单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 524 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptome Landscape and Cell Fate Decoding in Human Brain Organoids after Transplantation
2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402287
PMID:38711218
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研究论文 | 本文探讨了人脑类器官移植后细胞命运的变化 | 研究揭示了移植后人脑类器官的细胞命运与宿主细胞接近的规律 | 未能详细探讨不同大脑区域对细胞命运的影响机制 | 探讨人脑类器官移植后细胞命运变化的机制 | 人类脑类器官及其移植后命运的细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 多个用于比较移植前后及不同大脑区域的样本 |
| 282 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals the potential prognostic roles and immunological values of unc-5 netrin receptor A (UNC5A) in glioma
2024-Jul-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01174-y
PMID:39039366
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研究论文 | 该文章探讨了UNC5A在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 首次综合分析了UNC5A在胶质瘤中的作用，并提出其作为新的预后和免疫标志物的潜力 | 未详细讨论UNC5A在治疗胶质瘤中的具体机制 | 研究UNC5A在胶质瘤中的功能及其与肿瘤免疫的关联 | UNC5A在胶质瘤患者中的表达及其预后意义 | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 大规模RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用了TCGA及CGGA数据集中的胶质瘤患者数据 |
| 283 | 2024-08-05 |
TGF-β1 mediates hypoxia-preconditioned olfactory mucosa mesenchymal stem cells improved neural functional recovery in Parkinson's disease models and patients
2024-Jul-22, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00550-7
PMID:39034405
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研究论文 | 该文章研究了TGF-β1在嗅觉黏膜间充质干细胞改善帕金森病神经功能恢复中的作用 | 首次揭示了TGF-β1在嗅觉黏膜间充质干细胞对神经功能恢复的调节作用及其机制 | 目前的研究主要集中在小鼠模型和初步临床试验，尚缺乏大规模的长期跟踪研究 | 探讨嗅觉黏膜间充质干细胞在帕金森病神经功能恢复中的潜在应用 | 帕金森病模型和患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、高通量测序的可接触染色质转座酶检测 (ATAC-seq) 和全长转录组同工谱测序 (ISO-seq) | NA | NA | 初步患者队列，具体样本量未说明 |
| 284 | 2024-08-04 |
Identification of tumor-specific T cell signature predicting cancer immunotherapy response in bladder cancer by multi-omics analysis and experimental verification
2024-Jul-20, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03447-6
PMID:39033098
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研究论文 | 本文开发了一种基于肿瘤特异性T细胞相关基因的五基因签名，以预测膀胱癌患者对免疫疗法的响应 | 提出了一种新的肿瘤特异性T细胞签名（TstcSig），该签名能够预测膀胱癌免疫疗法的结果 | 目前尚未对TstcSig在其他类型癌症中的预测能力进行广泛验证 | 研究肿瘤特异性T细胞在膀胱癌免疫治疗中的作用及其相关基因 | 膀胱癌患者及其免疫疗法响应的相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 在多个免疫治疗队列中验证，包括TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 |
| 285 | 2024-08-05 |
Determining M2 macrophages content for the anti-tumor effects of metal-organic framework-encapsulated pazopanib nanoparticles in breast cancer
2024-Jul-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02694-z
PMID:39033109
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研究论文 | 该文章探讨了金属有机框架封装的pazopanib纳米粒子在乳腺癌中的抗肿瘤效果。 | 创新点在于开发了一种新型纳米平台以提高pazopanib的抗肿瘤活性，并通过单细胞RNA测序揭示了其在抑制M2型巨噬细胞方面的作用。 | 研究中可能存在对临床适用性的局限性，尚需进一步的临床试验验证。 | 研究旨在提高pazopanib在乳腺癌治疗中的疗效。 | 研究对象包括四种小鼠肿瘤模型和人类乳腺癌MDA-MB-231模型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及小鼠和人类的乳腺癌模型 |
| 286 | 2024-08-05 |
Computing cell state discriminates the aberrant hematopoiesis and activated microenvironment in Myelodysplastic syndrome (MDS) through a single cell genomic study
2024-Jul-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05496-x
PMID:39033303
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组研究系统性描绘了骨髓异常造血、风险异质性和T细胞微环境的变化 | 提出了在MDS研究中使用整个骨髓细胞而非仅CD34+细胞可以提供更全面的信息 | 仅涉及五名MDS患者，样本量较小 | 探索骨髓样本中细胞状态与MDS异常造血和激活微环境之间的关系 | 研究五名MDS患者与四名健康供体的骨髓细胞 | 数字病理学 | 骨髓异常增生综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 五名MDS患者和四名健康供体的整体骨髓细胞 |
| 287 | 2024-08-05 |
Pathological mechanisms and novel drug targets in fibrotic interstitial lung disease
