单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity and key subsets of tissue-resident memory T cells in cervical cancer
2024-Jul-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00637-3
PMID:39014148
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研究论文 | 本研究分析了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的细胞异质性及其关键亚群 | 首次揭示了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的异质性及其在免疫反应中的作用 | 研究仅基于有限的样本数量和组织来源，可能无法涵盖所有的细胞特性 | 探讨组织驻留记忆T细胞在宫颈癌中的异质性及其对癌症免疫的贡献 | 来自11个宫颈癌组织和5个正常宫颈组织的组织驻留记忆T细胞及非组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12945个组织驻留记忆T细胞和25627个非组织驻留记忆T细胞 |
| 342 | 2024-08-05 |
Establishing an oxidative stress mitochondria-related prognostic model in hepatocellular carcinoma based on multi-omics characteristics and machine learning computational framework
2024-Jul-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01147-1
PMID:39014263
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研究论文 | 本文建立了一种基于多组学特征和机器学习计算框架的氧化应激线粒体相关预后模型，用于肝细胞癌的预测 | 采用多种机器学习算法构建了一种包含26个基因的共识氧化应激线粒体相关标志物，并筛选出6个具有良好预后价值的基因 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能存在数据异质性和外部验证不足的问题 | 本文旨在探讨线粒体功能与氧化应激在肝细胞癌中的预后价值 | 研究对象为肝细胞癌患者的基因表达数据 | 机器学习 | 肝癌 | 基因表达分析，机器学习 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用来自TCGA、GEO和ICGC的HCC样本数据 |
| 343 | 2024-08-05 |
Single cell profiling to determine influence of wheeze and early-life viral infection on developmental programming of airway epithelium
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602506
PMID:39026695
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研究论文 | 本研究旨在表征哮喘儿童气道上皮的发育表型及其与早期呼吸道病毒感染的关系 | 研究发现哮喘儿童的气道上皮在发育过程中表现出异常分化和基底细胞活化，这为理解哮喘的生物学基础提供了新见解 | 该研究主要集中于特定年龄段的儿童，可能无法代表所有年龄组的情况 | 探索幼儿哮喘与早期RSV感染对气道上皮发育编程的影响 | 从不同组别的哮喘与非哮喘儿童中收集的鼻气道上皮细胞 | 数字病理学 | 幼儿哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 共计涉及来自四个相互排斥组的儿童 |
| 344 | 2024-08-05 |
T-distributed Stochastic Neighbor Network for unsupervised representation learning
2024-Jul-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2024.106520
PMID:39024709
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研究论文 | 本文提出了一种简单的端到端T-分布随机邻居网络（TsNet）用于无监督表示学习和聚类下游任务 | 引入了适应性连接分布学习模块和基于T-分布随机邻居嵌入的损失函数，显著提高了表示的区分度 | 未提及具体的局限性 | 探索如何从通用数据中提取有意义的结构信息 | 通用数据的聚类表示学习，包括向量、图像和表格数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | TsNet | 图像，文本 | 涉及真实单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集的聚类 |
| 345 | 2024-08-05 |
Deciphering the heterogeneity of differentiating hPSC-derived corneal limbal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-Jul-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.06.001
PMID:38942029
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了人类多能干细胞(hPSC)向角膜缘干细胞(LSCs)分化过程中的异质性 | 首次描述了在hPSC分化过程中出现的四个之前未被描述的细胞状态 | 研究中所涉及的细胞系有限，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入理解hPSC向LSCs的分化过程 | 研究了三条hPSC细胞系在向角膜缘干细胞分化过程中的异质性 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 三条hPSC细胞系 |
| 346 | 2024-08-05 |
Decoding cellular plasticity and niche regulation of limbal stem cells during corneal wound healing
2024-Jul-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03816-y
PMID:38971839
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研究论文 | 本研究探讨了角膜伤害中透明角膜干细胞及其生态位的分子和功能响应 | 定义了透明角膜干细胞的分子特征并重建了角膜上皮细胞的伪时间轨迹，识别了新的转录因子Creb5及其在伤害后的作用 | 尚未深入探讨Creb5和OSM在临床应用中的具体效果 | 揭示透明角膜干细胞在角膜伤害愈合过程中的作用及其调控机制 | 透明角膜干细胞及其生态位细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自正常小鼠和角膜上皮缺损模型的组织样本 |
