单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 524 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-05 |
Unveiling the Potential of Migrasomes: A Machine-Learning-Driven Signature for Diagnosing Acute Myocardial Infarction
2024-Jul-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12071626
PMID:39062199
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研究论文 | 本文揭示了迁移体在急性心肌梗死诊断中的潜在作用。 | 本研究采用机器学习框架建立了迁移体相关的预测标志，并揭示了其在急性心肌梗死中的生物机制。 | 目前关于迁移体在急性心肌梗死中的诊断意义仍需进一步探索。 | 本研究旨在探讨迁移体在急性心肌梗死中的诊断价值和生物机制。 | 急性心肌梗死（AMI）相关的迁移体及其基因表达。 | 机器学习 | 心血管疾病 | 机器学习, 单细胞RNA测序 | Stepglm, Lasso | 基因表达数据 | 五个独立的AMI队列共113个机器学习组合 |
| 242 | 2024-08-04 |
FGF Signaling Regulates Development of the Anterior Fontanelle
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.14.603452
PMID:39071418
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研究论文 | 本研究探讨了FGF信号如何调控前囟的发育. | 揭示了FGF-WNT信号回路在前囟发育中的区域差异及其与缝合关节形成的关系. | 尚未探讨FGF信号对其他类型缝合的影响. | 研究FGF信号在出生后前囟闭合及其转变为额缝合中的作用. | 使用小鼠基因组学和单细胞转录组学重点分析前囟的细胞. | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠 |
| 243 | 2024-08-04 |
Characterization of Multicellular Niches Supporting Hematopoietic Stem Cells Within Distinct Zones
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601225
PMID:39071430
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研究论文 | 本研究调查了胎肝中的造血干细胞微环境，揭示了两种不同的细胞生态位 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了造血干细胞的多细胞生态位，改变了以往单细胞模型的理解 | 该研究主要集中在胎肝领域，可能不完全适用于其他环境或成人生理状态 | 研究造血干细胞在不同微环境中的调节机制 | 胎肝和成人骨髓中的造血干细胞及其支持微环境 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 胎肝与成人骨髓中的多种细胞成分 |
| 244 | 2024-08-05 |
Controlled Noise: Evidence of epigenetic regulation of Single-Cell expression variability
2024-Jul-17, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae457
PMID:39018178
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研究论文 | 本文研究了染色质可及性与单细胞表达变异性的关系 | 提出了一种创新性测试流程用于检测染色质可及性与单细胞表达变异性之间的关联 | 未提及具体的适用模型或其他细胞类型的验证 | 探讨染色质可及性如何影响单细胞表达的变异性 | 人类造血干细胞与前体细胞的单细胞多组学数据 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq 和 scRNA-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 配对的 scATAC-seq 和 scRNA-seq 数据 |
| 245 | 2024-08-04 |
A second wave of Notch signaling diversifies the intestinal secretory lineage
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603542
PMID:39071399
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研究论文 | 本文研究了小肠特定分泌细胞的命运指定及其与Notch信号的关系 | 揭示了一种稀有分泌细胞类型CHEs是如何通过第二波Notch信号通路来区分其他分泌细胞类型的 | 未提及具体的临床样本或在人类以外的动物模型中的测试 | 探讨小肠分泌细胞的起源及其功能 | 主要研究CHEs这一稀有的肠道上皮细胞群体 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用来自大鼠小肠空肠的单细胞样本进行分析 |
| 246 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics and Single-Nucleus Multi-omics Analysis Revealing the Impact of High Maternal Folic Acid Supplementation on Offspring Brain Development
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603269
PMID:39071367
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研究论文 | 研究母体高叶酸补充对后代大脑发育的影响 | 首次揭示高母体叶酸补充对与神经发生和记忆相关的基因途径的影响 | 研究仅使用了小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 探讨孕期高叶酸补充对后代大脑发育的影响 | 小鼠模型及其后代 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和单核多组学分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 247 | 2024-08-05 |
Ongoing genome doubling promotes evolvability and immune dysregulation in ovarian cancer
2024-Jul-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.11.602772
PMID:39071261
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研究论文 | 本研究展示了全基因组加倍（WGD）在卵巢癌肿瘤进化中的持续突变过程 | 通过单细胞全基因组测序，首次揭示了WGD如何促进细胞多样性和免疫损伤 | 本研究仅分析了65个高等级浆液性卵巢癌样本，可能存在样本代表性不足的问题 | 研究WGD在卵巢癌肿瘤进化中的作用及其对免疫系统的影响 | 65个来自40名患者的高等级浆液性卵巢癌组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组，RNA测序 | 65个样本 |
| 248 | 2024-08-05 |
The correlation between TRIM28 expression and immune checkpoints in CRPC
2024-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400061RR
PMID:38958986
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研究论文 | 本研究探讨了TRIM28在去势耐药前列腺癌中的作用及其分子机制 | 首次揭示TRIM28在去势耐药前列腺癌中的抗肿瘤免疫作用及其通过cGAS-STING信号通路的潜在调控机制 | NA | 阐明TRIM28在去势耐药前列腺癌中的免疫调控作用 | 去势耐药前列腺癌中的TRIM28表达及其与免疫检查点的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 高通量单细胞转录组测序 | TRIM28敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 249 | 2024-08-04 |
Elucidating the Transcriptional States of Spermatogenesis-Joint Analysis of Germline and Supporting Cell, Mice and Human, Normal and Perturbed, Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2024-Jul-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070840
PMID:39062554
|
review | 这篇综述文章旨在综合分析精子发生的分子基础，探讨健康与病态状态下的差异 | 通过单细胞RNA测序等先进技术，发现了小鼠精子发育的新阶段及其调控因子 | 主要依赖已知的标记以及缺乏对某些关键基因的深入研究 | 更好地理解精子发生的基本生物过程，并识别可能导致男性不育的新基因 | 小鼠和人类的生殖细胞及支持细胞 | 数字病理学 | 男性不育 | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 小鼠和人类样本的结合，具体数量未提供 |
| 250 | 2024-08-04 |
GZMK+CD8+ T cells Target A Specific Acinar Cell Type in Sjögren's Disease
2024-Jul-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3601404/v2
PMID:38196575
|
研究论文 | 该文章探讨了干燥综合症中GZMK+CD8+ T细胞如何针对特定的腺泡细胞类型 | 识别出新的浆液黏液腺泡细胞类型及其在干燥综合症中的特定靶向 | 未提供干燥综合症患者细胞治疗的有效方案 | 研究干燥综合症的腺体细胞景观及其变化 | 分析健康与干燥综合症患者的人体小唾液腺 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 251 | 2024-08-05 |
Targeting Microglia in Alzheimer's Disease: Pathogenesis and Potential Therapeutic Strategies
2024-Jul-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070833
PMID:39062547
|
研究论文 | 本研究探讨了小胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用及潜在治疗策略 | 揭示了小胶质细胞表型在阿尔茨海默病进展过程中的动态变化，并提出针对小胶质细胞的新治疗方法 | 本文未详细探讨各治疗策略的具体临床效果与应用 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病中的角色并探索治疗方法 | 小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 生物样本数据 | NA |
| 252 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics by clinical course of Mycobacterium avium complex pulmonary disease
2024-07-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66523-x
PMID:38977917
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Mycobacterium avium complex肺病（MAC-PD）患者的免疫特征 | 首次揭示了不同临床病程的MAC-PD患者外周血单核细胞的免疫特征差异 | 样本数量较小，仅限于21例患者，可能影响结果的普遍性 | 研究MAC-PD患者的免疫特征与临床病程之间的关系 | 21名不同临床病程的MAC-PD患者 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 21例MAC-PD患者 |
| 253 | 2024-08-05 |
Exploring the Role of Neutrophil-Related Genes in Osteosarcoma via an Integrative Analysis of Single-Cell and Bulk Transcriptome
2024-Jul-08, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12071513
PMID:39062086
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞相关基因在骨肉瘤中的作用及其与预后和肿瘤微环境的关系 | 提出了一种新的NRG评分和NRG特征，能够评估骨肉瘤患者的预后 | 研究尚未深入探讨NRGs在不同骨肉瘤患者中的具体功能机制 | 研究中性粒细胞相关基因在骨肉瘤中的预后价值及其与肿瘤微环境的关联 | 骨肉瘤患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含来自TARGET-OS和GEO数据库的多个样本 |
| 254 | 2024-08-05 |
Scanpro is a tool for robust proportion analysis of single-cell resolution data
2024-07-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66381-7
PMID:38971877
|
研究论文 | 本文介绍了Scanpro，一个用于单细胞分辨率数据的稳健比例分析工具 | 提出了一种新的工具Scanpro，用于在Python环境中进行单细胞数据的比例分析 | 当前缺乏对重复和不重复单细胞数据集进行稳健比例分析的生物信息学工具 | 研究高等生物体中个体细胞对信号的应答及其在不同生物条件下细胞类型比例的变化 | 主要研究单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据集中的细胞类型比例 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | NA |
| 255 | 2024-08-04 |
CrossMP: Enabling Cross-Modality Translation between Single-Cell RNA-Seq and Single-Cell ATAC-Seq through Web-Based Portal
2024-Jul-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070882
PMID:39062661
|
研究论文 | 本研究提出了一个模型，以实现单细胞RNA测序和单细胞表观基因组的跨模态预测 | 提出了一个基于深度神经网络的模型，能够从源模态学习潜在表示并预测目标模态 | 生成多模态数据技术挑战大且成本高，导致单细胞共检测数据的可用性有限 | 探索如何在单细胞层面同时分析多种组学模态 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序的数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | 深度神经网络 | 多模态数据 | 跨多个配对的人类scATAC-seq和scRNA-seq数据集 |
| 256 | 2024-08-05 |
CD163+ Macrophages Induce Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atheroma
2024-Jul-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324082
PMID:38860377
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研究论文 | 本研究探讨了CD163+巨噬细胞在动脉粥样硬化中诱导内皮细胞向间充质细胞转变的作用 | 揭示CD163+巨噬细胞通过促凋亡内皮细胞向间充质细胞转变来促进动脉粥样硬化斑块进展 | 仅使用了小鼠模型和人类动脉样本，可能无法完全代表所有类型的动脉粥样硬化 | 阐明动脉粥样硬化中细胞表型转变的刺激因素和意义 | 人类冠状动脉组织切片及不同小鼠模型（如ApoE-/-和ApoE-/-/CD163-/-小鼠） | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、组织病理学分析、西方印迹 | 小鼠模型 | 组织切片、细胞培养 | 107个急性冠状动脉斑块破裂病变 |
| 257 | 2024-08-05 |
Tumor suppressor FRMD3 controls mammary epithelial cell fate determination via notch signaling pathway
2024-Jul-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8958
PMID:38959315
|
研究论文 | 该文章研究了肿瘤抑制因子FRMD3在乳腺上皮细胞命运决定中的作用 | 该研究揭示了FRMD3如何通过降解Disheveled-2来调节Notch信号通路，进而影响乳腺上皮细胞的命运转变 | 未提及该研究的局限性 | 探讨FRMD3在乳腺上皮细胞命运决定中的角色及其机制 | 乳腺上皮细胞(MECs)及其在乳腺癌中的病理转变 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 258 | 2024-08-04 |
The impact of next-generation sequencing for diagnosis and disease understanding of myeloid malignancies
2024-Jul, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2024.2383445
PMID:39054632
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review | 本综述简要描述了应用于髓系肿瘤（MNs）临床诊断的技术及其相关挑战. | 介绍了当前尚为研究用途的长测序、全外显子组/全基因组测序和单细胞测序等新兴技术，将很快成为临床检测标准. | 讨论了在资源有限的环境中全面基因组测试的采用挑战，以及其纳入临床试验的限制. | 优化髓系肿瘤的临床护理，通过改善诊断、预后、治疗规划和患者监测. | 髓系肿瘤的分子评估与临床技术. | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-08-05 |
Correction: Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012417
PMID:39058654
|
更正 | 该论文修正了关于单细胞转录组分析和AID缺乏小鼠的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct metabolic "microniches" and close host-symbiont interactions in deep-sea chemosynthetic tubeworm
2024-Jul-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3053
PMID:39047091
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研究论文 | 该研究揭示了深海化学合成管虫中独特的代谢“微环境”及其与内共生体的密切相互作用 | 首次揭示管虫在共生器官中维持两种不同代谢微环境的机制 | 研究未详细探讨管虫及内共生体之间的其他可能的分子相互作用 | 研究深海管虫与其内共生体之间的分子相互作用 | 深海化学合成生态系统中的管虫及其内共生的硫氧化细菌 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 分子特征数据 | 冷渗漏管虫的单细胞样本分析 |