单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
221	2024-08-04	Molecular analysis of human tick-bitten skin yields signatures associated with distinct spatial and temporal trajectories - A proof-of-concept study 2024-Jul-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33600 PMID:39071681	研究论文	本研究揭示了人类被蜱虫叮咬皮肤样本的分子机制，分析了不同时间和空间轨迹的特征	该研究首次通过空间转录组学技术分析叮咬后皮肤样本，识别了与时间和个体特异性相关的分子特征	样本数量和个体多样性可能限制了研究结果的广泛应用	揭示蜱虫叮咬后皮肤的分子机制	从同一参与者获得的蜱虫叮咬样本（病例）和对侧皮肤样本（对照）	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	基因表达数据	同一参与者的蜱虫叮咬和对侧皮肤样本
222	2024-08-04	Integrated single-cell and bulk RNA sequencing revealed an epigenetic signature predicts prognosis and tumor microenvironment colorectal cancer heterogeneity 2024-Jul-15, World journal of gastrointestinal oncology IF:2.5Q3 DOI:10.4251/wjgo.v16.i7.3032 PMID:39072180	研究论文	本研究建立了一种能够预测结直肠癌预后的表观遗传标记	研究中的标记在不同数据集中经过验证，显示出良好的预后预测能力	该研究未提到样本的种类和数量的详细信息	研究的目标是构建一个稳健的结直肠癌预后标记	研究对象为结直肠癌患者	数字病理学	结直肠癌	RNA-seq	NA	基因组和转录组数据	使用了TCGA队列和六个独立数据集
223	2024-08-05	Single cell transcriptomic analysis reveals tumor immune infiltration by NK cells gene signature in lung adenocarcinoma 2024-Jul-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33928 PMID:39071697	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了肺腺癌中NK细胞的肿瘤免疫浸润特征	引入了NK基因特征分数（NKGS），用于区分NK1和NK2细胞	研究可能受到样本量和数据集的限制	了解肺腺癌中NK细胞的多样性特征	主要研究肺腺癌中的NK细胞群体	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	LASSO Cox回归	基因表达数据	多个初级肺癌（MPLC）数据集中的样本
224	2024-08-05	Constructing an immune-related prognostic signature for predicting prognosis and immune response in hepatocellular carcinoma 2024-Jul-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34012 PMID:39071637	研究论文	本研究旨在建立一个与免疫相关的肝细胞癌预后模型	首次在肝细胞癌中建立了一个免疫相关的预后模型	研究可能受到样本选择和数据集限制的影响	旨在分析肝细胞癌的免疫相关预后	研究对象为肝细胞癌患者及其免疫相关基因	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	Kaplan-Meier生存曲线，Cox回归分析	基因表达数据	438名肝细胞癌患者
225	2024-08-05	Disease-specific transcriptional programs govern airway goblet cell metaplasia 2024-Jul-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34105 PMID:39071568	研究论文	这篇文章探讨了慢性肺部炎症疾病中气道杯状细胞变性相关的转录程序	揭示了哮喘、囊性纤维化和慢性阻塞性肺病中杯状细胞变性的相似性和差异性	对该领域的分子机制和特征理解仍然有限	研究杯状细胞变性在肺疾病中的分子机制	人类肺部的单细胞RNA测序数据集	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	公共单细胞RNA测序数据集
226	2024-08-05	Single-cell RNA sequencing reveals special basal cells and fibroblasts in idiopathic pulmonary fibrosis 2024-07-09, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-66947-5 PMID:38982264	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析发现特定的基底细胞和成纤维细胞在特发性肺纤维化中具有重要作用	识别出几种之前未被认识的基底细胞亚型以及与细胞外基质相关的成纤维细胞群体，提供了对特发性肺纤维化中基底细胞和成纤维细胞复杂性和多样性的创新见解	样本量较小，仅包括五个特发性肺纤维化样本和三个健康对照样本	探讨导致特发性肺纤维化的分子机制	特发性肺纤维化患者的肺组织样本以及健康对照样本	数字病理学	特发性肺纤维化	单细胞RNA测序	NA	肺组织样本	8个样本（5个特发性肺纤维化样本和3个健康对照样本）
227	2024-08-04	Development of human pancreatic cancer avatars as a model for dynamic immune landscape profiling and personalized therapy 2024-Jul-05, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adm9071 PMID:38968363	研究论文	本研究开发了基于人类胰腺癌组织的个性化“化身”，用于动态免疫微环境分析和个性化治疗。	论文展示了一种新的个性化有机体模型，可以在时间和空间上报告胰腺癌微环境，并能够反映临床反应。	尚未提及具体局限性	研究旨在创建一个新的模型，评估胰腺癌治疗的免疫微环境和个性化疗法。	研究对象为胰腺导管腺癌（PDAC）和其微环境。	数字病理学	胰腺癌	多重免疫荧光和空间转录组学	个性化有机体模型	组织切片数据	具体样本量尚未提及
