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当前共找到 493 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-05 |
Exploring the Role of Neutrophil-Related Genes in Osteosarcoma via an Integrative Analysis of Single-Cell and Bulk Transcriptome
2024-Jul-08, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12071513
PMID:39062086
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞相关基因在骨肉瘤中的作用及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 提出了一种新的NRG评分和NRG特征，能够评估骨肉瘤患者的预后 | 研究尚未深入探讨NRGs在不同骨肉瘤患者中的具体功能机制 | 研究中性粒细胞相关基因在骨肉瘤中的预后价值及其与肿瘤微环境的关联 | 骨肉瘤患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含来自TARGET-OS和GEO数据库的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-05 |
Scanpro is a tool for robust proportion analysis of single-cell resolution data
2024-07-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66381-7
PMID:38971877
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研究论文 | 本文介绍了Scanpro，一个用于单细胞分辨率数据的稳健比例分析工具 | 提出了一种新的工具Scanpro，用于在Python环境中进行单细胞数据的比例分析 | 当前缺乏对重复和不重复单细胞数据集进行稳健比例分析的生物信息学工具 | 研究高等生物体中个体细胞对信号的应答及其在不同生物条件下细胞类型比例的变化 | 主要研究单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据集中的细胞类型比例 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-04 |
CrossMP: Enabling Cross-Modality Translation between Single-Cell RNA-Seq and Single-Cell ATAC-Seq through Web-Based Portal
2024-Jul-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070882
PMID:39062661
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研究论文 | 本研究提出了一个模型，以实现单细胞RNA测序和单细胞表观基因组的跨模态预测 | 提出了一个基于深度神经网络的模型，能够从源模态学习潜在表示并预测目标模态 | 生成多模态数据技术挑战大且成本高，导致单细胞共检测数据的可用性有限 | 探索如何在单细胞层面同时分析多种组学模态 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序的数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | 深度神经网络 | 多模态数据 | 跨多个配对的人类scATAC-seq和scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-05 |
CD163+ Macrophages Induce Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atheroma
2024-Jul-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324082
PMID:38860377
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研究论文 | 本研究探讨了CD163+巨噬细胞在动脉粥样硬化中诱导内皮细胞向间充质细胞转变的作用 | 揭示CD163+巨噬细胞通过促凋亡内皮细胞向间充质细胞转变来促进动脉粥样硬化斑块进展 | 仅使用了小鼠模型和人类动脉样本，可能无法完全代表所有类型的动脉粥样硬化 | 阐明动脉粥样硬化中细胞表型转变的刺激因素和意义 | 人类冠状动脉组织切片及不同小鼠模型（如ApoE-/-和ApoE-/-/CD163-/-小鼠） | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、组织病理学分析、西方印迹 | 小鼠模型 | 组织切片、细胞培养 | 107个急性冠状动脉斑块破裂病变 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-04 |
The impact of next-generation sequencing for diagnosis and disease understanding of myeloid malignancies
2024-Jul, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2024.2383445
PMID:39054632
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review | 本综述简要描述了应用于髓系肿瘤（MNs）临床诊断的技术及其相关挑战. | 介绍了当前尚为研究用途的长测序、全外显子组/全基因组测序和单细胞测序等新兴技术，将很快成为临床检测标准. | 讨论了在资源有限的环境中全面基因组测试的采用挑战，以及其纳入临床试验的限制. | 优化髓系肿瘤的临床护理，通过改善诊断、预后、治疗规划和患者监测. | 髓系肿瘤的分子评估与临床技术. | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-05 |
Correction: Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012417
PMID:39058654
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更正 | 该论文修正了关于单细胞转录组分析和AID缺乏小鼠的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-05 |
The vast majority of somatic mutations in plants are layer-specific
2024-Jul-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03337-0
PMID:39049052
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研究论文 | 本文分析了植物中体细胞突变的频率和分布，特别是在不同的分生组织层中 | 研究发现大多数体细胞突变特定于个别层，并揭示了不同层之间的变异动态 | 对突变特征的了解仍然有限，特别是在变异与表型变化的关系方面 | 研究植物分生组织中体细胞突变的特征与分布 | 在一个杏树的不同部位分析体细胞突变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多个水果样本来自整个树木 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-04 |
Diffusion on PCA-UMAP Manifold: The Impact of Data Structure Preservation to Denoise High-Dimensional Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Jul-09, Biology
DOI:10.3390/biology13070512
PMID:39056705
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研究论文 | 该文章提出了一种基于PCA-UMAP扩散的方法来去噪高维单细胞RNA测序数据 | 通过使用PCA-UMAP扩散方法，增强了数据结构的保持，优化了PCA维度和扩散参数的使用 | 未明确提及 | 解决单细胞转录组学中数据噪声和低效转录捕获的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 高维单细胞数据 | 经过多种scRNA-seq数据集验证 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-04 |
A single-cell pan-cancer analysis to show the variability of tumor-infiltrating myeloid cells in immune checkpoint blockade
2024-Jul-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50478-8
PMID:39034339
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润性髓系细胞在免疫检查点抑制中的变异性 | 通过单细胞转录组学进行全癌症类型分析，揭示了TIMs在不同癌症类型中的丰度和动力学行为的显著变化 | 在研究中可能未考虑所有癌症类型或个体差异，样本量相对有限 | 研究肿瘤微环境中TIMs的功能以及它们与肿瘤浸润淋巴细胞的相互作用 | 192个来自129名患者的肿瘤样本中的肿瘤浸润性髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 192个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-04 |
Unraveling Spatial Domain Characterization in Spatially Resolved Transcriptomics with Robust Graph Contrastive Clustering
2024-Jul-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae451
PMID:39012523
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研究论文 | 本文开发了一种深度图对比聚类框架stDGCC，能够准确揭示空间领域 | 本文通过显式建模空间信息和基因表达特征，提出了一种新颖的空间图节点嵌入模型，优化了特征学习与拓扑结构的保留 | NA | 研究空间转录组学中的基因表达及其空间分布 | 从不同平台获取的各种空间转录组数据集 | 数字病理学 | NA | 对比学习 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 各种空间转录组数据集，空间分辨率各异 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-04 |
Unveiling diabetic nephropathy: a novel diagnostic model through single-cell sequencing and co-expression analysis
2024-Jul-03, Aging
DOI:10.18632/aging.205982
PMID:38968594
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和共表达分析揭示了糖尿病肾病的潜在生物标志物和诊断模型 | 创新点在于首次探索了程序性细胞死亡的新类型——二硫酸死亡在糖尿病肾病中的重要性，并建立了基于该机制的诊断模型 | 本研究的局限在于使用的样本来自公开数据集，可能存在数据的多样性和异质性问题 | 研究的目的是揭示糖尿病肾病中二硫酸死亡的作用及其作为早期诊断生物标志物的潜力 | 研究对象为糖尿病肾病患者与健康对照组的细胞样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 包括糖尿病肾病患者和健康对照的样本数据分析 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-05 |
Characterize molecular signatures and establish a prognostic signature of gastric cancer by integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2024-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01168-w
PMID:39044041
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，特征化胃癌的分子特征并建立预后特征。 | 通过整合不同维度的数据，识别了226个候选标记基因，并开发了一个高预测准确度的预后模型。 | 疾病的异质性和分子交互的复杂性仍然是挑战。 | 研究胃癌的分子基础，开发个性化治疗策略的预后模型。 | 关注胃癌患者的分子特征和相关的临床参数。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和大规模RNA测序(bulk RNA-seq) | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-05 |
Characterization of cuproptosis signature in clear cell renal cell carcinoma by single cell and spatial transcriptome analysis
2024-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01162-2
PMID:39044005
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析对清细胞肾细胞癌中的铜死亡特征进行了表征 | 首次系统研究了铜死亡相关基因与清细胞肾细胞癌肿瘤微环境的关联 | 仅研究了清细胞肾细胞癌，未涉及其他类型肿瘤 | 探讨铜死亡在清细胞肾细胞癌中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 清细胞肾细胞癌的不同阶段的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 多阶段清细胞肾细胞癌的样本集 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis unveils immunosuppressive microenvironment in the occurrence and development of multiple pulmonary lung cancers
2024-Jul-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00651-5
PMID:39043808
|
研究论文 | 本研究揭示了多发性肺癌中免疫抑制微环境的特征 | 研究首次全面调查了与不同影像学或病理特征相关的多发性肺癌的分子和免疫特征 | 未提供关于样本来源的详细信息及样本数量的具体分布 | 研究多发性肺癌的发生与发展与其免疫微环境之间的关系 | 收集了27个肺结节及相应的正常组织和血液样本进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 全外显子测序（WES）和全转录组测序 | NA | 组织样本，血液样本 | 27个肺结节及匹配的正常组织和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-05 |
P53 Activation Promotes Maturational Characteristics of Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes in 3-Dimensional Suspension Culture Via FOXO-FOXM1 Regulation
2024-Jul-02, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.033155
PMID:38934864
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研究论文 | 本研究探讨了p53激活如何通过调节FOXO和FOXM1的平衡来促进人诱导多能干细胞衍生心肌细胞的成熟特性 | 首次揭示了p53激活在三维悬浮培养中促进hiPSC-CM成熟的机制 | 研究样本量较小，仅为每组3到6个样本，可能影响结果的普遍性 | 研究hiPSC-CM的成熟机制，以促进其临床转化 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 每组3到6个hiPSC-CM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing analysis and bulk-RNA sequencing analysis to forecast necroptosis in cutaneous melanoma prognosis
2024-Jul, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15148
PMID:39051739
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和普通RNA测序分析预测皮肤黑色素瘤中的坏死性凋亡 | 研究中提出了一种通过机器学习算法构建的与坏死性凋亡相关的标志（NRS），并验证了其在多组中的预后能力 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，可能存在数据的代表性和准确性问题 | 探讨坏死性凋亡在皮肤黑色素瘤预后中的作用 | 主要研究对象为皮肤黑色素瘤患者的细胞，包括不同类型的细胞团和相关基因表达模式 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序，普通RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 共分析了四个队列的黑色素瘤数据，包括一个TCGA和三个GEO队列 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals the potential prognostic roles and immunological values of unc-5 netrin receptor A (UNC5A) in glioma
2024-Jul-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01174-y
PMID:39039366
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研究论文 | 该文章探讨了UNC5A在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 首次综合分析了UNC5A在胶质瘤中的作用，并提出其作为新的预后和免疫标志物的潜力 | 未详细讨论UNC5A在治疗胶质瘤中的具体机制 | 研究UNC5A在胶质瘤中的功能及其与肿瘤免疫的关联 | UNC5A在胶质瘤患者中的表达及其预后意义 | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 大规模RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用了TCGA及CGGA数据集中的胶质瘤患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-04 |
Identification of tumor-specific T cell signature predicting cancer immunotherapy response in bladder cancer by multi-omics analysis and experimental verification
2024-Jul-20, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03447-6
PMID:39033098
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研究论文 | 本文开发了一种基于肿瘤特异性T细胞相关基因的五基因签名，以预测膀胱癌患者对免疫疗法的响应 | 提出了一种新的肿瘤特异性T细胞签名（TstcSig），该签名能够预测膀胱癌免疫疗法的结果 | 目前尚未对TstcSig在其他类型癌症中的预测能力进行广泛验证 | 研究肿瘤特异性T细胞在膀胱癌免疫治疗中的作用及其相关基因 | 膀胱癌患者及其免疫疗法响应的相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 在多个免疫治疗队列中验证，包括TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-05 |
Determining M2 macrophages content for the anti-tumor effects of metal-organic framework-encapsulated pazopanib nanoparticles in breast cancer
2024-Jul-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02694-z
PMID:39033109
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研究论文 | 该文章探讨了金属有机框架封装的pazopanib纳米粒子在乳腺癌中的抗肿瘤效果。 | 创新点在于开发了一种新型纳米平台以提高pazopanib的抗肿瘤活性，并通过单细胞RNA测序揭示了其在抑制M2型巨噬细胞方面的作用。 | 研究中可能存在对临床适用性的局限性，尚需进一步的临床试验验证。 | 研究旨在提高pazopanib在乳腺癌治疗中的疗效。 | 研究对象包括四种小鼠肿瘤模型和人类乳腺癌MDA-MB-231模型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及小鼠和人类的乳腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-05 |
Pathological mechanisms and novel drug targets in fibrotic interstitial lung disease
2024-Jul-19, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00345-2
PMID:39026335
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研究论文 | 本研究探讨了纤维性间质性肺病中的病理机制和新药靶点 | 识别出新的病理机制，代表了目前正在临床开发的新药靶点 | 未详细讨论研究方法的局限性 | 阐明肺间质性疾病纤维化进展的病理机制 | 以纤维性间质性肺病患者作为研究对象 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |