单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 505 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-05 |
Translational regulation enhances distinction of cell types in the nervous system
2024-Jul-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90713
PMID:39010741
|
研究论文 | 这篇文章揭示了转录后调控在神经系统细胞类型区分中的重要性 | 研究首次将转录后调控与细胞类型特异性蛋白表达联系起来，为理解细胞多样性的分子机制提供了新见解 | 研究仅在特定的转基因小鼠模型中进行，可能不适用于所有类型的神经细胞 | 揭示转录后调控对神经系统细胞类型区分的影响 | 研究基因定义的脑细胞的转录组和翻译组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq | NA | RNA数据 | 基因定义的细胞 |
| 362 | 2024-08-04 |
Single-cell total-RNA profiling unveils regulatory hubs of transcription factors
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50291-3
PMID:39009595
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研究论文 | 本文开发了一种基于总RNA的单细胞RNA测序方法snapTotal-seq，并展示其在转录因子调控中的应用 | 创新性地提出了一种同时测量未剪接RNA和剪接RNA的一步总RNA化学方法 | 只对单细胞RNA-seq化学的表现进行了比较，未评估其在其他细胞类型或条件下的适用性 | 本研究旨在通过新的方法深入了解基因调控，特别是在细胞状态转变中的调控机制 | 研究对象包括单细胞中的转录因子及其调控的细胞周期和衰老 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | LASSO回归 | RNA | NA |
| 363 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics analysis of bullous pemphigoid unveils immune-stromal crosstalk in type 2 inflammatory disease
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50283-3
PMID:39009587
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研究论文 | 本研究揭示了水疱性皮肤病中免疫-基质间的相互作用。 | 首次识别IL13-IL13RA1配体-受体对作为水疱性皮肤病中免疫-基质互动的重要介质。 | 未提供关于样本数量和具体实验条件的详细信息。 | 全面了解水疱性皮肤病的免疫景观，特别是免疫-基质之间的相互作用。 | 研究T细胞、树突状细胞和成纤维细胞等关键细胞群体。 | 数字病理学 | 水疱性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 364 | 2024-08-04 |
Endoplasmic reticulum stress promotes hepatocellular carcinoma by modulating immunity: a study based on artificial neural networks and single-cell sequencing
2024-Jul-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05460-9
PMID:39010084
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激如何通过调节免疫反应促进肝细胞癌的发展 | 提出了一种新的预测模型，结合多种机器学习算法与人工神经网络，为肝细胞癌的诊断提供新方向 | 采用的数据集和方法可能无法全面覆盖所有与内质网应激相关的基因和免疫机制 | 探讨内质网应激在肝细胞癌发展中的分子机制及早期诊断和治疗靶点 | 研究涉及与内质网应激相关的不同ially表达基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、机器学习（随机森林和支持向量机）、人工神经网络 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 综合GEO数据集（GSE25097, GSE62232, GSE65372） |
| 365 | 2024-08-05 |
Generation of musculoskeletal cells from human urine epithelium-derived presomitic mesoderm cells
2024-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01274-w
PMID:39010176
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研究论文 | 本研究探讨了从人尿上皮衍生的前体中胚层细胞生成肌肉骨骼细胞的过程。 | 本研究首次展示了UiPSM细胞的分化潜力，并证明其在移植后能够形成成熟的骨骼肌细胞。 | 研究未详细探讨UiPSM细胞在不同体内环境下的长期表现及其潜在的不良反应。 | 研究UiPSM细胞的分化潜力及其在肌肉骨骼发展中的应用。 | 本研究主要对象为从人尿上皮提取的UiPSM细胞及其衍生的骨骼肌细胞。 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 生物发光成像，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞培养，生物成像 | 使用了在MITRG小鼠前胫肌中的UiPSM细胞移植进行评估 |
| 366 | 2024-08-04 |
Advance and Application of Single-cell Transcriptomics in Auditory Research
2024-Jul, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01149-z
PMID:38015350
