单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 509 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling of sarcomas from archival tissue reveals programs associated with resistance to immune checkpoint blockade
2024-Jul-31, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2976
PMID:39083415
|
研究论文 | 该文章探讨了如何从存档组织中进行肉瘤的单细胞分析，并揭示了与免疫检查点抑制剂抵抗相关的程序 | 提出了一种从冷冻组织中生成多模态单细胞基因组学和全基因组测序数据的新方法 | 由于肉瘤的结构复杂，使用尖端的分子分析方法生成高质量数据存在挑战 | 研究肉瘤的治疗机制及其对免疫检查点抑制剂的抵抗性 | 分析了来自两名接受免疫检查点抑制剂治疗患者的五个未分化多形性肉瘤和三个内膜肉瘤样本的细胞转录组 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 75,716个细胞转录组，来自五个UPS和三个INS样本 |
| 222 | 2024-08-05 |
DISSyphilis and the risk of HIV infection: A Mendelian randomization study
2024-Jul-31, AIDS research and human retroviruses
IF:1.5Q4
DOI:10.1089/AID.2024.0005
PMID:39086230
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研究论文 | 本研究评估了梅毒对HIV感染的因果影响 | 研究发现梅毒与HIV感染之间存在显著的因果关系，并揭示了RPAIN基因的相关遗传变异对HIV感染的影响 | 未在摘要中提供具体的研究限制 | 探讨梅毒对HIV感染的因果效应 | 梅毒和HIV感染的基因组数据 | 数字病理学 | HIV感染 | 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA |
| 223 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis revealed that MTIF2 could promote hepatocellular carcinoma progression through modulating the ROS pathway
2024-Jul-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34438
PMID:39082024
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研究论文 | 本研究分析了线粒体翻译起始因子2 (MTIF2) 在肝细胞癌 (HCC) 中的表达及其生物功能。 | 研究首次确认MTIF2通过调节反应性氧种 (ROS) 通路促进肝细胞癌的进展，并揭示了MTIF2与SOD2的相互作用。 | 研究可能缺乏临床试验验证和长期随访的数据。 | 探讨MTIF2在HCC中的表达及其在癌症发展的作用。 | 研究对象为HCC组织中MTIF2的表达及其在不同细胞类型中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | HCC组织和其旁癌组织中的10种细胞类型 |
| 224 | 2024-08-04 |
Advances in targeting cancer-associated fibroblasts through single-cell spatial transcriptomic sequencing
2024-Jul-29, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00622-9
PMID:39075612
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综述 | 本文总结了针对癌症相关成纤维细胞的最新研究进展 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学解决了癌症相关成纤维细胞的空间景观缺失问题 | 主要为综述文章，可能缺乏新的实验数据 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤组织中的作用及其靶向方法 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的角色 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 文本 | NA |
| 225 | 2024-08-04 |
Single-cell hdWGCNA reveals metastatic protective macrophages and development of deep learning model in uveal melanoma
2024-Jul-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05421-2
PMID:39075441
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研究论文 | 本研究揭示了与转移样本相关的关键巨噬细胞亚群，并开发了一种深度学习模型用于预测眼部黑色素瘤患者的预后 | 使用单细胞转录组测序和高维加权基因共表达网络分析，识别出转移保护巨噬细胞及其相关的关键基因，为转移机制提供了新见解 | 研究中未提及样本的多样性和临床特征的考虑，可能影响模型的普适性 | 本研究的目的是识别与眼部黑色素瘤转移相关的巨噬细胞亚群及其功能，并开发预测模型 | 研究对象为眼部黑色素瘤患者的单细胞RNA测序样本 | 数字病理学 | 眼部黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 卷积神经网络（CNN） | 基因表达数据 | NA |
| 226 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptome and single-cell reveal the role of nucleotide metabolism in colorectal cancer progression and tumor microenvironment
2024-Jul-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05495-y
PMID:39075485
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研究论文 | 本研究揭示了核苷酸代谢在结直肠癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 本研究通过单细胞转录组和空间转录组分析，首次揭示核苷酸代谢在结直肠癌细胞和免疫微环境中的核心基因和作用 | 尚未充分探讨核苷酸代谢的所有潜在影响，仅限于特定细胞群体和基因 | 探讨结直肠癌中核苷酸代谢的具体机制及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直腸癌细胞及其相关的免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组，空间转录组 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 十种单细胞富集评分方法，经过四个额外的单细胞队列验证 |
| 227 | 2024-08-05 |
Deciphering decidual deficiencies in recurrent spontaneous abortion and the therapeutic potential of mesenchymal stem cells at single-cell resolution
2024-Jul-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03854-6
PMID:39075579
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研究论文 | 本研究探讨了复发性自发性流产中的蜕膜缺陷及间充质干细胞的治疗潜力。 | 首次在单细胞分辨率下评估WJ-MSCs对复发性自发性流产的治疗作用，并识别了新的细胞亚群。 | 目前对WJ-MSCs在复发性自发性流产中作用机制的理解仍然有限。 | 研究复发性自发性流产的病因及WJ-MSCs作为潜在治疗方法的有效性。 | 以小鼠模型为基础，研究正常妊娠组、复发性自发性流产组和WJ-MSC治疗组的蜕膜组织。 | 数字病理学 | 复发性自发性流产 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 鼠模型 | 蜕膜组织样本 | 包括正常妊娠、小鼠复发性流产和WJ-MSC治疗组的样本 |
| 228 | 2024-08-05 |
CRISPR-Cas9 Genome Editing Allows Generation of the Mouse Lung in a Rat
2024-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0964OC
PMID:38507610
|
研究论文 | 本研究使用CRISPR-Cas9基因编辑技术在大鼠中生成小鼠肺。 | 这是首次在大鼠中生成小鼠肺，展示了CRISPR-Cas9基因编辑与胚泡补充相结合的潜力。 | 研究仅限于小鼠与大鼠的异种嵌合体，尚未进行其他物种的验证。 | 本研究旨在探索在大鼠中生成小鼠肺的可能性。 | 研究对象包括利用CRISPR-Cas9编辑基因的转基因大鼠与小鼠胚胎干细胞。 | 数字病理学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 细胞 | 使用的样本包括缺乏特定基因的大鼠胚胎及小鼠胚胎干细胞的嵌合体 |
| 229 | 2024-08-05 |
The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2
2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028
PMID:38796708
|
研究论文 | 本文探讨了PSMP作为一种新型治疗靶点在急性肾损伤中的作用 | 发现PSMP在急性肾损伤中的增加，并且PSMP缺失可以改善肾功能和减少肾小管损伤 | 目前未提供在人类试验中的应用结果 | 研究PSMP在急性肾损伤中的角色及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 急性肾损伤小鼠模型以及患者的肾脏组织、尿液和血浆 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物标本 | NA |
| 230 | 2024-08-04 |
Sequencing the transcriptome of single cells: a path to discovering cellular biodiversity
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_532
PMID:39083470
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研究论文 | 这篇文章介绍了单细胞转录组学（scRNA-Seq）技术及其在生物医学、发育生物学和植物生物学中的重要应用 | 该研究展示了通过scRNA-Seq技术发现细胞多样性及其发育过程的新方法 | 本文未提及具体的实验局限性 | 研究单细胞转录组学技术的实验与计算部分 | 涉及组织、类器官、细胞及整个生物体的研究 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 生成的数据分析 | 可以分析数万到百万个细胞 |
| 231 | 2024-08-05 |
Coexpression enhances cross-species integration of single-cell RNA sequencing across diverse plant species
2024-07, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01738-4
PMID:38937637
|
研究论文 | 本研究展示了共表达如何增强不同植物物种中单细胞RNA测序的跨物种整合 | 利用共表达减小多对多同源基因家族，从而识别一对一的基因对，提升了传统整合方法的性能 | NA | 探讨通过基因表达和细胞类型组成驱动的跨物种差异 | 不同植物物种中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 232 | 2024-08-05 |
Recessively Inherited Deficiency of Secreted WFDC2 (HE4) Causes Nasal Polyposis and Bronchiectasis
2024-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202308-1370OC
PMID:38626355
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研究论文 | 本研究识别了一种与鼻息肉和支气管扩张症相关的隐性遗传缺陷。 | 该研究首次确认了WAP四硫化物核心结构域2导致支气管扩张症的分子病因。 | 研究样本量较小，仅研究了来自10个家庭的11个个体。 | 识别与严重鼻窦炎、鼻息肉和肺部感染相关的支气管扩张症中的新型基因缺陷。 | 分析来自美国、欧洲、亚洲和非洲的多个独立家庭的个体。 | 数字病理学 | 支气管扩张症 | 下一代测序、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA、RNA、血清样本 | 11个个体，来自10个独立家庭 |
| 233 | 2024-08-05 |
CD34+ synovial fibroblasts exhibit high osteogenic potential in synovial chondromatosis
2024-Jul, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03892-9
PMID:38602543
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研究论文 | 本研究旨在识别在滑膜软骨症中异常分化的祖细胞和可能的致病信号通路 | 识别了滑膜软骨症中CD34+滑膜成纤维细胞的高骨生成潜力及其相关信号通路 | 研究的样本来源于关节置换手术，可能存在样本选择偏差 | 识别滑膜软骨症中的异常分化祖细胞及相关的信号通路 | 来自滑膜软骨症患者的滑膜样本和组织细胞 | 数字病理学 | 滑膜软骨症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 滑膜软骨症患者的样本和来自骨关节炎的对照样本 |
