单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 498 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Endothelial POFUT1 controls injury-induced liver fibrosis by repressing fibrinogen synthesis
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.032
PMID:38460791
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞POFUT1通过抑制纤维蛋白原合成控制损伤诱导的肝纤维化的机制 | 首次发现POFUT1通过NOTCH/HES1/STAT3信号通路抑制纤维蛋白原表达，并鉴定纤维蛋白原作为新的促纤维化旁分泌信号激活肝星状细胞 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性仍需进一步验证 | 探究肝窦内皮细胞表达的POFUT1在肝纤维化中的作用机制 | 内皮特异性Pofut1敲除小鼠、肝窦内皮细胞、肝星状细胞、肝硬化患者样本 | 分子生物学 | 肝纤维化/肝硬化 | RNA测序、qPCR、蛋白质印迹、ELISA、组织学分析、电子显微镜、免疫染色、RNA原位杂交 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织学图像 | 内皮特异性Pofut1敲除小鼠模型、肝硬化患者和健康个体的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-05 |
Van Gogh-like 2 is essential for the architectural patterning of the mammalian biliary tree
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.030
PMID:38460794
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研究论文 | 本研究揭示了平面细胞极性蛋白VANGL2在哺乳动物胆管系统结构模式形成中的关键作用 | 首次发现VANGL2通过调控细胞间接触形成和肌动蛋白细胞骨架极化来协调胆管模式形成 | 研究主要基于小鼠胚胎肝脏模型，在人类系统中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明胆管板从简单上皮细胞片转变为复杂连接胆管系统的机制 | 小鼠胚胎肝脏胆管上皮细胞 | 发育生物学 | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序,遗传学工具,类器官模型 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-05 |
Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type specific responses in primary human pancreatic islets
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604861
PMID:39211206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了柯萨奇病毒B感染在人类胰岛不同细胞类型中引发的特异性转录反应 | 首次在单细胞分辨率上系统揭示了CVB感染对不同胰岛细胞类型的特异性转录响应，并发现β细胞中长链非编码RNA与病毒感染的关系 | 使用尸体来源的胰岛样本，可能无法完全反映体内真实情况；研究时间点仅限于24和48小时 | 探究柯萨奇病毒B感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响及其与1型糖尿病的关系 | 人类尸体来源的胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类尸体胰岛样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-05 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
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研究论文 | 本研究揭示了杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用调节TDP-43相关神经退行性疾病中皮层兴奋性的神经保护机制 | 首次发现具有独特形态和转录特征的杆状小胶质细胞亚群，并证明其通过调节兴奋性突触输入来抑制运动皮层过度活跃 | 研究仅限于TDP-43神经退行性疾病小鼠模型，尚未在人类或其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病运动皮层回路过度兴奋中的调控作用 | TDP-43神经退行性疾病小鼠模型(rNLS8)的运动皮层神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 多通道探针记录、纵向钙成像、空间转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 电生理信号、钙成像数据、转录组数据 | rNLS8转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-05 |
Single-cell landscape of functionally cured chronic hepatitis B patients reveals activation of innate and altered CD4-CTL-driven adaptive immunity
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.017
PMID:38423478
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了功能性治愈慢性乙型肝炎患者的免疫病理特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了慢性乙型肝炎与功能性治愈患者的肝内组织和外周血免疫细胞状态，发现了CD4细胞毒性T淋巴细胞和天然免疫细胞激活等新机制 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索慢性乙型肝炎功能性治愈的免疫病理机制和生物标志物 | 慢性乙型肝炎患者和功能性治愈患者的肝内组织及匹配的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 慢性乙型肝炎和功能性治愈患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-05 |
Immune disease dialogue of chemokine-based cell communications as revealed by single-cell RNA sequencing meta-analysis
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603936
PMID:39071425
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荟萃分析 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示免疫疾病中基于趋化因子的细胞通讯机制 | 首次通过跨疾病跨组织的单细胞RNA测序荟萃分析系统揭示免疫细胞趋化与外渗模式 | 基于公开数据库的二次分析，受原始数据质量和覆盖范围限制 | 解析免疫疾病中细胞间通讯与免疫细胞迁移机制 | 多种免疫疾病患者组织样本（皮肤、肺、结肠、肾脏） | 生物信息学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 配体-受体相互作用分析 | 单细胞转录组数据 | 多种免疫疾病公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-10-05 |
Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis
2024-07-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae028
PMID:38289873
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研究论文 | 本研究通过翻译核糖体亲和纯化测序技术鉴定出Itih4作为动脉粥样硬化中平滑肌细胞特异性表达的新基因 | 开发了SMCTRAP转基因小鼠模型，首次应用TRAP测序技术直接分析组织中的平滑肌细胞特异性基因表达 | 研究样本量较小，仅使用15月龄小鼠的胸主动脉样本 | 研究动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的基因表达特征 | SMCTRAP和SMCTRAP-AS转基因小鼠的胸主动脉样本 | 单细胞组学 | 动脉粥样硬化 | TRAP-seq, 免疫荧光染色, 空间转录组学, 全基因组关联分析 | 转基因小鼠模型 | 测序数据, 图像数据 | 15月龄SMCTRAP和SMCTRAP-AS小鼠的胸主动脉样本 | NA | 翻译核糖体亲和纯化测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-05 |
Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction
2024-07-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae075
PMID:38666458
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的关键调控作用 | 首次发现SerpinA3n通过调节基质功能和蛋白酶活性影响心肌梗死后心脏重塑过程 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究丝氨酸蛋白酶抑制剂在心肌梗死后瘢痕形成中的作用机制 | SerpinA3n条件性基因敲除小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、组织学分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组分析 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Feature selection followed by a novel residuals-based normalization that includes variance stabilization simplifies and improves single-cell gene expression analysis
2024-Jul-30, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05872-w
PMID:39080559
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研究论文 | 提出一种新的单细胞RNA测序数据分析流程，包括先进行特征选择再进行包含方差稳定的残差归一化方法 | 提出先特征选择后归一化的修订工作流程，开发基于稳定基因的新型方差稳定残差归一化方法 | NA | 改进单细胞基因表达数据分析方法 | 单细胞RNA测序计数数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Integration tools for scRNA-seq data and spatial transcriptomics sequencing data
2024-07-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae002
PMID:38267084
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综述 | 本文系统整理了19种整合单细胞RNA测序数据与空间转录组测序数据的方法，为研究人员选择合适的数据整合方法提供参考 | 首次对19种scRNA-seq与空间转录组数据整合方法进行系统性分类和比较分析，强调高变异基因在不同技术注释中的应用 | 未对整合方法进行实证性能比较，主要基于方法原理进行理论分析 | 为研究人员选择单细胞RNA测序与空间转录组数据整合方法提供指导 | 单细胞RNA测序数据与空间转录组测序数据的整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Improving cell type identification with Gaussian noise-augmented single-cell RNA-seq contrastive learning
2024-07-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad059
PMID:38242863
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研究论文 | 提出一种基于高斯噪声增强的单细胞RNA测序对比学习方法，用于改进细胞类型识别任务 | 首次将高斯噪声增强策略应用于单细胞RNA测序数据的对比学习，专门针对困难细胞类型识别任务进行优化 | 未明确说明方法在特定细胞类型或组织中的适用性限制 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性，特别是困难细胞类型的识别 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to analyze the potential pathogenic mechanism of CTSH gene involved in type 1 diabetes in the exocrine pancreas
2024-07-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad052
PMID:38050341
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据探索CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的潜在致病机制 | 首次结合eQTL研究、GWAS汇总数据和单细胞转录组数据系统分析CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的作用机制 | 研究结果主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探究CTSH基因在1型糖尿病发病机制中的潜在作用 | 1型糖尿病患者和健康对照者的胰腺组织 | 生物信息学 | 1型糖尿病 | eQTL分析, GWAS, 单细胞RNA测序, 单细胞WGCNA分析, 功能富集分析 | 基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR) | 基因组数据, 转录组数据 | 1型糖尿病患者和健康对照者的胰腺单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
SmartImpute: A Targeted Imputation Framework for Single-cell Transcriptome Data
2024-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603649
PMID:39071378
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研究论文 | 提出一种针对单细胞转录组数据的靶向插补框架SmartImpute | 采用改进的生成对抗插补网络架构，专注于预定义标记基因，提高插补过程的生物学相关性和计算效率 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件问题 | 头颈部鳞状细胞癌和人类骨髓的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络(GAN) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Detection of allele-specific expression in spatial transcriptomics with spASE
2024-Jul-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03317-4
PMID:38978101
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研究论文 | 开发了一种名为spASE的计算框架，用于从空间转录组数据中检测和估计空间等位基因特异性表达 | 首次实现了在空间转录组数据中研究空间等位基因特异性表达，并采用涉及空间平滑样条加性混合的分层模型来解决细胞类型混合和低信噪比挑战 | NA | 开发检测空间等位基因特异性表达的计算方法 | 小鼠小脑和海马体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 分层模型、空间平滑样条 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Slide-seq | 等位基因分辨的Visium和Slide-seq平台数据 |
| 35 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling unveils insights into ovarian fibrosis in obese mice
2024-07-02, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00496-9
PMID:38956667
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了肥胖小鼠卵巢纤维化的细胞机制 | 首次构建肥胖小鼠卵巢组织的单细胞图谱，发现SPP1-CD44和TNF-TNFrsf1α相互作用在卵巢纤维化中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究肥胖条件下导致不孕的精确细胞亚群及其分子机制 | 肥胖成年雌性小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | 卵巢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖模型小鼠组与对照组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Functional genomics of the human epididymis: Further characterization of efferent ducts and model systems by single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13477
PMID:37301539
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析人类附睾输出管细胞组成并与体外培养模型进行比较 | 首次在单细胞水平上揭示人类附睾输出管的细胞类型组成，并发现具有膀胱和尿路上皮标记基因的特殊上皮细胞亚群 | 样本来源有限，组织获取困难 | 阐明人类附睾输出管的细胞身份特征及其与附睾头部的差异 | 人类附睾组织、原代人类附睾上皮细胞和类器官培养模型 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类附睾组织样本及体外培养模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium平台 |
| 37 | 2025-10-06 |
Impending HCC diagnosis in patients with cirrhosis after HCV cure features a natural killer cell signature
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000804
PMID:38381525
|
研究论文 | 本研究通过分析自然杀伤细胞特征，识别HCV治愈后肝硬化患者发生肝细胞癌的早期指标 | 首次发现TIM-3hi和CD38+在NK细胞上的持续共表达可作为HCV相关HCC发展的早期预测标志物 | 研究样本量有限，仅针对HCV相关肝硬化患者，需要更大规模验证 | 探索HCV治愈后肝硬化患者发生肝细胞癌的自然杀伤细胞特征 | HCV感染后肝硬化患者（发展为HCC和未发展为HCC两组）及健康对照 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，功能分析实验 | NA | 单细胞测序数据，流式细胞术数据 | 8个队列覆盖HCC发展全过程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Oleic acid-PPARγ-FABP4 loop fuels cholangiocarcinoma colonization in lymph node metastases microenvironment
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000784
PMID:38377465
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研究论文 | 本研究揭示了油酸-PPARγ-FABP4正反馈环路在促进胆管癌淋巴结转移微环境定植中的作用机制 | 首次发现淋巴结转移中胆管癌细胞的脂代谢重编程特征，并鉴定出油酸-PPARγ-FABP4正反馈环路的关键调控作用 | NA | 探究胆管癌在淋巴结微环境中定植的代谢重编程机制 | 胆管癌患者的原发肿瘤病灶和配对淋巴结转移灶 | 单细胞测序分析 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序,代谢组学,CRISPR/Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据,代谢组数据 | 胆管癌患者的原发灶和淋巴结转移灶样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Alveolar macrophage-CD8 T cell interactions after acute lung allograft dysfunction: Insights from single-cell RNA sequencing
2024-07, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2024.03.003
PMID:38490571
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Identification of a clinically efficacious CAR T cell subset in diffuse large B cell lymphoma by dynamic multidimensional single-cell profiling
2024-Jul, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00768-3
PMID:38750245
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研究论文 | 通过动态多维单细胞分析鉴定弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有临床疗效的CAR T细胞亚群 | 整合时间推移成像显微镜、亚细胞分析和单细胞RNA测序技术，首次鉴定出具有多重功能的CD8-fit T细胞亚群 | 研究样本仅限于大B细胞淋巴瘤患者，需要进一步验证在其他恶性肿瘤中的适用性 | 鉴定CAR T细胞治疗中具有优越临床活性的T细胞亚群 | 大B细胞淋巴瘤患者的CAR T细胞输注产品 | 单细胞分析 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 时间推移成像显微镜, 亚细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 显微镜图像数据 | 大B细胞淋巴瘤患者的CAR T细胞输注产品 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |