单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 493 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Whole-genome sequences reveal zygotic composition in chimeric twins
2024-Jul-18, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100301
PMID:38773773
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研究论文 | 该研究使用全基因组测序揭示了嵌合双胞胎的合子组成 | 本研究首次精确理解双胞胎的合子组成，并展示了在血液组织中细胞交换的历史 | 研究仅限于一种特定的双胞胎和三胞胎家庭，样本量较小 | 探讨人类发育过程中双胞胎的细胞历史 | 研究了一个三胞胎家庭和一个双胞胎家庭的合子组成 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，血液组织样本 | 一组三胞胎和一对双胞胎 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-05 |
Destabilization of mRNAs enhances competence to initiate meiosis in mouse spermatogenic cells
2024-Jul-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202740
PMID:38884383
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研究论文 | 该文章探讨了mRNA不稳定性如何增强小鼠生精细胞启动减数分裂的能力 | 本文首次揭示了MEIOC在减数分裂启动前促进生精细胞转录组变化的机制 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全推广至其他物种 | 研究MEIOC如何在生精细胞中分子层面上支持减数分裂的早期阶段 | 小鼠生精细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 开发同步的小鼠生精细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-04 |
Diffusion on PCA-UMAP Manifold: The Impact of Data Structure Preservation to Denoise High-Dimensional Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Jul-09, Biology
DOI:10.3390/biology13070512
PMID:39056705
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研究论文 | 该文章提出了一种基于PCA-UMAP扩散的方法来去噪高维单细胞RNA测序数据 | 通过使用PCA-UMAP扩散方法，增强了数据结构的保持，优化了PCA维度和扩散参数的使用 | 未明确提及 | 解决单细胞转录组学中数据噪声和低效转录捕获的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 高维单细胞数据 | 经过多种scRNA-seq数据集验证 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-04 |
A single-cell pan-cancer analysis to show the variability of tumor-infiltrating myeloid cells in immune checkpoint blockade
2024-Jul-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50478-8
PMID:39034339
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润性髓系细胞在免疫检查点抑制中的变异性 | 通过单细胞转录组学进行全癌症类型分析，揭示了TIMs在不同癌症类型中的丰度和动力学行为的显著变化 | 在研究中可能未考虑所有癌症类型或个体差异，样本量相对有限 | 研究肿瘤微环境中TIMs的功能以及它们与肿瘤浸润淋巴细胞的相互作用 | 192个来自129名患者的肿瘤样本中的肿瘤浸润性髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 192个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-04 |
Unraveling Spatial Domain Characterization in Spatially Resolved Transcriptomics with Robust Graph Contrastive Clustering
2024-Jul-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae451
PMID:39012523
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研究论文 | 本文开发了一种深度图对比聚类框架stDGCC，能够准确揭示空间领域 | 本文通过显式建模空间信息和基因表达特征，提出了一种新颖的空间图节点嵌入模型，优化了特征学习与拓扑结构的保留 | NA | 研究空间转录组学中的基因表达及其空间分布 | 从不同平台获取的各种空间转录组数据集 | 数字病理学 | NA | 对比学习 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 各种空间转录组数据集，空间分辨率各异 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-04 |
Unveiling diabetic nephropathy: a novel diagnostic model through single-cell sequencing and co-expression analysis
2024-Jul-03, Aging
DOI:10.18632/aging.205982
PMID:38968594
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和共表达分析揭示了糖尿病肾病的潜在生物标志物和诊断模型 | 创新点在于首次探索了程序性细胞死亡的新类型——二硫酸死亡在糖尿病肾病中的重要性，并建立了基于该机制的诊断模型 | 本研究的局限在于使用的样本来自公开数据集，可能存在数据的多样性和异质性问题 | 研究的目的是揭示糖尿病肾病中二硫酸死亡的作用及其作为早期诊断生物标志物的潜力 | 研究对象为糖尿病肾病患者与健康对照组的细胞样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 包括糖尿病肾病患者和健康对照的样本数据分析 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-05 |
Characterize molecular signatures and establish a prognostic signature of gastric cancer by integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2024-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01168-w
PMID:39044041
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，特征化胃癌的分子特征并建立预后特征。 | 通过整合不同维度的数据，识别了226个候选标记基因，并开发了一个高预测准确度的预后模型。 | 疾病的异质性和分子交互的复杂性仍然是挑战。 | 研究胃癌的分子基础，开发个性化治疗策略的预后模型。 | 关注胃癌患者的分子特征和相关的临床参数。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和大规模RNA测序(bulk RNA-seq) | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-05 |
Characterization of cuproptosis signature in clear cell renal cell carcinoma by single cell and spatial transcriptome analysis
2024-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01162-2
PMID:39044005
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析对清细胞肾细胞癌中的铜死亡特征进行了表征 | 首次系统研究了铜死亡相关基因与清细胞肾细胞癌肿瘤微环境的关联 | 仅研究了清细胞肾细胞癌，未涉及其他类型肿瘤 | 探讨铜死亡在清细胞肾细胞癌中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 清细胞肾细胞癌的不同阶段的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 多阶段清细胞肾细胞癌的样本集 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis unveils immunosuppressive microenvironment in the occurrence and development of multiple pulmonary lung cancers
2024-Jul-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00651-5
PMID:39043808
|
研究论文 | 本研究揭示了多发性肺癌中免疫抑制微环境的特征 | 研究首次全面调查了与不同影像学或病理特征相关的多发性肺癌的分子和免疫特征 | 未提供关于样本来源的详细信息及样本数量的具体分布 | 研究多发性肺癌的发生与发展与其免疫微环境之间的关系 | 收集了27个肺结节及相应的正常组织和血液样本进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 全外显子测序（WES）和全转录组测序 | NA | 组织样本，血液样本 | 27个肺结节及匹配的正常组织和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-05 |
P53 Activation Promotes Maturational Characteristics of Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes in 3-Dimensional Suspension Culture Via FOXO-FOXM1 Regulation
2024-Jul-02, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.033155
PMID:38934864
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研究论文 | 本研究探讨了p53激活如何通过调节FOXO和FOXM1的平衡来促进人诱导多能干细胞衍生心肌细胞的成熟特性 | 首次揭示了p53激活在三维悬浮培养中促进hiPSC-CM成熟的机制 | 研究样本量较小，仅为每组3到6个样本，可能影响结果的普遍性 | 研究hiPSC-CM的成熟机制，以促进其临床转化 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 每组3到6个hiPSC-CM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing analysis and bulk-RNA sequencing analysis to forecast necroptosis in cutaneous melanoma prognosis
2024-Jul, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15148
PMID:39051739
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和普通RNA测序分析预测皮肤黑色素瘤中的坏死性凋亡 | 研究中提出了一种通过机器学习算法构建的与坏死性凋亡相关的标志（NRS），并验证了其在多组中的预后能力 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，可能存在数据的代表性和准确性问题 | 探讨坏死性凋亡在皮肤黑色素瘤预后中的作用 | 主要研究对象为皮肤黑色素瘤患者的细胞，包括不同类型的细胞团和相关基因表达模式 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序，普通RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 共分析了四个队列的黑色素瘤数据，包括一个TCGA和三个GEO队列 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals the potential prognostic roles and immunological values of unc-5 netrin receptor A (UNC5A) in glioma
2024-Jul-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01174-y
PMID:39039366
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研究论文 | 该文章探讨了UNC5A在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 首次综合分析了UNC5A在胶质瘤中的作用，并提出其作为新的预后和免疫标志物的潜力 | 未详细讨论UNC5A在治疗胶质瘤中的具体机制 | 研究UNC5A在胶质瘤中的功能及其与肿瘤免疫的关联 | UNC5A在胶质瘤患者中的表达及其预后意义 | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 大规模RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用了TCGA及CGGA数据集中的胶质瘤患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-04 |
Identification of tumor-specific T cell signature predicting cancer immunotherapy response in bladder cancer by multi-omics analysis and experimental verification
2024-Jul-20, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03447-6
PMID:39033098
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研究论文 | 本文开发了一种基于肿瘤特异性T细胞相关基因的五基因签名，以预测膀胱癌患者对免疫疗法的响应 | 提出了一种新的肿瘤特异性T细胞签名（TstcSig），该签名能够预测膀胱癌免疫疗法的结果 | 目前尚未对TstcSig在其他类型癌症中的预测能力进行广泛验证 | 研究肿瘤特异性T细胞在膀胱癌免疫治疗中的作用及其相关基因 | 膀胱癌患者及其免疫疗法响应的相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 在多个免疫治疗队列中验证，包括TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-05 |
Determining M2 macrophages content for the anti-tumor effects of metal-organic framework-encapsulated pazopanib nanoparticles in breast cancer
2024-Jul-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02694-z
PMID:39033109
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研究论文 | 该文章探讨了金属有机框架封装的pazopanib纳米粒子在乳腺癌中的抗肿瘤效果。 | 创新点在于开发了一种新型纳米平台以提高pazopanib的抗肿瘤活性，并通过单细胞RNA测序揭示了其在抑制M2型巨噬细胞方面的作用。 | 研究中可能存在对临床适用性的局限性，尚需进一步的临床试验验证。 | 研究旨在提高pazopanib在乳腺癌治疗中的疗效。 | 研究对象包括四种小鼠肿瘤模型和人类乳腺癌MDA-MB-231模型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及小鼠和人类的乳腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-05 |
Pathological mechanisms and novel drug targets in fibrotic interstitial lung disease
2024-Jul-19, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00345-2
PMID:39026335
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研究论文 | 本研究探讨了纤维性间质性肺病中的病理机制和新药靶点 | 识别出新的病理机制，代表了目前正在临床开发的新药靶点 | 未详细讨论研究方法的局限性 | 阐明肺间质性疾病纤维化进展的病理机制 | 以纤维性间质性肺病患者作为研究对象 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-05 |
Association of CD8+TILs co-expressing granzyme A and interferon-γ with colon cancer cells in the tumor microenvironment
2024-Jul-19, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12605-y
PMID:39030523
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研究论文 | 本研究探讨了共表达颗粒酶A和干扰素-γ的CD8肿瘤浸润淋巴细胞与结肠癌细胞之间的关系 | 揭示了GZMA和IFN-γ共表达的CD8TILs如何调节GSDMB表达的肿瘤细胞及其在结肠癌免疫微环境中的重要作用 | 结论主要基于临床样本和单细胞RNA测序数据，样本数量及其代表性可能限制了结果的普适性 | 阐明GZMA和IFN-γ共表达CD8TILs与结肠癌细胞的相互作用及其对患者预后的影响 | 结肠癌患者样本中的CD8TILs及其与GSDMB表达细胞的相互作用 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多色免疫组化 (mIHC) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals the gene expression profile and the critical signaling pathways of type II CPAM
2024-Jul-18, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01276-8
PMID:39026356
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研究论文 | 这项研究通过综合分析大宗和单细胞RNA测序，揭示了II型先天性肺气道畸形（CPAM）的基因表达谱和关键信号通路 | 首次结合大宗RNA-seq和单细胞RNA-seq，深入揭示CPAM的基因表达及细胞间通信网络 | 仅分析了CPAM患者术后的样本，可能未能全面反映疾病的全貌 | 探讨与II型CPAM发病机制相关的基因表达及潜在的治疗靶点 | 以II型CPAM患者的囊性区域和邻近正常组织的样本为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 术后提取的样本来自II型CPAM患者的囊性区域和邻近正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-05 |
Decoding ecosystem heterogeneity and transcriptional regulation characteristics of multi-subtype renal cell carcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33196
PMID:39044973
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研究论文 | 本研究全面分析了肾细胞癌的细胞多样性和细胞间通信网络。 | 通过使用单细胞RNA测序技术，首次揭示了肾细胞癌亚型中特定的巨噬细胞和CAF细胞亚群及其作用状态。 | 研究未涉及所有可能的细胞类型和细胞间交互的全面性。 | 本研究旨在深入理解肾细胞癌的细胞异质性及其调控特征。 | 研究对象为不同亚型的肾细胞癌，重点分析巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的功能状态。 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种肾癌亚型的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-04 |
Exploring ABHD5 as a Lipid-Related Biomarker in Idiopathic Pulmonary Fibrosis: Integrating Machine Learning, Bioinformatics, and In Vitro Experiments
2024-Jul-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02107-1
PMID:39046603
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研究论文 | 本研究探讨了ABHD5作为特发性肺纤维化(IPF)的脂质相关生物标志物的潜力 | 通过整合机器学习、生物信息学和体外实验，提出了ABHD5作为IPF新生物标志物的概念 | 研究可能存在样本量不足或特定数据集选择偏倚的问题 | 旨在探索IPF的脂质相关生物标志物及其机制 | 涉及特发性肺纤维化相关的数据集与细胞实验 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 机器学习、单细胞测序，细胞计数试剂盒-8，5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 涉及多个数据集和细胞实验，具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-04 |
Key factor screening in mouse NASH model using single-cell sequencing combined with machine learning
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33597
PMID:39040415
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习相结合，识别与非酒精性脂肪肝炎（NASH）进展密切相关的基因 | 结合单细胞RNA测序和深度学习技术，揭示了NASH相关基因与免疫细胞之间的关系 | NA | 识别与NASH进展相关的关键基因 | 小鼠NASH模型中的细胞群体和基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因数据 | 比较Chow组和NASH组的细胞群体数据 | NA | NA | NA | NA |