单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-04 |
Exploring the causal role of immune cells in cerebral aneurysm through single-cell transcriptomics and Mendelian randomization analysis
2024-Jul-12, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxae042
PMID:38661482
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研究论文 | 本研究探讨了免疫细胞在脑动脉瘤形成中的因果作用 | 通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了免疫细胞与脑动脉瘤发展的复杂相互作用 | 研究主要基于单一数据集，可能无法全面反映所有因素 | 研究免疫细胞在脑动脉瘤发病机制中的作用 | 未破裂的脑动脉瘤及其对照组 | 数字病理学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化 | 基因表达数据 | 来自GSE193533数据集的样本数量不明确 |
| 382 | 2024-08-05 |
Myeloid-T cell interplay and cell state transitions associated with checkpoint inhibitor response in melanoma
2024-Jul-12, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.03.015
PMID:38593812
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研究论文 | 该文章探讨了黑色素瘤中髓系细胞与T细胞之间的相互作用及其在检查点抑制剂反应中的细胞状态转变 | 揭示了检查点抑制剂反应前肿瘤免疫微环境的特征，提出通过调节髓系细胞和效应细胞的相互作用以改善免疫治疗反应的可能性 | 研究主要限于22名阶段III-IV转移性黑色素瘤患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨免疫治疗前肿瘤微环境与黑色素瘤患者对检查点抑制剂反应之间的关系 | 22名检查点抑制剂初治的阶段III-IV转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22名患者的肿瘤免疫浸润细胞和外周血单核细胞 |
| 383 | 2024-08-05 |
Targeting CSF1R in myeloid-derived suppressor cells: insights into its immunomodulatory functions in colorectal cancer and therapeutic implications
2024-Jul-11, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02584-4
PMID:38992688
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研究论文 | 本研究探讨了CSF1R在结直肠癌中的免疫调节功能及其对骨髓源抑制细胞的影响 | 探讨了CSF1R和JAK/STAT3信号轴在结直肠癌免疫抑制中的关键作用，并评估了LNCs@CSF1R siRNA与抗PD-1联合治疗的疗效 | 研究的样本仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类结直肠癌中的相应机制 | 研究骨髓源抑制细胞在结直肠癌中的免疫抑制作用 | 主要研究小鼠模型中的骨髓源抑制细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠结直肠癌模型 |
| 384 | 2024-08-04 |
Deconwolf enables high-performance deconvolution of widefield fluorescence microscopy images
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02294-7
PMID:38844629
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研究论文 | 本研究开发了Deconwolf，一种用于高性能去卷积宽场荧光显微镜图像的开源软件 | Deconwolf能够在普通笔记本电脑上高效运行，并显著提高了在DNA和RNA原位杂交图像中分辨拥挤荧光点的准确性 | 此文未提及具体的局限性 | 旨在克服传统显微镜方法在拥挤分子靶标分辨率上的限制 | 研究针对DNA和RNA原位杂交图像的荧光点及细胞切片中的个体转录本 | 数字病理学 | NA | 荧光显微镜 | NA | 图像 | NA |
| 385 | 2024-08-05 |
CellRank 2: unified fate mapping in multiview single-cell data
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02303-9
PMID:38871986
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研究论文 | 提出了CellRank 2框架，用于统一研究多视角单细胞数据中的细胞命运 | CellRank 2能够结合多种数据视角和时间点信息，提供了对细胞命运的深入分析 | 尚未提及具体的局限性 | 研究细胞的命运映射和动态变化 | 单细胞转录组数据，涉及人类造血和内胚层发育 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 多达数百万个细胞的单细胞数据 |
| 386 | 2024-08-05 |
Partitioning and aggregating cross-tissue and tissue-specific genetic effects to identify gene-trait associations
2024-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49924-4
PMID:38982044
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研究论文 | 本文提出了MTWAS框架，用于识别基因-性状关联并增强TWAS和GWAS的信息利用 | 引入了一种非参数插补策略来增强不可获取组织的信息，并基于扩展贝叶斯信息准则将eQTL分类为跨组织和特定组织的eQTL | 未提及具体的局限性 | 开发一种新的统计框架MTWAS，以识别基因-性状关联 | 对GTEx数据集的47个组织和其他数据集中的免疫细胞类型进行基因预测和分析 | 生物统计学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 84项UK Biobank GWAS研究和其他数据集的样本 |
| 387 | 2024-08-04 |
Deep 3D histology powered by tissue clearing, omics and AI
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02327-1
PMID:38997593
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研究论文 | 本文讨论了通过3D组织组织学技术综合理解组织和生物体生理及病理生理的重要性 | 提出了一种结合组织清理化学、标记和体积成像的新技术，以增强3D重建，并与分子技术协同作用 | 缺乏针对具体应用案例的实证数据支持 | 创建完整的三维细胞图谱，以全面理解组织和生物体的生理和病理 | 涉及组织样本和细胞的3D空间结构及其分子组成 | 数字病理学 | NA | 组织清理化学、体积成像 | 深度学习 | 细胞结构和分子数据 | NA |
| 388 | 2024-08-05 |
Diversification of the VH3-53 immunoglobulin gene segment by somatic hypermutation results in neutralization of SARS-CoV-2 virus variants
2024-Jul, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451056
PMID:38593351
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研究论文 | 该研究揭示了通过体细胞超突变，VH3-53免疫球蛋白基因片段的多样化如何导致对SARS-CoV-2病毒变异体的中和作用 | 文章创新性地展示了特定B细胞克隆的体细胞超突变如何增加单克隆抗体的中和范围 | 研究中对B细胞克隆扩增的机制缺乏深入分析 | 本研究旨在探讨COVID-19恢复患者的B细胞如何通过超突变生成能够中和病毒变异体的抗体 | 研究对象为从SARS-CoV-2恢复患者中获得的针对刺突蛋白特异性B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 来自一名SARS-CoV-2恢复患者的B细胞样本 |
| 389 | 2024-08-05 |
Clustering single-cell RNA sequencing data via iterative smoothing and self-supervised discriminative embedding
2024-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03074-5
PMID:38834657
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据的深层聚类方法scRISE，旨在解决聚类过程中的相似性度量挑战 | 提出了基于图自编码器的迭代平滑模块和自我监督的鉴别嵌入模块的新方法来改进数据表示和聚类质量 | 在文章中没有明确提到具体的局限性 | 研究单细胞转录组测序数据的聚类分析 | 用于单细胞RNA测序的17个数据集及HNSCC数据集 | 数字病理学 | NA | NA | 深度聚类模型 | 单细胞RNA测序数据 | 17个单细胞RNA测序数据集 |
| 390 | 2024-08-05 |
Identification of ferroptosis-related gene signature for tuberculosis diagnosis and therapy efficacy
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110182
PMID:38989455
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研究论文 | 本文识别了与铁死亡相关的基因特征，旨在用于结核病的诊断和疗效评估 | 提出了一种包含ACSL4、CTSB和TLR4基因的铁死亡相关基因特征，作为结核病的生物标志物 | 研究主要依赖于血液样本，可能无法全面代表结核病患者的情况 | 探讨铁死亡相关基因特征在结核病诊断和治疗中的应用 | 结核病患者、潜伏结核感染者和健康对照者的血液样本 | 数字病理学 | 结核病 | scRNA-seq、微阵列和大规模RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组基因表达数据，涉及结核病患者、潜伏感染者和健康对照者 |
| 391 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals that NRF2 regulates vascular smooth muscle cell phenotypic switching in abdominal aortic aneurysm
2024-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400001RR
PMID:38995239
|
研究论文 | 研究表明NRF2在腹主动脉瘤中调节血管平滑肌细胞表型转变 | 识别NRF2作为维持血管平滑肌细胞收缩表型的重要调节因子，并且通过miR-145依赖性机制影响腹主动脉瘤形成 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能存在物种间差异 | 深入理解NRF2在血管平滑肌细胞表型转变中的作用 | 血管平滑肌细胞及其在腹主动脉瘤形成中的反应 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组转录组数据 | NA |
| 392 | 2024-08-07 |
Erratum for the Research Article "Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations to lupus" by R. K. Perez et al
2024-Jul-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr4064
PMID:38991087
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-04 |
Unbiasedly decoding the tumor microenvironment with single-cell multiomics analysis in pancreatic cancer
2024-Jul-09, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02050-7
PMID:38982491
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研究论文 | 本文总结了胰腺癌肿瘤微环境的单细胞多组学分析研究 | 提供了一种无偏见的方式对胰腺癌肿瘤微环境进行解码，强调了每种细胞成分的功能和分类基础 | 研究可能未能全面评估所有细胞簇的功能及其在抗肿瘤中的潜力 | 旨在精确识别胰腺癌肿瘤微环境中的所有细胞簇并提供新的见解 | 关注胰腺导管腺癌的肿瘤微环境及其单细胞组成 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序和质谱技术 | NA | 多组学数据 | NA |
| 394 | 2024-08-05 |
A novel CAF-cancer cell crosstalk-related gene prognostic index based on machine learning: prognostic significance and prediction of therapeutic response in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Jul-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05447-6
PMID:38982511
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研究论文 | 本研究开发了一种与肿瘤相关成纤维细胞-癌细胞相互作用相关的预后指数，以评估头颈部鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 提出了一种新颖的肿瘤相关成纤维细胞-癌细胞相互作用相关基因预后指数（CCRGPI），可用于评估头颈部鳞状细胞癌的预后和免疫检验点抑制剂的疗效 | 研究未涉及其他类型癌症的适用性，局限于头颈部鳞状细胞癌 | 旨在评估头颈部鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者及其相关的细胞模型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），LASSO回归 | FCICC模型和FC-organoid模型 | 基因组数据 | NA |
| 395 | 2024-08-07 |
Correction to: Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae022
PMID:38981583
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-05 |
GHCU, a Molecular Chaperone, Regulates Leaf Curling by Modulating the Distribution of KNGH1 in Cotton
2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402816
PMID:38666376
|
研究论文 | 该研究揭示了GHCU作为关键调节因子在棉花叶片展平中的作用 | 首次识别GHCU作为叶片形态发生的致因基因，并阐明其通过调节KNGH1分布影响生长素反应的机制 | 缺乏对GHCU在其他植物中功能的广泛验证 | 研究GHCU基因在棉花叶片形态发生中的作用 | 天然棉花突变体cu及相关的转基因棉花和烟草 | 遗传学 | NA | CRISPR | NA | 单细胞RNA测序数据及时空转录组数据 | NA |
| 397 | 2024-08-05 |
BirthSeq, a new method to isolate and analyze dated cells in different vertebrates
2024-Jul-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202429
PMID:38856078
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方法BirthSeq，用于根据细胞出生日期隔离和分析细胞。 | BirthSeq是一个创新的方法，能够进行体内标记、利用荧光激活细胞分选隔离细胞，并通过高通量技术分析。 | 尚未提及BirthSeq在其他物种或条件下的适用性和局限性。 | 研究开发一种新的实验工具，以理解时间如何转化为驱动细胞命运的遗传指令。 | 研究对象为不同脊椎动物的发育器官中的细胞。 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 三种脊椎动物（小鼠、雏鸡和壁虎）的发育器官样本 |
| 398 | 2024-08-05 |
Unraveling dynamic immunological landscapes in intracerebral hemorrhage: insights from single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.635
PMID:38988493
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组剖析，揭示了脑内出血后的免疫学动态格局 | 首次从单细胞分辨率层面探讨了脑内出血后免疫细胞动态及其空间分布 | 临床试验的失败可能归因于细胞异质性和复杂的细胞间网络 | 揭示脑内出血后免疫学的动态变化和空间分布 | 针对脑内出血后的免疫细胞群体进行分析 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 在超急性、急性和亚急性三个不同时间点的样本 |
| 399 | 2024-08-05 |
Interleukin-7-based identification of liver lymphatic endothelial cells reveals their unique structural features
2024-Jul, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101069
PMID:38966234
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研究论文 | 本文识别了肝脏淋巴内皮细胞的独特结构特征，并发现了IL7作为其特有标记物 | 创新点在于首次确定IL7为肝脏淋巴内皮细胞的特有标记，并建立了淋巴内皮细胞的分离方法 | 研究仅基于小鼠肝脏细胞，尚需在人体样本中验证IL7标记的有效性 | 探索肝脏淋巴内皮细胞的特征以及其在肝脏损伤过程中的转录组变化 | 小鼠肝脏中的淋巴内皮细胞（LyEC） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 小鼠样本，具体数量未提及 |
| 400 | 2024-08-04 |
Identification of signaling pathways that specify a subset of migrating enteric neural crest cells at the wavefront in mouse embryos
2024-Jul-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.034
PMID:38636517
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研究论文 | 该文章探讨了小鼠胚胎中波前肠神经嵴细胞的信号通路 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了波前ENCCs的分子动态和关键信号通路 | 尚未完全理解分子机制及其与周围细胞的相互作用 | 理解肠神经系统发展中的细胞迁移和信号通路 | 小鼠胚胎的波前肠神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | 小鼠胚胎样本 |