单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 493 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-01 |
Single-cell technologies in psoriasis
2024-07, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110242
PMID:38750947
|
综述 | 综述单细胞技术在银屑病研究中的应用，以增进对该疾病机制的理解 | 系统总结了单细胞技术在银屑病免疫微环境研究中的最新应用，涵盖单细胞转录组、蛋白质组和代谢组多层次分析，为理解银屑病发病和复发机制提供了新视角 | 未提及单细胞技术当前在银屑病研究中的具体局限性，如技术成本、数据复杂性或临床转化挑战 | 通过综述单细胞技术在银屑病中的应用，深化对银屑病发病和复发机制的理解 | 银屑病相关的免疫细胞和皮肤实质细胞及其相互作用 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞技术（包括单细胞转录组、蛋白质组、代谢组） | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞蛋白质组学，单细胞代谢组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-06-30 |
Activated Clec4nhi Neutrophils Aggravate Lung Injury in an Endothelial IGFBP7-Dependent Manner
2024-07, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0017OC
PMID:38574235
|
研究论文 | 发现活化的Clec4n高表达中性粒细胞通过内皮IGFBP7依赖性方式加重肺损伤 | 首次揭示IGFBP7在内皮细胞亚型中的差异表达及其在急性肺损伤中的致病机制，并发现Clec4n高表达中性粒细胞的新角色 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类患者中的验证尚未进行 | 探究急性肺损伤中内皮细胞不同亚型的作用及IGFBP7的分子机制 | 脂多糖诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-06-26 |
Multiomics Analyses Identify AKR1A1 as a Biomarker for Diabetic Kidney Disease
2024-07-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0540
PMID:38394643
|
研究论文 | 通过多组学分析确定AKR1A1作为糖尿病肾病的生物标志物 | 结合单细胞RNA测序、蛋白质组学、蛋白质定量性状位点和全基因组关联分析，首次揭示AKR1A1为糖尿病肾病的关键分子枢纽 | 未说明 | 利用多组学方法缩小与糖尿病肾病相关的功能基因、基因产物及相关通路，揭示其病理生理机制 | 糖尿病肾病患者 | 机器学习和生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、蛋白质定量性状位点分析、全基因组关联分析、代谢组学 | Seurat, pathfindR, limma | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢组数据 | 肾单细胞RNA测序数据集和肾皮质活检蛋白质组数据，以及纵向糖尿病心脏研究样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-06-20 |
Transcriptional analysis of primary ciliary dyskinesia airway cells reveals a dedicated cilia glutathione pathway
2024-07-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.180198
PMID:39042459
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、蛋白质组学和高级显微镜技术，分析原发性纤毛运动障碍患者的呼吸道上皮细胞，揭示了一个专门的纤毛谷胱甘肽通路 | 首次发现纤毛GSTA2通路对正常纤毛运动至关重要，并揭示了PCD患者与杂合母亲及健康个体之间独特的转录组特征 | NA | 探究原发性纤毛运动障碍的分子机制及其对多纤毛细胞的影响 | 原发性纤毛运动障碍患者、其杂合母亲和健康个体的原代培养上皮细胞，以及来自PCD患者的诱导多能干细胞 | 数字病理学 | 原发性纤毛运动障碍 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 高级显微镜, 免疫金标记 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 显微镜图像 | PCD患者、杂合母亲和健康个体的原代细胞，以及一名PCD患者的iPSCs（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-06-19 |
Imputing abundance of over 2500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.31.605432
PMID:39131290
|
研究论文 | 提出SPIDER模型，利用单细胞转录组数据预测超过2500种表面蛋白丰度，并展示其在细胞类型注释、生物标志物/靶点识别和细胞间相互作用分析中的广泛应用 | 首次实现上下文无关的零样本深度集成模型，能够大规模预测细胞表面蛋白丰度并泛化至不同组织或疾病状态 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够从单细胞转录组数据大规模预测细胞表面蛋白丰度的计算方法，并验证其泛化性能和应用价值 | 利用CITE-seq技术同时测量的表面蛋白丰度和转录表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌、结直肠癌 | 单细胞RNA-seq、CITE-seq | 深度集成模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质丰度数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 与CITE-seq结合 |