| 347 | 2024-08-04 |
Applications of single-cell multi-omics in liver cancer
2024-Jul, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101094
PMID:39022385
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综述 | 本文探讨了单细胞多组学在肝癌研究中的应用。 | 强调通过整合多种单模态技术到单细胞分辨率的多组学方法中，推动个体化治疗的发展。 | 当前单细胞多组学在肝癌研究中的应用仍然有限。 | 旨在深入理解肝癌的生物学及其临床影响。 | 主要关注肝细胞癌（HCC）的细胞异质性及其治疗反应机制。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-05 |
Unveiling mitochondrial and ribosomal gene deregulation and tumor microenvironment dynamics in acute myeloid leukemia
2024-Jul, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00788-2
PMID:38806621
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研究论文 | 该研究揭示了急性髓系白血病中线粒体和核糖体基因的失调及肿瘤微环境的动态 | 使用机器学习方法重新分析scRNA-seq数据，识别急性髓系白血病中枝状细胞的基因模块失调和免疫信号通路的失衡 | 研究可能受到样本规模和数据来源的限制 | 深入理解急性髓系白血病细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 急性髓系白血病患者的细胞与基因表达数据 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | scRNA-seq | 正常Cox模型和人工神经网络模型 | 基因表达数据 | CSC和G20队列的样本 |
| 349 | 2024-08-05 |
Translational regulation enhances distinction of cell types in the nervous system
2024-Jul-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90713
PMID:39010741
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研究论文 | 这篇文章揭示了转录后调控在神经系统细胞类型区分中的重要性 | 研究首次将转录后调控与细胞类型特异性蛋白表达联系起来，为理解细胞多样性的分子机制提供了新见解 | 研究仅在特定的转基因小鼠模型中进行，可能不适用于所有类型的神经细胞 | 揭示转录后调控对神经系统细胞类型区分的影响 | 研究基因定义的脑细胞的转录组和翻译组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq | NA | RNA数据 | 基因定义的细胞 |
| 350 | 2024-08-04 |
Single-cell total-RNA profiling unveils regulatory hubs of transcription factors
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50291-3
PMID:39009595
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研究论文 | 本文开发了一种基于总RNA的单细胞RNA测序方法snapTotal-seq，并展示其在转录因子调控中的应用 | 创新性地提出了一种同时测量未剪接RNA和剪接RNA的一步总RNA化学方法 | 只对单细胞RNA-seq化学的表现进行了比较，未评估其在其他细胞类型或条件下的适用性 | 本研究旨在通过新的方法深入了解基因调控，特别是在细胞状态转变中的调控机制 | 研究对象包括单细胞中的转录因子及其调控的细胞周期和衰老 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | LASSO回归 | RNA | NA |
| 351 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics analysis of bullous pemphigoid unveils immune-stromal crosstalk in type 2 inflammatory disease
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50283-3
PMID:39009587
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研究论文 | 本研究揭示了水疱性皮肤病中免疫-基质间的相互作用。 | 首次识别IL13-IL13RA1配体-受体对作为水疱性皮肤病中免疫-基质互动的重要介质。 | 未提供关于样本数量和具体实验条件的详细信息。 | 全面了解水疱性皮肤病的免疫景观，特别是免疫-基质之间的相互作用。 | 研究T细胞、树突状细胞和成纤维细胞等关键细胞群体。 | 数字病理学 | 水疱性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 352 | 2024-08-04 |
Endoplasmic reticulum stress promotes hepatocellular carcinoma by modulating immunity: a study based on artificial neural networks and single-cell sequencing
2024-Jul-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05460-9
PMID:39010084
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激如何通过调节免疫反应促进肝细胞癌的发展 | 提出了一种新的预测模型，结合多种机器学习算法与人工神经网络，为肝细胞癌的诊断提供新方向 | 采用的数据集和方法可能无法全面覆盖所有与内质网应激相关的基因和免疫机制 | 探讨内质网应激在肝细胞癌发展中的分子机制及早期诊断和治疗靶点 | 研究涉及与内质网应激相关的不同ially表达基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、机器学习（随机森林和支持向量机）、人工神经网络 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 综合GEO数据集（GSE25097, GSE62232, GSE65372） |
| 353 | 2024-08-05 |
Generation of musculoskeletal cells from human urine epithelium-derived presomitic mesoderm cells
