单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 495 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-18 |
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.02.573939
PMID:38260306
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研究论文 | 本研究开发了一种使用顶端向外人类气道类器官进行高通量抗病毒药物筛选的标准化方法 | 引入了具有反向双极性的气道类器官，实现了单类器官每孔的高通量培养和分析，提高了病毒感染效率和药物筛选的标准化水平 | 研究主要作为SARS-CoV-2的概念验证应用，尚未广泛扩展到其他病毒或疾病模型 | 开发标准化的类器官平台用于抗病毒药物发现和评估 | 人类气道类器官和SARS-CoV-2病毒株 | 数字病理学 | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 类器官模型 | 转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-03-17 |
Single Cell RNAseq Analysis of Cytokine-Treated Human Islets: Association of Cellular Stress with Impaired Cytokine Responsiveness
2024-07-11, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqae015
PMID:38985000
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析细胞因子处理的人胰岛，揭示了细胞应激与细胞因子反应性受损之间的关联 | 首次在单细胞水平上比较人胰岛与小鼠胰岛对细胞因子的基因表达响应差异，并发现核糖体蛋白高表达与应激反应相关，限制了细胞因子响应 | 研究未详细探讨供体死亡原因和胰岛分离方法对细胞应激的具体影响，样本来源和处理可能引入偏差 | 研究细胞因子对人胰岛基因表达的影响，特别是细胞应激如何调节细胞因子响应 | 人胰岛细胞，包括β细胞等内分泌细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人胰岛细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-03-14 |
Single-Cell Transcriptome Landscape and Cell Fate Decoding in Human Brain Organoids after Transplantation
2024-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402287
PMID:38711218
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，探索了人脑类器官在移植到前额叶皮层和海马体后的细胞命运变化 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了人脑类器官移植后，其细胞命运如何受到宿主微环境（特别是前额叶皮层中多巴胺和乙酰胆碱的丰富表达）的调控，并随时间从神经发育转向胶质发育 | 研究主要基于体外实验和特定时间点的观察，移植后更长期的细胞命运稳定性、功能整合程度以及潜在的免疫排斥反应尚未充分阐明 | 阐明移植后人脑类器官的细胞命运决定机制，以增进对细胞移植和再生医学的理解 | 移植到小鼠前额叶皮层和海马体的人脑类器官 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 移植到不同脑区（前额叶皮层和海马体）并在不同时间点（移植后2个月和4个月）采集的人脑类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-03-14 |
GHCU, a Molecular Chaperone, Regulates Leaf Curling by Modulating the Distribution of KNGH1 in Cotton
2024-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402816
PMID:38666376
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研究论文 | 本研究通过遗传定位和分子研究，鉴定了棉花叶片卷曲突变体cu中的关键基因GHCU，揭示了其通过调控KNGH1蛋白分布影响生长素响应水平，从而控制叶片扁平化的分子机制 | 首次在棉花中鉴定出GHCU作为分子伴侣调控叶片形态的关键基因，并阐明其通过促进KNGH1从近轴面向远轴面运输来影响生长素分布的新机制 | 研究主要基于自然突变体和模式植物烟草，在棉花中的功能验证和具体分子互作网络仍需进一步探索 | 探究棉花叶片形态建成的分子基础，特别是叶片卷曲性状的遗传调控机制 | 棉花自然突变体cu及其野生型，以及烟草作为模式植物 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、时空转录组分析 | NA | 遗传数据、分子数据、转录组数据 | 未明确具体样本数量，涉及棉花突变体和烟草转基因材料 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-03-02 |
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-Jul, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24843
PMID:38668123
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研究论文 | 本研究评估了胶原酶A和分散酶两种酶解方法对小鼠肺组织内皮细胞分离的影响，比较了细胞回收数量、活性和亚型组成 | 首次系统比较了胶原酶A和分散酶在发育期小鼠肺组织内皮细胞分离中的效果，并利用单细胞RNA测序揭示了不同酶解方法对细胞亚型组成的显著影响 | 研究仅针对小鼠肺组织，结果可能不适用于其他组织或物种；未评估长期培养后细胞功能的变化 | 评估不同组织解离方案对发育期小鼠肺内皮细胞回收的影响 | 幼年和成年小鼠肺组织中的内皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 流式细胞术，荧光激活细胞分选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 小鼠肺组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-02-26 |
Getting to the root of root-microbe interactions
2024 Jul-Sep, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504241278783
PMID:39234658
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评论 | 本文总结了关于吸收性和运输性细根中微生物群落差异的最新研究，并探讨了根-微生物相互作用在生态系统功能中的重要性 | 强调了细根功能分类（吸收性与运输性）对微生物群落特征的影响，并提议应用前沿单细胞测序技术进行未来研究 | 作为评论文章，主要基于现有研究总结和推测，缺乏新的实验数据验证 | 探讨细根功能分类如何影响微生物群落，并推动根-微生物相互作用研究的未来发展 | 细根（直径小于2毫米）及其相关的微生物群落 | 微生物生态学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-02-21 |
Transcriptomic Analysis Reveals That Excessive Thyroid Hormone Signaling Impairs Phototransduction and Mitochondrial Bioenergetics and Induces Cellular Stress in Mouse Cone Photoreceptors
2024-Jul-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25137435