| 26 | 2026-06-19 |
Immunological landscape of human lymphoid explants during measles virus infection
2024-07-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172261
PMID:39253971
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，研究了人类淋巴组织外植体中麻疹病毒感染的免疫学景观 | 首次在人类淋巴组织外植体模型中系统描绘了麻疹病毒对不同免疫细胞亚群的感染偏好性，并揭示了感染B细胞中干扰素刺激基因转录和蛋白水平的关联 | 未提及，原文未明确说明 | 阐明麻疹病毒感染人类淋巴组织过程中的免疫学事件 | 人类淋巴组织外植体及Raji细胞 | 机器学习 | 麻疹病毒感染 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 质谱分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质组数据 | 多例供体，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-06-19 |
Targeting CEBPA to restore cellular identity and tissue homeostasis in pulmonary fibrosis
2024-07-16, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175290
PMID:39012710
|
研究论文 | 通过公开RNA-Seq数据集挖掘，发现CEBPA缺失与特发性肺纤维化有关，利用条件性敲除小鼠、单细胞RNA测序、肺类器官等方法探究其在肺纤维化和修复中的作用 | 首次建立CEBPA抑制、AT2细胞身份受损、组织稳态破坏与肺纤维化之间的直接机制联系，并发现S100A8/A9抑制剂可缓解实验性肺纤维化 | 未明确提及局限性，可能包括小鼠模型与人类疾病的差异，以及临床转化需进一步验证 | 探究CEBPA在肺纤维化中调节细胞身份和组织稳态的分子机制 | CEBPA基因及其在肺泡2型上皮细胞中的作用 | 机器学习 | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除, 肺类器官, 小分子抑制 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 条件性敲除小鼠，长期观察6个月以上，博来霉素诱导纤维化模型 | Illumina | RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公开RNA-Seq数据集分析 |
| 28 | 2026-06-19 |
Spatial transcriptomics implicates impaired BMP signaling in NF1 fracture pseudarthrosis in murine and patient tissues
2024-07-11, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176802
PMID:38990653
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术揭示了NF1骨折假关节中BMP信号受损的分子机制，并在小鼠模型和患者组织中验证了这一发现 | 首次利用空间转录组学在完整组织背景下解析NF1骨折不愈合的分子异质性，并证实了BMP信号缺陷是NF1假关节形成的关键机制 | 研究中空间转录组学的分辨率可能限制了对区域内单个细胞类型的精细解析 | 阐明NF1骨折假关节形成的分子机制，为临床使用BMP2治疗提供分子证据 | 小鼠骨折愈合组织及NF1患者假关节组织 | 空间转录组学 | 神经纤维瘤病1型（NF1）相关骨折假关节 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包含正常小鼠、Nf1Postn小鼠及一名NF1患者的假关节组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-06-19 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2024-07-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175047
PMID:38954467
|
研究论文 | 本文研究了肥胖背景下血小板反应蛋白-1（THBS1）如何促进膈肌纤维脂肪基质扩张和收缩功能障碍 | 首次揭示了THBS1在肥胖相关膈肌功能障碍中的关键作用，并通过基因敲除小鼠模型证明了THBS1缺失对膈肌的保护效应 | 未明确提及，但基于摘要可推断可能涉及动物模型向人类转化的局限性 | 阐明THBS1在肥胖诱导的膈肌纤维脂肪基质重塑和收缩功能障碍中的机制作用 | 野生型和Thbs1基因敲除小鼠的膈肌组织及纤维脂肪祖细胞 | 机器学习 | 肥胖相关呼吸功能障碍 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 野生型和Thbs1基因敲除小鼠各一组，具体样本量未明确 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-06-19 |
Single-cell RNA-Seq analysis reveals cell subsets and gene signatures associated with rheumatoid arthritis disease activity
2024-07-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178499
PMID:38954480
|