2024-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01274-w
PMID:39010176
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研究论文 | 本研究探讨了从人尿上皮衍生的前体中胚层细胞生成肌肉骨骼细胞的过程。 | 本研究首次展示了UiPSM细胞的分化潜力，并证明其在移植后能够形成成熟的骨骼肌细胞。 | 研究未详细探讨UiPSM细胞在不同体内环境下的长期表现及其潜在的不良反应。 | 研究UiPSM细胞的分化潜力及其在肌肉骨骼发展中的应用。 | 本研究主要对象为从人尿上皮提取的UiPSM细胞及其衍生的骨骼肌细胞。 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 生物发光成像，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞培养，生物成像 | 使用了在MITRG小鼠前胫肌中的UiPSM细胞移植进行评估 |
| 354 | 2024-08-04 |
Advance and Application of Single-cell Transcriptomics in Auditory Research
2024-Jul, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01149-z
PMID:38015350
|
综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在听觉研究中的应用 | 文章创新性地应用单细胞RNA测序技术揭示听觉器官中细胞的复杂生物机制 | 对于内耳的细胞异质性及其有限的细胞数量的深入研究仍然不足 | 本研究旨在提供听觉器官发展的参考、听力损失的发病机制以及再生疗法的基础 | 研究对象为听觉器官中的不同类型细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-04 |
Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics
2024-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.04.015
PMID:38692412
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究肾移植排斥反应的潜力 | 结合公共单细胞RNA测序数据，首次应用空间转录组学技术研究肾移植排斥反应 | 关于该技术的发展和未来应用的限制需要考虑 | 研究肾移植排斥反应的分子和细胞机制 | 分析非排斥、T细胞介导的急性排斥、间质纤维化和肾小管萎缩的活检样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 活检样本 | 多种病理状态下的活检样本 |
| 356 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing advances in research on mesenchymal stem/stromal cells
2024-Jul, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01076-9
PMID:38743204
|
综述 | 本文回顾了单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用及其前景 | 强调了单细胞测序技术在揭示间充质干细胞异质性和分子特征中的重要性 | 未提及具体的局限性 | 审视单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞（MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-04 |
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-Jul, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24843
PMID:38668123
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研究论文 | 本研究评估了不同酶解方法对小鼠肺部内皮细胞分离的影响 | 首次比较了胶原酶A和Dispase在小鼠肺内皮细胞分离中的效用，并发现胶原酶A在内皮细胞回收方面优于Dispase | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法直接应用于其他物种 | 探索不同组织解离协议对小鼠肺内皮细胞回收的影响 | 幼年和成年小鼠的肺内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未提供确切的样本数量，涉及幼年和成年小鼠的肺组织 |
| 358 | 2024-08-05 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-07, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13892
PMID:38829682
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研究论文 | 本研究探讨了早发阿尔茨海默病（EOAD）中干扰素反应性T细胞的扩展 | 发现早发阿尔茨海默病中抗病毒类干扰素信号关联基因高表达的T细胞显著扩展 | 未提及具体限制 | 研究早发阿尔茨海默病中的免疫反应 | 研究对象包括早发阿尔茨海默病患者及临床正常对照的外周血单核细胞和CD4 T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和滴度数字PCR（ddPCR） | NA | 基因表达 | 16名EOAD患者和19名CD4 T细胞样本参与者 |
| 359 | 2024-08-07 |
Decoding the building blocks of cellular processes from single-cell transcriptomics data
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01967-6
PMID:37735267
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptome atlas of human euploid and aneuploid blastocysts
2024-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01788-6
PMID:38839885
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研究论文 | 该文章探讨了人类正常和非正常胚泡的单细胞转录组图谱 | 本研究首次系统性地分析了人类非正常胚泡中转录组的改变，揭示了基因剂量效应和特定信号通路的影响 | 研究主要集中于初期的人类胚泡，可能无法完全推及其他发育阶段或物种 | 了解非正常胚泡中染色体异常如何影响细胞功能和胚胎发育 | 203个人类正常与非正常胚泡中的14,908个单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 203个胚泡包含14,908个单细胞 |