单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 505 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Deciphering decidual deficiencies in recurrent spontaneous abortion and the therapeutic potential of mesenchymal stem cells at single-cell resolution
2024-Jul-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03854-6
PMID:39075579
|
研究论文 | 本研究探讨了复发性自发性流产中的蜕膜缺陷及间充质干细胞的治疗潜力。 | 首次在单细胞分辨率下评估WJ-MSCs对复发性自发性流产的治疗作用，并识别了新的细胞亚群。 | 目前对WJ-MSCs在复发性自发性流产中作用机制的理解仍然有限。 | 研究复发性自发性流产的病因及WJ-MSCs作为潜在治疗方法的有效性。 | 以小鼠模型为基础，研究正常妊娠组、复发性自发性流产组和WJ-MSC治疗组的蜕膜组织。 | 数字病理学 | 复发性自发性流产 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 鼠模型 | 蜕膜组织样本 | 包括正常妊娠、小鼠复发性流产和WJ-MSC治疗组的样本 |
| 262 | 2024-08-04 |
Sequencing the transcriptome of single cells: a path to discovering cellular biodiversity
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_532
PMID:39083470
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研究论文 | 这篇文章介绍了单细胞转录组学（scRNA-Seq）技术及其在生物医学、发育生物学和植物生物学中的重要应用 | 该研究展示了通过scRNA-Seq技术发现细胞多样性及其发育过程的新方法 | 本文未提及具体的实验局限性 | 研究单细胞转录组学技术的实验与计算部分 | 涉及组织、类器官、细胞及整个生物体的研究 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 生成的数据分析 | 可以分析数万到百万个细胞 |
| 263 | 2024-08-05 |
Coexpression enhances cross-species integration of single-cell RNA sequencing across diverse plant species
2024-07, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01738-4
PMID:38937637
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研究论文 | 本研究展示了共表达如何增强不同植物物种中单细胞RNA测序的跨物种整合 | 利用共表达减小多对多同源基因家族，从而识别一对一的基因对，提升了传统整合方法的性能 | NA | 探讨通过基因表达和细胞类型组成驱动的跨物种差异 | 不同植物物种中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 264 | 2024-08-05 |
Recessively Inherited Deficiency of Secreted WFDC2 (HE4) Causes Nasal Polyposis and Bronchiectasis
2024-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202308-1370OC
PMID:38626355
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研究论文 | 本研究识别了一种与鼻息肉和支气管扩张症相关的隐性遗传缺陷。 | 该研究首次确认了WAP四硫化物核心结构域2导致支气管扩张症的分子病因。 | 研究样本量较小，仅研究了来自10个家庭的11个个体。 | 识别与严重鼻窦炎、鼻息肉和肺部感染相关的支气管扩张症中的新型基因缺陷。 | 分析来自美国、欧洲、亚洲和非洲的多个独立家庭的个体。 | 数字病理学 | 支气管扩张症 | 下一代测序、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA、RNA、血清样本 | 11个个体，来自10个独立家庭 |
| 265 | 2024-08-05 |
CD34+ synovial fibroblasts exhibit high osteogenic potential in synovial chondromatosis
2024-Jul, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03892-9
PMID:38602543
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研究论文 | 本研究旨在识别在滑膜软骨症中异常分化的祖细胞和可能的致病信号通路 | 识别了滑膜软骨症中CD34+滑膜成纤维细胞的高骨生成潜力及其相关信号通路 | 研究的样本来源于关节置换手术，可能存在样本选择偏差 | 识别滑膜软骨症中的异常分化祖细胞及相关的信号通路 | 来自滑膜软骨症患者的滑膜样本和组织细胞 | 数字病理学 | 滑膜软骨症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 滑膜软骨症患者的样本和来自骨关节炎的对照样本 |
| 266 | 2024-08-05 |
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-Jul-29, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2672-1
PMID:39083201
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研究论文 | 研究揭示了哺乳动物听觉受体中单细胞转录组的拓扑差异 | 首次确定了内毛细胞和外毛细胞的独特分子特征，以及与音调相关的新基因 | 研究主要集中在小鼠模型中，可能不完全适用于人类 | 探索哺乳动物毛细胞的声音频率选择和其分子基础 | 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了不同位置的内外毛细胞样本 |
| 267 | 2024-08-05 |
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae370
PMID:39073828
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法，能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 | 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 | 未提及具体的局限性 | 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释，尤其是检测未知类型 | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 开放集领域适应 | NA | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA |
| 268 | 2024-08-05 |
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0453
PMID:38635899
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研究论文 | 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达，并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 | 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用，并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 | CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 269 | 2024-08-05 |
Vaccine Therapy for Heart Failure Targeting the Inflammatory Cytokine Igfbp7
2024-Jul-30, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文研究了针对炎性细胞因子Igfbp7的疫苗治疗心力衰竭的效果 | 提出了通过疫苗靶向Igfbp7改善老化内皮细胞引起的心脏功能障碍的创新方法 | 研究主要在小鼠模型上进行，临床应用的验证尚未完成 | 探究炎性细胞因子Igfbp7在心力衰竭中的作用及其作为疫苗靶点的可能性 | 研究对象为小鼠模型和心力衰竭患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、毛细管电泳-飞行时间-质谱系统 | AAV9（腺相关病毒血清型9） | 组织样本 | 使用了小鼠模型和心力衰竭患者的组织样本 |
| 270 | 2024-08-04 |
Unveiling heterogeneity and prognostic markers in ductal breast cancer through single-cell RNA-seq
2024-Jul-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03325-1
PMID:39068476
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了导管乳腺癌的细胞异质性及其预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析乳腺癌细胞的异质性，识别CYP24A1和TFPI2作为潜在的预后标志物 | 研究主要依赖生物信息学分析，可能缺乏大规模临床样本验证 | 调查导管乳腺癌细胞的异质性机制及潜在预后标志物 | 导管乳腺癌细胞，特别是Type 1和Type 2导管上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso回归，Cox比例风险回归 | 基因表达数据 | NA |
| 271 | 2024-08-07 |
Developing a simple and rapid method for cell-specific transcriptome analysis through laser microdissection: insights from citrus rind with broader implications
2024-Jul-27, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-024-01242-y
PMID:39068421
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研究论文 | 本文开发了一种简单快速的激光显微切割方法，用于细胞特异性转录组分析，并通过柑橘皮的研究展示了其有效性 | 本文省略了样本固定和防冻剂添加步骤，采用新鲜样本快速冷冻并立即进行冷冻切片，缩短了脱水时间并省略了组织清除步骤，提高了RNA提取的质量和效率 | NA | 开发一种改进的、简单且高效的激光显微切割方法，用于细胞特异性转录组分析 | 柑橘皮组织及其细胞 | 分子生物学 | NA | 激光显微切割、下一代测序 | NA | 转录组数据 | 柑橘皮组织的多个厚度切片 |
| 272 | 2024-08-04 |
Decoding the spatiotemporal heterogeneity of tumor-associated macrophages
2024-Jul-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02064-1
PMID:39068459
|
review | 本综述探讨了肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的空间和时间异质性 | 创新点在于揭示了TAMs的不同亚型、起源及功能，以及其与其他肿瘤微环境成分的复杂相互作用 | 该综述可能未覆盖所有相关研究，且主要基于现有文献，缺乏新的实验数据 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其潜在治疗靶点 | 研究对象为肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，空间多组学 | NA | 文献 | NA |
| 273 | 2024-08-04 |
IRF8 deficiency-induced myeloid-derived suppressor cell promote immune evasion in lung adenocarcinoma
2024-Jul-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05519-7
PMID:39049031
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研究论文 | 该文章探讨了IRF8缺乏如何通过促进骨髓来源抑制细胞（MDSCs）影响肺腺癌的免疫逃逸机制 | 发现IRF8是LUAD骨髓细胞中MDSC分化的重要调节因子，并通过IL6-JAK-STAT3信号通路调节MDSC的分化 | 未提及样本的具体来源及其多样性，可能影响结果的广泛适用性 | 探索肺腺癌患者的肿瘤免疫逃逸机制，以期扩展受益于免疫疗法的患者群体 | 以954个肺腺癌患者的RNA-seq数据和15个单细胞RNA-seq数据为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 954个肺腺癌患者的群体数据和15个单细胞数据 |
| 274 | 2024-08-04 |
Interneuron diversity in the human dorsal striatum
2024-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50414-w
PMID:39039043
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研究论文 | 本文揭示了人类背侧纹状体中抑制神经元的多样性及其转录组特征 | 提出了一个全面的纹状体抑制神经元分类法，包括八个主要类别和十四个子类别 | 文章未提及样本的具体来源限制和潜在的偏倚 | 理解背侧纹状体抑制神经元的多样性及其对基底节电路和相关疾病的影响 | 人类尸检后的尾状核和壳核样本 | 数字病理 | 神经精神疾病 | snRNA-seq 和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 尾状核和壳核的尸检样本 |
| 275 | 2024-08-05 |
sNucConv: A bulk RNA-seq deconvolution method trained on single-nucleus RNA-seq data to estimate cell-type composition of human adipose tissues
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110368
PMID:39071890
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研究论文 | 本研究介绍了sNucConv，一种基于单核RNA测序数据训练的bulk RNA-seq去卷积方法，用于估计人类脂肪组织的细胞类型组成 | sNucConv利用深度学习方法，首次将snRNA-seq数据应用于bulk RNA-seq的去卷积并进行了模型验证 | 研究仅依赖于特定的snRNA-seq样本，可能限制了模型在其他组织类型的普适性 | 开发一种新方法以提高对脂肪组织细胞类型组成的估计精度 | 针对人类的脂肪组织细胞类型进行研究 | 数字病理学 | NA | snRNA-seq, bulk RNA-seq | 深度学习模型 (Scaden) | RNA-seq数据 | 使用了5个hSAT和7个hVAT的snRNA-seq数据进行训练，此外验证中使用了5个hSAT和5个hVAT样本 |
| 276 | 2024-08-04 |
Molecular analysis of human tick-bitten skin yields signatures associated with distinct spatial and temporal trajectories - A proof-of-concept study
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33600
PMID:39071681
|
研究论文 | 本研究揭示了人类被蜱虫叮咬皮肤样本的分子机制，分析了不同时间和空间轨迹的特征 | 该研究首次通过空间转录组学技术分析叮咬后皮肤样本，识别了与时间和个体特异性相关的分子特征 | 样本数量和个体多样性可能限制了研究结果的广泛应用 | 揭示蜱虫叮咬后皮肤的分子机制 | 从同一参与者获得的蜱虫叮咬样本（病例）和对侧皮肤样本（对照） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 同一参与者的蜱虫叮咬和对侧皮肤样本 |
| 277 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing revealed an epigenetic signature predicts prognosis and tumor microenvironment colorectal cancer heterogeneity
2024-Jul-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i7.3032
PMID:39072180
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研究论文 | 本研究建立了一种能够预测结直肠癌预后的表观遗传标记 | 研究中的标记在不同数据集中经过验证，显示出良好的预后预测能力 | 该研究未提到样本的种类和数量的详细信息 | 研究的目标是构建一个稳健的结直肠癌预后标记 | 研究对象为结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 基因组和转录组数据 | 使用了TCGA队列和六个独立数据集 |
| 278 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptomic analysis reveals tumor immune infiltration by NK cells gene signature in lung adenocarcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33928
PMID:39071697
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肺腺癌中NK细胞的肿瘤免疫浸润特征 | 引入了NK基因特征分数（NKGS），用于区分NK1和NK2细胞 | 研究可能受到样本量和数据集的限制 | 了解肺腺癌中NK细胞的多样性特征 | 主要研究肺腺癌中的NK细胞群体 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据 | 多个初级肺癌（MPLC）数据集中的样本 |
| 279 | 2024-08-05 |
Constructing an immune-related prognostic signature for predicting prognosis and immune response in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34012
PMID:39071637
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研究论文 | 本研究旨在建立一个与免疫相关的肝细胞癌预后模型 | 首次在肝细胞癌中建立了一个免疫相关的预后模型 | 研究可能受到样本选择和数据集限制的影响 | 旨在分析肝细胞癌的免疫相关预后 | 研究对象为肝细胞癌患者及其免疫相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | Kaplan-Meier生存曲线，Cox回归分析 | 基因表达数据 | 438名肝细胞癌患者 |
| 280 | 2024-08-05 |
Disease-specific transcriptional programs govern airway goblet cell metaplasia
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34105
PMID:39071568
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性肺部炎症疾病中气道杯状细胞变性相关的转录程序 | 揭示了哮喘、囊性纤维化和慢性阻塞性肺病中杯状细胞变性的相似性和差异性 | 对该领域的分子机制和特征理解仍然有限 | 研究杯状细胞变性在肺疾病中的分子机制 | 人类肺部的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集 |