研究论文 | 通过对36名个体的外周血单核细胞进行单细胞RNA测序，揭示与类风湿关节炎疾病活动相关的细胞亚群和基因特征 | 首次在单细胞水平上识别出与类风湿关节炎疾病活动度相关的IFN激活单核细胞亚群、CD4+ T效应记忆细胞和非经典单核细胞的变化，以及中度-高度疾病活动度的基因特征 | 样本量相对有限（18例患者和18例对照），未提及功能验证或外部队列验证 | 研究类风湿关节炎疾病活动相关的细胞亚群和细胞类型特异性基因特征 | 类风湿关节炎患者和匹配对照的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 36名个体（18例RA患者和18例匹配对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-06-18 |
Psoriatic arthritis subtypes are phenocopied in humanized mice
2024-07-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178213
PMID:39114979
|
研究论文 | 通过人源化小鼠模型研究银屑病关节炎亚型的表型复制 | 首次利用人源化NSG-SGM3小鼠重现银屑病和银屑病关节炎的表型，并揭示CD8+ T细胞和免疫球蛋白在发病中的关键作用 | 未提供转基因鼠模型的长期稳定性评估和临床转化的直接证据 | 阐明银屑病关节炎的免疫发病机制并验证人源化模型作为研究平台的有效性 | 银屑病和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞、血清及记忆T细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 空间转录组学、免疫荧光 | 人源化小鼠模型 | 转录组数据、图像数据 | 未具体说明样本数量，涉及患者外周血和血清 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-06-18 |
Deciphering lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy response through an AI-driven stemness-related gene signature
2024-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18564
PMID:39046884
|
研究论文 | 通过人工智能驱动干性相关基因签名解码肺腺癌预后和免疫治疗反应 | 结合传统回归、机器学习和深度学习算法构建AI驱动的干性相关基因签名，并利用多组学数据探索其与肿瘤免疫微环境的关系 | NA | 探索肺腺癌干性相关基因在预后和免疫治疗反应中的作用 | 肺腺癌患者和细胞系 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低 | 传统回归、机器学习、深度学习集成网络 | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-06-18 |
Summary data-based Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing analyses identify immune associations with low-level LGALS9 in sepsis
2024-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18559
PMID:39044269
|
研究论文 | 通过汇总数据的孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析，发现低水平LGALS9与败血症的免疫关联 | 首次整合全基因组关联研究数据与表达数量性状位点数据，结合单细胞RNA测序揭示LGALS9抑制在单核细胞和T细胞亚型中的激活与分化机制 | NA | 深入研究败血症免疫细胞表型变化及其分子机制 | 败血症患者的免疫细胞，包括单核细胞和T细胞亚型 | 机器学习 | 败血症 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals SPP1-CD44-mediated macrophage-tumor cell interactions drive chemoresistance in TNBC
2024-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18525
PMID:38982317
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示SPP1-CD44介导的巨噬细胞与肿瘤细胞相互作用驱动三阴性乳腺癌化疗耐药 | 首次发现SPP1+巨噬细胞通过分泌SPP1信号与恶性细胞表面CD44相互作用，激活整合素通路下游PDE3B通路，从而驱动化疗耐药，并提出SPP1+巨噬细胞可作为治疗靶点 | 样本量较小（仅5例敏感和5例耐药患者），且未在更大规模队列或体内模型中验证该机制 | 探究三阴性乳腺癌化疗耐药的分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者的巨噬细胞和恶性细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 临床样本图像 | 10例三阴性乳腺癌患者（5例化疗敏感，5例耐药） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603155
PMID:39071344
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，揭示了第一孕期绒毛膜板和基底板细胞滋养层细胞与滋养层干细胞之间的差异 | 首次在单细胞水平上比较了第一孕期不同胎盘区域（绒毛膜板和基底板）的细胞滋养层细胞与滋养层干细胞，发现了滋养层干细胞更倾向于分化为绒毛外滋养层细胞而非合体滋养层细胞 | 研究仅基于6个正常胎盘样本，样本量较小；TSC系可能不完全代表体内所有CTB亚型 | 探究第一孕期细胞滋养层细胞的转录多样性，并比较滋养层干细胞与不同CTB亚群的相似性 | 6个第一孕期正常胎盘（4个早期6-8周，2个晚期12-14周）和3个TSC系 | 单细胞转录组学 | 正常胎盘发育 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个胎盘组织样本（4个早期第一孕期，2个晚期第一孕期）和3个TSC细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 36 | 2026-06-17 |
Single-cell analyzing of tumor microenvironment and cell adhesion between early and late-stage lung cancer
2024-07, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.04.013
PMID:38696904
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早期与晚期肺腺癌的肿瘤微环境及细胞黏附差异，发现TNS1基因在早期肿瘤细胞中高表达并可能作为预后标志物 | 首次系统揭示TNS1基因家族在早期肺腺癌中的高表达与细胞黏附功能关联，并发现其通过Akt/mTOR信号通路调控肿瘤进展 | 研究主要依赖公共数据库数据（GEO和TCGA），缺乏独立队列验证；TNS1的功能机制仍需更多体外和体内实验证实 | 阐明早期与晚期肺腺癌肿瘤微环境差异及细胞黏附机制 | 肺腺癌肿瘤微环境中的上皮细胞、成纤维细胞及肿瘤细胞 | 单细胞测序 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | GEO数据库中的肺腺癌单细胞RNA测序样本，TCGA数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-05-30 |
TGF-β1 mediates hypoxia-preconditioned olfactory mucosa mesenchymal stem cells improved neural functional recovery in Parkinson's disease models and patients
2024-07-22, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00550-7
PMID:39034405
|
研究论文 | 本文研究了低氧预处理嗅黏膜间充质干细胞通过TGF-β1信号通路改善帕金森病模型和患者的神经功能恢复 | 首次在临床级低氧预处理嗅黏膜间充质干细胞治疗帕金森病的研究中，结合单细胞RNA测序、ATAC-seq和全长转录本异构体测序等多种技术，揭示TGF-β1通过激活ALK/PI3K/Akt信号通路调节小胶质细胞免疫调节和线粒体功能恢复的机制，并开展了I期首次人体临床试验 | I期临床试验样本量较小，需要更大规模临床试验进一步验证安全性和有效性 | 探索低氧预处理嗅黏膜间充质干细胞对帕金森病模型和患者的神经功能恢复作用及其机制 | 帕金森病模型（小鼠）和帕金森病患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 全长转录本异构体测序 | NA | NA | I期临床试验中严重帕金森病患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-05-27 |
Deubiquitylase ubiquitin-specific protease 7 plays a crucial role in the lineage differentiation of preimplantation blastocysts†
2024-07-12, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae034
PMID:38438135
|
研究论文 | 本研究探讨了去泛素化酶USP7在植入前胚胎发育中的关键作用，尤其对谱系分化的调控机制 | 首次揭示USP7通过稳定YAP蛋白调控桑椹胚向囊胚转换，并影响表观遗传修饰和关键基因表达 | 未详细说明动物实验的伦理审批及样本量统计效力 | 阐明USP7在植入前胚胎谱系分化和表观遗传重编程中的功能及机制 | 小鼠植入前胚胎 | 机器学习 | NA | RNA干扰，单细胞RNA测序，逆转录定量聚合酶链反应，蛋白质印迹，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据，DNA甲基化数据，蛋白质数据 | 小鼠胚胎样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序平台（未说明具体型号） |
| 39 | 2026-05-27 |
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601416
PMID:39005406
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示黑色素瘤治疗抵抗中微环境对内在命运的影响 | 首次通过空间转录组学揭示黑色素瘤抵抗程序与肿瘤微环境免疫特征的空间共定位关系，证明组织特征（如坏死区域）可影响抵抗命运的选择 | NA | 探究黑色素瘤治疗抵抗中内在细胞状态与肿瘤微环境的相互作用机制 | 黑色素瘤细胞系、患者样本、异种移植模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 共识非负矩阵分解 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 多种细胞系、患者肿瘤样本、异种移植模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-23 |
Optimization of mouse kidney digestion protocols for single-cell applications
2024-07-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过比较三种小鼠肾脏单细胞消化方案，评估其对细胞异质性的影响，为单细胞研究提供方案选择指导 | 首次系统评估已发表的单细胞悬液制备方案，并比较其在小鼠肾脏细胞产量和异质性方面的差异 | 仅检测了三种方案，且未涉及其他可能影响消化效率的因素（如酶浓度、孵育时间），未进行体内验证 | 优化小鼠肾脏单细胞消化方案，为单细胞技术（如流式细胞术、单细胞RNA测序）提供高质量细胞悬液 | 小鼠肾脏细胞（包括白细胞、血管细胞、肾单位上皮细胞、足细胞、成纤维细胞） | 单细胞生物学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自雄性和雌性C57BL/6小鼠的肾脏样本 | Miltenyi Biotec | 单细胞RNA测序 | Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒 | 三种方案：scRNAseq方案、Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒、实验室自建方案 |