PMID:39000540
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了过量甲状腺激素信号通过损害光转导和线粒体生物能量学并诱导细胞应激，从而导致小鼠视锥细胞退化的转录组学机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了过量甲状腺激素信号对视锥细胞转录组的影响，并明确了光转导、线粒体功能和细胞应激通路的具体变化 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类视网膜细胞或临床样本中验证 | 探究过量甲状腺激素信号诱导视锥细胞退化的基因/转录组学改变 | C57BL/6小鼠的视网膜细胞，特别是视锥细胞 | 单细胞组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 155,866个单细胞，来自甲状腺激素处理的小鼠视网膜 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-01-27 |
Transcriptomic Approaches to Cardiomyocyte-Biomaterial Interactions: A Review
2024-07-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00303
PMID:38934720
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综述 | 本文综述了转录组学方法在心肌细胞与生物材料相互作用研究中的应用，强调了其在心脏生物工程和再生医学中的重要性 | 聚焦于转录组学技术（如bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、单核RNA-seq和空间转录组学）在解析心肌细胞-生物材料相互作用网络中的创新应用，并探讨了纵向研究、通路分析和机器学习等方法的整合潜力 | 存在成本高、细胞尺寸限制、样本差异以及分析流程复杂等挑战 | 旨在通过转录组学方法深入理解心肌细胞与生物材料的相互作用机制，以促进心脏健康相关研究 | 心肌细胞与生物材料的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-01-16 |
Discovering mechanisms of human genetic variation and controlling cell states at scale
2024-07, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.03.010
PMID:38658256
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评论 | 本文探讨了单细胞测序在揭示人类遗传变异机制和控制细胞状态方面的潜力 | 提出将单细胞测序用于大规模构建变异效应表型图谱，并将遗传变异解释方法应用于工程化治疗性细胞状态 | NA | 加速人类遗传变异机制发现并推动基因组医学发展 | 人类遗传变异和细胞状态 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-01-13 |
The relationship between psoriasis and vitiligo: From a comprehensive study
2024-Jul, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13868
PMID:39031921
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研究论文 | 本研究通过病例报告、转录组测序和孟德尔随机化分析，探讨了银屑病与白癜风之间的关联，发现两者可能与免疫密切相关，但无因果关系的证据 | 结合单细胞转录组测序和孟德尔随机化分析，首次从多角度系统评估银屑病与白癜风的免疫关联和因果关系 | 孟德尔随机化分析基于欧洲人群数据，可能不适用于其他种族；样本量相对有限，特别是单细胞测序仅针对一例患者 | 探究银屑病与白癜风之间是否存在因果关系 | 银屑病和白癜风患者，包括一例中国患者和欧洲人群GWAS数据 | 数字病理学 | 皮肤病 | 转录组测序, 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, GWAS数据 | 一例中国患者（皮肤组织样本），以及来自IEU Open GWAS Project和NIH数据库的261,018名欧洲个体（包括4,510名银屑病患者和4,680名白癜风患者） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-01-04 |
Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19
2024-07-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136
PMID:39018367
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研究论文 | 本研究通过比较临床PASC样本与小鼠模型的单细胞RNA测序数据，揭示了干扰素-γ是驱动急性COVID-19后呼吸系统后遗症的关键因素 | 首次在临床样本和动物模型中进行全面的比较单细胞分析，确定了IFN-γ信号轴在呼吸系统PASC中的核心作用，并通过功能实验验证了其致病机制 | 研究主要聚焦于呼吸系统后遗症，可能无法完全代表其他器官系统的PASC机制；动物模型与人类疾病的完全对应性存在局限 | 探究严重急性呼吸综合征冠状病毒2感染后急性后遗症（PASC）的病因和免疫机制 | 临床PASC患者的支气管肺泡灌洗液样本和PASC小鼠模型 | 单细胞组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床PASC样本和小鼠模型样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-12-17 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604718
PMID:39091743
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研究论文 | 本研究利用海鞘Ciona模型，探索了心脏咽部祖细胞在发育过程中通过细胞周期驱动的转录组成熟获得多谱系能力的机制 | 揭示了转录组成熟过程，包括候选“成熟基因”如Rho GAP编码基因在G2晚期达到峰值，以及行为能力概念，通过多谱系启动和定向不对称分裂影响命运决定 | 研究基于海鞘模型，可能不直接适用于所有脊椎动物系统，且功能验证可能有限 | 探究多谱系能力的获得以及命运决定与细胞周期进程之间的耦合机制 | 心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-12-04 |
Clustering single-cell RNA sequencing data via iterative smoothing and self-supervised discriminative embedding
2024-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03074-5
PMID:38834657
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研究论文 | 本文提出了一种名为scRISE的深度聚类方法，用于单细胞RNA测序数据，通过迭代平滑和自监督判别嵌入来改善数据表示和聚类质量 | scRISE模型结合了基于图自编码器的迭代平滑模块和具有自适应相似性阈值的自监督判别嵌入模块，以去噪数据并优化聚类 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中相似性度量的鲁棒性挑战，以识别细胞类型和细胞间相互作用 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 图自编码器 | 基因表达数据 | 十七个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-11-18 |
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601416
PMID:39005406