| 234 | 2024-08-05 |
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-Jul-29, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2672-1
PMID:39083201
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研究论文 | 研究揭示了哺乳动物听觉受体中单细胞转录组的拓扑差异 | 首次确定了内毛细胞和外毛细胞的独特分子特征，以及与音调相关的新基因 | 研究主要集中在小鼠模型中，可能不完全适用于人类 | 探索哺乳动物毛细胞的声音频率选择和其分子基础 | 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了不同位置的内外毛细胞样本 |
| 235 | 2024-08-05 |
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae370
PMID:39073828
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法，能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 | 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 | 未提及具体的局限性 | 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释，尤其是检测未知类型 | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 开放集领域适应 | NA | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA |
| 236 | 2024-08-05 |
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0453
PMID:38635899
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研究论文 | 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达，并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 | 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用，并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 | CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 237 | 2024-08-05 |
Vaccine Therapy for Heart Failure Targeting the Inflammatory Cytokine Igfbp7
2024-Jul-30, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了针对炎性细胞因子Igfbp7的疫苗治疗心力衰竭的效果 | 提出了通过疫苗靶向Igfbp7改善老化内皮细胞引起的心脏功能障碍的创新方法 | 研究主要在小鼠模型上进行，临床应用的验证尚未完成 | 探究炎性细胞因子Igfbp7在心力衰竭中的作用及其作为疫苗靶点的可能性 | 研究对象为小鼠模型和心力衰竭患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、毛细管电泳-飞行时间-质谱系统 | AAV9（腺相关病毒血清型9） | 组织样本 | 使用了小鼠模型和心力衰竭患者的组织样本 |
| 238 | 2024-08-04 |
Unveiling heterogeneity and prognostic markers in ductal breast cancer through single-cell RNA-seq
2024-Jul-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03325-1
PMID:39068476
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了导管乳腺癌的细胞异质性及其预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析乳腺癌细胞的异质性，识别CYP24A1和TFPI2作为潜在的预后标志物 | 研究主要依赖生物信息学分析，可能缺乏大规模临床样本验证 | 调查导管乳腺癌细胞的异质性机制及潜在预后标志物 | 导管乳腺癌细胞，特别是Type 1和Type 2导管上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso回归，Cox比例风险回归 | 基因表达数据 | NA |
| 239 | 2024-08-07 |
Developing a simple and rapid method for cell-specific transcriptome analysis through laser microdissection: insights from citrus rind with broader implications
2024-Jul-27, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-024-01242-y
PMID:39068421
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研究论文 | 本文开发了一种简单快速的激光显微切割方法，用于细胞特异性转录组分析，并通过柑橘皮的研究展示了其有效性 | 本文省略了样本固定和防冻剂添加步骤，采用新鲜样本快速冷冻并立即进行冷冻切片，缩短了脱水时间并省略了组织清除步骤，提高了RNA提取的质量和效率 | NA | 开发一种改进的、简单且高效的激光显微切割方法，用于细胞特异性转录组分析 | 柑橘皮组织及其细胞 | 分子生物学 | NA | 激光显微切割、下一代测序 | NA | 转录组数据 | 柑橘皮组织的多个厚度切片 |
| 240 | 2024-08-04 |
Decoding the spatiotemporal heterogeneity of tumor-associated macrophages
2024-Jul-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02064-1
PMID:39068459
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review | 本综述探讨了肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的空间和时间异质性 | 创新点在于揭示了TAMs的不同亚型、起源及功能，以及其与其他肿瘤微环境成分的复杂相互作用 | 该综述可能未覆盖所有相关研究，且主要基于现有文献，缺乏新的实验数据 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其潜在治疗靶点 | 研究对象为肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，空间多组学 | NA | 文献 | NA |