单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 493 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-04 |
scSemiProfiler: Advancing large-scale single-cell studies through semi-profiling with deep generative models and active learning
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50150-1
PMID:39013867
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为“scSemiProfiler”的创新计算框架，用于大规模单细胞研究的半概况化。 | 将深度生成模型与主动学习策略相结合，从而在大规模队列中推断单细胞谱系。 | 往往依赖于严格选择的代表性样本，可能对样本选择的质量有较高要求。 | 实现对单细胞的高效、经济的分析。 | 主要研究大型生物医学研究中细胞类型的分析。 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | NA | 混合测序数据和单细胞测序数据 | 多组异质数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity and key subsets of tissue-resident memory T cells in cervical cancer
2024-Jul-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00637-3
PMID:39014148
|
研究论文 | 本研究分析了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的细胞异质性及其关键亚群 | 首次揭示了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的异质性及其在免疫反应中的作用 | 研究仅基于有限的样本数量和组织来源，可能无法涵盖所有的细胞特性 | 探讨组织驻留记忆T细胞在宫颈癌中的异质性及其对癌症免疫的贡献 | 来自11个宫颈癌组织和5个正常宫颈组织的组织驻留记忆T细胞及非组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12945个组织驻留记忆T细胞和25627个非组织驻留记忆T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-05 |
Establishing an oxidative stress mitochondria-related prognostic model in hepatocellular carcinoma based on multi-omics characteristics and machine learning computational framework
2024-Jul-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01147-1
PMID:39014263
|
研究论文 | 本文建立了一种基于多组学特征和机器学习计算框架的氧化应激线粒体相关预后模型，用于肝细胞癌的预测 | 采用多种机器学习算法构建了一种包含26个基因的共识氧化应激线粒体相关标志物，并筛选出6个具有良好预后价值的基因 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能存在数据异质性和外部验证不足的问题 | 本文旨在探讨线粒体功能与氧化应激在肝细胞癌中的预后价值 | 研究对象为肝细胞癌患者的基因表达数据 | 机器学习 | 肝癌 | 基因表达分析，机器学习 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用来自TCGA、GEO和ICGC的HCC样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-05 |
Single cell profiling to determine influence of wheeze and early-life viral infection on developmental programming of airway epithelium
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602506
PMID:39026695
|
研究论文 | 本研究旨在表征哮喘儿童气道上皮的发育表型及其与早期呼吸道病毒感染的关系 | 研究发现哮喘儿童的气道上皮在发育过程中表现出异常分化和基底细胞活化，这为理解哮喘的生物学基础提供了新见解 | 该研究主要集中于特定年龄段的儿童，可能无法代表所有年龄组的情况 | 探索幼儿哮喘与早期RSV感染对气道上皮发育编程的影响 | 从不同组别的哮喘与非哮喘儿童中收集的鼻气道上皮细胞 | 数字病理学 | 幼儿哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 共计涉及来自四个相互排斥组的儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-05 |
T-distributed Stochastic Neighbor Network for unsupervised representation learning
2024-Jul-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2024.106520
PMID:39024709
|
研究论文 | 本文提出了一种简单的端到端T-分布随机邻居网络（TsNet）用于无监督表示学习和聚类下游任务 | 引入了适应性连接分布学习模块和基于T-分布随机邻居嵌入的损失函数，显著提高了表示的区分度 | 未提及具体的局限性 | 探索如何从通用数据中提取有意义的结构信息 | 通用数据的聚类表示学习，包括向量、图像和表格数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | TsNet | 图像，文本 | 涉及真实单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集的聚类 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-04 |
Applications of single-cell multi-omics in liver cancer
2024-Jul, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101094
PMID:39022385
|
综述 | 本文探讨了单细胞多组学在肝癌研究中的应用。 | 强调通过整合多种单模态技术到单细胞分辨率的多组学方法中，推动个体化治疗的发展。 | 当前单细胞多组学在肝癌研究中的应用仍然有限。 | 旨在深入理解肝癌的生物学及其临床影响。 | 主要关注肝细胞癌（HCC）的细胞异质性及其治疗反应机制。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-05 |
Unveiling mitochondrial and ribosomal gene deregulation and tumor microenvironment dynamics in acute myeloid leukemia
2024-Jul, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00788-2
PMID:38806621
|
研究论文 | 该研究揭示了急性髓系白血病中线粒体和核糖体基因的失调及肿瘤微环境的动态 | 使用机器学习方法重新分析scRNA-seq数据，识别急性髓系白血病中枝状细胞的基因模块失调和免疫信号通路的失衡 | 研究可能受到样本规模和数据来源的限制 | 深入理解急性髓系白血病细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 急性髓系白血病患者的细胞与基因表达数据 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | scRNA-seq | 正常Cox模型和人工神经网络模型 | 基因表达数据 | CSC和G20队列的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-05 |
Translational regulation enhances distinction of cell types in the nervous system
2024-Jul-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90713
PMID:39010741
|
研究论文 | 这篇文章揭示了转录后调控在神经系统细胞类型区分中的重要性 | 研究首次将转录后调控与细胞类型特异性蛋白表达联系起来，为理解细胞多样性的分子机制提供了新见解 | 研究仅在特定的转基因小鼠模型中进行，可能不适用于所有类型的神经细胞 | 揭示转录后调控对神经系统细胞类型区分的影响 | 研究基因定义的脑细胞的转录组和翻译组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq | NA | RNA数据 | 基因定义的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-04 |
Single-cell total-RNA profiling unveils regulatory hubs of transcription factors
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50291-3
PMID:39009595
|
研究论文 | 本文开发了一种基于总RNA的单细胞RNA测序方法snapTotal-seq，并展示其在转录因子调控中的应用 | 创新性地提出了一种同时测量未剪接RNA和剪接RNA的一步总RNA化学方法 | 只对单细胞RNA-seq化学的表现进行了比较，未评估其在其他细胞类型或条件下的适用性 | 本研究旨在通过新的方法深入了解基因调控，特别是在细胞状态转变中的调控机制 | 研究对象包括单细胞中的转录因子及其调控的细胞周期和衰老 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | LASSO回归 | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics analysis of bullous pemphigoid unveils immune-stromal crosstalk in type 2 inflammatory disease
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50283-3
PMID:39009587
|
研究论文 | 本研究揭示了水疱性皮肤病中免疫-基质间的相互作用。 | 首次识别IL13-IL13RA1配体-受体对作为水疱性皮肤病中免疫-基质互动的重要介质。 | 未提供关于样本数量和具体实验条件的详细信息。 | 全面了解水疱性皮肤病的免疫景观，特别是免疫-基质之间的相互作用。 | 研究T细胞、树突状细胞和成纤维细胞等关键细胞群体。 | 数字病理学 | 水疱性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-05 |
Generation of musculoskeletal cells from human urine epithelium-derived presomitic mesoderm cells
2024-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01274-w
PMID:39010176
|
研究论文 | 本研究探讨了从人尿上皮衍生的前体中胚层细胞生成肌肉骨骼细胞的过程。 | 本研究首次展示了UiPSM细胞的分化潜力，并证明其在移植后能够形成成熟的骨骼肌细胞。 | 研究未详细探讨UiPSM细胞在不同体内环境下的长期表现及其潜在的不良反应。 | 研究UiPSM细胞的分化潜力及其在肌肉骨骼发展中的应用。 | 本研究主要对象为从人尿上皮提取的UiPSM细胞及其衍生的骨骼肌细胞。 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 生物发光成像，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞培养，生物成像 | 使用了在MITRG小鼠前胫肌中的UiPSM细胞移植进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-04 |
Advance and Application of Single-cell Transcriptomics in Auditory Research
2024-Jul, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01149-z
PMID:38015350
|
综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在听觉研究中的应用 | 文章创新性地应用单细胞RNA测序技术揭示听觉器官中细胞的复杂生物机制 | 对于内耳的细胞异质性及其有限的细胞数量的深入研究仍然不足 | 本研究旨在提供听觉器官发展的参考、听力损失的发病机制以及再生疗法的基础 | 研究对象为听觉器官中的不同类型细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-04 |
Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics
2024-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.04.015
PMID:38692412
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究肾移植排斥反应的潜力 | 结合公共单细胞RNA测序数据，首次应用空间转录组学技术研究肾移植排斥反应 | 关于该技术的发展和未来应用的限制需要考虑 | 研究肾移植排斥反应的分子和细胞机制 | 分析非排斥、T细胞介导的急性排斥、间质纤维化和肾小管萎缩的活检样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 活检样本 | 多种病理状态下的活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing advances in research on mesenchymal stem/stromal cells
2024-Jul, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01076-9
PMID:38743204
|
综述 | 本文回顾了单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用及其前景 | 强调了单细胞测序技术在揭示间充质干细胞异质性和分子特征中的重要性 | 未提及具体的局限性 | 审视单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞（MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-07 |
Decoding the building blocks of cellular processes from single-cell transcriptomics data
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01967-6
PMID:37735267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptome atlas of human euploid and aneuploid blastocysts
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01788-6
PMID:38839885
|
研究论文 | 该文章探讨了人类正常和非正常胚泡的单细胞转录组图谱 | 本研究首次系统性地分析了人类非正常胚泡中转录组的改变，揭示了基因剂量效应和特定信号通路的影响 | 研究主要集中于初期的人类胚泡，可能无法完全推及其他发育阶段或物种 | 了解非正常胚泡中染色体异常如何影响细胞功能和胚胎发育 | 203个人类正常与非正常胚泡中的14,908个单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 203个胚泡包含14,908个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-05 |
Microwave ablation combined with PD-L1 blockade synergistically promotes Cxcl9-mediated antitumor immunity
2024-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16182
PMID:38655660
|
研究论文 | 本研究探讨了微波消融与PD-L1拮抗，协同促进Cxcl9介导的抗肿瘤免疫 | 发表了微波消融结合抗PD-L1治疗对肿瘤免疫的改善作用的新发现 | 研究局限于小鼠模型，临床应用尚需进一步验证 | 探究微波消融与PD-L1拮抗结合对结直肠癌肝转移防治的潜力 | 使用经过微波消融的前临床小鼠模型进行研究 | 数字病理 | 结直肠癌 | 微波消融和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本和肿瘤细胞 | 小鼠模型，样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-05 |
Quantification and statistical modeling of droplet-based single-nucleus RNA-sequencing data
2024-Jul-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxad010
PMID:37257175
|
研究论文 | 本研究探讨了基于液滴的单核RNA测序数据的量化和统计建模 | 系统评估了基于液滴的单核RNA测序数据的概率分布，并发现其符合负二项分布 | 未能详细分析所有可能的量化映射策略 | 准确建模单核RNA测序数据，以改进下游分析 | 使用小鼠皮层和肾脏的单核RNA测序数据进行研究 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠皮层和肾脏的伪阴性对照数据 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-05 |
IRF8 configures enhancer landscape in postnatal microglia and directs microglia specific transcriptional programs
2024-Jul-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.25.546453
PMID:37645844
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF8在后天小胶质细胞发育中的作用 | IRF8通过结合增强子区域调控小胶质细胞特异性的转录程序，揭示了其在小胶质细胞发育中的关键作用 | 研究未涉及IRF8在其他类型免疫细胞中的潜在作用 | 了解IRF8在后天小胶质细胞发育及特异性转录调控中的角色 | 后天发育的小胶质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | 5xFAD模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-07 |
A one-stop shop for 3D spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01847-y
PMID:39009876
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |