单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 524 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-05 |
Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2024-Jul-22, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae364
PMID:39037931
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研究论文 | 本文揭示了系统性红斑狼疮患者在使用belimumab治疗中的B淋巴细胞动态变化 | 首次利用纵向单细胞转录组数据研究了抗BAFF治疗中B细胞的动态变化 | 样本数量有限，仅涉及四名韩国SLE患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SLE患者针对靶向疗法的治疗反应机制 | 四名韩国系统性红斑狼疮患者 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名系统性红斑狼疮患者，分析超过73,000个PBMC |
| 302 | 2024-08-05 |
ApoE ε4-dependent alteration of CXCR3 + CD127 + CD4 + T cells is associated with elevated plasma neurofilament light chain in Alzheimer's disease
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.28.596276
PMID:38853824
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研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病（AD）患者外周血中适应性免疫细胞的成分，并与神经炎症相关。 | 发现外周适应性免疫反应的失调可能受ApoE ε4基因型的影响，尤其是CXCR3 + CD127 + Th1细胞的变化。 | 该研究的样本量及范围可能限制了结果的普遍适用性 | 研究阿尔茨海默病患者外周适应性免疫细胞的组成与神经炎症的关系。 | 针对阿尔茨海默病患者的外周血单核细胞进行分析。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质量细胞术（CyTOF）及单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | NA |
| 303 | 2024-08-05 |
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.02.573939
PMID:38260306
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研究论文 | 本研究介绍了具有反向生物极性的人的气道类器官，推动药物开发标准化。 | 提出了一种新型的气道类器官，能够高通量分析与病毒感染的相关性，具有重要临床意义。 | 本研究主要集中在SARS-CoV-2的研究上，可能限制了其在其他病毒研究中的应用。 | 探讨高通量气道类器官在抗病毒药物筛选中的应用。 | 研究对象为与SARS-CoV-2相关的人气道类器官。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 约100个细胞 |
| 304 | 2024-08-05 |
Epigenetic Alteration of Smooth Muscle Cells Regulates Endothelin-Dependent Blood Pressure and Hypertensive Arterial Remodeling
2024-Jul-10, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.07.09.24310178
PMID:39040193
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研究论文 | 这篇文章探讨了平滑肌细胞的表观遗传改变如何调节内皮素依赖的血压和高血压动脉重塑。 | 识别了与高血压相关的DNA变异，并揭示了JMJD3在平滑肌细胞特异性基因表达中的重要性。 | 本研究的局限性在于可能未能涵盖所有与高血压相关的基因变异，且使用的动物模型可能不完全代表人类生理。 | 揭示高血压中平滑肌细胞功能的重要基因及其调控机制。 | 研究对象为平滑肌细胞及其在高血压中的表观遗传调控。 | 数字病理学 | 高血压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 基因组数据和转录组数据 | 三个独立的人类GWAS和孟德尔随机化研究 |
| 305 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing, spatial transcriptome ad periodontitis: Rethink pathogenesis and classification
2024-07, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14761
PMID:37794757
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综述 | 本综述阐明了单细胞RNA测序和空间转录组学在牙周炎中的应用 | 探讨了细胞群体和基因特征与牙周炎病因的相关性，带来了新的诊断思路 | 目前尚未确定与牙周炎相关的具体细胞或基因特征 | 研究单细胞测序和空间转录组学在牙周炎病理学和分类中的应用 | 人类的牙周炎相关研究 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 (ST) | NA | 文献 | 22篇涉及人类的研究论文 |
| 306 | 2024-08-05 |
CTCF mutation at R567 causes developmental disorders via 3D genome rearrangement and abnormal neurodevelopment
2024-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49684-1
PMID:38951485
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研究论文 | 本文探讨了CTCF R567W突变对发育紊乱的影响及其机制 | 研究首次揭示了CTCF突变如何通过3D基因组重构影响神经发育 | 仅探索了特定突变的影响，缺乏对其他CTCF突变的广泛分析 | 阐明CTCF突变对人类神经发育障碍的影响及其潜在机制 | 小鼠模型和人类胚胎干细胞衍生的皮层类器官模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠及其胚胎干细胞衍生的皮层类器官 |
| 307 | 2024-08-04 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调节作用及其对牙槽骨流失的影响 | 研究发现JMJD3在牙周炎组织中表达上调，并通过调节巨噬细胞极化在抑制牙槽骨损失中发挥保护作用 | 本研究缺乏长期观察数据，未能充分探讨JMJD3在不同阶段牙周炎中的功能 | 旨在研究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调节机制 | 研究对象为健康人群和牙周炎患者的牙龈样本及小鼠牙周炎模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序、免疫组化染色、实时荧光定量PCR | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 健康和炎症牙周患者各9个牙龈样本 |
| 308 | 2024-08-05 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了人类牙槽内颗粒组织的细胞组成及其异质性，通过单细胞转录组图谱阐明了炎症微环境中自然分解的潜在结果 | 本研究使用单细胞RNA测序构建了人类牙槽颗粒组织的单细胞图谱，揭示了炎症颗粒组织在不同微环境中的细胞序列变异及其时间空间分布模式 | 样本量相对较小，仅涉及12个牙槽颗粒组织，可能影响结果的普适性 | 研究炎症微环境中颗粒组织的自然分解过程及其细胞组成的变化 | 来自因牙周炎而拔除的牙齿的炎症颗粒组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 涉及12个牙槽颗粒组织样本 |
| 309 | 2024-08-04 |
Skeletal stem cells in bone development, homeostasis, and disease
2024-Jul-20, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae008
PMID:38442300
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综述 | 本文讨论了骨骼干细胞在骨发育、稳态和疾病中的作用 | 揭示了骨骼干细胞不是单一的，而是由不同的干细胞在不同的骨骼部位形成 | 未提及具体的局限性 | 旨在增强对骨骼干细胞多样性和可塑性的理解 | 研究对象为骨骼干细胞在不同条件下的特征 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选、血统追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-04 |
Integration tools for scRNA-seq data and spatial transcriptomics sequencing data
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae002
PMID:38267084
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综述 | 本文汇编了19种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法 | 提供了一种全面的参考，帮助研究人员选择适合其特定研究目的的整合方法 | 每种方法有其自身的优缺点和适用范围，研究者需要根据实际情况进行选择 | 旨在帮助研究人员了解和选择适合的整合方法以分析scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序数据和空间转录组测序数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA测序数据 | 19种整合方法 |
| 311 | 2024-08-04 |
Improving cell type identification with Gaussian noise-augmented single-cell RNA-seq contrastive learning
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad059
PMID:38242863
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研究论文 | 本研究提出了一种基于高斯噪声增强的单细胞RNA测序对比学习方法以提高细胞类型识别 | 提出了一种新的高斯噪声增强的对比学习方法(GsRCL)，用于细胞类型识别任务 | 未提及具体的局限性 | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别准确性 | 面向具有挑战性的细胞类型识别任务 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 大规模计算评估 |
| 312 | 2024-08-05 |
Single-cell immune landscape of measurable residual disease in acute myeloid leukemia
2024-Jul-19, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2666-8
PMID:39034351
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研究论文 | 本研究揭示了急性髓性白血病中可测残留疾病的单细胞免疫景观 | 该论文利用单细胞RNA测序技术，创建了一个包含184,231个细胞的全面免疫景观，并发现MRD阳性和阴性CD8 T细胞在细胞毒性基因表达上的差异 | 本研究样本量较小，仅包含32名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 研究可测残留疾病在急性髓性白血病中的免疫细胞特征及其转化机制 | 源自20名MRD阳性患者和12名MRD阴性患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 32个样本（20个MRD阳性患者和12个MRD阴性患者） |
| 313 | 2024-08-05 |
Integrating multi-omics data to analyze the potential pathogenic mechanism of CTSH gene involved in type 1 diabetes in the exocrine pancreas
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad052
PMID:38050341
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研究论文 | 本研究整合多组学数据分析CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的潜在致病机制 | 通过整合eQTL、GWAS和单细胞转录组数据，确定了与1型糖尿病相关的四个潜在致病基因 | 未提及具体的局限性 | 探讨CTSH基因在1型糖尿病发病机制中的作用 | 分析1型糖尿病患者与健康对照的胰腺组织中的基因表达 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含1型糖尿病患者和健康对照的胰腺组织样本 |
| 314 | 2024-08-04 |
Identification of Immune Infiltration-related Molecular Features in Ovarian Cancer Patients and Experimental Validation of Immune Response Molecular Mechanisms through Integrated WGCNA, Machine Learning, and Single-cell Sequencing Analysis
