PMID:39006440
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研究论文 | 本文研究了PFHpA对青少年代谢功能障碍相关脂肪肝病的风险影响 | 本研究首次探讨了PFHpA在青少年中与MASLD风险和进展之间的关系，提供了新策略来识别高风险个体 | 研究的局限性在于尚未全面人类研究PFAS对MASLD的影响 | 旨在识别和理解PFHpA如何影响MASLD的风险和进展 | 研究对象为肥胖青少年及其肝脏代谢 | 数字病理学 | 肝疾病 | 单细胞转录组学 | 3D人肝球体 | 多组学数据 | NA |
| 389 | 2024-08-05 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病小鼠模型中的作用 | 发现了一种独特的杆状微胶质细胞亚群，它通过与神经元树突和兴奋性突触输入的相互作用来抑制运动皮层的过度兴奋性 | 本研究仅在小鼠模型中进行，尚需在人类疾病中验证 | 研究微胶质细胞在运动皮层电活动调控中的作用 | 使用TDP-43神经退行性疾病小鼠模型中的微胶质细胞 | 数字病理 | 肌萎缩侧索硬化症 | 多通道探针记录和纵向钙成像 | NA | 细胞RNA测序 | rNLS8小鼠模型中的实验样本 |
| 390 | 2024-08-05 |
Exploring the Pathogenesis of Autoimmune Liver Diseases from the Heterogeneity of Target Cells
2024-Jul-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2023.00531
PMID:38993508
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review | 本综述探讨了靶细胞异质性对自身免疫性肝病病因学的影响 | 提出了靶细胞的异质性为自身免疫性肝病的病因学提供了新的见解 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果 | 研究自身免疫性肝病的病因机制及潜在治疗策略 | 主要关注肝细胞和胆管细胞的异质性 | 数字病理学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-05 |
Myeloid-T cell interplay and cell state transitions associated with checkpoint inhibitor response in melanoma
2024-Jul-12, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.03.015
PMID:38593812
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研究论文 | 该文章探讨了黑色素瘤中髓系细胞与T细胞之间的相互作用及其在检查点抑制剂反应中的细胞状态转变 | 揭示了检查点抑制剂反应前肿瘤免疫微环境的特征，提出通过调节髓系细胞和效应细胞的相互作用以改善免疫治疗反应的可能性 | 研究主要限于22名阶段III-IV转移性黑色素瘤患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨免疫治疗前肿瘤微环境与黑色素瘤患者对检查点抑制剂反应之间的关系 | 22名检查点抑制剂初治的阶段III-IV转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22名患者的肿瘤免疫浸润细胞和外周血单核细胞 |
| 392 | 2024-08-05 |
Targeting CSF1R in myeloid-derived suppressor cells: insights into its immunomodulatory functions in colorectal cancer and therapeutic implications
2024-Jul-11, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02584-4
PMID:38992688
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研究论文 | 本研究探讨了CSF1R在结直肠癌中的免疫调节功能及其对骨髓源抑制细胞的影响 | 探讨了CSF1R和JAK/STAT3信号轴在结直肠癌免疫抑制中的关键作用，并评估了LNCs@CSF1R siRNA与抗PD-1联合治疗的疗效 | 研究的样本仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类结直肠癌中的相应机制 | 研究骨髓源抑制细胞在结直肠癌中的免疫抑制作用 | 主要研究小鼠模型中的骨髓源抑制细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠结直肠癌模型 |
| 393 | 2024-08-04 |
Deconwolf enables high-performance deconvolution of widefield fluorescence microscopy images
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02294-7
PMID:38844629
|
研究论文 | 本研究开发了Deconwolf，一种用于高性能去卷积宽场荧光显微镜图像的开源软件 | Deconwolf能够在普通笔记本电脑上高效运行，并显著提高了在DNA和RNA原位杂交图像中分辨拥挤荧光点的准确性 | 此文未提及具体的局限性 | 旨在克服传统显微镜方法在拥挤分子靶标分辨率上的限制 | 研究针对DNA和RNA原位杂交图像的荧光点及细胞切片中的个体转录本 | 数字病理学 | NA | 荧光显微镜 | NA | 图像 | NA |
| 394 | 2024-08-05 |
CellRank 2: unified fate mapping in multiview single-cell data
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02303-9
PMID:38871986
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研究论文 | 提出了CellRank 2框架，用于统一研究多视角单细胞数据中的细胞命运 | CellRank 2能够结合多种数据视角和时间点信息，提供了对细胞命运的深入分析 | 尚未提及具体的局限性 | 研究细胞的命运映射和动态变化 | 单细胞转录组数据，涉及人类造血和内胚层发育 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 多达数百万个细胞的单细胞数据 |
| 395 | 2024-08-05 |