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综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在听觉研究中的应用 | 文章创新性地应用单细胞RNA测序技术揭示听觉器官中细胞的复杂生物机制 | 对于内耳的细胞异质性及其有限的细胞数量的深入研究仍然不足 | 本研究旨在提供听觉器官发展的参考、听力损失的发病机制以及再生疗法的基础 | 研究对象为听觉器官中的不同类型细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-04 |
Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics
2024-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.04.015
PMID:38692412
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究肾移植排斥反应的潜力 | 结合公共单细胞RNA测序数据，首次应用空间转录组学技术研究肾移植排斥反应 | 关于该技术的发展和未来应用的限制需要考虑 | 研究肾移植排斥反应的分子和细胞机制 | 分析非排斥、T细胞介导的急性排斥、间质纤维化和肾小管萎缩的活检样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 活检样本 | 多种病理状态下的活检样本 |
| 368 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing advances in research on mesenchymal stem/stromal cells
2024-Jul, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01076-9
PMID:38743204
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综述 | 本文回顾了单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用及其前景 | 强调了单细胞测序技术在揭示间充质干细胞异质性和分子特征中的重要性 | 未提及具体的局限性 | 审视单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞（MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-04 |
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-Jul, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24843
PMID:38668123
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研究论文 | 本研究评估了不同酶解方法对小鼠肺部内皮细胞分离的影响 | 首次比较了胶原酶A和Dispase在小鼠肺内皮细胞分离中的效用，并发现胶原酶A在内皮细胞回收方面优于Dispase | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法直接应用于其他物种 | 探索不同组织解离协议对小鼠肺内皮细胞回收的影响 | 幼年和成年小鼠的肺内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未提供确切的样本数量，涉及幼年和成年小鼠的肺组织 |
| 370 | 2024-08-05 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-07, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13892
PMID:38829682
|
研究论文 | 本研究探讨了早发阿尔茨海默病（EOAD）中干扰素反应性T细胞的扩展 | 发现早发阿尔茨海默病中抗病毒类干扰素信号关联基因高表达的T细胞显著扩展 | 未提及具体限制 | 研究早发阿尔茨海默病中的免疫反应 | 研究对象包括早发阿尔茨海默病患者及临床正常对照的外周血单核细胞和CD4 T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和滴度数字PCR（ddPCR） | NA | 基因表达 | 16名EOAD患者和19名CD4 T细胞样本参与者 |
| 371 | 2024-08-07 |
Decoding the building blocks of cellular processes from single-cell transcriptomics data
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01967-6
PMID:37735267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptome atlas of human euploid and aneuploid blastocysts
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01788-6
PMID:38839885
|
研究论文 | 该文章探讨了人类正常和非正常胚泡的单细胞转录组图谱 | 本研究首次系统性地分析了人类非正常胚泡中转录组的改变，揭示了基因剂量效应和特定信号通路的影响 | 研究主要集中于初期的人类胚泡，可能无法完全推及其他发育阶段或物种 | 了解非正常胚泡中染色体异常如何影响细胞功能和胚胎发育 | 203个人类正常与非正常胚泡中的14,908个单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 203个胚泡包含14,908个单细胞 |
| 373 | 2024-08-05 |
Microwave ablation combined with PD-L1 blockade synergistically promotes Cxcl9-mediated antitumor immunity
2024-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16182
PMID:38655660
|
研究论文 | 本研究探讨了微波消融与PD-L1拮抗，协同促进Cxcl9介导的抗肿瘤免疫 | 发表了微波消融结合抗PD-L1治疗对肿瘤免疫的改善作用的新发现 | 研究局限于小鼠模型，临床应用尚需进一步验证 | 探究微波消融与PD-L1拮抗结合对结直肠癌肝转移防治的潜力 | 使用经过微波消融的前临床小鼠模型进行研究 | 数字病理 | 结直肠癌 | 微波消融和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本和肿瘤细胞 | 小鼠模型，样本数量未具体说明 |
| 374 | 2024-08-05 |