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了黑色素瘤治疗耐药性中细胞内在状态与肿瘤微环境的共同影响 | 首次在单细胞分辨率上证明耐药命运同时受细胞内在状态和肿瘤微环境共同塑造，并发现不同耐药程序在个体肿瘤中共存 | 研究主要基于异种移植模型，人类患者样本验证仍需进一步扩展 | 探索黑色素瘤治疗耐药性中细胞内在因素与微环境因素的相互作用机制 | 黑色素瘤细胞系、患者肿瘤样本和异种移植模型 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 共识非负矩阵分解 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个细胞系和患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-05 |
A second wave of Notch signaling diversifies the intestinal secretory lineage
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603542
PMID:39071399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小肠中罕见分泌细胞CHEs的命运特化机制 | 发现Notch信号通路在分泌谱系中发生第二波激活以特化CHEs细胞群体 | CHEs细胞在大鼠和人类中存在但小鼠中缺失，限制了部分实验模型的适用性 | 探究小肠分泌细胞谱系多样化的分子机制 | 大鼠和人类小肠中的C FTR高表达细胞(CHEs) | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-05 |
scRNA-seq identifies unique macrophage population in murine model of ozone induced asthma exacerbation
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604740
PMID:39211080
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了臭氧诱导哮喘加重小鼠模型中独特的巨噬细胞群体 | 首次在臭氧诱导哮喘加重模型中鉴定出独特的肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群，并揭示了其特异性基因表达通路 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类转化需要进一步验证 | 探究臭氧暴露导致哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 尘螨、豚草和臭氧暴露的小鼠肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 暴露于DRA、臭氧或DRA+臭氧的小鼠肺部免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-05 |
Endothelial POFUT1 controls injury-induced liver fibrosis by repressing fibrinogen synthesis
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.032
PMID:38460791
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞POFUT1通过抑制纤维蛋白原合成控制损伤诱导的肝纤维化的机制 | 首次发现POFUT1通过NOTCH/HES1/STAT3信号通路抑制纤维蛋白原表达，并鉴定纤维蛋白原作为新的促纤维化旁分泌信号激活肝星状细胞 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性仍需进一步验证 | 探究肝窦内皮细胞表达的POFUT1在肝纤维化中的作用机制 | 内皮特异性Pofut1敲除小鼠、肝窦内皮细胞、肝星状细胞、肝硬化患者样本 | 分子生物学 | 肝纤维化/肝硬化 | RNA测序、qPCR、蛋白质印迹、ELISA、组织学分析、电子显微镜、免疫染色、RNA原位杂交 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织学图像 | 内皮特异性Pofut1敲除小鼠模型、肝硬化患者和健康个体的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-05 |
Van Gogh-like 2 is essential for the architectural patterning of the mammalian biliary tree
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.030
PMID:38460794
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研究论文 | 本研究揭示了平面细胞极性蛋白VANGL2在哺乳动物胆管系统结构模式形成中的关键作用 | 首次发现VANGL2通过调控细胞间接触形成和肌动蛋白细胞骨架极化来协调胆管模式形成 | 研究主要基于小鼠胚胎肝脏模型，在人类系统中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明胆管板从简单上皮细胞片转变为复杂连接胆管系统的机制 | 小鼠胚胎肝脏胆管上皮细胞 | 发育生物学 | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序,遗传学工具,类器官模型 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-05 |
Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type specific responses in primary human pancreatic islets
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604861
PMID:39211206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了柯萨奇病毒B感染在人类胰岛不同细胞类型中引发的特异性转录反应 | 首次在单细胞分辨率上系统揭示了CVB感染对不同胰岛细胞类型的特异性转录响应，并发现β细胞中长链非编码RNA与病毒感染的关系 | 使用尸体来源的胰岛样本，可能无法完全反映体内真实情况；研究时间点仅限于24和48小时 | 探究柯萨奇病毒B感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响及其与1型糖尿病的关系 | 人类尸体来源的胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类尸体胰岛样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-05 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
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研究论文 | 本研究揭示了杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用调节TDP-43相关神经退行性疾病中皮层兴奋性的神经保护机制 | 首次发现具有独特形态和转录特征的杆状小胶质细胞亚群，并证明其通过调节兴奋性突触输入来抑制运动皮层过度活跃 | 研究仅限于TDP-43神经退行性疾病小鼠模型，尚未在人类或其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病运动皮层回路过度兴奋中的调控作用 | TDP-43神经退行性疾病小鼠模型(rNLS8)的运动皮层神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 多通道探针记录、纵向钙成像、空间转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 电生理信号、钙成像数据、转录组数据 | rNLS8转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |