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当前共找到 495 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-21 |
Mining alternative splicing patterns in scRNA-seq data using scASfind
2024-Jul-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03323-6
PMID:39075577
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scASfind的新型计算方法，用于使用全长scRNA-seq数据进行细胞类型特异性剪接事件的定量分析 | scASfind利用高效的数据结构存储每个剪接事件的剪接入百分比值，使得能够全面搜索所有差异剪接事件中的模式 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在scRNA-seq数据中定量分析细胞类型特异性的剪接事件 | scRNA-seq数据中的替代剪接模式 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-21 |
Spatial multimodal analysis of transcriptomes and metabolomes in tissues
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01937-y
PMID:37667091
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研究论文 | 本文介绍了一种结合组织学、质谱成像和空间转录组学的空间多组学方法，用于在组织区域中精确测量mRNA转录物和小分子代谢物 | 该方法兼容市售的Visium玻璃载玻片，并展示了在多巴胺和帕金森病背景下对小鼠和人类脑样本的应用潜力 | NA | 开发一种新的空间多组学方法，以提高对组织中转录物和代谢物的测量精度 | 小鼠和人类脑样本，特别是在多巴胺和帕金森病的背景下 | 数字病理学 | 帕金森病 | 质谱成像 | NA | 图像 | 小鼠和人类脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-21 |
An increment of diversity method for cell state trajectory inference of time-series scRNA-seq data
2024-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.01.020
PMID:39156571
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research paper | 本文提出了一种基于多样性增量法的细胞状态轨迹推断方法IDTI，用于时间序列单细胞RNA测序数据 | IDTI方法结合了时间序列信息和最小多样性增量法，能够准确构建细胞状态轨迹，无需起始细胞 | NA | 推断时间序列单细胞RNA测序数据的发育轨迹 | 时间序列单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | 时间序列数据 | 模拟数据和三种真实多样组织发育数据 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-08-16 |
CD58 Alterations Govern Antitumor Immune Responses by Inducing PDL1 and IDO in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2874
PMID:38635903
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研究论文 | 本研究通过多种测序技术分析CD58在弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的基因特征，发现CD58的遗传改变与治疗反应和生存率降低相关，并揭示了CD58通过调控PDL1和IDO表达影响肿瘤免疫逃逸的机制。 | 首次全面分析了CD58在DLBCL中的基因特征及其对免疫反应的影响，揭示了CD58通过激活LYN/CD22/SHP1轴抑制JAK2/STAT1通路，从而调控PDL1和IDO表达的新机制。 | 研究主要集中在基因和分子层面，未涉及临床试验验证CD58相关治疗策略的有效性。 | 探究CD58在弥漫大B细胞淋巴瘤中的作用及其对免疫反应的影响，为改善患者治疗提供潜在靶点和策略。 | 弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者中的CD58基因及其表达。 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 下一代测序（NGS）、RNA测序（RNA-seq）、全外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 所有入组的DLBCL患者 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-15 |
Single-Cell and Spatial Transcriptome Profiling Identifies the Transcription Factor BHLHE40 as a Driver of EMT in Metastatic Colorectal Cancer
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3264
PMID:38657117
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组测序技术，揭示了BHLHE40转录因子在结直肠癌转移中的作用，特别是在上皮间质转化（EMT）过程中的作用 | 首次通过单细胞和空间转录组测序技术，结合细胞间通讯分析，识别出BHLHE40作为驱动结直肠癌EMT的关键转录因子 | NA | 阐明驱动结直肠癌上皮间质转化（EMT）的细胞机制 | 结直肠癌患者的非转移性和转移性原发性肿瘤 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | RNA序列 | 22个样本，包括11个非转移性原发性肿瘤和11个转移性原发性肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-14 |
Novel insights into paclitaxel's role on tumor-associated macrophages in enhancing PD-1 blockade in breast cancer treatment
2024-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008864
PMID:39009452
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研究论文 | 本研究探讨了紫杉醇（PTX）在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗中通过激活肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的TLR4信号通路，增强PD-1阻断剂效果的机制 | 发现紫杉醇通过激活TAMs中的TLR4信号通路，增强其抗原呈递能力，从而提升CD8+ T细胞的抗肿瘤反应 | NA | 探究紫杉醇与PD-1阻断剂联合治疗三阴性乳腺癌的机制 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自三阴性乳腺癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-08-14 |
Investigation into the role of H2-Ab1 in vascular remodeling in pulmonary arterial hypertension via Bioinformatics
2024-Jul-15, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-024-03156-w
PMID:39010027
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探讨H2-Ab1在肺动脉高压血管重塑中的作用 | 通过WGCNA和差异分析筛选出与肺动脉高压相关的关键基因H2-Ab1，并验证其在肺动脉高压发展中的作用 | NA | 探索肺动脉高压的生物标志物，以增进对该疾病的理解 | H2-Ab1基因在肺动脉高压中的作用 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | WGCNA, 差异分析, qRT-PCR, Western Blot | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 使用GSE49114, GSE180169, GSE154959数据集，涉及906个关键模块基因和576个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-08-13 |
Advancements in Research and Treatment Applications of Patient-Derived Tumor Organoids in Colorectal Cancer
2024-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152671
PMID:39123399
|
综述 | 本文综述了患者来源的肿瘤类器官（PDTOs）在结直肠癌（CRC）治疗中的应用，作为一种新型的药物抗性筛选工具 | PDTOs能够重现肿瘤的结构、细胞异质性和基因组景观，是一种有价值的体外预测药物筛选工具 | NA | 探讨PDTOs在预测结直肠癌治疗反应、药物抗性和生物标志物识别方面的潜力 | 结直肠癌及其治疗中的药物抗性问题 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 类器官 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-08-13 |
Decoding Clonal Hematopoiesis: Emerging Themes and Novel Mechanistic Insights
2024-Jul-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152634
PMID:39123361
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综述 | 本文综述了克隆性造血（CH）的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 揭示了CH在老年人群中的普遍性及早期启动的可能性，并探讨了环境因素通过异常炎症促进克隆扩增和疾病进展的机制 | 克隆性造血现象的许多方面仍待阐明，精确机制、特定环境下的驱动因素及克隆扩增途径尚未完全建立 | 探讨克隆性造血的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 克隆性造血及其相关疾病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-08-13 |
VNN2-expressing circulating monocytes exhibit unique functional characteristics and are decreased in patients with primary Sjögren's syndrome
2024-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103275
PMID:38936146
|
研究论文 | 本研究旨在阐明外周血单核细胞中VNN2表达的意义及其在原发性干燥综合征（pSS）中的临床相关性 | 研究首次发现VNN2在单核细胞中的高表达，并探讨了其在pSS中的潜在作用和诊断价值 | 研究主要基于单细胞RNA测序和流式细胞术，未涉及VNN2功能的具体机制研究 | 阐明VNN2在原发性干燥综合征中的临床意义 | 外周血单核细胞中的VNN2表达 | NA | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-08-12 |
A comparison of scRNA-seq annotation methods based on experimentally labeled immune cell subtype dataset
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae392
PMID:39120646
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研究论文 | 本研究构建了一个实验标记的免疫细胞亚型单细胞数据集，并系统评估了18种细胞注释方法 | 首次使用实验标记的免疫细胞亚型数据集来评估细胞注释方法，揭示了无监督聚类方法的不足，并为监督方法提供了新的数据集支持 | 无监督聚类方法无法完全拟合实际的细胞类型分布 | 评估和比较不同细胞注释方法在单细胞数据分析中的效果 | 免疫细胞亚型单细胞数据集和18种细胞注释方法 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | SVM, scBERT, scDeepSort, Seurat | 单细胞数据 | 同一批次实验标记的免疫细胞亚型单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-08-11 |
Integration of miRNA in exosomes and single-cell RNA-seq profiles in endemic osteoarthritis, Kashin-Beck disease
2024 Jul-Aug, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2033
PMID:38156801
|
研究论文 | 研究整合了外泌体中的miRNA和单细胞RNA测序数据，以探索卡欣-贝克病（KBD）中软骨细胞的功能和潜在的诊断与治疗方法 | 首次综合分析了KBD患者血清和软骨细胞来源的外泌体miRNA与单细胞RNA测序数据，揭示了外泌体miRNA可能在通过细胞间通讯调节不同KBD软骨细胞群基因表达中的潜在作用 | NA | 探索卡欣-贝克病中软骨细胞的功能和潜在的诊断与治疗方法 | 卡欣-贝克病（KBD）中的软骨细胞及其外泌体miRNA | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 血清来源的外泌体中鉴定出20个差异表达miRNA，软骨细胞来源的外泌体中鉴定出53个差异表达miRNA，以及16,063和57,316个预测目标基因 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-11 |
A rule-based multiscale model of hepatic stellate cell plasticity: Critical role of the inactivation loop in fibrosis progression
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011858
PMID:39074160
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于规则的多尺度模型，用于研究肝星状细胞在纤维化进展和逆转过程中的动态变化 | 首次在模型中考虑了肝星状细胞表型的异质性，并使用Kappa图形重写语言来克服时间爆炸问题 | 模型主要基于实验数据和理论假设，需要进一步的实验验证 | 研究肝星状细胞在慢性肝病中纤维化进展和逆转的动态变化 | 肝星状细胞及其在纤维化过程中的作用 | NA | 慢性肝病 | Kappa图形重写语言 | 基于规则的模型 | 单细胞RNA测序数据 | 使用CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型和非酒精性脂肪性肝炎患者的RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-08-10 |
Integrative and comprehensive pan-cancer analysis of ubiquitin specific peptidase 11 (USP11) as a prognostic and immunological biomarker
2024-Jul-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34523
PMID:39114046