228	2024-08-05	Hypoxia inhibits the iMo/cDC2/CD8+ TRMs immune axis in the tumor microenvironment of human esophageal cancer 2024-Jul-04, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-008889 PMID:38964786	研究论文	本研究探讨了食管癌肿瘤微环境中的iMo/cDC2/CD8+ TRMs免疫轴的调控机制	首次揭示了CD8+ TRMs在食管癌中的抗肿瘤作用及其免疫调控的特征	本研究的机制探索仍需进一步验证，样本数量较小	深入了解人类食管癌肿瘤微环境的免疫特征及其潜在调控机制	主要研究食管癌患者肿瘤及其邻近组织中的免疫环境	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序，流式细胞术，质量细胞计数	NA	组织样本	来自治疗前患者的肿瘤及邻近组织样本
229	2024-08-05	Identification of a clinically efficacious CAR T cell subset in diffuse large B cell lymphoma by dynamic multidimensional single-cell profiling 2024-Jul, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-024-00768-3 PMID:38750245	研究论文	本研究通过动态多维单细胞分析识别出在弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有临床疗效的CAR T细胞亚群。	引入了时间延迟成像显微镜和单细胞RNA测序的功能性分析，首次识别出多功能CD8 T细胞的特征。	研究可能限于特定的患者群体，尚需在更广泛的样本中验证CD8-fit T细胞的普适性。	研究CD8-fit T细胞在大B细胞淋巴瘤患者中的作用及其临床应用。	研究对象为接受CAR T细胞治疗的大B细胞淋巴瘤患者。	数字病理学	淋巴癌	单细胞RNA测序	NA	细胞功能评估数据	由多名大B细胞淋巴瘤患者的输注产品组成
230	2024-08-05	Unraveling the Prefrontal Cortex-Basolateral Amygdala Pathway's Role on Schizophrenia's Cognitive Impairments: A Multimodal Study in Patients and Mouse Models 2024-Jul-27, Schizophrenia bulletin IF:5.3Q1 DOI:10.1093/schbul/sbae063 PMID:38811350	研究论文	本研究探讨了前额叶皮层-基底外侧杏仁体通路在与精神分裂症相关的认知障碍中的作用	研究提供了前额叶皮层-基底外侧杏仁体通路在精神分裂症及其认知障碍中的作用的新见解，提出了血液外泌体mRNA作为非侵入性生物标志物的潜力	研究样本主要限于小鼠模型和精神分裂症患者，可能影响结果的普遍性	探讨前额叶皮层-基底外侧杏仁体通路在精神分裂症认知障碍中的作用	精神分裂症患者和小鼠模型	数字病理学	精神分裂症	单细胞RNA测序、磁共振成像、光遗传学	小鼠模型	图像、基因表达数据	包含精神分裂症患者和小鼠模型
231	2024-08-05	Heterogeneous fibroblasts contribute to fibrotic scar formation after spinal cord injury in mice and monkeys 2024-Jul-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-50564-x PMID:39060269	研究论文	这篇文章揭示了脊髓损伤后纤维化瘢痕中成纤维细胞的异质性。	这项研究首次通过谱系追踪和单细胞RNA测序展示了成纤维细胞在脊髓损伤后纤维化瘢痕中的分布、起源和功能差异。	该研究集中于小鼠和雌性猴子模型，可能在其他物种或人类中不具普遍性。	研究脊髓损伤后纤维化瘢痕形成过程中成纤维细胞的异质性。	研究对象为小鼠和雌性猴子模型中的成纤维细胞。	数字病理学	脊髓损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	NA	小鼠和雌性猴子中多个成纤维细胞亚型
232	2024-08-05	Unraveling the metastatic niche in breast cancer bone metastasis through single-cell RNA sequencing 2024-Jul-27, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03594-2 PMID:39066875	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌骨转移中的转移微环境	识别了乳腺癌骨转移中特有的转移微环境，并发现与不良预后相关的独特亚型	研究主要集中在单细胞RNA测序和TCGA数据分析，可能未涵盖所有肿瘤微环境的复杂性	探讨乳腺癌骨转移的免疫微环境并为治疗干预提供见解	乳腺癌原发肿瘤、淋巴结转移和骨转移	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
233	2024-08-04	Timing and location dictate monocyte fate and their transition to tumor-associated macrophages 2024-Jul-26, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk3981 PMID:39058763	研究论文	本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）如何从血单核细胞转变，并在肿瘤发展过程中如何演变	揭示了单核细胞首先转变为短暂的中间TAM群体，再生成两个寿命较长且具有不同基因表达特征的终末分化TAM谱系	目前尚不清楚影响TAM表型和功能的所有因素	理解血单核细胞转变为TAM的时机和位置	胰腺导管腺癌（PDAC）中的TAM及其来源的单核细胞	数字病理学	胰腺癌	单细胞转录组学和高维流式细胞术	诱导性单核细胞命运追踪小鼠	转录组数据和患者肿瘤样本	NA
234	2024-08-05	PPAR-γ/NF-kB/AQP3 axis in M2 macrophage orchestrates lung adenocarcinoma progression by upregulating IL-6 2024-Jul-26, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06919-9 PMID:39060229	研究论文	这项研究探讨了AQP3在肺腺癌中的作用及机制	本研究首次揭示了AQP3通过PPAR-γ/NF-κB轴在M2巨噬细胞极化中的重要作用	研究中仅涉及5名肺腺癌患者，样本量较小	探讨AQP3在肿瘤微环境中对肺腺癌进展的影响	研究对象为肺腺癌患者及相关的免疫细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	小鼠模型	生物样本	5名肺腺癌患者的免疫细胞
235	2024-08-05	Preclinical efficacy of peanut-specific IgG4 antibody therapeutic IGNX001 2024-Jul-26, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.07.014 PMID:39069172	研究论文	本文开发了一种具有说服力的花生特异性IgG4抗体治疗方法	利用来自过敏个体的人类IgE单克隆抗体的多样性开发了新的IgG4抗体治疗	目前研究仅在小鼠模型中进行，临床效果尚需进一步验证	研究一种能够迅速提供保护的花生过敏治疗方法	研究花生过敏个体的IgE单克隆抗体及其转化为IgG4抗体的效果	NA	花生过敏	单细胞RNA测序	小鼠模型	全血样本	来自多个不同人群的过敏个体的全血样本
236	2024-08-04	Open-ST: High-resolution spatial transcriptomics in 3D 2024-Jul-25, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.05.055 PMID:38917789	研究论文	本文介绍了一种开放源代码的高分辨率3D空间转录组学方法Open-ST	Open-ST提供了一种易于使用、高分辨率、成本效益高且可扩展到3D的空间转录组学方法	NA	研究组织在2D和3D中的分子组织	小鼠大脑、头颈部肿瘤及患者匹配的健康/转移性淋巴结	数字病理学	NA	测序	NA	转录组数据	小鼠大脑和头颈部肿瘤样本，以及患者匹配的淋巴结
237	2024-08-05	Cytotoxic Lymphocyte-Monocyte Complex Reflects the Dynamics of Coronavirus Disease 2019 Systemic Immune Response 2024-Jul-25, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiae048 PMID:39052699	研究论文	本研究揭示了在外周血中由CD14+单核细胞与不同的细胞毒性淋巴细胞形成的异质性细胞复合体。	该研究首次描述了SARS-CoV-2特异性免疫反应中细胞间相互作用的复杂性。	本文未讨论细胞相互作用的长期后果及其对其他疾病的影响。	探究新冠病毒感染中细胞免疫反应的动态变化。	重点研究CD14+单核细胞与SARS-CoV-2特异性细胞毒性淋巴细胞之间的相互作用。	数字病理学	冠状病毒病	单细胞RNA测序和成像流式细胞术分析	NA	血液样本	NA
238	2024-08-04	The architecture of silk-secreting organs during the final larval stage of silkworms revealed by single-nucleus and spatial transcriptomics 2024-Jul-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114460 PMID:38996068	研究论文	该文章系统性地描绘了蚕虫在幼虫最后阶段的丝腺细胞和空间组成	通过单细胞核和空间转录组学的方法，首次揭示了丝腺的细胞类型和动态状态，以及调控网络	研究主要集中在蚕虫幼虫阶段的丝腺，可能无法推广到其他发育阶段或不同物种	阐明丝腺的细胞和空间组织，促进自然丝蛋白合成机制的理解	蚕虫晚期幼虫的丝腺细胞及其相关功能	生物医学	NA	单核转录组学和空间转录组学	NA	细胞、转录组数据	使用了多种丝腺细胞，具体数量未明确指出
239	2024-08-04	Macrophages preserve endothelial cell specialization in the adrenal gland to modulate aldosterone secretion and blood pressure 2024-Jul-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114395 PMID:38941187	研究论文	这篇文章探讨了巨噬细胞在肾上腺中如何维持内皮细胞的特化，以调节醛固酮分泌和血压	文章首次揭示了巨噬细胞与内皮细胞之间的信号传导对内皮细胞特化和肾上腺功能的重要性	研究主要集中在小鼠模型上，尚需在其他生物模型中验证结果	研究巨噬细胞如何影响肾上腺醛固酮的分泌及其在血压调节中的作用	肾上腺中的巨噬细胞及其与内皮细胞的相互作用	数字病理学	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	NA	使用了小鼠模型及人类醛固酮产生腺瘤的样本
240	2024-08-04	The mechano-chemical circuit in fibroblasts and dendritic cells drives basal cell proliferation in psoriasis 2024-Jul-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114513 PMID:39003736	研究论文	这篇文章研究了纤维母细胞和树突状细胞中的机械化学电路如何驱动银屑病中的基底细胞增殖	揭示了树突状细胞通过增强细胞外基质表达和改善皮肤硬度来促进基底细胞超增殖的机制	研究主要集中在小鼠模型上，尚需在临床人类样本中验证	探讨树突状细胞和纤维母细胞在银屑病发展中的作用	主要研究树突状细胞和纤维母细胞在银屑病中的相互作用	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫染色	小鼠银屑病模型和皮肤类器官模型	细胞, 组织样本	NA