Quantification and statistical modeling of droplet-based single-nucleus RNA-sequencing data
2024-Jul-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxad010
PMID:37257175
|
研究论文 | 本研究探讨了基于液滴的单核RNA测序数据的量化和统计建模 | 系统评估了基于液滴的单核RNA测序数据的概率分布，并发现其符合负二项分布 | 未能详细分析所有可能的量化映射策略 | 准确建模单核RNA测序数据，以改进下游分析 | 使用小鼠皮层和肾脏的单核RNA测序数据进行研究 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠皮层和肾脏的伪阴性对照数据 |
| 375 | 2024-08-05 |
IRF8 configures enhancer landscape in postnatal microglia and directs microglia specific transcriptional programs
2024-Jul-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.25.546453
PMID:37645844
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF8在后天小胶质细胞发育中的作用 | IRF8通过结合增强子区域调控小胶质细胞特异性的转录程序，揭示了其在小胶质细胞发育中的关键作用 | 研究未涉及IRF8在其他类型免疫细胞中的潜在作用 | 了解IRF8在后天小胶质细胞发育及特异性转录调控中的角色 | 后天发育的小胶质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | 5xFAD模型 | NA | NA |
| 376 | 2024-08-07 |
A one-stop shop for 3D spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01847-y
PMID:39009876
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-04 |
Paris saponin VII inhibits triple-negative breast cancer by targeting the MEK/ERK/STMN1 signaling axis
2024-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155746
PMID:38763012
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研究论文 | 本研究探讨了Paris saponin VII对三阴性乳腺癌的治疗效果及其潜在机制 | 首次表明STMN1磷酸化的抑制可能是PSⅦ抗癌作用的机制 | 尚未进行临床试验验证 | 阐明PSⅦ对三阴性乳腺癌的治疗作用 | 研究对象为三阴性乳腺癌细胞及相关基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 分子对接、分子动力学、西方印迹 | NA | 单细胞测序数据 | 4T1异种移植模型 |
| 378 | 2024-08-04 |
Early human fetal lung atlas reveals the temporal dynamics of epithelial cell plasticity
2024-Jul-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50281-5
PMID:39003323
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研究论文 | 该研究提供了发育中的人类肺脏的单细胞图谱 | 该研究通过对超过150,000个单细胞进行测序，揭示了人类胎肺的细胞谱系发展动态 | 该研究可能未涵盖所有潜在的细胞类型和发育阶段 | 研究人类胎肺的发展及其在发育缺陷和疾病状态下的功能变化 | 分析19个健康人类假腺性胎肺组织中的细胞发育轨迹 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 19个健康人类胎肺组织样本 |
| 379 | 2024-08-04 |
Unraveling the molecular architecture of autoimmune thyroid diseases at spatial resolution
2024-Jul-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50192-5
PMID:39003267
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术探讨自身免疫性甲状腺疾病的分子结构及细胞异质性 | 首次识别出不同类型的细胞亚群及其在甲状腺中的分布，揭示了与甲状腺疾病相关的特定细胞损伤和纤维母细胞亚群 | 该研究的样本量和选取标准未明确说明，可能影响结果的普适性 | 研究自身免疫性甲状腺疾病的分子机制和细胞间相互作用 | 研究对象为自身免疫性甲状腺疾病患者的甲状腺组织样本 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 空间转录组技术 | NA | 甲状腺组织样本 | NA |
| 380 | 2024-08-05 |
Altered tumor microenvironment heterogeneity of penile cancer during progression from non-lymphatic to lymphatic metastasis
2024-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70025
PMID:39003681
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研究论文 | 本研究首次探讨了阴茎癌在从非淋巴转移到淋巴转移过程中肿瘤微环境异质性的变化 | 研究揭示了阴茎癌微环境中上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞之间的相互作用以及肿瘤进展和淋巴结转移中功能合作的重要性 | 研究样本量较小，仅涉及六名进行单细胞RNA测序的患者和七名进行整体RNA测序的患者 | 研究阴茎癌的肿瘤微环境如何随着从非淋巴转移到淋巴转移的进展而变化 | 六名阴茎癌患者的细胞，分别为四名淋巴转移患者（IV期）和两名非淋巴转移患者（I期） | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | NA | 细胞 | 六名患者的46,861个细胞和七名患者的RNA样本 |