2024-Jul-19, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00345-2
PMID:39026335
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研究论文 | 本研究探讨了纤维性间质性肺病中的病理机制和新药靶点 | 识别出新的病理机制，代表了目前正在临床开发的新药靶点 | 未详细讨论研究方法的局限性 | 阐明肺间质性疾病纤维化进展的病理机制 | 以纤维性间质性肺病患者作为研究对象 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序技术 | NA | NA | NA |
| 288 | 2024-08-05 |
Association of CD8+TILs co-expressing granzyme A and interferon-γ with colon cancer cells in the tumor microenvironment
2024-Jul-19, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12605-y
PMID:39030523
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研究论文 | 本研究探讨了共表达颗粒酶A和干扰素-γ的CD8肿瘤浸润淋巴细胞与结肠癌细胞之间的关系 | 揭示了GZMA和IFN-γ共表达的CD8TILs如何调节GSDMB表达的肿瘤细胞及其在结肠癌免疫微环境中的重要作用 | 结论主要基于临床样本和单细胞RNA测序数据，样本数量及其代表性可能限制了结果的普适性 | 阐明GZMA和IFN-γ共表达CD8TILs与结肠癌细胞的相互作用及其对患者预后的影响 | 结肠癌患者样本中的CD8TILs及其与GSDMB表达细胞的相互作用 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多色免疫组化 (mIHC) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 组织样本 | NA |
| 289 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals the gene expression profile and the critical signaling pathways of type II CPAM
2024-Jul-18, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01276-8
PMID:39026356
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研究论文 | 这项研究通过综合分析大宗和单细胞RNA测序，揭示了II型先天性肺气道畸形（CPAM）的基因表达谱和关键信号通路 | 首次结合大宗RNA-seq和单细胞RNA-seq，深入揭示CPAM的基因表达及细胞间通信网络 | 仅分析了CPAM患者术后的样本，可能未能全面反映疾病的全貌 | 探讨与II型CPAM发病机制相关的基因表达及潜在的治疗靶点 | 以II型CPAM患者的囊性区域和邻近正常组织的样本为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 术后提取的样本来自II型CPAM患者的囊性区域和邻近正常组织 |
| 290 | 2024-08-05 |
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322864121
PMID:38976727
|
研究论文 | 本研究探讨了在伤口诱导下神经元的分化轨迹。 | 揭示了NFY转录因子在再生过程中如何调控神经元功能基因的表达，并揭示了神经分化通路的初始机制 | 研究主要集中在一种特定的高再生性生物上，结果的普遍适用性尚未验证 | 研究伤口诱导的转录调控事件如何导致神经元的产生和功能性大脑的形成 | 主要研究生物为高再生性的无肠虫，分析其在伤口下的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 291 | 2024-08-05 |
Decoding ecosystem heterogeneity and transcriptional regulation characteristics of multi-subtype renal cell carcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33196
PMID:39044973
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研究论文 | 本研究全面分析了肾细胞癌的细胞多样性和细胞间通信网络。 | 通过使用单细胞RNA测序技术，首次揭示了肾细胞癌亚型中特定的巨噬细胞和CAF细胞亚群及其作用状态。 | 研究未涉及所有可能的细胞类型和细胞间交互的全面性。 | 本研究旨在深入理解肾细胞癌的细胞异质性及其调控特征。 | 研究对象为不同亚型的肾细胞癌，重点分析巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的功能状态。 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种肾癌亚型的单细胞RNA测序数据 |
| 292 | 2024-08-04 |
Exploring ABHD5 as a Lipid-Related Biomarker in Idiopathic Pulmonary Fibrosis: Integrating Machine Learning, Bioinformatics, and In Vitro Experiments
2024-Jul-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02107-1
PMID:39046603
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研究论文 | 本研究探讨了ABHD5作为特发性肺纤维化(IPF)的脂质相关生物标志物的潜力 | 通过整合机器学习、生物信息学和体外实验，提出了ABHD5作为IPF新生物标志物的概念 | 研究可能存在样本量不足或特定数据集选择偏倚的问题 | 旨在探索IPF的脂质相关生物标志物及其机制 | 涉及特发性肺纤维化相关的数据集与细胞实验 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 机器学习、单细胞测序，细胞计数试剂盒-8，5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 涉及多个数据集和细胞实验，具体样本数量未提供 |
| 293 | 2024-08-04 |
Key factor screening in mouse NASH model using single-cell sequencing combined with machine learning
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33597
PMID:39040415
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习相结合，识别与非酒精性脂肪肝炎（NASH）进展密切相关的基因 | 结合单细胞RNA测序和深度学习技术，揭示了NASH相关基因与免疫细胞之间的关系 | NA | 识别与NASH进展相关的关键基因 | 小鼠NASH模型中的细胞群体和基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因数据 | 比较Chow组和NASH组的细胞群体数据 |
| 294 | 2024-08-04 |
Mechanisms of regeneration: to what extent do they recapitulate development?
2024-Jul-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202541
PMID:39045847
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回顾 | 该文章探讨了再生生物学中再生与发育的关系及其机制 | 提出了再生是一种更动态和可变的过程，并探讨了其对形态发生的新理解 | 未提及具体的实验数据或样本分析 | 研究再生与发育之间的关系及其背后的生物机制 | 主要集中在不同模型生物的再生机制 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR系统 | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on drug response genes to predict prognosis and therapeutic response in ovarian cancer
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33367
PMID:39040239
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研究论文 | 本研究利用单细胞和大规模RNA测序识别出可预测卵巢癌预后和治疗反应的药物反应基因特征 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，构建了高灵敏度和特异性的预后模型 | 未提及具体样本大小和多样性，可能影响模型的普适性 | 探索卵巢癌的可靠生物标志物，以预测药物反应和指导治疗选择 | 卵巢癌患者和其基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 296 | 2024-08-04 |
Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis
2024-Jul-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae028
PMID:38289873
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研究论文 | 本文通过转录组分析，识别出Itih4作为动脉粥样硬化中特异性的平滑肌细胞基因。 | 首次确定Itih4为与动脉粥样硬化相关的平滑肌细胞特异性基因，并链接其与冠状动脉疾病的关系。 | 研究依赖于特定的转基因小鼠模型，可能限制结果的普适性。 | 探讨平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的基因表达变化。 | 使用SMCTRAP小鼠模型分析动脉粥样硬化相关的平滑肌细胞基因表达。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 转译核糖体亲和纯化测序 | 转基因小鼠 | 组织样本 | 15个月大的SMCTRAP和SMCTRAP-AS小鼠的胸主动脉样本 |
| 297 | 2024-08-04 |
Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction
2024-Jul-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae075
PMID:38666458
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研究论文 | 本研究探讨了SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的调节作用 | 首次揭示了Serpins在调节基质功能和心肌梗死后心脏重塑中的因果关系 | 该研究主要使用小鼠模型，可能在临床应用中存在差异 | 研究Serpins在心肌梗死后瘢痕形成中的作用 | 使用条件性敲除小鼠模型观察SerpinA3n的影响 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基因敲除及蛋白质组学分析 | 条件性敲除小鼠 | 组织样本 | 使用了缺乏SerpinA3n的小鼠模型 |
| 298 | 2024-08-04 |
Exploring the immune landscape and drug prediction of an M2 tumor-associated macrophage-related gene signature in EGFR-negative lung adenocarcinoma
2024-Jul, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15375
PMID:38886907
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研究论文 | 本研究探讨了EGFR阴性肺腺癌中M2肿瘤相关巨噬细胞基因特征的免疫景观和药物预测 | 构建了基于M2-TAM的预后特征，揭示了EGFR阴性肺腺癌的免疫景观，并预测了免疫治疗反应 | 可能缺乏大样本验证，临床适用性需进一步研究 | 改善EGFR阴性肺腺癌患者的免疫治疗效果 | EGFR阴性肺腺癌（LUAD）患者 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA |
| 299 | 2024-08-04 |
PARE: A framework for removal of confounding effects from any distance-based dimension reduction method
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012241
PMID:38985831
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研究论文 | 本研究介绍了一种去除混杂效应的PARE框架，可应用于任何基于距离的降维方法 | PARE框架允许从任何距离基础的降维方法中去除混杂效应，扩展了降维方法的应用 | 暂无明显的限制提及 | 研究目标是开发一种去除混杂效应的框架，以提高生物学模式的可视化 | 研究对象包括基因组和神经影像数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 高维数据 | 涉及单细胞测序数据和神经影像测量的多种样本 |
| 300 | 2024-08-04 |
CAbiNet: joint clustering and visualization of cells and genes for single-cell transcriptomics
2024-Jul-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae480
PMID:38850160
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研究论文 | 该文章介绍了一种用于单细胞转录组学数据的聚类和可视化的新方法 | 提出了基于网络的对应分析双聚类方法CAbiNet，该方法高效地进行细胞及其标记基因的共同聚类和可视化 | 文章未提及具体的限制 | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据的聚类和可视化效果 | 研究对象是单细胞RNA测序数据中的细胞及其标记基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | NA |