2024-Jul-18, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过综合的WGCNA、机器学习和单细胞测序分析，探讨卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征及其免疫响应机制。 | 揭示了AIDPS在卵巢癌患者中的临床意义，并确认抑制RPL31的表达能够显著影响卵巢癌细胞的增殖和迁移。 | 研究主要基于公共数据库数据，实际临床验证需进一步加强。 | 旨在揭开卵巢癌的免疫响应机制，并为免疫基础治疗提供理论基础和治疗策略。 | 卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、机器学习、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | CoxBoost+StepCox | 基因表达数据 | 使用来自公共数据库的相关卵巢癌数据集，具体样本数量未详 |
| 315 | 2024-08-05 |
Pulmonary osteoclast-like cells in silica induced pulmonary fibrosis
2024-Jul-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4913
PMID:38985878
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研究论文 | 研究了二氧化硅诱导的肺纤维化机制。 | 首次揭示了二氧化硅如何诱导肺部成骨细胞样细胞的分化及其在肺损伤中的作用。 | 尚不完全了解二氧化硅在其他类型的肺病中的作用。 | 旨在深入理解二氧化硅暴露导致的肺纤维化的机制。 | 使用来自职业暴露于二氧化硅患者的人类肺样本和小鼠模型进行研究。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 来自职业暴露于二氧化硅患者的肺样本及小鼠模型 |
| 316 | 2024-08-04 |
Integrating Mendelian Randomization with Single-cell Sequencing Data Reveals the Causal Effect and Related Mechanisms of Smoking on Parkinson's Disease
2024-Jul-20, Nicotine & tobacco research : official journal of the Society for Research on Nicotine and Tobacco
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/ntr/ntae180
PMID:39030896
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研究论文 | 这项研究探讨了吸烟对帕金森病的因果影响及相关机制 | 结合梅登随机化、转录组学和单细胞测序分析探索吸烟与帕金森病之间的关系 | 缺乏实验证据仅基于观察研究和计算分析 | 探讨吸烟对帕金森病的因果关系及机制 | 帕金森病患者与对照组之间的差异表达基因 | 数字病理学 | 帕金森病 | 梅登随机化，单细胞测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 涉及GSE7621和GSE184950数据集的帕金森病患者与对照组样本 |
| 317 | 2024-08-05 |
Deciphering the impact of aging on splenic endothelial cell heterogeneity and immunosenescence through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul-18, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00452-1
PMID:39026350
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研究论文 | 本研究构建了年轻和老年小鼠脾脏内皮细胞转录组的单细胞RNA图谱 | 揭示了年龄相关的分子变化及内皮细胞与免疫细胞之间的潜在相互作用 | 本研究没有涉及人类脾脏内皮细胞的相关研究 | 探讨衰老对脾脏内皮细胞异质性和免疫衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的脾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共识别了十个内皮细胞簇 |
| 318 | 2024-08-04 |
Cell type mapping of inflammatory muscle diseases highlights selective myofiber vulnerability in inclusion body myositis
2024-Jul, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00645-9
PMID:38834884
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研究论文 | 本研究揭示了与IBM相关的特定肌纤维脆弱性和细胞类型特异性驱动因素 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的结合，识别了IBM与其他肌病的不同病理特征和细胞反应 | 对IBM病理进展的因果因素和分子驱动因素仍然了解不足 | 研究IBM的细胞类型特异性驱动因素及其与其他肌病的比较 | 聚焦于IBM患者肌肉活检样本中的细胞类型和基因表达特征 | 数字病理学 | 老年性肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 生物样本数据 | 来自IBM患者的肌肉活检样本 |
| 319 | 2024-08-05 |
Exercise rejuvenates microglia and reverses T cell accumulation in the aged female mouse brain
2024-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14172
PMID:38747044
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研究论文 | 本研究探讨了运动对衰老女性小鼠大脑微胶质细胞的年轻化及T细胞积累的影响 | 展示了运动对老年微胶质细胞的选择性影响，并重新转变其基因表达特征 | 目前对运动如何具体影响认知的机制仍不明确 | 研究运动如何影响小鼠的脑龄化及相关细胞类型 | 18个月大的女性小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 18个月大的女性小鼠 |
| 320 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis
2024-Jul-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03835-9
PMID:39020442
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研究论文 | 本研究揭示了FKBP5作为面部浸润性脂肪瘤的治疗靶点。 | 首次通过单细胞转录组测序确定了FKBP5在面部浸润性脂肪瘤中的显著过表达。 | 尚未完全理解PIK3CA变异的具体机制。 | 探讨面部浸润性脂肪瘤的发病机制及其潜在治疗靶点。 | 面部浸润性脂肪瘤患者和非患者的面部脂肪组织。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 面部脂肪组织样本来源于FIL患者和非FIL个体 |