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当前共找到 493 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-09-06 |
Single-cell decoding of drug induced transcriptomic reprogramming in triple negative breast cancers
2024-Jul-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03318-3
PMID:39026273
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研究论文 | 研究探讨了三阴性乳腺癌中单细胞转录组在药物诱导下的重编程机制 | 首次结合单细胞转录组和基因组拷贝数数据，揭示了药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的克隆响应和转录重编程 | 研究仅限于三阴性乳腺癌，且样本量相对较小 | 探讨药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的转录组重编程机制 | 三阴性乳腺癌细胞的单细胞转录组和基因组拷贝数数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53,641个过滤后的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-09-05 |
Novel AT2 Cell Subpopulations and Diagnostic Biomarkers in IPF: Integrating Machine Learning with Single-Cell Analysis
2024-Jul-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25147754
PMID:39062997
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研究论文 | 本研究通过综合机器学习和单细胞分析技术，探索了特发性肺纤维化（IPF）中肺泡上皮II型细胞（AT2）的亚群及其诊断生物标志物。 | 本研究首次揭示了IPF相关肺泡上皮II型细胞的两个独特亚群（IR_AT2），并通过机器学习算法识别了与这些亚群相关的基因表达模块和特征。 | NA | 旨在发现IPF中AT2细胞的亚群及其分子特征，并探索这些特征在IPF诊断和预后中的应用。 | 特发性肺纤维化（IPF）中的肺泡上皮II型细胞（AT2）及其亚群。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 正常和纤维化肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-09-05 |
FOS+ Macrophages Promote Chronic Rejection of Cardiac Transplantation
2024-Jul, Experimental and clinical transplantation : official journal of the Middle East Society for Organ Transplantation
IF:0.7Q4
DOI:10.6002/ect.2024.0019
PMID:39223812
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研究论文 | 本研究探讨了FOS阳性巨噬细胞在CD40调控下介导心脏移植慢性排斥反应的作用及其机制 | 揭示了CD40通过激活转录因子NF-κB2上调c-Fos和FosB表达，从而促进心脏移植慢性排斥反应的新机制 | NA | 阐明FOS阳性巨噬细胞在CD40调控下介导心脏移植慢性排斥反应的作用及其机制 | 慢性排斥反应中的巨噬细胞及FOS家族成员 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 流式细胞术, 实时定量聚合酶链反应, 蛋白质印迹, 免疫荧光, RNA测序, ChIP测序 | NA | 基因表达数据 | 慢性排斥肾脏移植患者的单细胞测序数据, 慢性排斥小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-09-04 |
DEPDC1 as a metabolic target regulates glycolysis in renal cell carcinoma through AKT/mTOR/HIF1α pathway
2024-Jul-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06913-1
PMID:39068164
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研究论文 | 本研究探讨了DEPDC1作为代谢靶点在肾细胞癌中通过AKT/mTOR/HIF1α途径调控糖酵解的作用 | 发现了DEPDC1在肾细胞癌中的新作用，并证明了其作为TKI联合靶向代谢治疗的潜在靶点 | 研究样本量相对较小，需要进一步的大规模临床研究验证 | 探索肾细胞癌中的代谢调控机制及潜在治疗靶点 | 肾细胞癌及其药物抵抗性 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（RNA-seq）、非靶向代谢组学测序 | NA | RNA序列、蛋白质水平数据 | 14名肾细胞癌患者（包括3份TKI耐药的针刺活检样本）及98份临床组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-09-04 |
Decoding single-cell molecular mechanisms in astrocyte-to-iN reprogramming via Ngn2- and Pax6-mediated direct lineage switching
2024-Jul-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01989-z
PMID:39068473
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研究论文 | 本研究通过Ngn2和Pax6介导的直接谱系转换，探讨了星形胶质细胞向诱导神经元（iN）重编程的单细胞分子机制 | 本研究揭示了星形胶质细胞向诱导神经元重编程的关键基因和通路，为优化重编程过程提供了新的见解 | NA | 阐明星形胶质细胞向诱导神经元重编程的分子动力学 | 星形胶质细胞和诱导神经元 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用10×Genomics平台进行了单细胞RNA测序，涉及的细胞数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-09-04 |
CHAI: consensus clustering through similarity matrix integration for cell-type identification
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae411
PMID:39207729
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研究论文 | 本文介绍了CHAI方法，通过集成相似性矩阵的共识聚类技术来识别单细胞RNA测序数据的细胞类型 | CHAI方法集成了七种最先进的聚类方法，并展示了在多个基准数据集上的优越性能 | NA | 解决在单细胞RNA测序数据中选择最佳聚类方法的问题 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA测序数据 | 多个基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-09-04 |
Systemic and skin-limited delayed-type drug hypersensitivity reactions associate with distinct resident and recruited T cell subsets
2024-Jul-23, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178253
PMID:39042477