Partitioning and aggregating cross-tissue and tissue-specific genetic effects to identify gene-trait associations
2024-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49924-4
PMID:38982044
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研究论文 | 本文提出了MTWAS框架，用于识别基因-性状关联并增强TWAS和GWAS的信息利用 | 引入了一种非参数插补策略来增强不可获取组织的信息，并基于扩展贝叶斯信息准则将eQTL分类为跨组织和特定组织的eQTL | 未提及具体的局限性 | 开发一种新的统计框架MTWAS，以识别基因-性状关联 | 对GTEx数据集的47个组织和其他数据集中的免疫细胞类型进行基因预测和分析 | 生物统计学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 84项UK Biobank GWAS研究和其他数据集的样本 |
| 396 | 2024-08-04 |
Deep 3D histology powered by tissue clearing, omics and AI
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02327-1
PMID:38997593
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研究论文 | 本文讨论了通过3D组织组织学技术综合理解组织和生物体生理及病理生理的重要性 | 提出了一种结合组织清理化学、标记和体积成像的新技术，以增强3D重建，并与分子技术协同作用 | 缺乏针对具体应用案例的实证数据支持 | 创建完整的三维细胞图谱，以全面理解组织和生物体的生理和病理 | 涉及组织样本和细胞的3D空间结构及其分子组成 | 数字病理学 | NA | 组织清理化学、体积成像 | 深度学习 | 细胞结构和分子数据 | NA |
| 397 | 2024-08-05 |
Diversification of the VH3-53 immunoglobulin gene segment by somatic hypermutation results in neutralization of SARS-CoV-2 virus variants
2024-Jul, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451056
PMID:38593351
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研究论文 | 该研究揭示了通过体细胞超突变，VH3-53免疫球蛋白基因片段的多样化如何导致对SARS-CoV-2病毒变异体的中和作用 | 文章创新性地展示了特定B细胞克隆的体细胞超突变如何增加单克隆抗体的中和范围 | 研究中对B细胞克隆扩增的机制缺乏深入分析 | 本研究旨在探讨COVID-19恢复患者的B细胞如何通过超突变生成能够中和病毒变异体的抗体 | 研究对象为从SARS-CoV-2恢复患者中获得的针对刺突蛋白特异性B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 来自一名SARS-CoV-2恢复患者的B细胞样本 |
| 398 | 2024-08-05 |
Clustering single-cell RNA sequencing data via iterative smoothing and self-supervised discriminative embedding
2024-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03074-5
PMID:38834657
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据的深层聚类方法scRISE，旨在解决聚类过程中的相似性度量挑战 | 提出了基于图自编码器的迭代平滑模块和自我监督的鉴别嵌入模块的新方法来改进数据表示和聚类质量 | 在文章中没有明确提到具体的局限性 | 研究单细胞转录组测序数据的聚类分析 | 用于单细胞RNA测序的17个数据集及HNSCC数据集 | 数字病理学 | NA | NA | 深度聚类模型 | 单细胞RNA测序数据 | 17个单细胞RNA测序数据集 |
| 399 | 2024-08-05 |
Identification of ferroptosis-related gene signature for tuberculosis diagnosis and therapy efficacy
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110182
PMID:38989455
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研究论文 | 本文识别了与铁死亡相关的基因特征，旨在用于结核病的诊断和疗效评估 | 提出了一种包含ACSL4、CTSB和TLR4基因的铁死亡相关基因特征，作为结核病的生物标志物 | 研究主要依赖于血液样本，可能无法全面代表结核病患者的情况 | 探讨铁死亡相关基因特征在结核病诊断和治疗中的应用 | 结核病患者、潜伏结核感染者和健康对照者的血液样本 | 数字病理学 | 结核病 | scRNA-seq、微阵列和大规模RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组基因表达数据，涉及结核病患者、潜伏感染者和健康对照者 |
| 400 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals that NRF2 regulates vascular smooth muscle cell phenotypic switching in abdominal aortic aneurysm
2024-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400001RR
PMID:38995239
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研究论文 | 研究表明NRF2在腹主动脉瘤中调节血管平滑肌细胞表型转变 | 识别NRF2作为维持血管平滑肌细胞收缩表型的重要调节因子，并且通过miR-145依赖性机制影响腹主动脉瘤形成 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能存在物种间差异 | 深入理解NRF2在血管平滑肌细胞表型转变中的作用 | 血管平滑肌细胞及其在腹主动脉瘤形成中的反应 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组转录组数据 | NA |