单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 505 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-04 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调节作用及其对牙槽骨流失的影响 | 研究发现JMJD3在牙周炎组织中表达上调，并通过调节巨噬细胞极化在抑制牙槽骨损失中发挥保护作用 | 本研究缺乏长期观察数据，未能充分探讨JMJD3在不同阶段牙周炎中的功能 | 旨在研究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调节机制 | 研究对象为健康人群和牙周炎患者的牙龈样本及小鼠牙周炎模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序、免疫组化染色、实时荧光定量PCR | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 健康和炎症牙周患者各9个牙龈样本 |
| 342 | 2024-08-05 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了人类牙槽内颗粒组织的细胞组成及其异质性，通过单细胞转录组图谱阐明了炎症微环境中自然分解的潜在结果 | 本研究使用单细胞RNA测序构建了人类牙槽颗粒组织的单细胞图谱，揭示了炎症颗粒组织在不同微环境中的细胞序列变异及其时间空间分布模式 | 样本量相对较小，仅涉及12个牙槽颗粒组织，可能影响结果的普适性 | 研究炎症微环境中颗粒组织的自然分解过程及其细胞组成的变化 | 来自因牙周炎而拔除的牙齿的炎症颗粒组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 涉及12个牙槽颗粒组织样本 |
| 343 | 2024-08-04 |
Skeletal stem cells in bone development, homeostasis, and disease
2024-Jul-20, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae008
PMID:38442300
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综述 | 本文讨论了骨骼干细胞在骨发育、稳态和疾病中的作用 | 揭示了骨骼干细胞不是单一的，而是由不同的干细胞在不同的骨骼部位形成 | 未提及具体的局限性 | 旨在增强对骨骼干细胞多样性和可塑性的理解 | 研究对象为骨骼干细胞在不同条件下的特征 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选、血统追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-04 |
Integration tools for scRNA-seq data and spatial transcriptomics sequencing data
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae002
PMID:38267084
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综述 | 本文汇编了19种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法 | 提供了一种全面的参考，帮助研究人员选择适合其特定研究目的的整合方法 | 每种方法有其自身的优缺点和适用范围，研究者需要根据实际情况进行选择 | 旨在帮助研究人员了解和选择适合的整合方法以分析scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序数据和空间转录组测序数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA测序数据 | 19种整合方法 |
| 345 | 2024-08-04 |
Improving cell type identification with Gaussian noise-augmented single-cell RNA-seq contrastive learning
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad059
PMID:38242863
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研究论文 | 本研究提出了一种基于高斯噪声增强的单细胞RNA测序对比学习方法以提高细胞类型识别 | 提出了一种新的高斯噪声增强的对比学习方法(GsRCL)，用于细胞类型识别任务 | 未提及具体的局限性 | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别准确性 | 面向具有挑战性的细胞类型识别任务 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 大规模计算评估 |
| 346 | 2024-08-05 |
Single-cell immune landscape of measurable residual disease in acute myeloid leukemia
2024-Jul-19, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2666-8
PMID:39034351
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研究论文 | 本研究揭示了急性髓性白血病中可测残留疾病的单细胞免疫景观 | 该论文利用单细胞RNA测序技术，创建了一个包含184,231个细胞的全面免疫景观，并发现MRD阳性和阴性CD8 T细胞在细胞毒性基因表达上的差异 | 本研究样本量较小，仅包含32名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 研究可测残留疾病在急性髓性白血病中的免疫细胞特征及其转化机制 | 源自20名MRD阳性患者和12名MRD阴性患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 32个样本（20个MRD阳性患者和12个MRD阴性患者） |
| 347 | 2024-08-05 |
Integrating multi-omics data to analyze the potential pathogenic mechanism of CTSH gene involved in type 1 diabetes in the exocrine pancreas
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad052
PMID:38050341
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研究论文 | 本研究整合多组学数据分析CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的潜在致病机制 | 通过整合eQTL、GWAS和单细胞转录组数据，确定了与1型糖尿病相关的四个潜在致病基因 | 未提及具体的局限性 | 探讨CTSH基因在1型糖尿病发病机制中的作用 | 分析1型糖尿病患者与健康对照的胰腺组织中的基因表达 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含1型糖尿病患者和健康对照的胰腺组织样本 |
| 348 | 2024-08-04 |
Identification of Immune Infiltration-related Molecular Features in Ovarian Cancer Patients and Experimental Validation of Immune Response Molecular Mechanisms through Integrated WGCNA, Machine Learning, and Single-cell Sequencing Analysis
2024-Jul-18, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过综合的WGCNA、机器学习和单细胞测序分析，探讨卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征及其免疫响应机制。 | 揭示了AIDPS在卵巢癌患者中的临床意义，并确认抑制RPL31的表达能够显著影响卵巢癌细胞的增殖和迁移。 | 研究主要基于公共数据库数据，实际临床验证需进一步加强。 | 旨在揭开卵巢癌的免疫响应机制，并为免疫基础治疗提供理论基础和治疗策略。 | 卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、机器学习、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | CoxBoost+StepCox | 基因表达数据 | 使用来自公共数据库的相关卵巢癌数据集，具体样本数量未详 |
| 349 | 2024-08-05 |
Deciphering the impact of aging on splenic endothelial cell heterogeneity and immunosenescence through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul-18, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00452-1
PMID:39026350
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研究论文 | 本研究构建了年轻和老年小鼠脾脏内皮细胞转录组的单细胞RNA图谱 | 揭示了年龄相关的分子变化及内皮细胞与免疫细胞之间的潜在相互作用 | 本研究没有涉及人类脾脏内皮细胞的相关研究 | 探讨衰老对脾脏内皮细胞异质性和免疫衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的脾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共识别了十个内皮细胞簇 |
| 350 | 2024-08-04 |
Cell type mapping of inflammatory muscle diseases highlights selective myofiber vulnerability in inclusion body myositis
2024-Jul, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00645-9
PMID:38834884
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研究论文 | 本研究揭示了与IBM相关的特定肌纤维脆弱性和细胞类型特异性驱动因素 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的结合，识别了IBM与其他肌病的不同病理特征和细胞反应 | 对IBM病理进展的因果因素和分子驱动因素仍然了解不足 | 研究IBM的细胞类型特异性驱动因素及其与其他肌病的比较 | 聚焦于IBM患者肌肉活检样本中的细胞类型和基因表达特征 | 数字病理学 | 老年性肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 生物样本数据 | 来自IBM患者的肌肉活检样本 |
| 351 | 2024-08-05 |
Exercise rejuvenates microglia and reverses T cell accumulation in the aged female mouse brain
2024-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14172
PMID:38747044
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研究论文 | 本研究探讨了运动对衰老女性小鼠大脑微胶质细胞的年轻化及T细胞积累的影响 | 展示了运动对老年微胶质细胞的选择性影响，并重新转变其基因表达特征 | 目前对运动如何具体影响认知的机制仍不明确 | 研究运动如何影响小鼠的脑龄化及相关细胞类型 | 18个月大的女性小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 18个月大的女性小鼠 |
| 352 | 2024-08-05 |
Perimenopausal and Menopausal Mammary Glands In A 4-Vinylcyclohexene Diepoxide Mouse Model
2024-Jul-17, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-024-09569-x
PMID:39017946
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研究论文 | 该论文描述了一种新的小鼠模型，能够表征围绝经期和绝经期乳腺腺体。 | 创新点在于开发了4-乙烯基环己烯二醇小鼠模型，该模型能够精准模拟女性的围绝经期和绝经期状态。 | 该研究未明确提及对模型的其他潜在限制。 | 研究围绝经期和绝经期对乳腺癌的影响。 | 对4-乙烯基环己烯二醇处理的小鼠乳腺进行表征与分析。 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | VCD小鼠模型 | 生物样本 | 实验中使用了处理的小鼠，但具体样本数量未提及 |
| 353 | 2024-08-05 |
The thalamic reticular nucleus orchestrates social memory
2024-Jul-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.04.013
PMID:38701789
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研究论文 | 本文研究了感觉丘脑网状核中介导社会记忆的parvalbumin阳性神经元 | 揭示了sTRN神经元通过调节新的皮层-丘脑回路协调社会记忆的机制 | 研究中可能未涵盖所有影响社会记忆的神经元类型或回路 | 探讨sTRN神经元在社会记忆中的作用 | 老鼠的parvalbumin阳性神经元及其在社会记忆中的功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 354 | 2024-08-04 |
Integrative multi-omics analysis reveals cellular and molecular insights into primary Sjögren's syndrome
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33433
PMID:39027515
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研究论文 | 本研究综合分析了基因组、转录组、蛋白质组和单细胞测序数据，以揭示原发性舍格伦综合征的分子基础 | 通过整合多组学数据，发现CTSS和GSTO1是潜在的生物标志物和治疗靶点 | 需要进一步研究以阐明潜在机制并开发针对这种复杂自身免疫疾病的靶向疗法 | 研究原发性舍格伦综合征的分子基础及探索潜在的治疗靶点 | 研究原发性舍格伦综合征患者的不同血细胞类型的差异表达基因 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 355 | 2024-08-04 |
NDC80/HEC1 promotes macrophage polarization and predicts glioma prognosis via single-cell RNA-seq and in vitro experiment
2024-Jul, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14850
PMID:39021287
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研究论文 | 该研究探讨了HEC1在胶质瘤中的功能及其对预后的影响 | 首次揭示了HEC1的过表达与胶质瘤预后不良和肿瘤微环境中的免疫抑制相关 | 研究主要集中在细胞实验和RNA-seq分析，临床应用尚需进一步验证 | 探讨HEC1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 胶质瘤及其细胞系 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 人类胶质瘤组织和细胞系 |
| 356 | 2024-08-04 |
Opening the Black Box: Spatial Transcriptomics and the Relevance of Artificial Intelligence-Detected Prognostic Regions in High-Grade Serous Carcinoma
2024-Jul, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100508
PMID:38704029
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研究论文 | 本研究探讨了空间转录组学与人工智能识别的与预后相关区域在高等级浆液性癌中的相关性 | 该研究展示了AI引导的空间转录组分析改善了与患者预后相关的生物特征的识别 | 对肿瘤的异质性理解有限，且样本量相对较小 | 提高对高等级浆液性癌患者预后相关生物特征的理解 | 研究对象为16名接受初次减瘤手术和铂类化疗的高等级浆液性癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 组织样本 | 16名患者，分别为8名短期和长期化疗反应组 |
| 357 | 2024-08-05 |
Integrative profiling of untreated primary membranous nephropathy at the single-cell transcriptome level
2024-Jul, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfae168
PMID:39027416
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研究论文 | 本研究在单细胞转录组水平上综合剖析了未治疗的原发性膜性肾病 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析原发性膜性肾病患者的血液、肾脏和尿液样本，揭示了细胞成分和细胞间通信的变化 | 样本数量较少，仅包含五名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨原发性膜性肾病的发病机制与潜在的干预策略 | 五名经活检证实的原发性膜性肾病患者 | 数字病理学 | 原发性膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液、肾脏和尿液样本 | 五名患者的血液、肾脏和尿液样本 |
| 358 | 2024-08-05 |
Selectively T cell phosphorylation activation of azvudine in the thymus tissue with immune protection effect
2024-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.03.032
PMID:39027259
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研究论文 | 本研究探讨了药物Azvudine在胸腺组织中选择性激活T细胞磷酸化的作用及其免疫保护效果 | 研究表明胸腺的免疫细胞对氟呱韦(FNC)表现出较强的代谢能力，并强调了磷酸化激酶在NA药物性质评估中的重要性 | 本研究主要在大鼠和树猕猴模型中进行，可能缺乏对人类患者的直接适用性 | 探讨Azvudine在处理COVID-19患者时的免疫保护机制 | 该研究的对象为大鼠和SARS-CoV-2树猕猴的胸腺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，蛋白质组学，平行反应监测（PRM） | NA | RNA，蛋白质 | NA |
| 359 | 2024-08-05 |
scBoolSeq: Linking scRNA-seq statistics and Boolean dynamics
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011620
PMID:38976751
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研究论文 | 提出了一种名为scBoolSeq的方法，旨在将scRNA-seq数据与基因的布尔激活状态双向链接。 | scBoolSeq能够通过计算统计标准和适应基因相关参数的概率模型，成功实现对scRNA-seq数据的二值化和从布尔模型生成合成数据。 | 将scRNA-seq数据特征与布尔状态链接是一项具有挑战性的任务。 | 研究目的在于实现scRNA-seq数据与布尔动力学之间的连接，以促进数据驱动的模型构建和验证。 | 研究对象包括基因及转录因子的激活状态以及scRNA-seq数据集。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用参考的scRNA-seq数据集进行案例研究，具体样本量未明确说明 |
| 360 | 2024-08-05 |
Integrated single cell-RNA sequencing and Mendelian randomization for ischemic stroke and metabolic syndrome
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110240
PMID:39021802
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化，探讨代谢综合征与缺血性中风之间的分子机制和遗传关联 | 首次识别缺血性中风与代谢综合征之间的共同分子特征和遗传关联 | 未能深入探讨具体的代谢失调机制和环境因素的影响 | 理解代谢失调在缺血性中风中的作用 | 缺血性中风和代谢综合征之间的遗传关联 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | 随机森林, Lasso回归, XGBoost | 基因表达数据 | 涉及多个细胞群体的标准化数据集 |