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研究论文 | 本研究利用先进技术探讨了不同类型的药物过敏反应中皮肤驻留记忆T细胞（TRMs）和招募T细胞亚群的起源、表型和功能 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和细胞内转录组和表位的测序（CITE-Seq）以及T细胞受体测序（TCR-Seq），揭示了系统性和皮肤局限性药物过敏反应中T细胞亚群的差异 | NA | 探究不同严重程度的药物过敏反应中致病性T细胞的起源、表型和功能 | 皮肤驻留记忆T细胞（TRMs）和招募T细胞亚群 | 免疫学 | 药物过敏反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），细胞内转录组和表位的测序（CITE-Seq），T细胞受体测序（TCR-Seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-09-04 |
Disease-specific T cell receptors maintain pathogenic T helper cell responses in postinfectious Lyme arthritis
2024-Jul-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179391
PMID:38963700
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、高通量T细胞受体（TCR）测序和单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析了来自欧洲抗生素耐药性莱姆关节炎（ARLA）患者关节中的CD4+ Th细胞，旨在揭示疾病特异性Th细胞的分子程序。 | 研究发现了在ARLA患者中特异性的TCR-β基序，并将其与特定的HLA-DRB1*11或*13等位基因相关联，这些等位基因在欧洲患者中更为常见，为ARLA的诊断提供了新的生物标志物。 | 研究主要集中在欧洲患者群体，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于其他地区或不同遗传背景的患者。 | 阐明抗生素耐药性莱姆关节炎中疾病特异性Th细胞的分子机制。 | 来自欧洲ARLA患者关节中的CD4+ Th细胞。 | 免疫学 | 莱姆关节炎 | 流式细胞术、高通量T细胞受体（TCR）测序、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | T细胞受体（TCR）序列、RNA序列 | 来自欧洲ARLA患者的关节样本 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-09-04 |
DIS3 ribonuclease is essential for spermatogenesis and male fertility in mice
2024-Jul-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202579
PMID:38953252
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研究论文 | 本文研究了RNA外泌体相关DIS3核糖核酸酶在维持精子发生和雄性生育力中的关键作用 | 首次揭示了DIS3核糖核酸酶在精子发生中的关键作用，特别是在维持精子干细胞稳态和促进生殖细胞分化方面 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人类研究来验证这些发现 | 探讨DIS3核糖核酸酶在精子发生和雄性生育力中的作用 | 精子干细胞和生殖细胞 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 建立了雄性生殖细胞Dis3条件性敲除小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-09-02 |
Single-Cell RNA-seq Analysis Reveals a Positive Correlation between Ferroptosis and Beta-Cell Dedifferentiation in Type 2 Diabetes
2024-Jul-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12081687
PMID:39200152
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了铁死亡与2型糖尿病中β细胞去分化之间的潜在关联 | 首次揭示了铁死亡在2型糖尿病β细胞去分化过程中的作用，并识别了关键的转录因子和长非编码RNA | 研究仅基于公共数据集，未进行体内实验验证所有发现 | 探究铁死亡在2型糖尿病β细胞去分化中的作用 | 2型糖尿病患者的β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-09-02 |
Identifying cell states in single-cell RNA-seq data at statistically maximal resolution
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012224
PMID:38995959
|
研究论文 | 本文提出了一种新的方法Cellstates，用于在单细胞RNA测序数据中以统计上最大分辨率识别细胞状态 | Cellstates工具直接操作原始数据，自动确定最佳分区和聚类数量，无需可调参数，并且能够从第一原理推导出唯一解 | NA | 旨在解决在单细胞RNA测序数据中准确识别不同基因表达状态的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-08-31 |
Multiomics unveils extracellular vesicle-driven mechanisms of endothelial communication in human carotid atherosclerosis
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.21.599781
PMID:38979218
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研究论文 | 本文研究了外周血管疾病中的细胞间通信机制，特别是通过外泌体在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次综合分析了外泌体在颈动脉粥样硬化中的多组学特征，揭示了其在疾病进展中的复杂通信网络和功能影响 | 研究样本量相对较小，且仅限于颈动脉粥样硬化的特定阶段 | 探讨外泌体在颈动脉粥样硬化中的细胞间通信机制及其对疾病进展的影响 | 颈动脉粥样硬化患者的外泌体及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 全转录组miRNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | RNA测序数据和蛋白质组学数据 | 症状性患者16例，无症状患者13例 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-31 |
Negative selection allows human primary fibroblasts to tolerate high somatic mutation loads induced by N-ethyl-N-nitrosourea
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.07.588286
PMID:38617356
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研究论文 | 本文研究了人类原代成纤维细胞在N-乙基-N-亚硝基脲（ENU）诱导的高体细胞突变负荷下的耐受性 | 首次揭示了单个细胞能够承受约60,000个单核苷酸变异（SNVs）而仅轻微影响生长速率，并证明了这种高突变水平仅通过基因编码区域和维持基本细胞功能及生长的遗传途径中的负选择来耐受 | 研究仅限于人类原代成纤维细胞，未涉及其他组织类型 | 探讨细胞在衰老过程中积累的突变负荷对功能的影响 | 人类原代成纤维细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 多个低剂量ENU处理的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-08-29 |
Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Jul-31, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01263-1
PMID:39085925
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，比较了薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的细胞异常情况 | 首次系统地研究了薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的分子特征、细胞相互作用和结构变化 | 需要进一步的研究来验证这些发现并将其转化为临床应用 | 阐明薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的差异 | 反复植入失败患者和生育能力正常个体的子宫内膜 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | TE-RIF组3人，NE-RIF组2人，对照组3人 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-29 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Dysregulated POSTN+WNT5A+ Fibroblast Subclusters in Prurigo Nodularis
2024-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.021
PMID:38246584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了28,695个病灶和非病灶性痒疹结节（PN）细胞，揭示了PN中失调的POSTN+WNT5A+成纤维细胞亚群 | 首次揭示了PN中POSTN+WNT5A+成纤维细胞亚群的失调，并发现其与癌症相关成纤维细胞的关联 | NA | 探究痒疹结节（PN）的发病机制 | 痒疹结节（PN）中的成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,695个病灶和非病灶性PN细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-08-28 |
CD28-expressing δ T cells are increased in perivascular adipose tissue of hypertensive mice and in subcutaneous adipose tissue of obese humans
2024-Jul-01, Journal of hypertension
IF:3.3Q1
DOI:10.1097/HJH.0000000000003725
PMID:38704218
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研究论文 | 本研究探讨了高血压小鼠的肠系膜动脉周围脂肪组织（MV/PVAT）和肥胖人类皮下脂肪组织（SAT）中表达CD28的δ T细胞的增加情况。 | 首次揭示了在高血压小鼠和肥胖人类中，CD28高表达的δ T效应记忆细胞的增加，并提出了这些细胞可能在肥胖相关高血压中具有致病作用。 | 研究仅限于小鼠模型和人类样本，可能需要更多种类的样本和更广泛的人群来验证结果。 | 验证高血压小鼠和肥胖人类中γδ T细胞亚型的相似性，并探讨这些细胞在高血压发展中的作用。 | 高血压小鼠的肠系膜动脉周围脂肪组织和肥胖人类的皮下脂肪组织中的γδ T细胞。 | 免疫学 | 高血压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠实验包括高血压小鼠的MV/PVAT T细胞；人类实验包括三名瘦女性和三名肥胖女性的SAT CD45+细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-25 |
Single-cell transcriptome analysis revealed heterogeneity in glycolysis and identified IGF2 as a therapeutic target for ovarian cancer subtypes
2024-Jul-31, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12688-7
PMID:39085784
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了卵巢癌中糖酵解的异质性，并确定IGF2为治疗卵巢癌亚型的潜在靶点 | 开发了基于糖酵解评分的新型卵巢癌亚型，并建立了稳定的预后模型 | NA | 探索卵巢癌的分子机制和个性化治疗途径 | 卵巢癌及其亚型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 85种机器学习组合 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-23 |
Human post-implantation blastocyst-like characteristics of Muse cells isolated from human umbilical cord
2024-Jul-11, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05339-4
PMID:38992309
|
研究论文 | 本文研究了从人脐带中分离出的Muse细胞，这些细胞表现出类似人类植入后囊胚的特征 | 首次发现人脐带中的SSEA-3阳性细胞具有类似植入后囊胚的特性，并且表达与成人组织Muse细胞不同的基因和DNA甲基化模式 | NA | 探讨人脐带中Muse细胞的特性及其在人类早期发育和生殖医学中的潜在应用 | 人脐带中的SSEA-3阳性Muse细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约20%的人脐带SSEA-3阳性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-08-21 |
Mining alternative splicing patterns in scRNA-seq data using scASfind
2024-Jul-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03323-6
PMID:39075577
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scASfind的新型计算方法，用于使用全长scRNA-seq数据进行细胞类型特异性剪接事件的定量分析 | scASfind利用高效的数据结构存储每个剪接事件的剪接入百分比值，使得能够全面搜索所有差异剪接事件中的模式 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在scRNA-seq数据中定量分析细胞类型特异性的剪接事件 | scRNA-seq数据中的替代剪接模式 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-21 |
Spatial multimodal analysis of transcriptomes and metabolomes in tissues
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01937-y
PMID:37667091
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研究论文 | 本文介绍了一种结合组织学、质谱成像和空间转录组学的空间多组学方法，用于在组织区域中精确测量mRNA转录物和小分子代谢物 | 该方法兼容市售的Visium玻璃载玻片，并展示了在多巴胺和帕金森病背景下对小鼠和人类脑样本的应用潜力 | NA | 开发一种新的空间多组学方法，以提高对组织中转录物和代谢物的测量精度 | 小鼠和人类脑样本，特别是在多巴胺和帕金森病的背景下 | 数字病理学 | 帕金森病 | 质谱成像 | NA | 图像 | 小鼠和人类脑样本 | NA | NA | NA | NA |