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研究论文 | 本文通过综合分析多个来源的数据，评估了泛癌研究中作为预后和免疫生物标志物的重要性 | 首次全面评估了在不同癌症类型中的表达及其对生存结果的预测作用 | NA | 研究作为泛癌研究中的预后和免疫生物标志物的作用 | 在不同癌症类型中的表达及其对生存结果的影响 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 包括五个免疫治疗队列，三十三个TCGA队列，十六个GEO队列，其中两个涉及单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-10 |
Targeting CD73 limits tumor progression and enhances anti-tumor activity of anti-PD-1 therapy in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Jul-13, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05869-1
PMID:39002018
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研究论文 | 本研究旨在探讨免疫检查点阻断疗法（ICBs）在肝内胆管癌（iCCA）中疗效不佳的潜在机制，并探索基于ICB的合理联合治疗方案 | 发现CD73抑制剂AB680能限制肿瘤进展并增强GC化疗或抗PD-1治疗的疗效，同时有效引发抗肿瘤免疫反应 | NA | 解析免疫检查点阻断疗法在肝内胆管癌中疗效不佳的潜在机制，并探索有效的联合治疗方案 | 肝内胆管癌（iCCA）患者及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序、Western blot、时间飞行质谱（CyTOF） | NA | 基因表达数据、蛋白质信号通路数据、免疫细胞功能数据 | 使用GSE151530数据集进行分析，构建了皮下肿瘤异种移植模型和自发性的AKT/NICD诱导的鼠iCCA模型 | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-08-10 |
Deletion of the Mitochondrial Membrane Protein Fam210b Is Associated with the Development of Systemic Lupus Erythematosus
2024-Jul-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25137253
PMID:39000360
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9方法构建Fam210b基因敲除小鼠，探讨Fam210b在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用 | 首次实验证明Fam210b基因敲除与SLE发病机制的相关性，并揭示了通过ROS过量产生引发SLE的可能性 | NA | 验证Fam210b在SLE中的作用及其可能的分子机制 | Fam210b基因敲除小鼠及其在SLE中的表现 | NA | 系统性红斑狼疮 | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞测序数据 | Fam210b基因敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic insights into chemotherapy-induced remodeling of the osteosarcoma tumor microenvironment
2024-Jul-20, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05787-2
PMID:39033089
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了化疗前后骨肉瘤患者的肿瘤样本，揭示了化疗对肿瘤微环境的复杂影响 | 研究发现化疗导致骨肉瘤细胞表达更多与干细胞相关的基因，并增强了癌症相关成纤维细胞的能力，同时增加了内皮细胞的数量但降低了其分化能力 | NA | 深入了解化疗如何重塑骨肉瘤的局部环境，以推进骨肉瘤治疗方案的发展 | 骨肉瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 化疗前后收集的骨肉瘤患者肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-09 |
Therapeutic potential of the secreted Kazal-type serine protease inhibitor SPINK4 in colitis
2024-Jul-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50048-y
PMID:38997284
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了炎症性肠病早期黏膜损伤与杯状细胞（GC）耗竭的关系，发现Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂SPINK4在结肠炎肠道中的动态调节与疾病活动平行，并探讨了其在结肠炎治疗中的潜在治疗作用。 | 发现SPINK4在结肠炎中的动态调节，并证实其与现有TNF-α抑制剂infliximab在治疗结肠炎中的协同作用，以及通过Kazal样基序调节EGFR-Wnt/β-catenin和Hippo通路促进GC分化。 | NA | 探讨SPINK4在炎症性肠病中的作用及其作为治疗和诊断标志物的潜力。 | SPINK4在结肠炎中的调节及其治疗潜力。 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞测序 | NA | NA | Spink4条件性敲除小鼠及健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-08-08 |
Identifying MSMO1, ELOVL6, AACS, and CERS2 related to lipid metabolism as biomarkers of Parkinson's disease
2024-07-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68585-3
PMID:39080336
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习方法，识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 首次将MSMO1, ELOVL6, AACS, 和CERS2作为与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物进行研究。 | NA | 旨在识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 帕金森病患者中的脂质代谢相关基因。 | 生物信息学 | 帕金森病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, qRT-PCR | 反向传播神经网络 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-08 |
Sustained generation of neurons destined for neocortex with oxidative metabolic upregulation upon filamin abrogation
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110199
PMID:38989458
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研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中通过抑制Flna和Flnb基因，成年V-SVZ区域是否能持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | 首次展示了成年V-SVZ区域通过上调氧化磷酸化、线粒体生物合成和血管丰富度，能够持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | NA | 探讨成年V-SVZ区域是否具有产生大脑皮层神经元的能力 | 小鼠模型中的V-SVZ区域 | 神经科学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |